2JDOA

Structure of pkb-beta (akt2) complexed with isoquinoline-5-sulfonic acid (2-(2-(4-chlorobenzyloxy) ethylamino)ethyl)amide
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
337
structure length
314
Chain Sequence
KVTMNDFDYLKLLGKGTFGKVILVREKATGRYYAMKILRKEVIIAKDEVAHTVTESRVLQNTRHPFLTALKYAFQTHDRLCFVMEYANGGELFFHLSRERVFTEERARFYGAEIVSALEYLHSRDVVYRDIKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKEGISDGATMKFCGTPEYLAPEVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHERLFELILMEEIRFPRTLSPEAKSLLAGLLKKDPKQRLGGGPSDAKEVMEHRFFLSINWQDVVQKKLLPPFKPQVTSEVDTRYFDDEFTAQSITMFEDFDYIADW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A Structural Comparison of Inhibitor Binding to Pkb, Pka and Pka-Pkb Chimera
pubmed doi rcsb
molecule keywords RAC-BETA SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 92
structure length 314
sequence length 337
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2007-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF00433 Pkinase_C Protein kinase C terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2jdoA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2jdoA01
3ULZA 2J51A 2YZAA 2NPQA 3D5WA 2Y7JA 4NSTA 3DQWA 4RJ7A 4FODA 3NW7A 3VUKA 3CEKA 1MUOA 5HD7A 2BZKB 2O63A 2YLEA 2G1TA 3EN4A 5F20A 3L8SA 4R5SA 1GJOA 2ETRA 2H8HA 3WARA 4AT5A 5I3OA 1PJKA 1VJYA 2A0CX 4KS7A 3TJDA 3PUPA 5KZ0A 3TWJA 4BC6A 3DK3A 3W8LA 4HCTA 4GYGA 5EKNA 3ORLA 2HZ4A 3DB8A 3FZSA 3P4KA 4R3RA 3R28A 1IEPA 4FIGA 3QRKA 2QLQA 4GL9A 2X2MA 3DBFA 4WD5A 4FIFA 2UZTA 4BDFA 4F1TA 2WZJA 1H24A 2JIUA 3OOGA 3P5KA 5TT7A 3SOCA 2GNLA 2BILB 1RJBA 4D9UA 1TKIA 4HVGA 2VX3A 2YWVA 4GYIA 3ORNA 4O0RA 5HNGA 4LRMA 5ACKA 4ZSJA 2W1IA 4OLIA 4BCPA 3KEXA 4MYGA 2BHEA 3VQUA 3G90X 3ZFYA 5F9EA 4ENYA 4ZJVA 1A06A 3KXNA 4FUYA 3PA5A 4ZIMA 2XCHA 5AP7A 1Q5KA 2X8IA 1YI4A 1OECA 4PTGA 3NUXA 1R1WA 3ERKA 3Q9WA 4FZDB 1URCA 3MI9A 4IIRA 2ERKA 4FZAB 4L8MA 4CT1A 4USEA 5CNOA 2VWBA 2GNGA 3QCXA 4YU2A 3OWLA 3SW7A 4ZLYA 5KMLA 3WILA 3GVUA 1UWJA 4UEUA 2RKUA 1YW2A 4N6ZA 2PZYA 3CTHA 3FLZA 2OIQA 4V01A 3HZTA 3KK8A 2FYSA 3T3VA 5IA5A 1MRUA 3BYUA 4XHKB 4LGDA 3CKWA 5BNJA 4OTPA 1JVPP 4U5JA 1W84A 3EN5A 4MQ1A 4ZJIA 5JT2A 3MH2A 1BUHA 1ERKA 4FTKA 4L01A 1KWPA 2B9JA 1WBOA 4MD8E 3S4QA 3A7JA 3UGCA 2PWLA 3ET7A 4IAAA 4ZJJA 4L3JA 5CSVA 4QMMA 5IQDA 4JDIA 4LG4A 2JKKA 5HLNA 3KVWA 2QG5A 4W4VA 1PRYA 5E8XA 5HG7A 3NS9A 4I5PA 1O6YA 4TL0A 5M44A 3RAKA 5LXMA 4G5PA 3ZM9A 4FSNA 4C36A 4FKTA 2OZAA 2R9SA 5EYMA 2O65A 1PXMA 2OW3A 4CFMA 4E8AA 1OZ1A 2JC6A 2QOIA 2QU5A 4GVJA 5FXSA 5HEZA 3KQ7A 5CXHA 4HYSA 1Y6AA 2ZM3A 4EZ3A 3DTCA 4DEEA 4UBAA 3QD4A 3ATTA 3N4VA 4DFUA 2BVAA 3CIKA 2C3JA 4QP4A 3DBDA 4DFZE 3CC6A 2ETKA 4BI2A 3W33A 2GDOA 2C6DA 2O0UA 3RJCA 3OUKA 3OCTA 3DJ5A 2BRHA 5E92A 5C27A 3TACA 4HGEA 4O7YA 3I5NA 3VBQA 3BWFA 3LFBA 3CTJA 2EWAA 4JAJA 5FEDA 4IX3A 1SM2A 3O17A 2HELA 3SG9A 5HCXA 2W4KA 2OFVA 2XJ1A 2VTJA 3HECA 1V0OA 4A7CA 4BCKA 4RBLA 5HD4A 4CZUA 4JBVA 2YCSA 3D94A 4RWIA 4TPTA 1OKZA 3ZZEA 4E1ZA 2J2IB 4Y73A 4DTAA 5IUIA 2NO3A 3DOGA 3THBA 5E7RA 2VUWA 5BQ0A 3R1YA 4FIEA 2P4IA 4GG5A 4BKJA 3KFAA 4FE2A 4QMSA 3R8VA 4M15A 1NVRA 2OU7A 3O8UA 4B8MA 4GUEA 4EH9A 5CALA 4W4YA 3R01A 3RNYA 3GI3A 5HBJA 1OL1A 3C7QA 4NIFA 3WIKA 1PMEA 1XH4A 2UZVA 3EJ1A 4C8BA 3IGOA 5I9VA 1S9JA 2QQ7A 4EI4A 4G31A 5M4FA 3QAME 1KV1A 4NFNA 1J3HA 3RBWA 4BDAA 4X6RA 4IVBA 4KA3A 3LOKA 3QX2A 3VJNA 3IDBA 4TWOA 5CWZA 2OG8A 3UODA 3VN9A 4BVUA 4KINA 5HZNA 3HV3A 5IQHA 4XP2A 5DE2A 3O71A 4ZMFA 1PY5A 2C47A 3FDNA 4IEBA 4MCVA 4F6UA 1PW2A 3FMKA 5CEOA 3ZDIA 5DBXA 4PY1A 1JOWB 3EZRA 1H07A 3TKIA 2YZLA 2W1CA 4CKJA 5BVNA 1HCLA 4BY9E 3FMLA 4E6DA 1FVVA 2IW8A 4IM3A 4H05A 4YNOA 2R3RA 4JIKA 5L8KA 3W2OA 2FA2A 4ZMEA 3ELJA 5EKOA 2QOQA 5KO1A 5KZIA 5HNIX 1XKKA 4BBFA 1FOTA 4I22A 1V0BA 2XB7A 4JR7A 3DFCB 3V3VA 4FSYA 1OB3A 4HCVA 4KRDA 5E8VA 4AP7A 4FVRA 2YDIA 2WHBA 2ITWA 3W32A 3UNZA 3U9NA 4QT1A 1OBDA 5KE0A 5K5NA 3IK3A 4AGDA 2GMXA 5JH6A 4H3PA 5CSWA 4X3FC 3GQLA 3EQDA 3HRBA 3MY0A 2AYPA 4KKHA 4O22A 1VEBA 2WQOA 1QL6A 1KE8A 1XQZA 2R2PA 1DAWA 3ALNA 2GNFA 3CD8A 5FDPA 2GHGA 4GKHA 5LJJA 2VGPA 2XUUA 4IWQA 3OW4A 2JITA 5TOZA 4BDIA 5CANA 5CEMA 1G5SA 3A99A 5CX9A 4O81A 1QPJA 4Y83A 5J9ZA 3EQFA 3R0TA 4FV9A 2A4LA 3QGYA 5I9UA 3R83A 3W1FA 4ERWA 4NCTA 5CENA 4K77A 4HVDA 4M97A 2CJMA 4FTJA 2WTJA 2B7AA 4I20A 1NVQA 3ORPA 2YDKA 4LQMA 3ID6C 2PZPA 3RAWA 4AUAA 5BYZA 4RIWB 3VS4A 4CV9A 3AG9A 2IVTA 4RGJA 4S34A 3CP9A 3W16A 2JLDA 4RQKA 3QTQA 3H0YA 3RK5A 2PMNX 2JKMA 3G6GA 4RPVA 5E8UA 5EM5A 3SXSA 2QOKA 3ACJA 3IDPA 4YTFA 4EZ5A 4DINA 3OMVA 3GU6A 4UB7A 4MD9E 4WG3A 1XJDA 4JAIA 2JDSA 3IW5A 5LQFA 3CXWA 3BKBA 4CTBA 3TIYA 3FJQE 1PXOA 2C6EA 3EQPA 3RPRA 3W2RA 2PUUA 3F5GA 3MDYA 5CEQA 3CGFA 4U45A 3IDCA 3TKHA 3VS3A 4RIYB 4PDYA 2YACA 4E4NA 5CU2A 2JFMA 3HLLA 3KL8A 5A9UA 3QXPA 3E8NA 3TV4A 4F9YA 3VIDA 4EJNA 3VULA 4I4FA 4CXAA 4U3ZA 4F4PA 1KV2A 2QOFA 1OUYA 2YA9A 3BYSA 2YIYA 3UYSA 1UKHA 1XR1A 3ETAA 4UMPA 3I4BA 5HIDA 5HTCA 4KAOA 5EI8A 5C8KA 4J7BA 1PXKA 4EZ7A 4ZY5A 2W4JA 3EOCA 4J71A 2BAKA 3UVQA 4WRSA 3C0HA 1EH4A 2XMYA 5CXZA 2Z8CA 5A3XA 5AR4A 1YHSA 4UZHA 2PULA 4OTWA 2DWBA 2RFSA 5AAGA 5ANOA 1GOLA 2R3LA 3GENA 4S32A 5AV1A 4CLIA 3N51A 1OKYA 2QCSA 4FT3A 4IZAA 3UE4A 2UW0A 4CYJA 4IBMA 3TEIA 4PUZA 4GJ3A 4OT6A 3H10A 4F9AA 3M42A 4EH2A 4FNZA 3O2MA 4RVTA 5A14A 4GFGA 5KX8A 2GHMA 3ZYAA 3D7TB 4EYMA 3RM7A 4JQ7A 5M07A 4HVSA 2VGOA 3OW3A 4ZTMA 5IU2A 1IG1A 2XVDA 5AUVA 1WVWA 4IW0A 3D83A 3UPZA 3HYHA 3MV5A 1WBWA 3SV0A 2QD9A 2YM7A 5CVFA 1OBGA 4BB4A 2ZDUA 4YHFA 4JBOA 3UBDA 3VS2A 5CF8A 4R77A 4FG9A 4OW8A 4K11A 2A2AA 4M0YA 4W8EA 4AA5A 4BR3A 3RI1A 2GQRA 2G2FA 4IAFA 5IEVA 3ENHA 3P78A 3AD5A 3S3IA 4WSQA 4O82A 3Q2JA 3AC2A 3RHXA 4KKEA 2RG5A 2ZAZA 4GFOA 4YGAA 4QMLA 1J7IA 4GIHA 2PVNA 3D5VA 4UYNA 4E20A 3FXXA 2CKOA 4GK4A 2OBJA 1KUTA 3TUDA 2B55A 2Y6MA 4H1MA 4DITA 1OL6A 2X9FA 3LAUA 2VO3A 3FSKA 2F2UA 2WNTA 3PSCA 4GG7A 3TNWA 4XG2A 2IW9A 3G9LX 1WVXA 4C4IA 2C69A 2VNWA 4EYJA 2C6MA 3TZ8A 4USFA 4IVCA 4F70A 3LQ8A 2NP8A 4BDKA 2Y4IB 2PY3A 5M55A 3AGLA 3V8SA 3WBLA 4AZFA 3UQCA 4DT8A 3KCFA 3R22A 4IX6A 5CNNA 4AX8A 3RPYA 3VUGA 1VYZA 1H8FA 4FTMA 5E90A 4C58A 2P55A 3F3WA 5CT7A 3BZ3A 2SRCA 2X9EA 4O7WA 3UVPA 3WZEA 4K6ZA 3BBWA 3BQRA 4GT5A 3R02A 4ITJA 3V5JA 5H9BA 3F69A 3EQIA 5DR9A 4QP9A 3MH0A 3F82A 4XG9A 4U97A 2JIVA 4XYFA 5CAQA 4BDJA 3JYAA 4OBOA 2J90A 3CCNA 4CFNA 3PA3A 1FGKA 4JR3A 3PJCA 2CGWA 3QTSA 4EBWA 4U9AA 3JY0A 3GFWA 3MIYA 1ZXEA 1S9IA 1FMOE 1ZRZA 3HUBA 4JDJA 4M3QA 2C1BA 5KMOA 4CV8A 4QPMA 1G8SA 2WEVA 4WNMA 3RZBA 3LHJA 2C3KA 5HO8A 3MWUA 4O1OA 3UPXA 3R7GA 2RFEA 3PG3A 5ETFA 2BHHA 5ICPA 5E1SA 5I9YA 1IRKA 3R00A 2YEXA 3BCEA 1PXLA 4NM7A 4GSBA 4O91A 1SMHA 3K3JA 4WA9A 4AE9A 5JFWA 3AT2A 5DIAA 3MTLA 4R3CA 3QKMA 4FBXA 5H8BA 2CMWA 4TZRA 2CHLA 3MN3A 2E9PA 3TDWA 4M68A 4C61A 4G3EA 4FYNA 2QOHA 2WQMA 5M53A 5HCZA 2WMRA 1YQJA 3HV5A 5IF1A 2R3QA 4MF1A 3OS3A 2W7XA 3F5PA 5A54A 4C3FA 3GCVA 2WTKB 4GUBA 3QD2B 3BWJA 4K0YA 4U6RA 3CE3A 2P2HA 2HOGA 5KBQA 2X4FA 2BIKB 5L2QA 3FZOA 1W8CA 1ZMWA 3U9CA 4W4WA 4XOZA 5FP5A 2X7FA 4MEDA 5M09A 2BTRA 3CD3A 1NW1A 3D5UA 1QMZA 4FF8A 4G6LA 1ZYCA 4J8MA 2YIWA 4DEHA 3BELA 2J5EA 3Q3BA 3PXKA 2R3OA 1PF8A 5JRSA 2UV2A 1IA8A 1U54A 3ZXTA 3PLAE 1WVYA 3PG1A 2HZ0A 4KABA 4N70A 4IHPA 1H25A 3DLZA 3A7IA 3OWPA 5T3QA 2XK7A 2EXEA 5DGZA 5IDPA 3AD6A 2BROA 3NAYA 4APPA 2UW6A 2OGVA 4RSSA 3PPJA 5HOAA 4EK6A 2RF9A 3KRRA 4IB1A 4X2KA 2PVRA 3E88A 2VTOA 3MA6A 5K3YA 3SHEA 1OIYA 3HP5A 2BZJA 2UVZA 4G16A 5IDNA 5IQCA 4D28A 1Q24A 5DLSA 3W2QA 3WYYA 4YLJA 5KHXA 4NU1A 3C13A 3ZBXA 5CU0A 1R3CA 5EYDA 4AOTA 2IW6A 2B54A 3D7ZA 4EOOA 4O84A 3MH3A 5IA1A 3MH1A 3QZIA 4FA2A 3HKOA 3LFEA 4CD0A 3LLAA 2YJSA 3C51A 1YXUA 3OD6X 2ZV9A 4E6AA 2WTVA 3UG1A 1JSVA 3LFAA 3RGFA 4IAYA 3KA0A 2EB2A 1J1BA 3FHRA 3LCDA 3PFQA 4CMTA 2VTMA 3I6WA 3UOKA 1Q3DA 1GZKA 4FI1A 4B4LA 3ZO2A 3QXOA 3QA8A 3ZEWA 3P79A 5JK3A 5KUPA 4I6FA 4D2WA 4RWLA 4JG8A 2XJ2A 3IKAA 1ZYLA 1YWNA 3IW8A 2PMIA 5FRIA 4ANQA 3V5QA 5AV4A 5J79A 4O7SA 5EW3A 2YHVA 4HZSA 3IW7A 4O7RA 1BL6A 1KOBA 3E8CA 3FMHA 3IOKA 3KGAA 1M2QA 4U41A 4F7LA 3RM6A 4UWBA 3VS0A 3DDPA 1YVJA 3NDMA 4I23A 4R8QA 4AAAA 3FYJX 3MY5A 3RKBA 3FSFA 2V62A 1OKWA 1YI3A 2OF2A 3GU5A 3HAMA 4E4MA 4PP9A 2XNNA 3VQHA 4DYMA 3NLBA 2C6KA 4F6SA 2IO6A 4MXYA 3C4WA 1GIIA 4MX9A 1WFCA 3MYGA 5IQIA 1P14A 4HYUA 3GC0A 3LM5A 3GBZA 5F4NA 4UYAA 2ZYBA 4V0GA 4BGHA 5K0KA 5JQ8A 4PL5A 3QHWA 3JS2A 3G15A 4I93A 3QC9A 2PMLX 3E7VA 2XIKA 2XK3A 4RX9A 3TIZA 4EOIA 1K2PA 2Z7LA 3PXYA 3LVPA 4ZP5A 4CLJA 1QPDA 3N4TA 1P4FA 1G3NA 2YN8A 2FH9A 2G2HA 4WT6A 4CZYB 4UX9A 5M08A 3C4ZA 3WYXA 4G1WA 2C6IA 3FPMA 4ZAUA 4ZLZA 3PZEA 4O2PA 4YZMA 5JRQA 1M14A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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