2CPKE

Crystal structure of the catalytic subunit of cyclic adenosine monophosphate-dependent protein kinase
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
336
structure length
333
Chain Sequence
VKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the catalytic subunit of cyclic adenosine monophosphate-dependent protein kinase.
pubmed rcsb
molecule keywords cAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE, CATALYTIC SUBUNIT
molecule tags Transferase(phosphotransferase)
source organism Mus musculus
total genus 102
structure length 333
sequence length 336
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 1992-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2cpkE01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2cpkE02
4LL5A 2XNBA 4QMNA 3CJGA 3FWQA 5E8ZA 3R8VA 1P4FA 1YHWA 4F09A 5B0XA 4KKGA 5HD4A 3SG9A 3O8UA 2OWBA 2EXMA 1P4OA 1REKA 1E1VA 2FO0A 1PXOA 1Q61A 2R3HA 2X39A 3H9FA 1ZYCA 4JDIA 4EL9A 4FZ7A 4GKIA 1OZ1A 4AAAA 1ZMUA 2VN9A 3QZGA 3OW4A 3Q2JA 2LAVA 4CV9A 4AZFA 3LCDA 3I0OA 3CPCA 4BCPA 4GEOA 2CLXA 2VUWA 4C4JA 4ZLZA 4FSUA 3OCSA 4D0WA 1VR2A 5FTOA 3W33A 3QWKA 2FH9A 3OP5A 3IKAA 1OL6A 3PVBA 4IB3A 5JRSA 5CF5A 4BICA 4JBQA 3BHHA 3IW5A 4J8MA 5IQFA 3LCKA 1PJKA 3PY0A 4U79A 4EK6A 2XNGA 5E8TA 4KIOA 4HGLA 3TWJA 4BDGA 3ZDUA 5LQFA 5HTCA 3HRCA 5CNOA 1JSTA 3VF9A 4NH1A 4GFMA 2CKEA 4TRLA 5B2KA 5IQGA 2YLEA 4F4PA 2PU8A 1ZYDA 4M0ZA 3BLHA 1TKIA 3KVWA 1CKPA 2ZYBA 4CFNA 2CNQA 4KKEA 3F3TA 4QMUA 3Q52A 5IA5A 3VQHA 4B0GA 5HIEA 2VWBA 5K4IA 1MQBA 4ZTLA 3NLBA 4RIXA 3LM0A 4IADA 4ENYA 3RPSA 5FBNC 1U54B 5D7VA 4F6SA 5HBJA 4KINA 2W4KA 2PL0A 2WQMA 3WIGA 4M0YA 4CYIA 2OJFE 3PFQA 1CM8A 1H07A 2F7EE 2XB7A 3FLZA 4FNZA 4EOLA 3C0HA 4BHNA 2VWVA 2UZVA 4U41A 4AGCA 5E7RA 2O63A 4O82A 3PJ1A 2PSQA 4MWHA 1VYZA 4TNDA 3IOKA 5TT7A 2QG7A 2ZMCA 1K3AA 3FMDA 2XNPA 4F70A 4YGAA 2JFMA 2W06A 4GSBA 3QALE 2PZRA 3QQGA 4YHFA 2F9GA 2W1IA 4GFOA 3MJ2A 4YJTA 2HK5A 4XV3A 3FXWA 4M14A 2O0UA 3SHEA 3GC7A 4TW9A 4OLIA 4DITA 4HW7A 2XS0A 3D2KA 3RPVA 4L3JA 4H36A 3A8WA 5CEOA 5JT2A 3Q53A 5CU6A 5C01A 2X2LA 4DBNA 3E8DA 2QONA 3LXLA 2XRWA 5J7HA 4HZRA 3LZBA 4FT7A 4TWPA 2X9EA 3QYWA 3V51A 3UIMA 2WOTA 3W55A 3ZLYA 2OF4A 4IXPA 3GC8A 2IVVA 3LFFA 4FKTA 4KWPA 3ZZWA 3RAHA 4J53A 2Z7LA 2C68A 2VTTA 3D5UA 4ZJJA 3BLQA 3F3ZA 4BWXA 4ZTNA 4GJ2A 3VUMA 3GC9A 4N6YA 5ITAA 3GU5A 4O83A 4O22A 2HY81 3I79A 1PRYA 3N9XA 3ORKA 4E6CA 3OW3A 3IW4A 4XG7A 5IKWA 3WI6A 5LMKA 5IUGA 4EHEA 2VTMA 2HW7A 3P1AA 5DE2A 1YXTA 4X2NA 2R3GA 3HDMA 3P4KA 1XH8A 4OTQA 3L8VA 4JDHA 4BDEA 4DTBA 3DPKA 2PZPA 2B9HA 4V01A 5EDPA 5LVNA 4GKHA 1SNXA 4O7SA 2Y6MA 3LJ2A 3NRMA 3Q32A 4QP7A 5K9IA 3JY0A 3MV5A 4QP8A 5AP6A 4FSWA 4A4OA 3F5XA 3OEFX 2FB8A 4RIXB 1OKZA 4RJ3A 4A07A 3ZTXA 2J51A 3LFCA 3MTFA 5HQ0A 1FINA 1IR3A 3OHTA 3I5ZA 4F99A 5GJFA 4MXAA 3D5WA 4ZS0A 2R3FA 5EYDA 4BKJA 4EK4A 2I6LA 1QPDA 3FEGA 2XJ2A 1GZOA 2VO7A 3DJ7A 3GCUA 3ZBXA 2VWXA 3IDCA 1OECA 2I1MA 3L8XA 3E5AA 4BL1A 3IECA 4HNIA 5L6PA 4HGSA 5FXQA 1JKSA 4CFXA 4DFLA 5A3XA 2JKQA 4G3GA 3FJQE 3MS9A 5LMBA 3P86A 3AMYA 1XKKA 4JX7A 4PUZA 3EYHA 4NM5A 3BELA 3QX4A 4UMUA 4CV8A 4E5BA 3DCVA 4YO4A 1PYXA 2YZAA 3FUPA 5FDXA 5FEDA 4XHKB 5AR8A 3RZBA 5KKRB 2GNLA 3I0QA 4L9IA 5IH4A 2ITWA 3TZ8A 4AA5A 4XLIA 4NIFB 3GCVA 5DRDA 3KGAA 4D58A 4E4NA 4MHAA 5KMOA 4QP9A 3VBQA 2A0CX 4FTJA 1PY5A 2F2CB 3A7JA 2EU9A 3HP5A 3C4XA 4JDKA 2XNOA 5AP2A 4DGGA 2J90A 2W0JA 3MH0A 3VRZA 4XV2A 5M09A 4FKPA 4YPDA 3WOWA 3QKKA 1W0XC 4FF8A 3O7LD 4LRKA 4TKSA 4WIHA 3RZFA 4FKSA 2GQSA 4TWOA 2BKZA 3V3VA 4HCTA 5LVLA 2PVYA 3LFQA 5AR7A 3SLSA 3WILA 5BYZA 5HU9A 2REIA 5HLPA 3TJDA 2VAGA 3ORLA 3NYOA 4FSNA 2P3GX 4AGUA 5EQPA 3S1HA 3B2WA 4FX3A 3A2CA 4FIGA 4BGGA 2F7ZE 3RGFA 4AT5A 5KHXA 3F69A 2VX3A 5AJQA 3RP9A 5JMSA 3FZRA 2B9JA 4P4CA 4PPBA 4FV1A 5A4EA 4OTHA 4LFIA 3VWAA 3I60A 3LXNA 4NW6A 4RVLA 5DLSA 4C02A 4C3RA 5I0BA 4KS7A 3QCYA 3TT0A 1FVVA 4HPUE 3FMHA 2XK7A 4I6FA 3Q4TA 4UZHA 4XH6A 2J6MA 2XIZA 2R9SA 4WHZA 4FT0A 2FSMX 3FLNC 3OEZA 4IVBA 2GNIA 4IVCA 5DR2A 3C13A 4X6RA 2IWIA 4AXAA 3CS9A 1IEPA 3AT2A 1LEZA 2VX0A 4N0SA 5I9WA 5FUTA 4C57A 2OH4A 1M17A 1Y6BA 3LKMA 4KABA 4OT5A 2WZJA 3BIZA 1IAHA 4XG6A 4ZSLA 3ZXTA 4WUAA 3R6XA 4CFFA 3NAYA 3E93A 2JIUA 3U51A 5KMLA 4H3BA 4UN0C 3T8OA 4N57A 2RG5A 5F1ZA 3MVHA 3QRKA 1DAWA 4NM3A 5EHLA 4S2ZA 1APME 4CYJA 5EYCA 4F63A 2WU7A 3AG9A 5A6NA 4C62A 4ALVA 3KK8A 1XH6A 4PTGA 2ZM4A 4RG0A 3KMWA 5AV0A 4RZVA 4ERWA 3R71A 3DDPA 3NNXA 4S32A 5CSPA 1O6LA 4QQCA 2E9OA 1FMOE 3JYAA 4JQ8A 3OTVA 2RFSA 4RMZA 4DFYA 1V0OA 1NXKA 1GZNA 4G3FA 2Y9QA 2QHMA 4BC6A 5KHWA 4U3ZA 4WG5A 4QYYA 1M2RA 1SVHA 4PTEA 5IISA 4D5KA 4DT8A 4PMSA 3C0GA 1ZY4A 4LYNA 5T68A 3CQWA 3M1SA 3QAME 4HJOA 4YJSA 3RINA 2C5VA 2OZAA 4FTUA 3TG1A 3U9NA 4QP1A 3H9OA 2ZV7A 2Y4IB 4ZY4A 4EH5A 3VS1A 3QGYA 4YTHA 2B54A 4U6RA 4Y83A 4ZSAA 4ZZOA 1LEWA 3KRXA 3RALA 3ETAA 5JFXA 3SRVA 3VF8A 4I5HA 4H3PA 2QOFA 3BEAA 5AP7A 3UNZA 3A99A 3AT4A 3RTPA 4J71A 2YIRA 1MQ4A 3TM0A 1YW2A 5AV1A 3QTSA 4J99A 4JI9A 3ZHPC 2C5YA 2W5HA 5HTIA 3A4OX 3FQHA 4PMMA 1GIJA 5E8VA 5HICA 4BB4A 4FT5A 2C6KA 3FLSA 1LR4A 5E8UA 3ORXA 2CGUA 2XMYA 4FC0A 3FI2A 3W8LA 2PMLX 1JSVA 3IOPA 3KXZA 5EOLA 4BCQA 3G0FA 3EZVA 3AC2A 2XCHA 3R8UA 3ZM4A 5BMSA 5BVFA 4U9AA 4U44A 3MA6A 2JDSA 3P08A 1T45A 4I41A 4PL3A 4BIEA 3WYYA 3REPA 4EH4A 1KUTA 4TYJA 4BVUA 4RX5A 1PXPA 1JQHA 4G16A 4ASEA 4IAYA 4L8MA 5DR9A 4F6UA 3QWJA 3KVXA 3POOA 4GVJA 5J9ZA 4O2PA 4PDOA 4CQGA 3DNEA 2XKCA 3DAKA 4JIAA 5D1JA 4EQUA 3GT8A 1OL1A 2OW3A 2WMTA 4RLKA 5ETFA 2W1ZA 3COIA 1DM2A 4MXYA 2X7FA 4F7SA 1M7NA 4QNAA 2BRHA 3HUCA 4CEGA 4CZUA 2H96A 4M3QA 4W4WA 2R2PA 3PA5A 3R7EA 2B0QA 4ID7A 2XKEA 4IZYA 4UWYA 3C4FA 3EQPA 2OZAB 2I0HA 2BHHA 3AQVA 3Q9YA 4A9YA 4EEVA 2ZV8A 3RVGA 4HYSA 5HVJA 4FKRA 5HCXA 4IIRA 5DEYA 5EH0A 2ZAZA 4IWPA 3FZOA 3UNJA 4QTDA 4KIKA 4IX4A 2YM4A 2PVRA 3SRVB 2H34A 4X2FA 4U8ZA 3R9RA 3BGZA 2VRXA 4C4HA 4DG3E 1H27A 3CP9A 1M7QA 4LQMA 5KMKA 1XR1A 4UXQA 5A9UA 4W4VA 1DI9A 1WZYA 3B2TA 5C8NA 4FUXA 3QRTA 1LPUA 5C27A 4UEUA 4M67A 1WBWA 4L67A 4O91A 2ZOQA 3F5UA 3O51A 4TPTA 4AG8A 1FVTA 3QF9A 2PE0A 3R83A 4WBOA 2RKUA 2HXLA 5AMNA 3DXQA 2ETMA 1ZY5A 4RIWA 3HP2A 3UVPA 4ZIMA 4DEIA 1BI7A 3QXOA 2AC3A 1WBVA 2CJMA 3P78A 4QYGA 1SNUA 1B6CB 4Y46A 3ZH8A 2BUJA 4HVSA 4X7QA 3F6XA 3Q4UA 3VS5A 4PP7A 4YZMA 4NSTA 2VNWA 3UZRA 2JAMA 3DZOA 3FQEA 3LHJA 4WD5A 3R8LA 3DY7A 2WHBA 3AC4A 2JKOA 5K0XA 4EBWA 1WBSA 3NEWA 1BL7A 4RX7A 4FV4A 3S2PA 4A9TA 2RFEA 4GT5A 4OTDA 5AV2A 3GVUA 1M52A 3TCPA 2UZEA 5IA1A 4OAVB 3SW7A 2YWVA 4I22A 5BMMA 4IM0A 4PWNA 4RZWA 4O7VA 1X8BA 3ORNA 4OGRA 2BFXA 3O8PA 3NNVA 3FY0A 4KAOA 4WNOA 3W2PA 3S95A 4HOKA 3RI1A 5IDPA 4JQ7A 1GOLA 2Z8CA 5IUIA 4MEDA 1W8CA 4JLCA 3ENHA 4A9UA 2I0YA 3FMLA 4ANSA 3ALNA 4AW5A 4B8MA 2IG7A 3PVGA 2WTIA 1OIRA 3QHWA 5F94A 1J7LA 2YAAA 4AS0A 3SGCA 4OBOA 4F9WA 4JG6A 5AUTA 1PMVA 3VRYA 3F2AA 1JBPE 3IONA 1XBBA 4EZ3A 3KFAA 1F5QA 4TYEA 3R02A 2OXYA 2QQ7A 3SW4A 3C4WA 5DN3A 5AV3A 4MAOA 2QURA 3V8SA 2ZV2A 2WQOA 3MH2A 2BTRA 4RIWB 5JRQA 3SAYA 5CU2A 5L6OA 5KBQA 4YZDA 4BCMA 4D2VA 1JVPP 5ETCA 3PXFA 4ZXTA 1ZMVA 4ZTRA 3WARA 1H0VA 3P7AA 2UVYA 3IGOA 1Q8WA 3I5NA 3Q9ZA 4GK2A 3MPAA 1OL7A 2GHLA 3HDNA 5E91A 3PJ2A 4MD7E 4BDJA 3IW7A 4QP4A 1J1CA 2VTIA 4DLIA 3PJCA 5HNIX 3MY1A 3O96A 3LCTA 4FTOA 2GQRA 5DI1A 3NX8A 5EM6A 2ETRA 3ZC6A 5EM7A 2WPAA 5HBHA 5M56A 3Q9WA 2PZ5A 4PMTA 2A4LA 3UYTA 4I3ZA 2V7AA 3LE6A 3LOKA 5EK7A 2QHNA 4U80A 3QCSA 3DK7A 4RX9A 2CCIA 3R7IA 2WMVA 2X9FA 3NYVA 4HZSA 4RBLA 2YCFA 3TNPC 2PMIA 1H1QA 1ZYJA 3NCGA 3VBYA 3ZO1A 5AAEA 5CEQA 4NEUA 3TNQB 2XA4A 4ZTHA 5CY3A 2YM6A 3PE2A 4OBQA 1G5SA 1Q8TA 2QC6A 3SKCA 5CF8A 5M51A 3UZTA 2WEVA 4M15A 3TUDA 4HYHA 3U9CA 1LP4A 3PIYA 3C50A 4XLVA 4YJUA 3D15A 5GZAA 3LIJA 3MPTA 4ZTMA 5LJJA 3OS3A 2BIYA 2XK3A 2WTVA 3Q6UA 4JBOA 2BRGA 4ZSEA 4YJRA 1S9JA 3KY2A 4LV8A 4CT2A 3PA4A 3KKVA 2H8HA 5HE2A 3CCNA 3OWPA 3DBFA 4PP9A 5KCVA 3UIXA 3R22A 2F57A 3I7CA 3NUNA 4FSYA 5CX9A 4O21A 5HLNA 3HV4A 5IQDA 4TYIA 4ALWA 4BBEA 4PDPA 3D2IA 2R3KA 4M69A 2VU3A 4FSQA 2W9ZB 3G6GA 4BTJA 3ZUVA 4DC2A 3CXWA 2HZ0A 2BRBA 2AUHA 3DBEA 4DCEA 4GUEA 3VS2A 2IZTA 3NIEA 2XKFA 2YISA 3BHYA 3TV6A 4DGNA 1TQMA 1YWNA 2W1DA 3HNGA 2QOCA 3PXZA 4O1OA 1WVYA 4RA5A 3AD6A 3RMFA 5BQ0A 1OIQA 4RFZA 4U5JA 5IQBA 4GS6A 4I5MA 4NM0A 3S0OA 4RJ4A 4OTGA 4YJQA 4LMNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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