2BRHA

Structure-based design of novel chk1 inhibitors: insights into hydrogen bonding and protein-ligand affinity
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
266
structure length
257
Chain Sequence
VEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-Based Design of Novel Chk1 Inhibitors: Insights Into Hydrogen Bonding and Protein-Ligand Affinity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 257
sequence length 266
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2005-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2brhA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2brhA01
3F82A 2YZLA 4PDYA 1H01A 3C4XA 3TZ7A 3MY5A 2B52A 3B2WA 4BDHA 3HVCA 2WMTA 3BZ3A 1YDRE 4QTAA 5AUYA 3FPMA 5CF4A 4LGDA 4BN1A 4OBOA 2V22A 3QCQA 1UU9A 2PVFA 3ZRMA 1UVRA 2C3JA 4K8AA 4L9IA 2UZNA 4TWCA 3CJGA 4O0YA 2OJGA 4IAKA 1JLUE 1W83A 4FSTA 1U5QA 4BI2A 2Q0NA 3AXWA 5TE0A 3EN4A 3UP7A 3TEIA 4FTRA 1H26A 1PF8A 1YHSA 4FKJA 3G15A 2YABA 3LJ2A 2YERA 4GK3A 4BTFA 5J9YA 1FBNA 4II5A 4FG9A 3IW4A 5M51A 1CKJA 4WRSA 3VIDA 4O81A 4K9YA 5CWZA 2WMXA 1KOAA 5IUIA 3D94A 3QFVA 4I5HA 4CD0A 4CV8A 3PJ1A 3OROA 2Z7SA 4OTRA 5EYMA 3UO6A 4XHKB 1BL6A 2DS1A 2ZM3A 3VW6A 4FIHA 4ZMFA 5GHVA 1W98A 5E91A 2XNGA 2PVYA 1SYKA 1YHVA 4KIPA 3NIZA 4TWOA 4CFFA 2VO3A 2WQOA 2JKMA 3NUXA 2H96A 3C5IA 3HNGA 3C9WA 2WQNA 4HGLA 3F5PA 4JRNA 2VGOA 4D55A 5A4QA 4I24A 4DF3A 4ANBA 1ZYDA 4FL3A 1OIQA 2PWLA 4HZRA 1U5RA 3R28A 3W18A 3FSKA 1GNGA 5D10A 1OPKA 2FO0A 4C8BA 4A9YA 4U79A 4JAIA 1OKWA 3KRJA 5IH6A 3VBYA 2ZDUA 2XM9A 4X3FA 4IC7A 3NPCA 5LARA 2HOGA 3WF5A 2BTSA 2IZUA 4TL0A 4OTQA 1U59A 2ZV8A 5AX3A 1L3RE 3ANQA 3UVRA 3BU3A 3FE3A 1M14A 4E4NA 2GU8A 3Q96A 5F95A 1YXTA 3RCDA 4C02A 1KV1A 2VN9A 3MY0A 5DR2A 5H2UA 5C1QB 4C4FA 1OIUA 2BZKB 3TZMA 3FMEA 2XYUA 4ANMA 2HXQA 3OD6X 4CXAA 1OBGA 5GJFA 4BDBA 3UTOA 3GT8A 3UG2A 1YHWA 2QR7A 5HIEA 3H0ZA 4FNYA 4B99A 1JSVA 1DAYA 1P4OA 3OWJA 3W2PA 3V5PA 4XG4A 3LHJA 3DLZA 4CCBA 4HVGA 1ATPE 1WCCA 5C9CA 5I9VA 1H4LA 2WTWA 5CAPA 4EUUA 4BYJA 3KCKA 2UW7A 3OS3A 4FSNA 4BCPA 1GZKA 2UW0A 3QTXA 4O6EA 4I6HA 1H1QA 3CEKA 4UB7A 5HEZA 3RBWA 4AQCA 5ANEA 4CT1A 4EJNA 4YUQA 2C6KA 1WBVA 3GU5A 4FR4A 4WNMA 5IQAA 5E8ZA 1YI3A 5CU2A 1CDKA 4EOPA 3Q53A 4BKJA 3WZEA 4RBLA 4JQ8A 3D5VA 3DB6A 2W0JA 3UC4A 4BGGA 5LCJA 2W4OA 3HX4A 3W16A 4AE9A 5HCXA 4MNEA 2X2LA 4G9RA 4S34A 5LWNA 4H3QA 4IFCA 3NUSA 3P86A 4DAWA 2GHMA 4K33A 4FV8A 4Q5EA 5CEKA 5L6OA 2XNOA 2A27A 5CAOA 2I7QA 4FVRA 3D9VA 4MXYA 5D7VA 3GCPA 3MPAA 4DGNA 5M4CA 1WFCA 5B2LA 3OP5A 4ACGA 5BVFA 3W10A 5ICPA 2ONLC 2XA4A 1GIIA 1Q3DA 3QLGA 3FI3A 3MJ2A 4CKJA 2PVHA 2YAAA 5IH4A 4ZLOA 2IZTA 1NVRA 2VGPA 4F7LA 3AT2A 4BDKA 4FBXA 3PXFA 5AX9A 2X6EA 2QOIA 2X2MA 4LFIA 5AR2A 4DH1A 2B9IA 4CKRA 4W8EA 1R0EA 1PXKA 1ZMWA 2QKWB 4HCTA 5AIKA 3W32A 1JKLA 5CI6A 4E4LA 4YU2A 5BQ0A 1M2PA 3EHAA 2F9GA 3ZFXA 3UQCA 3ZM4A 5DG5A 4O7RA 4F65A 2VTJA 4AT3A 2XCHA 4PRJA 5EDQA 2YITA 4RC4A 5L8KA 5HVYA 5HU9A 5EW8A 3MW1A 4RZWA 4GG5A 5IA3A 1KUTA 1PMVA 3PWYA 4FEVA 3QTIA 1CKIA 2Y6OA 2XRWA 2GTNA 4FODA 4ANLA 1Q61A 5IH5A 2P55A 3ORXA 2VTTA 4X6QC 5D1JA 3COKA 2VWXA 3CLYA 3D2KA 2QOOA 3SKCA 3GENA 3NUPA 4AUAA 1OKVA 3FXWA 5E92A 4TWPA 3TIZA 1Y6AA 4L53A 1WVXA 4P5QA 1ZY5A 3U55A 3QTRA 3OEZA 4YC3A 4ORKA 5KZIA 3PXYA 4DEBA 5ETCA 1RDQE 5GJDA 5HQ0A 5HORA 4Q9SA 5CX9A 1YDSE 3IW8A 4BHNA 2VTIA 1OL6A 3MV5A 4A9UA 4BCFA 1UKHA 4I1ZA 4IAZA 1H07A 4CYJA 3FY0A 3RGFA 5LMBA 4O38A 3VUHA 3SW7A 1ND4A 3SRVB 4PPAA 1U46A 4P2KA 3TL8A 2CJMA 4L46A 3LMHA 2RFNA 4FL1A 4BWKA 4MXCA 2PUNA 3NCGA 1Q8TA 5E8WA 4FK6A 3GCUA 3KMWA 3LZBA 1OPJA 4PTEA 3LMGA 3PZHA 3LVPA 5TR6A 2R3LA 3KEXA 3O8UA 4FEQA 5I3OA 3PTGA 3QQKA 3HMPA 2UZEA 5J9ZA 3BYSA 3F7WA 3RPOA 4XUFA 4G9CA 4XV3A 5C03A 3TKHA 5DI1A 3WZJA 5AA9A 3O71A 4ZTSA 3ZO4A 4MF0A 3A2CA 4CRLA 3QZFA 5JMSA 2WEVA 4S2ZA 3FZTA 2OF4A 3IOKA 4NZWB 4O2PA 4M0ZA 4UWBA 4AFJA 5J7BA 5J1WA 3UQGA 3V8SA 4APPA 3D5XA 2UW3A 3PWDA 4BDEA 3OOMA 3CBLA 1ZARA 4PL3A 4UN0C 5IPJA 5F94A 1PW2A 4LV8A 3SC1A 3TUBA 4ZSEA 4YGAA 3CD3A 3IQ7A 4U43A 4J7BA 3VS7A 1J1BA 3R0TA 3S1HA 2QQ7A 4RIXB 4X3FC 4TRLA 3FPQA 4BCMA 1XQZA 3LCKA 5I5ZA 4RA5A 1GZNA 3EMGA 3NNWA 4TTHB 3RK7A 2J0IA 3SXFA 4EHEA 3QLFA 3DAJA 4FSWA 4X0MA 4EH9A 3OY3A 4FVQA 3QCXA 1PJKA 4FOBA 4J98A 4LOOA 1NVQA 4EWHA 3R9HA 5IA1A 3IDBA 1XJDA 2Y9QA 2XK8A 4YSMA 2WMRA 3H10A 5BMSA 2F2UA 2VAGA 2DWBA 1KE9A 1FGKA 2ZB0A 4PV0A 3NX8A 1ZMUA 3NS9A 3W1FA 1IAJA 4CG8A 3R04A 2PVLA 4MAOA 4UMQA 1TKIA 2BAQA 2ERZE 2Z7LA 4K6ZA 4L01A 5ANGA 2W5HA 1Q41A 1NXKA 3BV2A 4J99A 4UZHA 2P33A 2W05A 4EH4A 4KBAA 2X1NA 2FB8A 4BHZA 1WBNA 4E6QA 4EH6A 5LMKA 2YM3A 4PL4A 3UOHA 4FV0A 5M4UA 3N51A 2XEZA 3QRUA 3I0QA 3OTUA 3ZSGA 3E8EA 4K18A 4EUTA 3MGYA 3NRMA 3MFSA 3PJ2A 3TWJA 5E90A 3VC4A 3UQFA 2QOCA 3F3VA 3S3IA 2GSFA 4USFA 3BHUA 3CY3A 3K2LA 5I9ZA 4WG4A 4MD9E 3NZ0A 3ZC6A 2PL0A 2BAJA 4I6FA 2YACA 5CSHA 5CALA 1PXOA 3R1SA 4RPVA 5HOAA 4C2WA 2XKDA 3GCVA 1ZZ2A 3PXZA 4Z55A 2QOFA 3BPRA 4ZEGA 4YP8A 3PDTA 2O64A 4IAYA 2ZV9A 2BDJA 2WTJA 2XRUA 4IVBA 4XOZA 2JLDA 1KE8A 5HTCA 3EZRA 2WZJA 4F7JA 4FT0A 2VU3A 4HZSA 1UKIA 4JQEA 3DV3A 4YNEA 5CEIA 4AZEA 2AC3A 2X4ZA 2R3IA 5AWMA 4FKLA 4E20A 4ZSJA 1HOWA 3A7GA 4MQ2A 4QMOA 4FYOA 4CRSA 1ZRZA 3C5UA 1WBPA 3P5KA 2A2AA 5DWRA 3TZ9A 4R77A 4G31A 3MVMA 5HG8A 5A54A 2W5AA 4MXOA 5KBRA 2RFEA 4O7NA 4EH3A 2X2KA 4X2GA 4AX8A 5CVGA 3A62A 5LQFA 1OGUA 3POZA 4FKVA 4S33A 5BVOA 4M97A 3F3TA 5IQHA 3F6XA 2RIOA 1Y6BA 4BCGA 3QA0A 1GY3A 3CR0A 3EN5A 4KRCA 3VNTA 5J95A 3OOGA 3T3UA 5IA2A 3EL8A 3PSBA 3W2RA 1BI8A 3UG1A 4NW6A 5H9BA 5D7AA 3GBZA 5JZNA 1OL2A 3ALNA 2YIRA 4LOQA 2IN6A 1LPUA 5DRBA 2OXYA 3R9RA 5JFXA 2JITA 2GNJA 2YFXA 1Y91A 2W1EA 4DGGA 2PMNX 3UJGA 4LGGA 4MQ1A 4PY1A 2O2UA 1G5SA 4ZP5A 3WYYA 5CZIA 5M57A 4C2VA 4DYMA 4O84A 4APCA 4QQTA 2XZSA 1JQHA 2Z02A 3SOAA 3PIZA 3DKGA 4UXQA 5HE2A 3BEGA 5LVPA 4PNIA 4EHGA 3KRLA 4K11A 3C0IA 4QP4A 4QMTA 5HX8A 4ZZMA 2YA9A 2W96B 2IVVA 4CMUA 4TT7A 4QP8A 3ZRKA 1BX6A 2PE0A 1RQQA 5CXHA 3FLQA 1ZOHA 3MFRA 3HV6A 3KMUA 4D4RA 4JR3A 4UWCA 5DT3A 4MVFA 3IONA 4EQMA 2XNEA 3ENHA 4EZ3A 4KIOA 3LOKA 5A4TA 3UOKA 5BYYA 4LRMA 4M15A 4YJVA 2AYPA 3C51A 4TNBA 5EHLA 4YJSA 2PE1A 4BC6A 4FEXA 2VTHA 4WUNA 3DNDA 5EHOA 3PY1A 3TUDA 4O7LA 3ZLSA 1H1SA 4IQ6A 4R6VA 2CNQA 2J0LA 2W7XA 3BYVA 4ZXTA 2W4JA 3ZZWA 3GCSA 3VO3A 3F5XA 3G9NA 5CU4A 4O0XA 3FEGA 5CZHA 5IDPA 4JBQA 2BTRA 3FKNA 4GU6A 1Y8YA 2CHLA 4XBUA 4GT4A 4ARKA 4FNXA 4M69A 4Y85A 2Y8OA 3DFCB 2W4KA 3BHTA 3E92A 5FBNC 5A14A 4RX7A 4YJPA 4U0IA 4XP3A 1QPDA 4JQ7A 5J87A 2VWWA 4BTMA 2JIUA 4EJ7A 4EI4A 2RFSA 3A4OX 4CG9A 3VF8A 3Q9WA 3U6IA 3EQIA 2VX1A 4KKEA 4RGJA 3AD6A 4EYJA 3OXTA 2VTMA 1WAKA 1AGWA 1YWVA 4EHZA 2OW3A 1LR4A 2HELA 3HZTA 4YJRA 5CASA 2C5VA 2QNJA 4XJ0A 1H24A 5BX0A 5DT0A 3DS6A 3CKXA 1IG1A 4YHTA 4GJ3A 5TO8A 4IVCA 4BDFA 2IVSA 3U9NA 3ORKA 3UIUA 4AN2A 1V1KA 3ZXTA 4XRLA 4GL9A 3GC9A 5HE0A 2DQ7X 4IB0A 5ETFA 2R7IA 4IB1A 4FIGA 2R3QA 4NKAA 3MVLA 3HMNA 3QD3A 4BFMA 3ENMA 5C26A 4C3FA 1XBCA 3FZOA 1Q8ZA 5AIRA 1PMNA 2OIDA 4IX5A 1Q97A 2ITUA 4LMNA 3MN3A 4TZRA 4Y83A 3ZLXA 5KKRB 5EM7A 1XH5A 3ET7A 2OIQA 2J4ZA 3A7IA 4MTAA 1OBDA 3ZEWA 4LUEA 4NIFB 2ETRA 2G9XA 4EK3A 3QCSA 1M7NA 3K3JA 4PX6A 4S31A 3V3VA 5KHWA 3C13A 1YDTE 2FH9A 2PMLX 4I92A 2EB2A 3LCTA 4PPCA 2EWAA 5HG7A 3VBWA 3IKAA 4A9SA 4UMRA 5JFWA 2PU8A 5E9EA 4TYHB 2JAMA 5A4LA 1OL1A 3PA5A 4ASZA 3TG1A 5C4LA 1Q4LA 4U7ZA 3QXPA 2EB3A 4IWQA 2BVAA 5AUVA 2YM6A 2OZAB 4F9BA 3LMIA 1Q8YA 4QP1A 2X39A 4L43A 4XLIA 4FTCA 4RIWB 5HHWA 3AC8A 4FSMA 4C4GA 2VTRA 3KL8A 3AGMA 3NUYA 4MHAA 4Y95A 2YN8A 2J0KA 3LCDA 1TQMA 2NRUA 3E64A 4RIOA 2CGXA 4ITJA 5HTIA 4QTDA 3G51A 5JK3A 3SVVA 1K9AA 5JZJA 5LVMA 5H3QA 4X2JA 4AW5A 2VTPA 3QA8A 3VBXA 2PUPA 5AV0A 4DE4A 3NYXA 2WFYA 4FKPA 3I6UA 3LM0A 4KD1A 1K3AA 1FVVA 4EEVA 1H1WA 4F9YA 4DFNA 5CEPA 4ZTRA 3EQGA 5AV3A 3R1NA 4ZMEA 4P5ZA 2B0QA 3PYYA 3Q4UA 2BUJA 5FM3A 3OBGA 4ALVA 3GXLA 4JDHA 1GZ8A 4JG8A 4JT3A 4RLKA 4WA9A 4E73A 5KMKA 4W4WA 1O6LA 3FC2A 2W9ZB 3MB6A 1S9IA 2YIWA 4LG4A 3VJOA 4D2PA 5IZFA 1F5QA 3R9NA 4R5SA 3V01A 2YDKA 3NIEA 5AV4A 2PTKA 4AZTA 3WARA 2QURA 3OCBA 3FI2A 2UZBA 2WMSA 2VRXA 2J0MB 1M17A 4WBOA 4AN9A 5AEPA 4FKOA 4ZIMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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