2OIQA

Crystal structure of chicken c-src kinase domain in complex with the cancer drug imatinib.
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
278
structure length
265
Chain Sequence
AKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTTRVAIKTLKPGTMSPEAFLQEAQVMKKLRHEKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMSKGSLLDFLKGEMGKYLRLPQLVDMAAQIASGMAYVERMNYVHRDLRAANILVGENLVCKVADFGLGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMVNREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHDLMCQCWRKDPEERPTFEYLQAFLEDYFTSTEPQYQPGENL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title c-Src Binds to the Cancer Drug Imatinib with an Inactive Abl/c-Kit Conformation and a Distributed Thermodynamic Penalty.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
molecule tags Transferase
source organism Gallus gallus
total genus 78
structure length 265
sequence length 278
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2007-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2oiqA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2oiqA01
5FDXA 4L7FA 2C30A 4RWJA 3CP9A 4TXCA 1DI8A 5L2TA 3E8DA 5D10A 1UU9A 3S0OA 4DFBA 4RJ8A 1OKYA 4QQCA 4WG3A 2ITNA 3UIUA 3C4XA 4QQTA 2X4FA 3FQHA 3OUKA 2BZHB 4BICA 4E4LA 4AZVA 3ZC6A 2KULA 5FD2A 2R5TA 3FPQA 3F88A 2VX1A 3TZMA 5DRDA 5AR5A 4EWHA 5KMKA 4YJVA 3TIZA 2PMIA 1BMKA 2ZVAA 4FTRA 5M09A 2JLDA 4GKIA 3DQWA 2WZJA 4X7QA 3TDVA 4G5PA 3KKVA 4N57A 2BAQA 4K11A 4NIFB 2XUUA 4PPCA 3ZUVA 3SW7A 2BTSA 4E4NA 2QOCA 4IAFA 3NUYA 3QYZA 4WRGA 4F9BA 3UC3A 2HENA 3W2SA 4DE4A 4XH6A 4EBVA 3E3PA 2XYNA 2RSVA 3QWJA 2JKQA 4UEUA 2VTJA 1ZARA 3LMHA 2WPAA 4FTCA 3T9IA 3OT8A 5FBNC 4I6HA 4DC2A 3FHIA 2VGPA 4HGEA 4K8AA 4JDHA 4I1ZA 3KEXA 4QMZA 5E91A 3W2QA 4DAWA 2E9UA 2WTVA 4HNFA 3RPOA 3CPBA 2ZV9A 5IUIA 4RJ3A 1NVQA 4JBVA 3HRFA 2FA2A 4DGNA 3FLYA 1O6KA 4LL0A 2WHBA 5TKDA 2C1AA 3EYHA 4EK4A 2O2UA 3MIYA 3R1NA 3NSZA 1H28A 2XZSA 4PUZA 2YM6A 3QKMA 3FI3A 2PVYA 3TN8A 3ITZA 2GS7A 4GK2A 2W17A 4NKSA 2BROA 3VBWA 4RVKA 5CEMA 3CLYA 3W8QA 3TJDA 1IAJA 3IOKA 3DDQA 4CTCA 3B2WA 4WBBB 3R1QA 3QD4A 4WHZA 3VS6A 3W16A 4DFNA 4CKRA 2XBAA 2YZAA 4RC4A 4FUYA 4G3FA 4ZTQA 5HESA 5HCXA 2WMWA 4XP0A 3WF9A 3BU5A 1PXPA 4L3PA 5GIOE 2W06A 2JAVA 5G1XA 4JS8A 3VBQA 4GG5A 1SZMA 2GFCA 4WNOA 1M7NA 3VIDA 4FEWA 4FZAB 3E7VA 3LFFA 2GHLA 3RPVA 4ANMA 3LE6A 4AN9A 3C51A 1BL7A 2HELA 2QOKA 2ZV7A 4FIFA 4ZY4A 3HV7A 3DQXA 4DGMA 5HBJA 2YCRA 2QOOA 2W1IA 4FZDB 4O0WA 3R8ZA 4F08A 1LPUA 4F7SA 5AEPA 3UQFA 3NR9A 2WMBA 3DV3A 3GC7A 2YLFA 1GIJA 4QMNA 2X7OA 4MHAA 4AE9A 3V5JA 4W8EA 5CS6A 3EZRA 3Q53A 3F2NA 4FKSA 3W10A 5J5TA 3U87A 4QYYA 2GPHA 2PZIA 1KUTA 4A4XA 3RK7A 3P23A 3BX5A 2PZPA 1SVEA 3Q5ZA 2XK7A 4IC8A 4USDA 3PRIA 4KIPA 3ANQA 5CSWA 2IVSA 1RQQA 4EBWA 2GQGA 2BDFA 1YHWA 4CMOA 3OXTA 3S00A 2W99B 4L45A 5CI7A 2B1PA 4YLLA 1J7IA 5CEPA 4UMPA 1H25A 3QGYA 4MF0A 3SHEA 4C2VA 4C4FA 3T3UA 4I24A 3QCQA 3Q60A 3P86A 4NSTA 3F3WA 4FBXA 4JX3A 1UWHA 5HTBA 3KA0A 4HNIA 2ITXA 2G01A 1IASA 2JIVA 3QCXA 2UZEA 3FQSA 3LQ8A 4GRBA 4JJRA 3RAKA 3W8LA 5FXRA 4RFZA 4QYGA 3UG1A 5H9BA 4QOXA 1R39A 4XG6A 4APCA 4MWIA 2VN9A 4GK3A 4UYNA 2YZLA 4MK0A 3C4FA 5CALA 5JRQA 2OF4A 3HV6A 3EQCA 3FY0A 4BYIA 1H0WA 3FHRA 4GU6A 3MVMA 2Z02A 1Q4LA 4PNIA 4K33A 5CXHA 2B9JA 3BE2A 4FV4A 5C8KA 4EOPA 4ORKA 4TW9A 5T3QA 3CKWA 3VHEA 5CT7A 3UG2A 2X6EA 4LI5A 4V04A 5EHOA 2HZ4A 4DFXE 2OSCA 1NW1A 3QCYA 4S30A 4CQEA 5AP2A 2YJSA 4NEUA 3SX9A 2WMRA 5HNBA 3OT3A 5JZNA 3Q52A 2VWIA 2QG5A 5ANDA 2G2FA 3HUBA 4QMTA 4ENXA 4L01A 3MVHA 1XO2B 2V22A 2WTDA 4GSBA 3QKKA 4G2FA 4KKHA 4MTAA 3VHKA 3Q04A 5BVDA 1PXOA 3LFSA 4NYEA 2X0GA 3I1AA 3LM0A 4TWNA 5D9HA 3ROYA 2BPMA 4CMTA 4H05A 3DCVA 4O7VA 3OTUA 4FTMA 4BB4A 5A54A 4TY1A 3TKIA 4YSMA 3KXNA 4E93A 5ICPA 3R9RA 2IW6A 3MH3A 4E3CA 3K2LA 5LVNA 4WIHA 2PWLA 4UMRA 4YZCA 1IG1A 2GSFA 2ETMA 1W7HA 3AC4A 2R3OA 3TNWA 3GFEA 4GYIA 5EKNA 1AQ1A 2WQNA 4Y5QA 4I0RA 3SXRA 5IQBA 2FUMA 3BYUA 1OVEA 4KA3A 4UMTA 4BWPA 5D1JA 5K4IA 1ZZLA 2XK4A 3FZTA 3HDMA 5I9VA 3KQ7A 5IA4A 3DOGA 4YJQA 3LFNA 2QG7A 2EB2A 3QL8A 5B2MA 3UNZA 3VBVA 1XH6A 4PY1A 4JRVA 4Y83A 2X39A 5L6WL 3TUCA 3CD8A 4RJ7A 2ZMCA 2X2MA 2W4KA 2VWVA 3GOPA 4FEQA 1GZNA 4QMYA 2G15A 3F2AA 5JRSA 4FNYA 2IW8A 4RIWA 3ZDIA 4BDEA 1OL5A 2VNWA 3NW5A 3CQEA 3GC9A 4UZHA 3RHKA 4WO5A 3Q4UA 2WO6A 4R7IA 3NIZA 4BGGA 2GNHA 3A62A 5CU2A 4QNYA 3R8VA 2ZV2A 4ZLOA 1UWJA 1ZY4A 3CXWA 3MGYA 4JAIA 1CMKE 4J99A 2WMTA 3BYOA 3FLSA 2UW6A 4NFMA 4YBKA 4JVGA 4FTTA 4W4WA 4QP3A 4A4OA 3E7OA 3LFEA 3FZ1A 3PVWA 2PMNX 3PRFA 3RNIA 5IH4A 5L8LA 4MF1A 4LFIA 2OICA 2H8HA 3DDPA 2IN6A 2R3JA 4MXAA 3MJ2A 3QUPA 2OZOA 1UKHA 2BRBA 2EXEA 3WE4A 4BC6A 4QYFA 4EH4A 3R71A 3S2PA 3NUNA 3F9NA 3EN7A 4EORA 2PULA 5BVEA 3Q2MA 3HMOA 3L8PA 4II5A 3WI6A 5CEIA 4H3QA 3TM0A 4BCIA 2W9ZB 3IPHA 3COIA 3P1AA 5GZ9A 2XNEA 4UYAA 5LVMA 2HAKA 4M12A 4M14A 3CBLA 3SLSA 1U4DA 4FVQA 3BEAA 5K0KA 4C62A 1Q8WA 3FZOA 3S4QA 3GU8A 3MB7A 4S2ZA 4ZTHA 4CNHA 1JKLA 2PVRA 5IPJA 4CEGA 2HW6A 3B8RA 3OW4A 1WMKA 3WF7A 3EJ1A 4IIRA 2HCKA 3ALOA 3PIXA 2F9GA 4PPBA 4W9XA 4I6BA 5DR6A 2XK8A 3FWQA 3BHYA 4I22A 3C9WA 5HU9A 3QQUA 1WBVA 5AR7A 4O0VA 3HMPA 4C4IA 2Z60A 4IWDA 3EFWA 3EFLA 3NUXA 4NL0A 3L8XA 4O7RA 3G6GA 5E8WA 4M68A 1OITA 2WXVA 3MI9A 4I5PA 4RWLA 4NCTC 3RM6A 3NPCA 3OCSA 1Q3WA 4NJ3A 4UWCA 4V0GA 1T46A 4MYGA 3TNHA 1OPLA 2YAAA 3DK7A 4FK3A 3RI1A 4BCNA 3ROCA 2ITYA 2WD1A 5DI1A 3QYWA 5L8KA 4PQNA 3QBNA 3MH1A 4BL1A 4EH6A 3QKLA 5AUZA 4QPMA 4DFYA 4EL9A 2QODA 3UIXA 5L2IA 3LQ3A 4JDKA 4GIIA 5HE0A 2BVAA 3IK3A 4FV9A 2QONA 5LXMA 4IDVA 4C3FA 3OVVA 1XBAA 4E8AA 1H1PA 4L3LA 3I5NA 4CTBA 4PMPA 2CKQA 3P79A 3V8TA 4YJNA 3PIZA 4E6CA 4FT0A 3H9FA 4BY9E 5GNKA 3ATSA 4XJ0A 3I5ZA 1I44A 1NXKA 3OFMA 4MAOA 1ZRZA 4EUTA 4I5MA 4ALVA 5GZAA 2HOGA 3QRTA 3KXMA 5EW3A 5HVYA 3O51A 4OT5A 2X81A 3UNKA 4O2ZA 4ITJA 3FV8A 3RPRA 4C58A 3I0QA 5M08A 5CYIA 2YDIA 4WUAA 2ITTA 4YNOA 4QTAA 2GS2A 4GG7A 1TQPA 2FH9A 2G1TA 3HV5A 3NNXA 2NPQA 3AGLA 3BWJA 3NEWA 2FO0A 3VUDA 2C5XA 2WMUA 3KRLA 4J96A 4PTCA 4R8QA 4KUJA 4IDTA 4XG7A 3QTIA 4XUFA 5FXQA 4USEA 3C0IA 5AV0A 1PW2A 4EZ5A 2LGCA 3KK8A 4UWYA 5KBRA 3MVLA 4PF4A 3DK6A 4M3QA 4YTHA 2UW9A 4CFWA 5KNJA 4O6LA 5JK3A 5BQ0A 3VULA 2C6LA 3FZSA 3R7VA 3VRZA 3GGFA 4RA4A 4O7NA 5AAGA 3SD0A 3Q4CA 1YXXA 4KSPA 3PXQA 5EKOA 4DEDA 5K5NA 5HE3A 1CTPE 3F7ZA 4U5JA 3JS2A 2QNJA 3MY5A 1URWA 4XYFA 4EOOA 3EL8A 4KS7A 2VTIA 2WMSA 1GAGA 4BTMA 3GQIA 2OFVA 3MB6A 4I6FA 1WBPA 3R9DA 3S95A 1PXMA 1PYXA 3WARA 2ITVA 2PK9A 3UODA 2P33A 4G1WA 4PP9A 4QMMA 4QP9A 3TL8A 3MW1A 4QTDA 4TPTA 4FV5A 4DEHA 3F5PA 3BGZA 1ZOGA 3TJCA 2W1HA 5KUPA 2W4JA 4F7LA 2UZUE 4MD7E 4YTCA 1U54B 2XNNA 3HA8A 1H00A 2HXLA 4D55A 2XK3A 3RCJA 4JI9A 4QMUA 4G17A 4G3DA 3CJGA 1Q62A 3TV4A 5FRIA 3DS6A 3L9LA 1TVOA 1PF8A 4NW5A 3FJQE 2OZAB 2R3HA 2RL5A 1FMOE 4EZ3A 5CF6A 4QNAA 4X3FB 2J6MA 3RK5A 1XH5A 1MUOA 4XNEA 2W05A 3BBTB 3IW8A 3R1SA 4M66A 3G2FA 4AP7A 4U0IA 2QR8A 1Q5KA 2QVSE 5HI2A 1KE7A 3R04A 1XHAA 1JBPE 3KK9A 3R2YA 5IKWA 4GH2A 4RQKA 5HBEA 3R9HA 5FGKA 3VUIA 4CFMA 5JFXA 2FSMX 3GI3A 2CN5A 5T68A 5EYDA 3RVGA 3TCPA 1RE8A 4D2TA 2Y4PA 5DR2A 4O38A 5B2KA 2JIUA 4QMWA 5KZ0A 4OUCA 5CX9A 5JFSA 3FXZA 1XH4A 2CCHA 4WNPA 1RDQE 2ETKA 2ZDTA 4I5HA 3IW5A 4UZDA 5C8NA 2WIPA 1E9HA 4B8MA 5C03A 4FTIA 4ERKA 2OXXA 2VTHA 4GS6A 4J8NA 2PYWA 4I5CA 3OOMA 4ZIMA 5TE0A 2YABA 3FL4A 4MNFA 5CF4A 1B39A 4TYHA 4PDOA 4CMUA 2C68A 4FTKA 2B9IA 1RW8A 3ERKA 2PMLX 3PXFA 4EOLA 3L9NA 4OBQA 5L6OA 4PL5A 5H8BA 5HIBA 3WF6A 2BTRA 3PY1A 4IB3A 1TQMA 3ZU7A 5AV3A 2I0VA 2UVZA 2VTPA 3FYKX 3LFDA 4KRCA 5HCYA 5IA5A 4IAYA 3ELJA 1JPAA 3VAPA 4M69B 4ACCA 3W18A 3MBLA 5AR3A 3NUAA 3O8PA 3IDCA 2OWBA 2X8IA 3BLQA 3H9RA 5CTPA 5CZHA 5E8ZA 4O83A 5C8MA 2YIYA 3HGKA 2GQRA 1ZLTA 5DWRA 2HIWA 1H07A 3PVBA 3IECA 3L8VA 4O82A 4FV1A 4GYGA 3DXPA 2F2UA 3AG9A 1OPJA 2UW5A 1V0PA 2W5AA 3DPKA 3F3UA 2IVTA 1ZYCA 2NRUA 4H3BA 4BCHA 3U9CA 3R83A 3DFAA 3DBEA 5JFVA 2WQEA 3GENA 4CLIA 3NRMA 4BWKA 3U55A 3H4JA 4A9YA 5I9UA 2REIA 1NVSA 4HYSA 4DF3A 5EHLA 4EQMA 3LFQA 3VUGA 3N9XA 3GB2A 4UXQA 4EOIA 4AACA 4FTOA 1FBNA 5ITAA 3FC2A 4EYMA 5HNGA 4A7CA 3I6WA 3R21A 1UU7A 1H08A 1ZYSA 3BGQA 4I6QA 3OBGA 4DFUA 3B8QA 3HV3A 2G2HA 4NIFA 2C69A 3H10A 5CT0A 3O50A 4TWOA 3F3VA 3MVJA 4FTQA 4IANA 3G6HA 2KTYA 2WEIA 5BPYA 3MPTA 2UVXA 1J3HA 4FSMA 5EI6A 5CASA 4F63A 1XR1A 3RP9A 1Q99A 4O0XA 3IW4A 2I0HA 2I40A 3PYYA 4EONA 4QMLA 1Q8UA 4CGAA 2UW7A 5AR2A 5M55A 2R3PA 1IR3A 1WAKA 3EQFA 4RJ4A 4HYIA 2VD5A 5IQIA 3H30A 2JITA 1IEPA 5C26A 5HD4A 4OBPA 3EN5A 4EJ7A 4LL5A 3BHTA 3QZHA 4IB5A 2OBJA 4OW8A 4AT3A 2ZM1A 4O86A 1CDKA 4FG9A 4Y85A 4R5SA 1YWNA 1H8FA 2WTKC 1JOWB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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