2OGVA

Crystal structure of the autoinhibited human c-fms kinase domain
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
317
structure length
317
Chain Sequence
KPKYQVRWKIIESYEGNSYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEADLDKEDGRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWALEPTHRPTFQQICSFLQEQAQEDR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The 2.7 A crystal structure of the autoinhibited human c-Fms kinase domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor precursor
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 86
structure length 317
sequence length 317
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2007-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2ogvA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2ogvA01
3EQBA 4BZDA 3P78A 3UO5A 5K4JA 2IZUA 4GK4A 4MXCA 1RJBA 3EL8A 2GFSA 3D94A 4YBKA 5DE2A 4C36A 2X1NA 3GVUA 2YM3A 1KV1A 4IVDA 4ZTSA 4TY1A 3VBXA 2W17A 4DFNA 5IA3A 5JFXA 1G8AA 2PUPA 1JNKA 3CY3A 2ZM3A 3CPBA 5IQBA 4NM3A 2BRGA 4YGAA 2VWWA 3OEZA 4O0SA 4F0FA 2IZRA 4ASEA 4O7YA 3NEWA 4JIAA 3GOPA 4EBWA 2ITXA 4E5WA 2YWVA 3VBVA 4AN2A 3U6JA 2B9IA 2P2HA 3HYHA 3TUDA 3BEGA 2XYNA 4LOOA 4QPMA 4UXQA 4TWPA 4NCTC 5DR6A 4DH1A 4F4PA 5C8NA 3F7WA 2QONA 5KE0A 2OXDA 1PXJA 2ETRA 4O0YA 2FSMX 3R30A 1OI9A 2QVSE 5K3YA 5DNRA 2DQ7X 2VX1A 3RMFA 4AW0A 2PWLA 4FI1A 4IZ5A 5BUEA 2F2CB 4U3YA 5AA8A 3RM7A 4C0TA 5CEKA 1K9AA 5CF8A 5KMNA 4HYIA 1Q8ZA 3U87A 2OBJA 4FKGA 3QTXA 5TF9A 4E4NA 2DYLA 2IWIA 4C3RA 2DUVA 3KMUA 4AW1A 3V51A 3KY2A 4DA5A 2XBJA 2G1TA 3Q60A 4QP9A 2YIQA 2C3LA 2E9VA 2VGOA 3VJOA 4F6WA 5JT2A 2C4GA 2BIYA 3RPVA 3BI6A 1W84A 1WBNA 4G3EA 3CS9A 2X8IA 4PP7A 4QMQA 5M06A 2CSNA 2W7XA 3UIXA 3EQHA 1A48A 2OFVA 3QQKA 5IMEA 4FTAA 2VTOA 2XB7A 4FZFB 4U9AA 4GFOA 2OLCA 4CLIA 3S4QA 4FSMA 3HRFA 5DGZA 2IVVA 3OP5A 3FI2A 4IVAA 3ZXZA 5HG8A 2PVNA 4BYIA 3V8TA 4XHKB 4GJ3A 3W2QA 4HYSA 3DB6A 4I92A 2I0VA 3QFVA 3TJCA 3RALA 3BHTA 4YJQA 4EH4A 5CEOA 5DG5A 4K77A 5D10A 1RW8A 4O91A 3AXWA 3KMMA 2W06A 2WKMA 1TQIA 2RF9A 3D7ZA 3ORIA 5AUYA 1GAGA 4G3DA 3G6HA 1Q41A 5LCJA 5IQCA 5KMOA 3AC4A 4FTTA 4X3FC 5TT7A 1OECA 4G6OA 3CPCA 3JXWA 4BBMA 2B0QA 3PG3A 3V5PA 4RJ7A 1Q5KA 5HESA 5IPJA 2RFEA 5M4CA 4I0SA 5TR6A 4FZ6A 5EM5A 3ZUTA 3G33A 4EJNA 4F9BA 4CG9A 3SRVA 2ERZE 1TVOA 4MF0A 4RFZA 4ANSA 3BX5A 3AC5A 3WILA 4UWBA 4RFYA 2GTMA 1Y8YA 4HVIA 2C1BA 4XCUA 2BRMA 2R4BA 3PJ2A 4O7WA 1OBGA 1R78A 5L6PA 2BUJA 2QHNA 3MSSA 2W1EA 3CE3A 4O7RA 4MXYA 3HA6A 5I0BA 1FINA 5I9VA 3ODZX 3JVSA 3IOKA 3WARA 1E1XA 1W83A 2JFMA 4XG3A 2ZV2A 3B8QA 2W4JA 2WFYA 4RPVA 2VN9A 4GJ2A 2PMIA 2PE0A 3R1QA 4WSYA 3A61A 2XIYA 4WRSA 2UW6A 4Z7HA 4UV0A 3QGWA 1Y6AA 4Y5QA 2X6EA 3QCYA 4PL3A 3FKLA 4I5CA 3KK9A 4RG0A 4E93A 2J6MA 3WBLA 5CENA 5M4FA 2Y4IC 3BCEA 4BFMA 4W4XA 4FYOA 3C9WA 4AU8A 1AGWA 2BCJA 2J0LA 4XP0A 5CY3A 4LGGA 5EHLA 4AA4A 2VWVA 3B2TA 2R3RA 3NCGA 1APME 2UZDA 4PMSA 4DLIA 5IEVA 4YZ9A 5IISA 5M44A 4RJ4A 4PNKA 3F7ZA 3EQGA 1OL2A 5I9UA 2VTMA 4GG5A 4LGDA 3F2AA 4EK3A 2W1ZA 4GVJA 2ITOA 2IW8A 4BCOA 4CTBA 4F09A 5HIEA 5LMBA 3W2OA 1GIJA 5AWMA 3TM0A 4TZRA 5CVGA 4BI2A 3AGMA 1J7LA 2YCFA 3EQRA 5ANJA 4L46A 2Z7QA 5HQ0A 3A7JA 5JFWA 4JR7A 3NNVA 3IW4A 3ID6C 1DI8A 2V62A 3Q4UA 4DT8A 1M7NA 4JNWA 4XG6A 1NY3A 1ZOGA 2WMRA 3SX9A 2BHHA 3BYOA 4OR5A 3ERKA 4I94A 5FM3A 4BR3A 3TT0A 4HCVA 3ULIA 3P79A 2A1AB 1ZLTA 3MJ1A 4EH6A 3O17A 3EZRA 4IJ9A 2OZAA 4QTDA 3WZJA 2HIWA 1AD5A 4KS8A 5GJDA 4JX7A 1JKSA 1H0WA 5FUTA 2R3PA 3WOWA 2WGJA 3ZC6A 4XV9A 2PSQA 4QMMA 2IVTA 5BVFA 4A9SA 2XKDA 4DGOA 2Y4IB 4RIXA 5CI7A 3BLQA 1OPKA 2JAMA 3GU5A 3AC2A 5CEPA 1YHVA 3F66A 1JLUE 3GP0A 4LRMA 4B8MA 2QOKA 5HHWA 2GU8A 2WTIA 4EK6A 5KMJA 5IKWA 2GPHA 3MH3A 2X2MA 5A9UA 4K8AA 4H3PA 5AP7A 3V04A 2X7OA 3U9NA 1SNUA 2AC3A 2IVUA 3DXQA 3F6XA 3P23A 3DT1A 5AP6A 4AP7A 4A9TA 4GU6A 3GFWA 3PP1A 4I24A 4X0MA 4B9DA 2Z02A 4IVBA 4Q9ZA 4DEBA 2YCQA 4O0WA 2IPXA 4BDDA 3CTHA 2ETKA 4RZWA 4YJSA 4E6CA 5LXMA 3BGPA 1UVRA 3LLTA 3PIZA 3VHKA 3U6HA 4IXPA 5I3RA 2XJ0A 4KSPA 4F64A 4XUFA 3GNIB 1YW2A 4II5A 2QOIA 3P0MA 4RA4A 4YTHA 3PPKA 5EYKA 2QURA 3W55A 3PG1A 3ZOSA 4YPSA 4ZJJA 2GQSA 1W0XC 4FKIA 2WMVA 5CEQA 3F2NA 3LFFA 4BC6A 4BTFA 4QQCA 2BHEA 4FBXA 3K3IA 2RSVA 4RFMA 3KQ7A 1OGUA 4ZZOA 5BVOA 4DEGA 3QHWA 4OUCA 2C5OA 2YDJA 2X7GA 3EQPA 4IZYA 4PPCA 2W5AA 2W1HA 2AYPA 2PZPA 2QHMA 4GYGA 2Y7JA 3HDNA 3NR9A 1M14A 2UW7A 2FH9A 4XYFA 4FIIA 4BDIA 5CF4A 4IB1A 2BILB 2YIWA 4G2FA 5BNJA 3Q96A 4O2ZA 1F3MC 3VUKA 4CNHA 4C34A 4NYEA 1U5QA 3OT8A 4FIJA 4FEVA 3ANQA 4AA5A 4D4SA 1B38A 3OD6X 4RX5A 2GNIA 5CQUA 3VAPA 5HTIA 4QTCA 4W9WA 5CNOA 3PDTA 1ZY4A 4GW8A 1PXNA 4GH2A 3LFEA 5E8VA 1IAJA 3OMVA 2Z60A 3CJGA 4L68A 4CFFA 2ZV8A 3CTQA 4I23A 4RC3A 4Y83A 4EH9A 3R73A 4BHNA 4QYHA 5IQFA 4YZMA 3C4ZA 2RL5A 4E4LA 3QUDA 3T3VA 2PPQA 4IADA 4EK4A 5AP3A 4W4YA 2NRYA 2W1IA 3OUKA 3PIYA 5BYYA 3FMHA 4W4WA 2G2HA 3QWKA 3MFTA 3R2BA 3DBQA 4FEQA 4ANOA 2OXXA 1FGIA 3HMOA 1ZZ2A 3LJ2A 4O6LA 3FLSA 3HL7A 2X4FA 4MWIA 5HKMA 3ZEPA 4ENXA 4RVLA 3DDPA 3VUTA 3CC6A 3HVCA 4QTAA 4GS6A 1JKTA 4I5MA 4JAJA 3NWWA 5EHYA 3GCQA 4YLJA 5CASA 2PULA 3BGZA 3MH2A 3RPYA 2CGUA 3UZPA 4L01A 5E8YA 4I20A 4AE9A 2OICA 3ZFYA 4EBVA 4P5QA 1FMOE 3KRXA 4FICA 2F7ZE 2R3MA 2ERKA 3DQWA 4ANQA 3QTUA 1CM8A 4D1ZA 3D7TA 3RK5A 1H1SA 3DV3A 3RZFA 4ASDA 2WTKC 3C7QA 2XM9A 1WZYA 1XBAA 3DOGA 1OIUA 3HV5A 4LG4A 5LVMA 2YHVA 3C0IA 4KIOA 2JIIA 4JG6A 1ZXEA 2W05A 3KXHA 3MA6A 3LQ8A 5EKNA 2R0IA 5J87A 2JD5A 2CKPA 3A8XA 3RCJA 4A4XA 2OF2A 3E64A 2OJJA 4EKKA 5M4IA 4TRLA 5EYMA 4LOPA 2O64A 2GHGA 2XK6A 5JQ8A 3ZC5A 1UNGA 2RG6A 2UZWE 4EH5A 4FSYA 4IANA 3G9LX 3D0EA 4D9TA 1Z5MA 4HGLA 1DAYA 5F94A 4IH8A 2VAGA 4L3JA 4QP8A 3IECA 4BN1A 3BYUA 3VIDA 4ZSEA 4U3ZA 4BKZA 2PMOX 3H30A 3OWLA 5JFSA 3IG7A 4PDSA 4MX9A 2I0YA 4JVGA 5B0XA 5IU2A 4C4HA 5KKRB 1PF8A 2OZOA 5IG1A 4J7BA 2C3KA 2R3OA 3R02A 3TZ8A 1NXKA 2Z7LA 3SLSA 3NNUA 2WIPA 5M51A 3VUIA 5HIBA 4MTAA 5JGAA 4XBUA 3N4TA 4EK5A 4FT0A 5IEXA 2VNWA 4WUNA 3EKNA 4ALVA 2YAKA 2OH4A 3TJDA 3EFKA 4EHVA 2CDZA 2XRWA 1JOWB 3PSDA 2W1CA 5DT0A 3RAHA 1IA9A 5GJGA 2DS1A 2VTPA 3D9VA 4W8EA 4K0YA 5D7AA 4G1WA 4JQEA 4LGHA 3R9RA 3LM5A 1H01A 4PL4A 3BYSA 5GHVA 4AACA 4ZSJA 3LQ3A 4ORKA 1HOWA 4CT1A 1KOBA 2YIYA 1JSTA 4KIPA 4NW5A 5CT7A 4I4FA 3UE4A 4WNKA 2Y6MA 3QALE 4XLVA 4S34A 3OT3A 3DZQA 5CZHA 4AZTA 5CLPA 3ORLA 3VULA 2Z2WA 4FNWA 4ZLOA 2J0IA 3G0FA 4WIHA 4CQEA 5IA2A 3MTLA 4MCVA 2J51A 3CGFA 4PTCA 3ZO1A 3VRZA 4V0GB 4TXCA 4IC8A 4ACMA 4RIWA 4IDTA 3ATSA 1XO2B 1GZ8A 4JOAA 3GC8A 4ZS4A 4RLLA 1IA8A 4R8QA 3PVGA 5LJJA 4FE2A 5HTCA 4AZFA 3G2FA 4M12A 2BTRA 4LYNA 1YHSA 2WQNA 5CF6A 3RP9A 4PDYA 3G51A 4QMOA 4ANMA 2VO7A 4FX3A 1YWNA 5LARA 5AAFA 4FGRA 3P1AA 5JN2A 5DFPA 4D9UA 1BL7A 1B39A 3E5AA 4XBRA 2PVRA 2XIZA 2J50A 5BX0A 5CF5A 5AP1A 3V01A 4BCKA 4A07A 3MY5A 1Y57A 3I7BA 4O83A 1OZ1A 3FLNC 4RJ5A 3RNYA 4QMNA 3FYKX 2UW8A 5FDXA 3TI1A 5E1EA 2ZYBA 4J97A 4NFMA 5HD4A 3LCDA 5L8LA 2ITZA 1MQBA 3REPA 2B1PA 4FTUA 3R9DA 4LL0A 1W7HA 2ITQA 3D5VA 3EL7A 5ETIA 3NYVA 1KOAA 4OGRA 3E8CA 3U51A 4GCJA 1PXPA 2UW0A 4O0TA 4UBAA 5ACBC 1P14A 3Q4ZA 4GK3A 3TKHA 4M13A 1X8BA 2HZ0A 4FKUA 2GHLA 1MUOA 3COKA 4TPTA 4UXLA 3AMYA 4QP7A 3NUAA 5LVOA 4H3QA 4MAOA 4A06A 4JAIA 3LKMA 1YOLA 2EXMA 2JKOA 4GFGA 3IGGA 5AR7A 3VS2A 5AUUA 3BLRA 4XG8A 4ZXTA 2PU8A 4H1JA 2A0CX 2KULA 3TNHA 3ZBXA 3W8LA 3WIGA 5J1WA 1VYZA 4FTQA 3B2WA 3QC9A 5BPYA 3NSZA 4O7VA 1JQHA 2VO0A 2OJ9A 3K54A 4KAOA 1FBNA 1BYGA 3M1SA 1H00A 2P4IA 3PPJA 5F9EA 3WYYA 3OXIA 4MKCA 3F82A 2CNVA 5HX8A 3V8WA 3EHAA 3A7FA 4RWIA 4D0XA 4EEVA 5AR5A 3DBFA 4U6RA 3GEQA 3Q4CA 3JR1A 2HY81 2XK8A 4NJ3A 3KRRA 4BCGA 3FZPA 3QL8A 4QMYA 3UG2A 1JKKA 3UMWA 4O82A 4TL0A 3BU3A 4C2WA 2O3PA 4FT5A 2UZNA 3MPAA 5CT0A 5L2IA 2G9XA 1SNXA 2V5QA 2JBOA 1PYXA 3IDBA 3C51A 3BPRA 3O50A 4FOBA 4N6ZA 1H1PA 2VRXA 4HCUA 3NAYA 3D2KA 2Y0AA 3Q9ZA 4QNAA 2XIKA 2QI8A 3SRVB 3WF6A 2BDFA 3BV3A 4XG4A 3WIKA 3LMHA 4CLJA 4L3LA 3R7UA 3KRWA 4RX7A 3ORKA 3HP2A 4QPSA 4ONAA 2PUUA 4DTAA 4ZTLA 3QXPA 4HJOA 1PHKA 5A4EA 5HCXA 4JBOA 3VS7A 4RWKA 3SD0A 3UQGA 4OTRA 2XNPA 3QTQA 1M52A 4WG3A 4KD1A 3OHTA 5HVYA 2G01A 3NIEA 5KCVA 1OB3A 2XEYA 4YZDA 4E4XA 3GENA 4WOVA 1A9UA 3CLYA 5TOZA 3QTWA 3FUPA 4CEGA 2O5KA 3DFCB 4Z3VA 3ZZEA 2VTRA 5KNJA 2JDRA 4BWKA 4IAYA 3BLHA 3COHA 5BVWA 4HNIA 4H3BA 4MD8E 4FT9A 4FV9A 4BIEA 5IDNA 1IAHA 3MESA 4MK0A 4D0WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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