2BROA

Structure-based design of novel chk1 inhibitors: insights into hydrogen bonding and protein-ligand affinity
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
275
structure length
272
Chain Sequence
AVPFVEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMKRCPENIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAKRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structure-Based Design of Novel Chk1 Inhibitors: Insights Into Hydrogen Bonding and Protein-Ligand Affinity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK1
total genus 76
structure length 272
sequence length 275
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2005-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2broA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2broA01
4FVPA 1H0VA 4X2NA 4W8DA 4IFGA 1PYXA 4WD5A 2JDTA 4AZEA 3ITZA 3UJGA 3MH1A 4B0GA 2WXVA 4FG7A 2VX1A 1BL6A 4FODA 4LOPA 4BICA 5TO8A 1LEZA 3KCFA 2XRWA 2WFYA 4D0WA 4EH8A 2OFVA 4XG2A 4C2VA 1XH5A 2VTPA 2BDFA 1AGWA 2V7OA 4BF2A 1YI6A 4FTCA 3AMBA 3H0ZA 4YHJA 4M69B 5L2TA 4ENYA 1JSVA 4L6QA 3FWQA 3ZO1A 1Q8ZA 4EC8A 3P78A 5C8KA 4F6WA 1PHKA 2XNPA 3QRTA 1WBWA 5E8YA 3W2CA 1RQQA 3SQQA 4O7NA 3PZEA 4CMUA 2ITWA 3SOAA 4DN5A 1XH6A 2I0VA 4D4VA 2IO6A 4I0RA 3WBLA 1PJKA 4NM0A 3FJQE 4MTAA 4DCAA 4IB1A 4RVKA 5EQYA 3MVMA 5LMKC 5B0XA 5F4NA 3B8QA 4BDBA 3H3CA 4CZUA 2XCKA 3ODZX 2QHNA 3W8QA 2B9JA 4O0YA 5KBRA 3MTLA 4FKUA 3BCEA 4L7FA 5M4FA 3DXPA 3MVJA 2IVTA 3UTOA 4RG0A 3HV4A 5AV4A 3CS9A 4BIDA 2CGXA 2P3GX 2QU6A 1RE8A 3BEAA 3MN3A 2F7ZE 3LXKA 3PXYA 3H9FA 2PHKA 5CZHA 1HOWA 4D1ZA 3QRKA 3OCBA 3LMHA 2R3QA 4RMZA 3QZFA 5JGAA 2Y0AA 5IQIA 4CQGA 3QGYA 3KRWA 1OB3A 3GFWA 4K6ZA 4YBJA 3T9TA 3VUHA 1Y8YA 2YM8A 3HGKA 3GBZA 4P7EA 4IWOA 5FP6A 4WBOA 3O7LD 4GG5A 5ACKA 4N70A 5HU3A 3MFTA 4CFVA 2W05A 5C4LA 4U6RA 3MJ1A 2FGIA 4WUAA 3VJNA 4RWLA 3MJ2A 3OBJA 4YNEA 5M4UA 4GK2A 4YGAA 2ZMDA 4M13A 2F4JA 4NFNA 3L8VA 2XEZA 2R5TA 4WKQA 3QWKA 5BVNA 2CCIA 3FZRA 5HU9A 5CSHA 5E1EA 5E1SA 4F0GA 3VUDA 3MB7A 5D10A 1GIJA 2FA2A 1ZXEA 2J2IB 2WB8A 4I6FA 1Q8WA 4W9WA 5B7VA 3UODA 1YDSE 2X8DA 3MTFA 3VS3A 2R3HA 4IBMA 4BR3A 1L3RE 4UN0C 4BI1A 4NCTA 3ZM4A 2XNNA 3QTRA 4YJQA 4BL1A 4ERKA 3W33A 2PVYA 5EKNA 5DA3A 3TNPC 1W0XC 1Y6BA 2QLUA 1AD5A 1ZMWA 4O0UA 2NPQA 3VIDA 1R1WA 1H26A 5BVWA 2F9GA 3F7ZA 4HCVA 5J79A 3PJ3A 5HNIX 1OL6A 2RGPA 4L46A 4NL0A 4GK3A 1OIUA 3PE1A 5BYLA 4QTEA 3FYKX 3FZSA 3LAUA 4A07A 2ZAZA 5TT7A 3JVRA 3NS9A 2G2IA 2OG8A 2GHLA 2J5EA 2PULA 1Q3WA 4JLCA 3R7OA 4PP7A 3MPAA 2UVYA 4FT5A 5EI8A 3VS1A 3Q9WA 3QKMA 1YI4A 5EYKA 4TL0A 3WARA 3RPSA 5IISA 3EMGA 4BCIA 2UZDA 2WMBA 5DNRA 3ZM9A 4ACHA 1CMKE 5EM8A 5IQBA 4L3LA 1UKIA 5FEDA 3GGFA 4XYFA 3SGCA 4BHNA 2C5VA 2WTIA 1W98A 5CVFA 4RJ4A 4C4JA 2YDJA 4F7SA 3LCDA 5DLSA 2GS6A 4FTLA 4ZK5A 4AACA 4D58A 4N6YA 4Y5QA 3A60A 4QP2A 5ANEA 5E8VA 3TTJA 2YCFA 1OM1A 1I44A 3DFAA 4BDJA 1YQJA 4ZP5A 3OT8A 4NKAA 4XMOA 4D5HA 1J7UA 4YC6A 1U46A 4RLKA 3T3UA 4FE2A 4IAIA 3HV3A 3L8SA 3VUGA 2I0YA 5IH5A 3UP7A 2X81A 4FKSA 4YTHA 3DBDA 4J96A 3KB7A 3O51A 2DQ7X 2R3GA 2UV2A 4KA3A 4EH2A 3ZFYA 4AAAA 4EOPA 4OTRA 4EH4A 1X8BA 2QHMA 3NW7A 4APCA 3GOKA 3TUCA 2OICA 4BWXA 4WO5A 5CNNA 5JN2A 4G9CA 4IH8A 4YU2A 4C4FA 1CDKA 2XCHA 3QUPA 5FP5A 5FXRA 4FSRA 2Z7SA 2PY3A 3D2IA 4WNKA 5KX8A 2ZDUA 4MBJA 3VBQA 4EORA 5BVDA 2WTWA 4HGSA 1XO2B 4XG6A 1XWSA 3OW4A 4ANLA 5LQFA 2Z7RA 2OJIA 4C37A 2WMRA 4EKLA 2BRHA 5HOAA 3FEGA 4Y85A 4RZVA 3TI1A 2OWBA 4LGHA 2W1ZA 2ZB1A 5KMOA 3KFAA 3DTCA 5DBXA 3POZA 4GVJA 1JKLA 3LVPA 4NM5A 5HD7A 4KKEA 4GH2A 5HGIA 4ZXTA 3OW3A 3U9CA 2PMIA 3U4UA 3KMWA 4E4NA 2W96B 2OH4A 4BCGA 4U97A 4FZ7A 3FKLA 2YAAA 3LCSA 3UIUA 3RZFA 4IHPA 2P2HA 2C6DA 1PF8A 1Q3DA 4DLIA 3VBXA 3V3VA 3FY2A 3OG7A 2W1HA 4O0TA 4Q9SA 4DG0E 3BGQA 3ZXZA 4WHZA 3E3BX 3VF8A 3P08A 1NVSA 3Q2MA 4K9YA 3KK8A 4MBIA 4O7ZA 2AYPA 3G5DA 2PMLX 4F4PA 4M84A 5DT4A 2ZV7A 3LFCA 3BYMA 4JAIA 4FVQA 3FPQA 2XIKA 1REKA 2JIUA 5AAEA 3C7QA 4OR5A 4FKLA 4LYNA 3D94A 4EOIA 1L8TA 4OTFA 4D1SA 2J0JA 2BTSA 4CYJA 2J5FA 4XV9A 3GCUA 2X4ZA 2R3LA 5DWRA 3LXNA 5M51A 3LKMA 1Q8YA 3G90X 4ANQA 4D9UA 3EQHA 4HJOA 4BHZA 3BHTA 3EJ1A 4BDGA 5E9EA 3IOKA 3VVHA 5TE0A 4GKHA 3GU6A 1ZRZA 2RSVA 3QZGA 3UIBA 4EWHA 1IEPA 4ACDA 1BKXA 4FV9A 4UMTA 4Q2AA 2YWPA 3NNXA 4GYGA 4LL0A 5FUTA 3S2PA 3WF6A 1SM2A 2UZBA 2Y6OA 3QLGA 4GUEA 5CSVA 4Z3VA 4D2SA 5BUEA 4ZMEA 5GZAA 1T45A 4DH3A 4EOKA 4MXCA 5HVJA 2X6DA 4YZBA 2B7AA 1FVTA 3FI3A 5FG8A 4YPDA 1V0OA 4KS8A 3MS9A 5AA8A 3IW6A 3R9HA 4ERWA 3BU3A 3AMYA 5CWZA 3BU6A 3F66A 2XK6A 4FTAA 1ZZLA 3AC1A 4EOLA 4MF0A 3EQIA 3F3VA 3GVUA 2PK9A 3Q9YA 4GFMA 2XRUA 3QQGA 2P0CA 4QMWA 3NYNA 4U0IA 4NM7A 4Q9ZA 4KIKB 4I94A 1P4FA 4CG8A 4C34A 2C30A 1F3MC 1PW2A 3PJ2A 3ZOSA 3QUEA 1OPJA 2C6KA 3C4ZA 3DAEA 4CNHA 2XB7A 5JZNA 1ZLTA 2XNEA 3LFSA 4F70A 4C2WA 3ZO2A 1GNGA 3TM0A 4RWIA 2YIYA 1SVEA 1Q8TA 5FTGA 1M2RA 2NRUA 2VTSA 2X4FA 3FHRA 4FTJA 5CU3A 4C3PA 3GU4A 4NZWB 4D2WA 4DINA 4GJ2A 3FI2A 4EK6A 4PNKA 4NEUA 2F2CB 2W1GA 1E1XA 2HK5A 4FL2A 4FT3A 4TWOA 4XNEA 3HMMA 3PSDA 4KD1A 2AC5A 4I3ZA 2WQMA 3H30A 5CSWA 5T68A 2NNWB 2X8EA 3IW5A 1TQIA 3GNIB 1FMOE 3NNVA 4F9AA 2OBJA 3P9JA 4BCKA 4YP8A 2V62A 4H3QA 3Q2JA 1KE5A 5E92A 5EW9A 3PXZA 2QLQA 2H6DA 3S1HA 1QPEA 5GJFA 5JFSA 3Q96A 1PXKA 3ULIA 1BI7A 4PMSA 2YAKA 3LCOA 4ZLOA 3F5GA 3W2PA 5IH6A 5BVOA 3EB0A 4LV5A 4HPUE 4RX8A 3C4XA 4ALVA 1H8FA 3E8NA 3R02A 2JBOA 4JBQA 3OHTA 3PVUA 4FVRA 1SVGA 3OUKA 3VBVA 3ZZWA 2GFSA 5GZ8A 1WMKA 3HX4A 1P5EA 2W1CA 3D15A 5IQAA 1SNXA 3C0GA 2RIOA 2LGCA 2VU3A 4S31A 3TKIA 3ZUUA 5ANKA 4UWYA 5AP1A 5GZ9A 3A99A 3PWDA 3G9NA 2YM5A 2A0CX 5EDPA 3RAHA 3QCSA 4QP7A 2UZVA 3NSZA 3V5PA 2I0HA 4FUYA 2BAJA 3GC8A 3OF0A 4CYIA 1A48A 4BIBA 4YJTA 1MRYA 2ZVAA 3B2TA 3BRBA 3QRJA 5FEEA 1OUKA 4LL5A 4QP4A 5AM6A 5HE3A 3VQUA 4BC6A 2VTMA 3EWHA 5J1VA 3V5LA 4M8TA 3CIKA 2VNWA 5DR9A 3PSBA 3AXWA 4BDEA 3ZONA 1CTPE 2PZRA 3PLSA 4I5MA 3MV5A 2ACXA 1M2QA 5IEVA 2WQNA 4E5WA 4DA5A 4BCHA 5AV1A 3JXWA 1DI8A 2ITXA 3GU7A 3POOA 1FINA 3D0EA 5ETCA 3PY3A 4O38A 2PVRA 4IZYA 4I93A 2VTQA 4AT3A 2CN5A 4DG2E 4FSNA 3COMA 3II5A 4BZOA 4G3EA 2JIVA 2XVDA 5E8XA 4ZMFA 4FEQA 3C0HA 3OCSA 4OTWA 3OEZA 5HX6A 1VEBA 4BI0A 3LFEA 4DBNA 3BX5A 3QWJA 3V5JA 1OI9A 2JD5A 1K9AA 3Q6WA 4MXXA 3Q3BA 1Q97A 3AC8A 2PZIA 4FMQA 5HCXA 4L00A 3OY1A 1YXXA 3I79A 4OTHA 5C1QB 3NCGA 4KB8A 5CYIA 3E87A 2ERZE 1Q5KA 4DTKA 3Q04A 3TJCA 3FLZA 5GJGA 4F64A 5D41A 3BBTB 1A06A 3LZBA 4RFMA 2BKKA 3UYTA 2XIZA 2BHEA 3D5XA 4GEOA 3UNZA 5I9YA 4FEWA 4BTJA 5K4JA 4ALWA 5JQ8A 4IACA 4X0MA 2XYNA 4RIWB 4AT5A 4BWKA 2ZV9A 5JQ5A 1I09A 4CV8A 4Y72A 4D28A 5JH6A 3TDVA 3RGFA 5AUTA 4BBMA 1JQHA 4CFWA 5DG5A 4YR8A 1IG1A 1TQMA 3HL7A 1A9UA 3HRBA 4O0WA 4QMUA 4I4FA 3QQLA 3BYSA 2YM7A 2GNLA 4CFFA 4QMXA 2QURA 3OTUA 5AIRA 1OGUA 2E9PA 2X2MA 3NR9A 3RM7A 4ZSAA 4IDVA 4KBCA 4H3PA 3WF9A 5A4QA 2R4BA 5EW8A 3DZOA 3MI9A 4FOCA 4J52A 5BQ0A 3ATTA 3FHIA 2DWBA 3ZXTA 4CT1A 1DAYA 4EK8A 3UNKA 2QOQA 3EL8A 3OEFX 1O9UA 1YHVA 4I5PA 3RALA 3PUPA 4DE4A 3IK3A 2WQBA 5AP5A 3OY3A 3EH9A 1H0WA 3ZMMA 5JMSA 3LIJA 2Y9QA 3R01A 3MESA 3PLAE 4I6BA 4JR3A 4X21A 4F9YA 4O0VA 1M14A 1XH8A 2I0EA 3C0IA 4A4LA 1EH4A 4EUUA 3G51A 5HG5A 4EJNA 3QC9A 3U6HA 4FBXA 4BKZA 1YHWA 4CMTA 4NFMA 3PRIA 3OXZA 4L45A 4F9CA 1MQ4A 3QXPA 5J1WA 3TDWA 1F5QA 4EBVA 2WOUA 3EQGA 4FT0A 1WBTA 2H34A 4AW0A 3N9XA 3ZTXA 1KOBA 4HZSA 4IC7A 4OTIA 4IM2A 2GSFA 2XP2A 4BCJA 4I20A 4O91A 2DS1A 2WHBA 5H8GA 3TWJA 3HP5A 5I3OA 3QD4A 4JOAA 5M56A 5FDXA 4O96A 3RAKA 4RIOA 2X7OA 3TKUA 3FMHA 2XUUA 3FV8A 2Y6MA 5KKRB 5IA0A 2VNYA 2R0IA 4RA5A 4P4CA 4R3PA 2HCKA 4FV3A 4Z9LA 2XIRA 3LMIA 2XJ2A 1IA8A 2WMWA 2QOCA 4FIGA 4OTQA 4FKOA 4RJ7A 5CEIA 5CQWA 3SG8A 2XA4A 1WVWA 5EYDA 3MH2A 3QRIA 4OW8A 4YNOA 2ITZA 5AUZA 4H1MA 4AF3A 4C4EA 3BE2A 3RK5A 2QI8A 4HVDA 1YDRE 2BFXA 3REPA 2XZSA 2YCSA 4YJRA 5BX0A 5LVPA 3JS2A 4YURA 2WAJA 2JEDA 2C3LA 2ERKA 4DG3E 3DY7A 2QKRA 4PX6A 4CRSA 4D2RA 3ULZA 1O6KA 4I22A 4IVDA 4Q5HA 5H9BA 5I3RA 5L8KA 2OJ9A 4XG3A 3I0OA 2E2BA 4PPCA 4AA0A 5HO8A 4EHEA 3GCPA 3N4UA 4QPMA 4NTTA 1AQ1A 1ZYJA 1OPLA 4QP1A 3R8UA 4EL9A 4JR7A 4O7YA 4JQ8A 5IA2A 3QFVA 2WU6A 4J98A 4YLLA 1Y8GA 4I0TA 4AFJA 5EM5A 4JDKA 2CDZA 1J7LA 5FXQA 1WVXA 3W2SA 4J53A 3ZLSA 4AE6A 3BI6A 2ITTA 4XV1A 5IG1A 3ATSA 2HZIA 2UVZA 4QRCA 1E9HA 5BMMA 3E5AA 4RWKA 1OUYA 3NW5A 2FSMX 4DEAA 3UE4A 4D1XA 3PVWA 5CTPA 2R3NA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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