2DWBA

Aurora-a kinase complexed with amppnp
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
264
structure length
262
Chain Sequence
RQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWSVHAPSSRTLCGTLDYLPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Aurora-A kinase complexed with AMPPNP
rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase 6
total genus 83
structure length 262
sequence length 264
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2006-08-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2dwbA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2dwbA01
5A4EA 5EI2A 4UX9A 4CKJA 4OTRA 4HGSA 3R7IA 2BDFA 1KV1A 2J0JA 3FXZA 5EQPA 4M15A 4EBWA 3U6IA 2HCKA 2ITWA 4XP0A 4AT3A 5D9HA 4DN5A 1XBBA 2IO6A 1T45A 2XBAA 3LFBA 4PP9A 4PDOA 1YXXA 2PVYA 4F9BA 2V0DA 4AOIA 3C4WA 5IISA 3KRRA 4HVSA 3VIDA 3RWQA 2Q83A 3P9JA 4I23A 4I0SA 1FVVA 2VTHA 4L3LA 4ACDA 3LHJA 3OWJA 3KK9A 4L67A 4FV9A 4X21A 3TL8A 1KOBA 2QOKA 3THBA 1UWJA 4HJOA 1SVGA 2W1FA 3O23A 3MA6A 4I20A 4L3JA 4P90A 3TACA 4O0WA 4ZXTA 4GK4A 3R30A 1XH4A 1GZNA 3VS6A 5HCZA 4QO9A 3ZUTA 3KRXA 5FEEA 5FEQA 3PJ1A 3FKOA 4NM3A 3ROCA 5EQEA 2CJMA 3OT8A 3S4QA 3ZOSA 2WQOA 5BVDA 4XNEA 4D58A 4NYEA 3DGKA 4RFZA 3TNWA 4FIJA 4XX9A 3Q53A 4JRNA 3ETAA 3PG1A 2FSOX 5JGDA 3QCSA 3OOGA 4QTEA 4RWJA 4A07A 1VJYA 1JVPP 3IQ7A 4BDBA 2O65A 4DH5A 4XOZA 4Y85A 4U44A 3BHUA 5JMSA 3I6UA 3VS7A 4EOIA 3VF9A 5M53A 5JH6A 4F0GA 3EL7A 5LMBA 3GCUA 3MJ1A 4NKAA 3UQFA 4O0RA 2VTPA 2ZDUA 4PTEA 5F4NA 5H2UA 3ORTA 3QRJA 1LEWA 2R3LA 3V3VA 2YIRA 4FV4A 3O7LB 1PXKA 3L1SA 5DLSA 2WZJA 1FINA 3MA3A 4NCTA 5ETFA 5FRIA 3MVLA 4GH2A 4KBKA 2PVFA 4KUJA 3WBLA 3R8UA 4WG4A 4EK4A 4XV2A 2ACXA 4FKVA 4EC9A 1SVHA 4O0XA 5CALA 2CMWA 4PWNA 4RWKA 5AP4A 3LOKA 5AR4A 2XKFA 4E5AX 3DAJA 4PRJA 4QPSA 3AGMA 2PZIA 2WOTA 4DINA 4HGEA 4FVPA 3UG2A 3QRUA 5CF5A 4FTRA 3OHTA 3FMLA 2YDJA 3GFWA 3C5IA 3JXWA 4RIXA 5CSXA 3W55A 1YRPA 2PL0A 3HP2A 3NR9A 4RT7A 3P0MA 5L6OA 3Q52A 1BLXA 4N4SA 5ANKA 3NS9A 4L52A 3I7BA 4J98A 4LMNA 4GT5A 3VRZA 4JDHA 4AZTA 4D2VA 1YXTA 4G6LA 2XCKA 1Y6BA 5FQDC 3TWJA 4O83A 3OTUA 1P5EA 4QMYA 5A54A 1MQ4A 2GTMA 5JFWA 4CRSA 3NNWA 3IW7A 3RM6A 1BYGA 5E8WA 4OTWA 3W18A 1OVEA 4F0IA 3C0HA 5EM6A 3OFMA 2ZAZA 3EZVA 4LMUA 2X9FA 3LMHA 4IFCA 2J5EA 3OW3A 3P79A 4NKSA 3TTJA 5EDQA 2PUIA 1OECA 4R5YA 4G9RA 4EJNA 4OR5A 2CNUA 5T68A 3GBZA 4CLJA 4XLIA 2GMXA 2CNVA 3ID6C 3EZRA 4CFUA 3O71A 2R3GA 4ZZMA 1WBSA 1XBAA 4FSNA 4QMOA 2YWVA 3IDPA 2PY3A 3WZEA 2YM6A 3MB7A 3BQRA 3RALA 4C4EA 3D83A 4EKKA 4FEXA 5AV0A 3MBLA 3H0YA 3TV4A 3SAYA 4MCVA 2E9VA 3FI8A 3HAMA 4O7WA 4ZJIA 4L3PA 4XV1A 1AQ1A 2Q0NA 3NGAA 4I41A 4Y5QA 4UZDA 4YLLA 2XNPA 3R8VA 1OIYA 1PYXA 3U9CA 1SVEA 3DZOA 4J95A 1FVTA 4AGUA 4FEUA 2V7AA 2QU6A 2PULA 5ACKA 4ANMA 4O7ZA 3MH2A 3SG8A 3D2KA 2V22A 4HZSA 4ZK5A 4CFNA 4DHFA 2QO2A 3EJ1A 3AT2A 5KKRB 3ZSGA 5DT3A 3A61A 1W83A 4MEDA 1JLUE 1M2RA 2ZV9A 3ZXTA 5DMZA 4BGHA 4FIIA 5IH5A 3ZLXA 3FJQE 4XEYA 2VN9A 5ETAA 3BI6A 4FNWA 1JKLA 3P86A 3KL8A 4FTAA 5HO7A 3BGQA 4C2WA 3GU8A 2CKQA 4NM5A 3EQCA 3KKVA 5HHWA 5F95A 3UNZA 4ZMEA 3F82A 1OGUA 3ANRA 4I5CA 5FWKK 3JR1A 4AGWA 4FL3A 1XH8A 4QP6A 1WFCA 3KY2A 3RMFA 1ZYJA 2OFVA 4O27B 2ITNA 3I81A 5HIEA 1FPUA 2XKCA 1U5QA 4OAUC 4BY9E 4AT4A 1GIJA 5EFQA 2G2IA 3M2WA 2XJ1A 4N6ZA 5B2KA 2GHGA 3DB8A 3QD3A 4D5KA 3K3JA 3QTXA 4ZSEA 3W2CA 3DXPA 4RRVA 1F5QA 2R7IA 4LFIA 5DEWA 3OUNB 4CKIA 3KMMA 3GU5A 3ZRMA 2R3MA 4RZVA 5E8YA 3QA8A 3FLWA 4FYNA 1XQZA 4C02A 2GNFA 5AV3A 5FP5A 5IQGA 1U59A 3LMGA 2F7EE 2OIBA 5BQ0A 2P55A 3G90X 5IZFA 5AJQA 2GNIA 1MRYA 4UMQA 2R3JA 2YFXA 3Q3BA 4Q9SA 3C51A 5J7BA 3W33A 3NW5A 1M2QA 1PKGA 2Y6OA 4MD9E 3D5UA 2JFMA 4O22A 3NUAA 4O21A 5EM8A 3CE3A 5M4FA 3MTFA 4ZJJA 1WBOA 4E4MA 4ZZNA 3KULA 4E4LA 1TVOA 2ZB1A 1SM2A 1J1CA 3A7GA 2G1TA 3A8XA 4IDVA 4RPVA 1H00A 5IDPA 1STCE 2J0IA 3ENMA 3MVJA 4WNMA 3MFUA 4ALVA 4CTBA 3QKKA 4D4RA 3U55A 4G2FA 4YNEA 5E8VA 3SC1A 3MVMA 4CGAA 4QMMA 4I92A 3OY3A 3W2PA 3SG9A 1KE8A 4IWQA 4NU1A 3C7QA 3VUMA 4YURA 2UW8A 5FEDA 3NUPA 3LLAA 4UMPA 3Q6UA 5HD7A 3O2MA 3CC6A 1ZLTA 5I9ZA 3DT1A 4GYGA 4E1ZA 3S0OA 5HBJA 3NDMA 4JT3A 5CVGA 3VC4A 2ZV7A 4W4YA 1Q41A 2O63A 4S30A 2ETKA 3JY9A 4EZ5A 3ALOA 5DVRA 5I9YA 3COIA 4C4GA 1KE7A 2OF4A 5FM3A 5A4TA 4H3PA 4F1TA 3HRCA 2P3GX 2YJRA 4CZYB 5HIBA 4YBJA 2RF9A 4NTTA 2GTNA 5E8XA 4I22A 4L45A 1A06A 4I6QA 3F3ZA 3GI3A 4WOVA 3D4QA 4BBEA 3G0EA 3MH1A 4I0RA 3KF4A 4L6QA 3UJGA 1M17A 4RFYA 4YHFA 4ZTLA 4L43A 5BUJA 4EK8A 4D0XA 3EQGA 2HZ4A 4IX5A 4GEOA 2J0KA 5DR9A 2G15A 5CAVA 2H96A 2XRUA 4NTSA 3RPVA 4FTQA 4YSJA 3R9RA 2C5VA 3KRLA 4A4XA 2XJ0A 3FYJX 4DFYA 3CIKA 5HO8A 2FB8A 3S1HA 3ORZA 4DTKA 4RWLA 2VWYA 2YM5A 2YISA 4AOTA 3NSZA 2OGVA 4CCBA 3W10A 4CQGA 3VQUA 2WGJA 4GMYA 2BTRA 3E62A 2PMLX 3E92A 4FSQA 4JLCA 4CYJA 5HLWA 2R3KA 5C27A 4BDIA 2ITYA 2WO6A 3I5ZA 1KWPA 1ZYSA 4EL9A 3GCSA 2OI4X 4RX7A 5AUVA 2W06A 5BVOA 1V0BA 4BBMA 4D0WA 2YEXA 5CSPA 4E3CA 1W98A 3NW6A 4WUNA 3LCSA 4H05A 3QX2A 4KIKA 5FM2A 5CENA 3R7VA 5TF9A 4GKIA 3NLBA 5HX8A 5K5NA 4RIYA 4I6HA 4D1SA 4E20A 4FZ7A 2OZAA 1JKKA 3WIKA 2QD9A 4R8QA 1JSTA 4GFOA 3C50A 1Q8WA 2JITA 2OJFE 5G6VA 1M7QA 2ESMA 4G31A 5DEYA 5IQIA 5HVKA 3DXNA 4AN3A 1TQMA 3H9RA 2VX0A 1G8SA 4ITIA 1U5RA 4XH6A 4XRLA 4EZ7A 2CN8A 5CEMA 3UVRA 3EMGA 1B6CB 1YHSA 3PFQA 2WD1A 3T8OA 5C4LA 3PJCA 1W0XC 1YOJA 3QGWA 1YHVA 4LL5A 4F7LA 1U54B 5HVYA 3UTOA 5LOHA 4ZS0A 4DA5A 4DEDA 4D2RA 3SXSA 3QZIA 5H9BA 4KSPA 2Y4PA 4NIFA 4OT6A 4A9RA 1Q3DA 2CGXA 2VWIA 3OBJA 3MN3A 4DFUA 4ZY4A 2B7AA 4JQ8A 3D15A 1E1XA 4RMZA 4DFBA 3PE1A 1OKYA 4ZLZA 2BZKB 5K5XA 2HWOA 2ITOA 3A7IA 3TDWA 1SZMA 5IMEA 4XOYA 3MB6A 4J52A 2C3JA 4QTAA 2B1PA 1R0EA 2PUUA 5BYZA 2LAVA 2VTIA 3HZTA 4IWDA 3IPHA 3PYYA 5EYCA 3WZJA 4FNXA 4PL4A 3EYGA 4X6RA 3EFWA 4V05A 5K0KA 3TNHA 4BDGA 3QTQA 1VYZA 2G2FA 1ZYCA 2W1GA 2PE2A 3F66A 3P78A 2J2IB 3VW8A 4MNEB 3SHEA 2ZM3A 2QQ7A 3GP0A 5EOBA 5JSMA 4C8BA 1Q99A 3NWWA 2QLQA 3FKLA 3V5LA 2YACA 2CDZA 4IH8A 3SRVB 3MVHA 3W2QA 2IN6A 5B7VA 4PPBA 2PMNX 4JG8A 4Y46A 3GC8A 4K18A 5AFVA 4TW9A 5BUEA 1O6KA 3PRIA 2VTLA 1ZARA 2ITXA 3JUHA 4EUTA 4O7SA 2YAAA 4MXXA 5KNJA 1J91A 2FVDA 4OW8A 2VTNA 3FSFA 2IZSA 5HZNA 4C58A 1MRUA 4PDYA 5E1EA 1IRKA 4D9UA 4E73A 3R7EA 3MWUA 5E1SA 2GNHA 1IEPA 4HNFA 4JDIA 3U51A 2B53A 1ZOEA 3MSSA 2XK9A 5CEIA 3IDCA 2W17A 4WIHA 3CY3A 4K8AA 5AUUA 5A46A 3UYSA 4IZAA 3I79A 4H36A 4XUFA 4JAJA 4EORA 3IW8A 3Q5ZA 1K9AA 3L8VA 4BI1A 2ITVA 3AC4A 4L7SA 4QPMA 4YJNA 2Q0BA 1E9HA 4MYGA 5FTGA 3ORKA 5ANJA 4RFMA 1SYKA 3GEQA 4EK3A 2HZIA 2BALA 4KNBA 1S9IA 3POZA 3TKIA 2BRMA 2W5BA 1FMOE 4AZEA 3RPOA 3UIBA 5IQFA 3C5UA 4IAAA 4M66A 4A9YA 1VZOA 1XKKA 3E64A 4B99A 4O7NA 4QYFA 5EI8A 5JRQA 3Q9XA 5EOLA 4C4HA 4D28A 4YPSA 4PNKA 5EW9A 1B39A 4DLJA 3AG9A 4F7NA 4F9AA 3PWDA 2OWBA 4FKLA 3TNPC 3W2OA 1YDSE 5AADA 4F9YA 5KBRA 5L4QA 4M7IA 2X2MA 5DI1A 4DBXA 2NNWB 2A4LA 3LIJA 5EYDA 2B9IA 4C59A 5KCVA 5A4QA 3OMVA 3A7FA 5EDRA 1O9UA 4X2JA 5I5ZA 5J9YA 2X81A 3PJ3A 4V0GA 4F6WA 4BDAA 5D11A 4PL5A 3PP1A 3GXLA 3HDMA 4JI9A 4AGDA 4FIHA 3TUCA 3AOXA 3R2BA 4B4LA 2OG8A 3L9NA 5M55A 1F3MC 4TY1A 1M7NA 5IA3A 4WG3A 3F7WA 3R1SA 2BCJA 4X2FA 4F63A 4KABA 1ZOHA 4RSSA 5GINE 5GIPE 4EH2A 5GJFA 4EWHA 3UP2A 5AP1A 2PHKA 2VV9A 1O6LA 4RQKA 2QLUA 3RP9A 2BIKB 3UC4A 1YVJA 4EUUA 1PW2A 1XH6A 4YJVA 4TWNA 3LFFA 3R2YA 3Q6WA 5IQHA 5GNKA 4TKSA 2UZBA 3AGLA 4HPTE 4JOAA 4RWIA 3AC5A 4BHZA 3C4FA 4FKOA 3UQCA 3TKHA 1OUYA 4D2TA 5LMKC 2OU7A 2YM8A 1SNUA 2YABA 3VS5A 1BL6A 2CHLA 3BYVA 3PA5A 3C0IA 3FHIA 3M42A 4QTCA 1XWSA 2YA9A 4IJPA 4DBNA 4DGGA 4DCAA 4E5BA 2QR8A 5AUWA 3UO5A 5IUHA 4LRMA 4EZ3A 4JG7A 3PLSA 4D55A 2XJ2A 4ZY5A 4JBVA 4X3FC 5HCYA 1FGKA 1GIHA 1NVSA 3QQHA 3CKXA 3CTHA 5LWMA 5JZJA 3HVCA 5EDPA 4IWOA 2CGVA 2VTOA 2VX3A 4RG0A 4BIBA 3BIZA 2B4SB 3CJGA 2YLEA 3PY0A 3HMPA 4ANBA 2WB8A 4NM7A 5IH6A 5D10A 3KN5A 3RK5A 1ZAOA 5HNBA 5GZ8A 3OXTA 2CCHA 2WNTA 5DGZA 4BRXA 2F7XE 3LCKA 3Q9YA 5LARA 4ZMFA 2R3HA 5FGKA 4R77A 2W1CA 4U80A 4ZSJA 3R9OA 4TT7A 5M51A 2OICA 4L8MA 4F09A 3NYXA 3PZEA 3LXLA 4HVIA 4M14A 5CYIA 4BYJA 2IW9A 1Q5KA 3WE8A 3P5KA 4G3FA 2PTKA 4QMVA 5BX0A 5LWNA 5AWMA 3LMIA 2XNEA 1W7HA 2W1IA 5JT2A 3LJ1A 1UU7A 2OIDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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