2GFCA

Camp-dependent protein kinase pka catalytic subunit with pki-5-24
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
337
structure length
335
Chain Sequence
SVKEFLAKAKEDFLKKWENPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVKHMETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Bos taurus
publication title Structural Analysis of Protein Kinase A Mutants with Rho-kinase Inhibitor Specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase, alpha-catalytic subunit
total genus 109
structure length 335
sequence length 337
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2006-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2gfcA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2gfcA02
3DNDA 2W1DA 3PA4A 5J8IA 2UW3A 2C6TA 1ZZLA 3BI6A 4R7BA 4H3BA 4JVGA 2ITZA 4QOXA 3AMBA 4Z7GA 4NM3A 2JFMA 5A6NA 3UG1A 3TTJA 4QTAA 4RQVA 5CAPA 4NJ3A 3QCSA 2UZTA 4F08A 4GUBA 4E1ZA 4KUJA 4R78A 3LCTA 4HJOA 4LUEA 5LCJA 3RWQA 4U8ZA 3IO7A 4HNIA 5EW8A 2YCRA 2F2CB 2QOOA 4KB8A 4PPAA 4ZZMA 4BZOA 4D5KA 5KBRA 4K2RA 4JIKA 5FBOA 4YZ9A 3ZXTA 4LGDA 3LFCA 3L8VA 3N51A 2OXYA 2C6DA 3L8XA 4QMWA 1GZ8A 5DPVA 4EH2A 2YCFA 4YGAA 3Q5ZA 1ND4A 1BI8A 3JXWA 3R71A 4BDDA 3KGAA 2Z7LA 3CY2A 3MFRA 4FKGA 5JH6A 5JFXA 2DS1A 2XNMA 2Z8CA 4KIKA 4X3FB 4BDBA 5FWKK 1JVPP 4NT4A 3KQ7A 3FKOA 4FTLA 2UZVA 5AP0A 1W83A 3R7OA 1PMUA 2RFSA 3JS2A 3MIYA 4RQKA 5DYJA 4AA0A 2YIRA 4A4XA 3VF9A 3ENMA 5E8TA 4X6QC 4ACMA 3AOXA 4IJPA 5KO1A 4RZVA 5LOHA 3MH3A 5KKRC 4IZ7A 4ZK5A 3P5KA 1YXVA 2RKUA 5AM7A 3O51A 2FUMA 4PX6A 5DEWA 3MBLA 3UOKA 2GDOA 2WMAA 5EYDA 3KCKA 3GT8A 3EWHA 4MBJA 3DT1A 3LIJA 2PUPA 3OXZA 2OXXA 3HUCA 5C4LA 5ANDA 4X3FA 2QI8A 1JOWB 3FKLA 2W5HA 4XP2A 4C33A 1YWRA 5AP5A 4OUCA 1GIIA 1KOAA 3KXHA 5FLFA 4AGWA 2OW3A 5FD2A 4RFMA 2UZEA 3OCSA 5EW3A 4AOIA 3U87A 3JR1A 2QLQA 4U40A 2OZAB 4Y83A 3BWFA 2CGUA 4BCFA 4FA2A 2PMLX 4Z16A 3AG9A 4QRCA 4C3RA 3BPRA 1H07A 4J7BA 1Y6BA 4OTFA 4ZP5A 5BMSA 2PVMA 1KSWA 3BGQA 4RX5A 5CU0A 4O38A 4EHEA 2BDWA 2Z7QA 1MRVA 5IDNA 5GZ9A 4RJ7A 3QGYA 3GC8A 3U4UA 3WZEA 4D2RA 2OJIA 2C0OA 3REPA 3FY0A 3VS6A 5M51A 1YRPA 4IWQA 5JSMA 5CSWA 2QNJA 4FC0A 5IA3A 3U6HA 3GXLA 3TN8A 5HU3A 2KTYA 3FZPA 3OROA 3ORLA 3I79A 5C9CA 4YZMA 4C02A 1H08A 2NNWB 4L46A 1OBDA 2XK6A 2OZAA 2C6LA 3F7ZA 3GOKA 3LHJA 3N9XA 4FSWA 4YHTA 2QG7A 4EUTA 2NRYA 1O9UA 3D9VA 5IZFA 4D1SA 5DI1A 1RJBA 3AMAA 3MA3A 3ZLXA 2NPQA 1H27A 3S2PA 3QLFA 2JDSA 5A46A 4EJNA 3LAUA 4CV9A 5TT7A 2QR8A 2OBJA 4EZ5A 1Q62A 5IA4A 1YXUA 5HBEA 3V3VA 3HECA 1JPAA 2J0IA 3S0OA 2QURA 5ANOA 3TZ9A 4TWOA 4C0TA 3D2KA 4M66A 3OF0A 3IDPA 2X8IA 3UVRA 3ZSGA 1ZZ2A 2GNJA 3G9NA 4A4OA 3H10A 4H3PA 2J5FA 4TWCA 4ANBA 3PPKA 4FICA 2HOGA 1UNGA 4QMTA 2XBJA 2I1MA 1PMVA 3EKNA 3QL8A 4J52A 3D94A 5IMEA 2OFUA 5IF1A 4AAAA 4IX5A 4BBMA 4ANSA 4MXXA 2Y4PA 4EL9A 3GNIB 4X6RA 5LMKA 4O7NA 4DEBA 3W16A 2VO7A 2HAKA 5CF4A 2PUIA 4NH1A 4O7YA 1Y57A 4PL3A 3TDWA 2ZV8A 3VBYA 2J90A 3P0MA 4YJTA 4QMMA 4QP6A 4WKQA 2Y6MA 2HYYA 1Y8YA 4MK0A 5FTQA 4YJRA 3ZMMA 3AT3A 4QP7A 3GCPA 3BEAA 2W0JA 3HKOA 4FI1A 1O6LA 4GUEA 4FV4A 1YDRE 4I23A 4O2PA 3R9NA 4DEIA 4IM0A 1H26A 3UO6A 1APME 5EM7A 5DFPA 3E87A 3RP9A 3JPVA 4NFMA 3KK8A 4XV2A 4FZDB 4JBVA 4ZS4A 2X39A 4NTSA 4ZMEA 5JKGA 5KHXA 2RGPA 1RDQE 3Q9XA 5DN3A 2UW0A 4ZAUA 5FM2A 2VTOA 3IOPA 3PFQA 2XNGA 1YOJA 2Q0NA 4O96A 5HTIA 5FTOA 4OTIA 3VWAA 4N70A 3TNHA 2SRCA 1CMKE 4ZMFA 4PMSA 4IWDA 4I22A 2ZMCA 1M52A 1TQPA 2IWIA 4YZBA 2ITPA 1YWVA 4C36A 3KN5A 4E4LA 5CEKA 5HORA 5EQPA 1VYZA 1YXSA 2G9XA 4FKQA 3PG1A 4QMPA 3I7CA 1KE9A 3O23A 3TJCA 1XKKA 2BZJA 2C3KA 3UC3A 2Y9QA 2C6KA 4U5JA 4AF3A 1JSVA 4RLKA 4EC9A 5CZIA 4QMVA 4EZ7A 4ITHA 4F99A 2PULA 3KXMA 3PP1A 4IAAA 4NW6A 3ET7A 2BALA 3L9NA 4QP1A 3QCYA 4JRNA 2RFDA 4CTCA 4DGNA 4EORA 5AAEA 2WTDA 3NYXA 4IWOA 4YJOA 4BCOA 3DAEA 4PTEA 3DDQA 1ZOHA 4O0WA 4FR4A 4MBLA 4R7HA 5DEYA 4OGRA 5F4NA 2UW5A 4LOPA 2W7XA 4QTCA 5ETCA 4OTHA 3EYHA 3ANQA 5AUYA 3P7BA 4PMPA 3PJ3A 3E93A 4FX3A 4Z3VA 2V55A 1OPJA 2J0JA 4U6RA 2YWVA 2I7QA 3COKA 4W8DA 3OW4A 5AUUA 3VS7A 4TYGA 3DLZA 3SDJA 3VO3A 5KNJA 1BYGA 3C0IA 2YFXA 2P2IA 2VTNA 4YZDA 5AUZA 2JLDA 5JT2A 5HD7A 4AUAA 4KABA 4IB5A 3QRJA 3TZ7A 2J9MA 1XQZA 4FSQA 5HVYA 4ZSAA 5CQUA 3GGFA 5FRIA 5KE0A 3ZO4A 4BTMA 3ZCLA 1MRUA 5KUPA 4BCKA 3A99A 2UW8A 4BIEA 3DQXA 3HDMA 2Y7JA 4FKUA 4GS6A 3UODA 3W2SA 2WTKB 2C5XA 3ULZA 2W96B 5ETAA 1F0QA 3KEXA 2C3IB 4XBUA 3T3VA 5KX8A 3QD0A 4IMYA 4OBOA 1PXPA 3JY9A 1BMKA 1IASA 3D5UA 3SXFA 5E90A 2RFEA 3NX8A 4O7SA 3PJ8A 4ASXA 1Q8WA 3CJGA 3MVHA 4CZTA 5KMLA 2BRMA 3E8NA 4QYGA 2WU6A 3FAAA 5IQFA 3E64A 3KF7A 1URWA 2X9EA 4ALWA 3O96A 5C8MA 3ZUUA 5BUIA 5EG3A 3U9NA 4ZLZA 1OPLA 3Q4ZA 4FSRA 3NYOA 4CLIA 4FEWA 4BTJA 3VF8A 2XM9A 4M13A 2P55A 1S9JA 3THBA 5BVNA 2BTRA 3TACA 1VYWA 3SW7A 4IX3A 4G5PA 3LFBA 4QP9A 5C27A 3DJ6A 3QTSA 4U44A 4F64A 4BCJA 2JAVA 3CP9A 3EKKA 2JDTA 1SVHA 5C4KA 2DUVA 5JRQA 4NIFB 4IAYA 2YAAA 5EYKA 3P79A 3LFAA 2ERZE 1JQHA 1J7IA 3DTWA 4AZSA 4DEGA 4O0SA 4E3CA 5HE1A 4GFOA 5JEBA 2QOHA 4AS0A 2X8EA 4FODA 3LLTA 3DPKA 3H0YA 5J9LA 3I60A 2ZB0A 3SGCA 4IANA 1JSUA 4QMUA 3QYZA 4M84A 5B0XA 4RIWA 4K18A 1Q3WA 3DB8A 4KNBA 4MD9E 4RWKA 1Y6AA 1YOMA 2YLEA 2VTTA 4YJPA 4CFWA 4FTJA 3HGKA 3TNWA 4FIIA 4FNXA 2WTCA 1Q24A 4FV0A 2OF4A 5T68A 3TI1A 5A4EA 5AX9A 3QU0A 3Q2MA 1IAHA 2ITTA 3BWJA 1REJA 1OECA 4UX9A 5C26A 4KAOA 4DH8A 4BHNA 2PE1A 4UYAA 4YSMA 5J7HA 1GZNA 2A0CX 4GJ3A 2W1CA 4O1OA 4TWPA 3U4WA 2WKMA 2YM7A 3ZM9A 3OY1A 3ZDIA 3R7EA 5IEXA 2FB8A 2Z02A 4KRDA 4WD5A 3EQDA 2P0CA 5HTBA 3DFCB 2PZRA 4NM5A 2GS7A 3MPMA 3UYTA 2X0GA 3GOPA 2GPHA 3MDYA 4L67A 4DG2E 3H9OA 1VZOA 4O0RA 4OBQA 4L68A 2WMQA 4FKWA 5DBXA 4YMJA 2WAJA 1BX6A 3SW4A 2WB8A 3IQ7A 5CSXA 4TNBA 4FV2A 3Q9YA 4DFBA 5HNGA 5AP4A 2VO0A 4DGGA 4E73A 4BY9E 3Q96A 5H8GA 4F7SA 1K9AA 2CDZA 3BHUA 3FMHA 3HVCA 3GC9A 3OEFX 4V05A 3EN7A 4JQ7A 4RC2A 3R9RA 2QO2A 1H0WA 2OKRA 2PWLA 4NK9A 5L8JA 3N4VA 4KA3A 1XH6A 3NUUA 4FTIA 4CKIA 1Q97A 3FZOA 4EOMA 3ZS5A 2X81A 3TUBA 4CMUA 4YZNA 5B2MA 4FTCA 5L6OA 5JFVA 3V8SA 1F5QA 3FE3A 1WMKA 1KV1A 3SXRA 4DLJA 3IW8A 2JAMA 3P9JA 4FK6A 4O6LA 3VRYA 4D9UA 4A9YA 5CI6A 3RK5A 3PXFA 1UKIA 1DM2A 4I20A 3AC2A 1P2AA 3GI3A 1IRKA 3ULIA 2P2HA 2UZLA 2JDVA 2X4ZA 4EOOA 1ZYCA 4F9AA 3CR0A 3PXYA 5EH0A 2FO0A 3MIAA 4KD1A 3RGFA 1X8BA 3EFKA 4BGQA 3M1SA 2H6DA 3V04A 3SG8A 3O50A 1PY5A 4CFMA 4HPTE 4FVPA 1ZOEA 3CY3A 3DY7A 4HOKA 2R0IA 4IDVA 4CZUA 5E8VA 4CT1A 4TRLA 2R3GA 2QO9A 4FTMA 4FUYA 3CGOA 2PZPA 3NEWA 5HBHA 4YSJA 4L01A 3NUAA 5IQAA 3FMDA 2C1BA 1QCFA 4HYHA 4OTPA 4BFMA 1NY3A 4XG8A 4TZRA 5I0BA 3PY3A 2XYUA 2O5KA 3Q5IA 3QAME 4QYEA 3VC4A 2QC6A 3LXNA 4NKSA 4YNEA 5ANJA 3ZO1A 4K6ZA 3NLBA 4U42A 4YJSA 5CWZA 1EH4A 4FV3A 3FI4A 5D10A 2BMCA 2XS0A 2ZAZA 3V6RA 3QTXA 1LEWA 4IWPA 4RWIA 3VUIA 2WIHA 2QOKA 2YDJA 3UMWA 1U5QA 5AR7A 3FEGA 3UDBA 1IEPA 2XIKA 1ATPE 1OM1A 3CPBA 5HICA 3SD0A 5HIBA 5I9WA 2R3NA 4FG8A 2VTLA 4IQ6A 3BLHA 4R1VA 3RAWA 5HLPA 3OBJA 3DLSA 3C4FA 3EZRA 4H58A 2J7TA 4CFNA 4XS2A 4CZYB 3U6JA 3DAJA 3POOA 3G51A 1R0EA 1AD5A 4U79A 3ACJA 3V6SA 4E6CA 4UWBA 4AW2A 3WF9A 5CT0A 4ZJIA 3RALA 1NXKA 3NPCA 4XCUA 2B52A 3G6GA 4E6AA 5AEPA 3PPZA 5A3XA 4PV0A 1URCA 4K0YA 2VWXA 3HUBA 3D2IA 4MQ1A 2VWIA 3TKUA 5G1XA 4FKPA 4R5SA 3ZO3A 2CSNA 3UP7A 3CQEA 2W1FA 3R30A 4E5WA 1YXXA 4C61A 4EHVA 4BCNA 4EYJA 2EWAA 4RPVA 5LWNA 2QOQA 2BIKB 3C4XA 3ROCA 2GU8A 4I6HA 2QU6A 4HGTA 2GNLA 5IQIA 3LQ8A 3KC3A 3TXOA 3P23A 3MH0A 2FVDA 3WYXA 4BI2A 1QPCA 1M2RA 3NMUF 4IM3A 2C30A 2HZ4A 3PVUA 5H9BA 4O86A 3FLYA 2Z60A 2PTKA 2W06A 3HYHA 4ITJA 5EM5A 1Q8UA 4PPCA 1YDTE 2H9VA 3R04A 4A9UA 2YISA 3K2LA 4ORKA 4R8QA 4FKJA 3ELJA 5L6PA 3C5UA 3GC0A 4MF1A 4UB7A 1YWNA 2PK9A 4I4FA 1T46A 3OWJA 5FEQA 1WBPA 3A2CA 3KK9A 4AZVA 3EB0A 3T9TA 4BGHA 4CYIA 3QX4A 3W55A 4AZEA 3IECA 4S33A 4FOCA 4A9RA 2BROA 2QOLA 5ANEA 1IA9A 2QKWB 3CQUA 4Y73A 3EN5A 3EJ1A 2BPMA 4L42A 5HG9A 4APPA 5AAGA 3R1QA 2CGXA 4ACGA 3PXZA 2YJRA 3MY1A 2EUFB 1FVRA 2OWBA 3BHHA 2WMVA 3Q4UA 4QMQA 2UZBA 4I41A 3BU3A 1BKXA 3CD3A 3R7GA 5FXSA 3FC1X 3F5UA 3HZTA 5IA5A 3TJDA 1ZMWA 2PVFA 3HRFA 3LM5A 1U54B 2QCSA 3C50A 3QTIA 4LYNA 5CNOA 5E91A 4ZTLA 4EOIA 4EK6A 3IKAA 4K33A 4ONAA 3VUHA 3A61A 4U7ZA 2WMTA 2W99B 5DT4A 2XCKA 3OXTA 4WSQA 5AA9A 4RJ3A 1F3MC 2O0UA 2XEZA 3CQWA 3DXNA 3FZSA 4TL0A 3GFWA 4HZRA 4LL0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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