2GCDA

Tao2 kinase domain-staurosporine structure
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
309
structure length
308
Chain Sequence
DPDVAELFFKDDPEKLFSDLREIGHGSFGAVYFARDVRNSEVVAIKKMSYSGKQSNEKWQDIIKEVRFLQKLRHPNTIQYRGCYLREHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHKKPLQEVEIAAVTHGALQGLAYLHSHNMIHRDVKAGNILLSEPGLVKLGDFGSASIMAPANFVGTPYWMAPEVILAMDEGQYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQNESPALQSGHWSEYFRNFVDSCLQKIPQDRPTSEVLLKHRFVLRERPPTVIMDLIQRTKDAVRELDNLQYRKMKKILFQEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the MAP3K TAO2 kinase domain bound by an inhibitor staurosporine.
pubmed rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase TAO2
molecule tags Transferase
source organism Rattus norvegicus
total genus 96
structure length 308
sequence length 309
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2006-03-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2gcdA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2gcdA01
3GB2A 5D9HA 3IW6A 4IM0A 4NW5A 4KNBA 2AC5A 3KB7A 4K11A 3Q32A 2OIQA 3DAJA 2J5EA 4D4SA 4X7QA 5C4LA 1ZMUA 4DFUA 3B2WA 4QYFA 3Q9YA 1WBPA 2BALA 2GQGA 2RSVA 3Q04A 3C5UA 4OGRA 3U4UA 3ZSGA 4BIBA 3LLAA 3PXZA 5HIEA 3MIYA 5HO8A 4NKSA 4D28A 5M07A 4H39A 4Y46A 4RWLA 5FBOA 5IQBA 5AAFA 4CLJA 3BV3A 4CTCA 4JDHA 5AP0A 3R21A 3BWFA 4LOOA 4M69B 2HOGA 3DAKA 4E4NA 3CTJA 2QHMA 3QGWA 3OMVA 4MH7A 3V5PA 4YJPA 4HW7A 4O7TA 4HZSA 2DQ7X 3R7YA 3AGLA 4EOMA 4L68A 5CASA 5GNKA 5EM8A 4EC8A 3MJ2A 2J9MA 2KTYA 2W9FB 4B6LA 2PVMA 4YJOA 1QPJA 5B0XA 1WVYA 3ZEWA 4Y8DA 1W7HA 2ZDUA 3B2TA 4QPSA 4FSWA 4I93A 4S33A 2NP8A 4F6WA 3D7TA 3MPTA 1JQHA 4EK3A 5TF9A 3OEZA 3TACA 5AUZA 3KF4A 3DY7A 3ORKA 5AV0A 5CANA 1JKKA 2RG5A 3HAMA 5ACBC 2CN5A 4BHZA 5BVFA 1PJKA 1XH4A 1XH9A 3C0HA 4WRSA 1FBNA 4ZXTA 4M0ZA 3VQUA 2ITOA 3DFAA 2Q0BA 2PZ5A 5JK3A 3IS5A 4JBOA 4LOPA 2C68A 4MX9A 3O96A 3P08A 3V6SA 3OY1A 1E1VA 3KN6A 3Q4UA 2VTLA 4CCUA 4TN6A 3LMHA 4HCTA 2QOCA 4JJRA 2R3HA 1W8CA 2R3OA 4EOKA 3COHA 2WMWA 4C8BA 3OXIA 3NIZA 3GC9A 4RT7A 3A60A 4MD9E 1JSTA 3PVGA 4UWBA 1A06A 2UVZA 3O8TA 4L42A 4J95A 4QMQA 3OT8A 4KSPA 4TW9A 1ZYJA 4RWIA 5EM5A 4FYOA 5HG8A 3COMA 1UNLA 4X6RA 3GBZA 3PA5A 3QQHA 3FLNC 5JGAA 5EYMA 1JKSA 2XA4A 3IOPA 5FBNC 4F65A 2QR7A 2AC3A 5J95A 4WG4A 3LAUA 3ANRA 2I40A 2ZV9A 3TCPA 3THBA 4PTEA 5IQFA 3KQ7A 1NVQA 5HO7A 4GU9A 4J99A 5BYLA 4F7JA 3EJ1A 4FNXA 4FGRA 3U87A 3RPYA 4L01A 4BBEA 3D14A 1LPUA 4ANQA 4IMYA 3GU7A 4FV8A 4O27B 3MTFA 2VWBA 3LFBA 4IAKA 1LP4A 3PIXA 4QMVA 4RVMA 5CY3A 4ZIMA 4CMUA 4CFVA 3UVQA 4AG8A 2WQEA 1QCFA 1OKWA 3KN5A 3FPQA 1SVGA 1DS5A 4FV7A 4CXAA 4C4JA 3MVMA 3QRJA 4RIYA 4BB4A 4E4XA 4N6ZA 3RZBA 5FG8A 3UVRA 3FPMA 1DI8A 2X4FA 3H0YA 3UPZA 2WNTA 3VN9A 4CNHA 2XK7A 2VN9A 3TTJA 5CEOA 4J96A 2R2PA 2PVHA 2P0CA 3B8RA 4IX3A 3IDBA 4L00A 3BYVA 5CEQA 4BCKA 1YXUA 5BMSA 5H3QA 3UIUA 1ZY4A 3BPRA 4FTUA 2W5AA 3DNEA 2YHVA 4G3GA 3HV3A 1GNGA 5TKDA 4BF2A 1WMKA 5AR2A 2WEIA 4ZTQA 4BHNA 3Q9XA 3VNTA 4BBFA 2XVDA 5E8WA 1GJOA 4DGOA 4UMRA 3HAVA 3ORLA 4FZ6A 3LMGA 3BWJA 1GZKA 3QD3A 1ZYDA 5AA9A 5FGKA 4U44A 1Q24A 2HZ0A 3RMFA 3IDCA 3D5XA 1Q62A 3MY5A 5TR6A 4I94A 4B8MA 4JX3A 5IQHA 4G9RA 5EM6A 2ITWA 5DHJA 4OTWA 2XJ2A 3S4QA 4UMTA 3VWAA 3G51A 1YOLA 2VO0A 1R0EA 2VWXA 3U4WA 4CEGA 3HUCA 1M14A 3BGPA 1JSVA 3ZZWA 4ZSGA 1JSUA 1R78A 4MBJA 2HZ4A 4KWPA 4DEIA 2JDTA 2PVNA 2RL5A 3UG1A 4D0WA 1E9HA 5LMBA 3S1HA 4E4LA 1BMKA 1SVEA 2OF4A 4PP9A 3FI3A 4QNYA 5AUWA 3WE8A 5F20A 3OS3A 3V5WA 1G3NA 4F6UA 4HYHA 4DLJA 4BICA 4UYNA 5EK7A 4XV1A 1TQPA 3QZGA 3QXOA 3E7OA 5ETCA 3UZRA 3TNHA 3F82A 4NFMA 3GFWA 1O6YA 4PMTA 3VF9A 4CYIA 5IQAA 4LQMA 5DLSA 1H27A 5D12A 5DWRA 4D9UA 3U54A 5ANOA 5A4TA 3VVHA 4FC0A 2HK5A 4ZMEA 4A4OA 1RJBA 3KFAA 3SRVA 4MD8E 1KOBA 2C6MA 5JFXA 4YHTA 4JAIA 5JFWA 4QQCA 4YJQA 2ZM3A 2HENA 2JEDA 2V0DA 2W1EA 1SZMA 3MFSA 4RX7A 4UMPA 4TY1A 4YJNA 2XKFA 2OICA 5AV3A 1YVJA 3HV6A 3R9NA 4FVQA 4DCEA 3FJQE 4NT4A 1M52A 1OL6A 4L7SA 1GZOA 5IDPA 4FIHA 2W1GA 4MNEB 3JXWA 3KU2A 4NIFB 4C57A 1Q8UA 1RW8A 4K77A 5CU6A 1ZYLA 2OZAB 4A4XA 4YR8A 4GSBA 2QKRA 4RGJA 5G1XA 2Z8CA 5HIBA 4MXZA 3NUXA 5AJQA 4UYAA 3R00A 3PG1A 4PL3A 4ZLZA 3HRFA 1XWSA 2VUWA 3NAXA 1MP8A 3NNWA 4FSQA 5ETAA 2XJ0A 3PLAE 3KKVA 4RRVA 2XK3A 3ZS5A 1GY3A 1H01A 4C4HA 4B7TA 4CMTA 2C6KA 4BYIA 2J0KA 5GJGA 3D2IA 4RJ3A 3LXPA 3C4EA 4GV1A 3F3ZA 4FV5A 4PDOA 5G6VA 4FT9A 4IFGA 4X2KA 5BVWA 5HQ0A 4RIXB 4OW8A 2PSQA 2QHNA 4LMUA 5IUIA 4B0GA 4D5KA 1BKXA 4XLIA 1KV1A 3W8LA 4EBWA 4IWDA 4ZSAA 4YTFA 3QF9A 1PXPA 1H1WA 2C47A 3KMWA 4LL5A 3W55A 3T9IA 2HIWA 3ULIA 2XF0A 3VBWA 3CKWA 2C0OA 3ODYX 3V8SA 4DAWA 4CFFA 4L52A 3EH9A 3RAWA 5T68A 5D7AA 2IW6A 5AM6A 3RWPA 3VAPA 3RVGA 4W4YA 3FLYA 4YBKA 3QC4A 5IQGA 3SV0A 4FTOA 5DT3A 3RAIA 3WI6A 3PG3A 1H1PA 1IA8A 3DPKA 3F2NA 3F5PA 4TPTA 4DEBA 3A7FA 5AV4A 5EI2A 3UBDA 2PULA 4UBAA 3PFQA 4FT0A 4UMQA 3P9JA 4FEQA 4BIEA 3KXGA 2RFDA 3ZRKA 4UY9A 2LAVA 2XK8A 4JIKA 3QUDA 4OR5A 3A7IA 4J97A 3R8VA 4I21A 4ZAUA 4KABA 3EN5A 4G3EA 4IB3A 4E6CA 3HDMA 4I24A 4ZLYA 1WBSA 3O23A 3KL8A 3QTZA 2CSNA 3PY0A 4CVAA 5J79A 3OCBA 2ZV2A 4EHZA 4BCGA 5JN2A 3ZDIA 1Q41A 3KXXA 4M7IA 3MW1A 5BVEA 4KINA 5L2TA 4HCUA 5CQUA 3BHTA 2VTNA 3ZRLA 2HW7A 5JEBA 5AWMA 4ACGA 1PF8A 2P2IA 5CVHA 3QQKA 2Y4PA 4D2RA 4DN5A 4JAJA 2AUHA 5DG5A 4YUQA 3BELA 3S0OA 2JC6A 5HTIA 4KIKB 4WNOA 4ASXA 4QMLA 5HCZA 1ZRZA 3ZZEA 4BFMA 4K0YA 1KUTA 3HA6A 4R7IA 1U4DA 3MVJA 2EVAA 4I6BA 4IC7A 4ACDA 3KXHA 2Y6MA 4P5QA 4G6LA 4TTHB 4W9WA 3D7TB 4R5SA 3GU8A 5CEPA 3IQ7A 3R28A 4FKJA 5IUGA 1WZYA 3F3TA 3WYXA 2ZV7A 3C4WA 3EFWA 5KHWA 1PRYA 4ITJA 2DUVA 2QU5A 2RIOA 3KRLA 4QTAA 4MKCA 3VS0A 2QC6A 3VS5A 4PPBA 4KAOA 4FTKA 2GFSA 3AOXA 3CD8A 4FTIA 2OKRA 4TNDA 3PP1A 5C27A 4RJ6A 4GK3A 4K33A 3MYGA 3KK9A 3UMXA 2X7OA 4UMUA 4EH9A 3FMDA 3F6XA 4HPTE 1M2RA 4JLCA 2PY3A 5EYCA 1TKIA 4RX8A 1YHSA 2AYPA 2GTNA 2PHKA 4FZAB 3VUDA 3ZO1A 5JSMA 3VBTA 4BCIA 1U5QA 5CAQA 1TQIA 2QOBA 2UUEA 2X39A 4XP0A 4AGWA 5HORA 1J3HA 3V04A 2B9JA 2DS1A 4GT5A 2GHGA 2VX3A 3F5XA 5DR9A 1IASA 3EQDA 5D10A 4D2WA 5EQYA 2QO7A 3QQUA 2VTAA 5HD4A 1SMHA 2R3NA 4YNOA 4FIIA 4R7HA 2H9VA 3LHJA 2V55A 3GOPA 3KXMA 2E9OA 3EFLA 2VU3A 4NCTC 4DT8A 4GJ3A 1YI4A 4IAZA 2C6LA 2OH0E 2CHLA 2G9XA 5HGIA 4E8AA 2OF2A 3VHKA 3PIYA 2ZMDA 4F0GA 1AGWA 1ZZ2A 5L4QA 5DNRA 4HZRA 3B8QA 4EWQA 2O64A 4ERWA 1OUKA 4X2GA 3TL8A 2GNJA 3NNVA 1PXLA 3KGAA 4QTBA 3BU5A 2B53A 3U6HA 1V0PA 2IO6A 1WCCA 2ZDTA 4D2SA 4ITHA 3KY2A 2B9FA 3D2KA 3DKGA 4MXOA 5KMNA 4UX9A 3PDTA 5AAGA 4O7ZA 1G5SA 3NW5A 4FT7A 4I22A 3OEFX 4GJ2A 2NRYA 2ONLA 4TYEA 3VF8A 4FKTA 4CV8A 5HE0A 2GTMA 3PVBA 4W8EA 4GYGA 2PZRA 3DOGA 1IAHA 5FEEA 4KIPA 4BIDA 4QMSA 2JIIA 3DDQA 3LMIA 4CTBA 3ZMMA 5CF5A 2O63A 2YM3A 1ZAOA 1EH4A 3FY0A 1IA9A 3BKBA 3E7VA 4WA9A 4YC8A 2OJIA 3PJ8A 2J90A 4YSMA 5I9XA 4YTHA 4F4PA 2J0IA 3COKA 3I5ZA 4GRBA 4RIOA 4AOTA 5K0XA 5DH3A 4G6OA 2YWVA 2SRCA 1REKA 4IJPA 4DG3E 5E8SA 4FMQA 1A9UA 3NX8A 4F0FA 4KB8A 4E93A 1CM8A 3KA0A 4X3FC 2BRBA 1YOMA 4TZRA 3TN8A 3ALOA 5CSHA 2VRXA 4DFXE 5A54A 1Q3WA 1ZOEA 3MPAA 4RMZA 4TNBA 3WILA 4NTSA 5L8JA 3ZO3A 4JS8A 3W1FA 4Z7GA 4F99A 4BCHA 2WTCA 3S2PA 4GFMA 2NNWB 3ZEPA 4FVRA 2I6LA 4GS6A 4PV0A 5J9YA 4HVDA 4EH8A 4CGAA 1HOWA 5KE0A 3FZTA 4L3JA 5CXHA 3WOWA 3CP9A 2YZLA 2VTHA 4JVGA 4FUYA 5I9WA 4DFBA 2XRUA 3UDBA 5HEZA 4HGSA 3C5IA 1AQ1A 2IZRA 3V8TA 3QXPA 4D1XA 3TZ9A 2X81A 3FMLA 4L67A 1STCE 1ZWSA 3Q5ZA 4PPCA 1NW1A 4BDEA 2OG8A 3HDNA 4KD1A 3FZPA 5ANEA 2BHEA 2E9UA 2PMNX 2QLUA 1J7LA 3NVKI 4D1SA 4HJOA 3UOKA 4FL3A 4NTTA 4BGHA 4RLKA 4YJSA 4EKKA 2J0JA 2OXYA 2X4ZA 3VUTA 4WO5A 4CSVA 3H0ZA 3TI1A 4EH5A 3PVWA 3T3VA 1OIQA 4NM5A 2JBOA 4AFEA 3QRKA 5CYIA 5M4UA 3LKMA 3MWUA 4I0RA 3BX5A 4LOQA 1VEBA 4RC2A 2QQ7A 2A2AA 2Y0AA 4O0RA 4I6FA 5AP2A 4DTBA 2YACA 5FXRA 4IVCA 3KRRA 2PE2A 2XBAA 1WBWA 4FTRA 4FUXA 1XJDA 1PXOA 2Y4IC 5JMSA 2RF9A 2OBJA 4NYEA 1UNGA 3MSSA 1Y6AA 3ELJA 3PRFA 2F7XE 4XX9A 5CENA 5IA2A 1BL6A 3BIZA 3WZDA 3AC1A 5D7VA 4RVKA 1JKLA 3MVHA 4FG7A 5DA3A 5HD7A 3UZPA 4DEDA 3EB0A 4EWHA 1H8FA 1I44A 4IVBA 5K4JA 3FXXA 1BYGA 2ESMA 2HZNA 4N70A 5EM7A 1NT2A 4BDKA 3HVCA 4CT1A 4FV1A 3TUBA 4FEWA 3HA8A 4FTMA 2WTWA 3CQUA 2FSTX 5AIKA 3DTWA 2W1CA 3C4XA 5HNIX 4JRVA 3I1AA 2RFSA 3JPVA 3PJ2A 4PRJA 4GMYA 1OITA 1YXXA 4FZ7A 3RHKA 4YLKA 2WB8A 3CLYA 2R3PA 2W4KA 3W2PA 5HX6A 4APCA 5I9ZA 3TKIA 2WGJA 4M84A 2XMYA 2CPKE 4A9RA 4FYNA 4RWJA 5E1EA 4Z7HA 4USDA 5L2IA 3TKUA 3JY9A 1UNHA 2Z7LA 4K1BA 2ZVAA 5A4QA 5HVYA 5AR8A 3OOMA 3Q53A 4GK4A 3A7JA 4LRMA 4YZDA 3SD0A 4UWYA 3SXSA 5IH6A 3PVUA 4JI9A 4PY1A 4ZJJA 4FI1A 4EOIA 2OXXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GB2 A;  5D9H A;  3IW6 A;  4IM0 A;  4NW5 A;  4KNB A;  2AC5 A;  3KB7 A;  4O4D A;  4K11 A;  3Q32 A;  2OIQ A;  3DAJ A;  2J5E A;  4D4S A;  4X7Q A;  5C4L A;  1ZMU A;  4DFU A;  3B2W A;  4QYF A;  3Q9Y A;  1WBP A;  2BAL A;  2GQG A;  2RSV A;  3Q04 A;  3C5U A;  4OGR A;  3U4U A;  3ZSG A;  4BIB A;  3LLA A;  3PXZ A;  5HIE A;  3MIY A;  5HO8 A;  4NKS A;  4D28 A;  5M07 A;  4H39 A;  4Y46 A;  4RWL A;  5FBO A;  5IQB A;  5AAF A;  4CLJ A;  3BV3 A;  4CTC A;  4JDH A;  5AP0 A;  3R21 A;  3BWF A;  4LOO A;  4M69 B;  2HOG A;  3DAK A;  4E4N A;  3CTJ A;  2QHM A;  3QGW A;  3OMV A;  4MH7 A;  3V5P A;  4YJP A;  4HW7 A;  4O7T A;  4HZS A;  2DQ7 X;  3R7Y A;  3AGL A;  4EOM A;  4L68 A;  5CAS A;  5GNK A;  5EM8 A;  4EC8 A;  3MJ2 A;  2J9M A;  2KTY A;  2W9F B;  4B6L A;  2PVM A;  4YJO A;  1QPJ A;  5B0X A;  1WVY A;  3ZEW A;  4Y8D A;  1W7H A;  2ZDU A;  3B2T A;  4QPS A;  4FSW A;  4I93 A;  4S33 A;  2NP8 A;  4F6W A;  3D7T A;  3MPT A;  1JQH A;  4EK3 A;  5TF9 A;  3OEZ A;  3TAC A;  5AUZ A;  3KF4 A;  3DY7 A;  3ORK A;  5AV0 A;  5CAN A;  1JKK A; 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