2F49 | Genus

Total Genus 102

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	102
sequence length	351
structure length	335
Chain Sequence	KRIVYNISSDFQLKSLLGEGAYGVVCSATHKPTGEIVAIKKIEPFDKPLFALRTLREIKILKHFKHENIITIFNIQRPDSFENFNEVYIIQELMQTDLHRVISTQMLSDDHIQYFIYQTLRAVKVLHGSNVIHRDLKPSNLLINSNCDLKVCDFGLARIIDVEFVATRWYRAPEVMLTSAKYSRAMDVWSCGCILAELFLRRPIFPGRDYRHQLLLIFGIIGTPHSDNDLRCIESPRAREYIKSLPMYPAAPLEKMFPRVNPKGIDLLQRMLVFDPAKRITAKEALEHPYLQTYHDPNDEPEGEPIPPSFFEFDHYKEALTTKDLKKLIWNEIFS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__57293814374128__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__57293814374128__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/2F49/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__57293814374128__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"57293814374128","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/2F49/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__57293814374128__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
source organism	Saccharomyces cerevisiae
publication title	The Ste5 scaffold allosterically modulates signaling output of the yeast mating pathway pubmed doi rcsb
molecule keywords	Mitogen-activated protein kinase FUS3
total genus	102
structure length	335
sequence length	351
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date	2005-11-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00069	Pkinase	Protein kinase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	2f49A02
3.30.200.20	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Phosphorylase Kinase; domain 1	Phosphorylase Kinase; domain 1	2f49A01

5CZHA 5AP4A 3UE4A 4AP7A 2OFVA 1JQHA 5IDPA 4B7TA 2JDVA 1BI8A 2ONLA 3BV3A 4U41A 3UDBA 5CU2A 5TE0A 4TRLA 3FKOA 4RBLA 2GS2A 4NM0A 5L2WA 3OHTA 3T9IA 4FNWA 1Q8YA 1QPJA 1R3CA 3NWWA 2W1DA 4FV1A 3TZ8A 1OITA 2R2PA 2UVZA 1SVHA 3UG1A 4G2FA 5ETFA 4CXAA 4IZAA 2O0UA 4G9CA 5K0XA 3GCQA 3GOPA 4ZLYA 4J52A 4C4EA 2W9FB 3F5UA 4O1PA 4CGAA 4F99A 4FSYA 4ACCA 3NNVA 3R1QA 2OICA 2QURA 4IVAA 1O6YA 2C47A 2BCJA 5FM3A 3K5VA 3VN9A 3W10A 5A4LA 2RFDA 3TACA 4EK5A 2HZNA 2NRUA 3KXHA 4LGGA 3RBWA 4FT3A 2R3NA 3BX5A 1F0QA 4ARKA 2W5BA 3Q4CA 2BALA 4O7VA 4DT9A 1XH5A 3CIKA 4QPAA 3R28A 4IZ7A 3HV3A 2H34A 4BHNA 5AV2A 4DH3A 4EL9A 4CV8A 3E93A 4H39A 3WE8A 4F4PA 3C1XA 3HRBA 1WBNA 4FSNA 1PKDA 2BRMA 3CPCA 2GSFA 4QMXA 1OIRA 2WTVA 4WG3A 5CU4A 5DR6A 3NR9A 2BAJA 5JSMA 3UIBA 4P5ZA 3G9NA 4RWLA 4ZTSA 4D2PA 1XKKA 3F9NA 2EB3A 3LFNA 3E5AA 4F6SA 3V5PA 2P55A 2IVSA 2QU5A 4O7RA 3UP2A 1KOAA 3NGAA 4UY9A 3OZ6A 4S32A 4OTWA 3WZDA 4AGUA 3NCGA 4C4HA 4AW5A 3NYNA 1H08A 4JBQA 4O2ZA 3VBWA 3D5UA 2EXCX 3U4UA 2X9FA 4F7JA 4O81A 4PMSA 2XKCA 4CD0A 3PE2A 4L68A 4TNDA 5AX3A 2GS6A 3BGQA 3NYOA 4YHFA 5KMNA 1Q3DA 4CCUA 4LQMA 3QZGA 2YDKA 3WZEA 4F0FA 1FVTA 3BLQA 4DH5A 4LV8A 4WNPA 2OF4A 4KA3A 4OT5A 3C51A 4WSQA 4X2GA 3DFAA 1YOLA 3QTQA 3ZSHA 3FXWA 5E90A 4RT7A 3AC2A 4QP1A 4I6QA 4W8EA 3CJGA 4BBEA 5DFPA 4NTTA 5I9YA 4AZVA 3RM7A 4D1XA 2C6MA 4MNFA 3DK3A 4FEVA 2C6LA 4BIDA 4ZY6A 3WBLA 3Q5ZA 2VAGA 5EW9A 4ANNA 5HTBA 1JKKA 4FK6A 5JQ5A 2W99B 3KA0A 3QTSA 4J53A 3R7IA 5BYLA 3GB2A 3SVVA 3MTFA 4J95A 3VUKA 5KX8A 3AXWA 2QOKA 3BYOA 3PP0A 3IDPA 1U59A 5M4FA 4MBLA 3F3UA 2Z8CA 4F1MA 2CLQA 4JLCA 4YTFA 2JBOA 3U4WA 4XRLA 3A8WA 2CGXA 3F5XA 1WVXA 3BE2A 3DZQA 3QYWA 4XYFA 3MB6A 3C9WA 1ZOHA 1H27A 2WKMA 1IA8A 2QOOA 4YBKA 5EYKA 2W1CA 2UW4A 5HICA 3S3IA 4CFXA 3QQKA 4YZMA 3D7ZA 5EHOA 1OUYA 5CYIA 5LMAA 3TKIA 5AUZA 4J97A 2IZTA 3R73A 5LJJA 1ND4A 2JEDA 2YACA 4FTNA 4QTCA 5GJFA 4UMTA 4YO4A 1IEPA 3MJ1A 3IECA 3CQEA 3ZLXA 2R0UA 3U6IA 2QO2A 2W1IA 3DKOA 3K54A 4CRSA 4FTCA 5KUPA 5K4IA 3DU8A 4ERWA 2C3KA 3P5KA 4BDJA 4O0TA 4C58A 4QQ5A 4JL9A 3Q32A 4L9IA 1OL2A 1OKYA 3LJ1A 4EZ5A 3F6XA 2IG7A 4EZ3A 3EB0A 4YZNA 4C57A 5A4TA 2BKKA 2BDFA 2HY81 3SXSA 4D9UA 3G2FA 3DB8A 3V3VA 3NUPA 4FEQA 3WZJA 3O17A 4O0UA 3QRJA 3MVJA 3R21A 4U8ZA 4BF2A 2XP2A 4C35A 4O22A 1BYGA 2JDTA 3IPHA 4NTSA 3G0FA 5IQDA 2VTHA 4HCVA 4PUZA 3NRMA 4W4WA 3LOKA 2A0CX 2X39A 2O65A 2OXDA 2OSCA 2VGPA 2YLEA 3DPKA 2QOCA 4OBPA 2ITVA 2XIYA 5J1VA 4LOQA 2J2IB 3AOXA 1PJKA 1R0EA 3TN8A 2R3RA 2VWWA 3DGKA 2Y4IC 4DT8A 2EWAA 3HUBA 5B2LA 3DV3A 3A4PA 5AV4A 4CV9A 4TN6A 5DBXA 2Y7JA 4EHZA 4L67A 4CSVA 5ICPA 3AT3A 1UNGA 4FV5A 5CSHA 5ETIA 5EOLA 5HVJA 3TKUA 5DH3A 3DCVA 2XIZA 2DQ7X 5M06A 1OB3A 3UMWA 3PLAE 2HYYA 4HVSA 3AQVA 2OZAA 3HMOA 1WBWA 4E4NA 3GI3A 1FVRA 3BYUA 4V05A 4XG4A 4XH6A 4DFXE 5A14A 1KE9A 4Q5EA 5AP6A 2LGCA 1XJDA 1NVRA 1SVEA 1PXPA 2XEYA 3ORIA 4AUAA 4C33A 4DH7A 2NNWB 3HDNA 2QG7A 2WHBA 2A27A 4A4LA 3OWLA 4FIIA 3NCZA 4PL3A 4D2RA 4FSMA 5HG8A 5L6OA 4A9TA 3MY1A 3PSDA 2PY3A 4AAAA 3TXOA 2DS1A 3NNWA 4GYIA 2C5VA 5FQDC 3SRVB 3OG7A 3NNUA 4FV8A 3SA0A 1J3HA 2ITUA 2UZBA 3FI8A 3U51A 3IOKA 3M42A 1VYWA 4Y46A 1B39A 3QYZA 5IQGA 2O63A 5DIAA 3VJNA 3ORXA 4L53A 4RIWB 1UWHA 3MH2A 4HVHA 2A19B 1F3MC 3LMHA 2XNOA 5KMOA 4ZSJA 2X8EA 4O86A 1M2QA 3PE1A 2UW0A 3LQ5A 4ANOA 3FY0A 3UP7A 2IWIA 4X3FB 4Y73A 1BI7A 4RFYA 3NLBA 2XYUA 3MH1A 5LVPA 3UJGA 3A61A 4I0RA 3L9NA 4IM0A 4RJ3A 4UZDA 4Y95A 4CFWA 2A1AB 3GP0A 4WBBB 5L3AA 5J8IA 3FMEA 5IA1A 3KXXA 2W1ZA 1M7QA 3R9OA 1ZZ2A 3PJ8A 4L52A 4CFVA 4D1ZA 3ZRKA 5KMLA 2FSOX 3F3VA 3UOLA 2H8HA 2C6IA 4BDFA 4YJNA 2NO3A 4DYMA 2PVRA 4YURA 4EOQA 3QZIA 1VEBA 3DXNA 4DEHA 5IA0A 4O7ZA 3EQGA 4D2WA 5BUJA 4QT1A 3E88A 4IX5A 3ZO2A 2WQBA 2A2AA 3CGOA 4U7ZA 2BMCA 2HOGA 4OTDA 4E6QA 4ENYA 1JAMA 1UKIA 4MHAA 2WTIA 4IX4A 1PMVA 3EFWA 1PMEA 5H9BA 3ZLWA 3W55A 4O21A 4XJ0A 5FEQA 5GZAA 4QPSA 4ZTQA 2YIXA 3QHWA 5JFWA 2VO3A 3ORNA 1OECA 3CD8A 5AP3A 3OWKA 3OEZA 5CSVA 4ZIMA 4LRKA 4O0RA 5HIBA 1NY3A 5E8YA 4HGEA 4PPBA 1KE8A 3R8MA 1NA7A 1CSNA 3OP5A 4UV0A 3R2YA 1XH8A 4HPUE 4IB5A 4QTAA 5BMSA 2VTTA 3HVCA 5JK3A 2HK5A 3E3BX 3LCTA 2R3GA 3RWPA 2YM4A 4DEDA 2R3PA 1LEZA 1OIYA 5H3QA 2Y9QA 4BI1A 4I20A 2JIVA 1RE8A 4QTBA 3THBA 3KEXA 2VNWA 4L42A 3VRYA 3ZS5A 3R1SA 3COHA 3ZUVA 3VBVA 3O8TA 1H0VA 3ALNA 4ALWA 2GTNA 4BYIA 4ZJVA 5KHXA 3A62A 4EOSA 2YZLA 1ZY5A 4O7YA 2QCSA 3W18A 4JBPA 2UW6A 4HYUA 4X7QA 3EN4A 4R8QA 1Q99A 3UODA 3I7CA 3L8VA 3T3UA 3B2WA 4ENXA 5KKRC 1M17A 2CJMA 3PY0A 4FOBA 3SOAA 3P4KA 3PY1A 5HU9A 3EL7A 4UYNA 4U80A 1J1BA 4O84A 1YDTE 3CKWA 1W98A 3S0OA 5LVOA 1H01A 3EKNA 2QKRA 5KE0A 3A7JA 5H2UA 5HE1A 5I9XA 3TNPC 3RALA 3K2LA 4IIRA 3OTVA 2OWBA 4QP6A 4O7WA 2B52A 4YLJA 3M1SA 2F4JA 2UZNA 4NL0A 1YWRA 2GNHA 3D5VA 4G31A 5M53A 3C50A 2BTSA 2GHGA 4RLKA 3NVKI 3VW6A 2DUVA 2ZM1A 5CNNA 5IQEA 1JPAA 4FT7A 4RIYB 4ITIA 4HYHA 5D12A 5FTQA 4ANBA 3EL8A 5J9ZA 4PDYA 3ID6C 4ACDA 5H8EA 3KB7A 3U6JA 4WUAA 4UMQA 3RHXA 4FGRA 2OK1A 4TZRA 3BI6A 5CVHA 5AV1A 3LKMA 2XKEA 4R7HA 5I9ZA 5HOAA 5J5TA 2WMBA 2O3PA 3KCKA 3RINA 3L8SA 5CF8A 3IW7A 1WBTA 2ETMA 2VRXA 4U79A 1Y57A 3QC4A 4NSTA 5L8LA 3PYYA 2W05A 2R7BA 4BCGA 3N4VA 4P5QA 5HGIA 4GRBA 4G16A 3BGZA 1SMHA 2YHVA 1JLUE 3FMJA 4NW5A 3FL4A 3Q9YA 4E4MA 4KIOA 4J7BA 4M0YA 2ACXA 3EQIA 3EIDA 3LFCA 3O8UA 4D4RA 4H05A 2WTJA 3Q5IA 5T3QA 4C0TA 2PZIA 2WAJA 3IW4A 4E93A 2P33A 1A48A 4DEGA 3E7OA 3CD3A 1V1KA 3PXFA 4BI0A 2G2FA 4ZSAA 2WMRA 5CAQA 5IF1A 2J6MA 3WE4A 5CEQA 2J51A 2ZDUA 4B6LA 1XO2B 1YQJA 4L43A 4OW8A 4JNWA 5IDNA 4BC6A 4F9AA 5L6PA 2WTKC 4L45A 5ETCA 3ZEPA 3R7EA 4AU8A 2ITOA 3QRIA 5HO7A 4QMSA 3R8PA 2YISA 4KWPA 3FXZA 4KKHA 5CS6A 3LFFA 4MBJA 4C4FA 1SZMA 1GZ8A 4ANQA 3E7VA 3F5GA 3ZBXA 4J8NA 4OBOA 3NW6A 3LCKA 3OT8A 3KMMA 1B38A 2X4FA 5AIRA 1ZWSA 5LVNA 4DEBA 3BHTA 1MRUA 3OCSA 4EOKA 4JDIA 2VWYA 2W17A 2GHLA 1FBNA 1OI9A 2WEVA 4QRCA 1WBSA 3I79A 5TT7A 4E20A 5HD4A 3RCJA 3FZPA 3TZMA 2ZV8A 3RZFA 4D58A 3GC9A 3NEWA 3D7TB 1FPUA 4BIBA 3Q9ZA 5H8GA 4MF1A 4FUXA 4IC8A 2QHMA 5TO8A 5I3OA 2JLDA 4AF3A 5M44A 4DEEA 2BRHA 2Q0NA 2RSVA 5IQFA 4JQ7A 1PYEA 4EBVA 4ALVA 2W1EA 4Z16A 2R3IA 3EJ1A 4L01A 2YM6A 4I1ZA 4YR8A 1BLXA 3OS3A 4FTAA 4NU1A 4RVKA 4FKVA 2J0JA 3H9RA 3BHUA 3QWKA 5BPYA 4O0VA 4EORA 4P90A 5CEKA 2HY0A 4EH2A 4LMNA 4D4SA 2QO9A 3KL8A 3NUNA 1PRYA 4CRLA 3FZSA 4AFEA 1Z5MA 5CAVA 4M69A 1Y8GA 2OLCA 3I7BA 2FB8A 3IDBA 4RFZA 2VUWA 4YZBA 2PVJA 4CYJA 4BCMA 2R64A 4C61A 3ULIA 1BX6A 4XV9A 3V5JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4IX3 A;  4KRC A;  3PZH A;  4EK6 A;  1WBO A;  2HCK A;  2BZH B;  4AZT A;  2UZE A;  4AOJ A;  4DFZ E;  3TJC A;  2R9S A;  4BI2 A;  4O7T A;  1YXS A;  4KS8 A;  1XHA A;  3A4O X;  3PFQ A;  4W4V A;  5AR7 A;  3DLZ A;  3FC1 X;  3R9N A;  3LFD A;  4F63 A;  4I6B A;  2VTP A;  3PG1 A;  2WD1 A;  3V5T A;  2PMN X;  5DOS A;  3G6H A;  3SLS A;  4RWK A;  1MRV A;  5E1S A;  4KUJ A;  2VWX A;  3I4B A;  3QKM A;  4FUY A;  4H3B A;  5AP1 A;  4GFO A;  4EOO A;  4RIY A;  1STC E;  2ZMC A;  3CBL A;  4I6F A;  4I5M A;  3NSZ A;  4ITH A;  4U44 A;  4BYJ A;  3P9J A;  4WG5 A;  5F95 A;  3ZEW A;  5HES A;  3E3P A;  4IX6 A;  4WOV A;  5AP7 A;  2PL0 A;  4FV9 A;  4BWX A;  2C68 A;  5FED A;  4AGW A;  1GZO A;  2UVY A;  2X1N A;  3I6W A;  3K3J A;  4AAC A;  4N0S A;  4B4L A;  2X8I A;  4X21 A;  3N9X A;  4F7S A;  3RTP A;  3UMX A;  2CGW A;  3IO7 A;  2WQE A;  4OLI A;  5HQ0 A;  3OFM A;  1ST4 A;  5M57 A;  3F69 A;  5L2S A;  2C5O A;  1PW2 A;  1GY3 A;  4A7C A;  3G33 A;  5M08 A;  4BDI A;  4LUD A;  1UU9 A;  1YI4 A;  3CTQ A;  3LM5 A;  3LPB A;  3GVU A;  4O27 B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2F49A

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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