2OU7A

Structure of the catalytic domain of human polo-like kinase 1
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
292
structure length
292
Chain Sequence
AKEIPEVLVDPRSRRRYVRGRFLGKGGFAKCFEISDADTKEVFAGKIVPKSLLLKPHQREKMSMEISIHRSLAHQHVVGFHGFFEDNDFVFVVLELCRRRSLLELHKRRKALTEPEARYYLRQIVLGCQYLHRNRVIHRDLKLGNLFLNEDLEVKIGDFGLATKVEYDGERKKVLCGTPNYIAPEVLSKKGHSFEVDVWSIGCIMYTLLVGKPPFETSCLKETYLRIKKNEYSIPKHINPVAASLIQKMLQTDPTARPTINELLNDEFFTSGYIPARLPITCLTIPPRFSIA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the catalytic domain of human polo-like kinase 1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PLK1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 292
sequence length 292
ec nomenclature ec 2.7.11.21: Polo kinase.
pdb deposition date 2007-02-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2ou7A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2ou7A01
3RHKA 2VX1A 1UU7A 3F3UA 4U3ZA 4ANNA 5ANOA 3WARA 1W7HA 3E64A 4X2JA 1XBAA 3MSSA 2BZIB 2WOUA 4N0SA 3EIDA 4BHNA 5KHXA 1YWRA 1H25A 4IX4A 2V55A 3GC8A 3RP9A 4GG7A 1OIUA 3UO5A 4IAFA 2I0HA 3NYXA 3I60A 4FK6A 2F2UA 4L46A 5CTPA 5AIRA 2J90A 2QC6A 5KMIA 5GIPE 3R7UA 4C57A 2Y4IB 3DB8A 5DLSA 4K0YA 4ZTHA 1PMUA 4F0FA 4QTEA 1M52A 3LFNA 3LAUA 4FEWA 1UU8A 3CPCA 3C4ZA 3GOPA 1MUOA 3L8XA 3TJDA 5LCJA 3LLTA 3OT3A 2GFSA 3ANRA 4UYAA 2FUMA 5IA5A 2V5QA 3KY2A 3DU8A 4X2NA 4ANMA 1I09A 5D7AA 2DS1A 3PUPA 2R3IA 1S9IA 2YDKA 2UZWE 2PVRA 4FSTA 3OW4A 5HESA 2JC6A 3BLQA 1RQQA 3FSFA 3Q3BA 3Q9XA 4FV1A 4G16A 4M84A 4MEDA 1X8BA 3FV8A 2WELA 4KWPA 4QYFA 4AA0A 4D4YA 2VTPA 4O82A 2IW6A 2X4FA 1LUFA 2OWBA 4YPSA 4YPDA 5IISA 4AW1A 3MV5A 5D9HA 3W33A 2XK4A 4PX6A 5FDPA 3WILA 4ZSGA 4C2WA 3HUBA 2GPHA 4OTIA 4OR5A 3QTIA 2BR1A 2X7FA 3QA8A 4C8BA 4MAOA 4U45A 3T3UA 4HVIA 4KBCA 4XV3A 5EKNA 1OMWA 5KE0A 4FUYA 2PTKA 4QTBA 3QQFA 2WMVA 2VTOA 5J9ZA 3MY1A 2X7OA 4FV7A 4F09A 2Y4PA 1J91A 2WTVA 2BVAA 3DB6A 3EFWA 5J95A 4J1RA 3AG9A 3V3VA 4KSQA 3UQFA 2YCRA 4II5A 1YHWA 2W1CA 1SMHA 4KB8A 2C6DA 3ZSGA 3ZUTA 1JVPP 4AN9A 4PUZA 4YURA 4EK6A 1PXLA 3F3ZA 3IPHA 4GUBA 3PPJA 4AF3A 3W8LA 4GFGA 4C4JA 3FZPA 5ANIA 4ZK5A 1R78A 3THBA 4BDEA 4FSQA 3VS2A 4DCAA 4M7IA 3ALOA 4C4IA 3UPXA 3E8DA 4OBOA 3AMYA 4NTTA 5J7HA 2CN5A 4OBQA 4R77A 3AC4A 3FLSA 4J95A 2ZVAA 4R5YA 2X2KA 4F64A 3GCPA 2PUPA 2XRUA 5T68A 2C3JA 3GQIA 1K2PA 1YRPA 4IAIA 4ALWA 4K33A 3U8WA 5ICPA 4ANOA 2J0LA 4FTAA 2DYLA 3EHAA 1G8SA 4JQ7A 2QOKA 4PP7A 2W5BA 3OCSA 4O7RA 2IVTA 5FEEA 3D14A 3MPMA 5E8YA 5AIKA 2WTKB 5DBXA 3TKUA 2XJ0A 4BBFA 4EORA 3O8UA 3GT8A 3UC4A 2WMBA 2WTCA 1I44A 3F5XA 2BDJA 3DK7A 3FKNA 3SRVB 3A7FA 5IEXA 4DFBA 2WTDA 5IA0A 3ULZA 4F70A 2QONA 4O0UA 3P7CA 3MJ2A 3UP2A 4U42A 3C51A 5KUPA 4OTFA 5BMMA 1H26A 4WRSA 3NIZA 3R8LA 2FVDA 1Z57A 3AD6A 3ZLXA 4JRVA 4ZOGA 2GU8A 4ZTMA 4P7EA 4O7NA 4NKSA 2ZV7A 2I40A 4FV6A 3PXYA 5J5SA 4IM2A 5LARA 3QKMA 3O0GA 3H9OA 3COKA 4MH7A 4APPA 5HO6A 4AW2A 2HXLA 4CYJA 3MPTA 2CDZA 5FTOA 3R9DA 2YLEA 4HCVA 2HCKA 1IAHA 4G3CA 4S31A 5BVOA 2PUIA 2OZAA 5GIOE 5CEIA 5EQEA 1OL1A 3IO7A 3ODYX 4IZAA 3CBLA 1V0PA 2XK9A 5GNKA 2YITA 4GT5A 3A7JA 1QPEA 3P08A 1ZWSA 1VJYA 3IONA 4ZLZA 2IVSA 4FYNA 3AGMA 2XH5A 4OTPA 5DPVA 3QQKA 5IEYA 3ZLSA 4E5BA 2XVDA 4IVAA 4HPTE 2UZVA 4NM5A 5ACKA 2QO9A 5FXQA 4XG9A 2BAJA 4DF3A 5HKMA 2XKEA 3VC4A 1WBOA 3OBJA 4JLCA 4EH5A 3TDVA 1PF8A 4NCTC 5C01A 2X8DA 4C4GA 4FTJA 4QP4A 5DWRA 3VS4A 3EKNA 3IGGA 3G2FA 3KK9A 4FV4A 3O96A 5HICA 3PSCA 3VNTA 2NPQA 1DI9A 3NPCA 5HE3A 3U6IA 3F2AA 3ROYA 4EOLA 2F4JA 5EI8A 5CF8A 5LMKC 3HA6A 3ET7A 4BDBA 4GU9A 5AUTA 3JR1A 5HIBA 5BUJA 2X1NA 2CKQA 4DFYA 3F6XA 3LMIA 1NXKA 3I7CA 3NDMA 4BCGA 4I3ZA 5EK7A 4BDFA 1PXNA 4E20A 5EOBA 4FG9A 4N70A 1H1QA 3JS2A 2PE0A 1WBSA 3UVQA 3ZO1A 3C0HA 4HPUE 4MKCA 4BBMA 4FE2A 3RCDA 3UOJA 4IE9A 3TG1A 3FSKA 4C36A 5DA3A 4OGRA 4RA4A 1XH4A 2YM6A 3HDMA 4LMUA 2UW3A 4KIPA 5CF5A 2H8HA 5ANJA 3WZJA 4BTKA 3LQ8A 4RX9A 4MNFA 3EQFA 1GZNA 4DG2E 4M0YA 3G0EA 5CEKA 2IVVA 3DJ5A 4BC6A 1VYWA 3ORTA 4I20A 5L6OA 5M56A 4I22A 2LAVA 2W7XA 4IJPA 3VF8A 4JI9A 1J1BA 4IXPA 4NJ3A 4RWIA 2BZHB 3PIYA 3H4JA 4GEOA 2BIKB 3OZ6A 5JH6A 1H24A 4M12A 1PMEA 5GINE 2UW9A 2WPAA 3FI2A 3W2CA 4E1ZA 4XG4A 3SG8A 1ZYCA 4F1OA 4QP8A 4YO4A 5HTBA 4L7SA 5IKWA 4F9YA 5B2LA 3EN7A 3GC9A 4S33A 5FD2A 3K54A 5L8KA 3PRFA 5I9YA 3FAAA 1OITA 4W4VA 3DTWA 5F4NA 4G5PA 4O0VA 5E4HA 4D2TA 2CPKE 3KXGA 5J87A 2IO6A 2W1ZA 2R3OA 3QCXA 4FODA 4QMVA 3P0MA 4BCQA 2QO2A 5B2KA 2C6LA 5JFVA 4FTLA 2ZMDA 3ZXZA 5L2TA 2C69A 3GC0A 1MQ4A 2XBAA 2R7BA 2BFXA 4KA3A 4D4SA 1QPJA 3ZFMA 2WMSA 4FMQA 4YJPA 5DOSA 4PMPA 4BL1A 1J7LA 1PYXA 1F3MC 2WNTA 1UWHA 3WZKA 2XP2A 2ITTA 3MIAA 4HOKA 3D83A 5HCXA 3HP2A 5AUZA 3DFAA 2XM8A 4IB3A 3P78A 3TNHA 3UODA 3ZOSA 4DC2A 4GW8A 5LVNA 5AJQA 4BN1A 2Z7SA 3TTJA 4BRXA 2Y7JA 5M4IA 4BCKA 3MFRA 4ZJIA 3BHYA 1NT2A 1GZKA 4FC0A 4HW7A 3TZMA 3ZRKA 4I5MA 3FLNC 4IC8A 3V5PA 4YTCA 3GU7A 4DH3A 3MVMA 5LXMA 5IUIA 4BGGA 3NYVA 3W18A 2BHHA 2UW0A 4O91A 4ENYA 5HBHA 2X8EA 3NNVA 5F20A 5HE0A 1SNUA 4BYIA 2C3IB 3QUPA 4TKSA 4AE6A 1OBGA 3BHHA 3T3VA 3VN9A 1UNLA 4A9TA 2XS0A 4BDJA 1JAMA 2CNQA 1GZOA 5EM7A 4RIYA 1R39A 3Q9WA 2PHKA 2G01A 2EWAA 5FWKK 5CT0A 4Q2AA 4DTBA 3VVHA 3U9CA 4GT4A 1PJKA 2BAKA 2BIYA 2UW5A 4YSJA 3EQGA 4C0TA 4I0SA 4MXOA 4LGDA 2JIIA 4AT4A 5F95A 4H36A 3CSVA 4DFZE 5DG5A 2JFMA 3KN5A 4ZZNA 5HGIA 3DAKA 5J1WA 4JNWA 2VX3A 4EHEA 3CCNA 4ZZMA 5IMXA 2QD9A 2XEZA 4LGGA 4DCEA 4LRMA 1P4FA 3ORXA 4RFMA 4FOBA 4OTQA 4A9SA 4EBVA 4RJ7A 2OF4A 5HO7A 2B9JA 4LG4A 3HRFA 2WXVA 2BTSA 3MI9A 3NUNA 3SAYA 2OJFE 3DBQA 4PPAA 3RINA 3I0OA 4IANA 3UC3A 5G1XA 3CY2A 3ZRLA 4BI2A 1KV2A 4I4EA 3A7HA 2OI4X 4CQEA 1W84A 3F7ZA 3KRRA 4EQUA 1GIJA 5HNIX 3TUBA 3NYNA 1YHVA 4D2SA 3NEWA 4ACDA 4RIXB 3OEZA 2XZSA 2XCHA 3E7VA 4TYEA 4LI5A 4EL9A 4F1MA 2EXCX 2WMUA 2ZYBA 2R3KA 2PMNX 3NAYA 3EN4A 4NZWB 3PSBA 4L44A 4USDA 3R8VA 3ZO4A 1J7IA 4E4LA 3QGYA 3IQ7A 3MFUA 1SVGA 1IA9A 2VWIA 2C0OA 4I6QA 3GFWA 3PP1A 2JITA 3TM0A 2B52A 3Q6WA 3TACA 3MVLA 3VBQA 3ZDIA 5CAVA 2J9MA 3W16A 5HVKA 3CJGA 1PKGA 2W9ZB 3VJOA 4FKPA 1ZYLA 3BLHA 4X3FA 4ASXA 3ACJA 3HAMA 1OM1A 2WO6A 4M69B 2B9FA 3K3IA 3VS6A 3TXOA 5CSPA 1BYGA 2GNFA 3H10A 4E6DA 2XKFA 1XWSA 2OLCA 2PU8A 3EFJA 5F1ZA 3IDPA 3NCGA 3ORLA 5CEOA 2G15A 2H6DA 3LFEA 4RIWA 4EOSA 1OIRA 1XQZA 2B9HA 4F08A 4YC8A 1XH5A 3QL8A 4U97A 4RT7A 2VGOA 3G6GA 2PSQA 2VU3A 3DQWA 3Q4TA 4TRLA 2QLQA 2ZJWA 4ZTRA 4I6BA 5EKOA 4BHZA 2UZEA 1ZY4A 4Z7GA 2YN8A 3OY1A 2R3HA 4W4XA 3R9OA 2Z7RA 4QMLA 5AV0A 2IZTA 4IVDA 2ZAZA 3AC1A 3C4WA 2YM5A 2GCDA 4WT6A 3O50A 1IASA 4K77A 2G9XA 2ITUA 1BI7A 3R7OA 3K5UA 2ITNA 4RMZA 4L42A 2W4JA 1O6KA 3NUYA 5FEQA 3ZSHA 5IDPA 2CLQA 1WCCA 3QQGA 2VWVA 4YZ9A 5M4FA 4DA5A 1YI3A 3FXZA 4E4NA 4PL5A 5J7BA 1U5QA 2YACA 4IX3A 5LVLA 2UZNA 2OF2A 5CT7A 2E9UA 3RM6A 3RBWA 4FSNA 4FKUA 2OK1A 4L3PA 5FDXA 4FGBA 3R9HA 5IH6A 4U80A 4TTHB 2HELA 3BEGA 3IW6A 5IH5A 4C2VA 2C1BA 4QYHA 4RVMA 5E7RA 4WBOA 2F7XE 3HNGA 4BCPA 4GKHA 4EK5A 2PVMA 1ZMWA 3Q4UA 2XM9A 4ACHA 4ZJVA 3I4BA 4RJ6A 3LPBA 4IVBA 4CZTA 3KVWA 4PTEA 4WUAA 4XV1A 4BBEA 3HRBA 3VF9A 4MD8E 3JVSA 5C9CA 3TEIA 2C68A 5DE2A 4C38A 4R7HA 4EQMA 3ETAA 4QQTA 2FB8A 4HCTA 2UW8A 5IQGA 4AXAA 3E88A 3QHRA 2A2AA 2GS7A 4C4HA 1V0OA 4L43A 5GZAA 3GB2A 4G9CA 4JRNA 3SW4A 2C6IA 4M13A 1P2AA 1Y91A 3F5UA 2GHGA 3QF9A 1T46A 1TKIA 4YJQA 3SG9A 3PG1A 4MVFA 1KWPA 3D2KA 5DT4A 3WBLA 2XKCA 4H3BA 4AZWA 5AMNA 2CJMA 5EHYA 5C27A 4Z3VA 2WQEA 5CSXA 4BI0A 5BUIA 4XHKB 4WG3A 1OI9A 5EW8A 3LFSA 3BZ3A 3DK6A 3QD4A 4IDTA 3V5JA 1BUHA 1NVSA 5AAGA 3C0IA 4OTGA 1CKPA 1REJA 3NUXA 3LCTA 3R83A 2YERA 4BIEA 2P4IA 1REKA 2G2HA 1OUKA 2PZRA 3FWQA 2I0YA 4JIKA 4RJ8A 4EOOA 3LM0A 4A9RA 3QC9A 5HNGA 4ZS0A 3JXWA 5CEPA 3H0ZA 3KMWA 3TTIA 4O7WA 4UB7A 3NUPA 2ZM3A 4FTQA 4AZFA 3CE3A 4FV9A 4Y8DA 2BAQA 4ZTSA 4CV8A 4I5CA 1YOMA 2R3QA 3PVGA 3U54A 3KF4A 3O17A 1Z9XA 5AUVA 3FXWA 4HJOA 5EFQA 3G15A 4V01A 3G90X 2PVLA 3ITZA 3PJ2A 5DR6A 1BX6A 5HZNA 1PXIA 2XJ1A 1YXXA 3L9MA 4MNEB 4FTTA 3QQUA 3TN8A 4EHGA 2YABA 4MXAA 4W8DA 1YXVA 2R0IA 5DRBA 2BRGA 1Y6BA 4QMWA 4AS0A 1QMZA 1JBPE 3RNIA 3BHUA 3S4QA 4UN0C 5A4QA 4FEUA 3VUGA 1Q24A 2V22A 1H27A 1ERKA 5EH0A 2C47A 3F9NA 4LGHA 1B6CB 2YISA 4V0GB 5FTQA 4XOZA 5LWMA 3PPZA 3HP5A 4FF8A 3U4WA 3R00A 4GVAA 3UIBA 1CTPE 3TIZA 1CM8A 3DZOA 2DUVA 4CKRA 1OIQA 4O84A 4RLLA 5C8MA 5I5ZA 3UO6A 3WF6A 3WI6A 4YMJA 1OECA 5HLNA 5C8KA 2W1DA 3R73A 1H1PA 2HYYA 4AFJA 3JY0A 2WQNA 2QOBA 4WIHA 4YC6A 4BZOA 4DBXA 2VWBA 3QHWA 1JKLA 3V8TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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