2OWBA

Structure of the catalytic domain of human polo-like kinase 1
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
294
structure length
294
Chain Sequence
AKEIPEVLVDPRSRRRYVRGRFLGKGGFAKCFEISDADTKEVFAGKIVPKSLLLKPHQREKMSMEISIHRSLAHQHVVGFHGFFEDNDFVFVVLELCRRRSLLELHKRRKALTEPEARYYLRQIVLGCQYLHRNRVIHRDLKLGNLFLNEDLEVKIGDFGLATKVEYDGERKKVLCGTPNYIAPEVLSKKGHSFEVDVWSIGCIMYTLLVGKPPFETSCLKETYLRIKKNEYSIPKHINPVAASLIQKMLQTDPTARPTINELLNDEFFTSGYIPARLPITCLTIPPRFSIAPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structure of the catalytic domain of human polo-like kinase 1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PLK1
total genus 81
structure length 294
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.7.11.21: Polo kinase.
pdb deposition date 2007-02-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2owbA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2owbA01
4DH7A 2HZIA 4J7BA 3QA0A 4E5AX 3QBNA 1U5RA 4QQTA 4QP2A 2A0CX 2OZAA 3BEGA 2BMCA 2GS2A 3ET7A 5AR7A 5HLPA 4CFUA 5HQ0A 4FSMA 5CAOA 4OAVB 2B0QA 3A7HA 4FIHA 4MEDA 3QUPA 4JAJA 4TYJA 5LMKA 5TO8A 1V0BA 2YABA 4UYAA 5LCKA 1BUHA 4CMOA 4ANLA 4IQ6A 2XKDA 3R8PA 3ZO1A 4O21A 3SG8A 3AC3A 3GOKA 3LFSA 4AT3A 4O91A 3A99A 1ZLTA 1AGWA 4UZDA 4RWLA 3BYMA 5FDXA 2G1TA 3GOPA 5ANDA 5M44A 3KCKA 1OB3A 2HWOA 4IH8A 2Y7JA 3VBVA 1KOBA 2CPKE 3AG9A 3G6GA 4U7ZA 4EUUA 4CVAA 2EVAA 4QTCA 4J95A 3UNKA 5CSHA 1VEBA 3OROA 4LGGA 3QGWA 4XH6A 2VTSA 5CVGA 2R4BA 3LFDA 3FXZA 4DHFA 4FF8A 4RGJA 3RAKA 3SA0A 4D4SA 4NW6A 4JI9A 2R9SA 5HCXA 1XR1A 4DTAA 3PLSA 4KBAA 3O7LB 3GU5A 1VR2A 4FV1A 3WZEA 2OWBA 2B9IA 2W1GA 4ANOA 2CKPA 3FZPA 4BI1A 1NXKA 2J0JA 4GU9A 4I5MA 5HCZA 3W2RA 4YTCA 3V04A 4FSUA 4PRJA 3NGAA 5DMZA 4X3JA 5F94A 3BELA 3DBEA 5HORA 4BBMA 5IEYA 4ORKA 4YPSA 2AUHA 2VUWA 3OBJA 4IVBA 3AXWA 4GSBA 3DDQA 2YDIA 2OJ9A 4LRMA 3M42A 1FGIA 4IW0A 5EYCA 2YM7A 4NFNA 5L8LA 3IDBA 2Z60A 3OUNB 2R3NA 3FLSA 4N57A 2PULA 4FV5A 3FXWA 4RLLA 1XH5A 4FEQA 4GCJA 2J4ZA 3HMNA 3GVUA 3SW7A 5AAFA 2WFYA 3O17A 4ZSAA 2OI4X 4ID7A 4GUBA 2PYWA 3BGQA 4E20A 1APME 4RVTA 4Q9SA 5LQFA 2BVAA 2IW8A 4Z7GA 3SXRA 3MH0A 4I6BA 3EKKA 2C6DA 3V5LA 1Q62A 5E8TA 5CF6A 3SLSA 4D2WA 1L8TA 3PXYA 3ZS5A 4D2PA 2WMSA 3RHXA 5CANA 4O86A 3LXKA 3FMHA 2WQMA 4NM3A 4XS2A 4PWNA 2R0IA 4FNWA 3TV4A 3DBQA 4W9WA 4EH6A 3VUKA 3F3UA 2QOQA 3FXXA 1YWNA 4D4YA 3CGOA 1IA9A 3GC8A 3MH1A 3QRTA 2VWZA 3D83A 3DKGA 4G2FA 2YIYA 1KE5A 3DLZA 4IMYA 4B0GA 2PVRA 5E8UA 2B54A 2OU7A 3F69A 3FI4A 4XLIA 5DT0A 3QD4A 4YU2A 3E8CA 4EWHA 1QPDA 5CT7A 5DT3A 3HV5A 3QRKA 3KY2A 1K3AA 4IZ5A 1ZYDA 4X0MA 5DBXA 3KN5A 3I5ZA 4I93A 4W4WA 3H0ZA 4HZSA 4RLKA 2O64A 3ULIA 2WIPA 2UVYA 4QMUA 4ZTQA 4IZ7A 3KVXA 5HNBA 3NVMB 2Y4IB 3UPXA 4F7NA 4MAOA 4XOYA 3CQEA 1U46A 2VO7A 2Z7LA 3HNGA 2PK9A 5CU6A 4BYIA 5KMJA 3QYZA 4DT8A 3H30A 3E7OA 4QYYA 4C3RA 3O50A 4D1SA 3QUEA 4FEXA 4JS8A 2C4GA 4OUCA 3ZSGA 4ZMEA 4WBOA 3TIZA 3PDTA 3THBA 4FL2A 2IG7A 1SNXA 5CEMA 3OY3A 1V0OA 2WMVA 3SD0A 2CCIA 5HX6A 2QURA 5D9HA 3FY2A 4BKJA 4ALWA 1OIQA 3VS6A 2GSFA 2VD5A 4U5JA 5DOSA 4EUTA 5F9EA 2GNHA 2QU6A 4ZS4A 4TXCA 3DA6A 3S00A 3MYGA 2C3KA 5E8VA 5HG9A 5JH6A 1QPCA 2X7FA 2GS6A 2GQRA 3F5XA 3ZSIA 4OTFA 3U6IA 3RNIA 3FLQA 3FLNC 3PSCA 5JT2A 4FKJA 4I0RA 3V8SA 5AADA 4QMNA 4ASXA 4QTEA 2W7XA 2XCHA 3PWDA 1REKA 3M1SA 5IU2A 4L53A 4HNIA 4X6QC 4P2KA 4UMRA 3ULZA 3HECA 4FV4A 1OGUA 3UMXA 4B7TA 3OTVA 3Q32A 4R7IA 4LFIA 5FM3A 4F64A 4JQ8A 2IW6A 4UWCA 4L52A 2ZAZA 3KXGA 4KABA 3VUDA 3FLWA 1YOJA 3MH3A 3AMYA 4U9AA 3Q6UA 4QP3A 3ZM4A 1NW1A 1M52A 4DE4A 4USEA 1O6KA 3OW3A 4GFOA 4RX8A 3DKFA 1R0EA 2W1EA 4RSSA 4B9DA 5K0XA 4NCTA 4O7YA 5EQEA 3AT4A 4FSYA 4FZAB 5D12A 4EOSA 2F49A 2WTKB 3I7CA 3P79A 5H8BA 4H1MA 3A7JA 3JVRA 1MP8A 3TWJA 5I3RA 2CLXA 4M68A 3TN8A 3IW4A 2RFNA 3HRCA 3P4KA 3R71A 3ZFMA 4FTIA 4J98A 3UTOA 4FV9A 3FZTA 3PYYA 4M0ZA 3S2PA 3ZSHA 4AFJA 3LKMA 4JIAA 4JQ7A 5TE0A 4FI1A 4TYEA 4FSRA 2YCRA 5JEBA 5BMMA 3H9RA 4MYGA 2UW8A 3KA0A 2BHHA 4LMUA 1XBBA 2FSOX 4YJOA 3QQLA 3LLAA 3LCOA 2UVZA 1Y6BA 3NYNA 4U40A 2ZM4A 4Y5HA 4CQGA 4CQEA 2ZV9A 3MFRA 2IPXA 2BIKB 4ZJVA 3H0YA 3MJ2A 3C4ZA 3TJCA 5FQDC 4BCMA 4BTJA 5C8NA 5ACKA 4E4XA 3OBGA 1WBVA 3G33A 3MDYA 4QMTA 1XO2B 3GFEA 2HYYA 4F63A 3DK6A 3BCEA 4XG6A 5AM7A 5HD4A 2Z7SA 2VRXA 1FGKA 3ORZA 5GNKA 3VUGA 3R6XA 4JX7A 3NUAA 5AR4A 3ZYAA 5EQPA 3CGFA 4O81A 2OLCA 2X9FA 4C37A 3HAMA 1JSUA 1MQ4A 4DEAA 1J7LA 3RK7A 1H26A 2C0OA 3CKXA 5HHWA 4OLIA 4Y72A 1J3HA 3MFUA 4FT3A 4EYJA 4DYMA 3UZPA 2Z02A 2P2IA 3NUNA 3V5WA 4OR5A 2OJFE 3WF5A 5HTBA 5FDPA 1Z57A 2EUFB 4IEBA 4O6LA 4BIEA 2C6MA 2V7AA 2Q83A 3H4JA 4EK5A 4PNIA 4J52A 4XX9A 2QODA 4YC6A 2GTMA 3DU8A 3D4QA 3HMIA 4ARKA 3F7WA 4U8ZA 4KB8A 4FTLA 4TRLA 2C68A 5EDQA 3C5UA 4FK3A 2GHLA 2PZRA 5EG3A 3HKOA 1PXLA 4MF1A 3HV7A 5GJGA 3VS7A 2C0IA 3Q2JA 4PX6A 3C1XA 4U0IA 2PHKA 3LVPA 4EOKA 2GFCA 4F1MA 4F9AA 2UZEA 3KCFA 1J7IA 4BICA 5M57A 2CLQA 5D1JA 1T45A 3QFVA 3GU8A 4FGBA 5H8EA 4XNEA 5FP6A 3GCUA 4JBQA 2VWVA 4WA9A 3W8QA 1QL6A 4JR3A 4MBLA 4RVLA 3TZ8A 3H10A 2BZHB 2ZV8A 3W2QA 3VF9A 2YAKA 4YBJA 2JKMA 4BBFA 1YDTE 4ALUA 3GI3A 1YWRA 2FB8A 2WMTA 4QMLA 5I9UA 5CAUA 4FSTA 3F7ZA 1ZY5A 2VTHA 4RWKA 3WE4A 4BDAA 2C3IB 2XIXA 1QPJA 3E88A 4IHPA 2B4SB 3IW8A 5J95A 3WBLA 1ZZLA 2VTTA 4FX3A 5EDPA 1W84A 4AWIA 3L8PA 4R6VA 4YZMA 3P7BA 3VAPA 3ORMA 1ZWSA 4FT7A 2QHMA 4E6AA 4FTJA 3FZRA 4I41A 3PJ8A 5DWRA 2YACA 3EN9A 4A7CA 2XIYA 3FYKX 5DG5A 3DXPA 2C0TA 1YOMA 5A54A 3LQ8A 3MTLA 2YWPA 2HOGA 3OCSA 4FTTA 3UVRA 3A8WA 1JPAA 4G5JA 1O9UA 4FIEA 5CI6A 3CC6A 3ZTXA 3ZXTA 4AP7A 4IJPA 1BKXA 1UNHA 2VGOA 4WUAA 3HL7A 2UZOA 1QMZA 3TNQB 5FUTA 4X2FA 3P5KA 3IW6A 1B6CB 3QL8A 3H9OA 4ZJJA 1OUYA 4FIJA 5HD7A 3WILA 4DBXA 2ZV7A 1FPUA 3RM6A 2YIWA 4AE6A 3D14A 4D1XA 2GQSA 2PVLA 4FICA 5TOZA 4WD5A 2ZV2A 5HGIA 4BDJA 1W8CA 1CSNA 1O6LA 3PZEA 5HE2A 4MWIA 2OXYA 5HVKA 5FBNC 5JGBA 3NVKI 5D41A 2XA4A 3CE3A 4FSWA 4EH9A 4L7SA 2B52A 2X6DA 4OT5A 2HELA 1PXNA 2VTLA 4QP9A 4AOTA 4AQCA 3ZLXA 4CG9A 4X6RA 1Y57A 3PXFA 5HIEA 5E4HA 1OZ1A 3TUCA 5HE0A 3HVCA 3G5DA 2JFLA 2OJJA 5HEZA 4DGNA 5HESA 2QOBA 1JNKA 3NYVA 5EM7A 4YHJA 2FO0A 2OG8A 3HV3A 3BPRA 1XH9A 2XEYA 3KMWA 4TYIA 3RM7A 5HCYA 3FMDA 1V1KA 1FMKA 1XQZA 2UW6A 3T3VA 3Q04A 5I0BA 2W05A 4HGEA 4NWMA 2VX0A 3Q3BA 3QX4A 4G6NA 4ZZOA 1FBNA 3R0TA 4G9RA 4EHGA 3BKBA 1UNGA 3NCZA 4YSMA 5J8IA 2ZDTA 3LFEA 5E91A 1MRVA 4E4LA 4O7ZA 3U51A 3I4BA 3W16A 5EI8A 4ERKA 4FKSA 3R9NA 2OJGA 3DNDA 3QC4A 3QHWA 4L45A 3F61A 3L9NA 4NT4A 3AT2A 4KIKB 3ALOA 2WU7A 3EOCA 4X2JA 5JSMA 3B8RA 4AZSA 4DEHA 4M69B 5H3QA 2BZJA 3LJ2A 4FTAA 2VWIA 4BI2A 2H9VA 3HUCA 2B9HA 3VS5A 3PTGA 2W4KA 3TV6A 5M06A 5EKNA 5AP6A 3KRWA 3A8XA 2UZWE 5L2WA 1A06A 3MA6A 3PP1A 4ITHA 4TWCA 3MIYA 4YO4A 3ZUUA 2XS0A 2V0DA 2WMAA 4QRCA 4KIPA 4ZTHA 3GUBA 2C47A 3PA4A 1SMHA 1XH8A 3MFSA 3KVWA 2I1MA 2Q0BA 5AV1A 2WOUA 5FXQA 3COKA 5CEPA 5FEEA 2C3LA 3HMMA 2F57A 4PTGA 4EBVA 1U54B 3LFFA 1CM8A 2IVUA 5K5NA 3MSSA 4JBVA 1PMEA 3NIZA 3U9NA 2ETMA 3MY5A 3BLRA 3PVWA 3AC4A 3QQHA 4HZRA 5B7VA 3KREA 2ONLA 2WTVA 5HI2A 4AAAA 4I24A 4O0XA 4FNZA 5FRIA 4P4CA 1BL6A 4R1VA 5ICPA 1SZMA 2G2IA 4FT9A 2R3IA 4NJ3A 5IF1A 2WD1A 3CR0A 2R7BA 5L8JA 4HVHA 4TWOA 2UZTA 3ACKA 3PZHA 3R7VA 5LVOA 2VTIA 2X81A 4OTHA 3QC9A 1KE8A 4JXFA 2LGCA 5AUYA 3CSVA 3REPA 1WVYA 4P5QA 4QMYA 4R5YA 4O2ZA 5HTIA 2IO6A 5AP7A 4S34A 4N0SA 4AW5A 3N51A 3O8TA 5IQAA 5HZNA 4CMTA 4O7NA 4DGMA 2QOOA 1M2RA 4KUJA 3PXRA 3OW4A 1GY3A 1ZZ2A 5CQWA 4Q5HA 4QP1A 4Y83A 3FQHA 4GS6A 3UMWA 3UIMA 5I9ZA 4QTBA 1S9IA 3NRMA 2R3FA 1M2QA 1SM2A 3GNIB 4ACGA 3UOKA 1YXUA 3Q9ZA 4AZWA 4EZ3A 4S30A 2CNQA 4YZNA 4KKHA 4OTIA 5ETCA 1Q8WA 2X0GA 2OF4A 4K1BA 2WQOA 3F6XA 4ZZMA 1ZYCA 3L9MA 1PW2A 3AC5A 4I3ZA 4CZTA 1Y91A 4F6WA 2RGPA 2R3QA 4WRSA 5CT0A 3KRLA 3W33A 3Q9YA 5EW8A 5I9XA 4CFFA 4O0TA 5M56A 4ZIMA 3L8SA 1U4DA 3GCVA 4BDBA 3VIDA 2YN8A 3OEZA 4S32A 4U45A 5G6VA 1M14A 4F7LA 5IQHA 2ITXA 1JKTA 5BYZA 2WO6A 3BE9A 1Q3WA 4GKIA 4YURA 1GNGA 1YXSA 4ZAUA 5T6KA 3KXMA 3PA5A 5CS6A 4BCFA 3FEGA 2Z2WA 3GQIA 4LQMA 4BWPA 5T3QA 1YRPA 4BL1A 4IM3A 4G3DA 2B9JA 3JYAA 1OL6A 3LFNA 2E9OA 2H34A 2IVVA 2PZPA 3MJ1A 4YBKA 5DIAA 1KSWA 5M09A 1B39A 5CEKA 3PJ2A 3NUPA 4FYOA 5JFXA 4IM0A 3D5XA 3V01A 5FXRA 2FSTX 3FDNA 2JGZA 4O7SA 2PSQA 4OTQA 5EW9A 3F5UA 4BCPA 2W5BA 3CTHA 4O1OA 3W32A 4BTFA 5CLPA 3BEAA 5AP1A 2XF0A 4PTCA 3CTJA 4FTMA 3RPSA 2HWPA 1GZ8A 1OI9A 2F2UA 3MVJA 3RAIA 3VWAA 5KBQA 5J9LA 1UNLA 3KK8A 1YQJA 4PL5A 3VVHA 1V0PA 4PNKA 1OM1A 4DFXE 1WBTA 3DKOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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