2O64A

Crystal structure of pim1 with quercetagetin
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
274
structure length
274
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization of a potent and selective small-molecule inhibitor of the PIM1 kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proto-oncogene serine/threonine-protein kinase Pim-1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 274
sequence length 274
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2006-12-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2o64A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2o64A01
2JDTA 3VBYA 4C61A 4ASDA 4ZSEA 3ZLSA 2WTDA 4X2GA 4ACHA 4O27B 4C58A 4XV3A 3UZRA 3BYSA 2ZAZA 4BIBA 4CGAA 1REJA 4IZYA 4HNFA 1ZZ2A 2BIYA 5EKNA 3E7VA 5H8EA 3NZ0A 4BN1A 1AD5A 2WIPA 1M2RA 3D5XA 5L3AA 2C5VA 3NLBA 4AOJA 3EQGA 5BMMA 4YO4A 4DH3A 3WZEA 4UMUA 3VBVA 4G2FA 2VO3A 5TE0A 2C3JA 1Q41A 4K2RA 5CNOA 1YWRA 5EM5A 3ET7A 1KV1A 3BYUA 5IH5A 4PPAA 3PG3A 3KXHA 2BRHA 3CEKA 3I6UA 5G6VA 3EFLA 3E87A 2CHLA 3OWKA 4CLIA 2UW6A 3FSKA 4L7SA 1NVRA 4UBAA 4AWIA 4BYIA 2O3PA 2OJ9A 2P3GX 3PPZA 3L8XA 4A9UA 3KRWA 2PZYA 2YM5A 2IVVA 3AC3A 3QHRA 4U3ZA 3RPYA 3COIA 1YXVA 3ODZX 2W1CA 5AUZA 2F57A 4EZ3A 4ZXTA 2RFDA 1OM1A 4BCOA 1ZOHA 2VTMA 2R7BA 3ZUVA 5HVKA 4NJDA 3EZVA 4LUDA 1QPEA 3U55A 3GCVA 3LZBA 4E6DA 5DEWA 4ORKA 4FEXA 5T6KA 1OIRA 4DFXE 1Z57A 3R02A 3D83A 3L9LA 4IM0A 4KBKA 5GIPE 4OR5A 4DG0E 3MI9A 1YOLA 4GVJA 2IJMA 3DAEA 4BIEA 4QP9A 4G31A 3QALE 3IONA 4TY1A 2OJGA 5KHWA 4DFBA 2R9SA 4DBNA 2XJ2A 5HTCA 4ZAUA 2VNYA 1QPDA 4M15A 3EQDA 3BX5A 5CU2A 3FXZA 4AZTA 5HE3A 2B0QA 5AJQA 5ITAA 4QTAA 2VTLA 2ZMDA 3AGMA 5IA0A 1NT2A 4ZTSA 3BQCA 3I4BA 4IC8A 4BCNA 2QCSA 4C0TA 4D2PA 2WQMA 3FC1X 3SGCA 3KMWA 1ZAOA 3PE2A 4OTPA 4WBOA 3CC6A 3K2LA 4TT7A 3VF9A 4FEWA 2HK5A 1DM2A 4LV8A 4QP4A 4WA9A 5C8MA 5I9ZA 1K3AA 2ITTA 5B7VA 3VUIA 3QXOA 4WHZA 5KKRB 2WMQA 4CT1A 3FLQA 5HCXA 3PVUA 3NVKI 2ACXA 4LRJA 4RIXB 1BL7A 3KXNA 4F08A 4QMWA 1FBNA 2WMBA 3ZCLA 4JDHA 2VU3A 2I0VA 1BLXA 1A48A 3SXSA 3NNVA 5J95A 3I5ZA 4D1XA 4YJRA 2X8EA 4KIOA 1ZYJA 4UY9A 4DH1A 5A9UA 3WILA 1MQ4A 4Y46A 3ZMMA 4L67A 4O0TA 3G51A 1OECA 5HD7A 5CNNA 3WZUA 4BL1A 3R00A 4QMTA 3P23A 2RGPA 4JVGA 5E91A 3LFDA 2ITXA 4FBXA 4GG5A 4RWLA 4G9CA 2PVHA 2BRBA 3EN6A 2QR7A 3LXPA 3ZM9A 4FV5A 3ANQA 2CNQA 2OFUA 4L3JA 2PZPA 3EQBA 3GQIA 2JIIA 2UVYA 4ALVA 1JQHA 2BRMA 2XNMA 1RJBA 3ROYA 3ZU7A 4ANNA 4ANOA 1XJDA 5CT0A 4XP0A 3IW4A 1OPLA 4TWOA 5AUVA 4BWKA 2YISA 3NUXA 1XH7A 4QMPA 5HO6A 3VRYA 4BGQA 4Q2AA 4FL3A 2VWWA 3ENHA 3DBEA 2Z7SA 4RIYB 5AM7A 2DQ7X 5A6OA 4U9AA 4RC2A 3ZC5A 4FZFB 4FUYA 4FZ6A 4EEVA 1QMZA 1GIJA 3ORMA 4FI1A 2XKCA 2W7XA 5EFQA 2ZM4A 2I1MA 4LFIA 2B52A 2XNBA 4LL0A 1FMOE 2AUHA 4X2FA 2YJSA 1Q8WA 1ZOGA 3ATTA 2C6DA 3TZ9A 1BX6A 1S9JA 2GNLA 4R7IA 3DJ5A 2WELA 4YZCA 3TJDA 2YWVA 5ANEA 4O7SA 3T9IA 1MUOA 4F63A 2F4JA 3EQRA 4NM5A 2Z60A 4JQ7A 3LFEA 2P2IA 1ZY5A 4FG9A 4AT3A 3QQLA 5DGZA 5DIAA 3RAIA 3RVGA 4EQUA 4DF3A 2XIKA 1DI8A 4PMMA 1FQ1B 1JSVA 4PL4A 3R8ZA 2ZDUA 5AUTA 4BKYA 4FE2A 2OIDA 4QYYA 3WZDA 3OG7A 2V0DA 4Y73A 3RNYA 4J8NA 3ZUUA 5BVKA 5H9BA 2REIA 3U6JA 3E8CA 4M66A 3R71A 5ANDA 4BHNA 3R1NA 5FQDC 4I6FA 2EB2A 5TOZA 3BHYA 3RGFA 4DAWA 4EUTA 3KXGA 1FOTA 4YJVA 2WNTA 2VZ6A 5CF8A 4ALUA 3UPXA 3IOKA 3QQJA 2X4ZA 2GNHA 4O1PA 3G2FA 3CXWA 2GTMA 3VBWA 5EOLA 5CU0A 4JAJA 3OEFX 4V05A 4EI4A 4EWQA 5ANJA 4MXZA 3IDCA 4FR4A 4U81A 4DEBA 5DA3A 4EK6A 4DA5A 2PYWA 4XHKB 2J51A 3C7QA 3RWPA 2HENA 5FRIA 3OEZA 2YM7A 3PSBA 4FV4A 3CR0A 2UZTA 4GMYA 3V8TA 5E90A 4ZY4A 4TXCA 3W2SA 5L2QA 4X2KA 3WOWA 4YC6A 3CP9A 4M3QA 4QTCA 3FUPA 2C6KA 4I3ZA 5A14A 3RI1A 4QMSA 2YDIA 1DAYA 2WTCA 3FBVA 3UTOA 5FXQA 2YCRA 4GUEA 5H2UA 2BRNA 1PMUA 2F7EE 4YLLA 2UZLA 2JAMA 3LQ3A 2BCJA 2OK1A 4R1VA 3GGFA 3MV5A 2GNFA 5KMOA 2VWXA 3GU7A 4AW1A 5M07A 3TN8A 4RPVA 3BYVA 2B9JA 4KIQA 4M69B 3CKWA 3MDYA 5CAPA 1OUKA 3DFCB 3MJ2A 5M55A 5KKRC 5M51A 1UNLA 3IGGA 4IACA 2W4KA 5C27A 3O50A 4AF3A 1KOBA 2WMTA 4W8EA 4X3FA 3IDBA 4TYIA 4GFMA 1Q24A 4JI9A 5I5ZA 4FODA 3BU5A 3KF7A 2R0UA 3KF4A 4OTDA 5CTPA 1GZKA 2C5YA 4HGEA 4JBQA 2VD5A 3QD4A 3RHKA 3NW6A 3UJGA 4IZ5A 2HELA 5FEQA 3VJNA 5D1JA 2ZYBA 3POZA 3AOXA 4QYGA 3BU6A 3NCGA 4DTAA 3GT8A 4EOMA 5DLSA 5DVRA 3FL4A 1OKZA 5IQDA 4MVFA 2XEZA 1U46A 1PYXA 5D10A 3VAPA 1WVWA 1UU8A 4BZNA 5J9YA 3R83A 4F70A 2CN8A 3LJ0A 2W1IA 2OZAB 3MVLA 4QOXA 4WG3A 3VS3A 2WMVA 4AA5A 5JK3A 5AMNA 5ACKA 3MJ1A 2YM4A 3OCTA 1YXXA 3E8DA 4XJ0A 4M97A 1MRYA 5IH6A 5KMIA 3MIYA 2QNJA 2VAGA 2VWYA 3DK6A 3MFUA 3VVHA 4LRMA 2R3PA 4EOQA 4KNBA 5C9CA 4P5QA 1P4FA 4IDVA 5IF1A 2X8IA 3HAVA 2HOGA 2AC5A 4UB7A 5AIKA 5C26A 3PUPA 4ZMEA 3DKCA 1OL5A 4DH8A 3KVWA 3W55A 3LXKA 4AZSA 2A2AA 4ZS0A 3GB2A 5IUGA 4V01A 5JN2A 3NS9A 2I40A 3FSFA 3EQIA 4ARKA 1H1QA 2OIBA 2RIOA 3D0EA 3L9PA 2F9GA 3EOCA 3NX8A 4NKAA 4QYFA 4AE9A 4GIIA 3VRZA 3ZM4A 4E4MA 4KS8A 2GDOA 4BDFA 2XK3A 3TV6A 3K5UA 4X0MA 5AWMA 2VTSA 3OOMA 5D11A 5HG9A 3C4ZA 2B4SB 1SYKA 3MPAA 5KO1A 3W16A 2VTRA 2ZOQA 4P7EA 3QA0A 3JY9A 3QD3A 2J0JA 2UZEA 3QQFA 4CMUA 4RX8A 5H8BA 4AW2A 2PZ5A 4XX9A 4BB4A 2QHNA 4O2ZA 4QP2A 3E7OA 5HCYA 3QQKA 1Q3WA 2J0KA 3LPBA 3UOJA 2BZJA 3KCKA 3FLNC 5L8KA 4IEBA 3BE9A 3OF0A 2UZWE 2GHMA 1W0XC 3LVPA 3Q4ZA 4PTCA 5J5TA 5L8LA 1VEBA 2X39A 4LL5A 4AW0A 2X1NA 4FTIA 3PXZA 1PJKA 3OZ6A 3SRVB 4U97A 5IA5A 5IDPA 4CLJA 4RSSA 4E1ZA 4KBAA 2EWAA 4L7FA 4PPCA 3Q6WA 5EHYA 1NXKA 2WMUA 1IASA 4GK4A 2CKOA 4BBEA 2E2BA 4ZLOA 1ZYDA 3FC2A 4N4SA 2CKPA 3BYMA 4OBQA 4Y5HA 4YSJA 1OKVA 2YABA 3AD4A 4C2WA 1IG1A 2ONLA 3FI2A 2XCHA 4MHAA 1KOAA 4G1WA 4IADA 5EDPA 2XRWA 5CENA 5A4TA 1J7UA 3AD6A 2E9OA 2OSCA 2X0GA 2BVAA 3PXFA 1OGUA 2I0YA 2OJJA 4UV0A 4YO6A 5AIRA 2QO7A 4G3EA 3GU6A 3V04A 1JKKA 2JDVA 5ANKA 3Q32A 1Z9XA 2ZV7A 2I0HA 2PMNX 3IW8A 4FV2A 3E8EA 3OT8A 3QXPA 5DBXA 4FA2A 2YIXA 5KE0A 3NMUF 2QO2A 3FQHA 4H39A 3ORNA 4L43A 4RA5A 4J53A 3UODA 3THBA 2G2IA 5LCJA 4FIFA 3W1FA 4EUUA 3PDTA 3DB8A 4FX3A 3QKMA 3SA0A 3GC7A 2PY3A 3HMNA 2WTVA 3R7VA 4BDDA 4M12A 3W8LA 1H0VA 2V5QA 5IH4A 2C5NA 3DZOA 4ZSLA 3T3VA 3UC3A 3ZLWA 4RX5A 4MF1A 5A4CA 1OIQA 3DS6A 1WMKA 5FTQA 2X6EA 4XS2A 4AFJA 3S4QA 2C3IB 1KSWA 5AP2A 5FEDA 5HESA 4EH3A 1NW1A 3VULA 3EQPA 2V7AA 2WOTA 4IHPA 5IQIA 2VNWA 5EM6A 2UV2A 3PE1A 3RAWA 4ACDA 2CGXA 4CFFA 3VNTA 3UG2A 3DGKA 3UIBA 5JFSA 3RINA 3Q3BA 2JIVA 4E6AA 3UGCA 5EM8A 5AAEA 5K5NA 3GU5A 4BCPA 2J5EA 4FIJA 2I0EA 5EH0A 4CD0A 2ZMCA 2PZIA 2IPXA 2ETKA 1JNKA 3C13A 3KQ7A 1NVSA 5GJDA 3G0EA 4IXPA 4R7HA 4LOOA 4JL9A 2CLXA 5M53A 1PXJA 4O22A 4YR8A 1E1XA 4KKGA 4XG9A 5JRQA 2OW3A 5IQHA 3DNDA 1ATPE 3PVWA 5E92A 4LYNA 4OTRA 4U7ZA 2X7GA 1PHKA 4W4YA 3TNIA 2R3JA 3C4WA 3QTXA 4CCUA 3R2YA 3EFWA 4EKKA 3FE3A 3OT3A 4JT3A 4WIHA 2ZB1A 5C8KA 5DR6A 3TZMA 3OCSA 2GFCA 3BBWA 4AXAA 4CQGA 3EN5A 4Y95A 4CFWA 2VX1A 4E4LA 1SM2A 2BRGA 1KV2A 2C6IA 4FICA 3CQEA 1ZYSA 4NJ3A 1UVRA 4NM0A 2VO0A 1OBGA 3OP5A 3PJCA 4ZZMA 3FYJX 4I5PA 4EH8A 1H1SA 3PXQA 3NYXA 4BRXA 5BMSA 3DT1A 2OU7A 3ENMA 3Q6UA 5EW8A 3R04A 4XG8A 1XO2B 1YQJA 4O96A 4KIPA 2BPMA 3RAKA 1CM8A 2CGVA 1F5QA 3BGZA 1PKDA 1U5RA 4JX3A 5CS6A 4FTUA 3LLTA 4RLLA 2GFSA 3LMIA 4R78A 3NUSA 4K18A 2PVKA 3ZO4A 3TDWA 2QOHA 3SW4A 3TWJA 5ICPA 1PMEA 4WD5A 5HX6A 4C4EA 3QZIA 5H8GA 4R7BA 3BGPA 4TWNA 5ETIA 5DR2A 4BKZA 4FKOA 1LPUA 4QQJA 4AQCA 3A60A 4Y83A 2XIZA 5AR8A 4MQ1A 4H1MA 2OXYA 3R30A 3QTUA 4DEHA 2QG7A 5DN3A 3RALA 4ONAA 3DK7A 4IAIA 4D9TA 2CKQA 3GXLA 3NYOA 4KBCA 3WF8A 2W5BA 3Q4CA 3VQHA 5BYZA 4FUXA 4C4GA 2W4OA 3F2RA 2C0IA 4YJTA 4FTOA 4BKJA 4CFNA 3WE8A 3TIYA 3ZFXA 3KB7A 2YLEA 3S00A 5B2KA 4HYIA 3Q2MA 2OI4X 3D2IA 2DUVA 5IMEA 3VS0A 4JR3A 4ZLYA 4QMXA 4YHJA 2YZLA 3JY0A 5DEYA 4I1ZA 3GCQA 4O81A 3PA5A 3F5GA 3R0TA 3UP7A 4U44A 4BC6A 4YC3A 4FKLA 5GJFA 5LARA 3E3PA 5D12A 3G6HA 4MAOA 4MEDA 4NIFA 3P0MA 2R2PA 4HW7A 4EH4A 2OBJA 3BRBA 4MBJA 3CY2A 4PP9A 4F99A 3I60A 4FT7A 2J0LA 4PQNA 5CZHA 5CY3A 2CGUA 2KTYA 5CASA 2PMIA 4UYAA 3COKA 4NWMA 3DZQA 5I9WA 3U6HA 3OUKA 1G8SA 2E9NA 2I7QA 2PUUA 2W17A 2QI8A 3QBNA 3M1SA 3BLHA 4IWDA 3RCJA 5JZJA 3D7TA 1FMKA 4IVDA 4KKHA 4MBLA 5HU9A 3HDMA 5HHWA 3Q9WA 2XNOA 5KCVA 2WZJA 3IPHA 4FK3A 1Y91A 2QOCA 4HYHA 3A8XA 2BFYA 3BQRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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