2OGVA

Crystal structure of the autoinhibited human c-fms kinase domain
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
317
structure length
317
Chain Sequence
KPKYQVRWKIIESYEGNSYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEADLDKEDGRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWALEPTHRPTFQQICSFLQEQAQEDR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The 2.7 A crystal structure of the autoinhibited human c-Fms kinase domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor precursor
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 86
structure length 317
sequence length 317
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2007-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2ogvA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2ogvA01
2BAKA 4G2FA 4BIEA 1J1CA 3A62A 2UZNA 2ZV7A 4PTGA 5JGDA 4RIYA 1UKIA 2J4ZA 4QNAA 3VS2A 2CNUA 4WKQA 1XKKA 4LUEA 3FI4A 2W1HA 4M7IA 3FL5A 2WMBA 4QP6A 5CZIA 4AN9A 2PVMA 2OZOA 4D55A 5A4QA 3FMNA 5AWMA 5GHVA 3PYYA 4S30A 2W05A 3Q60A 1M2QA 2GHMA 5KMOA 3FSKA 1Q99A 2O65A 4NH1A 3KF4A 2PVKA 3UE4A 3VC4A 3SW4A 3PVWA 4YLKA 3PRIA 1K3AA 2ITZA 2WD1A 4ENXA 5LQFA 3MESA 3L8PA 4D1ZA 3I4BA 4PNIA 5HBEA 1OKVA 3W2OA 5DYJA 2WXVA 3G9NA 2GTNA 4HOKA 2FSLX 2CCHA 3ZUTA 1AD5A 4Z9LA 4QMZA 5DFPA 3UZPA 5K9IA 3HA6A 2JAMA 1H27A 3KULB 4KIKA 2OZAA 4QMUA 3JYAA 3TNWA 2C47A 1PXOA 2BMCA 5DRBA 2O63A 3ZONA 3Q2JA 2E9VA 2F57A 2RKUA 4TRLA 4F09A 3QKLA 4ALVA 5HE2A 3F82A 4L3JA 3SA0A 2R2PA 5A54A 3U9NA 4KBKA 3L9NA 5LMAA 4HYSA 3GI3A 3F2RA 2FVDA 3TJDA 4A9TA 1H01A 1QPCA 2YEXA 4FVRA 1M17A 2YCSA 3QWJA 4EC9A 2W1EA 3L8XA 3VNTA 2ZV2A 2C6DA 2R3KA 4M84A 3F3WA 2IW9A 3U4UA 2G2HA 3PJ2A 5DR2A 1XH5A 4H3QA 4PDPA 4ZSGA 3COHA 3NYXA 3GT8A 4K0YA 4KRCA 4FUYA 2W4OA 4I20A 2GQGA 4RMZA 3R8ZA 3ZC5A 4LFIA 2C3IB 3IW4A 3FLQA 4I41A 4WO5A 5DBXA 4ZSEA 4MQ1A 4LG4A 5BYLA 4AF3A 4TNDA 2UW0A 4YC3A 4EOJA 1EH4A 1OITA 3BU3A 1P4OA 3NIZA 2UW9A 4M68A 2W4KA 4QMQA 4Z7GA 1OL7A 2WTKC 4IB1A 5CXZA 1LUFA 3W33A 3TUCA 2ZAZA 5J1WA 4IWDA 1FBNA 4S33A 4A9RA 5CSXA 4G6OA 5B7VA 4BDDA 4NK9A 2C5YA 3RWPA 1WMKA 4GV1A 4JDKA 4TXCA 3UO4A 2R3NA 5HCZA 1JKLA 1KV1A 3R71A 2BZHB 4GG5A 4C2WA 4FIJA 4ORKA 2HZNA 4X3FA 2BROA 2H9VA 4R7BA 3MS9A 4KIPA 4HCVA 5ETFA 3BYMA 2BIYA 2C1BA 4YGAA 4BHZA 3TIYA 4EZ3A 2YZLA 1LR4A 5IMEA 2YJSA 1ZOEA 4EH6A 4LRMA 2HZIA 4MF0A 2XBAA 5F94A 2GNHA 5I9YA 2F7EE 2XA4A 5KBRA 3BEAA 3V5PA 3ROYA 5BVDA 4GEOA 4GW8A 3KEXA 3PJCA 2W1FA 5A4TA 4DFUA 1PW2A 3FMLA 4IZAA 4X21A 2XVDA 2C6LA 3EFWA 4FTIA 4A4LA 3DFAA 3SG8A 5ITAA 4YMJA 3ATSA 4G3DA 4D2PA 3UPZA 5EHLA 3LQ3A 4TW9A 1JKTA 4MNEB 2UUEA 3PJ8A 3WE8A 2UW8A 3E8EA 4WOVA 3I0OA 5DHJA 5FXSA 3HUCA 4GS6A 3W32A 4C4GA 4FBXA 3F2AA 4AW0A 2Q0NA 4CTBA 3EH9A 2I6LA 3TKIA 3W55A 4U9AA 4QMTA 5K5XA 4GRBA 4IB5A 4O27B 4YO6A 2RL5A 3I6UA 5EHYA 4EKLA 1UWJA 3R22A 4V01A 2YABA 3ZZWA 3OY3A 5ANOA 4ZTQA 3QRKA 4W4WA 1VYWA 2VRXA 2WMRA 2B53A 4IM0A 4P4CA 1K2PA 2ITTA 2X7GA 2QKWB 3MPTA 5EHOA 2XYNA 4TKSA 3D9VA 3DJ6A 1NVSA 3OTVA 2QCSA 4RZVA 3VS3A 3F2NA 4DT8A 1H1WA 2WAJA 3QALE 3CC6A 3WZUA 2VX1A 4K11A 4XJ0A 2CLQA 1HCKA 2B52A 4G3GA 4AU8A 2F2UA 3FWQA 5HVYA 2XBJA 4XG6A 4YZMA 3Q5ZA 3W2SA 3V5JA 2ONLA 3S4QA 4WG3A 1Y8GA 5C1QB 3C4ZA 5D10A 3ALNA 4AX8A 3CGFA 3HLLA 3TTJA 4ZJIA 4XG8A 2XK8A 4EEVA 5CAPA 4IX3A 3ZDIA 1YHWA 1YW2A 3GFEA 3KMWA 3KRWA 2C68A 4HCTA 1BLXA 2JFMA 4F1TA 3E62A 4O7SA 2GDOA 4JBOA 3REPA 4XG4A 3LM0A 2C6KA 4OTWA 5BVKA 4ANMA 5IQCA 1JVPP 3QCSA 4FT0A 3TNQB 4FZDB 4JDJA 2WMTA 3LFCA 4DGLC 4E5AX 1BYGA 1IASA 3QTQA 4WRSA 2PMNX 1W82A 3WYYA 4E93A 5IKWA 4BTJA 4RJ6A 2JKOA 4FKUA 3JY0A 2XNPA 1Q97A 2VX0A 3VIDA 3QTUA 1R0PA 4EC8A 3QTWA 4FV9A 4HZSA 1L3RE 1Q4LA 2VWIA 2VX3A 3PE2A 2VTQA 2W99B 4RBLA 3ZFXA 2DYLA 4N6ZA 4L3LA 5ICPA 4XUFA 2CKOA 3VULA 2O3PA 3KQ7A 3TWJA 5AR4A 4MXCA 1XBAA 4FTUA 5IA4A 4PF4A 1M7NA 2BRHA 4LOOA 3UIMA 3CEKA 4EHEA 3HX4A 4EH7A 3DAKA 4TN6A 4TT7A 2R5TA 5EM6A 4AP7A 4EHVA 2OJFE 1GZ8A 2PVJA 3SGCA 4Q2AA 3LXPA 3R02A 2F49A 2VTAA 5EM8A 4IACA 3PVGA 5AX3A 4DEBA 4D2WA 2OW3A 3CD8A 3R1SA 4NKSA 5HU9A 3F5PA 2IJMA 3ATTA 4Y95A 3SD0A 1XH7A 3OWJA 4K9YA 3RTPA 4EH4A 3HA8A 4ZLOA 4JLCA 3DT1A 2C5NA 2UZVA 3MVLA 4E7WA 3A8XA 2XNBA 1URCA 3UODA 3DK6A 5CF6A 4QPMA 5L8KA 3PPJA 4MXOA 2IW8A 4FNZA 4IVDA 4FEVA 2IN6A 3O7LB 1MQBA 5HO6A 3RPVA 4C35A 2IZTA 4IHPA 5AV3A 4EOSA 2BDWA 4BI0A 3ZSHA 4EK6A 3NAXA 3PIYA 4H1MA 4TL0A 4RFZA 5FXQA 3ANRA 4DEAA 5K5NA 3BHVA 1CSNA 1H25A 3WF5A 5M09A 4D4YA 5IUGA 1WCCA 2B7AA 1ZOHA 3PRFA 4WT6A 3DBCA 1WBPA 5IISA 5JRQA 4JQEA 4KSQA 2VWZA 4F9BA 5CAUA 5IQGA 3W8QA 2A19B 2ZV9A 4C34A 3ET7A 3BQCA 2QVSE 2FSMX 3E3BX 3BLHA 2WTCA 3OUNB 4B9DA 3UP7A 5M4UA 2QOQA 3OROA 4WRGA 4BCQA 4XOYA 4D5HA 4R1VA 2OJIA 4ERKA 3BBWA 4U43A 4YZNA 4EQMA 4EUTA 1IAHA 4KKEA 3CD3A 4IX4A 2QNJA 3RKBA 1V0OA 2IZSA 2XF0A 3H9FA 4I4EA 2CKPA 2EU9A 4OT6A 4B6LA 3EWHA 3F7WA 4QP2A 4FV5A 4DG2E 2Z02A 4ANBA 4EORA 2GNFA 3QRJA 4FGRA 4MK0A 3RPYA 2ESMA 4J7BA 4L9IA 1WVXA 2XNGA 3OT3A 4F7NA 4UMRA 2C3JA 5CU0A 3OS3A 3FPMA 5CF4A 4IDVA 5AM7A 3HDNA 4BCMA 4C4JA 4O7RA 5EYKA 5ANDA 5AIKA 4L7SA 1Y6AA 4V04A 4C62A 4WUAA 2BHHA 3E3PA 3GOPA 3IG7A 1OPKA 4O0VA 3LLTA 3QRTA 4FEXA 3CSVA 3PIXA 3UIUA 4K2RA 2ITNA 4RFMA 3NYVA 2JLDA 1ZYLA 5C4KA 5IPJA 2BR1A 2OH4A 2BRNA 4HCUA 2J5EA 1U59A 2W1CA 1YWNA 4EH8A 4PNKA 2W7XA 3LFDA 5HO7A 2W96B 1P5EA 5IQBA 4IWPA 4O0WA 5JZJA 3ZUVA 4BZNA 4IM2A 1KOBA 4BHNA 2RFNA 4FKVA 1XH4A 2VUWA 4KBCA 1UKHA 4QTAA 3NYOA 5FBNC 3TV4A 4R5YA 4WG5A 2XUUA 4UYNA 1YHSA 1G8AA 2XP2A 4UV0A 4EZ5A 4W4YA 4QQTA 5L2TA 2OJ9A 1WVYA 1G8SA 4QD6A 4CFNA 1SVEA 2EXEA 2HYYA 4OBOA 2HY0A 5E8UA 4A7CA 5I3RA 1OKYA 1R0EA 4HGEA 4R1YA 2YCRA 1TQMA 1U4DA 4KIQA 4MWHA 4RPVA 2C6MA 3RI1A 1O6KA 3M11A 4I5CA 4GJ3A 1ZWSA 5FG8A 4I6FA 4XP3A 4WHZA 5HLPA 2B9IA 3QC4A 3KRJA 1R78A 2WQBA 3D7ZA 4BDKA 3GC9A 2IG7A 4O86A 2GNJA 1W84A 2YFXA 5ANIA 5ACKA 2HWOA 5JFSA 4NTTA 3VUGA 2W5BA 3QCQA 2AC3A 2WTIA 2XNMA 3OY1A 4M67A 1IG1A 2QR8A 4U5JA 4YNEA 5EW9A 3R63A 4DH8A 1OUKA 4TPTA 5E90A 3IDBA 3CIKA 5AIRA 4I23A 5B2MA 1YXTA 2YIQA 4FSUA 3Q9WA 3GU6A 1Y6BA 2X81A 3NVMB 3O0GA 2XK7A 3C0GA 2BILB 2RFSA 2Y6MA 3A7JA 1FMOE 3NCZA 4MBIA 3LFBA 4PDOA 3MB6A 4RJ8A 1YQJA 1WBTA 2E9OA 2XRUA 2C4GA 3HMNA 1QPJA 2OK1A 4LL5A 4UXLA 3R0TA 2YDKA 5HE3A 2YCFA 4KB8A 4RIWA 3QGWA 2UVYA 2C3KA 3Q9ZA 4IFCA 3VS4A 4CRLA 3VRYA 4CQGA 4MXAA 3VUIA 5KE0A 4E6QA 4IWOA 4V0GA 3WE4A 3OCSA 2Y6OA 4O81A 2H34A 4L45A 5CU4A 1R3CA 3OZ6A 4WNMA 2OF2A 4E4LA 1PXKA 4IBMA 3O96A 5ANJA 2E2BA 4AFJA 4QYEA 3D5UA 4FNXA 4MBLA 1ZMUA 4TWNA 5C8MA 4QMOA 2UZBA 5EYMA 5CF8A 3BYSA 2WOTA 4JBQA 3NNWA 4IZYA 2IW6A 3AC1A 4PTCA 3UMWA 5KZ0A 3M42A 3ACKA 4BTKA 3OEZA 4EBVA 1H07A 4U45A 4GKHA 3ZH8A 2AYPA 3MIAA 4XYFA 3LPBA 5HG9A 3R9RA 2C6EA 3QFVA 4FG9A 4XG2A 5IEYA 3ZFMA 2W1IA 1Q3DA 3BE9A 4KRDA 1NVQA 5AFVA 1T46A 3ZSGA 4IIRA 3Q9XA 4W8DA 4LM5A 3QD2B 3HP5A 3HECA 1OKZA 5DG5A 4JOAA 4D2RA 4O7LA 2B55A 4EKKA 3BI6A 5GIOE 4FVQA 3U4WA 3AT3A 5GNKA 3PUPA 1VEBA 1J91A 3G51A 4I5HA 5BMMA 4YUQA 5L6PA 2HY81 3AC4A 3OXIA 3JPVA 2QU6A 4BDGA 5K4IA 4H36A 3GC7A 3DJ5A 2X9EA 3EZVA 4NFNA 3WZEA 5FEQA 5DMZA 5M4IA 4I6HA 1KSWA 2FSTX 4O91A 3GU8A 3NUXA 4J8MA 4X3JA 3MVHA 4YTFA 5LJJA 1JWHA 2P33A 5BYYA 2Z7SA 2IZUA 3RAWA 2BVAA 3VS6A 4YURA 4BGQA 4DGNA 2R0UA 3CGOA 4AXAA 4EOMA 3LMIA 5J9YA 2PL0A 3F88A 3R04A 5D12A 4DFNA 5K0XA 4LI5A 1CM8A 3PSDA 3CR0A 4PY1A 5B2LA 4UEUA 3SRVA 3KCKA 3V6SA 3AC8A 2OIQA 3QHWA 4XP0A 1TVOA 1UU8A 2GHGA 4LOQA 4O0RA 3ZHPC 2G15A 3FBVA 3EIDA 5EYDA 3ZLYA 4F0IA 2NRUA 4USFA 3POZA 3TACA 3UJGA 4XBUA 4RJ5A 4JNWA 3R7OA 2OU7A 4RIOA 5EH0A 5LMBA 2YM6A 3FMMA 4GT3A 4AZWA 2CDZA 3BYVA 3Q4CA 3KXGA 2XEZA 4RWLA 5FM2A 3QUPA 4KSPA 4QT1A 4YNOA 4F9YA 3NVKI 3P7AA 1OL5A 4FKJA 4RT7A 5GJDA 4DFBA 4XH6A 4L00A 4XV2A 1B6CB 3BYOA 4FSQA 3HL7A 3I60A 4FT7A 4YTHA 2WNTA 1IRKA 3ZLWA 4C59A 2XB7A 4UWCA 3I79A 4FZ7A 3RJCA 1H26A 3P23A 4FV1A 4DITA 3ORLA 3D7TB 5BNJA 3KN5A 5CEPA 4C8BA 1OPLA 5M08A 1FVTA 4ZTNA 3FMDA 4R3RA 1VYZA 4ZP5A 4PMPA 4N70A 5J87A 4H1JA 4QQCA 3BGQA 5LCJA 3G6GA 2PE2A 5FGKA 2JDRA 4ZEGA 3TCPA 1NY3A 3CS9A 4FL3A 3T9IA 1YI3A 3SC1A 2HXQA 1BL7A 2PZ5A 3FKNA 5J79A 3MBLA 2JFLA 3NX8A 4NW5A 4OR5A 2R7IA 3PSCA 1G5SA 2X2KA 4FG8A 3I81A 1TQPA 4KINA 1CMKE 1HCLA 4QQJA 4EK4A 4DFXE 4YJOA 3I7BA 2CGWA 5KBQA 3VRZA 5L2IA 2BUJA 5HLNA 2XM9A 4RVKA 3ZLSA 2B9HA 1J1BA 2PMLX 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2BAK A;  4G2F A;  4BIE A;  1J1C A;  3A62 A;  2UZN A;  2ZV7 A;  4PTG A;  3KIO C;  5JGD A;  4RIY A;  1UKI A;  2J4Z A;  4QNA A;  3VS2 A;  2CNU A;  4WKQ A;  1XKK A;  4LUE A;  3FI4 A;  2W1H A;  4M7I A;  3FL5 A;  2WMB A;  4QP6 A;  5CZI A;  4AN9 A;  2PVM A;  2OZO A;  4D55 A;  5A4Q A;  3FMN A;  5AWM A;  5GHV A;  4QDV A;  3PYY A;  4S30 A;  2W05 A;  4DHJ A;  3Q60 A;  1M2Q A;  2GHM A;  5KMO A;  3FSK A;  1Q99 A;  2O65 A;  4NH1 A;  3KF4 A;  2PVK A;  3UE4 A;  3VC4 A;  3SW4 A;  3PVW A;  4YLK A;  3PRI A;  1K3A A;  2ITZ A;  2WD1 A;  4ENX A;  5LQF A;  3MES A;  3L8P A;  4D1Z A;  3I4B A;  4PNI A;  5HBE A;  1OKV A;  3W2O A;  5DYJ A;  2WXV A;  3G9N A;  2GTN A;  4HOK A;  2FSL X;  2CCH A;  3ZUT A;  1AD5 A;  4Z9L A;  4QMZ A;  5DFP A;  3UZP A;  5K9I A;  3HA6 A;  2JAM A;  1H27 A;  3KUL B;  4KIK A;  2OZA A;  4QMU A;  3JYA A;  3TNW A;  2C47 A;  1PXO A;  2BMC A;  5DRB A;  2O63 A;  3ZON A;  3Q2J A;  2E9V A;  2F57 A;  2RKU A;  4TRL A;  4F09 A;  3QKL A;  4ALV A;  5HE2 A;  3F82 A;  4L3J A;  3SA0 A;  2R2P A;  5A54 A;  3U9N A; 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