1YOLA

Crystal structure of src kinase domain in complex with cgp77675
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
278
structure length
256
Chain Sequence
AKDAWEIPRESLRLEVKLGQGGEVWMGTWNGTTRVAIKTLKPGTMSPEAFLQEAQVMKKLRHEKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGSLLDFLKGETGKYLRLPQLVDMSAQIASGMAYVERMNYVHRDLRAANILVGENLVCKVADPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMVNREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHDLMCQCWRKEPEERPTFEYLQAFLEDYFTSTEPQYQPGENL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structures of active SRC kinase domain complexes
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
total genus 79
structure length 256
sequence length 278
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2005-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1yolA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1yolA01
5CEIA 4U0IA 1MRYA 1APME 5JGDA 3F88A 5E8VA 2V55A 2CMWA 5IQFA 2OJGA 4PMMA 3D5WA 3OUNB 1FVVA 3PYYA 4X0MA 4C4GA 2PZRA 4ZK5A 4DLJA 3K54A 5DT4A 2ZOQA 5I9UA 2GQRA 4D1SA 3BHYA 4F1OA 1ZMUA 2X4ZA 5IUHA 3DBEA 4W4WA 3CQWA 2C3JA 2EB2A 3N4VA 1OMWA 4UB7A 4Q2AA 4Y95A 3UDBA 3TEIA 3RP9A 4GK3A 3BYOA 3QYWA 4X2KA 4XOZA 4ANLA 3ZLXA 2YITA 3ZC5A 3BU5A 5DFPA 2HZ0A 4KRDA 2XK8A 3OBJA 3TKIA 1XH6A 5EW9A 3DA6A 3ZZEA 1W0XC 5BVWA 3FPQA 4BCHA 3A7GA 3ORLA 3U9CA 2WTKB 3PZHA 3GOPA 4MVFA 2C5XA 3OZ6A 4KS8A 1KE7A 2Q0BA 1H00A 4E7WA 5E4HA 1VYWA 3QRUA 3ITZA 1REJA 4O91A 4D2WA 5ANEA 4X6QC 5D41A 2Y7JA 3VUKA 1YI3A 1J7LA 3GCVA 2Y4IB 5F20A 4O1PA 4C38A 2W4JA 4KKEA 4JBQA 4RGJA 3G9NA 3EQRA 5A54A 2JC6A 3DAJA 3IQ7A 1CKPA 2GHMA 4LMUA 1H26A 5HG5A 3BU6A 4AUAA 3KGAA 4FT5A 3C4EA 3ORXA 4GT5A 3MBLA 2OIDA 3R7UA 3EFKA 4QMVA 3T8OA 2Y4IC 4RT7A 4U97A 3LCDA 3FY2A 2NNWB 4ZJJA 3I0QA 5L6PA 4IEBA 3W8LA 2XF0A 4HZRA 3ZBFA 4RZWA 3DAKA 2BZIB 3TI1A 5GIPE 5IQDA 3FQEA 3HRFA 4BYIA 1WBOA 1QCFA 4M0YA 4XG7A 3LLTA 4RC2A 3N4TA 4UEUA 2IZRA 5AA8A 1JLUE 2Y0AA 4C62A 4FIIA 4KABA 3U9NA 4E8AA 3WF7A 3PZEA 2RG5A 4KD1A 5T6KA 5LMKC 1UA2A 2WMXA 3F2AA 4EYJA 4EC9A 4IAKA 2XBJA 4FK3A 4KSPA 4RX5A 4EEVA 2C68A 2WMAA 4ANNA 2QOHA 4D5HA 4F7JA 5KBQA 1ZY4A 3L8VA 2WQMA 4FNZA 4F70A 1X8BA 3H9FA 2YWPA 4RIOA 3CY3A 1OUYA 4RC3A 5EG3A 4U3YA 2VUWA 3QTSA 4IMYA 3F2RA 4EUUA 2IZTA 4YHJA 3D9VA 4YJPA 2BAQA 2UZLA 4OTWA 2ZV7A 4FTAA 3VS4A 4L9IA 3LXPA 4IVBA 3QD2B 3NIZA 3W2CA 3I6UA 4HGLA 4NM5A 2PZIA 4UV0A 3QFVA 4FSUA 4K9YA 3VBWA 4A9UA 4D5KA 3TT0A 5KMLA 4J53A 5AR5A 4CFNA 3CE3A 3PFQA 2Y6OA 3KY2A 3OXIA 4JRNA 3VAPA 2BRBA 4GFMA 4EHGA 3ZUUA 5BVNA 4BIDA 1H1RA 2Q0NA 4PTGA 4WNKA 5M07A 4I94A 4V01A 4AT4A 4U80A 5E91A 5EKNA 3QZGA 2QHMA 4YTCA 3ROYA 3BV3A 2YWVA 4JQ8A 5DR6A 2J5EA 3V6SA 3GENA 3O17A 5JFXA 5C01A 4EUTA 4CYIA 3OFMA 3I4BA 4TRLA 4JRVA 3EYGA 5CF5A 5ITAA 3UODA 2AC3A 4YO4A 2E9PA 4AOIA 4YSJA 3V8SA 2VWWA 3F3ZA 2JITA 4Z7GA 3VUMA 2C3LA 4WA9A 4XG2A 4ZY6A 4BR3A 4PY1A 1A06A 4FNYA 3CD8A 4FVRA 1AD5A 2QCSA 4NW5A 3VW6A 2QOOA 3A99A 4YZ9A 4JNWA 5CEQA 1FMOE 2ITQA 2PE1A 5AR2A 4CCUA 2X7FA 4QMLA 5DG5A 3BIZA 4ZAUA 5CSHA 4M15A 4CXAA 4I5HA 5CTPA 2YIWA 2Z2WA 3FKOA 4ANBA 4A07A 2A1AB 2UW5A 2RFEA 3KVWA 3HEGA 5HO8A 4E6AA 1CM8A 4JG7A 4QYGA 3UMXA 2PMNX 5AUXA 5DIAA 2ZDUA 5GJGA 5CALA 2UZWE 3MB7A 2WAJA 2X6EA 5JN2A 3E8NA 2ONLC 1XJDA 5KO1A 2QOCA 3KREA 5HVJA 4GUBA 1BLXA 1H0WA 4BDAA 1BMKA 4FT3A 4ONAA 3VBVA 4D0WA 5CEKA 5I9WA 5IDPA 3NCZA 3IECA 4WD5A 3HZTA 3PLAE 5AV2A 4F65A 2VTJA 4UXLA 3TJDA 2PULA 2UW8A 1F3MC 3OF0A 2C6MA 3D2KA 4IZYA 1ZZ2A 5AWMA 2CCIA 4QMPA 5J95A 4TWOA 1JBPE 3HX4A 3RK5A 4U40A 2AYPA 4F64A 3QLFA 5M09A 3BHUA 2XRUA 4IZ5A 5H9BA 3RTPA 3E3BX 2E9NA 2UUEA 2XM8A 3ORMA 3QYZA 4QMYA 3WF8A 1Q5KA 3WZDA 5A9UA 4A7CA 5ANOA 1M2RA 4USFA 3KRLA 2WMUA 2G2IA 2W5AA 1WVWA 3E92A 4IX3A 3GP0A 3DT1A 2J50A 1FBNA 1LUFA 2PPQA 2IVUA 1OIUA 4QT1A 2WMTA 3IW5A 2F7EE 3IW8A 3MIAA 5M55A 4G9RA 3S4QA 2JFMA 5DEWA 3SAYA 2E9VA 3MTFA 4C3RA 4P5QA 4E1ZA 3R9DA 4MYGA 5BUIA 4CZYB 3LFQA 4APCA 4AXAA 2J6MA 1YOLA 3F3UA 4I93A 4ZOGA 3TCPA 2PMLX 1IAHA 3CJGA 1IA8A 4FK6A 3BV2A 3LZBA 3TUBA 4RIWB 2NO3A 1LEZA 4IM3A 2GFSA 4RMZA 3WF9A 2A4LA 4W4VA 4F9AA 1B6CB 3QQHA 4BZOA 3DZQA 3WF6A 3UVQA 4QP8A 3RM6A 2HXLA 1SVHA 4XRLA 4FE2A 1YXTA 2NRYA 3OWLA 5LXMA 3SRVA 4J99A 3CXWA 2WQNA 4EOLA 3FEGA 3M11A 3UIUA 3KRJA 2QKWB 4CGAA 5JK3A 4BCGA 5BYZA 5AUTA 4TYHA 3TUCA 4J96A 3VJOA 5BYYA 5KNJA 3EZVA 1R39A 3BHVA 1PMUA 4OT5A 4Y5QA 1CKJA 5AX3A 3R8MA 4CEGA 4CT2A 1PJKA 4JLCA 4DEIA 4DN5A 3OCSA 2Y8OA 5KE0A 4I24A 4HCVA 3I60A 2VTRA 3EFWA 3KF4A 3KXXA 3QTZA 3NNWA 3UOJA 4KBAA 2HZIA 2HELA 3OUKA 3ORTA 5ANIA 5IA3A 3DDQA 2XZSA 3TIYA 1SNXA 3LFFA 4Q5EA 3QF9A 4MXAA 4F6WA 3QUEA 3QTUA 3GCUA 5IEYA 1HOWA 4AF3A 3Q04A 4BI2A 3QQLA 4N6YA 3DB6A 4NM0A 2OLCA 3LM0A 4ZTSA 3F5XA 3RNIA 3DBFA 5BVDA 5CY3A 3R7YA 5KKRB 3OXTA 3U4WA 5KMIA 4W8DA 2IN6A 3D0EA 4GJ2A 5DOSA 2VTOA 4HCUA 3TV6A 1M14A 2CHLA 3FPMA 3KFAA 4RLKA 5A4EA 4I6BA 4CFXA 3MTLA 3EQGA 1BI8A 3WOWA 2OH4A 4ZSGA 4MD9E 3IKAA 3DXPA 1KE6A 2YLFA 3H9OA 5GINE 4IH8A 5LQFA 4FTQA 5A3XA 4AN2A 2XS0A 4XG3A 5CSVA 2WB8A 3G33A 3SOCA 2IWIA 5KZ0A 3VF9A 2QD9A 1STCE 5EW3A 4BY9E 2I6LA 3OXZA 5TKDA 2OBJA 2VRXA 4XUFA 5D7AA 3MPMA 4YZMA 4FOCA 2CGWA 3PRIA 3NPCA 2CN5A 3HUBA 4FX3A 3PXZA 5IUIA 4MWIA 1W7HA 3PXYA 4DGOA 2XNPA 2O65A 3LQ3A 3R7OA 3KMMA 4I4FA 5B0XA 3AD4A 2VTNA 4HGSA 4NH1A 2QOBA 5IDNA 4HW7A 5J5SA 4GG5A 4QQJA 2YACA 3KULA 4I6QA 3AT3A 3K2LA 2BHHA 4PQNA 4IM0A 4UN0C 4B99A 4RC4A 3R2BA 3NGAA 2QC6A 4NSTA 5D9HA 3UG2A 2YAAA 4IB0A 2XK6A 3ZFMA 3OW4A 3T3VA 1KWPA 2UVXA 4L45A 5GZ9A 5D12A 3LW0A 3D5VA 4DTBA 4O0SA 4BDEA 4USDA 4JX3A 3F7ZA 4LQMA 4I1ZA 5JFVA 4QPMA 3ZDUA 4FTMA 2GU8A 4EOPA 3EB0A 3KF7A 1JSUA 4O2PA 5EM7A 4G1WA 5CAPA 1YDSE 2GPHA 2V62A 3HRBA 3KVXA 5CZIA 2ZAZA 3F5GA 4EJNA 4TT7A 4C58A 3BBTB 3FZRA 4LYNA 3MJ1A 4BKYA 1YXUA 1XH4A 2PZ5A 4ZSJA 2R3JA 2ITXA 4FNWA 4CCBA 5HCZA 4FEXA 2GSFA 2X39A 4KB8A 4QP1A 4G6LA 3WI6A 5IQAA 2X4FA 3FLYA 3JVRA 3BPRA 4FYOA 5IPJA 4QMSA 3BWJA 2YAKA 3PPJA 5L2IA 5DGZA 4ANOA 2UZBA 4OTHA 1IG1A 1DAYA 4O7YA 2FUMA 4C4HA 2OO8X 3MPAA 3MVMA 3HV4A 5AIKA 2BFYA 1PY5A 1ZMVA 4BCMA 4F7SA 1SM2A 3QZHA 1ERKA 4RLLA 3DNDA 4BCKA 4O7TA 5M4UA 4FG7A 3ZCLA 3HDMA 3C5IA 1PXKA 2WHBA 5LWMA 4DCAA 2PVKA 3LFEA 1A48A 1UNGA 4BCOA 3LFNA 4RZVA 2BZKB 5M57A 2G2FA 4K8AA 2EU9A 4R78A 3ANRA 4II5A 4L3LA 4AT3A 2PTKA 3PSDA 2R7BA 3QBNA 4HYUA 5CS6A 2YCRA 3DKOA 3IW6A 4GL9A 4BCQA 5LVNA 3ZEWA 2IJMA 3R0TA 4H3QA 1OUKA 4L44A 3BYMA 3PXKA 4GKHA 1H4LA 1IASA 1W83A 4QP3A 3UP7A 5I9YA 4G5JA 5IUGA 3MN3A 2QR8A 1GZNA 3DY7A 3FMMA 4LUEA 4NCTA 2AUHA 4QYHA 3CP9A 2UW3A 4MQ2A 2BUJA 3D83A 1MP8A 1IA9A 2PU8A 5IH4A 3K3JA 3REPA 2CCHA 4J52A 5EW8A 5HNGA 3FLQA 3PXRA 4MQ1A 4DFXE 3EYHA 2OU7A 1Y8GA 2JAVA 3VHKA 5BYLA 4G16A 2QKRA 2OJ9A 2WQEA 3OCGA 4XRJA 4XX9A 4U3ZA 3TM0A 4QPSA 4DH7A 1OKWA 5IU2A 3R7IA 1PXIA 3F3TA 4JQEA 3EQCA 2CLQA 2Z7RA 1PXNA 3FMEA 2JDSA 1OITA 3QTRA 2RGPA 3DKFA 3FZ1A 4ANQA 3QQJA 4O1OA 3GU6A 4E6CA 3GU4A 3O2MA 3FJQE 4JG6A 5FLFA 3RCDA 4NL0A 1XBAA 3VBYA 4BFMA 4FZFB 2JDOA 4R1YA 3K3IA 2J5FA 4WBOA 1OB3A 5IMXA 1P4OA 2XBAA 4L52A 4F08A 3D7TB 3NW7A 1Y8YA 4L01A 4GCJA 4NTTA 5JZNA 4MX9A 3V8TA 4CSVA 1HCKA 4I0TA 3NDMA 5CANA 4QD6A 1EH4A 1UWJA 4YJTA 3ACJA 3MH2A 4X3JA 3UZTA 5K5NA 4FKVA 2ITZA 2VWXA 2C0OA 1K2PA 2J0JA 2WKMA 5FUTA 4CFMA 3HA8A 2W5BA 4BN1A 1XH7A 4FSRA 3FMJA 1L3RE 5CU4A 1WVYA 5IA2A 4IAIA 2O5KA 1ZMWA 1NXKA 2W1FA 4YLKA 3VHEA 4FV1A 4BWKA 5JQ5A 3F69A 3FXXA 4K1BA 2YISA 1UWHA 4MD8E 4C2VA 2WTWA 3IGGA 3MH0A 1PW2A 3QWJA 2PYWA 4MXCA 5BPYA 2DYLA 3ZUVA 1FPUA 3E62A 5KCVA 3PLSA 3H30A 3U55A 1RW8A 2PE0A 3U6IA 1YWRA 2P2HA 1XWSA 2JKKA 3GXLA 4L3JA 4ZS4A 4KIOA 2ZMCA 4GS6A 2WEVA 4OTGA 4PF4A 2Z60A 5HTIA 4D4YA 2VX0A 5EM6A 5GZ8A 5IQCA 3NS9A 4F1MA 2CGUA 4LMNA 2W4OA 3UTOA 3ZEPA 3ZUTA 2WOUA 3II5A 2QU6A 5DR9A 3U51A 3BGQA 3OT8A 4FT0A 4TWNA 3H0YA 1ZYDA 1WAKA 2VZ6A 2W1EA 4R8QA 3LCOA 4HVDA 3H4JA 5IQIA 4KKGA 3W2OA 4E4NA 5E92A 4DEAA 1UKHA 3HMIA 4TKSA 4M66A 1PF8A 4YJUA 5L6WL 3RI1A 3FC2A 4S31A 4CT1A 2PL0A 3FI2A 3KL8A 4GSBA 4DINA 1K3AA 4IX5A 3ZC6A 2J0IA 5IKWA 2VWIA 4FSNA 4M12A 5HEZA 3VUIA 3LFCA 5AR4A 5IG1A 4XCUA 4LGHA 3LLAA 3VRYA 4YR8A 2EXEA 3W33A 4AGDA 3HMOA 4E20A 1V0PA 2ZM3A 5DPVA 2X81A 4E3CA 2Z02A 3COIA 3C4FA 3FUPA 4J98A 2HWPA 3SKCA 3PUPA 4RIWA 3SXFA 4XP3A 2ZVAA 4LRMA 1YXVA 2JKOA 3GBZA 4GMYA 5B2MA 2B4SB 3Q9ZA 4WG5A 1XO2B 2OW3A 4RIXA 2OH0E 5ANDA 3VJNA 3PG1A 3RAIA 4C34A 3KEXA 4MD7E 4U43A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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