2FSOX

Mitogen activated protein kinase p38alpha (d176a) activating mutant
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
349
structure length
325
Chain Sequence
RPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of p38alpha Active Mutants Reveal Conformational Changes in L16 Loop that Induce Autophosphorylation and Activation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 109
structure length 325
sequence length 349
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2006-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2fsoX02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2fsoX01
2W4KA 3OXZA 5CSHA 5TF9A 3RGFA 2C1AA 3C5UA 3DTCA 4FF8A 4H58A 4U97A 4B8LA 4N57A 2GNHA 3G0EA 3COKA 2IW8A 5FM3A 4YHTA 4EWQA 3BIZA 4O7VA 1PW2A 3OT3A 2QOQA 5FUTA 3NVKI 3W2PA 4C7TA 4LOOA 5L6OA 1WAKA 2W06A 1UVRA 2WMQA 3F5GA 4EUUA 1FGIA 5C4KA 2YLEA 4QMOA 5E8VA 4FTQA 4NSTA 4YTHA 2VWVA 4R3RA 4BTMA 4QPSA 1FQ1B 4FIJA 3D2IA 5FXQA 4FTMA 5HG5A 3FMEA 3RAKA 2YM7A 4FG8A 5HG7A 3F3ZA 5FDXA 4PWNA 2X7FA 4JIKA 2BILB 2PUIA 5KUPA 4BY9E 2Q0BA 2X2LA 4AGDA 3LJ0A 2XBJA 4Z7GA 3G9LX 3I5NA 4BDJA 5CU0A 2PVJA 3NPCA 3QQLA 1OL1A 1W98A 4A9SA 3QZIA 3R1NA 4X2FA 3DLSA 3HV3A 4EOOA 3CSVA 3Q6UA 4A9YA 1APME 2XVDA 4RQVA 4D58A 4USEA 2BVAA 3KXZA 3HMNA 2JIVA 3P23A 3L9MA 1I09A 3HMPA 4AF3A 3R6XA 4F08A 1M7NA 3EQFA 4ZY5A 2XS0A 4BC6A 1E1XA 3Q4ZA 1OIQA 5CEIA 2Q83A 5CLPA 4RFYA 4LFIA 2G1TA 3HDNA 3EL8A 3PRFA 3DQXA 4FV2A 3FC1X 5C8KA 3EZRA 4FV1A 4I6QA 4ZTNA 3UQCA 5HNGA 2JC6A 2OFVA 1P5EA 2W9ZB 1FOTA 4ANOA 2E9PA 3IOPA 5KMKA 4BYJA 2QLUA 4RIWB 2W4OA 5CXZA 5GIPE 4J1RA 4XG2A 3WYYA 4RJ8A 2OJGA 5IQDA 2BROA 1YI3A 4TYJA 3HUCA 1L8TA 3QLFA 3TUCA 2QO9A 2R3QA 2Z02A 1E1VA 3UIMA 4RJ3A 4DG3E 3UO5A 1Q24A 2NRUA 2X1NA 4CQEA 5J79A 2CJMA 3F7ZA 3ZBXA 4MBJA 3COMA 4KBAA 2JFLA 1IASA 2PU8A 4FSZA 4I23A 3FLYA 4I24A 1STCE 5A6NA 4B0GA 2X8DA 4U43A 1W7HA 3IDBA 1H1SA 4JG6A 4LM5A 2F4JA 3CJGA 3TDVA 3ZLYA 4QMXA 4LRMA 4F6WA 3EQBA 4EQCA 5AP6A 2B52A 5A6OA 3KFAA 2UZOA 3GCVA 3QQHA 4F0FA 3MYGA 3RPRA 3ZLWA 2CLQA 5IMXA 3HV6A 3QGYA 5CF5A 4CG9A 3MS9A 4EHEA 4BF2A 2B53A 3OWPA 4FTJA 1P14A 2BTRA 2IW6A 4KKHA 4CZYB 3RK5A 3AC2A 1CMKE 2ETKA 5EDQA 5CF6A 1QPEA 3MSSA 2DWBA 5FEQA 3O23A 4RIXA 3COIA 4U0IA 4H36A 1NVSA 4F9CA 5HE3A 5JGAA 4KIPA 2J7TA 1J7IA 3ORIA 3DOGA 2RL5A 5EI8A 1GIJA 2BR1A 5FGKA 3C9WA 5D7AA 5GZ8A 1JBPE 3FI3A 3DS6A 2ZV9A 4BB4A 4ZMEA 4U7ZA 2A19B 3GP0A 3O50A 1JSTA 1GZ8A 2BPMA 2G2FA 3KRRA 2ETMA 5CWZA 1GNGA 4GIIA 4O7WA 3H9OA 3M2WA 5HO8A 5AUYA 4UXQA 4BHZA 1M2RA 2XKEA 4XH6A 5DN3A 2BHHA 3PYYA 4D55A 4ZLYA 2J0LA 3ZXZA 4DBNA 5IQGA 1AD5A 4L3JA 4O91A 4JL9A 4XG7A 4EQMA 4HZSA 2W1EA 4KABA 4EK8A 5D41A 4UMTA 1H07A 3UIUA 4ITHA 3R73A 3E3PA 2B9FA 5JT2A 1GOLA 4NFMA 4DLIA 5JN2A 2FVDA 3IW6A 4L7SA 4NKAA 3AMYA 2WD1A 1O9UA 3NUSA 5HBJA 2XYNA 4GUBA 1OL6A 5CU4A 2YHVA 2OJFE 2XEYA 2XF0A 4CFUA 4ERKA 4ALWA 2QKRA 4YNEA 2BZHB 5BVWA 4O84A 3MN3A 3P78A 5ETCA 4ZZMA 4CVAA 4FZFB 2YDKA 3KA0A 3VF9A 4IWDA 4FTIA 3LAUA 3PA3A 4AZWA 4O7SA 1U46A 5AR7A 3ULZA 4I20A 4I41A 4TXCA 1P4OA 2WZJA 3R7GA 3HYHA 4F0IA 2YM5A 1M2PA 3SG9A 4KS7A 4TTHB 5JK3A 5IMEA 3THBA 5AP3A 1H0WA 5M4UA 2PY3A 1DS5A 3MVMA 3LMHA 2RIOA 3JVRA 4G3FA 3FMHA 4WD5A 3EKNA 3E7VA 2CGVA 4QQJA 3FAAA 4FT7A 4EOSA 2BALA 3UQFA 2UW7A 2JIUA 2PE1A 4NIFB 5E1EA 4W4YA 5DYJA 3GT8A 3FPQA 4JIAA 4D0XA 4YR8A 2BTSA 5M44A 5HIBA 4JBOA 2YABA 1YXXA 2GHLA 4CNHA 1LPUA 2NPQA 3VQUA 3BZ3A 1BLXA 2XIXA 4J97A 5LOHA 4G3EA 3UVPA 1F5QA 5CI7A 3R7VA 3PVWA 2Y0AA 4H3BA 4WG4A 4PY1A 2GNLA 2QQ7A 2OI4X 4WBOA 2ONLC 4O96A 5CT0A 2X81A 1UKHA 3VBTA 1GZKA 4KSPA 5A3XA 4LV8A 3PPZA 3F3TA 4GW8A 2C3LA 3GOPA 5T3QA 3AGLA 2YA9A 2BHEA 2J5FA 4Z9LA 5AR4A 5KMNA 5A4EA 2C6TA 4EZ7A 5CI6A 1BI8A 1OKVA 3BGZA 4CRSA 3TJCA 4BCOA 3CKXA 5IUGA 3NW5A 3A7HA 3LMGA 4RA5A 1Q8TA 3MIYA 3Q9WA 4CFWA 1Q3WA 5EHYA 2ZV8A 2VTMA 3VS3A 4DG2E 4WRGA 4TYHB 5EW3A 3GENA 1NVRA 3GC0A 5GNKA 3OCGA 5FBNC 3MY1A 3VBQA 4DHFA 3LXPA 2HXQA 3FUPA 3PJ8A 4ENYA 3DXNA 2F7EE 5DVRA 1H1PA 2R0UA 3BHHA 1GZOA 5KNJA 1JNKA 1SM2A 4GS6A 4DFXE 4F6UA 3FSKA 5IQEA 3ZM4A 2RF9A 2VO6A 1QL6A 3ZO1A 2OXYA 4AAAA 3NMUF 2HAKA 3D5UA 3QX4A 2FO0A 4FZAB 5E92A 3EFKA 1VEBA 3EQDA 2PMOX 2VTRA 3I1AA 4R77A 1JQHA 4QNAA 3G6HA 4BICA 4X0MA 2YLFA 5AA8A 4PTCA 1WBVA 3KEXA 4AW5A 1PXPA 3EB0A 2GFSA 4E4MA 4OTIA 4C4GA 4IVBA 3NW7A 1KE5A 1YRPA 3UOLA 1PRYA 3TWJA 3VS1A 4WIHA 4FV8A 4DCEA 3NAYA 3QUPA 4AFJA 5IQBA 4MBIA 5IA3A 2OJ9A 4HCVA 5IZFA 2HXLA 4Z3VA 4QMPA 1XHAA 4CG8A 4MNEB 2A1AB 5HTBA 4A4XA 4NCTA 2F57A 4QP9A 3AG9A 4FKGA 4RWLA 3E8NA 4QMZA 1M14A 3NUPA 3SAYA 3TN8A 4CCUA 2ZVAA 4EHVA 5M08A 3QGWA 1JKTA 5HE2A 4AOTA 3UZTA 4M13A 1ERKA 2B55A 2E2BA 3B8QA 2WTCA 5D11A 5H8BA 3VHKA 3ZOSA 3NLBA 4WRSA 2WHBA 2HELA 2YIYA 4M7IA 4MTAA 5L2QA 1RJBA 3K5VA 4EH3A 3DFCB 4OBPA 4EQUA 3DPKA 4TYGA 4FVRA 3CEKA 4D9TA 5FG8A 4X2NA 3QQKA 4FG7A 1ZWSA 4MEDA 5CEPA 2R3PA 4JR7A 3CS9A 3RALA 2XIKA 5B2KA 1MQBA 4RX8A 5M06A 4C2VA 1BI7A 5CVHA 3GU6A 3FKLA 4UXLA 5LQFA 4YPDA 3TZ7A 4R3CA 3O2MA 4UWYA 4EHZA 1HCLA 2QOOA 3R9HA 2Z60A 5EYKA 3W33A 1QCFA 2R3OA 4YZDA 4QMTA 2UZWE 3G51A 3IK3A 2B9JA 2WIHA 2GHGA 3S2PA 1H8FA 4V0GA 3ORMA 4Y83A 3VBXA 4OAUC 2BDFA 5AIKA 4CKJA 1OL5A 3NVMB 4EOIA 2YCRA 4E7WA 4QMMA 4ZLZA 3FLZA 3RWQA 5HLNA 5A4TA 4E6QA 3MA6A 2ITPA 3OHTA 5L8KA 1JKSA 5EM8A 4DC2A 3QRUA 3CTJA 5AAEA 4AE9A 2X6DA 5BQ0A 3OD6X 2QOFA 3RNIA 3HMMA 2YIWA 3NNVA 3NUXA 3JY0A 4IBMA 2YACA 3QTQA 5EI6A 4ZSEA 4A9UA 4C34A 2OSCA 3QA8A 4IVDA 4MD7E 3CLYA 3P86A 3ZFYA 2GU8A 1SMHA 2WMBA 4EK6A 3G5DA 1XBCA 4HW7A 3AC4A 4UBAA 5A4LA 4APPA 2ITVA 5EQEA 4IZYA 3OBGA 5D9HA 3QKMA 5C4LA 4AGUA 3QCQA 3MV5A 3AOXA 1VYWA 1G8AA 1GIHA 3T3UA 3C0HA 1KOAA 2EUFB 4J96A 4DT9A 3UNKA 5AR2A 4ZXTA 3AMAA 3KL8A 4XV9A 4LQMA 3LE6A 5CAOA 2JITA 5AP1A 5EDRA 4IVAA 1YDSE 1OL7A 2R3MA 3D5XA 4O2ZA 4N0SA 4H3QA 4YPSA 4OTGA 1M52A 3ZFMA 3ENHA 3ZMMA 4BTFA 4EC9A 5BUEA 2G2HA 3D15A 2ZM3A 2UZVA 3PP0A 4RFMA 4U40A 5CSXA 5JRSA 5IPJA 3SG8A 2IW9A 3BEGA 2C4GA 4G6OA 2XK6A 5CSVA 3N51A 4ZY4A 2BDJA 1YWRA 1YXSA 2BMCA 3LPBA 4GU6A 3UGCA 5LMBA 2VNWA 4FV9A 2R5TA 4BBEA 3EN5A 4L43A 3R9RA 3FLQA 3ZYAA 4UB7A 1PJKA 1YWNA 2C68A 2QG7A 4DEBA 1M2QA 4ORKA 4FKLA 3SRVA 4RX7A 3ZDIA 2GCDA 5HLWA 1QPDA 1Z5MA 5HG8A 3BWFA 3Q2MA 4KIQA 4F65A 3BYVA 2QG5A 2HWOA 3E5AA 5HEZA 5ANJA 4DGGA 3Q9XA 3U9CA 3WZJA 1VYZA 3FPMA 4M84A 4RJ5A 4ZSLA 4ZTHA 4PDSA 4C0TA 2Z7LA 4TNDA 3G9NA 1JPAA 2C5XA 4FICA 4FSYA 3ZXTA 2I1MA 5EH0A 5LCJA 1JSUA 4JDIA 5LMKA 3WE8A 4MF0A 4BWXA 5DIAA 2B9HA 3VBVA 3O8PA 2RFNA 5CASA 1ZYDA 1A06A 4Q5HA 4O0XA 3C4EA 4BCKA 1IA9A 4O7NA 1FGKA 2W1ZA 3EL7A 4JXFA 4F70A 3Q4TA 2B9IA 3WF7A 3B2WA 4JQ7A 4H39A 4CD0A 3FYKX 3R63A 2EB2A 3DXPA 3ATTA 5AAFA 4DGLC 4G34A 3GCPA 4K0YA 2GSFA 5M57A 3IS5A 2XEZA 4FBXA 1Q8YA 5KBQA 4NU1A 4KBCA 2OJIA 2XMYA 5BVKA 4YJUA 3KK9A 4QP4A 3V8SA 4KRDA 1TQPA 2CGXA 3OWLA 2VAGA 4L46A 1R0EA 4YJQA 3F66A 1U54A 1UNLA 2BAQA 3NSZA 5EHOA 5TOZA 2YWPA 3ZZWA 4AZSA 4C4JA 5IQHA 4V04A 2XIRA 2X8EA 3NRMA 2BAJA 3E93A 3KK8A 3EYGA 4CYJA 4FKWA 2VGOA 2YJSA 2EXCX 5DR2A 5H3QA 3FZTA 4JVGA 5LVMA 2BKKA 4LMNA 3AC1A 4GT5A 4J95A 3SXSA 3NWWA 2XCKA 4JDHA 4E8AA 5CQUA 4Z16A 3TNWA 2YERA 3Q32A 2OIDA 4N70A 4GVJA 4OUCA 4IB5A 2AC5A 4O6LA 2VWYA 4O7RA 4U8ZA 3OCSA 4LI5A 3BYOA 1BL7A 2JGZA 4K77A 3FQEA 3PLAE 5E8SA 3DKFA 1OBGA 5EW9A 3E8EA 3WBLA 2P4IA 3LQ5A 4PMPA 5A4CA 4DLJA 3TDWA 4MH7A 4NM0A 3K3JA 3EQPA 4DEGA 2KTYA 4AG8A 5ITAA 1PY5A 4S34A 2WFYA 4K11A 4G3DA 4YO6A 3VRZA 4DCAA 3R7YA 4D1ZA 3I60A 4O86A 1KOBA 2C1BA 4E20A 3TT0A 2BFXA 3CY2A 3PA4A 4LOQA 5CNNA 3PY3A 4O0VA 5FP5A 2PUPA 4L44A 4UMUA 2C3JA 2I0VA 2J51A 2JFMA 3C51A 3LCSA 5IDPA 4AOIA 4FSWA 3ZFXA 4G2FA 1ZYSA 4AZEA 5BMSA 1H1QA 3BBWA 4OTFA 2XNMA 4K6ZA 3ZO3A 2W1FA 5BVOA 2YZLA 2OG8A 4C38A 2QO2A 5BVDA 4APCA 1FVTA 2O63A 1F3MC 4RC3A 4IMYA 2XRWA 3PLSA 4QTCA 3UYTA 5IQCA 3EQGA 3QZFA 4UMRA 3I7CA 4AS0A 4G5PA 5DR9A 4O1PA 3BU5A 1IR3A 1TKIA 4YZMA 4GVAA 4ANLA 4AUAA 2WTDA 5M51A 4DEAA 2JDOA 2XNPA 5TKDA 4FKTA 4FL2A 4WOVA 3RCDA 4GG7A 4AX8A 3VO3A 4D4SA 2QO7A 2BRNA 3IKAA 2E9VA 5KX8A 3HLLA 3E63A 3EQHA 3LOKA 1M17A 2UW0A 3ET7A 2UVZA 4FTCA 2C5VA 5JQ8A 3DJ7A 3BV3A 4QTAA 5AEPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2W4K A;  3OXZ A;  5CSH A;  5TF9 A;  3RGF A;  2C1A A;  3C5U A;  3DTC A;  4FF8 A;  4H58 A;  4U97 A;  4B8L A;  4N57 A;  2GNH A;  3G0E A;  3COK A;  2IW8 A;  5FM3 A;  4YHT A;  4EWQ A;  3BIZ A;  4O7V A;  1PW2 A;  3OT3 A;  2QOQ A;  5FUT A;  3NVK I;  3W2P A;  4C7T A;  4LOO A;  5L6O A;  1WAK A;  2W06 A;  1UVR A;  2WMQ A;  3F5G A;  4EUU A;  1FGI A;  5C4K A;  2YLE A;  4QMO A;  5E8V A;  4FTQ A;  4NST A;  4YTH A;  2VWV A;  4R3R A;  4BTM A;  4QPS A;  1FQ1 B;  4FIJ A;  3D2I A;  5FXQ A;  4FTM A;  5HG5 A;  3FME A;  3RAK A;  2YM7 A;  4FG8 A;  5HG7 A;  3F3Z A;  5FDX A;  4PWN A;  2X7F A;  4JIK A;  2BIL B;  2PUI A;  5KUP A;  4AAY A;  4BY9 E;  2Q0B A;  2X2L A;  4AGD A;  3LJ0 A;  2XBJ A;  4Z7G A;  3G9L X;  3I5N A;  4BDJ A;  5CU0 A;  2PVJ A;  3BL7 A;  3NPC A;  3QQL A;  1OL1 A;  1W98 A;  4A9S A;  3QZI A;  3R1N A;  4X2F A;  3DLS A;  3HV3 A;  4EOO A;  3CSV A;  3Q6U A;  4A9Y A;  1APM E;  2XVD A;  4RQV A;  4D58 A;  4USE A;  2BVA A;  3KXZ A;  3HMN A;  2JIV A;  3P23 A;  3L9M A;  1I09 A;  3HMP A;  4AF3 A;  3R6X A;  4F08 A; 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 5IMX A;  3HV6 A;  3QGY A;  5CF5 A;  4CG9 A;  3MS9 A;  4I6L A;  4EHE A;  4BF2 A;  2B53 A;  3OWP A;  4FTJ A;  1P14 A;  2BTR A;  2IW6 A;  4KKH A;  4CZY B;  3RK5 A;  3AC2 A;  1CMK E;  2ETK A;  5EDQ A;  5CF6 A;  1QPE A;  3MSS A;  2DWB A;  5FEQ A;  3O23 A;  4RIX A;  3COI A;  4U0I A;  4H36 A;  1NVS A;  4F9C A;  5HE3 A;  5JGA A;  4KIP A;  2J7T A;  1J7I A;  3ORI A;  3DOG A;  2RL5 A;  5EI8 A;  1GIJ A;  2BR1 A;  5FGK A;  3C9W A;  5D7A A;  5GZ8 A;  1JBP E;  3FI3 A;  3DS6 A;  2ZV9 A;  4BB4 A;  4ZME A;  4U7Z A;  2A19 B;  3GP0 A;  3O50 A;  1JST A;  1GZ8 A;  2BPM A;  2G2F A;  3KRR A;  2ETM A;  5CWZ A;  1GNG A;  4GII A;  4O7W A;  3H9O A;  3M2W A;  5HO8 A;  5AUY A;  4UXQ A;  4BHZ A;  1M2R A;  2XKE A;  4XH6 A;  5DN3 A;  2BHH A;  3PYY A;  4D55 A;  4ZLY A;  2J0L A;  3ZXZ A;  4DBN A;  5IQG A;  1AD5 A;  4L3J A;  4O91 A;  4JL9 A;  4XG7 A;  4EQM A;  4HZS A;  2W1E A;  4KAB A;  4EK8 A;  5D41 A;  4UMT A;  1H07 A;  3UIU A;  4ITH A;  3R73 A;  3E3P A;  2B9F A;  5JT2 A;  1GOL A;  4NFM A;  4DLI A;  5JN2 A;  2FVD A;  3IW6 A; 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