2BRGA

Structure-based design of novel chk1 inhibitors: insights into hydrogen bonding and protein-ligand affinity
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
263
structure length
257
Chain Sequence
EDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMKENIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-Based Design of Novel Chk1 Inhibitors: Insights Into Hydrogen Bonding and Protein-Ligand Affinity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK1
total genus 74
structure length 257
sequence length 263
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2005-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2brgA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2brgA01
3NPCA 5J8IA 5HNIX 3KK9A 4QMWA 4O6EA 2YM8A 4QTDA 5HHWA 4FMQA 2IZSA 4EZ3A 4PY1A 2WHBA 4HYHA 3MSSA 4D2TA 1H0VA 1APME 3P7BA 4O21A 1R3CA 3HRBA 4C3RA 4JXFA 2I1MA 3FI3A 3CCNA 5D7AA 4USDA 5AV0A 1OL2A 2ZM4A 3R28A 2BDJA 3ZO2A 4J98A 3RK7A 1W0XC 4C4JA 4YGAA 4IVDA 3IW5A 1STCE 4NW6A 1OIQA 3QTZA 4X6RA 4R1YA 4B4LA 3PJCA 3O2MA 4DEBA 4BCOA 4YJOA 2JDOA 2WD1A 3UO4A 3GUBA 4AACA 5JZNA 3JXWA 1WAKA 1YXVA 4GKIA 3O8UA 3DQXA 4OBOA 2G01A 3NUYA 3DAKA 2X81A 2JKOA 4G3FA 4ZIMA 3P4KA 4FIEA 3GI3A 4ENYA 2HZ0A 2YM3A 2PZIA 3FMKA 5EOBA 4YJTA 3FLWA 4ITIA 4PV0A 4RIYB 4J52A 3DB8A 3FLQA 3PA3A 5DLSA 1KV1A 4HVSA 2ZB0A 4KIOA 4RWKA 3UZRA 4FV7A 3CTQA 3D7TB 4HCTA 3U4WA 3O17A 5EYKA 2J0LA 2Q0BA 1OMWA 4GJ3A 4OTHA 1RJBA 4GEOA 2QLUA 2UVYA 3RK9A 3U87A 4AT3A 3F61A 5EYMA 3I6UA 4WD5A 3NYVA 3MVMA 4PX6A 3CPBA 4TYHA 5CI6A 5AP0A 3ZFMA 3OXTA 5B2KA 2YLEA 5CXZA 3N4UA 4FUXA 3BRBA 3JY0A 4BDDA 2GS7A 5I9WA 1Q24A 2EVAA 3GB2A 5HG8A 4R3PA 3VBQA 4TXCA 1R39A 4MKCA 3V8SA 4QMLA 2I6LA 4H58A 1IAJA 5I4NA 1NY3A 1SZMA 2E2BA 2VWIA 4FV0A 5LMAA 3F5PA 3R9DA 4F0IA 3UO5A 5CX9A 3M1SA 3E7VA 4AGUA 4C36A 4YU2A 4F70A 5E8VA 5E1EA 3QUPA 2C0OA 5HESA 4DN5A 2ZM3A 4IZAA 4DEDA 2E9NA 3LKMA 4W4VA 3LAUA 3RCDA 3ITZA 4A4XA 4QP2A 4YBJA 3UG1A 5DN3A 1QPJA 2J5EA 2UW4A 2VNWA 3ORTA 5HG9A 4QP1A 5FQDC 3WE8A 3FHIA 4E5AX 4YR8A 3ORIA 4WNMA 3CEKA 4RZVA 1ZZ2A 4FG8A 5EFQA 3SGCA 5D1JA 2GPHA 4AA4A 5JN2A 3EQBA 4NIFA 3SA0A 2QKRA 3A7HA 1UVRA 5FM2A 5JQ5A 5CXHA 5KMKA 1OGUA 2E9UA 4QTAA 4W8EA 2OJ9A 4EH7A 3EL8A 2CLQA 4GIHA 3FZPA 3S95A 2OW3A 2JGZA 3E93A 3PE2A 3NW6A 3ZBXA 4FZ7A 3MJ1A 1XH9A 3G9NA 3KQ7A 3VS3A 1ZOEA 3QLFA 1OIRA 3SRVA 3HRCA 3NSZA 3HECA 4G16A 1HOWA 2FVDA 4LFIA 4MBLA 4NT4A 2F2CB 3LXPA 5L6WL 4Z3VA 5EH0A 5GJFA 5EM6A 2R3JA 2GHLA 4JRVA 2WMRA 4I41A 4RIXA 3LM0A 3L9LA 4M3QA 2PU8A 5C4KA 3CY3A 3HMNA 4G5JA 4LV8A 2IPXA 4BBMA 2B9HA 3MY5A 4JQEA 3HA6A 4C3PA 4H1JA 1JSVA 3TWJA 4AN3A 3POZA 5J1WA 5EI8A 5HO8A 4RJ6A 5L2QA 3VUMA 4QD6A 3TIYA 2C47A 4JDHA 4O7YA 5IH4A 4ANSA 1KE9A 2Y7JA 3WARA 3ZO4A 4E6DA 3FUPA 1IEPA 4OTPA 4YZMA 3RPVA 3UIMA 4A4OA 5BUJA 3DBCA 4CKJA 5CENA 1Q5KA 3R8ZA 4F7NA 2W1EA 2Z8CA 4IB1A 4C4GA 3M42A 3S2PA 5AX3A 5AUXA 4ACGA 3EQHA 2VWWA 2XKDA 4CQGA 5F9EA 2WQOA 3DBQA 1FPUA 5M57A 4HPTE 4FEXA 4AZSA 3HP5A 3AG9A 3QTIA 1MP8A 4KRDA 4TWCA 4DEHA 1FGIA 3R71A 2W1FA 3VN9A 4NCTC 4BN1A 3TTIA 2PWLA 5AR7A 1J3HA 3OBGA 4XV3A 2FA2A 4S2ZA 5AV1A 1YHSA 3QBNA 5M44A 3Q2MA 2GNFA 5I9ZA 4I0TA 3DBEA 3PIYA 4BCPA 2FSOX 5E8UA 2BTSA 2B1PA 4ZSGA 4DGMA 3CQEA 5F1ZA 2VD5A 4J7BA 3K2LA 2W1DA 4FKUA 5HIDA 3BQCA 4J8MA 4KAOA 5LQFA 3A7GA 2FSMX 2WMBA 3OCBA 2O0UA 3P78A 5IZFA 5LWNA 1H1RA 5FGKA 4JR3A 2C3LA 4O83A 4YLLA 3IGOA 4EOIA 1XO2B 2ZB1A 3OEFX 1CKJA 4I5CA 5KBQA 4LMUA 3SOCA 3FQHA 2C6MA 2CNUA 4CV9A 1G5SA 3MPTA 2AUHA 3NS9A 4YTCA 3NCZA 3SVVA 4M12A 2R3NA 4BDFA 3NNVA 5HGIA 4C34A 2PMOX 5ACKA 3NWWA 2UZUE 3AD5A 3V51A 4PMPA 3DXPA 4RPVA 3U4UA 3FLNC 4BYIA 4CYIA 2W99B 2DWBA 2C6EA 3FSKA 3MIAA 4MD8E 4Y5HA 5FXSA 3R8PA 4E5BA 4IIRA 2GCDA 4GUEA 3BHVA 4XEYA 4O38A 2C5VA 2OXYA 3KXHA 4IAFA 3ZTXA 2GFCA 4AZVA 5IA2A 3BLQA 3LOKA 5CNOA 3QA8A 4BKYA 2YCQA 4AF3A 2HK5A 5HVYA 4FOCA 1HCKA 2EB2A 3FQSA 4FKJA 3JPVA 4FSWA 4L68A 4M84A 4BZDA 3UNJA 3BIZA 3MB7A 3TKUA 3W2PA 3LCKA 2VWXA 5E8TA 5HKMA 5TE0A 3OROA 3EKKA 1LEZA 3PPZA 1JNKA 1MQ4A 2W9FB 3T3UA 3WZDA 4BL1A 4APPA 5K9IA 4NEUA 2UZTA 3R1QA 4YUQA 4KBAA 5JKGA 3ORZA 4C0TA 1FGKA 2XMYA 4EH9A 4AFEA 1PKGA 3LIJA 4RFZA 1ZARA 2WMAA 3WYYA 4E93A 4YTFA 3MIYA 4YLKA 1P14A 3DY7A 1QL6A 3KN6A 4KA3A 3R7IA 3A7FA 4L46A 4QPAA 3WZEA 4AOJA 2C6DA 3UYTA 4L9IA 4U0IA 4ENXA 3U54A 3A62A 3KU2A 2HXLA 1FVRA 3ZM4A 3PRIA 4DCEA 4XG2A 1T45A 1OBGA 5E8YA 2R7IA 4EOOA 4XG4A 3VUKA 5IQGA 3OCTA 4UWBA 4FK6A 3MH0A 5LWMA 2YAKA 3FMJA 4ZK5A 4EWQA 2YIXA 3PJ1A 5HCZA 3RMFA 3QRJA 5IH6A 2WMUA 4FSMA 4QMSA 1NT2A 1HCLA 3C7QA 3PLSA 5DWRA 2B9IA 2UUEA 2C6LA 3W55A 3E63A 4U6RA 4MEDA 1W7HA 1Y57A 2WGJA 4K0YA 4YTHA 5C4LA 4BF2A 4D2SA 1WVYA 4KUJA 3OWKA 4F0GA 5KMLA 3C4WA 1GNGA 4YJVA 4PMTA 2BHHA 4O1OA 4FSZA 4QYEA 3QTWA 4LL5A 3W16A 5AA8A 5KMNA 2X8DA 3S00A 2YIQA 4RJ8A 5FEQA 2OIQA 5CNNA 3Q60A 3LXKA 3LE6A 4GRBA 5E92A 3SD0A 1GY3A 2AC5A 5AUYA 3PJ3A 4ZTHA 4M13A 3OF0A 3ORXA 5DI1A 2UZWE 2JD5A 2ZV8A 5E8XA 5KKRC 1M2PA 1M2QA 3TZ8A 1XWSA 3K54A 4C7TA 4GG5A 5AUUA 3ULZA 2WTDA 3A7JA 3IOPA 4NKSA 4RZWA 3BHUA 3DQWA 3QRTA 4J8NA 4XLVA 5D12A 2W5HA 2VTJA 3KN5A 4TPTA 2FH9A 5D41A 3BBWA 3OTUA 3GQLA 3QQUA 1BL7A 4FTLA 3FBVA 3R8LA 5IA0A 4DFNA 4CFMA 2X1NA 4EUUA 5F94A 1CTPE 4QMQA 3DLSA 3LMGA 3LCSA 4CQEA 2F2UA 4FEUA 1VYZA 3ETAA 2JKMA 3BLHA 1U46A 2YZAA 3PXFA 3PLAE 2OXDA 3RKBA 4OAVB 2ETKA 3BKBA 5K4JA 4QMOA 1H24A 5AA9A 2X2KA 4KRCA 2VO3A 1YKRA 4QTEA 5EDPA 4F9CA 2QODA 4NM7A 4AE9A 5C1QB 5K4IA 3GFWA 2VWZA 4XG8A 3LQ5A 4BR3A 2VX3A 3HV3A 3G0EA 5L2SA 5IQEA 3TNPC 3FKLA 4YNEA 5H8EA 4O2PA 5G1XA 4QYHA 5G6VA 3V5JA 2OSCA 1UU7A 2YDIA 3FYJX 4GVAA 2GTNA 2UZDA 1Z9XA 3PG3A 3M11A 4RIYA 4WUAA 3DZQA 5DFPA 3W8QA 4XNEA 2IZTA 3QCSA 5IDPA 5IQDA 2BZJA 1JAMA 5FM3A 4NKAA 3D7TA 2PUNA 4B7TA 3HKOA 3ORNA 3F7ZA 3BBTB 5DE2A 3EQPA 4JAIA 3GU8A 3QZFA 5JGBA 2UW8A 4YO6A 5M08A 2ETRA 5IQAA 3DKOA 4DA5A 4QQCA 4X2GA 3NIZA 1OPLA 4Y46A 5IA4A 3F7WA 3MVLA 5ETCA 3TACA 5M53A 4H3BA 3HZTA 2BAKA 3E8NA 2WKMA 3QU0A 4FF8A 4I4EA 5AV3A 4D1XA 3A2CA 4ASDA 2R3HA 4EJNA 5E1SA 5ANGA 4YC6A 5EM7A 2DS1A 3AC4A 3F3ZA 5IA5A 4E6CA 4FKWA 2YCSA 4W4XA 2Z7RA 5M4IA 4O7LA 4DEEA 4HGSA 4RIWB 4BBFA 3PWDA 4FSYA 4GMYA 4JI9A 2B7AA 3O8PA 4UY9A 4DC2A 4IX5A 3TM0A 3L1SA 4IHPA 5EQEA 4O86A 4Z55A 3FWQA 3BHHA 4MCVA 4AZFA 2I0HA 2LGCA 5IPJA 3LHJA 3Q9YA 4YNOA 4C2WA 4RJ5A 4RX7A 2ONLC 4DGGA 5BVEA 4O0RA 4AE6A 3R2YA 3NNWA 2VTIA 3R1SA 4U5JA 5IMXA 4WHZA 4Y95A 4OTDA 5H9BA 5I3OA 4DITA 1G8SA 1QPCA 2FGIA 3L8PA 4O96A 1ZYCA 4YZNA 2YDJA 4MQ2A 4BVUA 4D1SA 1L8TA 2GNJA 3HNGA 3VW6A 5K0KA 3A4OX 4HYUA 2XNPA 4TYEA 5DT0A 3RAKA 3SXFA 2CGUA 2QG5A 3MWUA 1Y6AA 5CYIA 1URWA 4GS6A 3ZLYA 2NRYA 3QUEA 4DH8A 3VBXA 1VEBA 3FZRA 3QQGA 4OTGA 2PE2A 2X7FA 4IDVA 4U80A 3F5UA 4CLJA 4FKGA 3ET7A 5DRBA 3UPZA 4YJRA 4X21A 3ZCLA 3E7OA 1R0EA 1A48A 4DFBA 3IK3A 3EN9A 4IH8A 1OKWA 2OH4A 3FAAA 4L52A 2G9XA 5GIOE 3BELA 4ZZMA 3D14A 3QTSA 5C27A 3QCXA 3O71A 3R02A 4APCA 4PP7A 4YSJA 5HO6A 1R0PA 2J4ZA 5TR6A 3FE3A 2GQRA 3R8UA 4N57A 2IJMA 2BFYA 2YN8A 2XCHA 3HX4A 3UDBA 4EYMA 1NW1A 2I0EA 4C8BA 3C4XA 4OTIA 2BZKB 3DPKA 3WIGA 2R3MA 3SRVB 4F1MA 4KINA 3G15A 1IA8A 4V0GA 5GZ9A 2G1TA 2C6TA 4JAJA 4MHAA 4RWJA 3UPXA 4TWOA 3U6IA 3KCKA 2CCIA 3BGQA 3ZXZA 1YWNA 1ZMUA 1DAWA 4IFCA 5JFWA 3SAYA 3BU3A 2P33A 2JIUA 3NW5A 1YVJA 4OBPA 2WTIA 4IWOA 4RA5A 2G2HA 4X3JA 1JLUE 4ZXTA 3A8XA 3QZIA 4CCBA 4G3CA 4EH6A 5DIAA 1ZYJA 4DTKA 1L3RE 4PMMA 4H39A 4J95A 5BMSA 3LFQA 1LP4A 2F9GA 3R0TA 4DBXA 2GS2A 3GP0A 3QD0A 3RVGA 3TV7A 1FMOE 4EZ7A 2OFUA 4FTIA 3OWLA 1PXOA 2QO2A 3FZ1A 5C01A 3SQQA 2W06A 4JX7A 5FBOA 4OBQA 5H8GA 2BIKB 4TT7A 5D10A 3ID6C 2J9MA 3VWAA 3LLTA 1U5QA 4ASZA 4I5PA 4UMTA 2CKEA 3QC9A 4BIEA 3QC4A 3CLYA 3PVGA 4YSMA 1UU3A 3VULA 5DYJA 5HE1A 2RL5A 4FIIA 5FTGA 2C4GA 5CVHA 5LCKA 3RZBA 2J7TA 2XNBA 3ODYX 5I9VA 2PMNX 4IM2A 4OTRA 4C4EA 4PDPA 3GGFA 4NWMA 4H36A 1ZAOA 4PP9A 4RG0A 4XG7A 5I9XA 4NYEA 3UODA 4HYIA 3HV6A 5A4LA 3EOCA 2EU9A 3QYZA 4LUEA 3ZO3A 1Q3DA 3QCYA 4R7IA 1PMVA 3HA8A 1B39A 3RPYA 3RHXA 5CAVA 2PVJA 3Q5ZA 2WTWA 2G2IA 3DCVA 4NU1A 4IAKA 4L45A 2JLDA 1BMKA 1OVEA 4FSTA 4QMPA 1KUTA 3OT8A 2W1GA 2NPQA 1Q99A 3B8QA 4KB8A 3RBWA 3W10A 4Q9ZA 4AGDA 2CCHA 1ZMVA 4MF0A 3LFBA 1E1XA 1R1WA 3O51A 4KKEA 4PDOA 4QYFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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