2OXDA

Protein kinase ck2 in complex with tetrabromobenzoimidazole k17, k22 and k32 inhibitors
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
SKARVYADVNVLRPKEYWDYEALTVQWGEQDDYEVVRKVGRGKYSEVFEGINVNNNEKCIIKILKPVKKKKIKREIKILQNLCGGPNIVKLLDIVRDQHSKTPSLIFEYVNNTDFKVLYPTLTDYDIRYYIYELLKALDYCHSQGIMHRDVKPHNVMIDHELRKLRLIDWGLAEFYHPGKEYNVRVASRYFKGPELLVDLQDYDYSLDMWSLGCMFAGMIFRKEPFFYGHDNHDQLVKIAKVLGTDGLNVYLNKYRIELDPQLEALVGRHSRKPWLKFMNADNQHLVSPEAIDFLDKLLRYDHQERLTALEAMTHPYFQQVRAAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Zea mays
publication title The ATP-Binding Site of Protein Kinase CK2 Holds a Positive Electrostatic Area and Conserved Water Molecules.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
total genus 98
structure length 325
sequence length 325
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2007-02-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2oxdA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2oxdA02
4IAZA 4KIOA 4WNOA 2FSOX 3PY0A 4LRKA 5F4NA 4ANLA 4B8LA 3TDVA 2IVTA 4Y95A 3VF9A 3P78A 3V51A 5EQEA 3R8MA 3CSVA 2W17A 2E2BA 5EYCA 1BKXA 4TW9A 2WNTA 3CGOA 2YJSA 4CZUA 3KRLA 4FZAB 1APME 4K18A 2OGVA 3V6SA 1Y8YA 1ZYCA 3JS2A 3ANQA 2OZAA 4IQ6A 2G2FA 2WIPA 3QKLA 3UP2A 1YHWA 3QA8A 4IJPA 4ZJJA 3MVJA 1SVGA 4FG8A 4V01A 4AWIA 3TNIA 5CXZA 3MWUA 4FF8A 1E1XA 1P14A 3SX9A 1FBNA 4XV2A 4FSUA 4BVUA 3HV6A 4UALA 3I0QA 3TJCA 2E9VA 2XIRA 3FE3A 3QALE 3FXXA 2WQMA 3RHXA 3V04A 4ZTRA 3VJOA 4EK5A 5IPJA 3PPZA 2GNGA 4O82A 4ZTHA 3M42A 3PY3A 3PY1A 1GIHA 2WMVA 3WF6A 3S1HA 5EM8A 4QP3A 3MFUA 4F65A 3JR1A 3OCTA 4KRDA 1J3HA 2QC6A 2WQNA 3UZRA 4MF1A 4EH6A 1J1CA 3R63A 1W82A 1Z57A 1KOBA 1Y57A 2YCQA 4QMYA 3N51A 3CPBA 4D2SA 2ZJWA 5CF4A 2ITPA 5M44A 4YJSA 2Z7LA 2XK3A 4JQ8A 3V5JA 2ETRA 4JBQA 3DKGA 4FA2A 3RGFA 3ATSA 4AN2A 4DEHA 2GPHA 1H26A 4AQCA 2J0KA 4I5MA 4F7LA 3SG9A 5GJDA 3W8QA 3WBLA 4QNYA 2OXDA 4QO9A 4MHAA 1IG1A 5M51A 4PV0A 3OXZA 4Y5QA 3QHWA 4RIYA 5I3OA 4ZEGA 5IKWA 2BVAA 4N0SA 3TL8A 3ULIA 4B7TA 4O7LA 3PPKA 3HDMA 4F6WA 2W1HA 3F5PA 3GB2A 3W2OA 4BDGA 2JAVA 4JR3A 2WTIA 3Q4UA 4HVSA 4U42A 3NCGA 2GTMA 3QD2B 3JY9A 1H1SA 4CFVA 1GZKA 3QA0A 3OT3A 3CKXA 3SOAA 2O8YA 5EI6A 3SLSA 4HYSA 3R7GA 2NRUA 4EH8A 2V62A 3SOCA 5IH5A 4IAIA 4H58A 4IACA 2CLQA 3Q4CA 4RJ3A 4DGGA 3F5XA 4E1ZA 4G3FA 2PUNA 3O7LB 4XRLA 2XS0A 3L8VA 4DFZE 4J8NA 3IW7A 2RFEA 5JEBA 4WRSA 3FMJA 4RIOA 2GDOA 5DOSA 3W32A 5CVGA 1M2QA 3S3IA 4CT1A 2YM3A 3NNVA 3QCXA 5AAEA 1PXIA 4KBCA 4ENYA 3CD3A 5IUIA 3Q4TA 3DZOA 1M14A 4ACDA 4E6AA 2FB8A 4FKUA 3P86A 2XM8A 4RIXA 2WB8A 1YI6A 3DAKA 3VUMA 3M2WA 3QCYA 4D2RA 2J7TA 4D9UA 3NYXA 4FICA 5J7BA 3FPMA 4BR3A 2P3GX 4O7VA 3POOA 4FKVA 4PMMA 5IA3A 5ITAA 3VS0A 2C1AA 2UZLA 3Q52A 1MQ4A 5KHWA 3LQ3A 3FZSA 2QU5A 2CGWA 3HA8A 1YWNA 2GU8A 3QGWA 3V5TA 5HVKA 4E5WA 1JKTA 4G3EA 3KULB 1DAYA 2C4GA 2G15A 2HW6A 3F3WA 4FSZA 5HNBA 5DBXA 3R2YA 3D0EA 3BGPA 4RA5A 4YJOA 3COMA 1IA8A 1ZYSA 4HGLA 4EUTA 5IUHA 4X3JA 3HP2A 3FDNA 3DBEA 1Q41A 3VVHA 4AZEA 5A4EA 3UIMA 3KRRA 2XNBA 1MRYA 4GSBA 4RFMA 4FNZA 2OKRA 3RK7A 2QONA 3MPMA 3EHAA 3TACA 3EYHA 2VO7A 2X8DA 2UW8A 5ETFA 2NPQA 2QD9A 4E73A 2R3OA 1FQ1B 3GVUA 4TWPA 3HMMA 5CU3A 4F4PA 3DKCA 2B9FA 4QTCA 3DTWA 4FGRA 3DNEA 2QI8A 2QO2A 2C3IB 4GFGA 3ZBXA 5AUUA 4Y46A 4IAKA 3ZO2A 1OPJA 2QOQA 3C13A 3NVKI 5KCVA 3BYVA 1PXJA 2PWLA 4MTAA 3U9CA 5GINE 1PKGA 2Y7JA 3MI9A 3GU8A 2P4IA 3LXKA 3OBJA 4QP7A 2BFYA 3EL7A 5AR5A 3N4TA 3ZLSA 2QOFA 4TY1A 3PDTA 2JITA 4PWNA 4EI4A 4O0XA 2W5BA 2ZV7A 3PJ1A 4F9BA 3EQIA 4IVCA 4FE2A 2I7QA 2BHHA 3EFLA 4YPDA 2QQ7A 3QQJA 3A7FA 4ARKA 4RJ7A 2Y4IB 3ZZWA 4PUZA 1WVWA 3AOXA 2A27A 4DN5A 5M06A 5B2KA 2KULA 3F5GA 3U9NA 4L68A 4U3ZA 5HICA 5CVHA 2DYLA 2ZVAA 3BIZA 5E7RA 4M12A 4AUAA 3B2TA 2WO6A 3T3UA 4NL0A 2OFUA 2WU6A 3CP9A 3DLZA 4N6YA 3G51A 3E5AA 2NNWB 2CGUA 2YAAA 1KOAA 5CEKA 5JKGA 4DH5A 5AIRA 3FQHA 4NM5A 2VWUA 2FA2A 4FV9A 4UXQA 4BCFA 2GQRA 3C1XA 2VTOA 2W1GA 3FMDA 3K2LA 3O7LD 4M13A 3ZFMA 4CMUA 2BKKA 4F7NA 4JNWA 4R3RA 2WOTA 2W9FB 2Z7SA 3CTHA 1W83A 3OWJA 5CF6A 3PXQA 2C69A 3R2BA 1H1QA 3ORXA 4GFOA 2YIYA 3ET7A 3TT0A 3ZU7A 2XA4A 2X7GA 3PXYA 3GU6A 2XIXA 5HO8A 3AMAA 3H9OA 3G5DA 4ACMA 3FY0A 2XNGA 3QLGA 5BVDA 5M57A 3S95A 5HI2A 3TN8A 4U41A 3VNTA 3EFWA 5E8SA 3C50A 4HCVA 1ZZ2A 2YWPA 4WBOA 4NKSA 4A4LA 3BE9A 1Q8TA 3FLYA 5E8XA 4AU8A 5JRSA 4FV3A 4GK4A 4DEAA 2RKUA 5K5XA 4X3FB 2B52A 3FKOA 1VYZA 2VO6A 4FOBA 2RG6A 3A7JA 4GIHA 2VWWA 4U9AA 5AEPA 5CT0A 1Q3WA 3ORZA 1KSWA 3G9LX 4E4XA 1Q97A 2VV9A 4RVTA 4UMQA 3GOKA 3UOLA 1PYXA 3DBDA 3W2CA 4CLIA 4BDEA 5HTIA 2V7OA 4WOVA 4WNPA 4FTLA 4TYJA 3UVRA 4GW8A 2I0EA 2ITWA 3CTJA 4YZBA 5C9CA 4BCHA 5CEPA 4DYMA 5I9XA 3PLSA 3TTJA 4JL9A 4OTGA 2ITUA 3BX5A 4FODA 4BL1A 3NAYA 3V6RA 4EK8A 5M08A 2VTAA 3PG3A 4MAOA 2C5VA 4V0GB 3G15A 4QQCA 1WBPA 4EH7A 4DF3A 2DWBA 5DVRA 3K54A 5BYYA 1CMKE 1I09A 3HNGA 4YJTA 3UDBA 3VS1A 4C4GA 2VX1A 3D94A 3ZFYA 3I79A 3AT3A 3GENA 2YABA 2Z02A 2X4ZA 2B53A 5CALA 2GNHA 4DBXA 2VN9A 1MQBA 4J7BA 1B39A 2XIKA 3RAWA 5AFVA 4EUUA 1Q8WA 3KULA 3SRVB 4I1ZA 4KS7A 4RX8A 4CFFA 3VF8A 5CZIA 1T46A 4D4RA 4ZLZA 3ROCA 4U0IA 2PHKA 4C8BA 5HX8A 4IWQA 2R7IA 3QF9A 2C30A 4YC8A 5D41A 3H9RA 3DDQA 4AG8A 2C5NA 4EOQA 3BV2A 5L2TA 4FKLA 4F1OA 4EBVA 1PMEA 4TYHB 1SVHA 4X0MA 2XJ2A 4AE6A 3GCSA 3NUYA 4WUAA 4MBJA 4HJOA 4XP3A 3LM5A 4IZ5A 5LVMA 2X39A 2IZRA 4APCA 4ASDA 5AV3A 2AUHA 2YA9A 2XBJA 3HMNA 5M4IA 5BYZA 1KE8A 2YIWA 4EYJA 2J90A 5K0KA 4FSRA 3F7WA 5CU4A 3ROYA 2R3KA 3GT8A 4WUNA 5HLWA 2BRBA 3MBLA 4RX5A 1OPKA 3TTIA 4JDIA 2OJFE 2R2PA 4GK3A 4M0YA 4NKAA 2I40A 3T3VA 2OW3A 4OTRA 3VBQA 3TNPC 2GNIA 4C35A 3QTZA 3WZUA 4O7YA 1SNXA 3VRZA 4RMZA 4Z16A 2PUUA 3IDCA 5AR3A 4NT4A 2O3PA 5AV1A 2PMIA 2HY81 3LFEA 4AGCA 5FP5A 5ACBC 5IH4A 4I0RA 1L8TA 1TQMA 1E1VA 4XEYA 3UNKA 2YACA 1BI7A 5HX6A 2R3NA 2CMWA 4QQTA 1WBOA 3ZS5A 2I6LA 5F1ZA 4M84A 3BRBA 4FTQA 3DB8A 4UEUA 5AUWA 1YOLA 3FC2A 1JNKA 3KFAA 4GUEA 3OEFX 4HYHA 4IB5A 4RLLA 2VTJA 3QCSA 4BHNA 3UIBA 4F70A 5DEYA 1JVPP 5CAPA 3CEKA 5GIOE 2F7ZE 2IWIA 3GU7A 4YC6A 4M7IA 5DR2A 3A62A 4TNDA 3KQ7A 3QRIA 2YZLA 5FTOA 4DTBA 4DCEA 3P0MA 3UJGA 1K3AA 2WFYA 4QMSA 3R83A 4GUBA 2ITXA 5I5ZA 4CRSA 1JLUE 4FTRA 1Z5MA 3AMYA 4UB7A 3NYVA 5ANGA 2JC6A 5CYIA 1DI8A 2H9VA 1PXLA 2VTRA 4E4NA 4E7WA 3ZO1A 3BLHA 3DNDA 4BCIA 4EKLA 5IQIA 1LPUA 3EL8A 4QP8A 4C62A 5CQWA 3JXWA 4X3FA 4GG5A 4J96A 4C59A 2QNJA 3MN3A 1QPDA 4FMQA 5FGKA 3T9TA 4C58A 4AGUA 1Q3DA 4I5CA 4PMSA 5HZNA 5EW8A 4DG0E 1H1WA 1OIYA 2JIUA 2ZOQA 3TKUA 3GNIB 4YU2A 5AV2A 3UZTA 2QOOA 4UN0C 2H6DA 4O83A 5DYJA 4HGSA 2BCJA 4TWOA 3RM7A 4FZ6A 3RINA 5L6WL 3C4XA 4HVIA 4MD9E 2WTKC 1H8FA 3CE3A 3H30A 3TV4A 4OAUC 4NSTA 3VS3A 2X8EA 2Y4PA 3PLAE 2YM7A 2EB3A 3A7IA 3CY2A 4E20A 2OIDA 3GQLA 2J51A 3WYXA 3R73A 4V0GA 3TNHA 3S00A 5D7AA 5EM6A 3ZBFA 4ANSA 5IDNA 4EC9A 4JRVA 5ETAA 4DFBA 4XG3A 4Y85A 3ZRLA 3UOKA 3U6IA 3VW6A 3EKKA 3OCBA 2PVMA 2YDKA 2ZB0A 4CFNA 5HIDA 2YFXA 4XOYA 3LFCA 3VUKA 4O7RA 2OLCA 2EU9A 4S33A 5KBRA 1NW1A 5IQFA 3PVGA 3ZOSA 4AACA 5IUGA 5IEVA 3TIZA 3ALNA 4PL4A 3RWQA 3R7OA 4EH3A 3CD8A 4DCAA 2F9GA 4CV8A 3THBA 4F6UA 3QKKA 2CKPA 3AD6A 4W8DA 4G5JA 3VUIA 3OY3A 3OZ6A 3DAEA 3R7IA 5EI2A 3BE2A 5IA2A 4DGOA 2XB7A 3Q5IA 3ZLWA 5J7HA 2WEVA 5HE1A 4TYHA 5IA4A 5LMBA 4ZSJA 3HLLA 2Y9QA 1YXVA 4WRGA 3QRTA 4OW8A 4D5KA 3MS9A 1HOWA 4MXOA 4X21A 2YISA 1XH8A 2W4KA 4JI9A 3IONA 1XH4A 3NZ0A 3OG7A 4PTGA 3R1QA 4ASXA 2ZMCA 2W5AA 4BTKA 4AS0A 3Q9XA 3C4CA 3BU6A 2J5EA 2E9PA 1EH4A 5ANIA 4KINA 4EOJA 5AAFA 2CCHA 4KD1A 2GMXA 2YAKA 3Q6WA 4HNIA 1FVVA 4ZY6A 2PUIA 3FXZA 2ETKA 3LE6A 2WTCA 1AQ1A 3PSDA 2XKFA 4YBJA 2G9XA 4LMUA 2WMAA 4FNWA 5CEOA 3IDBA 3ORIA 5DT0A 1OIUA 5IEYA 4AF3A 4H05A 5F9EA 4U5JA 2VX0A 2Q83A 3IK3A 3H0ZA 2YEXA 3GEQA 1PRYA 4ZTNA 2PYWA 4ACCA 3KU2A 5HG9A 3PA3A 4RVLA 4Y5HA 4BBEA 4RWLA 3NDMA 3IO7A 3UNZA 3WIKA 2V7AA 1VJYA 4L43A 3TM0A 4BTMA 2W9ZB 2VTIA 1Z9XA 2PY3A 3SQQA 1P4OA 2YM8A 4DFXE 3NNWA 3R02A 3QFVA 1W98A 3NW7A 4TKSA 4BBMA 2YM6A 2IN6A 4RT7A 4HVGA 5LXMA 2XKEA 3D4QA 2E9UA 2ZAZA 4R6VA 3EYGA 4NJDA 5IMEA 5M56A 4WT6A 4DAWA 5G6VA 3PWYA 4HVDA 4IXPA 2FH9A 3EFJA 5A4LA 4W9XA 1JKKA 5M55A 3GXLA 2WMUA 2R0UA 3KCFA 4BCPA 4BBFA 2UW0A 5LARA 3TUCA 3TWJA 3I1AA 5IA0A 3GFWA 3G2FA 4TPTA 5HHWA 4H1MA 3PSCA 2XH5A 2DQ7X 4PNIA 2QKRA 1BL7A 2VO0A 4LL5A 2XIZA 3I6UA 3KXNA 4XG6A 5HCYA 3RI1A 5EFQA 1SVEA 4ASEA 4BC6A 4JIKA 2OJIA 4BCGA 5LVLA 3H4JA 4RFZA 3BEAA 4FNXA 5BMSA 2H34A 2ITVA 5EQYA 4FKWA 3R9OA 5JSMA 2PZYA 2BRHA 4XP0A 4YHJA 3V8WA 3WYYA 3D14A 2BFXA 5J9LA 3CKWA 5EM7A 3MB6A 4CFWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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