2C4GA

Structure of cdk2-cyclin a with pha-533514
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
301
structure length
301
Chain Sequence
PLVDMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title 3-Amino-1,4,5,6-Tetrahydropyrrolo[3,4-C]Pyrazoles: A New Class of Cdk2 Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 89
structure length 301
sequence length 301
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2005-10-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2c4gA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2c4gA01
2C6MA 2VO7A 2CDZA 4EOMA 3HDNA 4EJ7A 5J7BA 4PWNA 5AUZA 3UO6A 3ENHA 5HG9A 4DYMA 4F0FA 1WVXA 3IECA 3COIA 4ONAA 3KCKA 5H2UA 1WFCA 3UQCA 2QOLA 5JKGA 4FSRA 5J9ZA 4GKIA 4XG9A 4F9WA 1W98A 3LJ0A 3E93A 4I0TA 3KRLA 3EKKA 1G8AA 4RFZA 3DFAA 4O7YA 3CLYA 4O22A 1WAKA 5E7RA 1OIUA 4XG4A 2VWWA 3SAYA 1ZYLA 3PE2A 2OO8X 3OBJA 3N51A 2H34A 3HX4A 3FXXA 5AR2A 2ZV2A 2YM3A 1VJYA 3L8PA 1YHWA 4QP3A 3GGFA 1YQJA 2XKDA 5F20A 2EB2A 5HBJA 3UMXA 2W99B 3BIZA 5AP1A 4U42A 3LM0A 2X7OA 4GVAA 4JNWA 4UX9A 2B52A 5HG8A 2EXCX 5HG5A 3F3VA 1YI4A 5K3YA 2QKWB 4A07A 4DTBA 3CP9A 3UG1A 3CY2A 3GU8A 3C4EA 3VS4A 3HV4A 4DH7A 3FY0A 1Z5MA 4G34A 3QD2B 4K8AA 4ZJVA 4HVDA 4DEDA 1B39A 2JIVA 4YC8A 4BIEA 1URWA 2HELA 4RQKA 3UPXA 3ZFMA 3LAUA 5H8EA 4ZTLA 3U87A 2VNYA 2QLUA 3UNJA 4N6ZA 1BI7A 4PTEA 4EZ5A 3L9NA 4QP6A 4N57A 3QCXA 3EYHA 2BRNA 1SYKA 1IG1A 4O7TA 4G6OA 5GIPE 3OXTA 2W17A 4HGTA 4RBLA 4I5CA 4S33A 4NFNA 4ANQA 3IOPA 4JR7A 4PTCA 3VUIA 4X2FA 1IA8A 5DPVA 2QOBA 3Q6UA 4O91A 1SNXA 3O8TA 2CKQA 1XH5A 3HAMA 1ERKA 3EQPA 3NUNA 2IZSA 1PKGA 2Y4PA 3OHTA 3ZSHA 4CV8A 3QUDA 3D94A 2RG5A 3D7ZA 3W2OA 4QMMA 5I5ZA 3U54A 4M15A 5L2TA 4O2PA 3ZM9A 2HW6A 4CG9A 4CRLA 3PPJA 3ZZEA 4E5BA 3D2KA 4G9RA 3TI1A 3FZRA 1SZMA 2RFSA 3G9LX 4O6EA 1PMEA 3S1HA 1VR2A 1LEZA 1W82A 3KEXA 4O7RA 2OBJA 3PZHA 4XEYA 2WQOA 3DPKA 3ORMA 5I9VA 5IQHA 3VBYA 4DEEA 3EB0A 3WE4A 1PW2A 3W2PA 4UMRA 5C8NA 3A2CA 1A9UA 4RVTA 4D1SA 5DFPA 3LFCA 2PVFA 1SVEA 3QD3A 4B0GA 4FICA 4PDPA 4W4XA 1I44A 1M2RA 3BI6A 3PIXA 4ERWA 4QTDA 4FT7A 5DWRA 2VTPA 4O2ZA 3U9CA 4F70A 4L9IA 4OAUC 4IFGA 2V7OA 2QNJA 5F94A 5M09A 5AV1A 3BX5A 5EM6A 1ATPE 4ZXTA 3U51A 5HBEA 3GU5A 4KIKA 4GW8A 1O9UA 1M2PA 3A8XA 3BU3A 4PMSA 4XX9A 5ETAA 3VUHA 4TKSA 4NWMA 3ELJA 1GIIA 3PSDA 2YACA 3RAHA 4EWQA 3GBZA 4NM7A 4AAAA 3VBWA 4JIAA 4TYJA 5A54A 5IQFA 4MXOA 5HE1A 3LE6A 2HZIA 4FTMA 3C51A 2BZHB 2P55A 5FP6A 3AD6A 5KMOA 5KMNA 3DNDA 5JFSA 3BHVA 3ZFXA 5A14A 1R39A 3ORLA 4C7TA 4JG7A 4CFWA 2GSFA 2V5QA 1ZY4A 5FEDA 3KXNA 3RALA 3DDQA 4JBPA 3KULA 4F6UA 3NMUF 4FGRA 2GQSA 4WSYA 5FM2A 3LJ2A 4QQ5A 4S31A 4RRVA 2BDFA 5LXMA 2YIRA 4GFMA 2PZRA 3TZ8A 3W10A 4RZVA 2ZOQA 4HOKA 4UYAA 3P7CA 4UBAA 4EH9A 5AUVA 2C3JA 1J1BA 5DRBA 5KZIA 3TUCA 4CRSA 3TEIA 3ZS5A 3LOKA 4HCVA 4Y73A 2YIYA 1PHKA 2OF2A 3V5QA 5A6OA 4O0VA 1M7QA 3OY1A 3NS9A 1BL7A 3SD0A 2OW3A 4FKVA 2BRHA 3T9TA 4OBQA 4BCKA 4O27B 3TZ9A 2PY3A 3AGMA 3D15A 5DR2A 3TL8A 3QXPA 2UVYA 5KHWA 4FKPA 5D11A 5HHWA 2YZAA 5ETCA 2R3GA 1HOWA 3FBVA 2ZM1A 3E7OA 2RF9A 3KRWA 3QWKA 3GC0A 4C3PA 5E8SA 3PRFA 4OAVB 2OH4A 4RX8A 2VZ6A 5LVOA 2WMXA 3HMIA 4O7WA 4LRKA 5GZAA 4E20A 3OC1A 3FJQE 3DKOA 3KMUA 3BLQA 3TKUA 3QTZA 2IW6A 4X6QC 4IACA 5D9HA 2Z60A 4RVKA 4JQ7A 2ZM4A 3ZBFA 2VTQA 2J0MB 1BUHA 1JAMA 2R0IA 4CMUA 2W4KA 3MIYA 4JBVA 4YO4A 2BDWA 1XWSA 2PZIA 5BMSA 4TTHB 3G2FA 4FNZA 4J97A 3RPVA 3HP5A 3GU7A 3ZEPA 2P3GX 4AGUA 5H8GA 3FMEA 1PXJA 4JRVA 3BYVA 4AZTA 4QP7A 4BKZA 4BZDA 3KY2A 4CYIA 3CD8A 4M69B 4W8EA 4QP2A 4E3CA 2JDOA 4C3FA 3ODZX 5DGZA 4L3PA 3R28A 3R9NA 1UA2A 2JFLA 4MXYA 4FV3A 4GH2A 3BV3A 5C01A 5FDPA 1H1RA 2I0EA 3Q9ZA 3NUPA 3EH9A 1BX6A 4KKHA 4UZDA 3ZEWA 5CENA 2CNQA 4I0SA 4PMTA 1XKKA 3GC7A 2GCDA 5L2WA 3MFUA 3AC8A 2W9FB 4FV5A 4GS6A 2JKOA 2EB3A 4ZS0A 4PPCA 4B7TA 3BE2A 3EWHA 4ITIA 5CVHA 4QPMA 2WTVA 4YJRA 4XG8A 4U80A 4J95A 4WSQA 5EK7A 5EKNA 2DYLA 3AXWA 4J53A 4LUEA 2G9XA 3P23A 3RAIA 5FG8A 1ZOHA 4M13A 1JSTA 3I6WA 5A3XA 4B6LA 1ZOGA 2Q0NA 4DA5A 4EWHA 1STCE 3I7BA 5JFXA 1R1WA 3ZO4A 2O3PA 4A4XA 2I6LA 2UVZA 4BIBA 3VS3A 3TXOA 4O7SA 2B9HA 3LVPA 4GSBA 3TV4A 4J8MA 4D2RA 3AC5A 4FVQA 1OVEA 4KD1A 5JN2A 2JIIA 3IKAA 2PVKA 4I4FA 3WBLA 5AR8A 1W83A 3DBFA 3CE3A 1JBPE 3FMHA 1P4OA 2GNIA 2YAAA 2QURA 3QUPA 5CF5A 4CFXA 4CZUA 2Z8CA 2IN6A 2P2IA 4AT3A 4GG5A 2BHEA 3UVRA 4MCVA 3RHXA 2H6DA 3N4UA 3FMJA 4AF3A 5J5SA 4RJ6A 3OMVA 2GU8A 3S3IA 5CSVA 3FY2A 5CTPA 2WU6A 3P7AA 3KFAA 2XKCA 1Q8WA 2C1BA 4IAFA 3HP2A 4G3EA 3PJCA 3O7LB 3QCYA 4U40A 2V55A 2C68A 1YDTE 2OXXA 2WOTA 4IWOA 2XJ2A 4KB8A 5FGKA 5IH5A 4WUNA 2HYYA 3V5PA 1MUOA 4MQ2A 4NT4A 3FLSA 3QC9A 3TNWA 3ZRKA 4BWXA 1F0QA 2YCQA 3PPKA 2Z7LA 4RWLA 2B9IA 2J5FA 2YLEA 4R1YA 1REKA 3O8UA 3PFQA 5HU3A 5IH4A 5HO6A 5IUHA 4NEUA 4AT5A 3D7TB 4U6RA 5HD4A 4JBQA 4ZTNA 3TJCA 4DBNA 5M55A 2F2UA 5C26A 3TZMA 2GS2A 1CKPA 4E6CA 4PPAA 3VS2A 3PWDA 5CU4A 2R0UA 4EOPA 3S4QA 3MY1A 1WZYA 4BBEA 3LQ5A 4QMZA 3ERKA 3OW3A 1PRYA 4BCPA 4F9BA 4RIYA 3VHKA 2OJFE 2EXMA 4EOSA 2YCRA 4XV1A 2BRBA 4AA4A 4Q5EA 1ZYDA 5FM3A 3NNUA 2R3IA 2WGJA 4HYUA 2IW8A 4BBMA 4D28A 4YTCA 4FG8A 2PWLA 5LMKC 3QQKA 5BUEA 5ANJA 4BCQA 3QRKA 2CNUA 5C4KA 4YJTA 3GT8A 5BVNA 4YJUA 4D4SA 3OP5A 4HNFA 4O0YA 2PHKA 2R7BA 2OFVA 4IBMA 2WIPA 3C50A 4F7LA 3QWJA 3AOXA 5M07A 5ANKA 1XH4A 3CPCA 2A4LA 3K54A 1DAWA 2XZSA 5EI6A 1F3MC 3OROA 1ZRZA 3F2NA 2CGXA 5HNGA 3THBA 3UNKA 2XJ0A 1KOAA 1MQ4A 1WVYA 3F6XA 3TIYA 4ZY5A 2O5KA 2OJ9A 5KNJA 4YZNA 5AV2A 2QU6A 4U41A 1YVJA 4FZDB 4U3YA 4R3PA 4AN3A 4S2ZA 3HMPA 5HVJA 4O81A 3LMIA 1H07A 5LVPA 4K18A 1RDQE 4K6ZA 4MX9A 4XP0A 4BDIA 5EQYA 4U3ZA 2IVTA 2RGPA 5EDQA 2XK3A 2HWPA 2PVJA 1Q24A 3AMAA 3QX4A 1NY3A 4KINA 1WBVA 3JXWA 1B38A 4G6NA 4UV0A 4ALVA 3EFKA 4M0YA 2QO9A 3ZLSA 4GUEA 4CLJA 1M17A 5CX9A 5LMKA 4JG8A 1KE7A 4FE2A 2VWVA 3L1SA 1Y6AA 3H9FA 1TQPA 3F9NA 3HA6A 3O96A 4J1RA 3VF9A 2CN8A 4MXZA 4BN1A 4BWPA 1UU8A 5CQUA 2C0TA 3HECA 3NGAA 3ORZA 4MH7A 3A99A 4ZJIA 4BI1A 5IQAA 4GV1A 5DRDA 3VHEA 3NWWA 3W32A 2ZDTA 2W1IA 4A9SA 4DC2A 4F08A 1OKZA 4BGHA 4K0YA 4HVSA 2ERKA 4FYOA 2LAVA 3TNHA 4I20A 3OS3A 3A7JA 3VUDA 4EJNA 4MTAA 4YSJA 3GOPA 1KWPA 3R04A 3LMGA 3UZRA 1KE8A 4AUAA 4MBJA 2X8DA 1ZMVA 4FV1A 3DKCA 3DXQA 2J90A 2WQNA 4D2SA 2BAKA 2YM4A 3FYJX 2BFXA 3OUKA 3RKBA 3TNIA 5L2IA 2G2FA 1FMOE 2OI4X 4KSQA 1AGWA 3T9IA 4QMWA 2ETKA 3DFCB 1ZMUA 5AR7A 3U6HA 4O7VA 2XYNA 5LJJA 3Q2MA 1H26A 4MBLA 4MWIA 3F82A 4YLKA 5LARA 5KO1A 3UOJA 3CSVA 4DF3A 3M1SA 3WIGA 3E92A 3FQSA 3FYKX 3IW5A 3KGAA 4CFMA 3MVLA 4QP1A 5KKRC 3OG7A 3KF4A 2HAKA 4Z9LA 5AP0A 4LOOA 4F6SA 4UYNA 5IEVA 2WELA 3F5XA 3LKMA 4EOOA 5C1QB 3DBQA 4WNKA 5AIRA 4A4LA 2JBOA 3BLHA 4C62A 3BHHA 4PTGA 1Z9XA 2NO3A 2ZYBA 3ETAA 4KS7A 5EG3A 5I4NA 3PSBA 4FTOA 4IC7A 2WXVA 4AZFA 3MVHA 2VD5A 1ZYSA 4FKRA 3NEWA 5CF8A 4HGLA 1YHVA 4TZRA 1M7NA 1H24A 4BC6A 4HPUE 3OEFX 2PE2A 2WMSA 2PVNA 4NUSA 3R7YA 3RTPA 1G8SA 3DTCA 5DIAA 4B8LA 3QTSA 4L52A 4BDJA 4LI5A 4CV9A 5EHYA 4L43A 2J9MA 3DJ6A 1K3AA 1RW8A 3KXGA 5CLPA 4FVPA 4EQMA 4YJVA 2PUPA 2CCIA 2A27A 4X7QA 1J91A 2VTLA 3SKCA 3SQQA 4DEHA 1KV2A 4F1TA 3C4WA 5IA4A 2JLDA 4OTFA 4E73A 3PY3A 3MY5A 2W5BA 3HDMA 4NTTA 2RSVA 4MNFA 4BGGA 2Y9QA 3DQXA 4BIDA 4FOBA 4DH1A 5IQEA 2CGUA 5IDNA 2ONLA 4QYGA 3RVGA 1Q4LA 3E5AA 5FXQA 4DCEA 4DEIA 1OKWA 4H1MA 4QYYA 5HESA 2ETMA 3OTVA 2IO6A 4FKLA 2GDOA 5JK3A 3GCQA 1J1CA 3G9NA 3CS9A 4O1PA 4WRSA 3JVRA 5ACBC 4MYGA 4NIFB 5BVKA 3JYAA 3UPZA 4KWPA 4L6QA 2E9OA 2YAKA 2ZMCA 3OWPA 2CLXA 3D0EA 4YSMA 4MBIA 3QTQA 4U79A 5HLPA 4F6WA 3D9VA 4AW5A 3BHUA 2FSTX 2C0IA 4BB4A 3OD6X 1KE6A 3CQEA 3BEAA 3FLNC 3IONA 3DJ5A 3KU2A 2C6KA 3PA3A 4OUCA 1ZZLA 2GNLA 3EHAA 4TPTA 2UZUE 1W8CA 2OXDA 4MNEA 5KMLA 2XS0A 4AOTA 1JPAA 2WPAA 3A4PA 3BLRA 3UG2A 2B53A 4C36A 5E8TA 3R8ZA 4FL2A 4ITJA 4JS8A 3RBWA 5DN3A 3FZPA 3C5IA 3AMBA 3AC3A 1ZWSA 1ZYCA 3LCKA 3OF0A 5FXSA 5ETFA 2W1DA 2VO3A 4FTIA 5CU6A 2WD1A 3GCVA 3VS6A 4CNHA 4ZK5A 5DT4A 3V01A 3W2CA 2PVHA 3KKVA 4RVLA 3Q5ZA 3IW4A 3GC8A 5HLWA 3PXFA 3GENA 1BI8A 3M11A 4FTLA 4C8BA 3JPVA 1PMUA 3OZ6A 4O6LA 4ZSLA 1A48A 5BYZA 4ZMFA 4BYJA 5DR9A 3WARA 4ASZA 4JQEA 2PMOX 3DCVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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