1U4DA

Structure of the ack1 kinase domain bound to debromohymenialdisine
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
273
structure length
258
Chain Sequence
LTCLIGEKDLRLLEKLGDGSFGVVRRGEWDAPSGKTVSVAVKCPEAMDDFIREVNAMHSLDHRNLIRLYGVVLTPPMKMVTELAPLGSLLDRLRKHQGHFLLGTLSRYAVQVAEGMGYLESKRFIHRDLAARNLLLATRDLVKIGDFGLMRALPQDHYVMVPFAWCAPESLKTRTFSHASDTWMFGVTLWEMFTYGQEPWIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDCPQDIYNVMVQCWAHKPEDRPTFVALRDFLLEAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of the Phosphorylated and Unphosphorylated Kinase Domains of the Cdc42-associated Tyrosine Kinase ACK1.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Activated CDC42 kinase 1
total genus 86
structure length 258
sequence length 273
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2004-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1u4dA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1u4dA01
4JI9A 4PPAA 4ZLOA 3UYTA 4AP7A 4DINA 1W82A 3NWWA 5KO1A 4RJ8A 1WMKA 1Z57A 4RIXB 4D4YA 1FPUA 4NIFA 2G2IA 3MWUA 4GH2A 4GK2A 4BCOA 3UQCA 3OG7A 3MJ1A 4W4VA 1K2PA 2F9GA 2JIVA 5FM3A 3HMIA 5CU2A 3OP5A 2VTJA 3QRKA 2NRYA 4IWOA 2J7TA 4PPBA 4F9YA 4YR8A 3LZBA 2Y7JA 2X6DA 5HGIA 4RFYA 4A4OA 2FSLX 3DU8A 4NH1A 2CKEA 3EOCA 3R00A 1CKJA 2KULA 4V0GB 3QC9A 4AZTA 4EOKA 5HVKA 2IZUA 2VZ6A 4W4YA 4F7SA 1GIHA 4I5CA 4PNIA 3VVHA 4II5A 2B55A 1FVTA 3O8TA 2IVUA 4JBVA 4ZJJA 3QRTA 5K4JA 1G5SA 4J98A 2VWZA 4M0ZA 3E87A 4UYNA 5AUYA 3SKCA 4GUBA 3VS5A 3QRIA 4U41A 2XIYA 3ZO1A 2R3QA 2UZOA 2XVDA 3OWLA 3CJFA 5CXHA 3EH9A 3SOAA 3UNJA 4FT0A 4IC7A 5IPJA 4Y85A 4L46A 5E8TA 3DZOA 1H8FA 1P5EA 3GQIA 3JS2A 2BDFA 2OXDA 4ITHA 3ZLWA 3EQRA 3A7HA 4L43A 4WNOA 4P5ZA 4P90A 5KCVA 3GCUA 3UO6A 4OUCA 1FGIA 2JDTA 3PSBA 3UZPA 2XZSA 1FINA 3O23A 4JG7A 2GNFA 3P4KA 2GNLA 2W1ZA 3E7VA 4L3LA 5ICPA 3KQ7A 2I0YA 3OWKA 3Q5IA 4BGGA 3QD2B 3LQ3A 3ORLA 4Q2AA 4RWLA 3UVRA 3COIA 4KABA 4M15A 4F1OA 1ND4A 4YJSA 4L68A 5EH0A 4J8MA 4OLIA 3ETAA 3FC1X 2EXMA 4W4XA 3MS9A 4HYUA 5DN3A 4GU9A 2J9MA 3AG9A 2Y9QA 5K4IA 3MVJA 2HZ0A 3BI6A 4OGRA 3GOPA 3FI8A 3SG9A 4EWHA 2X8EA 3W1FA 1V0PA 1M17A 3PXRA 1H1QA 3OF0A 1YOJA 4RJ4A 4X2JA 4AS0A 3H3CA 5CVFA 4FOCA 2PE0A 3QAME 4XNEA 5BMMA 4ERWA 4FC0A 4WKQA 1WAKA 2QONA 3WF8A 5TO8A 4B6LA 5HI2A 1YWVA 5JMSA 3BRBA 3GC7A 4ASXA 3B2WA 2C6DA 2W05A 5ANGA 4AX8A 1XH4A 2W06A 2X9FA 4CKJA 4FKLA 4N70A 4IAKA 4BDEA 1CDKA 2IWIA 2IPXA 4PY1A 4PTGA 1NVRA 4C3PA 3FMDA 4UXQA 4J8NA 3V8SA 5M57A 4CG9A 5KMOA 4ZZNA 4S33A 3MA3A 4FIGA 4EUTA 5K0XA 3KA0A 1Z9XA 2VWYA 3TNQB 3DNEA 2JLDA 2OI4X 5HO6A 1MQBA 3KK8A 3PLAE 3ODZX 3RGFA 5IU2A 2JFMA 3T3VA 1GZKA 2R3FA 3LJ2A 2W1EA 4I22A 5FP5A 2RFDA 1BI7A 2X8DA 3F9NA 5DG5A 5FBOA 3TIYA 3KU2A 3LOKA 4YLJA 4GS6A 3RPRA 4EH5A 4LRJA 3EFLA 2XP2A 3L9MA 3HRBA 5C8KA 3D7TB 3DK7A 4TPTA 5AFVA 4BCJA 3C5IA 3DY7A 3R22A 2WZJA 3OVVA 5BYZA 2VO6A 2QR8A 3O7LB 5EI8A 4EH2A 2YM3A 3U6JA 4D1ZA 1P2AA 5BX0A 4AT3A 3EKNA 5AX9A 4FSQA 2JC6A 3IONA 1YWNA 4FT7A 4ENYA 1ZYDA 2HZIA 1SVEA 3WYYA 1R1WA 2VX0A 3F69A 2PVJA 5G6VA 3VUTA 4UMUA 2YHVA 4AOJA 5AR5A 2YDKA 3F82A 3GT8A 5I9ZA 4D58A 4WSYA 4PMTA 5FEQA 3EL8A 4ANNA 5AA9A 4R7HA 3R1YA 5JN2A 4O7ZA 2XIRA 4U6RA 2BFXA 2UVXA 4TNBA 4JXFA 1RDQE 3BV2A 3ODYX 2XIXA 3ROYA 4YBKA 2UZBA 4CTCA 5L2TA 4BDCA 1B38A 3RBWA 5CAPA 1Q3DA 4K77A 3E8CA 5CT7A 2C5XA 4W9XA 4EQMA 4FT9A 2EUFB 5M44A 3LLTA 1NT2A 4L7SA 3A7IA 4FTOA 3N4UA 3L8PA 1GOLA 3RK9A 5LQFA 4BCIA 3DQXA 5AR8A 4WSQA 3COKA 3DK6A 3E8NA 4S32A 3SDJA 3TM0A 1WBPA 5HG5A 4RWKA 2PYWA 5C9CA 2VO7A 2R3PA 3UYSA 3E64A 3PSCA 3ZBXA 3DJ7A 3HX4A 4I92A 4KS7A 4QP3A 5DYJA 3CP9A 3G5DA 4IXPA 2F49A 5DBXA 3EFJA 5EG3A 3FZRA 4DG0E 4EOOA 2UZDA 2A0CX 4ZTMA 5HLNA 3DTWA 4AA5A 4C33A 4YZDA 3ZBFA 1TQPA 5I0BA 2WFYA 3FQSA 3P0MA 5C8MA 4BDFA 4V04A 3RVGA 4PL3A 5JSMA 3L9NA 4BN1A 5KMMA 4RIWA 1GIJA 3ZZEA 3OUKA 3P1AA 3DKCA 2JAVA 3QTSA 5DLSA 3M1SA 4JJRA 2HZNA 5AUVA 2ACXA 3F5GA 3NSZA 3AGMA 4OTHA 3AD6A 4O7TA 4EJNA 4IADA 4J53A 2JBPA 2PVLA 3ZRKA 4CYIA 3RNIA 4PDOA 1VYZA 5A4QA 2R2PA 3CC6A 4EOSA 3ID6C 1R78A 1URWA 4RJ7A 3MGYA 2WMRA 4GK4A 4BCPA 4FNYA 4F0FA 5ANIA 2HWOA 4C7TA 1W98A 2BMCA 3UQFA 3H10A 2IW9A 2QOHA 3MI9A 1APME 4QNAA 2WEVA 3AQVA 4MAOA 4CMOA 5LXMA 4ZSAA 5F1ZA 1V0BA 3DXPA 3EB0A 2YDJA 5HBEA 3FLYA 4PQNA 4APPA 3AD4A 4KBKA 3G0FA 5G1XA 2OW3A 3QD4A 4I5HA 2XF0A 4FV6A 4U5JA 3W2OA 5C26A 3R8UA 5AUZA 3G9NA 4E5BA 4IFGA 4YJTA 4Y5QA 1PKDA 2X1NA 4QP2A 4G34A 3WYXA 3FZPA 3R63A 5HCXA 3C4FA 4DFZE 2X7FA 3CE3A 3CD3A 2FUMA 2X2KA 3R7GA 4XLIA 5EFQA 2NRUA 2VNWA 2GTMA 4JRNA 2XKDA 4E5AX 3VS7A 4GV1A 4G9RA 4EQUA 5M09A 1KSWA 2J50A 3DCVA 3NNWA 4YJNA 2HW7A 2OJ9A 1R3CA 3RZFA 3WF6A 1UNHA 4IH8A 4ZIMA 5K5NA 5CALA 4Z7HA 5IQEA 4BHNA 3R8VA 1S9JA 4EH6A 3PJ2A 3OC1A 4E26A 4EH8A 4CD0A 2CNQA 3BCEA 3EQIA 3TKUA 1PYEA 2RKUA 3UBDA 5AP6A 2RFSA 2WPAA 3P79A 3KK9A 1G8SA 3TL8A 1T46A 4M68A 4IX4A 4UALA 5J7HA 4MWHA 3BBTB 3O50A 4R1VA 4WNMA 4H36A 1ZLTA 3GOKA 4FL2A 4YC6A 3WF9A 4DFXE 4RVKA 4FV2A 2WGJA 3LQ5A 2W1GA 4DG2E 4FZDB 5IEXA 5FD2A 4WG3A 4AFJA 4ZLZA 4WOVA 1UU7A 4I0RA 3IOPA 5M4FA 4R7BA 4H1JA 4IB0A 3TKIA 4IZ7A 3GUBA 4U40A 2H34A 4L67A 2FGIA 1ZXEA 4O38A 2HAKA 2QOFA 1IA8A 3C4EA 3DFAA 4XG2A 2O64A 2G2FA 3DGKA 1ZRZA 2W99B 4ANOA 3K5VA 5LVPA 1Y8GA 3KFAA 2ERKA 4KKGA 1BI8A 4H1MA 3EQHA 2YJRA 4UY9A 4YLKA 5ETCA 4A4XA 4RC4A 4NTTA 2NNWB 5DT3A 1KWPA 4UMRA 4CRSA 4ZY5A 5IMXA 2W1CA 4GT5A 5AR2A 3VRZA 3CS9A 4A7CA 2DYLA 4UZDA 1XH7A 4LOQA 3CPBA 5BVEA 5D7AA 5C01A 3U8WA 4BDGA 5ETIA 4BZDA 2X7OA 2Z7QA 3MH3A 4I23A 3AMBA 3VF9A 4YJPA 3RINA 4ZOGA 4EOLA 2R3LA 4G16A 1KOAA 4ZZOA 4NUSA 1JBPE 4XBRA 5HCYA 4ACGA 3PXFA 2BDJA 3ORIA 5BVFA 5KMLA 3BELA 4KIPA 4IDVA 3KXXA 4EYJA 2VTRA 3P9JA 2W5AA 3FXZA 1JQHA 3QQKA 1KV1A 3TCPA 2J5EA 4FEUA 1PXOA 3DV3A 3PFQA 5AP4A 3FBVA 3R02A 3HMNA 4EWQA 3LMGA 4G3CA 4DFUA 3MSSA 4C2WA 5EQYA 1ZYCA 3DS6A 3R30A 2R4BA 4I5PA 4LV8A 3V04A 5C4LA 2PSQA 4X6QC 2C1BA 4CMTA 1MRUA 2GNJA 5A6NA 1H25A 3OOMA 1Q24A 3ET7A 2VD5A 3MBLA 4O1OA 3ZTXA 4DT8A 5IISA 3MH2A 5IEVA 3ZDIA 5EKNA 1XH8A 3POOA 4MEDA 4ZMFA 1JKLA 3NUUA 3EZRA 4YZCA 1PXJA 3A8WA 4BB4A 4O21A 5IQDA 3KULB 3BQCA 4QPAA 2RG6A 3WZEA 3R1SA 3AC2A 3P86A 5AUWA 4XG8A 3CD8A 1OVEA 4QP6A 3FLZA 4QMXA 3DTCA 2ZDTA 3NUXA 4JAIA 2OIBA 5D7VA 3B8RA 3HDMA 3LFBA 5FXQA 5DVRA 3BU5A 4I6QA 3MJ2A 5HIEA 4YGAA 1OUKA 4QRCA 5AV4A 2R3KA 3EQCA 4FBXA 4RIYA 3GCQA 2HOGA 3NVKI 2RSVA 3ACJA 2FB8A 3E62A 1WVYA 3Q9XA 4LG4A 2H9VA 2UW7A 5GIPE 3Q9WA 4Q9SA 3EHAA 2ZM1A 3LCSA 4ID7A 4I21A 3OCBA 2IVTA 4XHKB 3ZO4A 2E9PA 2VWXA 3KL8A 1YDTE 3VUDA 4CLJA 1OGUA 5DMZA 4FF8A 1LR4A 3FZ1A 4YO4A 5IMEA 4QTAA 4WBBB 3VBTA 3ZRMA 2VO3A 4BCFA 5CAVA 4BBMA 2ETMA 3A61A 3HUCA 3HV5A 3TZ8A 3FYJX 5CF6A 2W1FA 2HWPA 3DBDA 4GCJA 3LM5A 1YOMA 5GZAA 2OJGA 1P4FA 4I5MA 1QPEA 3V5JA 4E4NA 2ITYA 5EHYA 4HYSA 5DIAA 4D4VA 3FI3A 5HO8A 4P5QA 3HMMA 5AM7A 2XNMA 1OL6A 4XMOA 3I0QA 4PL5A 3ZO2A 4QMNA 2XA4A 2ZM3A 3R8ZA 3AXWA 4KIKA 4P4CA 4TRLA 4CQGA 3G33A 5IA1A 2YM7A 4IX5A 4F7NA 1IEPA 2JKMA 4EH4A 1W7HA 2YISA 3LXKA 3GU8A 3NEWA 2W1DA 2BUJA 5AJQA 5EM7A 2R7IA 4J52A 3RAHA 3VBVA 5IG1A 4QMZA 1JKSA 4YC8A 4DCAA 4EQCA 4KA3A 3UP2A 4A9UA 4OTPA 3F2AA 3QGYA 4KWPA 3H9FA 1NY3A 2ETRA 3H30A 3LPBA 3Q96A 4IZAA 4FUXA 3HA8A 4YHFA 3BYSA 4DEEA 5ETFA 3LKMA 3EYHA 4USEA 4QPMA 5EQEA 2ZVAA 2XNNA 3QD0A 1DM2A 2IW6A 4LYNA 4RC3A 2A4LA 4WO5A 2I6LA 2VUWA 3EJ1A 5LMBA 5M07A 4FICA 4S30A 1XKKA 5AP2A 3BBWA 4S34A 4GT3A 4HJOA 3NW7A 3RCDA 4JT3A 1Q62A 3EN9A 4I3ZA 3T9TA 4I6FA 3EFWA 3R9DA 5LVOA 3H0YA 3FI4A 4V05A 2DUVA 3UVQA 2ITZA 4EHVA 2V0DA 4LL5A 4M84A 3KXHA 4M14A 2XM8A 5KMJA 5A4EA 3MA6A 4BDKA 1YI6A 3BWJA 4BI2A 2XEYA 3KRLA 1GNGA 5HCZA 4N6YA 4L52A 4EH7A 5HE3A 4TWNA 3ZO3A 4F9AA 5IA0A 2O3PA 3ORTA 3OZ6A 5JRQA 2ZMCA 2CKPA 4FSMA 1U5RA 1WVWA 3QQLA 3TJCA 2YJSA 4D4RA 1KOBA 1LUFA 3A2CA 1PXIA 3MN3A 4WT6A 2A2AA 2BKKA 4FSWA 2FO0A 2GNHA 2B4SB 2C5OA 2QOCA 2PUPA 2UW4A 4J95A 1OB3A 3ZONA 3PPKA 4FTMA 1NVSA 3ZMMA 5H8EA 5J1WA 4J97A 3EL7A 4AE9A 1IRKA 3K54A 1SMHA 1YW2A 3GU4A 3A99A 5IDNA 4R7IA 3HAVA 4IBMA 4GEOA 4USFA 2YWPA 4CCUA 4B0GA 3UPZA 3JVSA 4WD5A 2PE1A 5DH3A 3NUPA 1IAHA 1J91A 3HV6A 3R9RA 5TOZA 4B8MA 4GUEA 2PL0A 2CSNA 4ONAA 2XNEA 2OH4A 3EZVA 1REKA 3W8QA 5E91A 1J7UA 4EJ7A 2BDWA 3DT1A 4UBAA 2C6OA 5HLWA 3NNUA 1CTPE 2X2LA 3M42A 5HEZA 2UW0A 3ZLSA 5DHJA 4KBCA 5IA5A 3C4CA 3O2MA 4RPVA 3FDNA 4PUZA 4IX3A 3R7IA 2O65A 4GVJA 1MRVA 1OKWA 5CSWA 3FMMA 3QD3A 3FPMA 5KHXA 2CCIA 4FIHA 2J0MB 2GS7A 4FL3A 5HKMA 4LQMA 3PIYA 3ANRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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