2BDJA

Src kinase in complex with inhibitor ap23464
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
265
structure length
254
Chain Sequence
KDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTTRVAIKTLKPGTMSPEAFLQEAQVMKKLRHEKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMSKGSLLDFLKGETGKYLRLPQLVDMAAQIASGMAYVERMNYVHRDLRAANILVGENLVCKVADFGLARLIEFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMVNREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHDLMCQCWRKEPEERPTFEYLQAFLEDYFT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis of Src tyrosine kinase inhibition with a new class of potent and selective trisubstituted purine-based compounds.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 254
sequence length 265
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2005-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2bdjA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2bdjA01
2C6MA 2IZSA 3E92A 5AADA 4BHZA 3EN5A 2GDOA 5DG5A 4RA4A 4QPAA 4FKOA 2REIA 2W4KA 4I6BA 5DA3A 4H1JA 3PUPA 4G6LA 4I20A 1NT2A 1GY3A 3NUYA 4CRLA 5AEPA 4HJOA 3F6XA 3PSBA 4JDJA 5CANA 5CAVA 3LCTA 3PLSA 4BBEA 2WMTA 1F5QA 1YDRE 2BDFA 5C8MA 1K9AA 5HGIA 2HWPA 2CMWA 3JUHA 3WZEA 2I7QA 3D14A 4JQ7A 3UE4A 3F66A 1MQ4A 2PMIA 3NWWA 3NEWA 2FGIA 4GH2A 5I0BA 3W2PA 4DLIA 4L44A 2GNGA 3NYOA 4TRLA 1HOWA 4EYMA 2OF2A 3I0OA 2A1AB 2V22A 2BTRA 3IW5A 3H4JA 3OEFX 3PPJA 3ZU7A 4L3LA 3ZEWA 4TL0A 5IH6A 4L46A 3LLTA 4RZVA 3SW4A 2J51A 4LMNA 1PKGA 4M84A 3ZFMA 3COMA 4CTCA 3N4VA 4YJPA 4EHZA 3VULA 2OKRA 3EB0A 4BICA 1XBCA 2OJJA 4RG0A 3HECA 4YTIA 5KMOA 2A19B 3OC1A 4NCTC 4NUSA 2GS6A 4EH8A 4N57A 3O8TA 2H34A 4WG5A 1KV1A 3HAVA 4QYGA 2HYYA 3ANRA 4KSQA 5AUTA 2YCSA 4BCOA 3AD6A 4IC8A 3VAPA 3WYXA 3C0HA 5E7RA 3LPBA 1G5SA 3KCKA 1I44A 1WVYA 2B1PA 3EQBA 4ANOA 5C26A 1IAJA 4WIHA 5K0KA 1Q3DA 4DGLC 1FOTA 3MDYA 4AQCA 3FHRA 4BC6A 4EK5A 3ODYX 4YR8A 4MYGA 4TTHB 4FIEA 3DKGA 4C59A 5AUYA 2A2AA 1FBNA 2BAQA 2UZUE 5BYYA 5JQ5A 3JY0A 3QLGA 4YZDA 5CSWA 1GZKA 4GFOA 4WNMA 4MD7E 5B0XA 3RINA 1G3NA 4IB3A 3G90X 4RIXB 3SAYA 3E64A 3EJ1A 4IACA 5E9EA 5KHWA 3P0MA 5DVRA 2IZTA 5IA2A 4NK9A 3FLWA 4RJ6A 4WRSA 3CTQA 3OUNB 4FI1A 3FLSA 5HCXA 3UG1A 2ZMCA 4IVDA 2CSNA 5KZ0A 3VUHA 2R3OA 5LVNA 1AQ1A 3TDWA 4NJDA 4IX3A 2OU7A 4G3DA 2GPHA 2H8HA 2X4FA 3FC2A 2KULA 4ZJVA 2QURA 2PVKA 3JVRA 4RBLA 1KE7A 2XMYA 1KOAA 2ZOQA 3VUTA 4A9RA 4ZTRA 5LJJA 2Y4IC 5AA8A 3KF4A 5CEPA 2W5HA 5KZIA 3PPKA 2HZ4A 3R1QA 2PE1A 3VWAA 2YITA 3C9WA 2RG5A 4CZYB 4QP8A 1XQZA 3UNZA 3TL8A 3C13A 2A0CX 2XJ2A 3PXFA 4FEVA 4H39A 2CN5A 3EIDA 4PQNA 4XEYA 3U9CA 4IVCA 3UQGA 4KKEA 4FKUA 4AG8A 2GTNA 2H96A 3F2AA 4MEDA 5E8VA 4LYNA 2ONLC 5L6WL 2WTIA 3ZUVA 5CVFA 3O71A 3Q4UA 5ANDA 1MRVA 2UW7A 3OW4A 3Q4TA 1PJKA 3LAUA 4MKCA 4U80A 2QC6A 4OTRA 4W4VA 4C4IA 4EOJA 3A7JA 2JC6A 5IQBA 4K6ZA 3F3WA 2ZM4A 5EK7A 3A7GA 3ZC5A 3DQWA 3BCEA 4WNKA 2PVLA 4F9BA 2ITZA 4QMVA 3RCJA 3QZGA 4G5PA 4LL5A 4HOKA 3UO5A 2VTPA 3KMUA 5C4KA 1H26A 2CN8A 4Y83A 4ANMA 1CTPE 4QTCA 3NUXA 5BVFA 1JSVA 3JXWA 4AGWA 4BN1A 3NCGA 4B8LA 5JFXA 1YOJA 1BI7A 2C6DA 4HNIA 4RJ3A 4J96A 4EONA 3KB7A 4J71A 4MBLA 5A4EA 2EXEA 2UZVA 4F9YA 4P4CA 2QKRA 1V0PA 4I0TA 5F1ZA 2WZJA 3MH3A 5FM3A 3QCQA 2QODA 4XRLA 2VNYA 4OTPA 3TJCA 4BCNA 1WMKA 4UWYA 4ZOGA 4EQUA 2B9FA 2OIDA 2YHVA 4O0YA 4WA9A 3PWYA 2R3JA 4BDGA 1Q8ZA 3LZBA 5EYMA 5G6VA 5CEIA 3RGFA 2X7FA 4F99A 3RPVA 4FTKA 4TPTA 5CQUA 1W7HA 3BGPA 2RFSA 2JKMA 2VRXA 3EKNA 2QOLA 1MRYA 3GNIB 2FSLX 3FQEA 3GQIA 3TCPA 3BEAA 4A9TA 4MBJA 4RIOA 3EYGA 5CSXA 2VWXA 4MXCA 4FTQA 2PUIA 4FL2A 1RW8A 2UZTA 5I9XA 4M0ZA 3NLBA 3KVXA 1ZXEA 4M8TA 5IKWA 2W9FB 4AZWA 3C0GA 3V5TA 4IWOA 4KWPA 4CNHA 1EH4A 2JKKA 3OOGA 4TWPA 1WBSA 4W9WA 4UEUA 3UOHA 3DXQA 2V7OA 3PVUA 2BVAA 2W5BA 4FKPA 2VO6A 5D9HA 4I4FA 4KUJA 5M4UA 2BZJA 3OW3A 4XH6A 3NAYA 4YO4A 3L8VA 3OY1A 3P23A 2J2IB 2V7AA 1OGUA 3ERKA 3F3VA 4LOPA 3W2OA 4DH5A 3PY1A 1UKIA 3NUNA 5JZJA 4JDHA 3PIXA 4KAOA 2JITA 3BYVA 2VGOA 2VWBA 4O27B 3UPZA 3TDVA 3GCPA 2IW9A 2ZV8A 3QCXA 4C36A 2YCQA 4ZAUA 3TT0A 2X2KA 3FMDA 3G0FA 3KF7A 4IE9A 4DG0E 2LGCA 5TO8A 3ALOA 1W0XC 2Z60A 3SDJA 4PL5A 5IA4A 1M2PA 4TW9A 4BTKA 1NVSA 3AOXA 4CKJA 3DAJA 5H8GA 2RFEA 4HGTA 3F5UA 4ASDA 3E8DA 4CQGA 3G33A 3NR9A 5IH4A 4CCBA 2CNQA 2QU5A 3TG1A 3QC4A 4JR3A 5J1VA 4ARKA 2HW7A 4JBPA 3EFJA 4G2FA 4J52A 4FZAB 5M57A 5CXZA 4ZMEA 3OBGA 3ZFXA 3U51A 4GIIA 4FNXA 4HVHA 4CVAA 3COHA 3Q9YA 3DNEA 2R2PA 4QYYA 2B9HA 3UO6A 4IAAA 4NEUA 4DT9A 2HK5A 2XIZA 4QYHA 3I1AA 4TKSA 2GFSA 4EK4A 1G8SA 2YABA 3FY2A 1XWSA 3NUPA 3V8TA 4F4PA 4LGHA 5LOHA 3R1NA 4RIXA 5JSMA 5FD2A 3ZDUA 3PJ3A 1JSUA 4I6FA 4IANA 4GMYA 4IFCA 4FA2A 2CGXA 4A9SA 5FBNC 3RWPA 5TOZA 3A99A 2WKMA 4V05A 5L4QA 4FTLA 2XK4A 1MUOA 4GK3A 4RZWA 4EBVA 4FV0A 5AV4A 4E5AX 2J7TA 4ACMA 5EQPA 3QTZA 2XKCA 4JS8A 2QG7A 3S00A 2QLUA 4B99A 5KMJA 3LFFA 3U4WA 3E63A 5BPYA 5HNBA 1SNXA 2UW9A 4O0XA 3K3JA 4AFEA 3R2BA 3PY3A 2X6DA 4ZZMA 4KABA 4KIPA 4HCVA 3FSFA 3F2RA 4JBVA 1W8CA 4G1WA 4A4OA 1ZYDA 3AC3A 4CFWA 4DEEA 4BDEA 2NRUA 5H3QA 3VUGA 2YN8A 4D4SA 2P4IA 3CJGA 5HG7A 3GFWA 4CLJA 5M07A 2J4ZA 3TUDA 4FUYA 5EOBA 4AW1A 5ANKA 4DAWA 5J87A 3QUEA 3V51A 2F9GA 4FKTA 1CKIA 3GB2A 2WU6A 3D7ZA 4LV8A 5FBOA 4JT3A 4ALWA 4FEQA 5C03A 4O7VA 1CKJA 2BROA 2C0OA 4JX7A 5M51A 3FWQA 3O50A 3N51A 4AN2A 1PKDA 5EYDA 1PXIA 3TZ8A 4A07A 4BZDA 4AA0A 3IOKA 4D2TA 4Q9ZA 5CALA 1STCE 4QTEA 2UW6A 3IDPA 4R7IA 4YZMA 3VNTA 3NIZA 2IW6A 4RRVA 4X2JA 1M2QA 4KS7A 3QZHA 2ITQA 3VW8A 2HELA 3GC9A 2OIBA 4JRNA 4R8QA 4AF3A 4YLKA 4FC0A 1M2RA 2BPMA 4C33A 4BGQA 3OT8A 4H3QA 3LFDA 1J1CA 4L01A 4V0GB 5AJQA 3SXSA 4C8BA 1OKVA 3LFAA 4MNEB 3PYYA 4XCUA 3DTCA 1YXUA 4O0SA 3OXTA 2VTHA 3QA8A 3PDTA 3MY5A 3D5UA 5IH5A 5J9ZA 4HGSA 1L8TA 5A46A 5JGBA 2ZVAA 3BYMA 4TYGA 1XHAA 2C5VA 2R3FA 4O0TA 5HX6A 4TYHA 1CDKA 5JGAA 3OY3A 4I41A 4O0RA 4NM5A 4S34A 4DEIA 3SG9A 5CZIA 2GNJA 5EQYA 4EJNA 1WVWA 2YDKA 2B9IA 3DB6A 4GK4A 4ASEA 4B0GA 5DLSA 3ANQA 2WQMA 3C7QA 4DEAA 2ZV2A 2OJ9A 4M15A 4NTSA 4FKGA 2IPXA 4GKIA 3K5VA 4EQMA 4B6LA 2GNHA 3SV0A 4BR3A 2HXQA 3VHEA 4WNPA 2B53A 2SRCA 3IGGA 5FEQA 4FIFA 4NJ3A 5FTGA 3PTGA 2O0UA 4QMUA 4BTJA 3NIEA 3UZPA 2CKPA 3ORMA 4F1TA 2X2MA 3GENA 4GJ3A 2E9UA 3LXNA 2GHLA 4JBQA 4O91A 3Q9XA 5CF8A 5DHJA 4E6CA 2UVZA 1H4LA 3VO3A 5IEYA 4C4HA 3CCNA 3MH0A 4DCEA 3G9LX 1JKSA 2B9JA 1YXTA 3A8XA 5I9ZA 4XG7A 3ZCLA 3FL5A 3DOGA 3BE9A 4HPUE 3RK7A 5I9VA 1P5EA 1ZY5A 1FQ1B 2ITTA 3D5WA 3OS3A 3ORXA 5T6KA 4UV0A 1YOMA 1AGWA 2PE0A 4E4NA 3BELA 4J97A 4TT7A 4YZBA 4EJ7A 3WZDA 4L52A 4ZSGA 3SHEA 2VTSA 3AD5A 3NVKI 4MH7A 4DITA 4EKLA 4CMTA 5IF1A 4O84A 4IFGA 4CV9A 4NFMA 3EQFA 3HMNA 3HX4A 3VS6A 4Q5HA 4EHEA 2YIWA 2P0CA 3PJ1A 3R28A 3LJ1A 3RNIA 4FOCA 3D0EA 2C47A 3UODA 5HO7A 4X3JA 5M55A 2JDSA 2W1CA 2YIQA 4D0XA 3RK5A 4MQ1A 3EQHA 3QHWA 5JFVA 1Z5MA 1FVRA 2OJFE 2XIKA 1H08A 1M17A 4IDTA 2O3PA 5EW9A 2FA2A 1TQPA 1XH5A 5E90A 2QO7A 5KBRA 2CNUA 4GT4A 4U44A 1LEWA 1SVGA 3DDQA 4QP6A 3PRFA 4LG4A 4IVBA 5H8BA 4E20A 2O8YA 4K8AA 4BBFA 4CG8A 2XCKA 3GP0A 3CGFA 4QQJA 3GCVA 4AW0A 2J5EA 3IDCA 5HE3A 4F0FA 2OJIA 3QX4A 4OTDA 4D2PA 4LI5A 2VTNA 1XH4A 4XHKB 5FDPA 5DPVA 4E4LA 3DPKA 4XLVA 2VTIA 2W05A 5T3QA 1J1BA 2RF9A 4GFMA 4IB5A 2YWVA 5J79A 3ZLSA 4ERWA 5EM5A 5CXHA 4CGAA 2PZPA 4Z7HA 3KQ7A 1AD5A 3BU5A 4BWPA 3JY9A 2BIKB 4BGHA 4CFXA 3ZRLA 4Z3VA 4QMMA 2X7GA 5BYLA 3BBTB 4TYIA 1OITA 3TIZA 2W06A 3BBWA 3AXWA 3PVBA 3KULB 4MF1A 4W9XA 3SVVA 5HI2A 4U43A 5IQAA 3FZPA 2ERKA 4N6YA 4QOXA 3CIKA 3GI3A 3QALE 4YGAA 4AX8A 4F65A 4JIKA 1MRUA 3UIMA 3QTIA 4K1BA 4PMSA 5HG8A 4ZJJA 2BMCA 1HCLA 3FLZA 4NSTA 5CENA 2VO3A 1JKLA 2P2IA 4ALVA 3QGYA 2IVVA 1RDQE 2CJMA 2YJRA 3A7HA 4DCAA 3IQ7A 3F61A 2J50A 3R04A 5I3RA 3TACA 2XRUA 3DFCB 4YO6A 1Q5KA 4JI9A 3KMMA 5AP3A 3O8PA 3HRFA 3TTIA 3ZONA 3TNQB 4HGLA 4MWHA 3R7YA 4C3RA 4A7CA 4D5KA 3FMKA 3A2CA 5LMAA 1VEBA 4YHTA 5K0XA 2F4JA 2OGVA 4LMUA 2UW3A 4BIDA 3QTXA 3MPAA 3P7BA 1WVXA 1XH9A 2QLQA 2RFNA 1QPJA 3FXXA 3GC7A 4RSSA 2WEIA 4V0GA 3L9NA 3HNGA 5DH3A 3FMMA 4KIQA 3A60A 3I6UA 4YBJA 4BCGA 2Z02A 3Q52A 1VYZA 3NYVA 4MNEA 2YZLA 4ZK5A 4R6VA 4DTAA 4DGGA 5C8NA 5IQFA 2BKZA 3GXLA 4I5PA 4D2WA 3UG2A 1UNLA 4FZDB 4EOOA 3PG3A 3LM0A 1OVEA 5A54A 3H9FA 5M4FA 2I0EA 4EK8A 3BHTA 4MAOA 3MVHA 5ANJA 4IAZA 4BDHA 3Q2JA 1P14A 4Y95A 5HTIA 1ND4A 1Q24A 3MBLA 4I24A 4C4JA 1GAGA 4FL1A 4BZOA 4UB7A 1OIQA 3EYHA 5EI6A 2AYPA 4I5HA 4UMQA 5HEZA 2WTCA 3NMUF 3O0GA 2VZ6A 3EZVA 3NS9A 3DJ5A 4QMWA 3LCOA 1WFCA 1ZOEA 4GVJA 4IB0A 4XBRA 2O2UA 2VX3A 2PMLX 4FKLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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