1YDSE

Structure of camp-dependent protein kinase, alpha-catalytic subunit in complex with h8 protein kinase inhibitor [n-(2-methylamino)ethyl]-5-isoquinolinesulfonamide
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
336
structure length
334
Chain Sequence
VKEFLAKAKEDFLKKWENPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVKHMETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKDGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of catalytic subunit of cAMP-dependent protein kinase in complex with isoquinolinesulfonyl protein kinase inhibitors H7, H8, and H89. Structural implications for selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords C-AMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Bos taurus
total genus 109
structure length 334
sequence length 336
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 1996-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1ydsE01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1ydsE02
2UW8A 4DH1A 2IZRA 4UV0A 4ZK5A 1QPEA 4TWPA 2ZMCA 3IW7A 5BYZA 1O9UA 3VS6A 2ERKA 4DINA 4JL9A 3UPXA 5DMZA 3TKUA 1Y6AA 2HW6A 2ZYBA 1JKTA 1TQMA 4IBMA 4R3RA 4IEBA 1UU9A 3BRBA 4RWLA 1M7QA 3UOKA 5KHWA 2FO0A 2J50A 4S2ZA 2HELA 4IDVA 5DRDA 5LCJA 5IU2A 5B2MA 5CT7A 3EN5A 5F4NA 4D4VA 2BAKA 3QCXA 1XKKA 4QQCA 3HECA 1PMUA 4AW2A 4DT8A 1JWHA 5J1WA 2PULA 3OOGA 5TO8A 3QRJA 1BL7A 1PHKA 3FAAA 5CNOA 3RWPA 3VUTA 5LQFA 5AUTA 3AD4A 4X6QC 4IB5A 2C47A 1BI8A 3ZO1A 5IA1A 4HNFA 5CASA 1TQPA 4O0RA 2ZOQA 3CTJA 1GZ8A 2OGVA 3R9NA 1Q8YA 2YERA 5ANJA 3KCFA 3LJ0A 3JVRA 5J9YA 3SRVA 5AUVA 3D7TA 3ATSA 5L6OA 4YC3A 3ZC6A 4AOTA 4C0TA 4OTIA 1OITA 2JKOA 3C7QA 3NUUA 3OC1A 4OT5A 2VX1A 3QXOA 1PXNA 3BHVA 3DNEA 3EJ1A 5AUUA 4PQNA 3P08A 5G6VA 2OF2A 2RGPA 2RKUA 4RVTA 3QZFA 2ZV2A 3F6XA 3O8UA 4GS6A 2O64A 4JJRA 4X2GA 4ZY6A 3V5JA 4RX5A 5E9EA 2HWOA 3MTLA 5BVDA 1Y57A 3NW5A 4ANSA 5M4FA 4Q5HA 1UA2A 3RK7A 1YDTE 4BDFA 2WFYA 4W4WA 4GEOA 4QQ5A 4UMPA 2HIWA 4D58A 3CCNA 4OTFA 4F7JA 3D5XA 3F7WA 1HCKA 3S3IA 5ANOA 4BYJA 4HCVA 3RALA 3UIMA 3W32A 3BHYA 4AE9A 5HG8A 2YIQA 1OKYA 4FG8A 4J71A 5EHLA 4AX8A 4EOLA 5HQ0A 1CKJA 3B8QA 3DBQA 4H1JA 5A14A 5J9ZA 2YM7A 5HO8A 1P4OA 4DG0E 1H0WA 1W84A 3IG7A 4BDIA 3SXSA 3QTUA 4BTJA 2PU8A 5KBRA 3BI6A 2JD5A 2OZOA 4ZEGA 4FC0A 5EK7A 5GJDA 5A4LA 4FKPA 4FX3A 5DLSA 3SAYA 3LCDA 3HA6A 5C03A 4C4JA 4EK6A 4RWIA 2OW3A 4OT6A 3HUBA 4EUTA 3DS6A 4YZDA 3MFTA 5ANEA 2C30A 4QOXA 5KKRC 4DTBA 4I22A 4F08A 3COHA 3VUGA 3R00A 4EYJA 3C9WA 3OWPA 4EQMA 3WOWA 4UZDA 4TT7A 4KIKA 3Q3BA 3LFSA 5CVHA 3E3BX 4D5HA 3FY0A 5K5NA 3ORZA 3E88A 2V62A 4RC4A 3NS9A 3VULA 3PWDA 4EL9A 3GP0A 3RM7A 4FGBA 3TL8A 5AUYA 4UXQA 3NW7A 3ZOSA 1KUTA 2O5KA 4YURA 4UYAA 5IQFA 5DRBA 3SDJA 2B4SB 4IHPA 2VTOA 4CFUA 1M7NA 5IUGA 3SG8A 3F2AA 5CEQA 4G31A 4IW0A 1Q24A 5L6WL 4N6ZA 4FKJA 3EN4A 5HBEA 3RPSA 1XBAA 1WBWA 3AC1A 4UEUA 1KE6A 3E64A 4TYHA 3VS0A 3VWAA 3ZBFA 2VO3A 4MX9A 4EUUA 4RC3A 4TL0A 4G3DA 3V51A 4UMUA 5C1QB 3D94A 2XYUA 2R3NA 4JI9A 5C8MA 2O65A 4J95A 2W99B 3LXLA 3I7CA 3ZRLA 2GNHA 3NNXA 4Y72A 3MPTA 4QP3A 1PY5A 5CI7A 4EYMA 3DKOA 4PMPA 5BVFA 2G2IA 4WG3A 3KL8A 4ONAA 3MV5A 2UW9A 4RA5A 3S95A 4LRJA 4RIYA 5AP6A 2W1EA 1M17A 2Y4IC 4TKSA 3FPQA 1BLXA 5M44A 5BVOA 2Z2WA 3GGFA 3ORKA 3QQUA 4LV8A 5CANA 3QRUA 4EK5A 4F9AA 2QO7A 4RQVA 4D2RA 1ERKA 3LE6A 1JSTA 2IZSA 3JY0A 4C59A 5LVOA 3CQUA 3H0ZA 4MXCA 5FUTA 2OJJA 3VUDA 3WF5A 3H0YA 3RVGA 5CWZA 1M2PA 2WPAA 3IPHA 3WZJA 4N70A 5BYYA 2IN6A 4W9XA 5HU9A 2ZM3A 3LLAA 2R9SA 3FBVA 4ZLYA 1ZYSA 3GT8A 4LYNA 4C2WA 4U42A 5EFQA 3HV7A 3MI9A 5AV2A 5KO1A 4L00A 3QQFA 5AV0A 3CP9A 2V5QA 2XNGA 5E1SA 3UP7A 4MHAA 4C4IA 5K9IA 4R1VA 4C8BA 4FOBA 2HXQA 2YIRA 2GTNA 4FV9A 4FVQA 3ETAA 1PXLA 4HOKA 3D15A 3SOCA 4D0XA 4KAOA 4FK3A 5H8GA 3RHKA 4IM2A 4CTBA 1KE7A 2WIHA 4HYIA 3ZCLA 1LUFA 4BGHA 3DT1A 1U5QA 1ZYCA 3NRMA 2B0QA 2YM6A 4LMNA 4O0YA 4ASDA 3I7BA 4HZRA 2UZTA 3BIZA 2J9MA 3R9HA 4ANMA 1XHAA 3QCYA 2YIXA 1PF8A 3SXFA 1DM2A 3EQIA 1K3AA 4USFA 4PP9A 3DKFA 4ZY5A 4EJ7A 1BKXA 4QP2A 2G9XA 4MWHA 5M57A 4RG0A 4FSQA 3QL8A 2XIYA 3ZZEA 3TUCA 5DE2A 3SG9A 3IOKA 3N51A 3MDYA 3ZO3A 5KMJA 3HDMA 2PSQA 1ND4A 4EC9A 4OTRA 4BWPA 4PDYA 4E6QA 5JFVA 4FSYA 1WVXA 3C0GA 3DZQA 4BDGA 5C26A 4Q9SA 4FUXA 5E8ZA 2A19B 2EXEA 3FMLA 3TTIA 3DLSA 5DPVA 4AGDA 4KKGA 1H08A 1GAGA 4PTCA 3OEZA 4YJVA 3LOKA 4IQ6A 1DI9A 1ZYDA 2JFMA 3ZSGA 1K9AA 3EFKA 4FL3A 4QPMA 2FVDA 3F3TA 4F9WA 4UWCA 3P9JA 3MPAA 4YGAA 3I81A 2ITVA 4QYYA 4V04A 3Q4CA 3F5GA 3MESA 3RTPA 3ET7A 4JIKA 1JOWB 5J87A 3QBNA 1PKGA 4R7IA 4BIBA 3PJ1A 3MA3A 3RGFA 3OY3A 3R9RA 3MVHA 4O2ZA 3REPA 4I0TA 4IZAA 4FKSA 4YZ9A 2YN8A 3BGZA 1QCFA 3GOKA 4HVHA 1M2QA 1ZMWA 2X2LA 3FZOA 3POZA 2X7GA 3THBA 5FEEA 4F70A 4F0GA 3BEAA 5D41A 3BQCA 4F7NA 4L68A 2UZUE 3ORLA 5EDQA 5I5ZA 3PJ3A 4IAZA 4K2RA 3UMXA 5IPJA 3W2OA 4DFLA 4EHGA 2X4ZA 2GQSA 3VO3A 1YW2A 4L3LA 1WFCA 3QXPA 4GG5A 1H00A 4B7TA 5IISA 4FV2A 2ZV7A 4ZTHA 3P78A 3FQSA 4YSJA 2ZMDA 3DU8A 1VYZA 2Y6MA 3UYTA 5AP4A 4FEUA 5BNJA 4Z9LA 4Y5HA 4A4LA 4II5A 3PTGA 3D4QA 3OMVA 3GU4A 3FEGA 2QU6A 3PG1A 4I6HA 5DVRA 3V5PA 5BVWA 4RVKA 4XCUA 3HVCA 4HPTE 4UMQA 3FLQA 1P2AA 2WEIA 4AOIA 5L6PA 5CU3A 2RSVA 3EN6A 3PP1A 3KXGA 5EM6A 5KUPA 2QOQA 2F7EE 2QR7A 4ZZOA 2UZWE 4CXAA 3U6HA 4ZZNA 2XK3A 4IFCA 4UBAA 3P0MA 1S9JA 1SM2A 2GS6A 2NO3A 5IA2A 3IW5A 3PLAE 1H27A 3PXQA 4OTGA 4QP4A 4D1XA 2C6KA 4C38A 1UWHA 4NTTA 3FWQA 5E1EA 1B6CB 4YJNA 5IQCA 3C0HA 4I94A 3PY0A 2X2MA 3O50A 4BHZA 4CMTA 3HAVA 1Q8ZA 2XJ2A 3EFLA 3AT3A 4A4XA 3N4VA 3BPRA 4DGLC 3QCQA 1G3NA 5AR2A 5F94A 5B0XA 4MBIA 4ASZA 3RHXA 4L9IA 2UVXA 5L2WA 3OW4A 5BMMA 5AP7A 3Q2MA 4O7WA 3V8TA 4PTGA 4OBQA 4QMOA 3R9DA 3ZRMA 3O7LB 2QURA 2Z02A 3OP5A 4O81A 4BBFA 1OB3A 3T3UA 2J7TA 4HZSA 1H07A 4PRJA 3O17A 2IVVA 4J98A 5HIBA 2VTSA 5ACBC 2YAAA 4EQUA 2ZVAA 5HE1A 5HX8A 4GK2A 4JQ7A 3T9IA 3NYOA 4N0SA 3FMHA 4H3PA 4EH8A 1Q8TA 4FV5A 4E1ZA 4IC7A 3PFQA 4O7TA 5LOHA 4YNEA 4TY1A 3R9OA 3LXKA 4NKSA 3CGFA 1J1CA 2WEVA 3A4OX 1CTPE 2OG8A 4MF0A 3MIAA 5A46A 4DF3A 4KNBA 3S2PA 4ZLOA 4YZMA 4RLKA 3KRJA 4KIQA 3LCSA 2WMWA 4JAJA 5E8VA 3QCSA 5AR4A 3W1FA 4QD6A 4AUAA 2FYSA 4AA0A 5EI8A 1JKKA 4G6LA 2IPXA 2BIKB 3AC4A 4WNMA 4FSWA 4QO9A 5JZNA 5LVPA 4PF4A 3LCTA 3SQQA 4C61A 4DH5A 1DI8A 3EQFA 4FI1A 3COKA 2OK1A 4I5CA 4WG4A 4AZEA 4BCHA 3W2SA 5CS6A 4OLIA 5HG7A 4RFYA 2ITZA 4XP3A 3ORIA 4LL5A 2B7AA 3VHEA 3U4WA 4XEYA 4DE4A 3NMUF 4J96A 4W4YA 4AW5A 4BTMA 3QC4A 4ZZMA 4BZNA 3QFVA 4K1BA 5BUEA 1QPCA 3P1AA 3A2CA 3QA0A 5GNKA 3O23A 2CGUA 1CSNA 2Y8OA 4RPVA 3ZSHA 3C4FA 4RX8A 4IMYA 2GU8A 2BRHA 2EU9A 4IWDA 2VTTA 3IOPA 4C7TA 2CLXA 2ZM4A 5E8UA 4QP9A 4MYGA 1L8TA 3PIXA 3CQEA 4O6LA 5J7BA 2BCJA 3A7IA 2OIBA 3SRVB 3D7TB 1MUOA 3P7BA 4I5HA 3CY3A 2CN8A 3P4KA 1G8SA 5EQYA 4ZSAA 2R4BA 2XKDA 3QLFA 3KXHA 3KXXA 2W06A 3ZLWA 4F9CA 3E92A 3IW6A 5E8TA 3UOHA 5J95A 2E9PA 3R83A 2B1PA 3RNIA 5LWMA 1ZY5A 3CJFA 4FKLA 3C13A 5AUZA 4F65A 2H96A 3F66A 4MKCA 4EK8A 1GZKA 3AMYA 3VUHA 5I3RA 2QI8A 4ZJJA 3AG9A 2PPQA 2SRCA 4O2PA 4O0SA 4YO4A 4IM0A 2XK8A 2OFVA 3T3VA 1FMKA 3DJ6A 4FSNA 4NFMA 5JQ5A 2PVFA 4U9AA 4M0ZA 1LEZA 2W1CA 3FJQE 4EJNA 3NNUA 3Q52A 3QTZA 5GINE 4JR3A 4O1PA 2E9VA 3ZO4A 3ZC5A 4IAAA 4U3YA 4EORA 4LMUA 1CM8A 2GMXA 3AMAA 4BZOA 3LCKA 5CTPA 5EM8A 1XH9A 4GKHA 4XLVA 3AD5A 3S00A 2J0IA 2WMRA 1CKIA 4QMXA 1JAMA 2E2BA 2JBPA 2BDFA 3HUCA 5GZ8A 3MH0A 4D2TA 4TWNA 2I0EA 1OBGA 3QALE 3IW4A 2J51A 1SMHA 4D9UA 3LFDA 4RX9A 5CLPA 3F61A 5IQDA 2W9ZB 4O83A 4JBPA 2YEXA 3BE2A 1R1WA 1IRKA 3IGOA 3O7LD 3L8PA 3OBGA 2YM3A 2XM8A 5HGIA 3ZFYA 5HLNA 5J5TA 2PE0A 3DK3A 3UQFA 3BE9A 2WTCA 1SVHA 3QQKA 3HMPA 4F4PA 1PXOA 3QTQA 2XNPA 4C4HA 5TT7A 3NEWA 3FY2A 4CT1A 4FEVA 3L9LA 3ROYA 5JFSA 1R39A 3OCGA 4HGLA 5LVLA 3CR0A 1OIRA 4FK6A 3P7CA 4S33A 3RZFA 4Z55A 2YWVA 4FBXA 4I23A 4XG8A 3GCVA 4AQCA 4KIKB 2IVUA 4ORKA 1U5RA 1Q5KA 1Y91A 4XBUA 3PLSA 4FT5A 3K5UA 4QMMA 5H9BA 3W2CA 1H4LA 3HMNA 3PA4A 4HGEA 4GKIA 5AIRA 3UO4A 3DBEA 3NCGA 2GNIA 1RE8A 5KE0A 2C5XA 1NVQA 2B9HA 2LAVA 5M4UA 3ZYAA 1Q97A 2WMQA 4PDPA 4B6LA 4C2VA 1A48A 5ANIA 4EK3A 2YCRA 3V8WA 4TPTA 4ERWA 2CNVA 3RCJA 4L7SA 4FNYA 2V22A 3KGAA 5BUJA 3FI4A 2PMOX 3MVLA 5CU2A 4FEQA 4TYHB 1CKPA 2EXCX 3OOMA 4I0SA 2W5HA 4BWXA 5C4LA 3AT4A 2QHMA 3V8SA 4CRSA 5LMBA 4IB0A 4KRCA 1URWA 3ZEWA 3WE4A 2JIUA 3I5ZA 1STCE 2PVLA 4ZOGA 3E8CA 3IS5A 4MVFA 4Z16A 2UZEA 1V0BA 4U5JA 4MK0A 3KRLA 3UJGA 3OUNB 4E26A 3QQJA 4GFOA 4NJ3A 4C35A 1NW1A 2H34A 4LL0A 5FWKK 5L4QA 3HV5A 3BBTB 2UZNA 4EQCA 2J6MA 2IWIA 4KKEA 4O38A 4RIYB 3FI3A 4P7EA 1YXXA 5CF8A 2QC6A 4FZFB 1KOAA 3VJOA 5BQ0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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