2B53A

Human cyclin dependent kinase 2 (cdk2) complexed with din-234325
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Quinazolines as Cyclin Dependent Kinase Inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Cell division protein kinase 2
total genus 81
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2005-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2b53A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2b53A01
3KFAA 5HTCA 3RPSA 3ZLXA 4CCUA 4LOOA 3TIYA 2XJ2A 4U79A 4O2PA 5DEWA 5GHVA 4WBBB 2PMIA 2UZDA 5DR6A 1U54B 3AT3A 1W0XC 2O3PA 3CIKA 2XIXA 4ONAA 1XH6A 1YXSA 5IISA 4HNIA 2G1TA 3GT8A 3MPMA 2AYPA 4HCTA 5HGIA 5CQUA 4CZUA 3DPKA 5KMOA 1GAGA 3GU5A 3H30A 4IDVA 5KMNA 3EQGA 2WQNA 5C26A 5J7BA 4QQ5A 1UV5A 4XG4A 2C69A 2IG7A 3H0ZA 2WOTA 3TG1A 5KMKA 3R9RA 1E1VA 5J87A 2BR1A 3PLSA 2YIQA 1H28A 1DM2A 2ITVA 3L9MA 4JRNA 4QPSA 4D4RA 3A2CA 2IZTA 2Z7SA 3ZOSA 1H1WA 4MCVA 4WKQA 2R3JA 4Y73A 3Q5ZA 3V5TA 3HRCA 1YOLA 3PP0A 3U9NA 4DYMA 2GNGA 2UZLA 2W5HA 3ZRMA 4FV3A 3ZSGA 1L8TA 4IVBA 3P7AA 3ZZEA 3PA4A 5KO1A 1UWHA 4IEBA 4FTJA 5TR6A 4DF3A 3SXFA 2VO0A 3HRFA 5L8LA 4O6EA 5CZIA 1GIJA 4O0RA 4PDYA 1OKWA 3H9FA 3OCGA 4AN2A 4KNBA 4V0GB 4YTIA 3CPCA 3MB6A 3MFSA 3ORIA 2YEXA 3R7EA 2CNVA 4NCTA 3DT1A 4PDPA 3CEKA 3DU8A 1GZNA 2CGXA 4O2ZA 1PXLA 4W4XA 4XV3A 3TIZA 3QUDA 1J7LA 2VAGA 2G2FA 2BAKA 2DWBA 3E92A 4LM5A 4QD6A 4DBXA 3GC0A 2O5KA 4PTEA 3ZRLA 2CKQA 3CTJA 2E9VA 2GSFA 4O1OA 4FNYA 4RVLA 4XG6A 1PMUA 2YM5A 1H0WA 4YPDA 1FVTA 5AR5A 3U9CA 1PHKA 4QP8A 3EFKA 4BIDA 1FVVA 3QD2B 2XUUA 2R2PA 2VO6A 4I6BA 4MEDA 3QHWA 4CFVA 2WQEA 1LEZA 4DGLC 4U0IA 2F57A 3KKVA 5CAQA 5AV2A 3V8SA 3N4TA 5L4QA 1Y8GA 3A4PA 3UC4A 3CE3A 3DKOA 3QWKA 5A9UA 3OT3A 1R1WA 2HELA 3QTRA 2E9PA 1DAWA 5HEZA 3AC4A 4F0IA 3QLFA 4FKJA 3VS3A 3SOCA 3QYZA 5I5ZA 4AW1A 3PTGA 2XNEA 5J8IA 4FBXA 5DBXA 3FLZA 4G1WA 3P0MA 2Z8CA 4FTTA 4L01A 2BDWA 4NH1A 4QPAA 4GK4A 4X3JA 3TTJA 4F6UA 4GRBA 1YXVA 2P33A 3NW5A 1Y57A 4FKWA 4KAOA 2G9XA 1UNGA 3BEAA 3P9JA 3R21A 5FTGA 2WIPA 5HVKA 5E1SA 2YIRA 3QGYA 4YGAA 2XK9A 4D58A 3EWHA 1ERKA 3WYXA 5IA1A 2HY0A 3CJFA 4NFNA 3HX4A 5CYIA 3R01A 5LCJA 3OFMA 2ITTA 4AA5A 1B39A 2VWYA 4PV0A 4DG0E 3QRUA 3NPCA 3H3CA 3BX5A 4QMLA 5CVFA 4ZTQA 4FGBA 3LAUA 2VTNA 4PX6A 2P2IA 4YC8A 2R5TA 5DH3A 4IB3A 4EH2A 5DFPA 3FJQE 1OB3A 4B9DA 3DLSA 3KXZA 1Q8TA 3F3ZA 4I93A 3NCGA 4N0SA 5CLPA 5EOLA 5CENA 4DEHA 2WTKB 3VHEA 1JQHA 3QU0A 4O7ZA 5LVOA 3OEFX 4APPA 5T3QA 4R77A 4E4MA 3PJ1A 3ZLWA 4EYMA 4YMJA 3ULZA 3ZSIA 4FMQA 4U3ZA 2V0DA 2WTJA 3HL7A 3ANQA 1AD5A 3K5VA 1XWSA 3GUBA 2UUEA 5IQFA 4R5SA 3NCZA 3EQIA 2Q0BA 3AMYA 2Y7JA 3EKKA 4RSSA 4EK3A 3MY0A 2UZEA 3H0YA 1JKLA 4W8DA 4YSMA 4II5A 3R00A 2J0JA 3LJ1A 5EYKA 2IO6A 5HU9A 2QO7A 4D2VA 4EOJA 4WNPA 5KMLA 4GKHA 4D1ZA 4CFNA 3IONA 1KE7A 4L9IA 4MF0A 4L6QA 4C3FA 3D7TA 4BCPA 3VN9A 4QP9A 4ANMA 4Z55A 3T3UA 4OAUC 4M68A 4JBPA 4ZS0A 1TQIA 2W5AA 3PZEA 5AM7A 2VNWA 2XK4A 3LVPA 4KS7A 4CZTA 2X7GA 2YLEA 3D83A 5IA0A 4EZ3A 3D2IA 5KBQA 3IOPA 4X6RA 4UWBA 3NLBA 2Y4IC 3MTLA 5I3RA 4TXCA 2ZAZA 4C7TA 2GTMA 4XOZA 3E93A 4BBFA 4U81A 3MPAA 5BUIA 4LGGA 5I9WA 3OCSA 4DTAA 4JAIA 3F5PA 1GY3A 4CD0A 3FI8A 2EXEA 2GMXA 5E4HA 3G51A 4QMSA 4YZBA 1YQJA 3AQVA 2I1MA 5HBEA 3F2RA 1IEPA 4O7SA 2WU6A 4FF8A 1WVXA 4ACHA 2GFCA 2PL0A 3DY7A 3JS2A 4FIFA 3RK7A 5CVHA 2W4JA 4BTFA 4JJRA 2B52A 3PWDA 5AUTA 5M44A 4UB7A 3CQEA 4EH6A 3FXXA 5AJQA 5ANJA 3R7OA 5I9YA 4R3RA 3VUGA 4CLIA 5AUVA 5L2IA 3C0GA 1AQ1A 3BU6A 5CT0A 5B7VA 4ALVA 3E64A 4FZAB 5JFWA 4J99A 3W1FA 3DA6A 4U45A 1SMHA 4C2VA 4CLJA 4FIHA 3PA5A 2RSVA 3OHTA 5K3YA 2B4SB 2WMXA 3ERKA 4JG8A 2EVAA 4A9TA 4A9UA 2PUNA 4YJVA 2H96A 2XIYA 3ACJA 3NIEA 3QXPA 5L2QA 3SG9A 2W96B 1RQQA 4IXPA 4F9BA 3W55A 4RC3A 1QPCA 3A8WA 2C0IA 4PP7A 5J9LA 3PDTA 3NMUF 2BAJA 4F7NA 4R7BA 4EWHA 4AGWA 4ZLYA 1YVJA 3DDQA 4IM3A 3R7IA 3LFNA 5ANIA 4EHVA 1W8CA 3JPVA 2JLDA 2C6IA 3GFWA 4JVGA 4MXCA 3VS0A 3OBGA 3TNIA 3W2CA 5FQDC 4PF4A 1JBPE 2X81A 2KTYA 2ZJWA 4BIEA 4ZY4A 3FYKX 5D9HA 2X4ZA 1J7UA 1WVWA 3P1AA 4QP3A 3VBWA 2VGOA 2BRMA 4BDBA 5K5NA 4X2JA 4FEXA 3NNVA 4EK4A 3QRTA 3R7VA 3UZPA 3HUCA 5G1XA 3BEGA 3DGKA 1XR1A 4Q2AA 3VJNA 2OIQA 3ZBFA 3R0TA 4A4LA 5M08A 3THBA 3VHKA 4EC9A 3MY1A 4KUJA 5KMJA 2X1NA 4M7IA 3TZMA 4IX6A 2W4OA 5EHLA 3VS6A 4FSNA 3KCKA 2F2CB 4L3JA 5JN2A 1MQ4A 4M67A 3HDMA 5AR7A 3I6WA 3NUAA 4YJNA 2QOCA 2HW7A 2XBJA 5DPVA 5LVMA 4EL9A 4DH7A 2JIVA 2UZNA 4FV1A 3BPRA 4TNDA 5EYMA 2QR8A 2WGJA 4J1RA 4NKSA 4EBVA 4QTCA 3DBEA 3UYSA 3EYGA 3MGYA 3VF8A 3U51A 4EBWA 4RWJA 4ALUA 2C0TA 2I0VA 1JKSA 1H27A 4IH8A 4UYAA 4ANSA 2VTMA 2QI8A 3KGAA 5HNGA 4U40A 5JSMA 4FV4A 2JBOA 3D0EA 4G3EA 5D7VA 2Q83A 4P2KA 4UMUA 4EOMA 3EFWA 3VUIA 3Q6UA 3ZS5A 2I0YA 3JYAA 3Q3BA 1PXJA 5LMAA 1OIUA 3B2TA 2CGWA 3OMVA 2QHMA 3I60A 1ZLTA 3H4JA 3O17A 3FI4A 3RPYA 4FUYA 3UO5A 4BI2A 3DB8A 4EUUA 5IQGA 1NVRA 1DI8A 4I20A 3TUCA 4GYGA 5HNBA 5BYLA 3R1SA 2HK5A 4DT9A 2XNMA 5AP7A 4KB8A 3CXWA 4UMQA 3F3UA 5D7AA 1KWPA 5HI2A 5L2TA 2JFLA 4CNHA 2IVTA 3DK7A 2A19B 4FV2A 3HMNA 3I81A 4IE9A 2VO3A 3PVBA 3SX9A 3ENMA 3D15A 3FZPA 3ORLA 3QTZA 2WOUA 3I5ZA 4XJ0A 3O71A 4NTSA 3BWFA 4EQCA 3ZCLA 4ZY5A 3ANRA 1ZRZA 3NX8A 2C3JA 5HE3A 3FWQA 4E20A 4HVSA 2PZYA 4OLIA 4HGEA 4MBLA 4KKHA 3KXMA 3SVVA 2F9GA 1CDKA 1OPLA 4ANNA 4RA4A 4D2RA 3O96A 4IAYA 2DQ7X 4GUEA 2XJ0A 2HOGA 3KVXA 3HDNA 2Z7RA 4FV5A 5C01A 1NT2A 5CEMA 4XG9A 1GZKA 2PHKA 4NU1A 2BHHA 4MH7A 3R6XA 5IUGA 5FM3A 4FTNA 3AD6A 4QOXA 5GNKA 5T6KA 4R1VA 5IG1A 1MP8A 4OTWA 4QPMA 5LWNA 4LQMA 1DAYA 4QQTA 3HV4A 3C4EA 2H8HA 4MD7E 4M14A 5CU4A 5E1EA 3QQGA 4J52A 3S2PA 3ZEWA 4BIBA 4BKYA 3VS2A 1B38A 1OL6A 3QFVA 4OUCA 3DK3A 3LCKA 3R1QA 4TKSA 1OKVA 3C4CA 5IQCA 3DXNA 5KKRC 4FEUA 1JPAA 2JKQA 3GB2A 3NW6A 4WG4A 4EOSA 4HVGA 3BQRA 3DBFA 4GV1A 3MDYA 4I94A 1UU3A 2VX3A 3ZEPA 4FNWA 5HORA 3G6HA 2VD5A 2GHGA 2RG5A 2W9ZB 3F9NA 3O0GA 3D7TB 4GMYA 1URWA 2R3RA 4JI9A 4OTRA 4KBCA 4QTAA 5L8JA 4DH3A 3F5GA 4AZTA 3EN4A 3EIDA 2JD5A 1OI9A 1NY3A 4W4YA 5TF9A 1H24A 4F6SA 5KBRA 4FTRA 3B2WA 3LFSA 2XBAA 3IW6A 5AAEA 2R3OA 4RIXA 3EQDA 4M69A 4TT7A 5J1WA 3ZUUA 3W10A 3Q4CA 3OWKA 4FKQA 5CU6A 3M42A 1CKPA 3P86A 1H1SA 4XRJA 5JZNA 4IJPA 2CNUA 2YISA 3R7UA 3TNQB 3ZTXA 3HRBA 4P5QA 3U6IA 2C1AA 2FVDA 4CXAA 3QQJA 1CKJA 5FGKA 4XCUA 2C0OA 3BU5A 5CF5A 1Z5MA 4ALWA 5KUPA 5LMKC 2VWBA 4MXZA 3ZLYA 3S95A 2G2IA 4CSVA 4NK9A 3WZUA 4W9WA 4QMQA 4FSTA 4JQ7A 3OUKA 4W8EA 4DITA 4A4OA 3D5XA 2C6DA 1OGUA 2OF2A 5FEQA 4CV8A 3KEXA 2FH9A 3VBVA 4ZMEA 2OJJA 3PG3A 4RLLA 1OECA 4EOPA 1OUKA 1YHVA 4EI4A 4C3PA 4DGOA 3LIJA 3U55A 5GZAA 2R3FA 4FK3A 4FOCA 5AA8A 4JQ8A 3RWQA 4YJPA 3AT2A 4M12A 3BYUA 4ITIA 2R7IA 4PTCA 1OPJA 3QUPA 3HAMA 3C7QA 3LQ5A 3FKNA 3NUXA 4UWYA 3PG1A 1KE9A 1XQZA 4BDEA 4NJDA 4RJ7A 3QQHA 5HTIA 5FDPA 3QKLA 5C8MA 2R0UA 2YN8A 2J9MA 3MVMA 2J50A 2ITNA 1J1CA 3QTXA 4TWOA 3HNGA 4XP2A 4YTCA 4J98A 3HA6A 4RVKA 1QMZA 4WD5A 1OVEA 1CTPE 3PXRA 3R04A 4AN3A 4FIEA 4NM7A 2BIYA 2X6DA 3NIZA 4F9CA 3G33A 4CRLA 1NW1A 2B0QA 4ZJVA 3DBQA 5CAUA 4L53A 3QRIA 3G90X 2PPQA 1A06A 2WD1A 4QMMA 3QTQA 2WPAA 4WNMA 4RFMA 4I5MA 5AR4A 3SLSA 3OWLA 3Q32A 3V01A 1SVHA 5BVNA 5LWMA 3AC2A 2C1BA 3Q52A 2XNNA 2H6DA 2HCKA 2XNGA 1U46A 2EB2A 3LFAA 4E6DA 2V22A 5GJDA 4XX9A 4X0MA 5E8ZA 4CQGA 4O7VA 2ZYBA 1IA9A 1H8FA 3E8CA 4L42A 4YNOA 4LRJA 2YAKA 5DA3A 1O6YA 3NYNA 4OTIA 1OIRA 5H8BA 4ZJIA 3NUUA 5EM8A 2WMQA 2WO6A 4XS2A 3R8MA 4BCNA 4K18A 2Y8OA 3Q53A 4HYIA 4C0TA 3JUHA 1P5EA 2ETRA 2OJIA 4JBOA 4BHNA 3E87A 4QP7A 3IO7A 3VW6A 3WIGA 5LVPA 3C51A 4ASZA 1IASA 1XO2B 3ZBXA 3OC1A 4QP2A 4YJSA 3AC1A 3ZO4A 4G17A 3DBDA 4KIPA 4GG7A 5CSHA 4IX5A 2BMCA 5HESA 2YFXA 4QMZA 1WBWA 1PF8A 2J7TA 4OBOA 2I6LA 3WBLA 3E3PA 2ETMA 5DR9A 2ZB1A 4O27B 2IZRA 3UNZA 4ZSAA 3QCQA 5EQPA 4Y5QA 3BHTA 5IA4A 5GINE 3FQSA 3UIXA 4USFA 1O6LA 4RIWA 2ZVAA 3O7LB 4BR3A 4DEBA 4L44A 3UOKA 1UKIA 2GDOA 4ZJJA 3A62A 4D55A 3C0IA 3SHEA 3ZC6A 3RAKA 4FZ7A 3OOGA 4EH8A 3SW7A 4QMTA 4JX3A 3Q04A 2C3KA 3OXIA 1U59A 2OWBA 4FUXA 4WBOA 5KX8A 5HD7A 3RNIA 4BI1A 4C4GA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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