2F4JA

Structure of the kinase domain of an imatinib-resistant abl mutant in complex with the aurora kinase inhibitor vx-680
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
287
structure length
287
Chain Sequence
GMSPNYDKWEMERTDITMKHKLGGGQYGEVYEGVWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVEEFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCTREPPFYIITEFMTYGNLLDYLRECNRQEVNAVVLLYMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLVGENHLVKVADFGLSRLMTGDTYTAPAGAKFPIKWTAPESLAYNKFSIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDLSQVYELLEKDYRMERPEGCPEKVYELMRACWQWNPSDRPSFAEIHQAFETMFQESSISDEVEKELGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the kinase domain of an imatinib-resistant Abl mutant in complex with the Aurora kinase inhibitor VX-680.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase ABL1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 92
structure length 287
sequence length 287
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2005-11-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2f4jA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2f4jA01
3VS5A 4O27B 2IWIA 3DQXA 3R01A 5A4TA 2CPKE 3HDMA 3FMHA 4TYGA 3OROA 5ANKA 5EDQA 4HYSA 4Z16A 4C35A 4O2PA 4J7BA 5J95A 4EQCA 4BIEA 4II5A 4KA3A 5AR5A 3HP2A 4MXZA 4EUUA 4C34A 4RIYB 2QOKA 1H1WA 4FL2A 3AOXA 3ORZA 4RJ6A 3VUKA 2B4SB 3FI8A 5AUUA 4U7ZA 1DI9A 2VZ6A 4FV3A 4X2FA 1JNKA 5HLWA 2WMTA 2IJMA 2XIRA 3KRXA 1SVEA 3FPMA 5AEPA 2YAAA 4XG6A 1JKSA 4I41A 4PDOA 5HESA 1W7HA 4F7JA 3Q2JA 3HAVA 4Y73A 5E4HA 4OT6A 5DNRA 3VS6A 3SG9A 3K54A 5DT4A 3ZRLA 2VTSA 4E5WA 4JBVA 5E90A 5K5NA 1U54B 2Y4PA 3FQEA 3FY0A 5L2QA 3E64A 2Y4IB 2VWVA 1MQBA 2VGPA 3MJ2A 4AW2A 3NUYA 4YSMA 5CVGA 4L68A 4DH7A 3UG1A 5KX8A 2UW8A 1JAMA 5ACKA 3ORLA 2YIXA 4YTFA 5JH6A 3CE3A 4AXAA 4QNAA 5ETIA 4HVGA 5BUEA 2BZJA 2EU9A 5HI2A 4FT9A 4X3FC 4EORA 4PDYA 4E26A 4PMTA 5LCJA 3VS0A 4X7QA 2PU8A 4G2FA 2XS0A 3P86A 4QYFA 2E9PA 3NVKI 3FSKA 4FL3A 2VTAA 2G15A 4XMOA 4PQNA 2GSFA 3BI6A 1G3NA 1H1RA 3OWLA 4DEAA 3GUBA 4YLLA 4TYHB 3LQ5A 2WAJA 4I5CA 2J90A 3QU0A 3AD4A 1FQ1B 4C61A 2B54A 4IXPA 3B8QA 3DV3A 4PDSA 4DEBA 3R9HA 2RIOA 3ID6C 4XBRA 3FSFA 3RALA 2QO7A 3LZBA 5DH3A 4KAOA 3RPRA 4U80A 3V5LA 1E9HA 3ALNA 3I5NA 3MVJA 2HY0A 4FODA 2PZYA 3QKMA 4AQCA 1KV2A 3FI3A 3GB2A 4RVMA 5JGBA 3POOA 3CY3A 2PZRA 2IO6A 4M12A 4JX3A 2XMYA 5E8UA 5CU0A 4O6EA 4IB0A 2OGVA 4F9BA 3IW8A 2EXEA 4X6QC 4X3FB 4MXOA 2CCHA 4ASZA 1K3AA 2G2IA 4FVRA 4O7YA 4BDKA 3MFUA 2LAVA 3QC4A 5I9UA 2PZ5A 3UC3A 3LFDA 4BF2A 5C4KA 1H28A 2EVAA 3LHJA 3R8LA 4I4EA 2O0UA 2VWYA 3JVRA 1V0BA 2PVRA 3ANQA 5AUYA 4BKZA 3FMNA 3KK9A 1G5SA 3FZOA 3JVSA 1OMWA 3NUPA 2I0YA 2J51A 2V5QA 3VIDA 2O5KA 4HGLA 1WBVA 2BIYA 4GCJA 4AN3A 2QOBA 4F6SA 2YWPA 4XOYA 3BGZA 4O83A 2QLQA 3PA5A 3R7YA 3H0YA 4XYFA 3DFAA 1YOLA 5C27A 5HZNA 3BPRA 1JBPE 1JQHA 3K2LA 3HAMA 2C6OA 3O96A 1ZARA 2G2HA 3AXWA 4JAIA 4UMUA 1PMNA 4DCAA 4KS8A 4FT5A 3TNHA 4F7SA 3UO4A 3MA3A 2VTRA 4RC3A 4FK3A 4QYHA 4EH5A 3BBTB 5AP2A 3RCJA 1RE8A 3WARA 2UVYA 3FLQA 2OG8A 4JOAA 5IH4A 2XCKA 3HGKA 3OCBA 2JDOA 3A8XA 2YIYA 3D2KA 4FTJA 4Y95A 3UG2A 4ACHA 4U6RA 3HX4A 2JKQA 4TY1A 2VTHA 5JQ8A 5AAEA 4I3ZA 3W2OA 3E93A 4YZBA 4V05A 5C1QB 3FZRA 5KMIA 1MRUA 3V51A 2WOTA 3A4PA 5H2UA 5IA0A 4DFUA 4FTKA 3ZRKA 2RFEA 5EM7A 4WNMA 5IEXA 4X2KA 5LMAA 4P7EA 4B0GA 1ZY5A 2O8YA 3CKXA 3DTCA 4W8EA 2YM4A 4NTTA 5HTCA 3RKBA 5BVNA 4P5ZA 4RWLA 3DTWA 4RIXA 3BU5A 4XS2A 4G6NA 4PTEA 4G34A 1H01A 1RQQA 5HE2A 5ACBC 2OIDA 2Y6OA 5FP6A 1JKKA 4N6YA 5KMJA 1U59A 2BKKA 1IASA 2FH9A 4PV0A 5A4LA 3SVVA 3MY5A 5BVOA 4YPDA 3MA6A 4XP3A 3ZLYA 2Y0AA 4RIWB 3IONA 1CTPE 4GYIA 3Q96A 1BL6A 3LW0A 3R21A 4O22A 4C3PA 1PXLA 3PTGA 2PWLA 4EK6A 4BCNA 4QP2A 2BZHB 5K4JA 3E5AA 2VTPA 5BX0A 1WMKA 1OECA 2ZDUA 4I21A 4PTCA 3ZLWA 1FINA 3DAKA 3UQCA 4AF3A 3U6JA 3F2RA 4BB4A 2KULA 5ANDA 4XG2A 2GNGA 4E1ZA 5DPVA 2ZV9A 3DY7A 5FBNC 1X8BA 2YIQA 4O82A 4FL1A 3V8SA 4JJRA 3WI6A 2X7GA 2JAVA 3SOAA 3F69A 3GENA 5GIPE 3I81A 1STCE 3NZ0A 4O7VA 4ITIA 3LXNA 3JXWA 2B53A 1Y6AA 2IW9A 4IDVA 3U4WA 4U40A 5CQUA 1B6CB 1GZ8A 3FL4A 5JZJA 4FF8A 2R3IA 2YABA 3R22A 3CSVA 1JKTA 3R9DA 2QCSA 5A4CA 3GU6A 4WOVA 3BHVA 5JFVA 2W05A 5K0XA 4IZYA 4BZDA 2GU8A 2QNJA 3BQRA 5HHWA 2EXCX 1WZYA 3R7VA 4CFUA 3W2CA 2E9VA 2WTIA 3UOHA 4E4XA 5HX6A 4QYYA 2HWOA 3BYMA 4RJ4A 4D2VA 2B0QA 4CCUA 5M44A 3BWFA 2QOOA 3VUTA 2WIHA 3E87A 2YDIA 4CMOA 4QP8A 4KRDA 3CQEA 4FSUA 4R5SA 1WFCA 5HNGA 5IA1A 4PRJA 4UMPA 5HD7A 4AOJA 1P2AA 4FSNA 2VGOA 2ZB0A 3RZFA 5KMNA 2XNMA 2YJRA 4ANNA 5CF8A 5H8EA 4M69A 3L9NA 2ZAZA 4MD9E 5JEBA 3NPCA 4CRLA 3CIKA 4DINA 2WZJA 5J7HA 3UC4A 4QTBA 2WU6A 3E62A 3R7EA 2HW7A 4ZS4A 5M06A 3OWJA 2VRXA 4MKCA 3KK8A 4IJ9A 3H9RA 4F9WA 4BKJA 3EOCA 3EKKA 3G51A 5IF1A 4LGDA 3V6RA 3E3PA 5EM6A 4YUQA 4MBJA 4D4SA 2X6DA 4E6AA 3FXWA 2W1DA 1NA7A 3R6XA 4AZSA 2PSQA 3LLAA 2P3GX 4DAWA 4KSQA 3GP0A 4JAJA 1M7QA 2ONLA 3AMYA 3IECA 4I0SA 4I6FA 5KCVA 4JBOA 4QTAA 3W18A 3W2QA 2OXYA 2A27A 4UEUA 4DGNA 4IANA 5E9EA 3KF7A 3PXFA 4YJRA 2YCFA 3ZMMA 5KMLA 4LUEA 5ANGA 4USDA 4UWYA 5TT7A 3D5VA 2XK4A 2H8HA 2YCRA 4A9RA 4BDGA 5L6PA 1URWA 3DAEA 4BC6A 3KXGA 2H6DA 2QVSE 4HNIA 3KMMA 4FEVA 1XJDA 4FEXA 1OIQA 2XNGA 4G3DA 2R5TA 3AC5A 4N0SA 2VWZA 2R3QA 3DK3A 4NJDA 1UKIA 4UMTA 5KZ0A 2AUHA 3R7IA 4D58A 4DGMA 4EWHA 4F0FA 1Y8GA 4LOOA 5LVPA 4AACA 4IB1A 3O51A 4X21A 2OU7A 1H0WA 2FSTX 5GINE 3NW7A 5CAPA 5KHXA 3PIZA 2JDRA 3DLSA 2UZLA 4MXYA 2A4LA 2R3MA 4G6OA 4YNOA 2WTKC 5HU3A 1SVGA 4FE2A 2WU7A 3ZXTA 3MVHA 3NRMA 4M0ZA 2G9XA 3IDPA 4YJQA 1ZYJA 3D5XA 2IZSA 3QAME 3HDNA 3DZQA 2PZIA 4L9IA 4I1ZA 4U79A 5DEWA 3N4TA 3Q9WA 4MEDA 4TL0A 3JYAA 2CGWA 3V5WA 4AGWA 3MH2A 3I4BA 2J0KA 4CV8A 4EC9A 4JRNA 3U9NA 3MSSA 3NUXA 4A9YA 4R6VA 3LCOA 2LGCA 3CP9A 3OCGA 3BELA 4F6WA 5BYYA 1Q8TA 4ZTHA 3MH0A 5EK7A 4ENXA 4H3QA 1G8SA 4JDKA 5BVKA 4AGCA 5BVEA 5DWRA 4QMPA 2NPQA 2YHVA 4Y83A 3BQCA 3MWUA 4ZSLA 3E8NA 3QUPA 5D7AA 4YBKA 4WT6A 3TKIA 4AS0A 2SRCA 2W1IA 2YM8A 4MAOA 3MESA 5LMKA 1HCKA 3FI2A 1VEBA 3K3IA 5IQEA 4FSZA 1SYKA 3MDYA 4O96A 5IMEA 3EQPA 3OCSA 1OL1A 2JDVA 3AMAA 3KVWA 5DHJA 3ZONA 4CYIA 4ZAUA 4EOIA 3PXZA 5CANA 5IEVA 3LKMA 3AC2A 4GRBA 5HIEA 4L44A 2PY3A 5EKOA 3VBVA 3NYOA 3D7TA 3QQLA 4PPCA 2P4IA 4BR3A 3OUKA 4G17A 5IA2A 4XX9A 4KIKA 4CEGA 4USEA 2VTOA 5L8KA 3EQCA 3L8VA 4R1YA 1NVRA 3EN5A 3V5QA 1TQPA 4X2JA 3ZUVA 3BWJA 4D2SA 4ID7A 1WBWA 4WNPA 5FXSA 3WBLA 2V22A 4AT4A 4F63A 2YIRA 3VWAA 2UZTA 1YWVA 1M2QA 3NAYA 5F1ZA 4FKUA 4EKLA 1NVQA 5HQ0A 4WSYA 3MVMA 4LRJA 4IB3A 3ROCA 1OL2A 4EHVA 3VUDA 3UOJA 2DYLA 4CRSA 3BEAA 2C6IA 4M15A 4O0VA 3SX9A 3VBXA 2Q0BA 5L4QA 4BIDA 3PE1A 2PZPA 4BN1A 2H96A 2PVHA 4WD5A 4XLVA 4APPA 3VO3A 4FEWA 4AZWA 3LXKA 1SM2A 2RFSA 4W9XA 3MI9A 4X0MA 5IQBA 1YDSE 2CLXA 3R02A 3UPXA 4RT7A 1T45A 1MUOA 2XIYA 3MPMA 1UU3A 5AR4A 5K0KA 3I7BA 5CU4A 4KIOA 5DN3A 3U87A 1WBOA 3ENMA 3QTXA 3W32A 4F0IA 2J0MB 3I60A 4GJ3A 4M67A 3HV7A 4YZ9A 2A0CX 3FC1X 4DE4A 3E3BX 4OTWA 4IAKA 4XRLA 5TF9A 3HV3A 4L52A 1OIYA 3NWWA 3V01A 1JSUA 4BVUA 3PSCA 4L3PA 5I5ZA 3UYSA 2XKEA 2RGPA 3GCUA 4XRJA 2OH0E 3ZC6A 1H08A 2HOGA 3KXNA 3KXMA 2EB2A 4E3CA 2W5AA 3D5WA 4GK2A 4YHTA 4UZDA 3MN3A 5M55A 4JRVA 3ZEPA 2YDKA 5IKWA 4BRXA 4F9CA 2YM6A 3CS9A 4B4LA 4PTGA 3DJ5A 4BCIA 3O8TA 3KMWA 2BRBA 4MNEB 4F64A 4QMQA 3NSZA 2QOFA 1UNGA 1XO2B 3NIEA 4IEBA 2PE0A 3DZOA 4S30A 2WNTA 4U43A 4LRMA 5E8WA 4EHZA 4ZMFA 3ORKA 1F0QA 4UY9A 4LV8A 4PDPA 2OWBA 5HORA 2FB8A 4H3PA 3UBDA 1GZKA 3R63A 4FNXA 4IX3A 4MXAA 3PP0A 4JQ7A 4KS7A 5JFXA 1JSTA 2G2FA 3NUAA 5J1WA 3UP7A 4C36A 2GS2A 3TTIA 3QTQA 5IMXA 2XVDA 2O3PA 3R1YA 3LCKA 4N4SA 4FYOA 3U51A 1OUYA 3R0TA 5CASA 4F99A 3QZIA 1JSVA 1OL5A 3BYVA 3OC1A 4I23A 3P5KA 3FE3A 4QQJA 4EEVA 3QTWA 5AFVA 3ZCLA 2UVXA 3VW6A 2R3LA 3L9PA 2XB7A 5JFSA 5EH0A 3HKOA 4CLJA 4HW7A 5CYIA 4D4RA 4TPTA 3EMGA 4X2NA 5AUVA 2C68A 3ORTA 2PMNX 4UYNA 5FTGA 3CTHA 1W83A 4EHEA 3OXTA 3DXPA 3AGMA 5AX3A 1V0PA 3FI4A 1YHVA 4I20A 5M08A 4YTHA 4BDHA 5LMBA 2CHLA 5JRQA 3KMUA 1FGKA 1O6LA 3C4FA 1GY3A 1GOLA 3EQGA 3VHKA 2A1AB 5A4EA 5KBQA 3P9JA 3EIDA 4ZY6A 2X39A 1I44A 2ITUA 3TNIA 2CMWA 3PIYA 1ZXEA 1UVRA 2X7OA 4RRVA 3C50A 4L6QA 4KINA 3S1HA 2R3NA 4M84A 4NJ3A 2WMXA 3F7ZA 3TACA 1KWPA 4F08A 5BNJA 4WBBB 4A9UA 1K2PA 5EOBA 3VQUA 5DFPA 4U5JA 3T9TA 2W96B 3PSDA 3ZFMA 4C2VA 4C33A 5A14A 3DK6A 4HGSA 4K18A 2BIKB 4AA0A 3QZHA 4TYEA 4FKIA 4LGGA 5A6NA 3G15A 1LP4A 4CMUA 2VTMA 3DB8A 2JIIA 5HVYA 1OZ1A 3L8SA 1PHKA 2YCQA 4UBAA 5DI1A 1CKIA 3E7OA 4CV9A 3U9CA 1W98A 4CCBA 3NMUF 2R3FA 3CPCA 5HG7A 3ZUTA 3IGOA 2XRWA 4TYIA 4ZTRA 3GBZA 4MWIA 3HEGA 2IZTA 3PZHA 3QQUA 3SRVB 3SGCA 3MS9A 4FTMA 4IFGA 5TO8A 3LM5A 3RVGA 5M53A 3HZTA 5HIBA 5L2WA 4D4VA 1ZYLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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