1V0OA

Structure of p. falciparum pfpk5-indirubin-5-sulphonate ligand complex
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
284
structure length
276
Chain Sequence
KYHGLEKIGEGTYGVVYKAQNNYGETFALKKIRLSTTIREISILKELKHSNIVKLYDVIHTKKRLVLVFEHLDQDLKKLLDVCEGGLESVTAKSFLLQLLNGIAYCHDRRVLHRDLKPQNLLINREGELKIADFGLARAFGIPVRKYTHEVVTLWYRAPDVLMGSKKYSTTIDIWSVGCIFAEMVNGTPLFPGVSEADQLMRIFRILGTPNSKNWPNVTELPKYDPNFTVYEPLPWESFLKGLDESGIDLLSKMLKLDPNQRITAKQALEHAYFKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of P. Falciparum Pfpk5 Test the Cdk Regulation Paradigm and Suggest Mechanisms of Small Molecule Inhibition
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Plasmodium falciparum
molecule keywords CELL DIVISION CONTROL PROTEIN 2 HOMOLOG
total genus 73
structure length 276
sequence length 284
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2004-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1v0oA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1v0oA01
3PJCA 4PUZA 4AZVA 1FPUA 2XMYA 2I40A 5KMNA 2FB8A 2X0GA 3OUKA 1MQBA 4MQ2A 3KK9A 3Q2MA 5AAFA 4BBFA 3MVHA 4HGSA 1M14A 4MXCA 4FOCA 4G3DA 4OTFA 5DR9A 3R8UA 2WFYA 4O7SA 4J99A 4I20A 4QP9A 4WSQA 2Y4IB 3K54A 5KKRB 1VZOA 3DB6A 3P79A 5DNRA 5B7VA 2XKDA 3GC9A 2R3QA 2J0MB 3R9OA 2ITWA 2XNBA 4FTRA 1H28A 2IZUA 3FUPA 2R3KA 2W1DA 4FGBA 3PZHA 3OVVA 5AADA 4LFIA 4W8DA 4BKJA 1UU8A 2P33A 4RRVA 4F9BA 4L00A 3ZDIA 1FBNA 4DFZE 1KWPA 3PXKA 5D12A 3LCDA 2XJ2A 3T8OA 4DEEA 2YM6A 2PZ5A 2QU5A 2X8IA 4BGQA 1J91A 4EK3A 3FXZA 3EOCA 5EYKA 5CX9A 4TRLA 5BYYA 4O2ZA 4BI2A 4USFA 2IZSA 4FSZA 2R9SA 4RIXA 1F0QA 2ITUA 4YNEA 2WTIA 3WZJA 2PZPA 4R6VA 1Q8YA 4RWLA 2Z7LA 3UGCA 2R3LA 1XBBA 3KL8A 4RJ4A 3KMMA 3DPKA 3AMAA 3VF8A 2IVUA 5CVFA 1ZOEA 4DH8A 3EYHA 3OXTA 4WHZA 4XP3A 2O64A 4K8AA 3CC6A 5GZ9A 2PVMA 5CQWA 3P78A 3PVGA 4ZZOA 5CVHA 4BTFA 4QMNA 2W99B 1SNUA 2W1ZA 5FRIA 1M7NA 3RK7A 3A4PA 3E8DA 3ZCLA 3KCFA 5TR6A 3SRVB 4DH7A 5A14A 3ZZWA 4ACMA 2UZWE 5M4UA 5HO8A 1PMNA 2BRMA 2ZOQA 3QWKA 3R0TA 4F63A 4MCVA 5KKRC 4ZOGA 3GCQA 1S9IA 3VUKA 3KCKA 4S31A 3VS1A 5AR5A 4FG8A 2WTCA 4B9DA 3LW0A 2PVNA 4JDIA 3W2PA 4UX9A 3KC3A 4X2GA 4WNPA 3QU0A 5FEQA 3LZBA 2I1MA 4BN1A 4FKWA 4XEYA 5A9UA 4XMOA 5I0BA 3QCYA 4U97A 4J71A 3SXRA 3A7FA 3G9LX 4HPTE 5CAQA 3UQFA 2Q0BA 5HBJA 2CGXA 2OJJA 4IC7A 4LYNA 5J9LA 2QG7A 1OVEA 3K5UA 4WRGA 3R7YA 2R3OA 5T3QA 3L8PA 3W1FA 5A4QA 2BAJA 3PRIA 3QGWA 3RCDA 3SOAA 4FEUA 2JGZA 2VTPA 5DMZA 5CALA 3FAAA 3BE9A 4MWIA 2JAVA 5HO7A 4EC9A 4G5PA 2WMWA 3R28A 2ACXA 3NGAA 4DCEA 4FNYA 5L6PA 1ZZLA 2XK4A 4EC8A 2B9HA 3ZSGA 1MRUA 5DIAA 1TQIA 5J1WA 5DA3A 2Z7RA 3HDMA 4GK3A 3ZO4A 4MKCA 4QT1A 4EOKA 3MA6A 3EH9A 1H26A 3CS9A 4BDAA 2UW4A 3MI9A 4UY9A 5EDQA 2HW7A 2R0UA 2W1GA 3R7UA 3W16A 1R78A 5LMKC 2OLCA 3KREA 2DWBA 4DFLA 4EEVA 3LJ0A 3RZBA 2JDVA 4PDPA 2ONLA 3CXWA 2W7XA 3UO5A 2GNLA 4O7NA 3B8QA 4GW8A 4L42A 4DEAA 3HP2A 3DBQA 4DT8A 1OI9A 3THBA 1OL2A 4ZTMA 4P5QA 3NYNA 2WD1A 4I24A 4EOMA 4XJ0A 2X7GA 4NJDA 5EKNA 2P55A 3MDYA 5IA5A 2C6MA 1OL7A 5E8SA 1MRYA 5IH6A 4PDSA 2C30A 3CCNA 4PL5A 3N4TA 5EI6A 1WBVA 4GJ2A 3N4VA 4YJVA 4L46A 4XV9A 3VNTA 5GIPE 4YHFA 5GZ8A 3TNPC 1PXMA 4JJRA 4R1YA 4ZY4A 2VNYA 1Z5MA 4E26A 4R7BA 4FEQA 3GB2A 4V0GB 2C5NA 3BHTA 3MPTA 1U5QA 3C4EA 2VGOA 4JL9A 3ZSIA 3W2SA 1NVRA 1PXLA 3I6WA 3LM0A 4FSYA 4BKZA 3BGZA 4RZVA 3EKNA 4ALWA 5E9EA 1OKYA 4IWDA 2E9OA 2W0JA 3G5DA 2W1FA 2BRHA 3FSKA 4HGEA 1VYZA 3SXFA 4C58A 1J1CA 2J0JA 4B7TA 3DXQA 3HX4A 4OTWA 1Q8WA 2A1AB 3BYOA 3VBXA 1UV5A 3LVPA 4F9AA 3NX8A 4ENXA 3KGAA 4IJ9A 4I5MA 3FPQA 4O2PA 3IO7A 4BKYA 1JWHA 2OXDA 3GFWA 2ITYA 3HYHA 5BPYA 2HWPA 3IDCA 4S34A 3RWQA 4S2ZA 2X9FA 5JZNA 3FPMA 2YIRA 5CXHA 2WMUA 3MFUA 2WQNA 2JIIA 4C4GA 3TDVA 3QTSA 4M12A 1PXNA 3W2CA 3TACA 3O50A 4BCMA 4QO9A 3R22A 2IN6A 4LRMA 4WG4A 1XH8A 2OBJA 4QYYA 2WXVA 3FLYA 1GAGA 3QD4A 5FDPA 4L3LA 5LVMA 3UO4A 3QWJA 3M11A 4OW8A 3AC3A 4FIGA 3EL7A 4FODA 3H0YA 2C3JA 3JXWA 4G6LA 2W06A 3Q96A 4XCUA 5IQEA 2NP8A 4TYJA 1NVQA 3LE6A 3ZH8A 4TYHA 4EWHA 4F70A 1YHWA 1WVWA 3HUCA 3OBJA 5K3YA 3LCTA 3UZRA 3GCSA 3GU4A 3ODZX 4J8NA 5AV1A 3HKOA 2JKKA 4CSVA 5M08A 3R2YA 4WD5A 4W4YA 4UMPA 1AD5A 2OICA 1P2AA 5LXMA 1H07A 3PLSA 5AP0A 4TWCA 2R5TA 2FVDA 4JNWA 5CT7A 4FV4A 3PA5A 4CMUA 1DM2A 4MVFA 5DN3A 4NH1A 4RLKA 5E8YA 4Z7GA 5IEYA 5JT2A 3WIGA 4QTDA 4CKIA 4M69B 3SAYA 4O84A 2OH4A 2Y4PA 4KAOA 3P4KA 4DEGA 3MB7A 4MQ1A 3RVGA 2QC6A 4Q9ZA 3VJOA 2GQSA 4DBXA 3VS4A 3UNZA 1CTPE 3FMEA 4X6RA 4P2KA 4FR4A 3TT0A 4L3PA 4IDTA 4Y8DA 5FUTA 1OIQA 3P08A 4I94A 4Y73A 2B53A 2Y9QA 3IW6A 2W5BA 3D15A 3MESA 4FTTA 3R8ZA 4JDHA 2B52A 3VUTA 3BYUA 4K11A 3KRJA 4BIEA 1GIHA 1ZYSA 4ZLZA 4Y95A 4DG2E 1NXKA 4AW2A 2UV2A 1Q61A 2J90A 4RX5A 5BX0A 4BYIA 5HO6A 1KOAA 2J0LA 4KIPA 3KA0A 3REPA 4JG7A 4WUAA 1XWSA 3LLTA 4F08A 1REKA 3BBTB 2OH0E 4J52A 1G3NA 5KBRA 4GH2A 5D9HA 4FBXA 4QTEA 3NMUF 1WCCA 1BX6A 3IOKA 4BHNA 5B0XA 3R8PA 4M7IA 2ZB1A 2YIQA 1Q8TA 3QTZA 5DT0A 3R9DA 3DV3A 4DAWA 3UYTA 4QMUA 4W8EA 5ETAA 3L8SA 2FYSA 5IUGA 3OFMA 4D58A 3UZTA 3A7HA 4J98A 2J51A 5FWKK 3WF6A 5LJJA 4YLJA 1UNLA 3MJ2A 3QLFA 5EI2A 2XCKA 3QCQA 4IB5A 2FSMX 2VWYA 4K1BA 1LEWA 4MYGA 1BL6A 2OZAB 4HYUA 3R00A 4IB0A 3IW5A 5IEVA 2ZVAA 4FTJA 5CANA 1SMHA 3EFLA 1GZ8A 5FTQA 2CDZA 1GZNA 1BUHA 4WUNA 3TDWA 4EUTA 4QQ5A 2CLQA 3P23A 2JLDA 4O1OA 4R3RA 3ZLWA 1DI9A 3V5LA 2BKZA 3D5UA 4C4JA 4D0XA 4MH7A 4HVGA 3LKMA 1OITA 2PVYA 3OC1A 4CG9A 3W8QA 5M56A 4HNIA 4GVJA 3FKLA 2C68A 3ELJA 3NR9A 4R1VA 3FMJA 5BVWA 5EM8A 3ZLSA 4BYJA 3UOLA 2IVSA 3OCBA 5JK3A 5LVPA 3BI6A 2ZDTA 3II5A 3W33A 3TIZA 2ZV8A 5FQDC 3QF9A 4MBJA 1M17A 4I0RA 4AS0A 4YR8A 3ZOSA 4OTQA 4XG4A 5J95A 5IQHA 5A4LA 3TN8A 3QCSA 5E8UA 3EQBA 1ZXEA 4UALA 3BBWA 5JZJA 4N70A 4FTAA 2X1NA 4FKTA 2GTMA 3SV0A 4AW1A 4KKGA 1FVRA 3DNEA 4RQVA 5C27A 3OBGA 5BVFA 3L1SA 3S95A 3ZRKA 3TKHA 3CP9A 3UQGA 1G5SA 4DFYA 5IA4A 5B2MA 1K9AA 1Q97A 1RW8A 3QFVA 4HZSA 5AWMA 2VO0A 1PF8A 4C61A 5M4FA 3SGCA 4F6WA 2C1AA 4OTGA 1Y6AA 3BIZA 4O21A 5AMNA 3Q4CA 4G5JA 3PIYA 4LUDA 5HVJA 3ZMMA 4YSJA 5C4KA 3QKMA 5FTOA 4CCBA 2JITA 3BLRA 4Q2AA 3UPXA 2VRXA 3VS3A 3LJ1A 3NYOA 4JX7A 3QL8A 4M8TA 3FKNA 5DPVA 2VO6A 3QRIA 2ZM3A 2PE0A 4ANOA 4B0GA 5HLPA 5IQCA 5FDXA 2UZUE 5K0KA 4EWQA 2AYPA 3FQSA 3QD2B 4XBRA 1URWA 3Q4TA 4OUCA 2R3JA 4ZJVA 3AC4A 4S32A 1Y91A 1PYEA 3Q4ZA 4Z9LA 1OUKA 3DKGA 3GC7A 4DTAA 1APME 4QMLA 4DEDA 5J9YA 4FV0A 1O6LA 2GS2A 3DTCA 4MWHA 3PFQA 2YERA 1ATPE 3UNKA 3SQQA 4FK3A 3KFAA 3BRBA 5IPJA 2BR1A 4AZTA 3TM0A 4O7VA 3CIKA 2VX0A 2XS0A 4PNIA 3RHXA 2VWBA 3EWHA 1RQQA 4Y5QA 5CTPA 5ANIA 5C8KA 5C8MA 2VU3A 3GC8A 1VJYA 3EIDA 1YW2A 2FO0A 4FICA 4AP7A 3QUEA 4FSWA 3NUUA 2ITVA 5JQ8A 2BDFA 3R04A 2FA2A 4QMYA 1Q24A 4LOPA 3RMFA 2XRWA 5CAOA 5HIEA 3E88A 1H24A 1OL5A 2X7FA 2X8EA 3QKKA 4QMMA 3ZO1A 4CZTA 2IO6A 2W4OA 1VYWA 3H9FA 1M2RA 2BTSA 4CFNA 3QRUA 3C51A 3FEGA 3P9JA 3HAMA 3O7LB 3S1HA 2IG7A 5AX3A 4QQJA 2GPHA 3OY3A 3DT1A 5HX8A 2G2HA 3WE8A 2AC3A 2W9ZB 4RJ6A 4X2NA 4FSTA 1ZRZA 2VO7A 4AQCA 5CEKA 5ANGA 3FY2A 3QHWA 5DR2A 3UPZA 2X81A 2V5QA 1FGIA 3V5WA 3COIA 4EHZA 3UIXA 3LMGA 2QU6A 4MD8E 5IQBA 3NVMB 5KE0A 1UU7A 3O23A 1SVGA 4Y5HA 3O7LD 5L8KA 4YC6A 1JQHA 2Y8OA 3UOJA 2A0CX 3NS9A 3MA3A 4NCTA 1ZY4A 5HGIA 1RJBA 4ZTNA 4NTTA 5CEMA 3AGLA 4XP0A 4D4RA 1PMEA 4X21A 3VO3A 4D1XA 3QQUA 4YZCA 3C4CA 4C37A 2CKOA 1FQ1B 4JG8A 3KY2A 4K2RA 2E2BA 4RWIA 3WYXA 3ZM4A 4B8LA 4ASXA 1FVVA 3L9LA 2JDSA 3D2IA 4BY9E 3MFTA 3TZMA 3ORIA 1ZMWA 3MB6A 1G8SA 1ZYCA 4AT3A 3SG8A 3I1AA 4F1TA 4LGGA 3D4QA 4MF0A 5AUUA 3ACJA 5AP5A 5KHXA 4FZFB 3PLAE 4YLKA 4YZMA 3MY1A 4I5HA 2HZ4A 3IKAA 4CLIA 1I09A 5I9UA 4ASDA 4EOPA 4Y46A 2JD5A 2XKFA 3I6UA 3OW4A 1JKKA 3WARA 4OR5A 5KUPA 3EN5A 3FI4A 4EJ7A 4OBPA 4R3CA 4F1MA 3F2RA 3DGKA 4JQEA 5M51A 3KKVA 4BHZA 5CF4A 2CJMA 2UW5A 2P2HA 4YBKA 2GHMA 4W4XA 3FZTA 2BVAA 1KE6A 2E9NA 3ZHPC 4ACCA 4CMTA 4E73A 4ENYA 2NNWB 4MX9A 4M69A 3ZEWA 3IW7A 2PUPA 4IM0A 4O83A 3OT8A 4WNKA 5CSXA 4FKIA 4RWKA 3OCSA 1NVSA 5EQYA 1XHAA 1Z57A 5HD4A 4LRJA 3TEIA 3AC2A 4U9AA 3WF5A 2H34A 2R3NA 5M09A 1KV2A 3MIYA 3OT3A 4PQNA 4ZK5A 4B99A 1E9HA 3V6SA 4KNBA 5IKWA 2I0HA 5CAUA 1LP4A 4USEA 4R5YA 3C4FA 2HZNA 4IH8A 4X3FB 1KE9A 5EFQA 5CAVA 5M4IA 4FL2A 5EQEA 3PG1A 3RALA 3VUGA 2C6LA 2PUNA 2WAJA 4PTEA 5AP3A 3E63A 5HD7A 5AA9A 4XG2A 5EG3A 1XR1A 4JQ8A 4AZEA 3EJ1A 1PHKA 4EL9A 4EI4A 3BLHA 4DEHA 3VUHA 2HENA 2YITA 3JPVA 3OWKA 5CI7A 5L4QA 2CLXA 2CNUA 1W98A 3PIXA 4YJRA 3C7QA 5IDPA 1FMKA 1SVEA 3O17A 5CSWA 5HKMA 2F7EE 3ZBXA 3PY1A 5K0XA 4RJ7A 3MVJA 2O63A 3NW5A 3R2BA 4X7QA 5E8WA 1MQ4A 3UVPA 4NT4A 4U44A 4KS7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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