2C6LA

Crystal structure of the human cdk2 complexed with the triazolopyrimidine inhibitor
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
298
structure length
291
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Triazolo[1,5-A]Pyrimidines as Novel Cdk2 Inhibitors: Protein Structure-Guided Design and Sar.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 291
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2005-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2c6lA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2c6lA01
4WBBB 3QHWA 1E1XA 2BZIB 5FXSA 4YTCA 2W1DA 4JDHA 3K3IA 5CEKA 4KUJA 4XBRA 4GMYA 2QHNA 5HBEA 2ZVAA 2PMNX 2WPAA 3IGOA 3IDCA 4X2KA 1IEPA 3LLAA 3LKMA 5GHVA 4JQ7A 2PSQA 4DH5A 4DF3A 2W5BA 4DG3E 4B8MA 4EK6A 3CBLA 3FXWA 1H01A 3LFEA 2O65A 1UNGA 2C3LA 4TYJA 3BRBA 3MVLA 2IVSA 3T8OA 2XMYA 4EH2A 4HCTA 2WMTA 4NIFB 5DA3A 3RHKA 3EH9A 3SG8A 3I0OA 3FJQE 3D5VA 3PWDA 2JGZA 2VTQA 4CZUA 5JFXA 5K5XA 3TWJA 3DCVA 1JAMA 3C4FA 2CGUA 3VUTA 2EB3A 3OC1A 3PZHA 2XUUA 3DLZA 4MKCA 1A9UA 1Q8WA 4RJ6A 3V51A 4ZSAA 5IQBA 2W4OA 2R3RA 3FLQA 4I93A 3BX5A 4WRGA 3C13A 3WF9A 4M69B 2QCSA 4GW8A 4QQJA 4LOPA 3FMEA 4WG3A 5CSWA 2J0KA 3C5UA 3C5IA 1JNKA 1M17A 3ODYX 3SA0A 4RZVA 3L9LA 4ZZMA 3UDBA 3W18A 5HTBA 2QG7A 2RF9A 3E92A 3BEGA 3CY2A 4BIDA 4S30A 1V0BA 3IO7A 4J96A 2YIYA 1Q24A 2PHKA 3D94A 3NUYA 1Q61A 1UU9A 4MQ2A 3RGFA 3FLYA 4JAIA 1KOBA 2F7ZE 3DGKA 5KX8A 1R1WA 3NRMA 5JMSA 2GNFA 3ATSA 4RJ3A 4FTCA 2X1NA 4HNFA 3BU6A 3AD4A 3RAIA 4XHKB 2VWXA 4JVGA 3R02A 3NNUA 2QOFA 3Q2MA 4U3YA 3PJ3A 5E1EA 4EQUA 4A9YA 1H27A 3MY5A 2C0IA 4RJ4A 1VYWA 2R3GA 3VBYA 4O81A 2WTWA 2GU8A 3CQUA 3QQJA 4M3QA 4KWPA 4BDGA 4D2PA 3VQUA 3E62A 4MBJA 4PUZA 4EORA 3MA3A 3LCDA 2ONLC 4AE6A 3SV0A 3MY0A 5IPJA 1GJOA 1SMHA 1J1CA 2VWWA 3BELA 3ORTA 2EB2A 3MN3A 4RA4A 3UG2A 3GENA 1J3HA 2JDSA 4PPBA 5HO8A 4ACDA 5AUZA 2RSVA 2V7AA 4QTAA 2HXLA 2R9SA 4UXLA 4IZ7A 3TL8A 5IEYA 5BPYA 3HMOA 1YI3A 3IW4A 3QCYA 4EOSA 4BFMA 2XK8A 3MWUA 4KKHA 4D58A 4UB7A 4BGHA 4QMXA 3FLWA 4CZTA 3OCTA 1PF8A 4EOQA 3DU8A 2W1ZA 3OMVA 4XV2A 5DGZA 4QRCA 4FGRA 4C61A 4J53A 4GJ2A 1BLXA 3U6JA 5EDQA 4IC8A 3HYHA 1VEBA 4YJTA 3N51A 4IJ9A 2IW8A 3RWQA 5LXMA 3D5UA 3W2SA 4MNEA 3LPBA 5E8TA 4CFWA 4X6RA 3QBNA 4S31A 4ZSLA 3RAHA 3CE3A 4DEEA 3LIJA 3OXTA 4UN0C 3MJ2A 1YXTA 5AFVA 1DS5A 5E8YA 5A9UA 4HVIA 5JFVA 5JKGA 3V3VA 4RVKA 2BHHA 5A6OA 1CKJA 3LCOA 5IZFA 2V55A 3FV8A 1W8CA 5CQUA 2VO0A 1Z5MA 2V5QA 2YIQA 2A19B 3LQ5A 4PPCA 2X8DA 5C03A 4F63A 2UUEA 1PJKA 3R63A 4BTMA 1M7QA 4MXOA 4WSYA 4BDKA 4C4JA 4U8ZA 2WMRA 4K8AA 2ERZE 3FMNA 3PY3A 4MXYA 4F1MA 5AUUA 3KRXA 2W1FA 4MK0A 1BL7A 2YCSA 3EZRA 4RX8A 4X2JA 4EC8A 3LFDA 3H0YA 5F4NA 4WD5A 3OWLA 2KTYA 2RFNA 4XG3A 4Y5QA 2QNJA 2I0HA 3NPCA 1YHSA 3QD4A 4RWKA 3Q60A 3ZUVA 4A9RA 1ND4A 5LQFA 2PTKA 4F65A 2JLDA 3TTIA 4V01A 3WYYA 5J9YA 2VX0A 1XBBA 3H30A 3V5JA 4KRDA 4FEUA 3R01A 2R3HA 3QTUA 2Z60A 3R7GA 3I5NA 4L68A 2VWYA 4BBFA 2GNLA 3DKGA 1J91A 3PA3A 5J9LA 1Y8YA 2VRXA 2PY3A 4M97A 4FTQA 3ZONA 3BLHA 2QOLA 3QCSA 3PVBA 4X6QC 4UBAA 5CXZA 3IG7A 5KZ0A 3QC9A 1WVYA 5J7HA 3ZXTA 2ITTA 4FSNA 4JDKA 4QMYA 1U5RA 3PWYA 2ITNA 3ACKA 2RG5A 3NS9A 3VC4A 1IASA 3BGZA 4IAZA 5E1SA 4X3JA 4RJ7A 2GSFA 5LARA 2WFYA 4F7LA 5CF5A 4FTOA 2WB8A 3HRBA 3O8UA 3FI8A 3WBLA 4QP7A 2JDRA 5IH4A 3F82A 4PTCA 5JRSA 2FSMX 2HAKA 2XJ1A 2Z7LA 1KWPA 4AZFA 4DLJA 4MXXA 3DPKA 3CQWA 3F7ZA 2OJJA 4ITIA 2F9GA 2R3KA 2PVNA 5KMIA 3JVSA 1ZMUA 4MQ1A 2F49A 2I1MA 1LR4A 3P7AA 4WNPA 4ZS0A 3IS5A 3QGWA 2UW8A 3F7WA 3QQKA 4FI1A 4XV1A 2KULA 3RPSA 4C7TA 2PUPA 5GIPE 2C47A 3VULA 5K5NA 4EC9A 1NW1A 4AF3A 3EZVA 4F9WA 1YXVA 4XRJA 4Z9LA 1IAHA 4UXQA 4AA0A 4D9TA 3OTUA 3E3BX 3FZSA 3O7LD 4GKHA 3UO6A 4F9CA 4A9TA 4O0YA 3D0EA 2Z2WA 4R1VA 1B6CB 4QP2A 2PPQA 4FIGA 3WF8A 4Q5HA 5IUIA 4YLLA 3UP2A 2UZDA 3DK3A 3ZCLA 3UP7A 2XIYA 4RX7A 2JBOA 5AJQA 3IW7A 2OSCA 3ORIA 2OXXA 4BZDA 4CVAA 3MFUA 4APCA 4FVQA 4O0TA 1H1RA 3FEGA 4GH2A 3VS3A 5EQYA 4K9YA 1FVVA 3ETAA 4LL0A 4CG8A 3NMUF 3PXQA 5ANJA 4C0TA 3SXRA 4U80A 4WA9A 3HX4A 2R5TA 4YHJA 3CQEA 3CY3A 2VUWA 4M15A 2QOOA 4IX3A 4J1RA 4PMTA 2V62A 3R9NA 3TZ8A 4NJ3A 4DEGA 3PXRA 5I9WA 4MF1A 4EOKA 3KEXA 2ZV8A 5G1XA 2X81A 4BCKA 2OIDA 4HGEA 4AZWA 3FI4A 4FV6A 4J52A 4OR5A 4EBWA 2C5NA 4ZAUA 3LXNA 4OT6A 4QPAA 3DOGA 2WMSA 3K54A 3QTSA 4IM0A 3LXPA 3TZ7A 2WQMA 3NYOA 4U7ZA 3MV5A 4YZMA 4YR8A 2XNGA 4FOCA 4BCMA 1ZY5A 3D83A 4EL9A 4P7EA 1WZYA 3A7JA 4RVLA 4EK4A 4DG0E 3WZDA 2I7QA 4YNEA 5FM3A 1CDKA 4ASXA 2WEVA 5EYKA 2JC6A 3V5PA 4BCGA 5B2MA 5BUJA 5DNRA 1UVRA 3EQPA 1REKA 3E8DA 2C1AA 2CNVA 4FK6A 1Q41A 5FRIA 3MBLA 4GK2A 3RNYA 3VUGA 3DT1A 1JSVA 2O64A 5ETFA 4Y85A 3EN6A 2GTNA 4NTSA 1URWA 3BLRA 3MTLA 4O7VA 3OOGA 4F0FA 5KMMA 2R0UA 4FTNA 4S33A 1FPUA 2WMXA 2YDIA 4O21A 2WQEA 5TT7A 4FA2A 4PTGA 1GIJA 4I41A 3O2MA 3QLFA 4Z3VA 3SRVB 2XH5A 3SXSA 4YNOA 3F5UA 2J2IB 3AC2A 4K1BA 4ZLZA 3DQWA 3F61A 3FWQA 2GHLA 3QRUA 1XH7A 5E8XA 1G5SA 2HW6A 1MQBA 4D4VA 5DYJA 2B4SB 3C50A 2W1IA 3DFAA 4OAUC 3KFAA 3UMXA 4DGGA 2VTOA 4R7HA 4TWOA 4KS7A 4J97A 3G2FA 5B2KA 5BVKA 2J0IA 4II5A 5ACBC 2GMXA 4C3FA 4KD1A 2XB7A 5M53A 3TIZA 3UE4A 5C01A 1WBTA 5J9ZA 2C68A 5AP4A 3CGOA 4HCVA 3TUBA 2IPXA 3WE4A 2JKMA 3Q04A 4NIFA 3HMMA 2HENA 2OICA 3AMAA 4CKIA 5FM2A 3CGFA 2C6MA 3OY3A 2ITXA 3ZRLA 3GCPA 3PLSA 4FVPA 4IANA 4YJUA 3DNEA 5I9ZA 3QA0A 4YZDA 1PXPA 5CASA 2W0JA 4QYHA 4IX4A 1H4LA 5LVLA 2Y4IC 4OTGA 4Y83A 3RTPA 4D1XA 1VZOA 5BMMA 4F1OA 2W9FB 3G90X 4FSMA 4RLKA 4FV1A 4M69A 3ZLSA 1WAKA 2VWUA 3P5KA 4CMTA 2XYNA 3GEQA 4F0IA 2UV2A 5FEEA 3POZA 3P1AA 2CN5A 3VUHA 3ZH8A 1U5QA 3QTWA 4O0SA 5BX0A 5ANOA 5HG7A 5CAOA 1G3NA 4PV0A 1JPAA 1SZMA 1XH9A 3WF6A 5A14A 2CKEA 5GJFA 3QKMA 3ZO3A 3KGAA 2C69A 3FC2A 4PL4A 3ZFYA 5DI1A 3AT4A 4FGBA 1H1QA 1JSUA 2XNEA 5LOHA 3QL8A 5CSXA 3ZM9A 1I09A 4MXZA 4ERKA 5HORA 1WBWA 1WBOA 5FEDA 3LJ1A 5H2UA 4I20A 3M1SA 5BYZA 4DEHA 2WTJA 3ODZX 5M4CA 3D7ZA 5L4QA 4YJQA 4CFMA 4D2RA 2W5HA 3OT8A 4U6RA 1U4DA 4C4HA 4USEA 5JQ5A 3E3PA 4D1SA 4E5AX 3KRLA 3PVWA 4P2KA 4IM3A 5DR6A 1EH4A 4UMUA 2ITUA 2OO8X 4FT9A 4JX7A 5EI6A 3GOPA 4FIJA 4XP0A 2XS0A 3VBWA 3HA8A 5HVJA 5K4IA 1PMNA 1XH5A 1YRPA 2BPMA 3CXWA 3LFSA 4ACCA 3UMWA 4B99A 4BCOA 1H0WA 3KVWA 5CF8A 1Q5KA 3DFCB 3LXKA 3NW7A 4ZMFA 2H96A 4UZDA 5FXRA 2VNWA 2X7GA 3II5A 4UWBA 4QQTA 2X8EA 5CAQA 3EN9A 4RQVA 5HD7A 4C59A 4ZMEA 3C0GA 2F7EE 3R9DA 1R78A 4M0ZA 5CVHA 4CZYB 4BYIA 2WMQA 4EWQA 5L2IA 4GKIA 1U46A 4I0TA 3U4WA 3UIMA 5EI8A 4F7NA 3ZEWA 4ANSA 4PMSA 4AW5A 4FKIA 3BYOA 2CMWA 5EG3A 4BKJA 4EZ3A 5BMSA 4FEXA 1OKZA 3CR0A 3MFTA 4ZSGA 2GDOA 3WZEA 1H1WA 1YOMA 5HNBA 2HWOA 2OU7A 3C51A 3MIAA 3NCGA 5D41A 2XIKA 4CFFA 2VX3A 3ORXA 5BVWA 2X2LA 4FKQA 3VS0A 2B9FA 3S2PA 4X0MA 4FNXA 3HV7A 4M7IA 4ZJIA 3KC3A 4CSVA 5CANA 4FG8A 3BI6A 4KIKA 5DLSA 1HOWA 3SHEA 2Y0AA 4QP1A 1NT2A 1ZZLA 3Q4UA 4QMQA 3NUPA 3R7UA 3PG3A 4HCUA 3HAVA 4ORKA 2BFYA 3A61A 3QAME 3IGGA 4HVDA 3OD6X 2ITWA 3NVKI 4UEUA 2QKRA 2QOQA 3LCTA 5HNIX 2HWPA 4EH9A 3U6HA 4ASZA 4KABA 4WHZA 4G5JA 4QP8A 2FA2A 2GHMA 4LOQA 5D12A 4F7JA 1ZYJA 3W2CA 3NIEA 3COIA 4XV3A 4FSWA 4ZJVA 3VS2A 3VW6A 1Q62A 5GJDA 3QGYA 4IX5A 4EUUA 3F69A 3IDPA 5HCZA 1CSNA 1LP4A 2XCHA 4U97A 3PTGA 5LVPA 5AAGA 3DJ7A 3HA6A 4XG6A 3UNZA 5L8KA 2PMIA 2ESMA 5M4UA 5E9EA 1JKSA 2BMCA 2XK6A 4QPSA 4H36A 4EHZA 5M51A 4HPTE 5AP1A 3ZC5A 4FSUA 3VW8A 4L46A 5T68A 4BDBA 5M08A 4GFGA 4DGMA 1Z57A 1OM1A 3RBWA 1H08A 2B52A 2W06A 3TNIA 1QL6A 5H9BA 3ZRKA 1PRYA 4EK3A 5IMXA 3NLBA 4W4WA 5JRQA 2XBAA 2GCDA 4Q9SA 4ID7A 5M55A 3P78A 4U45A 2BAKA 3FHRA 3Q4ZA 4FKVA 4OBQA 4XUFA 4FTTA 4IACA 1V0OA 3C4XA 4GRBA 3OVVA 3MTFA 4YPSA 5A4TA 3ZSIA 3A7IA 5IQHA 3RM6A 3TCPA 3GC0A 3TNQB 3Q5IA 4O7NA 3QLGA 4IAIA 3FXZA 3G0EA 3PYYA 4YJNA 4U9AA 3TG1A 4D9UA 4DA5A 1Q8ZA 2GPHA 2IZRA 5DFPA 4O84A 4CRLA 5AP6A 3QALE 4FYOA 3TIYA 1AD5A 4LMUA 3LFAA 2RL5A 1ZMVA 2QKWB 4Y73A 1FMKA 3RHXA 3QRIA 4BI0A 5IQAA 3SXFA 3RJCA 2ZMDA 4OT5A 3SVVA 1SNXA 3EFJA 5CNOA 3PVUA 2BDFA 2I6LA 5IH5A 4RIOA 5KMLA 4FL2A 4XP3A 4NYEA 1CKPA 4JX3A 5EW8A 4CCUA 3BYUA 3V5QA 2CKQA 3SGCA 5AA8A 1OPKA 4FUYA 4HJOA 5ACKA 4JIKA 4P5QA 4UYAA 4X21A 5TR6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4CYJ A;  1PXM A;  2JFM A;  3NW6 A;  3C7Q A;  4KKG A;  4C34 A;  1ZYS A;  2HIW A;  4GL9 A;  4ZEG A;  5ANI A;  1OIY A;  4DFY A;  4MCV A;  5E92 A;  3NUX A;  2JIT A;  3L9M A;  3WIK A;  1JLU E;  3W2Q A;  4KRC A;  2GS6 A;  3PRI A;  4AN3 A;  2ONL A;  1F0Q A;  3GVU A;  4I6F A;  2UZO A;  4FOB A;  3VWA A;  2PE1 A;  3W2R A;  1PXO A;  3A62 A;  1YXS A;  3R73 A;  4ZTN A;  3GXL A;  2WTD A;  2YCQ A;  3ET7 A;  3P4K A;  3QZI A;  4E8A A;  2B9J A;  2R0I A;  3PE2 A;  3CTJ A;  3FAA A;  1OL1 A;  3F5G A;  2XRU A;  4MXC A;  5CAP A;  5I0B A;  1BUH A;  4A7C A;  4CEG A;  2WAJ A;  2CJM A;  3QTR A;  4YPD A;  5AND A;  4IWO A;  5ITA A;  3QKK A;  4BDI A;  3I7B A;  4JS8 A;  2XK4 A;  3UYT A;  4FT7 A;  2AC5 A;  3KCK A;  4U43 A;  2YZA A;  3RK7 A;  3UVQ A;  4JDI A;  5E7R A;  4ACH A;  3ULI A;  3FKN A;  1OL7 A;  5E8W A;  1P14 A;  3PLA E;  2OG8 A;  3NGA A;  3F5P A;  4C3R A;  3QZG A;  3OXI A;  5HX6 A;  2RG6 A;  5KKR C;  5A4E A;  4EI4 A;  5DWR A;  4G9C A;  5DT4 A;  3SQQ A;  4L42 A;  4F08 A;  2WQN A;  4TN6 A;  2VWZ A;  3QQH A;  4HZS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4WBB B;  3QHW A;  1E1X A;  2BZI B;  5FXS A;  4YTC A;  2W1D A;  4JDH A;  3K3I A;  5CEK A;  4KUJ A;  4XBR A;  4GMY A;  3PFY A;  2QHN A;  5HBE A;  2ZVA A;  2PMN X;  2WPA A;  3IGO A;  3IDC A;  4X2K A;  1IEP A;  3LLA A;  3LKM A;  5GHV A;  4JQ7 A;  2PSQ A;  4DH5 A;  4DF3 A;  2W5B A;  4DG3 E;  4B8M A;  4EK6 A;  3CBL A;  3FXW A;  1H01 A;  3LFE A;  2O65 A;  1UNG A;  2C3L A;  4TYJ A;  3BRB A;  3MVL A;  2IVS A;  3T8O A;  2XMY A;  4EH2 A;  4HCT A;  2WMT A;  4NIF B;  5DA3 A;  3RHK A;  3EH9 A;  3SG8 A;  3I0O A;  3FJQ E;  3D5V A;  3PWD A;  2JGZ A;  2VTQ A;  4CZU A;  5JFX A;  5K5X A;  3TWJ A;  3DCV A;  1JAM A;  3C4F A;  2CGU A;  3VUT A;  2EB3 A;  3OC1 A;  3PZH A;  2XUU A;  3DLZ A;  4MKC A;  1A9U A;  1Q8W A;  4RJ6 A;  3V51 A;  4ZSA A;  5IQB A;  2W4O A;  2R3R A;  3FLQ A;  4I93 A;  3BX5 A;  4WRG A;  3C13 A;  3WF9 A;  4M69 B;  2QCS A;  4GW8 A;  4QQJ A;  3N4T A;  4LOP A;  3FME A;  4WG3 A;  5CSW A;  2J0K A;  3C5U A;  3C5I A;  2IF8 A;  1JNK A;  1M17 A;  3ODY X;  3SA0 A;  4RZV A;  3L9L A;  4ZZM A;  3UDB A;  3W18 A; 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