2JLDA

Extremely tight binding of ruthenium complex to glycogen synthase kinase 3
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
351
structure length
349
Chain Sequence
SKVTTVVATPGQGPDRPQEVSYTDTKVIGNGSFGVVYQAKLCDSGELVAIKKVLQDKRFKNRELQIMRKLDHCNIVRLRYFFYSSEKKDEVYLNLVLDYVPETVYRVARHYSRAKQTLPVIYVKLYMYQLFRSLAYIHSFGICHRDIKPQNLLLDPDTAVLKLCDFGSAKQLVRGEPNVSYICSRYYRAPELIFGATDYTSSIDVWSAGCVLAELLLGQPIFPGDSGVDQLVEIIKVLGTPTREQIREMNPNYTFKFPQIKAHPWTKVFRPRTPPEAIALCSRLLEYTPTARLTPLEACAHSFFDELRDPNVKLPNGRDTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHARIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Extremely Tight Binding of a Ruthenium Complex to Glycogen Synthase Kinase 3.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLYCOGEN SYNTHASE KINASE-3 BETA
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 102
structure length 349
sequence length 351
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2jldA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2jldA01
4TWNA 3GNIB 5HO6A 4XX9A 2PZRA 3I5ZA 2R3PA 3CSVA 3KREA 4X3FC 4Y8DA 4U42A 1E1XA 3TUBA 4U97A 1H28A 3MY5A 5HD7A 1NVRA 1M2RA 1Z9XA 3S95A 3OXIA 3KXNA 5HBEA 2VGPA 4LMUA 2PE0A 4L01A 4EWQA 3OXZA 3DBFA 4CYIA 5HX6A 4HVDA 3NCZA 2HAKA 2XP2A 1PXPA 3HMMA 3R28A 1PRYA 4CFMA 3FI2A 5FTQA 4YJVA 4RZWA 4I6HA 1PKGA 2Y8OA 3AT2A 3OW3A 5HBJA 1Q8WA 3COIA 2XIYA 3VS5A 3KF4A 1H25A 3GU8A 1ZYJA 4RIOA 1SNUA 3RPOA 3UP2A 1TVOA 3ZONA 4E4MA 3OTVA 2DWBA 2QOBA 5JZNA 4BCPA 5C1QB 2JDOA 4BFMA 3IK3A 5KHXA 3W10A 4FT0A 2I7QA 4FEQA 4U9AA 4L52A 4Y5HA 4WNMA 5D41A 3RAKA 1UNGA 3EQBA 4FTNA 3U55A 3DLZA 4H3QA 2W9FB 3LVPA 4FICA 3MIAA 1VYWA 3QTRA 3P79A 3QZFA 4UWCA 4UB7A 2WIPA 5DA3A 2WQEA 4EHGA 3RCDA 1Q8YA 5DIAA 3H9FA 4AZTA 4NEUA 1TQIA 1KE6A 2IW8A 3LHJA 2OXDA 4C4GA 4XRJA 3C50A 3BLQA 4EOPA 3PUPA 2WZJA 1FMKA 3A8XA 2QOQA 3KXXA 4PMSA 3HV7A 3OZ6A 3KRRA 5CU4A 3U4WA 4I5HA 3ZM9A 2XRWA 4OTIA 2ZOQA 3I60A 4FTQA 4NM5A 1O6KA 3QALE 3K3IA 1F3MC 5IKWA 3KRWA 4QMWA 2ITZA 2XJ1A 4AGWA 5L2IA 4UX9A 1NT2A 4JNWA 3CPBA 3FPQA 4C58A 3ET7A 5AP6A 3PJ8A 2VTRA 5AAGA 3A62A 3ZDUA 4YLKA 2VO7A 3QAME 4FK6A 4RSSA 2UW3A 3I7CA 3LOKA 3UMXA 3UNJA 2YDIA 2F4JA 4MEDA 3LFNA 1PYEA 2X2LA 5CTPA 5AAFA 3ZO4A 4XG3A 1OKZA 3PVWA 5CU0A 2RG5A 4A9YA 4YZBA 3F7WA 1NA7A 3F5PA 2LGCA 5G1XA 2PMIA 3UPZA 1GIHA 3QRJA 4AW1A 3KN6A 4O2PA 4YLJA 5HE0A 3DB6A 4I22A 3R01A 3UO5A 4RLKA 1UKHA 4CQGA 3HEGA 4E93A 2C5VA 2IJMA 2OIDA 3BWFA 4GRBA 2QOFA 5ANJA 3TNIA 3QLGA 4JDJA 3OCTA 3WARA 5HIEA 3VBQA 5IH4A 2YWVA 4QQ5A 3G2FA 2EVAA 4AZEA 4X6RA 4D5HA 2CNUA 4N6ZA 4CGAA 3HA8A 5BMSA 3AT3A 1H8FA 4O0XA 3RJCA 4XNEA 3ACKA 4IEBA 4JXFA 4ONAA 5HNIX 1WVYA 3ORLA 5GJFA 3ZCLA 4IH8A 5IA0A 4G6NA 4EH5A 3LFEA 3R9OA 2ZV7A 5C8MA 4ANSA 4CV9A 4ACCA 4ZS4A 3MYGA 3PLAE 1Z5MA 3ZBFA 3UQFA 5DYJA 4LOPA 3IOKA 4AW2A 4GVAA 3WE4A 3QKMA 4RVKA 1PMNA 2I40A 2QODA 5M4FA 3ORKA 3A7FA 4PDSA 2C0OA 1J7IA 3FYJX 1J1CA 2C6DA 4D2TA 4IAAA 2XK3A 4BR3A 4ACGA 4YU2A 4MQ2A 3BKBA 4BDDA 4LRJA 3N9XA 3PWYA 3D7TB 4HZSA 5DMZA 5H3QA 5EM5A 4C0TA 3EHAA 5J7HA 4FTJA 3UO4A 2WELA 4K6ZA 2QCSA 4ZIMA 1ATPE 4ZOGA 3SAYA 4RQKA 3QRUA 5M4CA 5FWKK 2QQ7A 4NKAA 2XYNA 4WG3A 2UW7A 2OXYA 3WYXA 5JRQA 3NS9A 4AACA 4MCVA 2C6OA 2YERA 3C0IA 4YJQA 3PTGA 4EJNA 4AZWA 3NUXA 3QKKA 4WD5A 4C57A 4IAYA 4FI1A 2JDSA 3PVUA 4G16A 3GQLA 4FKSA 4JR3A 3ZDIA 4YTIA 4APPA 3DKOA 4OBPA 3ALOA 3DK6A 3HMOA 3RVGA 4USEA 1UV5A 3FMHA 3CTQA 3QFVA 3EFKA 5EYDA 4D2PA 3C1XA 2GFCA 5DT3A 5HE1A 3Q4ZA 4BCKA 2ZM4A 4XV1A 5D7VA 4F1OA 3L1SA 5TT7A 2WTIA 3W2SA 1KV2A 2X9EA 4PNKA 3GXLA 4FGBA 4FG9A 4IMYA 4C59A 1V0PA 4IDVA 1Q8TA 4JIAA 1YI6A 4CEGA 2HK5A 2G1TA 4IIRA 4PTCA 3TV4A 4GUBA 4J95A 5HQ0A 4MNFA 1MRYA 2BRHA 2CNQA 3ENMA 5DFPA 4M0YA 5DOSA 2GSFA 5M4IA 4X7QA 3R73A 2XM9A 2BTSA 5CANA 4P2KA 4ARKA 4FZDB 2CDZA 3CCNA 4N6YA 2BAJA 1Y8GA 3D94A 4IAKA 2ETKA 3BX5A 3K5UA 5HVJA 2CKQA 5A6NA 3LLTA 4BDHA 1W7HA 2EXCX 3B2TA 3UOHA 4M8TA 3R22A 4DH7A 3TZ8A 5EKNA 5IH5A 3VHKA 5JN2A 3DBDA 1TQPA 4YC6A 1KE9A 4ZXTA 3LMIA 1YHWA 5B2LA 3TKHA 4E6CA 3C9WA 3P86A 4LL5A 5AUTA 1R78A 4WBOA 5EHLA 5CNOA 5BQ0A 1UNHA 4IFGA 4BIBA 2JKKA 1JBPE 4CZTA 2IVSA 4DTBA 3OTUA 2UZBA 4XRLA 2GCDA 3AG9A 4R3CA 5G6VA 3CTJA 3F5UA 3FZPA 4GV1A 4I6FA 4BDBA 4RWIA 3OP5A 4PP9A 1ZY5A 2JITA 4YJOA 2ZB1A 5H8EA 3W32A 5K4JA 3FXWA 2BPMA 4D1XA 1SVHA 1G5SA 2DQ7X 3VS1A 3ZFYA 5KCVA 1OKVA 3F82A 2HOGA 4AT4A 3V6RA 2JBPA 3MH0A 4MWHA 4ACDA 5IQIA 3BE2A 4FSTA 4JDKA 2AUHA 4L3LA 3W2OA 3EL7A 3EZRA 3G0EA 2JKMA 2QU6A 3LIJA 4DLIA 5FEEA 4RIXA 2FUMA 5M07A 3KCFA 3ZZWA 4JJRA 4KBCA 2BTRA 3ZO2A 5L8JA 4CLJA 3BEAA 3VUKA 2VO3A 2C5OA 2CJMA 4JDIA 3BBWA 3G0FA 3KVXA 1XR1A 4HPTE 2CNVA 4IZ5A 4W4WA 1ZARA 2UZOA 1GNGA 4R1VA 4ALUA 3GGFA 2HWPA 4L7FA 4KKEA 3NW6A 4Y95A 5HCXA 3BELA 3D15A 5CT0A 3THBA 4OUCA 3QX2A 4QP8A 4FG8A 1U5QA 3R71A 5A6OA 2ZMDA 3ZFMA 2YFXA 4C4JA 4P90A 4QPAA 1A9UA 5T6KA 3UVPA 5AP4A 4FA2A 3DB8A 3FKOA 5J95A 4AS0A 3N4VA 2VTTA 3CD3A 4IAZA 4F1MA 3BQCA 3KK9A 3F66A 3VS4A 3ZO1A 2WXVA 4EOIA 1R3CA 2WTDA 1AGWA 5H2UA 3MFTA 1UWJA 2YZLA 4BGHA 4G3EA 3S00A 1XWSA 3OCSA 4KA3A 4Y5QA 5DI1A 4ANMA 3D5XA 4I20A 4JQ7A 2GNIA 1U46A 2I0HA 4M69B 2J90A 3A4OX 3V5TA 4AGDA 5FTGA 1ZAOA 3TZMA 4R7BA 2R3MA 1H26A 2I0VA 5EM7A 1OPLA 1OUYA 2RKUA 4Y46A 3LE6A 3I0QA 4QOXA 5B2KA 3VRZA 5LVNA 1BLXA 3MIYA 4RIWB 2PZIA 3SC1A 5J87A 4KB8A 1ZOHA 2PMNX 4KSQA 1LEZA 2F49A 4ITJA 4L53A 4DCAA 1VZOA 3RK7A 4WNPA 5CASA 3UDBA 4MTAA 4ANLA 2WMXA 2W1EA 1Y6AA 4KS7A 4EUUA 4YBKA 3KEXA 4D4YA 4IADA 2C6MA 3HNGA 3PXFA 4KIKB 4EK8A 1XBCA 2UVYA 4C8BA 4ZTQA 3EN7A 4Z7GA 3GOKA 2CMWA 4WRSA 3H9RA 2CLQA 2Y6OA 3D0EA 5AR2A 2QR8A 2BZIB 3DDPA 3Q6UA 4NM3A 2HW6A 3TG1A 4KIKA 1REKA 4FMQA 4NH1A 4IFCA 3ZYAA 4O7NA 4HW7A 1APME 2VWWA 3P7BA 2YM4A 4LFIA 3EIDA 5HIBA 2XVDA 4OTWA 2XS0A 1YHSA 1BI8A 2ITUA 4U80A 3RHKA 1H0WA 1OGUA 3PPJA 2XMYA 3R63A 4FBXA 3Q32A 4FNWA 3WILA 3DQWA 3V5JA 4OBQA 3HV3A 4Q9SA 3ZEPA 2QURA 5TE0A 2VTHA 4E3CA 3OMVA 4QMNA 5K4IA 3S0OA 5C4KA 3WZJA 4H3PA 1KE8A 5DHJA 3RP9A 3EYHA 3V5PA 4ZLZA 2PVLA 3QCQA 4ZTHA 3GT8A 4BICA 4E7WA 2PE2A 3COKA 3O23A 4LOQA 4GG7A 4JQ8A 4GUEA 1F5QA 1LR4A 1ZMUA 2RIOA 4RMZA 1HCLA 4AT5A 5CEOA 4JX7A 3RK5A 3FSFA 4MXXA 1HOWA 2IO6A 3LXLA 3RPYA 2R3QA 4IC7A 5AP3A 3OT3A 4FOBA 5CSVA 4ANQA 3R9HA 4DCEA 2HW7A 3W2CA 3PA3A 2PSQA 5IQBA 4EJ7A 4CFXA 3SX9A 4WG5A 4IM2A 3WF8A 3KF7A 1TQMA 2VGOA 3LFDA 4XHKB 5E8YA 4P5QA 2FSTX 3L9MA 3EFLA 5ICPA 2VO6A 1Y8YA 1F0QA 3KY2A 4FL3A 4AE9A 5I0BA 3FZ1A 5JGDA 4CKIA 1GIJA 2FH9A 4UMPA 5IEVA 5KMOA 2YLEA 4I4FA 2EXEA 4K77A 3JY9A 1K3AA 2PWLA 3WZUA 4F64A 3NYOA 4F7LA 3DDQA 3DOGA 4BZNA 2AC3A 2B52A 3GI3A 2G2FA 5CF8A 3ENHA 1IASA 2YDJA 4RJ6A 3T3UA 3R7EA 4N4SA 3A7IA 2VTSA 4HYHA 2JDVA 4DC2A 5IUHA 5KMMA 4RX5A 1FQ1B 3QKLA 2F2UA 1OM1A 1KSWA 1KE7A 1PYXA 1URCA 2RFEA 3Q6WA 5EFQA 2R3HA 3TNHA 1XQZA 4K1BA 5GZ8A 3F61A 1YQJA 3PJCA 4HYSA 3QTZA 3ZLYA 3T9TA 3LMGA 1UU3A 4DHFA 2R2PA 2BFYA 4QT1A 4H1MA 3DK7A 2YAAA 4AUAA 5KUPA 3BCEA 1UNLA 3R8LA 2CHLA 3PZHA 5DVRA 5KNJA 3I6WA 4ACHA 3TV7A 1NVSA 4IJ9A 4MVFA 4PUZA 5DT0A 2UW6A 3GCVA 5C26A 4AAAA 5C03A 2PHKA 3C4ZA 4V04A 5EI6A 4F6SA 4FV2A 3QQKA 5E92A 4KABA 3PY0A 4GVJA 3DBCA 4K11A 4C2VA 4TZRA 2PVMA 4TYJA 5LJJA 4UALA 2UUEA 4IB3A 5IUIA 4ORKA 2UZTA 4ALWA 5BNJA 2R3OA 1XH7A 3FYKX 3QTWA 5DGZA 2JIIA 3EQFA 3LMHA 4O81A 5AP2A 3BBTB 2W5BA 3HP5A 2GNJA 2P0CA 5M56A 1GY3A 2VNYA 2WMBA 5ETCA 2XNGA 5F1ZA 4AXAA 3IO7A 2OZOA 3BWJA 2QOHA 4O0VA 4R5SA 5HGIA 4F7NA 2B54A 4CXAA 3CY3A 4IBMA 2VX0A 4UYAA 2OJFE 3FQEA 3QD4A 3W2RA 3Q2JA 3HAMA 3TZ7A 4QNAA 4F6WA 2C5YA 4I0TA 5AEPA 2CCHA 1IAJA 2QC6A 2IZRA 4XG2A 2OZAA 2X4ZA 4D55A 1FBNA 3NX8A 4DG2E 1IEPA 2B4SB 4EZ3A 4J8NA 1JKLA 2W9ZB 2PL0A 5JQ5A 4FTLA 1ZY4A 2PZ5A 1WCCA 4V0GB 3GQIA 5DBXA 3IS5A 3EH9A 2W1DA 4K18A 3F7ZA 4MD8E 3JR1A 2BRGA 3KA0A 4UXQA 5HVYA 4FV5A 3PG3A 5AFVA 5JGAA 3U87A 2Y7JA 4B8MA 4QP1A 4WUNA 3NWWA 4TWOA 2O63A 1FVVA 2WOUA 3FPMA 2C3LA 3CPCA 4GEOA 5FEQA 2VTOA 1JVPP 2FVDA 2PU8A 4DAWA 4WUAA 2YM6A 4O86A 4FKGA 4RX8A 4KBKA 4FZ7A 3ZRKA 4FVQA 3HA6A 3Q3BA 4RT7A 3PXYA 3Q04A 2F7EE 2YM8A 4W8DA 5AWMA 3TV6A 1Q99A 3MY1A 3ATSA 3FQHA 4IDTA 4TYEA 3KXHA 3VUTA 1YWNA 2V5QA 4L00A 4ZSLA 4BB4A 3F2NA 3CY2A 3KK8A 5A4LA 2RFDA 4HCUA 2XIRA 1EH4A 3JPVA 1OIUA 3QLFA 4GFOA 3OBGA 4GT4A 2F57A 3QQFA 4RWLA 4UMQA 4MXZA 4FIFA 2A27A 2HYYA 4XG6A 4FKVA 4FEVA 4YHJA 4J8MA 3AC2A 4BCHA 5LOHA 5KBRA 3E8EA 5HIDA 2RSVA 2W1ZA 5E4HA 3ORZA 3S1HA 2VTLA 2C0TA 3SLSA 4U41A 3OUKA 1P2AA 4JVGA 2W5HA 2JKQA 5LQFA 2YIRA 5E8XA 4ZJIA 5BPYA 5M08A 4NJDA 1QL6A 1JSUA 2XK7A 3OWJA 1Q62A 4X2FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1OB3 A;  3E8N A;  2UW5 A;  4U0I A;  2PUN A;  4DGO A;  4L3J A;  1H0V A;  3VS3 A;  3NVM B;  4DYM A;  4F99 A;  2VN9 A;  1PHK A;  2GHM A;  4MXC A;  5HO8 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4TWN A;  3GNI B;  5HO6 A;  4XX9 A;  2PZR A;  3I5Z A;  2R3P A;  3CSV A;  3KRE A;  4X3F C;  4Y8D A;  4U42 A;  1E1X A;  3TUB A;  4U97 A;  1H28 A;  3MY5 A;  5HD7 A;  1NVR A;  1M2R A;  1Z9X A;  3S95 A;  3OXI A;  3KXN A;  5HBE A;  4QEB A;  2VGP A;  4LMU A;  2PE0 A;  4L01 A;  4EWQ A;  3OXZ A;  3DBF A;  4CYI A;  5HX6 A;  4HVD A;  3NCZ A;  2HAK A;  2XP2 A;  1PXP A;  3HMM A;  3R28 A;  1PRY A;  4CFM A;  3FI2 A;  1G8J A;  5FTQ A;  4YJV A;  4RZW A;  4I6H A;  1PKG A;  2Y8O A;  3AT2 A;  3OW3 A;  5HBJ A;  1Q8W A;  3COI A;  2XIY A;  3VS5 A;  3KF4 A;  1H25 A;  3GU8 A;  1ZYJ A;  4RIO A;  1SNU A;  3RPO A;  3UP2 A;  1TVO A;  3ZON A;  4E4M A;  3OTV A;  2DWB A;  2QOB A;  5JZN A;  4BCP A;  5C1Q B;  2JDO A;  4BFM A;  3IK3 A;  5KHX A;  3W10 A;  4FT0 A;  2I7Q A;  4FEQ A;  4U9A A;  4L52 A;  4Y5H A;  4WNM A;  5D41 A;  3RAK A;  1UNG A;  3EQB A;  4FTN A;  3U55 A;  3DLZ A;  4H3Q A;  2W9F B;  3LVP A;  4FIC A;  3MIA A;  1VYW A;  3QTR A;  3P79 A;  3QZF A;  4UWC A;  4UB7 A;  2WIP A;  5DA3 A;  2WQE A;  4EHG A;  3RCD A;  1Q8Y A; 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 2IJM A;  2OID A;  3BWF A;  4GRB A;  2QOF A;  5ANJ A;  3TNI A;  3QLG A;  4JDJ A;  3OCT A;  3WAR A;  5HIE A;  3VBQ A;  5IH4 A;  2YWV A;  4QQ5 A;  3G2F A;  2EVA A;  4AZE A;  4X6R A;  4D5H A;  2CNU A;  4N6Z A;  4CGA A;  3HA8 A;  5BMS A;  3AT3 A;  1H8F A;  4O0X A;  3RJC A;  4XNE A;  3ACK A;  4IEB A;  4JXF A;  4ONA A;  5HNI X;  1WVY A;  3ORL A;  5GJF A;  3ZCL A;  4IH8 A;  5IA0 A;  4G6N A;  4EH5 A;  3LFE A;  2XAR A;  3R9O A;  2ZV7 A;  5C8M A;  4ANS A;  4CV9 A;  4ACC A;  4ZS4 A;  3MYG A;  3PLA E;  1Z5M A;  3ZBF A;  3UQF A;  5DYJ A;  4LOP A;  3IOK A;  4AW2 A;  4GVA A;  3WE4 A;  3QKM A;  4RVK A;  1PMN A;  2I40 A;  2QOD A;  5M4F A;  3ORK A;  3A7F A;  4PDS A;  2C0O A;  1J7I A;  3FYJ X;  1J1C A;  2C6D A;  4D2T A;  4IAA A;  2XK3 A;  4BR3 A;  4ACG A;  4YU2 A;  4MQ2 A;  3BKB A;  4BDD A;  1G8K A;  4LRJ A;  3N9X A;  3PWY A;  3D7T B;  4HZS A;  5DMZ A;  5H3Q A;  5EM5 A;  4C0T A;  3EHA A;  5J7H A;  4FTJ A;  3UO4 A;  2WEL A;  4K6Z A;  2QCS A;  4ZIM A;  1ATP E;  4ZOG A;  3SAY A;  4RQK A;  3QRU A;  5M4C A;  5FWK K; 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