2EUFB

X-ray structure of human cdk6-vcyclin in complex with the inhibitor pd0332991
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
296
structure length
282
Chain Sequence
DQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNGGRFVALKRVRVQTGEEGMPLSTIREVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETKLTLVFEHVDQDLTTYLDKVPEPGVPTETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLARIYSFQMALTSVVVTLWYRAPEVLLQSSYATPVDLWSVGCIFAEMFRRKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLPGEEDWPAQPIEKFVTDIDELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALSHPYFQDLER
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Toward understanding the structural basis of cyclin-dependent kinase 6 specific inhibition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords viral Cyclin
molecule tags Cell cycle/transferase
source organism Herpesvirus saimiri (strain 11)
total genus 69
structure length 282
sequence length 296
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2005-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2eufB02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2eufB01
3LVPA 3QHWA 3HAMA 3EWHA 3KCFA 1H07A 3FHRA 4QMQA 1YHVA 3OWLA 1SNXA 2PMOX 3GOPA 4KS7A 4XV1A 4BDFA 3KB7A 1PYXA 3GP0A 4LGHA 2WMSA 4G3FA 4X2NA 2G2FA 2OJ9A 3LCOA 4FV6A 4EK4A 4FEWA 4YC8A 3QRIA 3L8VA 4QYFA 2R3FA 3FXZA 3C0IA 2XIXA 4OTIA 1TQMA 4ALUA 4Y5QA 1UKIA 2VO3A 2FVDA 3BV3A 3TIZA 4X2GA 4GJ3A 2W5BA 4E5AX 2HCKA 3P23A 3MSSA 5KUPA 4QD6A 3B2TA 3K3IA 2UZUE 3Q9WA 2R3QA 3R8PA 4F9BA 4C58A 4YJPA 3TNQB 3N4TA 4FUYA 4WBBB 1PMUA 3GC7A 1K3AA 2ZAZA 2WPAA 4IX6A 2CPKE 3ZBXA 3O8PA 3ZMMA 4F0IA 2P0CA 3Q4TA 4TXCA 2RL5A 3N51A 4E6QA 2VTTA 4ZZNA 3O0GA 2P2IA 4DA5A 4ZTMA 4PNKA 4MTAA 3HV5A 3B8QA 2VWWA 4DBXA 4FK6A 3F3UA 2VTHA 2PVKA 1URWA 4WKQA 4EOKA 5I3RA 4EOLA 5CEQA 5DFPA 4H1JA 2A4LA 5C8NA 3ZFXA 4EZ3A 1MQ4A 3TDVA 4F9CA 2R7BA 4ITIA 3PPZA 5AV2A 4J96A 4JNWA 3RPRA 4UMPA 2ZM3A 4C4JA 3E87A 1I44A 3KC3A 5JFWA 4JDIA 2J0JA 5E92A 3UMWA 3LXLA 5EOBA 4GIHA 3BEAA 4HNIA 2XNOA 4O82A 4L68A 3LCTA 5EW3A 2BKZA 3HGKA 4HOKA 5D7AA 2XJ0A 1ZAOA 3ZS5A 4RX8A 4Y72A 5DT4A 5LWMA 4J97A 3QF9A 2WZJA 2X2MA 2XP2A 4S33A 4H1MA 4UEUA 3PP0A 3OFMA 4HCUA 3T9TA 4ANBA 4DEHA 5LCJA 4X3FA 2BKKA 1R78A 1H8FA 2GFSA 3DAKA 3ZRLA 3FC2A 5HU3A 5KO1A 1ZYJA 4WO5A 4RZVA 4CKIA 3GOKA 1JSUA 4QMWA 3DZQA 5AV4A 5M55A 5D12A 2QOQA 1F5QA 3KF7A 4R8QA 5HE1A 3ZFMA 2I0HA 4Q5EA 5AR3A 4KRDA 3UGCA 2JKQA 4NCTA 3I1AA 1Z5MA 4KKGA 2JAMA 3FMKA 3V5QA 1XBAA 4A9TA 4HVSA 2HELA 4D58A 3L9LA 4FKRA 2ZM4A 4UWBA 2V0DA 1YDSE 3VW6A 4GK3A 2A27A 5FWKK 1ZOGA 1PXPA 5GJGA 3RKBA 4QYHA 3LJ2A 1PMVA 2Y6OA 2BTSA 3FY0A 4S2ZA 4X2FA 4C57A 3MPMA 5DR9A 4DGNA 5HO8A 4KRCA 4BDCA 5ANEA 4I20A 4NW6A 2LAVA 4IM0A 2RFNA 3ZC6A 3VO3A 4EJ7A 3IG7A 4U0IA 3PZEA 2XYUA 4QQCA 3NNUA 3DFAA 2YLEA 3U9CA 1SVGA 3FYKX 3RPYA 3U6HA 3QCQA 4ALVA 4O7ZA 5E90A 4PY1A 2F7XE 2ONLC 5BVEA 2CCIA 5T6KA 3C4CA 3ZHPC 4O7NA 3R9RA 5CT0A 4BFMA 4IFCA 1UNGA 4ZTHA 4I0SA 3B8RA 3DY7A 3HRBA 3VBYA 4DEEA 1J1CA 3PVGA 3QTIA 3DCVA 3ROCA 3QD2B 2XJ2A 5EI2A 3CSVA 3QWJA 4OBPA 2QR7A 5F20A 2OKRA 3IW7A 2R3HA 3FYJX 4G3DA 2J9MA 1URCA 5IZFA 5EM6A 4CV9A 2C5OA 4IM3A 4ACCA 4EC8A 3VNTA 4UMQA 2ETMA 3F2NA 3MB7A 4ZMFA 3B2WA 5L2TA 4XG8A 4PV0A 3A4OX 1QPDA 1PKGA 3CTJA 2VN9A 2XK8A 5JH6A 3FKNA 4MBJA 3O50A 3R2YA 1OL1A 3BEGA 3C4FA 3DQWA 3VS3A 4M69B 2CKOA 4BCFA 3F5GA 4HCVA 2W1IA 4KAOA 4CRLA 3ORNA 4D2VA 5FM2A 4F6SA 3Q4ZA 5A4LA 5I0BA 3D9VA 3QCXA 1P14A 4ZK5A 1FMOE 4CFXA 1RQQA 1PJKA 3NUPA 3W1FA 5BUIA 4O0SA 4JX7A 3ZRMA 2C1AA 4KABA 3KVWA 4O0UA 4QTDA 2GNGA 2R64A 2NO3A 4M13A 3SOCA 2Y7JA 5H9BA 3A7HA 4C4IA 3VJOA 4IANA 4TTHB 4ORKA 3GU5A 3VAPA 3OCTA 5IKWA 5AWMA 4F9WA 3HEGA 3OD6X 3CPBA 3GEQA 4IVCA 4JR3A 2V5QA 2HY81 3ZYAA 4QO9A 5I4NA 5M09A 2QO2A 4OT5A 1XJDA 4C02A 4DHFA 2VWUA 4RQVA 3FMDA 4M68A 4B8LA 4AZVA 5C4LA 3NGAA 4G3EA 5E8WA 3PFQA 1GZ8A 4M69A 5BQ0A 3FZOA 3QCSA 2X39A 3NLBA 2BZIB 5L4QA 4G5PA 3DZOA 1JOWB 4YZNA 3G0FA 3R7GA 1JLUE 1TQPA 3WZUA 5IEYA 1UWHA 4IWPA 4BDJA 4BICA 3RM6A 3G9NA 1MP8A 1JWHA 1QCFA 2ITPA 3DKCA 3WF7A 4E6AA 1KOAA 2WELA 4R1YA 3EQDA 5CU2A 3QD0A 4FZDB 5CU6A 5AJQA 5CSHA 2UZVA 3WARA 2IN6A 3L9NA 1YHWA 5LVOA 3PXRA 3VBTA 2QOOA 2QOCA 1I09A 3LCKA 5JN2A 3HZTA 3F5XA 2C6LA 3MPAA 4G3GA 5CU4A 5FP5A 3IQ7A 1DAWA 4CMUA 3IW6A 3MTFA 4O7WA 5CYIA 2Y0AA 1ZMWA 3NVKI 1P2AA 3LCDA 3N4UA 3W32A 3LFBA 4FG7A 5AP4A 3DLZA 3LJ1A 4X3JA 3QXPA 4FTQA 3CIKA 3V8WA 3QKLA 5CSVA 4YPSA 4DBNA 3II5A 2ZVAA 3UP7A 2PVMA 4D55A 2FA2A 5FQDC 4QRCA 4GRBA 4QT1A 1RE8A 3VRYA 2R3MA 2C69A 3KMWA 4W4XA 5EW9A 4JG8A 3VW8A 3DKOA 4LOQA 4K2RA 3U54A 3TT0A 4BI0A 4OBOA 1Y6BA 3FMLA 4XUFA 1GIHA 5HG8A 3GBZA 4NIFB 5C9CA 4NW5A 1U59A 2F57A 4F4PA 2R3RA 3A4PA 4RFZA 1XH9A 2WQOA 4O7RA 3WYXA 2IVUA 4CYJA 2QOKA 4RIYA 5HGIA 1XH6A 4M84A 4YURA 3MY5A 5CF4A 3FI8A 3FKOA 4UWYA 4WT6A 4EONA 3QQHA 2OBJA 2C3IB 4USDA 5HICA 1WBWA 1XWSA 4BVUA 4DGLC 2Z7RA 3F61A 4FTJA 4FV4A 5E8UA 3SW4A 4EHGA 2PUPA 2HIWA 3ORTA 3T3VA 2OXXA 2UZTA 2GTNA 2WB8A 3UOJA 5C4KA 4P5ZA 4U45A 4BTFA 1PMNA 3PIZA 4LMNA 3CGOA 4FKSA 3DBEA 4IW0A 4CKRA 5KE0A 1LPUA 2YACA 3FMMA 1H1QA 4M67A 1QMZA 3F2RA 4IJ9A 2WTDA 4MXAA 5TE0A 3LFQA 3R8MA 4QOXA 1PXLA 3KRXA 3LM0A 3EFJA 5AP7A 1Q4LA 3TJDA 3Q6WA 4I1ZA 1GOLA 4E7WA 3LMIA 4N57A 2BHEA 3OBJA 4NSTA 3NSZA 3NYOA 4ZY6A 3UG1A 3MVMA 3RHKA 3SOAA 3W2SA 1BKXA 3MTLA 1OM1A 2B7AA 4C34A 4AXAA 4R3CA 4IB5A 3O8TA 3UQGA 2Y4IC 4WNKA 5CAUA 3NUSA 2JKOA 3BHVA 3IDPA 3LW0A 4FIJA 4CNHA 2IZSA 4BCHA 3EQBA 4LV5A 3C5UA 5D41A 4BZNA 4IWDA 4EYMA 5A14A 4W4YA 2I1MA 1KOBA 4U5JA 4QPAA 5AR8A 2JC6A 2UVYA 4TL0A 3MWUA 1LEZA 3ULIA 2GDOA 5L8LA 4E93A 3PTGA 1R3CA 4GJ2A 4IZAA 4X21A 3QKMA 4HW7A 1FPUA 2IZTA 4FKPA 4FTMA 4J71A 4BI2A 1BLXA 3O8UA 3LIJA 1E1VA 3FZPA 4R7HA 3VUTA 3FEGA 4PDOA 3TJCA 1OIRA 3DBQA 4BBEA 2IPXA 4FKGA 4H36A 5M07A 2VTSA 3KF4A 3WF6A 4AZTA 2BPMA 2BIKB 4JBPA 3BU5A 1SVEA 4TNBA 5AV0A 1K9AA 3ZZWA 5KMMA 5FDPA 3AC8A 3SVVA 4RX7A 4RIXB 5K5NA 3KULB 4NYEA 4ZMEA 5I5ZA 4LUEA 4A9UA 3QQKA 3O96A 3FI2A 4M7IA 1YXSA 3QKKA 1YHSA 2YN8A 5E8SA 4LL0A 1CTPE 5FRIA 4UZHA 3F5PA 5JK3A 4ZIMA 4J7BA 4BB4A 4NFNA 4OTRA 5KZIA 5K5XA 4D28A 1KE7A 5DVRA 1PMEA 4NM0A 2G9XA 3TKUA 3LQ5A 1PRYA 4X0MA 2W0JA 1O6YA 1OB3A 3W2QA 4LOOA 3D4QA 4KBKA 3VVHA 3BQRA 1WBVA 5AR2A 4BDAA 4YTHA 2ONLA 1M2RA 5AV1A 4YJNA 5GHVA 5L8KA 3KY2A 4WRGA 1BUHA 2J5EA 4FTOA 1YXXA 3PVUA 3ZSIA 5DPVA 3GU8A 4GVJA 2VX0A 2OJGA 3OTVA 4FL3A 1AQ1A 2QOHA 4DF3A 3E63A 1E1XA 1O9UA 5L3AA 2PVNA 4EH6A 3DNDA 4AGUA 3NS9A 2UW9A 1YXVA 4GFMA 5BVDA 4R5SA 2OIDA 3BX5A 4EOPA 3PXYA 2OG8A 4MK0A 4RWLA 2J2IB 4S34A 3AG9A 2NRUA 2CHLA 2W7XA 4LG4A 3I81A 2X2KA 4PL3A 3QRUA 4U8ZA 4GFOA 4GIIA 1H01A 2XF0A 2WMUA 4C37A 3SQQA 3R21A 4FTCA 4BCNA 3EQRA 2DYLA 4LGDA 3PLSA 4FGBA 3WILA 4GS6A 5T68A 4EHEA 4BC6A 5LARA 5IU2A 2PPQA 5JGDA 3VS1A 2ERKA 2CNUA 2R3IA 4JAIA 5LMBA 1H24A 3MFRA 4PMPA 2QU5A 3DA6A 3NUNA 3MBLA 4ID7A 3I6WA 4RJ8A 5EHOA 3ROYA 3EYHA 1WBPA 5CVGA 3TV7A 4PL4A 3V5LA 5IG1A 3AD5A 1TQIA 1YI6A 2GNHA 3R22A 4XYFA 3MA6A 5KBRA 4FIFA 3LOKA 4L7FA 5EG3A 3QZHA 3AMBA 2H34A 3QQLA 3M1SA 3R9NA 3DTCA 3EB0A 3S2PA 3PIXA 4KIKA 4EORA 4NM5A 1OPKA 5LVNA 1PW2A 3F66A 4C35A 5IQAA 5DI1A 4MBLA 4IIRA 4ZP5A 4EOMA 4JQ7A 3DS6A 2UW4A 1J91A 3FSFA 3LHJA 3OWPA 4FSQA 4PL5A 5L6WL 3UZRA 1U4DA 1OZ1A 2B9FA 4YUQA 5KHWA 3VS7A 3BHHA 2ITVA 5HNBA 1ZZ2A 4MAOA 3FPMA 5CXHA 3ALOA 2VGPA 4RA4A 1G8SA 3LFFA 5I3OA 4GUEA 4CZTA 2C6MA 2J51A 3KKVA 3ZLSA 3WZJA 1KV1A 2IW6A 4ZLZA 1ZMVA 4WG3A 2ITZA 3E3BX 4FA2A 4YHTA 1OI9A 4MD7E 3NRMA 3DDPA 3NW5A 3R7OA 2XYNA 3Q3BA 2Y8OA 3NCGA 4DFLA 3ZXZA 2C5YA 1REKA 3TIYA 4LYNA 4DN5A 5I9WA 5BVOA 4XHKB 4W9WA 2QO7A 4O21A 3R9HA 4NCTC 3OVVA 3NNXA 4IH8A 2JDSA 3R1NA 1JQHA 3UG2A 3ZU7A 5KKRB 3R63A 3C4XA 1WBSA 3PJ2A 4JJRA 2YCQA 4ZJVA 5LVPA 4RJ3A 2WU6A 3BI6A 3P9JA 4O0XA 3DAJA 4ONAA 4QYGA 4C3RA 4CTBA 4CZUA 3SG9A 1ZXEA 3PIYA 4R7IA 5IH6A 4FNYA 2CGWA 4GT3A 1JVPP 1EH4A 2B4SB 3G6HA 2ZJWA 3GUBA 1Q62A 4QP4A 5CNNA 4NU1A 4XV9A 2WXVA 3MIYA 4BYJA 3UNZA 3CCNA 1VYZA 3QX4A 2PE1A 3AT2A 4IC7A 4YJTA 4D2TA 1VEBA 4KSQA 5CEPA 2YERA 4FOBA 4RJ5A 2PVJA 4XNEA 1X8BA 3PWYA 1NY3A 3FMHA 2UW3A 3CP9A 4FKJA 4I24A 5AR4A 4I5MA 1OPLA 4GKIA 2Q0BA 5CENA 3POZA 5DEWA 4FVPA 4PDPA 3DXNA 1W82A 4FTIA 3R7IA 3UYSA 5LJJA 4U3ZA 2Z7SA 5D9HA 2B52A 4LOPA 3KU2A 5KMNA 4BBFA 4N4SA 3F7ZA 3P86A 2WOTA 3D5XA 4USFA 2PVHA 4AW1A 3LFSA 2ZDTA 3PRIA 1W98A 3MGYA 3R7VA 3AC5A 3E92A 3KK9A 4G3CA 3TV4A 4KIOA 5EKOA 3AC4A 3EZVA 4LRMA 2W1ZA 4O0YA 4PMSA 4XX9A 4BDIA 5AUUA 3KRLA 1RDQE 3COMA 3MY1A 4O6LA 2XS0A 3V3VA 1JBPE 5EM8A 5JRSA 2QURA 3EN7A 1O6KA 2YISA 3THBA 2J7TA 1YRPA 5LMAA 3DT1A 1WVYA 2EUFB 3D15A 4FKVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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