1SMHA

Protein kinase a variant complex with completely ordered n-terminal helix
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
350
structure length
348
Chain Sequence
GNAAAAKKGSEQESVKEFLAKAKEDFLKKWENPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVKHMETGNHYAMKILDKQKVVKLKEIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYAPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLMIDQQGYIQVTDFGLAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Typically Disordered N-Terminus of PKA Can Fold as a Helix and Project the Myristoylation Site into Solution
pubmed doi rcsb
molecule keywords cAMP-Dependent Protein Kinase, alpha-catalytic subunit
molecule tags Signaling protein,transferase/inhibitor
source organism Bos taurus
total genus 115
structure length 348
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2004-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1smhA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1smhA02
4FTQA 4U80A 2PE0A 2C1AA 3ACJA 5EM7A 4AA4A 5IH5A 5M4UA 4BTJA 2C47A 4KNBA 4RIYA 3E62A 5CT7A 5J7HA 2GFCA 1U54B 3BE2A 3WIKA 1OVEA 3PRIA 2XK8A 2AYPA 1UU9A 2IW6A 2VTJA 4QMYA 4XMOA 4IFCA 5AMNA 3LXLA 2GDOA 5D7VA 3F69A 3LCOA 1JKLA 4C4FA 4RIOA 4EOSA 4QP9A 4YBJA 4KUJA 4XX9A 1M2PA 2ONLC 4RRVA 2IJMA 2HELA 2QG5A 3EQGA 3D2KA 4WD5A 4XP2A 3RALA 1H1SA 3UODA 3V5PA 4FVRA 1GZNA 4NM7A 3UQCA 3MH3A 5AM6A 3C0IA 5HIBA 2XK7A 4KRDA 2Z7RA 4YBKA 4OTFA 3TXOA 4DEGA 4M97A 5ANJA 3VUMA 2C30A 3WF8A 1A9UA 5IKWA 4HW7A 4L01A 4J98A 3VHKA 1DAWA 3KMMA 4J8NA 1SVGA 1PY5A 2QKRA 2JFMA 3LFFA 2J5FA 3LFAA 3B2TA 4L8MA 4KA3A 5AP0A 4LGHA 1RDQE 3DZQA 3L8VA 4BWXA 4EK5A 3FSFA 4JBPA 3DPKA 4FKJA 4EWQA 1BYGA 2YM6A 2GSFA 4C3PA 5M4CA 4LV8A 4BDKA 4NU1A 4EH5A 3SDJA 4CMUA 3R1QA 4I6FA 4F65A 1SNUA 4RJ3A 3NAYA 3WZKA 3A7GA 4M7IA 4YHTA 5JKGA 2WKMA 4CV8A 4HZRA 2PVNA 5AM7A 5AAFA 3WILA 2PYWA 2XZSA 4RC2A 5KX8A 1BMKA 2WELA 2DUVA 4ACGA 4RIXA 2W05A 3ZM9A 2X81A 1LEZA 3EFLA 4E4MA 3OHTA 4MYGA 1Q3DA 3BYMA 4KSQA 4F1MA 3BV3A 3C4EA 1YVJA 3BV2A 4QP1A 3D15A 1WBPA 5AUXA 3WF5A 5A46A 4ENYA 3CQWA 2BZHB 4D0WA 2WGJA 3U6JA 3ATSA 3ET7A 1J1CA 2BCJA 2XMYA 2DS1A 2G9XA 5D1JA 1H25A 4KSPA 4KIPA 3SQQA 4UMUA 4BR3A 3S2PA 3FLNC 4BGGA 2C6EA 3BI6A 4DTKA 3NUUA 3U4WA 5J5TA 1M2QA 5BMMA 3GC8A 5CF4A 3CSVA 3E63A 3GCPA 4GH2A 5KBQA 3EQCA 2XKCA 5IDPA 1H4LA 3JYAA 4MXOA 4FTTA 4M15A 1SM2A 5EFQA 1W7HA 2X8IA 2GFSA 2WQNA 5IA2A 4FIIA 3OD6X 5IQHA 3AT2A 4E4NA 3WF7A 4FVQA 4X2KA 4Y8DA 4USDA 2I0HA 3AC2A 4DEAA 4I4EA 4DG3E 3CJFA 3NUPA 4FKVA 3OXZA 3W33A 3K3IA 4FGRA 5BUEA 5LMKC 1FPUA 4YNOA 5IQBA 3E64A 4N4SA 2ZMCA 1AD5A 4X3JA 3R22A 3DBDA 4U3ZA 5E8TA 5EHOA 3UVRA 5FTGA 2X1NA 2W4JA 4R5SA 3ELJA 3W1FA 3LFEA 4F9BA 2YEXA 4X0MA 5DWRA 4A7CA 5EW3A 1XH4A 4QTCA 4U43A 3NUXA 5IDNA 1M7NA 2YCSA 4LUEA 4M66A 1HOWA 3R71A 4QMPA 3CC6A 5CAUA 3UQFA 2VO0A 3KREA 1I44A 5FQDC 2PVJA 4JAJA 5DNRA 1Q41A 4HCVA 3COKA 3ODZX 4MTAA 3AG9A 1JOWB 3MJ1A 5BYZA 2ERKA 4UWYA 3V5TA 3VAPA 5C8NA 4FV3A 4I92A 1WVXA 1MQ4A 4AZVA 4QYGA 5GIOE 2OJJA 3D7TB 3ZO1A 3DZOA 4AGUA 4I6BA 3K54A 3VIDA 4ZEGA 1H28A 3FZPA 4FL2A 3TWJA 4YO4A 4DHFA 5M4IA 4I41A 2PWLA 5CNOA 2X39A 4ZTHA 2VV9A 4DG0E 3ORNA 3SGCA 2PUNA 5FEQA 1Q97A 4CKRA 3HMIA 2VWUA 5JFVA 2OF4A 2VN9A 4NJ3A 3L1SA 4HYUA 2HY0A 1QL6A 3F3WA 5L4QA 3BEGA 3KULA 3ZLXA 4RPVA 5A6OA 3AOXA 3HA8A 2BFXA 4K9YA 3ZM4A 4XLIA 5JFXA 4FIFA 2WD1A 2HZ4A 3CKXA 4IACA 5CWZA 4J96A 4BCPA 2PUIA 2JAVA 4AS0A 4LG4A 1M2RA 3RCJA 4BCMA 4G3EA 5ACKA 2EWAA 2XNOA 4U7ZA 3UG1A 5E8XA 4F70A 3WOWA 2PZPA 2UZTA 4CFXA 1KV2A 3I4BA 1R0EA 3BU5A 4X6RA 2PVHA 3GI3A 3ORPA 3MFUA 2XEZA 4RWLA 4TXCA 4GCJA 2HXQA 3DY7A 5HHWA 2XKDA 4QYHA 2Q0BA 1WBOA 2JDRA 5EKOA 3POOA 3TDWA 1VYWA 4DFUA 2YDJA 4F1TA 1YXVA 3PZEA 4FNXA 2OFUA 3LVPA 4N6YA 5DEYA 3M42A 3MI9A 3R8MA 4UY9A 3LJ0A 5LQFA 1S9IA 4GIIA 4E5AX 3CCNA 4L3LA 4MF0A 3COMA 3UC4A 3DU8A 4MD7E 3CQEA 2PVKA 3QWJA 3UG2A 1PXOA 3N4TA 3R21A 5IMXA 2C69A 3FZSA 3O50A 4G34A 2HCKA 4D2PA 5BMSA 3DQWA 3BYOA 3FLSA 4PX6A 4A4LA 1PYXA 4QYEA 5BVWA 3HX4A 1G8SA 1V0PA 3OBJA 4I0SA 2Z7QA 2OZAA 3R01A 5AR7A 3GC7A 5A3XA 5I9WA 3Q2MA 1YXSA 2UZBA 3QF9A 2Q0NA 5FEEA 3D7ZA 3NYOA 2OJ9A 2C6OA 2BTSA 4LMNA 2X9FA 1MQBA 4FTJA 2WTKB 4ZSJA 1OZ1A 2YM3A 4Y73A 4EZ3A 2ZOQA 4NZWB 3SHEA 3HKOA 4PRJA 4C58A 3C5IA 3O2MA 5L8KA 4HVHA 2OI4X 4E4LA 3W2RA 1GY3A 3SG8A 4HZSA 3F2RA 1L8TA 4F08A 2QO9A 3GXLA 4BZOA 2WMTA 3Q4UA 4L44A 4BDFA 3CP9A 2QOQA 1ZY5A 4QMOA 2H6DA 2ZYBA 2UW4A 3R73A 3UDBA 3H3CA 4JJRA 3PXFA 4XV3A 2XEYA 4C2VA 3F3VA 5BVFA 3ZTXA 3IS5A 2VTHA 4QMNA 5HZNA 3OOMA 5H8GA 5HE0A 1FVTA 4EH6A 1PXKA 5JRSA 4Z7HA 3H0ZA 1IA9A 4OAUC 4M0YA 4DA5A 4ZMFA 1PHKA 4QD6A 4PMSA 2X2MA 4FIGA 4PDOA 5DR6A 3PIZA 4AX8A 4RC4A 5J79A 3KXHA 4S34A 3HDMA 4EOIA 5I9UA 1PRYA 2P4IA 3ZS5A 3RAKA 4E5WA 3EJ1A 4FODA 2VX0A 2Y6MA 4V04A 2B53A 3BRBA 4DFZE 2WNTA 2IO6A 3FI2A 5HO6A 2R64A 3BGZA 3QCYA 3MIYA 5I9ZA 3VHEA 4DEBA 1WBNA 3HL7A 3VJOA 4P4CA 2QOLA 5CAVA 4PDYA 4EOPA 5B0XA 1ZRZA 3LOKA 1Y6BA 5KBRA 5EOBA 2YAKA 4EOKA 1XH6A 4C37A 1XR1A 3CPCA 4XRLA 3F6XA 2WQOA 4EHVA 4EHGA 3QA8A 1UNHA 4F6SA 2H8HA 2CN8A 3LM5A 2XK9A 2Z8CA 3I6WA 3ZXTA 4QMLA 5AAEA 3F82A 4H3BA 3VBTA 3VS1A 2WMVA 2ITXA 4L7FA 5CVFA 4ZY6A 3C50A 3TUBA 2GQSA 3LQ3A 4O84A 4BDDA 4FSTA 5CNNA 2BZJA 1ZOHA 3DJ7A 4O7NA 4Y72A 1FMKA 2IVSA 1YWVA 4BTKA 2RG6A 1QPJA 1RW8A 3CD3A 3M11A 4GW8A 4HPUE 1CSNA 4WBOA 1ZOGA 3ZUVA 5LWMA 2GNGA 3MV5A 5HESA 3T8OA 1KOBA 4APPA 4FTNA 1J7IA 1SMHA 4O27B 3V6RA 4OLIA 1OMWA 3PJ1A 4HNFA 4AA5A 4D4VA 2I1MA 2YFXA 5AIKA 1FBNA 4AN2A 4C36A 1H00A 4ZLZA 5CSPA 4USEA 3ZDIA 4O7LA 2R9SA 4DCAA 3B8QA 5CSXA 4H1MA 1YKRA 3MYGA 1KE8A 4LL5A 4QMTA 2C68A 4R1YA 2UVYA 2C0TA 4UMRA 5DEWA 1OIRA 3HNGA 2O5KA 4RMZA 5C4KA 4MAOA 4FG8A 3EOCA 4J53A 5D12A 5HE1A 4UBAA 4FL1A 1QPCA 1YI6A 4KWPA 3FKNA 5CENA 3PE1A 4R3CA 3TN8A 5ETCA 4ERKA 4KAOA 2YZLA 2W5AA 3Q6UA 4W8EA 1NY3A 5C8KA 4UYAA 3REPA 4E8AA 5AAGA 5JFWA 4WNKA 5BQ0A 3MDYA 5IQIA 1NXKA 3BU3A 3R1NA 4NEUA 4DLIA 4NM3A 4CMTA 5AP6A 5D10A 4FEVA 4ZY5A 4BKYA 2P2IA 5HVKA 2R5TA 2ZM1A 3OT3A 2CNQA 1LPUA 2XM8A 4BGHA 5H8BA 1SVEA 3NVKI 3NCGA 4CCBA 2YERA 2JIIA 1XKKA 3OUKA 4IQ6A 4MNEA 3UYTA 1YHWA 2QURA 4IH8A 4N6ZA 5DOSA 3MY5A 5A4CA 4LMUA 1OPJA 1YXTA 2XKEA 2B54A 5CSWA 1A48A 4ZZMA 5LCJA 3I6UA 2UW3A 2R3IA 4FYNA 4E7WA 5AWMA 2CNUA 3Q52A 1BI8A 3D5VA 3OWLA 3HV5A 4E93A 4BB4A 4L67A 3EMGA 2J0MB 2PZRA 4NL0A 2OO8X 4QNYA 3FE3A 3PP0A 2UZOA 4E3CA 5C26A 1Y91A 3PSDA 4G5JA 4HVSA 1SYKA 2VTAA 2QC6A 2C6TA 4R3PA 4G6NA 5HBJA 3T3UA 4J99A 3DKOA 2ITYA 4YZCA 4AE6A 5H2UA 3UZRA 4AFJA 2FSTX 1A06A 5IQDA 2XK3A 3KMUA 4I94A 4FV6A 2X7GA 4G6LA 3VBXA 3R02A 4TW9A 3PWDA 4XJ0A 4YSJA 3PFQA 3DTWA 3C0GA 5AR3A 1ZZLA 2ONLA 1YDTE 2YDIA 3V01A 3RPRA 5KUPA 1PMEA 4HYHA 1Q8UA 2C6LA 4IM0A 4RLLA 5CT0A 3E8DA 2HOGA 4BDIA 3U8WA 1YOJA 4EC9A 2ZV8A 5FG8A 3TM0A 1ZMUA 2BR1A 3RCDA 2BPMA 2PVMA 3IW8A 3O8TA 2BVAA 4QMUA 3HYHA 3MPMA 2HZNA 3MJ2A 4RZWA 5K5NA 1OBDA 2ITOA 3DA6A 4F6WA 2OF2A 3A99A 5HG9A 4A9TA 2R3HA 2VRXA 3G9LX 3K5VA 4LRMA 5CZHA 5AUYA 2BAKA 3RBWA 4F09A 4YURA 3NNUA 2B0QA 3R9NA 3H4JA 5CAOA 3RM6A 4FGBA 1SVHA 3HUBA 3JPVA 1OL5A 1RE8A 3P7CA 3CXWA 1Q61A 4FTIA 5E1SA 2Z02A 3UVPA 1W84A 4OTPA 4FZ7A 5HCYA 1FOTA 1M14A 5A6NA 3LPBA 4UZDA 5B7VA 4FV9A 2X8DA 3NEWA 5CU2A 3NZ0A 3PP1A 4MD8E 4BIDA 4ZZOA 1UA2A 3QTRA 4BCGA 4BFMA 4FEXA 2GS6A 3DQXA 5HBEA 1H01A 5HO8A 3TV6A 3HV4A 3E8EA 5IUIA 3QX4A 4FK6A 5K0XA 2GQRA 3Q32A 2XIKA 3F5UA 3JXWA 5A4QA 2BZIB 2VNYA 4U40A 5DR2A 1OKYA 4ACMA 2F4JA 2FSLX 3NR9A 1WBVA 3G6HA 4GV1A 4BCNA 3HRFA 3ITZA 2ZM4A 4XG8A 4RC3A 3NPCA 4YZ9A 4H58A 3QRIA 4OBOA 3BELA 4MBLA 3NYNA 3ZEWA 2EB3A 2CKPA 1BLXA 4F64A 2H96A 4S30A 3TI1A 3PWYA 4OT5A 4AQCA 3DAEA 4LUDA 3R7GA 5CQUA 3AXWA 5A54A 1K9AA 4F0IA 4O96A 3UPXA 3P7AA 4D2WA 3FQEA 4TYEA 3RVGA 4IAAA 3ZFMA 4EZ5A 2W1DA 2JDOA 1NT2A 4O7WA 4M13A 2VU3A 2SRCA 4FKSA 4YZNA 3W2SA 2NRYA 4GK2A 2VWIA 3QALE 4B7TA 4ZZNA 2WMQA 3EN5A 3IKAA 3L9NA 4D5HA 4E1ZA 3OBGA 1OKWA 4UWCA 3FXWA 1PKDA 4EKKA 3ORLA 3RINA 1J1BA 2QR7A 1YXUA 3FMLA 2UW8A 3E3BX 1OIQA 3HMOA 4AW0A 1KSWA 2W1GA 4CFWA 4TYIA 4YZDA 3P23A 4RX7A 1HCLA 2BMCA 2B7AA 4UMTA 4ZSGA 5L6WL 4DGNA 4XUFA 2VO3A 2GCDA 3KXXA 1H1QA 5IH6A 4FEQA 2PE1A 4IVAA 4Y5HA 3CTJA 4WSYA 3R04A 4BIBA 4TYGA 2YDKA 2CGVA 5DFPA 5EHYA 5C27A 5JFSA 5FRIA 5DE2A 4RIWB 3RHXA 1XO2B 1YHVA 1E9HA 5AUWA 4UZHA 5LMKA 3UO4A 3RPSA 4C62A 2IW9A 4CZUA 4IMYA 3BX5A 4IAKA 2YAAA 4JS8A 4DEHA 2QOFA 3MH1A 4L00A 4CLIA 5HLPA 1CKPA 5E4HA 2P55A 3CGFA 1GIIA 4ANMA 5IA1A 1GZ8A 2R0IA 3KRLA 3ROYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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