2BZIB

Crystal structure of the human pim1 in complex with a ruthenium organometallic ligand ru2
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
273
structure length
272
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIGGQVFFRQRVSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of the Human Pim1 in Complex with Ruthenium Organometallic Ligands
rcsb
molecule keywords PROTO-ONCOGENE SERINE THREONINE PROTEIN KINASE PIM1
total genus 84
structure length 272
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2005-08-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2bziB02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2bziB01
3CE3A 3LLAA 3WOWA 5L6WL 4M66A 4E4LA 2R5TA 4QYEA 5K5NA 5D1JA 5AP4A 5K4IA 2VUWA 3N51A 3QQUA 2J0LA 4GJ2A 4Y83A 3ZS5A 2UZVA 4MNEA 3WI6A 2VNWA 5IH4A 2A0CX 5LJJA 1CMKE 4E93A 4BB4A 4G9RA 2F2CB 2ZV9A 5FP6A 4ZSEA 4AW0A 1FINA 5ICPA 4F9AA 2PVKA 4FNZA 1Y8YA 1ZOEA 4TWOA 4GV1A 2WTIA 3RK7A 4UN0C 5AA9A 4GK4A 3FI3A 5CS6A 3PPZA 2WTJA 4RFMA 3QKMA 4PP9A 3QC4A 4FEVA 2BRHA 2HXQA 4ACDA 5E8ZA 5HTIA 2Y0AA 4UYAA 2B9JA 3WZJA 2FA2A 3ZSGA 3OXTA 3E63A 3IS5A 3VUMA 3TZMA 3DJ6A 5LVPA 3MPTA 2X6DA 5IQIA 3BLRA 5E8UA 1MP8A 3F3UA 4U45A 2YACA 4JBQA 3LCOA 5IMXA 2EXMA 2WFYA 3QXOA 3UOLA 4RWKA 5KMOA 4DTBA 3LVPA 3F7ZA 3K3IA 3OWLA 2EXCX 5LARA 2HCKA 3R28A 4G5PA 5EG3A 4FNYA 4QYHA 4QP4A 3KULB 2I0EA 4RT7A 4PDPA 3RK5A 4AT4A 5JQ5A 2RSVA 4IANA 3F3WA 3QBNA 5JK3A 4LGGA 5IEXA 3G5DA 2BZKB 5ANGA 5C4LA 2C6TA 2BRMA 4EOJA 3QRJA 4QPAA 5CAQA 3D7TB 5M06A 3A7IA 1WVYA 2REIA 3FQEA 3RAIA 4E5WA 3ATSA 2YFXA 3FEGA 3QRUA 2E2BA 2OGVA 2OI4X 1XH4A 3DNEA 4YJOA 3V5TA 4EH9A 4U5JA 2YDJA 3A8WA 2ERZE 4BGHA 5IQDA 4FKVA 4OTDA 1R0EA 1XH9A 4ASXA 1DS5A 3RHXA 2WOTA 4KBCA 4HYSA 3W2PA 3MY1A 3LMGA 4QTEA 3R22A 3FC1X 5EW3A 3I7CA 1HCLA 3ANQA 2JITA 3DAKA 4LM5A 4NKAA 4HOKA 1YVJA 2PE1A 4KRDA 2FSTX 4BDFA 3I6UA 1KV1A 5A4CA 4FKUA 4DGNA 3RNIA 4FL3A 3AOXA 3ZH8A 3PIYA 3BYOA 3ODYX 1U5QA 3C5UA 3BWJA 5AM7A 3TIZA 1FGIA 3NS9A 5AFVA 3QLFA 1YW2A 4CV8A 3ZYAA 1FMKA 3QQJA 4JJRA 3C0IA 4DF3A 2I0YA 4AZVA 4EORA 3VBWA 3NWWA 4EOLA 4O6EA 3C4FA 2C30A 2XUUA 4NM5A 3SKCA 3TT0A 1GIJA 3LQ3A 2KTYA 3F66A 4E8AA 1U54B 2BFYA 2P55A 2XCHA 5AP0A 5IA0A 3KMMA 4LMUA 5ACKA 2VTQA 3DDPA 3ULIA 2BDWA 4AGWA 3PZEA 3MW1A 4APCA 2J5EA 3VWAA 2J5FA 4BZDA 4EOIA 2O2UA 1M2PA 4L3LA 1UKHA 3RAHA 2GNIA 4QMLA 5JEBA 3EQHA 2CGXA 4FV2A 5IA3A 2OJ9A 4R3CA 5KMLA 2KULA 4QP6A 3D2IA 1BL7A 4HZRA 5HG5A 2O3PA 5HEZA 3U8WA 1PXPA 2QOHA 3HX4A 3BGQA 3FXZA 3R7VA 2RFSA 3VN9A 5I3RA 3PSBA 4XG9A 3R9HA 4MXAA 3RCDA 1XWSA 2YAKA 5CX9A 4P90A 5TE0A 4EHVA 4GG7A 2B9FA 3U6HA 2C4GA 3VF9A 5LXMA 3GFEA 3HRCA 3SOCA 2G15A 5JRQA 4JX3A 4APPA 5LWNA 1PW2A 4TNDA 4CKRA 4BCGA 3EOCA 4RWJA 5DWRA 1VJYA 1CKJA 2RG6A 4RX8A 2FH9A 4B0GA 4I5PA 3PLSA 3DK6A 3AT2A 1SMHA 3ODZX 5CXHA 4ZTMA 1K2PA 3EIDA 5EM5A 1LUFA 4MTAA 4ZLYA 2CNUA 2JDSA 3S00A 3Q4UA 4FOCA 4E6DA 4J98A 3UOHA 2BAQA 4NKSA 4YJRA 5E8SA 4S2ZA 4Z55A 2WAJA 3SVVA 3BU3A 4BCNA 4O7SA 3KXXA 3V6RA 3C4CA 4IFGA 2ONLC 4ACCA 4R3PA 4RFYA 4A9RA 3PJCA 4LMNA 3UC4A 4C4JA 5EHYA 2XM9A 3UNKA 3R9OA 4PX6A 3GBZA 3OW4A 4K9YA 4I6BA 4M15A 4Y72A 5HX8A 3AC2A 4JAJA 3ACKA 4FV0A 4YUQA 1G8AA 2UW8A 2YIQA 1B38A 5FP5A 1HOWA 1H26A 4RIXA 2G2FA 3KN5A 3U55A 3C51A 4K0YA 4YZNA 1ATPE 4OTWA 4PDOA 4CSVA 3E7OA 1FMOE 3WIKA 2C5NA 1W83A 2R7BA 5I9XA 3NSZA 4QMNA 5CSXA 3VUIA 2HZ4A 4IM3A 1MQ4A 1YQJA 1ZZLA 2P2HA 4XRJA 3MS9A 2QOCA 2PE2A 3IONA 3R00A 2W0JA 3HECA 5LVOA 3EFJA 1H0VA 2BTRA 2UVYA 3A7HA 4QNYA 4TL0A 4W8EA 3ZBXA 2R3IA 3GU7A 4F1TA 1CKIA 4X0MA 5IA2A 3CQEA 4PTEA 3VUGA 4EOPA 3RCJA 4FSNA 4OTGA 4KKHA 3ROCA 5LQFA 3IW5A 5AMNA 3C4WA 3VS4A 3I79A 3VJNA 3NW6A 4GUEA 5A6NA 4DINA 3NUSA 3ZM9A 4BR3A 2JKQA 2JBOA 5HIBA 5I9UA 4Z16A 1J7LA 5LMBA 4FZAB 4ITJA 3F2AA 2CKEA 3CGFA 3AT3A 3OT8A 4EH3A 5JMSA 4R5YA 4F4PA 4MHAA 3WBLA 5BVFA 5J1WA 1YDTE 3NCZA 2ZM1A 4G3FA 4BICA 4CZYB 3K5VA 5L6PA 3BHHA 3EFWA 2IVSA 3EN6A 1OBDA 2X8EA 2O0UA 3Q4TA 4UWCA 4RJ6A 3LM0A 4BF2A 1Q62A 3WF8A 4CRSA 4AZTA 3UPXA 4FEQA 3SXSA 2OIBA 4QPSA 3VBYA 4X3FC 5JGDA 3AC5A 4FUXA 4CYIA 4FTUA 4O6LA 5AV0A 1MRUA 4E4XA 2Q0BA 2WMTA 5F95A 3SRVB 1JSUA 2PUIA 2IZRA 2V0DA 3DJ5A 3I6WA 3QQLA 4FF8A 3HVCA 4IIRA 4M67A 2GMXA 4QD6A 2VTSA 1K9AA 2UZLA 2Y6OA 4WSYA 4WBBB 3FHRA 5LMAA 2ZV7A 4J1RA 2WTKB 4RLKA 5DE2A 2YM8A 2VTLA 3CJFA 2C1AA 3VS2A 4ANNA 4DCAA 4O38A 3AMBA 5IKWA 1O6KA 3CS9A 3AD6A 3FPQA 5I5ZA 2O63A 1P2AA 3UDBA 3DK7A 3G6GA 3LFBA 1B6CB 4H36A 5CU2A 3EL7A 3NNWA 2PVNA 3KXZA 3O2MA 3TN8A 4UYNA 4D4RA 4FEUA 2F49A 4WG4A 4ZTNA 3EN9A 3RHKA 1PHKA 5HNBA 3LQ8A 3ORKA 1SVGA 3OEZA 5C8MA 2VO0A 3TZ9A 4L3PA 2R3QA 3S0OA 2X39A 1ZYLA 3ACJA 4IC8A 5CAUA 5TO8A 1FGKA 3FY0A 3FYKX 2XKFA 3BV3A 3QTRA 4NK9A 3HLLA 3SW4A 3W2CA 4P2KA 2W1DA 2X81A 5DFPA 2R9SA 2ZMDA 4YLJA 3ZOSA 5AADA 2PZYA 4KSPA 1CKPA 2QURA 2RFEA 4O0XA 3TJDA 3UQGA 3V01A 3ZFMA 5FDPA 4GT3A 3N4TA 5CEPA 2ZV8A 4XNEA 3ZO1A 4FA2A 4FKRA 4DEAA 3W32A 4B8LA 4M69B 1ZOHA 3IDCA 4QMVA 2VTHA 4BC6A 4C3PA 3QD0A 2B52A 3G6HA 5M4UA 3TV6A 2PY3A 4CMUA 4YZMA 4EQUA 4FTNA 3UYSA 4U80A 1KE8A 3HV7A 4A9SA 1VYZA 2Y8OA 5C27A 3I5NA 4I94A 4L6QA 4FKIA 3EHAA 2VTRA 2Z7QA 2FSOX 4R7BA 2X2MA 3V51A 5J7BA 4MK0A 2BDFA 3C13A 4O22A 2V5QA 4S34A 3R8PA 4AU8A 4DLJA 2NO3A 5H9BA 3NPCA 4ZS0A 5IUGA 4FIEA 4CTBA 2ONLA 3OC1A 1Q8UA 2ZDTA 2XRUA 3W55A 5A4LA 2J0IA 4O7WA 3U6IA 5CAOA 2OKRA 3P0MA 4ERWA 4YTCA 2UV2A 3DZQA 5EDQA 3QX2A 2UW6A 4LYNA 2BAKA 4H58A 2YZLA 5BUEA 3NDMA 3ORTA 3W8QA 5CENA 2PVLA 4MEDA 3COHA 1ERKA 5DBXA 4F6WA 3FMHA 4GCJA 4XG2A 3QYZA 3PSDA 4CFFA 2VX3A 3E7VA 1MUOA 2WMUA 3VIDA 4BI2A 3UE4A 2VAGA 3Q2MA 4W4XA 4F7NA 1PMUA 3M1SA 2OO8X 4Q9ZA 4RPVA 1OIQA 2JFLA 3PP1A 1PYXA 3ORPA 3TEIA 4GYIA 5DR9A 3MFRA 3U54A 3NUXA 4I0TA 4L8MA 4EONA 3RVGA 5F9EA 3UQFA 1JVPP 3WARA 4E4NA 3F5XA 2ITVA 4UALA 4FMQA 1UV5A 3NRMA 5CAVA 3Q04A 1TKIA 4CFXA 4ANSA 4ZXTA 3AC4A 5AAEA 3MDYA 3KCKA 1AQ1A 1DI9A 4BCPA 3PPKA 4AFJA 1M14A 1IG1A 2XIYA 1J1CA 5HE3A 4X2JA 2CGWA 4F7JA 4FG7A 4RC4A 3VUKA 2QOFA 3LFDA 4G6LA 4H3BA 4PL3A 3ZMMA 1GZOA 4QMPA 2PUNA 3CKXA 1WBPA 3LFQA 3FYJX 3KGAA 2C1BA 4C57A 3PXKA 4N6ZA 5IMEA 5ANKA 3DDQA 2R7IA 5A46A 2XNGA 3BQRA 1H1SA 3P1AA 3ZO2A 5EOLA 3GQLA 2HAKA 5FM3A 4DFLA 4O7NA 4F0FA 3OXIA 2WQEA 4B7TA 1OIYA 2E9PA 3UZTA 1UNLA 3GCUA 2VWXA 4I93A 4YHTA 5J79A 3HAVA 4A4LA 4RGJA 4UY9A 4ASEA 5AEPA 1RW8A 3S4QA 4FTAA 3EN5A 4FT5A 4MBJA 4Q9SA 3GOKA 4IFCA 4X3FA 3V5PA 5KUPA 1GIIA 3PWDA 1Q8TA 1SYKA 1P4FA 4IBMA 2WMAA 4Z3VA 4QOXA 4FSYA 4DGMA 4GU9A 4YJSA 5HBHA 1Q97A 3FZOA 4EC8A 3DBQA 4FSUA 3WF7A 3UO4A 4DFXE 5DOSA 4CT1A 5IUHA 5M4CA 3EQIA 3QQHA 3TACA 3POOA 3PY0A 4FI1A 4OR5A 5FWKK 4WNKA 1F5QA 3R8LA 4PNKA 3SHEA 4CFVA 3SV0A 3QGWA 3CCNA 4BKYA 3GCPA 4IH8A 4WKQA 4XV1A 3F9NA 3R1QA 1UVRA 2QNJA 4R1VA 5BX0A 1IA9A 4DEHA 2QU5A 3R7GA 4ACGA 2J7TA 4PRJA 1BLXA 3F2RA 4TYIA 4U97A 5DGZA 4F9WA 4ZZOA 5CT7A 5EFQA 5B0XA 2J0MB 3OTUA 5DPVA 5FGKA 4A9UA 4BKJA 3ZM4A 4KD1A 4XBUA 4WD5A 4IZAA 1YHSA 4BWKA 1DAYA 4D2TA 4F08A 3BYSA 1YOMA 3P4KA 3PSCA 5EYKA 1YDSE 1GZKA 3AMYA 5AP5A 3GEQA 3DKOA 5AR8A 4F9YA 3QTXA 2E9UA 3TTIA 2W17A 3THBA 4KIKB 1YDRE 4CG9A 3LFCA 3ZEPA 1IEPA 2RKUA 2YLEA 4I1ZA 2VN9A 3VBQA 3GB2A 4DH1A 4HVHA 4HYUA 5FBOA 3OUNB 3ELJA 2VGOA 2JDTA 4O0TA 3V5WA 3DPKA 4NZWB 1NVRA 3FWQA 3QWKA 2XK6A 5IUIA 3OHTA 4TYGA 4PDSA 3SX9A 4O0VA 1JLUE 3PXRA 4ZLOA 3OOMA 4ZJVA 2GSFA 4QYGA 4HGTA 3CEKA 3PXQA 4I5MA 4IZ5A 4RC2A 3KVWA 3UZRA 2WMRA 4JAIA 5K4JA 5KBRA 3CY3A 1RE8A 4IWDA 1PY5A 4QP8A 5A4EA 2GQGA 3CQUA 3KKVA 3LCDA 4FC0A 1SVEA 4RIWA 4XLIA 4QTAA 1NA7A 3UC3A 4WSQA 4L52A 5GJDA 5DR2A 2Y4PA 2PZPA 2X6EA 2O8YA 4HCVA 2UZBA 5CEQA 5FLFA 4C7TA 2HZIA 3DV3A 4AA5A 3DAJA 5CZIA 5BVWA 3R9DA 4BIEA 5H8GA 1KE6A 3FMNA 3PA3A 4NIFB 4AOTA 5HO7A 4C02A 1H0WA 2BZJA 3VBVA 3CJGA 5KMIA 4D5HA 3PXFA 4FSQA 4AW1A 2XJ0A 4QP3A 2QCSA 5HESA 5JSMA 4NL0A 3DTWA 3QZGA 3FI4A 5EM8A 1WBOA 4IVDA 2H96A 4FX3A 1XH5A 1EH4A 2Z60A 2C6DA 5ANOA 3MVHA 4ANLA 5TOZA 3QZFA 2YIYA 3Q4CA 5LMKA 4FEXA 5AUWA 4IM2A 4EL9A 1YWNA 3O23A 3V3VA 2XKCA 2HK5A 3BBWA 1PJKA 1UU7A 2IJMA 1H25A 2R3MA 3F61A 3TNQB 5ETAA 4FIFA 4BGGA 4DG3E 5JQ8A 2Q83A 4O7LA 2PTKA 4BZNA 4WRSA 3VUTA 4E73A 3QLGA 5GNKA 5ETFA 2XK9A 4S30A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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