2BZKB

Crystal structure of the human pim1 in complex with amppnp and pimtide
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
273
structure length
268
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIGGQVFFRQRVSSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the Human Pim1 in Complex with Amppnp and Pimtide
rcsb
molecule keywords PIMTIDE
molecule tags Transferase/peptide
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 268
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2005-08-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2bzkB02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2bzkB01
4ITHA 3COKA 3EFLA 2B0QA 4X3FA 4YR8A 3QGYA 1HCKA 3RK7A 1Q8UA 2IZRA 2R0IA 3TL8A 2ONLC 3Q5ZA 5IA3A 3RPYA 4DEDA 3LJ1A 3S0OA 4DGOA 3LLAA 4IHPA 3D7TB 2QO7A 3RVGA 5K4IA 3VS2A 2WMRA 4YLKA 2WMXA 4C4HA 4CSVA 2WQBA 3WOWA 4GVJA 3H3CA 4YGAA 1RJBA 4FI1A 3SOAA 3LMIA 2OJ9A 3BBTB 3ZUUA 5KE0A 2IO6A 5DWRA 3ZM4A 4CVAA 2YCQA 3LLTA 4BC6A 3TDWA 2YZAA 4K8AA 3DKGA 4PF4A 2X1NA 4TYGA 1QPJA 4FT5A 1OIUA 5AP5A 4ZMEA 2WQOA 3ANRA 3MTLA 2QOCA 4J53A 5DBXA 2ZM4A 2B9IA 3D83A 3BPRA 4G31A 3NYVA 4BY9E 2OO8X 4RVLA 2B7AA 3ETAA 1WBOA 3PDTA 1PJKA 5EDPA 5IEXA 2VO7A 3I0QA 5HVJA 3NIZA 2V7AA 3PWYA 4GL9A 4H3BA 4I1ZA 5BVWA 3LM0A 3SV0A 4F09A 4Z55A 3CTJA 4KABA 3E8NA 2GNGA 4ZTLA 2QO9A 5E91A 4FODA 5FGKA 3VS1A 5AP2A 5BYZA 1YI6A 4IXPA 3M1SA 3U9NA 4ONAA 4X6QC 5K0KA 3UNJA 4F0FA 5JFXA 4OAVB 4Z16A 1YDRE 4BZNA 3OEFX 4PTCA 4F9AA 3DZQA 4I6BA 5C01A 3EH9A 4U79A 4LI5A 2QODA 5CVHA 3HMNA 5EHYA 1YXUA 4CG9A 5I9YA 3DQXA 5CT7A 2Y7JA 4IEBA 5L6WL 3NR9A 1H1RA 3DNDA 4GMYA 3PFQA 3TXOA 2JLDA 3PZEA 5JT2A 2BDWA 4MX9A 4U97A 5FXQA 2ZJWA 3F9NA 4GIIA 2X7GA 3HV4A 3LM5A 5J5SA 3TT0A 3OBJA 4RQVA 4Q5EA 4AE9A 3F69A 5BVEA 3A60A 4G6NA 3AC4A 3F7WA 1BX6A 3FZOA 5ICPA 1S9IA 4KKHA 4IZYA 4O0WA 3HMMA 3MFTA 2VTPA 2R3QA 3QLGA 2BKKA 4HVGA 3OCSA 3QXPA 2VTRA 4NCTC 2FSTX 5IU2A 1OL1A 2J0JA 5D7VA 1OZ1A 1VZOA 2C5YA 5AEPA 2W1GA 3QD3A 5E8WA 4O7RA 4L7SA 3OXTA 4E7WA 1UWHA 2YN8A 4K9YA 4GFMA 5LMAA 2XF0A 1GY3A 3AGMA 3WBLA 4BHZA 3PP0A 4JDIA 4O0VA 4U80A 4O0RA 4FIEA 1CSNA 4ANLA 3EQHA 4Y83A 4C58A 4L53A 3MWUA 1RQQA 4AA0A 5A4LA 2ZB1A 4F4PA 2C5OA 3B2WA 4FICA 4NFNA 4D0XA 4NL0A 2J6MA 3PIYA 2ONLA 3Q2JA 4AG8A 5HU9A 5CZHA 5FBOA 2RSVA 5IH4A 1WBNA 2IVUA 3QTQA 1URWA 3VJNA 4GEOA 4EOJA 4BWXA 3K3JA 1MRUA 2V55A 3NUUA 4O1OA 4ZSAA 1R3CA 1PXLA 3EHAA 3F82A 4I6HA 3CPCA 3UO6A 4BIDA 5M09A 2G2HA 5HIDA 4D2SA 1OL7A 3E7VA 4G9RA 2YJRA 4DTKA 5CEMA 3AD4A 4J96A 4Q9ZA 4I92A 3RPRA 3D2KA 3NNUA 3UC4A 5HD4A 4C4EA 4G5PA 4R7HA 3P86A 2CKPA 3QD2B 5CI7A 3LFQA 1SNUA 2XS0A 3NCZA 2BDFA 2X8DA 3BU6A 2AYPA 2JAVA 3KXNA 1TVOA 4FSZA 5FWKK 5KMLA 4UXLA 3ORZA 4PRJA 2B4SB 1IEPA 2BTSA 5G1XA 4MTAA 4QMYA 3FXWA 4JIAA 4LFIA 5AP3A 3QAME 4PMSA 2W1EA 1KUTA 3PIZA 3JR1A 4ZLYA 4O7VA 2ITTA 4O86A 3E93A 3HDMA 5HHWA 4F1MA 4KS7A 5A6OA 3MW1A 5AUUA 2UVYA 3PPKA 1ZOHA 3CC6A 2XNGA 3O0GA 2WU7A 4XG9A 4BCQA 4FKTA 2YERA 4XBUA 4RJ3A 4R1YA 5AFVA 3FY2A 3H0ZA 2WNTA 1BL7A 3JXWA 4FVPA 4A4XA 2JDSA 4WUNA 2AC3A 2QI8A 4FIHA 1W0XC 4YBJA 4R5YA 2XKEA 4M8TA 4BGGA 3DXQA 2IW9A 1IAHA 4WNOA 2X39A 2OGVA 4RX5A 1W98A 1JNKA 2WTKC 1HCLA 4C02A 3RNIA 1WVWA 3CJFA 2R3NA 3R7GA 5E8UA 5KNJA 4RX9A 4BBEA 2CJMA 4DFNA 4LV5A 5AM7A 5H8EA 4YLLA 3ALNA 2C5NA 2ITZA 2DUVA 2R3JA 2HY81 4NM3A 5E4HA 4DBXA 2GNFA 1Q24A 2GCDA 2JKOA 3KMMA 4G3GA 1JVPP 4NCTA 5HKMA 1XQZA 4PDSA 2CNQA 5HX6A 4DCAA 4A9UA 4AN3A 2HK5A 3WIGA 3BLRA 4UXQA 5HCZA 2WO6A 4F7NA 2P2HA 3FSFA 2WTKB 2OU7A 1YW2A 2ITPA 4DYMA 4X2FA 2PY3A 3MH0A 4WBBB 4AZEA 1Q97A 4RFMA 1V1KA 5HCXA 4BDEA 4RIWA 2C3KA 4F0GA 4EH4A 3HUCA 3R02A 2WGJA 4O0YA 1YRPA 2XK6A 3GC8A 5H8BA 4HYUA 4YBKA 4CFXA 2HELA 3ACKA 4JQEA 4FV5A 4OT5A 3Q9WA 3PXRA 3FKNA 4FKQA 4JR7A 4GG7A 5CY3A 1XH9A 2F7ZE 4AGUA 3SXFA 2GNLA 1BMKA 5FEQA 2YM8A 3L9PA 5ETIA 2QD9A 3KN5A 4RWKA 5L6OA 2ZM1A 5A9UA 2QU6A 4AA4A 3F66A 5BQ0A 4OT6A 4G17A 5D7AA 4MXXA 3DS6A 4A4LA 3D0EA 3FSKA 5GINE 3W8LA 2B55A 4QMQA 2E9NA 2J0MB 4DEGA 3TJDA 4BFMA 4V05A 4IC7A 2GNJA 4ITIA 3RAWA 3RCJA 3SXSA 4E26A 3QBNA 4CLJA 1RE8A 1YOLA 5D9HA 2B53A 5TR6A 1YHSA 2WKMA 3II5A 4HYIA 2QOBA 4HZSA 1APME 2BFXA 2OW3A 4AW0A 2CKQA 3W2CA 4FSQA 5FQDC 2VTMA 3OXIA 4JS8A 3L9MA 3UO5A 4FE2A 4W4WA 5LWMA 1IG1A 4L52A 4XMOA 3R2BA 4OTWA 3ZXTA 3NUSA 4Z3VA 3PVUA 2PE2A 4C0TA 1OPLA 2F2UA 5LXMA 2XK3A 2RFNA 5CAOA 4MF0A 4DTBA 3R8MA 3GCQA 3SDJA 1RDQE 2QOQA 4O7NA 3F7ZA 4A07A 4NT4A 2OI4X 3PPJA 4E4MA 1Q4LA 4UEUA 4OTRA 5D11A 1M14A 3KULB 4RIOA 2WMWA 1YHWA 2ITQA 2O63A 1REJA 5JRQA 3FC2A 3RZBA 5J9YA 3OBGA 4PY1A 2UZWE 4IFCA 2OXYA 3UGCA 4D5HA 1Q99A 2P2IA 1GIHA 3OF0A 2VWVA 4PPBA 4DH5A 5A14A 4L67A 2ZVAA 3VS6A 5C8NA 2REIA 4FT9A 2CCHA 3GCSA 2JIVA 1PXKA 4PMMA 2C47A 2H9VA 4TPTA 4GYGA 4W9XA 3UBDA 3UYTA 5LJJA 2ERZE 1XH4A 4DT9A 2C0TA 2HIWA 2XIKA 4TTHB 3MFSA 2ITVA 4YJPA 5EM7A 3RPVA 3UVRA 2CNVA 4D2TA 2WD1A 1H0VA 4GU9A 4R7BA 4PUZA 5C4KA 1XWSA 1JBPE 4AXAA 2JC6A 5F4NA 2X9EA 2YZLA 3D5XA 4CZTA 2X81A 3V5LA 3EQRA 4FTNA 3AC1A 4W9WA 1ZYJA 3GC0A 4LMNA 5DFPA 3PSDA 4YJVA 3ZDIA 3T3VA 3I7CA 4KUJA 5DVRA 1PKDA 3NS9A 2FGIA 4HCTA 3EQPA 4IX4A 2YHVA 1PHKA 2W1HA 2VV9A 4NZWB 3VHEA 4MBJA 4FKIA 4GFGA 4V0GB 4YJTA 4YSMA 4I5MA 3IW5A 1JPAA 4U9AA 2O3PA 2G1TA 1OVEA 2EB2A 2J0KA 4IAYA 4D1SA 5B2LA 4F64A 4QTAA 1ZARA 3M42A 4N4SA 3SKCA 4F08A 3DTWA 4PP9A 5E7RA 3VUTA 3DLZA 4FSYA 3ENHA 3QD4A 3QD0A 2NO3A 4OW8A 3DK3A 4DFYA 2Q0BA 3SW7A 4PDYA 3P5KA 4XHKB 2CPKE 2HY0A 2JIUA 3D14A 3MPMA 3FE3A 5J9LA 4O7WA 2JFMA 4FGBA 5C26A 4BB4A 4EI4A 2Y4IC 4FTKA 3REPA 1SNXA 3HKOA 4QP1A 4EJ7A 3DBFA 3HEGA 2CGUA 2P0CA 2PE0A 2XNPA 4MBIA 3QQLA 4JBOA 4OBQA 4QYEA 2VX1A 3EN4A 3A8XA 3OP5A 3OROA 3LW0A 4YUQA 1WMKA 2GSFA 5D1JA 4G3EA 4YTIA 4FSNA 1WVXA 5CU6A 4PNIA 3BQRA 3UZTA 4IAZA 2GFSA 2GS7A 2QKRA 4QYHA 1UNLA 4IDVA 3DK6A 3CJGA 3PSBA 3RWQA 3B2TA 3NNWA 3I0OA 2YAKA 2C0IA 4DTAA 3W32A 3FL5A 2WIHA 3KULA 4J95A 2WQEA 4BWPA 5L3AA 4ANOA 3VC4A 4TNBA 4HW7A 3OWPA 3UZRA 4IW0A 3MB7A 4MXOA 5CQWA 4FTIA 5G6VA 4TWNA 2Y4IB 3LXNA 4JI9A 2OJJA 4JXFA 2R7BA 4UV0A 4QMWA 4BCFA 5EYMA 2DQ7X 2PUNA 3FJQE 5JN2A 4KRDA 2DWBA 3NEWA 2XM8A 4AN2A 1A48A 4F6SA 4PP7A 2Z02A 4HGSA 4ZLOA 5T3QA 1UNHA 4GVAA 2Y6MA 2OSCA 2ITNA 1YWVA 3ORKA 3PP1A 4NU1A 4P5ZA 3OUNB 4QT1A 2OXDA 4RA4A 3CBLA 3HDNA 4TYEA 3LCTA 5M4IA 5IA5A 3OS3A 4RWJA 5CSHA 5AV2A 1QCFA 1BL6A 3GU4A 3UVPA 4FSMA 2ZV7A 5HLWA 5F1ZA 2BPMA 5CAPA 3F3TA 3EQFA 5FD2A 3MPAA 3C0IA 2YWPA 3KXXA 4IMYA 4D28A 2RIOA 2C6OA 4AW5A 4K11A 2A4LA 3EZVA 4DT8A 5FP5A 4BKYA 4BTJA 2OWBA 5IQBA 1U46A 2WXVA 2X8EA 4V0GA 3W2OA 3ORIA 3QU0A 2NRYA 2CKOA 4X7QA 2YCRA 2PZIA 4F9BA 2QKWB 3UTOA 5AV4A 1OKYA 3ZC5A 3OEZA 3DV3A 3OOMA 5CU0A 4RSSA 2WMBA 3ALOA 2XNMA 3CY3A 4E93A 3HRBA 1U4DA 3EL8A 1H01A 3S95A 1OKVA 4H58A 2X7OA 3FQSA 2WHBA 4K18A 2IG7A 1AQ1A 4WSQA 3OMVA 5BUIA 5CQUA 4ZTSA 4H1MA 3P79A 1PKGA 3LFAA 3DBQA 4P4CA 4YZCA 3EYHA 4ASDA 4YZDA 5EW9A 4G9CA 2PSQA 4IB1A 4NEUA 2BHEA 3LXPA 4CT2A 5M56A 4IZ7A 3NCGA 2R3FA 3I4BA 4C38A 3A4OX 4CNHA 2NNWB 4X2KA 3FYKX 3R7OA 1J91A 3VBQA 4QMPA 5CXHA 1PMEA 1H27A 2PVHA 3MVMA 4IWOA 3CD3A 4OAUC 2LGCA 3DA6A 4GK2A 3OCBA 5AV0A 4EHZA 5IUGA 3WE8A 2F9GA 5CX9A 3ZFMA 3V3VA 4FKUA 2R3IA 2VO3A 5EYCA 4QP2A 3ELJA 3FKLA 1DI8A 3TZ7A 2HENA 4XH6A 2BZJA 4EH9A 2EXMA 2WEVA 3R8VA 3PA3A 3FMEA 5HVKA 5HTBA 1YWRA 5DNRA 5JZNA 4FKOA 3R83A 3TV7A 1NXKA 4UX9A 3HAVA 1BI8A 1K2PA 4S32A 5K4JA 4IWPA 1MQ4A 2XRWA 3NW7A 5HGIA 2UUEA 4GYIA 2IW8A 4KAOA 3QTRA 4F9WA 5EOLA 3GCUA 5HE3A 1P5EA 3BELA 4OLIA 3HYHA 4RQKA 4DLIA 5IPJA 4LV8A 2WMQA 2J0LA 3QTWA 4EJNA 2BAKA 4FV4A 4DH3A 2UW3A 4JX3A 4RC2A 3VWAA 2PUUA 3QXOA 1SVEA 4MNFA 3MESA 1UNGA 4DE4A 4JR3A 2P33A 2QLQA 3FMJA 3HECA 4O0UA 4Z9LA 4XUFA 2O8YA 4ZTNA 4FL2A 5HE1A 3U87A 3D5UA 3DBDA 4QNAA 5EW3A 3RHXA 3MH2A 4ZTQA 3NZ0A 4EBWA 3D4QA 5GJFA 3ET7A 3GXLA 4CGAA 3F3ZA 4J98A 2XBJA 4UZDA 4BTKA 4IANA 4NYEA 2CN5A 3SG9A 3MBLA 2C0OA 4AOJA 3UJGA 4ANBA 4HGTA 3VAPA 1E1VA 1BLXA 1UU3A 1V0BA 2BROA 3T8OA 1PXOA 5J7HA 5CAUA 2XUUA 4DGLC 2W96B 3ERKA 3UG2A 2PZYA 3TEIA 2YM6A 5L2SA 3R7EA 1NT2A 5HE2A 3FBVA 4I20A 3VRYA 4XP3A 3P0MA 5FTOA 5CT0A 4M68A 2ZAZA 4RZVA 4RWLA 1SYKA 2WMVA 4R3PA 3F2AA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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