2J2IB

Crystal structure of the humab pim1 in complex with ly333531
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIGGQVFFRQRVSSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A systematic interaction map of validated kinase inhibitors with Ser/Thr kinases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTO-ONCOGENE SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE PIM-1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 273
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2006-08-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2j2iB02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2j2iB01
3BQRA 5DR6A 3R00A 4D1ZA 2C6DA 3ORZA 3REPA 5J1WA 2PVRA 4YJNA 4EK6A 5DWRA 4LG4A 3CGOA 2CN8A 3ALOA 3DKOA 2J5EA 4FV2A 3HV7A 2BKZA 3BYMA 4KIKB 4OGRA 5BUEA 4U40A 3LKMA 4CT1A 3M42A 5CU3A 4JR7A 4X6RA 2CKOA 3COKA 2ITVA 3OTUA 4DFXE 4ZS4A 3G15A 4LOQA 3PFQA 2XNNA 4X3FA 5KO1A 4S2ZA 4RMZA 4CT2A 4B4LA 3HA6A 5EQPA 1WZYA 4XOZA 3SG9A 4O2PA 4F0GA 5KMIA 4FYNA 2R3LA 4MBLA 1VZOA 3PA5A 5ANGA 5IG1A 2B9HA 3IK3A 4IMYA 4F1OA 5AWMA 3NW7A 5FGKA 2YM8A 4ACGA 3EQBA 3QRJA 1WBNA 2VN9A 4BCNA 5KKRC 2XK9A 2YAKA 4O0TA 3P86A 4AZVA 4HNFA 4RT7A 2XYNA 4PPCA 5CEIA 4PDYA 3KGAA 1SVEA 3V8TA 3FMJA 5GJGA 4FKTA 4QMWA 4FZAB 3ZDIA 4BBFA 5DRDA 2BVAA 4ID7A 4LOPA 3IGGA 2LGCA 1M2PA 3LLAA 1UU7A 4D4RA 2HIWA 3OMVA 4I0RA 1T46A 4C4GA 4CNHA 4BKYA 2XP2A 4W4VA 4CV9A 3BRBA 5ICPA 4RIYA 4FEVA 1BKXA 3QTSA 3R01A 2OW3A 3C51A 3MV5A 4O96A 3A7IA 3QALE 3VHKA 5IQGA 3R9OA 3IOKA 5L2IA 3UIXA 2FSOX 4QP1A 4YTIA 4BGHA 2UZDA 4JIKA 5AA8A 1OIQA 4FKGA 4IFGA 4O0SA 4QP8A 3NNVA 5I9ZA 4ALWA 3R7VA 3LCDA 5C8MA 3VRZA 4UMRA 4EH6A 3QL8A 4NT4A 1PXMA 3ZFYA 4YTFA 3EH9A 5KZ0A 1OL5A 1PJKA 4FBXA 3PY0A 1Q97A 5JMSA 3PXZA 4ZJIA 2ITYA 3VW8A 4BVUA 4CQGA 1BI7A 4RIYB 4C0TA 3PXYA 4FZDB 2C6EA 4F9BA 2HXLA 2SRCA 3ZS5A 2PHKA 3EFKA 4UZDA 2OJGA 5BYYA 3KMUA 5EK7A 3FJQE 2BRHA 4I94A 3LE6A 4FKPA 5E8VA 4AN3A 4ZY4A 3R30A 4DGGA 1DI8A 1XBAA 3PYYA 4GCJA 5E8SA 5A4LA 4I0SA 4XJ0A 2OXXA 3FQSA 4F7JA 4GT5A 4IAKA 1ZARA 5BYLA 4DT9A 1Q8WA 3JYAA 3M11A 2GNFA 2XK6A 2GFCA 3N4TA 4BWPA 3Q96A 3RCJA 2BHEA 2NP8A 3C0HA 2O0UA 2QOKA 4EOIA 2JDOA 2BTRA 3L9LA 4G2FA 1WAKA 5I9WA 2YZLA 2V7AA 3PPKA 1A9UA 4GIHA 2EB3A 3R1QA 2OH4A 3HECA 2UV2A 3MGYA 2ZV2A 3MW1A 3I5ZA 3WZEA 3IONA 4QYFA 3UOKA 4UB7A 4ZXTA 3II5A 5CSXA 4E8AA 4AU8A 4JBQA 5FEDA 3W33A 3UYSA 1YXSA 4R77A 4Z55A 4GJ3A 5FM2A 2B9IA 4M66A 4AE9A 4UMTA 3U6HA 4ZJVA 2PZIA 2X4FA 3F2AA 4WSYA 2KTYA 3TG1A 3OY3A 3AMYA 5A54A 3G9LX 2HZIA 4IZ5A 4MAOA 4IIRA 1H00A 4L67A 4UBAA 3CEKA 5HG5A 3TT0A 4FTOA 4I5CA 4QT1A 5IA0A 3L8VA 3VWAA 3AD6A 3TZ9A 5D7VA 3KN6A 5JK3A 4HVSA 5ANDA 1Q5KA 2OJ9A 4IX4A 3VUTA 4GUBA 1HCLA 5A46A 4S31A 2A2AA 3F3VA 3IW4A 4OTPA 2XIKA 2XK3A 4RZVA 2VUWA 1OI9A 1R1WA 3TNQB 4QMMA 4Z7GA 4E6DA 5M4FA 4AP7A 5E1EA 4A06A 3O8PA 1E1VA 4FOBA 3NNUA 5KZIA 3W1FA 4W4XA 2GNIA 3MIYA 3UTOA 5L6PA 2QO7A 2ACXA 4C61A 3GCSA 3C1XA 1M7NA 5CWZA 2HELA 2IW9A 4XV3A 1W98A 5AV3A 3QA8A 3FSFA 5DVRA 3HEGA 3OTVA 1I44A 3PZHA 5CQWA 3TL8A 1DS5A 4USDA 3TV7A 4DE4A 3OEZA 3PG3A 3BEGA 4Z9LA 2BIYA 3OWPA 4R5SA 4KIPA 4U7ZA 5BMSA 3T3UA 3TUCA 3D4QA 4NYEA 4EQMA 1QPEA 3GI3A 3NYOA 2J0LA 3Q6UA 3R28A 3FE3A 1J7IA 1YRPA 5HNBA 1TQMA 2FYSA 2QHMA 3FZPA 4TNBA 3Q5IA 4H1JA 2W4OA 3LXKA 4L42A 4R1VA 4A7CA 1W83A 4DFBA 5CVHA 3UO6A 4KKHA 4K33A 1UU9A 5FXSA 3D83A 5HVYA 3UBDA 1OPKA 4FA2A 4ZLYA 1U54A 1J1BA 3BELA 4I4FA 4EZ7A 4O86A 3ZLWA 2HW7A 4BCFA 1XH6A 3FXWA 3HDNA 3CS9A 2WOTA 3QRKA 5AA9A 4ORKA 4IWPA 3TJCA 1OB3A 2W17A 4IAZA 2YCFA 1ZYCA 2P2HA 2YIYA 4JBPA 4JDKA 5E8UA 3UG2A 5IA4A 4G6OA 1ATPE 2PMLX 3MFTA 2VWYA 3PY1A 2GQSA 4IXPA 3BZ3A 2GCDA 4FV5A 2PUPA 2J50A 2X6DA 4LGGA 4CSVA 5TE0A 1ND4A 3KN5A 3C5UA 3RNIA 4Y46A 4ZZNA 2YWVA 3P4KA 4M69A 4QPMA 3PXKA 4Z16A 3BLQA 3MJ1A 2Z7LA 4BTKA 2A0CX 3ACJA 4M13A 1BLXA 4QMTA 4ANNA 1K9AA 4GYGA 3R1SA 4C3FA 5EI2A 3E5AA 1A06A 2C69A 4K0YA 4E5BA 4E4LA 3LFNA 3WBLA 4RJ7A 1WVWA 2ITNA 5H8BA 3V5TA 4H39A 5ETCA 4BR3A 2IJMA 2UUEA 4KBAA 4YNEA 3RPOA 4C4EA 3F5UA 3FI8A 2UZUE 1GJOA 4HGLA 4U8ZA 3TZ8A 2JEDA 5L2TA 5HTBA 2GNHA 5M4IA 5IQFA 2VWXA 4NUSA 4IE9A 1Z57A 4JVGA 3HL7A 4M69B 5E90A 3OS3A 4K1BA 4DHFA 4MD7E 4FKLA 2FSLX 2I1MA 3KK8A 3Q3BA 2B9JA 2IVSA 4CZTA 4F99A 4E4XA 3CPBA 3F61A 2FO0A 3O7LB 2OZAA 2BFYA 3B8QA 4O22A 3F6XA 1YHVA 4UYAA 5AP3A 3TNHA 4WNMA 2PPQA 4KBKA 3E3BX 2C6LA 3FV8A 1KV1A 1YOJA 1O6KA 4J99A 4I23A 2QU6A 4V01A 2AYPA 3UMXA 1V0BA 4F4PA 3TXOA 4BDIA 4D4YA 3OBJA 4MXXA 4ANMA 4BCJA 2GS7A 4FSZA 3ZRMA 1ERKA 1XJDA 4XBUA 1KUTA 2V0DA 2YIRA 3NYVA 4FG7A 4QMUA 5DNRA 5HVJA 3FLWA 5M4CA 4L6QA 5I9XA 3U54A 3K54A 1SNUA 1W8CA 1M17A 3RWQA 4FSWA 2VWBA 4FTAA 3AQVA 4EJNA 2ZB0A 5KHXA 2BAKA 2GFSA 4OTQA 3R0TA 4OTGA 1WCCA 2JDRA 4RVMA 4AN9A 1IAHA 2RL5A 5LOHA 2W99B 3G2FA 3ANQA 2C3JA 3GB2A 5A9UA 3F2NA 4AF3A 5DPVA 5IQBA 3D2IA 3NW5A 4YPDA 2BPMA 2WMTA 3QRTA 4O1PA 4G17A 3B8RA 2C5NA 1QPCA 4FTJA 1XH5A 1U59A 4GRBA 3KMWA 4RFYA 4I22A 3BYOA 3Q4CA 4B99A 5K4JA 3MFUA 3OXZA 5C27A 1JSVA 5HZNA 3KXNA 4LI5A 3P7AA 1F3MC 2VZ6A 1YKRA 1GAGA 4I6BA 3JUHA 3BIZA 4DAWA 3V8SA 3SXRA 3MDYA 3OT8A 2PVHA 3HV4A 3LFCA 2X39A 2C3KA 4U43A 5LXMA 4AG8A 5I0BA 5AV0A 2FB8A 3LJ2A 2GMXA 4I21A 4XEYA 4AN2A 1QCFA 2WFYA 4IHPA 5BNJA 5LWMA 5FDXA 3L8XA 3QX4A 4QMOA 3UPZA 5AR5A 4TW9A 2YAAA 5LQFA 3I79A 5AR4A 4UWCA 4F6SA 4HVGA 3ZBFA 4UXQA 3UC4A 4V05A 4M0YA 1URCA 2QQ7A 4QQTA 1YWRA 3V3VA 2HZ4A 1WVYA 4KRDA 5HCZA 4QP2A 4EOPA 3RCDA 3P78A 4EHVA 2CNQA 4WNKA 1CMKE 3EN7A 3KULA 4E6QA 3FKLA 3KXHA 3HMPA 4DEHA 1H1QA 2YITA 4FKUA 5DT4A 1K2PA 3BYUA 5LARA 4FVPA 2CLXA 3UO4A 4QD6A 3MN3A 5EI8A 4D2WA 4F1MA 2YZAA 4IWQA 3ZUUA 4H05A 3Q5ZA 5EW3A 3VS3A 3A99A 3H0ZA 3ZBXA 3QQGA 5AMNA 5KMLA 4MXYA 3A4OX 5K3YA 5GJFA 3AC8A 1W82A 3RAKA 3SDJA 4EH5A 2VRXA 3Q2JA 3WOWA 3ZO2A 3E8NA 3R7UA 3RKBA 5K9IA 5DEYA 4EEVA 5FTGA 3Q2MA 4XG7A 4QMQA 2R7IA 3AT4A 4U81A 4WT6A 4FVQA 5HE3A 4TYIA 5AV1A 4QYGA 3JVSA 4KBCA 2R3QA 4FSQA 2R3IA 3CKXA 4RIOA 3KULB 3GP0A 5AV2A 3S4QA 4K18A 2QVSE 4Y95A 4DH7A 2W9FB 2R3KA 3GCUA 2XIXA 2GS2A 5LCJA 2H8HA 5C8NA 3FC1X 3FYKX 3H3CA 3VS4A 3GCPA 1JSUA 4USFA 4IFCA 4ZSLA 3ENHA 5HESA 4U80A 4CRSA 1YXUA 1Y6BA 3TV6A 2VV9A 1LEZA 1UNGA 5CZHA 3VUGA 1MRUA 4MVFA 3D2KA 4NTTA 2PMIA 3P08A 4GVAA 4BCHA 4ZLOA 4OTWA 4RC2A 4ENYA 4NFMA 4J97A 4FV9A 3QXPA 4KSPA 4DH8A 3VF8A 5EYCA 3QZFA 3HYHA 3LQ8A 2IN6A 4IZ7A 2JGZA 3SLSA 4XV2A 1OKZA 3ZONA 5HQ0A 1AGWA 3DAEA 4I6FA 1OGUA 4YZDA 4ITHA 3LMIA 3S2PA 4TZRA 3OW4A 2R7BA 3NNWA 5IA5A 3D5WA 3R71A 5IF1A 2WEVA 2I0YA 5AUWA 3FZ1A 4G6LA 4C59A 1GZNA 4A9YA 3KVWA 2CPKE 3DT1A 2B53A 2WIPA 5GZAA 2YHVA 3QU0A 5HIBA 2J5FA 3VS0A 2XM8A 4FEWA 4HGTA 2PZRA 3EN5A 3IQ7A 1ZWSA 4U9AA 4DG0E 3C7QA 4FSMA 4YC6A 3DKCA 5FEEA 2Y4PA 5ANJA 5CY3A 4AACA 1IEPA 4CGAA 3I6WA 3W55A 3KFAA 3OWKA 3FMKA 4YU2A 1YQJA 3OBGA 5J7BA 4RLLA 4S30A 5E92A 3V6RA 3F3UA 3V04A 2ZB1A 3QQKA 4I6HA 4DFNA 4EYMA 1BL7A 1KE6A 2PK9A 2F7ZE 4A4XA 4F64A 2DWBA 5D11A 3MWUA 4W8EA 1O6YA 2I0EA 4O7YA 4L3LA 2EXEA 1IASA 2HWPA 3AC2A 5G1XA 3R1NA 3FMLA 3ZOSA 1R78A 3RAIA 4FNXA 4RIXA 3QTQA 4B8MA 1WBWA 2XCKA 3DXNA 3N4UA 2VTSA 2X8IA 1Q61A 1Z5MA 3EN6A 3UMWA 5AUVA 4RJ5A 4ASDA 3E8EA 3LCSA 3VUIA 1T45A 3RNYA 3SG8A 2UVYA 3JY9A 3QRIA 4D2SA 4QMPA 4FNZA 4TXCA 4YZMA 3VUMA 3FUPA 1JAMA 5GIOE 5DYJA 3A4PA 4FF8A 4TPTA 4UV0A 4W4YA 4Y83A 5HE1A 2XIRA 2RG6A 3POZA 5JFVA 3VW6A 3BHTA 1XHAA 5CF8A 3HMMA 4ZMEA 3H0YA 3VRYA 2YJRA 1ZYLA 4G34A 2IWIA 4R3PA 4TYJA 5CLPA 5DT0A 4AZEA 5GZ8A 2HK5A 2O64A 1ZYDA 2RFEA 3PA4A 3QC9A 5CI6A 4E73A 2XKEA 3VS7A 4O7TA 3CTHA 4KIOA 4G3CA 5EHOA 3FXZA 3V01A 2PMNX 4FTMA 4LM5A 2P4IA 5CSHA 3W2QA 5JT2A 2IPXA 4KS8A 3AOXA 1G5SA 3Q4ZA 3LW0A 5DR2A 2WGJA 3WIKA 3GU8A 3L8PA 2WOUA 4EHEA 3EMGA 1O6LA 4YZ9A 1H1RA 2WEIA 4NJ3A 5IU2A 1HOWA 5CU0A 4JJRA 4AZWA 5HIEA 4BDAA 3UO5A 3OFMA 3OY1A 2XUUA 4IVDA 4JQ8A 4QPAA 2JIUA 4NCTA 4OTDA 3EZVA 5HORA 4O83A 2OH0E 4TKSA 4IAYA 3CJGA 1XR1A 4CXAA 5L3AA 4F7LA 3CP9A 4GEOA 4YJRA 3EN9A 4DGLC 4HVIA 3LAUA 1G8SA 4D9UA 4YUQA 1W0XC 4DYMA 3GU5A 4LRJA 2OG8A 1PXPA 4EKLA 4L8MA 1ZYJA 3PJ8A 1UA2A 4IWOA 3UIUA 4EOMA 4KWPA 1NA7A 3DJ7A 3EHAA 2C6KA 5AP4A 3S0OA 4YC3A 2QONA 3PPZA 4U45A 5HCXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3BQR A;  5DR6 A;  3R00 A;  4D1Z A;  2C6D A;  3ORZ A;  3REP A;  5J1W A;  2PVR A;  4YJN A;  4EK6 A;  5DWR A;  4LG4 A;  3CGO A;  2CN8 A;  3ALO A;  3DKO A;  2J5E A;  4FV2 A;  3HV7 A;  2BKZ A;  3BYM A;  4KIK B;  4OGR A;  5BUE A;  4U40 A;  3LKM A;  4CT1 A;  3M42 A;  5CU3 A;  4JR7 A;  4X6R A;  2CKO A;  3COK A;  2ITV A;  3OTU A;  4DFX E;  4ZS4 A;  3G15 A;  4LOQ A;  3PFQ A;  2XNN A;  4X3F A;  5KO1 A;  4S2Z A;  4RMZ A;  4CT2 A;  4B4L A;  3HA6 A;  5EQP A;  1WZY A;  4XOZ A;  3SG9 A;  4O2P A;  4F0G A;  5KMI A;  4FYN A;  2R3L A;  4MBL A;  1VZO A;  3PA5 A;  5ANG A;  5IG1 A;  2B9H A;  3IK3 A;  4IMY A;  4F1O A;  5AWM A;  3NW7 A;  5FGK A;  2YM8 A;  4ACG A;  3EQB A;  3QRJ A;  1WBN A;  2VN9 A;  4BCN A;  5KKR C;  4F78 A;  2XK9 A;  2YAK A;  4O0T A;  3P86 A;  4AZV A;  4HNF A;  4RT7 A;  2XYN A;  4PPC A;  5CEI A;  4PDY A;  3KGA A;  1SVE A;  3V8T A;  3FMJ A;  4O4F A;  5GJG A;  4FKT A;  4QMW A;  4FZA B;  3ZDI A;  4BBF A;  5DRD A;  2BVA A;  4ID7 A;  3VON A;  4LOP A;  3IGG A;  2LGC A;  1M2P A;  3LLA A;  1UU7 A;  4D4R A; 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