2PVMA

Structure-based design of pyrazolo[1,5-a][1,3,5]triazine derivatives as potent inhibitors of protein kinase ck2
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
328
structure length
327
Chain Sequence
MSKARVYADVNVLRPKEYWDYEALTVQWGEQDDYEVVRKVGRGKYSEVFEGINVNNNEKCIIKILKPVKKKKIKREIKILQNLGGPNIVKLLDIVRDQHSKTPSLIFEYVNNTDFKVLYPTLTDYDIRYYIYELLKALDYCHSQGIMHRDVKPHNVMIDHELRKLRLIDWGLAEFYHPGKEYNVRVASRYFKGPELLVDLQDYDYSLDMWSLGCMFAGMIFRKEPFFYGHDNHDQLVKIAKVLGTDGLNAYLNKYRIELDPQLEALVGRHSRKPWLKFMNADNQHLVSPEAIDFLDKLLRYDHQERLTALEAMTHPYFQQVRAAENS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-based design, synthesis, and study of pyrazolo[1,5-a][1,3,5]triazine derivatives as potent inhibitors of protein kinase CK2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
molecule tags Transferase
source organism Zea mays
total genus 112
structure length 327
sequence length 328
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2007-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2pvmA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2pvmA02
3QL8A 4LOOA 4EJNA 3F2RA 2PVHA 5HLWA 3COHA 3HGKA 4C36A 2ZOQA 4L42A 2BAKA 4BDAA 2J0MB 1ZYCA 2QC6A 2W5HA 3RAKA 5DGZA 1KE6A 4C2WA 5TO8A 2W9ZB 3FLWA 3QF9A 3UZPA 4GFGA 3QHRA 4O0UA 3A7IA 2IJMA 5JGDA 5HI2A 4B99A 1FPUA 3LFBA 4GV1A 3FC2A 3R9RA 3BQRA 3CP9A 5E8YA 1PYEA 5AR5A 3UTOA 4DEIA 4HYHA 4YZNA 3W2QA 3QHWA 5FG8A 4FZ6A 4EK8A 2ITXA 2ONLC 3NW5A 1FMKA 3F3WA 4EKKA 5IUIA 3UJGA 2VNWA 4QP9A 3FI2A 4YLJA 4BTMA 4GYIA 4L53A 4C35A 4DEBA 3LLAA 5AFVA 3K5VA 5LMAA 3S0OA 3Q3BA 1GNGA 4BDBA 4BCQA 1Q5KA 3CKXA 4QTAA 3FZPA 3PIXA 3R7VA 5HLNA 3DKFA 3NNWA 3IKAA 2PVYA 5ANGA 5G1XA 3IOPA 4NM3A 1YXVA 2C6TA 5JKGA 3VO3A 3IW5A 5I5ZA 2V55A 4XOYA 4QTCA 5EI8A 4FTAA 3TZMA 5CF8A 3G5DA 2ZMCA 4FSUA 2Y6OA 3LZBA 2IZTA 4YSMA 2WQMA 3Q9XA 4RG0A 3NNVA 3DBCA 4AOTA 2BHEA 3WZJA 4CKJA 4Z7HA 4HCTA 3NUNA 1H01A 3UVPA 3ZLWA 5CX9A 4ZTSA 3F69A 5CQWA 1H26A 2P4IA 1WZYA 4G2FA 1WVYA 4M8TA 3P23A 2DS1A 3UIXA 3ZSIA 4PMMA 3EFJA 3TIZA 2GQGA 5TKDA 4MNEA 4I22A 3F7WA 4NWMA 4L45A 4LRKA 5JQ8A 4L43A 2Z7QA 3HMPA 3E8EA 3FY0A 2XNBA 5DA3A 2BFXA 3V6RA 5HD4A 4IAYA 4Y5HA 3MN3A 1TVOA 4WUAA 2X1NA 1SZMA 3UO5A 5AR8A 4XP0A 4PNKA 1W82A 4F09A 4YJVA 3MGYA 5J7BA 4RIXB 2W1DA 4X0MA 2F7EE 4AAAA 3IK3A 4I5HA 2QOLA 3HMOA 1CSNA 3R01A 4E5BA 3DAEA 1PMUA 5C27A 4ZIMA 4HVHA 5AUYA 5HE3A 4D0WA 4YLKA 3L8PA 1UU3A 4GYGA 3QGYA 5J1VA 3LXKA 4IZ5A 3GCVA 3NIZA 4J98A 2GSFA 4ZSGA 4B9DA 4GCJA 4IXPA 4GFMA 3R9OA 4APCA 2Y4IC 1OIUA 4CTBA 2CNUA 3DXQA 3QKLA 3U6HA 4FODA 4FSNA 4DBNA 2HELA 2YCRA 1ZWSA 3RZBA 1XH4A 5DOSA 4IE9A 3BHVA 4AXAA 3HP2A 1OPJA 2HZ0A 1PYXA 5CS6A 4QPAA 4KKHA 2WEVA 2GTNA 2ZVAA 3BLQA 2WMUA 3TV4A 2WEIA 4G5PA 5TR6A 4K33A 3AD6A 1WVWA 3V8TA 1PKDA 5ACKA 4NCTA 4ALWA 4R3PA 3V04A 4QYFA 1CMKE 3OCBA 3R7GA 1NVSA 2V22A 5FM3A 3CEKA 4G6NA 3F88A 3JY9A 3F5UA 3V5TA 1W7HA 4G9RA 4J8NA 1PXJA 2E9VA 4P5ZA 4WG5A 4A7CA 4DEDA 4YUQA 2CKQA 5HQ0A 1H1RA 3OBJA 5AA9A 3LFNA 4L68A 1AD5A 4FEQA 2EUFB 3EQRA 3FHRA 3MPMA 3MH2A 4TL0A 4IX3A 1M2PA 4ZTRA 4AZVA 2PE1A 3QCXA 3I6WA 2R3QA 3D2IA 1WVXA 3E63A 3PP1A 4P90A 4X3JA 1G8SA 5DN3A 3LFCA 4RSSA 2VO7A 4P2KA 3DBFA 3M2WA 3WF5A 4AE6A 4EOLA 4WD5A 5ETIA 1OBGA 4MD9E 3W2RA 2AC5A 4L52A 4QMSA 5D41A 1TKIA 1JBPE 5CEMA 3GQLA 3OZ6A 3TNQB 3HA8A 3NPCA 3R02A 5H2UA 3AD5A 3UPZA 4M0ZA 4G3EA 5IH4A 2VWVA 5EHLA 4D4SA 3IPHA 2ITUA 3PG3A 1EH4A 1E9HA 3LVPA 4FTCA 3D5VA 3RWPA 3RPYA 1Z5MA 4TYGA 3RVGA 4E26A 3CY2A 5KMKA 4PL3A 2PULA 4RBLA 3EKNA 3MVJA 3CS9A 3FLNC 1TQPA 2OSCA 4QD6A 5GJDA 3BELA 3QRIA 1BKXA 4ITIA 4E4LA 5AJQA 5C8NA 5EH0A 2ACXA 3WF6A 3GFWA 3R7OA 2ZYBA 3EYHA 3R6XA 2ITYA 4RZWA 4XRJA 4YO6A 4I6HA 4D1XA 5M07A 4O1PA 5CWZA 3VBVA 4HJOA 1P4OA 3G33A 3LXLA 2YM7A 3P78A 4R1YA 2IN6A 3AGMA 4YZBA 1PY5A 5BVKA 4QP2A 4MQ2A 3QCYA 2ITTA 3JVSA 4V01A 3QD0A 3RK9A 5LQFA 4UYAA 3BYOA 3KGAA 4BVUA 4K11A 3AC4A 5AM7A 3EL8A 1IRKA 2W17A 3EQDA 1Y91A 4KIKA 2OK1A 2GHGA 3OWKA 2VGOA 4HVIA 4TWCA 5HIEA 5M53A 4YURA 5HOAA 5DNRA 2VTPA 5LVMA 5IDPA 5CSXA 2ITPA 5TOZA 4KS7A 1NT2A 2XH5A 5DFPA 3KMMA 3TZ9A 2J51A 4FKJA 4JT3A 3QRJA 2CN8A 4GSBA 4RVMA 4ZZNA 1M14A 1JSVA 2R2PA 2JDSA 2GNLA 4AWIA 4D2WA 5E1EA 5AP1A 4FSYA 3W2CA 4GVJA 3SXSA 4CD0A 3O2MA 3TNHA 2C6IA 4FL3A 3EQGA 5AUZA 4ZS0A 3GC0A 2PL0A 4R77A 3KXGA 1S9JA 3LIJA 3OF0A 3N4UA 3EN6A 5H3QA 3PA4A 4TZRA 5EW3A 4DG3E 3C7QA 4BDDA 4M67A 3SV0A 3ZOSA 4E20A 3FKNA 3M42A 2QQ7A 2R3NA 5KMNA 3PRIA 3I81A 1ZMWA 3MB6A 2Z2WA 4XX9A 3VUGA 4GMYA 2DWBA 4YNEA 3NVKI 5M08A 3FI4A 2KTYA 2V0DA 4D55A 4WNMA 5AV4A 3R7IA 3DJ5A 4EHGA 4JX3A 1J91A 3E7OA 3MV5A 4JXFA 4AOIA 4ANOA 4ZOGA 5KCVA 4O6LA 2YAKA 4QP1A 3LQ8A 4BI2A 5E1SA 4X21A 1CM8A 3PPZA 1OB3A 3PXFA 4FIIA 4NW6A 3MB7A 4J97A 4EYMA 4XBRA 3DJ7A 3VUIA 3BX5A 3PG1A 1T46A 4P7EA 4U42A 5HU9A 3Q6WA 2XIRA 3ORTA 2J9MA 3DDPA 4FKUA 2XIZA 5ANIA 2R3FA 4FNYA 4U45A 5DIAA 2CLXA 2VWXA 1A48A 5LARA 3PTGA 1RDQE 5ANOA 4NJ3A 3NYVA 4U81A 5I9ZA 1H24A 3QWKA 5BVWA 2JC6A 2R3HA 3VS3A 1B39A 2X7GA 3C13A 3RBWA 1ZXEA 3RJCA 4W4WA 4B7TA 4EQCA 3VQHA 1OIYA 2QOBA 3MY0A 1KE7A 3QRUA 5E91A 2QURA 5AM6A 2C4GA 2WNTA 1LR4A 4NEUA 5BYZA 3B2WA 4EOSA 4MXXA 4O7ZA 2WTCA 4YMJA 3VHEA 3MFUA 4FI1A 4U79A 4DEAA 1H8FA 4D2SA 2XEZA 4ZXTA 2R3MA 3QQFA 4EONA 4MKCA 3C4XA 5KMLA 2YCQA 5CZIA 3U6JA 2ITZA 4NZWB 1K9AA 2VWBA 2I0YA 5LXMA 5HICA 3EZRA 3WARA 5CNOA 3ORNA 4S30A 1OM1A 4O7RA 2WAJA 2Y0AA 2C6EA 2JAVA 5FEQA 1GOLA 4G9CA 4OGRA 2HYYA 4MH7A 4NJDA 3TCPA 4J95A 4DGNA 4E4XA 5IA2A 3E8CA 2BRHA 4FKGA 4X2KA 2WD1A 3VQUA 3W10A 1U4DA 2RFSA 3LCTA 4RA5A 4YJOA 3H0ZA 1O6LA 2GHLA 3D7TA 5M56A 4FKOA 3UNJA 4YPDA 3EN9A 3VN9A 4E5AX 4U0IA 4O7NA 1URCA 4M3QA 3MA6A 5L2WA 3CQEA 1JPAA 3FXZA 3ODZX 4GVAA 5JEBA 5KKRC 2QOQA 1H28A 4NCTC 4XNEA 3R1QA 4ZEGA 3BLRA 3VS5A 4EC9A 2JGZA 4NM0A 5GJFA 4CSVA 4WKQA 5J9ZA 4I5PA 4HYSA 3PXQA 3BWFA 2ZDTA 4IMYA 4R3RA 4U3ZA 3GC7A 2ERKA 3L8XA 4CV8A 3G0FA 4NH1A 4XV1A 5H9BA 2NPQA 4ZSJA 5AUVA 3DCVA 1H0WA 2V5QA 3Q60A 2FSOX 1J7LA 3R04A 3CC6A 5JH6A 4U8ZA 3JXWA 3LJ0A 3LOKA 2GTMA 1KUTA 3U4WA 2EXMA 3AD4A 4FC0A 3P7CA 3GVUA 4UMPA 4XEYA 1RE8A 4PF4A 4R1VA 3TTJA 3MY1A 3VAPA 1PXLA 4K18A 2PYWA 4DTBA 2BZKB 3EB0A 3FEGA 3R8LA 4F63A 4D2PA 4PL5A 4QMXA 3FMKA 4MVFA 4HW7A 3PIYA 2XJ2A 2ERZE 4Q5EA 3T9IA 3FZOA 3F3ZA 2XA4A 5E7RA 3W2PA 4AFJA 3E3BX 3HV4A 4DH7A 4NM7A 3GEQA 4P4CA 5AUXA 4OT6A 1NY3A 3DZOA 1OPLA 3HVCA 4FTJA 2F2CB 2VTIA 4FV9A 3UQGA 3I7BA 4GW8A 1SNXA 4YTIA 4AA0A 4BHZA 4DHFA 5A14A 2PMLX 3QZHA 3VUKA 5IH5A 2QOIA 4FT9A 4FKLA 3ZBXA 2G2HA 5CALA 1Q62A 1F0QA 1YOJA 5CU6A 5T3QA 4CFFA 3C9WA 2H9VA 3FMHA 4MK0A 2XVDA 2R0UA 4WNKA 4XHKB 5BYLA 3UVQA 1X8BA 3ZXZA 4RA4A 5IQAA 3GC9A 4TT7A 4XLIA 2PUIA 3Q2JA 5EQEA 2GS2A 2XM9A 2ZV7A 4IAKA 5IQEA 2B52A 3OG7A 4DE4A 3WF8A 5IEXA 3IW4A 3PZHA 4I94A 3G15A 1KOBA 2C0OA 4ZY5A 1YDTE 3PDTA 4XG6A 5AUUA 4A9YA 5HORA 4RVLA 1V0PA 4MXZA 5CVGA 1WBSA 4AZSA 2C6LA 3ORIA 4F1OA 3UG2A 5IF1A 4XBUA 3TUDA 4LMNA 1PXPA 2EXCX 3K3IA 3BV2A 3GU4A 2OXXA 5HO6A 3D2KA 1OIRA 5AUTA 1SYKA 4CFMA 1PXNA 3OTVA 2BUJA 3EZVA 5AX9A 3C4WA 3RPRA 4RIXA 5HO8A 4IM2A 4YJQA 5GIOE 5AP2A 3VRYA 4BDEA 1YXUA 2B55A 4E4NA 4A4LA 4BRXA 3HKOA 4F6SA 3FYJX 4IADA 4C0TA 2XIXA 3A7JA 5CAQA 3OT3A 5IA1A 4D9TA 5JZJA 3BGPA 3COIA 3P5KA 4E4MA 2XF0A 3F3VA 3QCSA 3K3JA 2BTSA 1M7QA 3QTRA 5M44A 2XKFA 2VTJA 5DR6A 5KHXA 4O6EA 4GK2A 4RJ7A 5EOLA 3H0YA 4E73A 3DZQA 3OXZA 3KRLA 4BDHA 3EMGA 4OTPA 5E92A 5CI6A 2WO6A 4TYEA 3TACA 3BBTB 2PUPA 1OZ1A 2BVAA 2OKRA 3QQUA 4Z9LA 5A9UA 5D12A 5FQDC 1PRYA 5HE2A 3FZRA 5CAPA 4MHAA 1UU8A 1OUYA 1P2AA 2W1HA 1MUOA 5C8KA 1WBOA 4CV9A 3TG1A 2R3RA 2Y7JA 1H27A 2YFXA 4KSQA 4RWIA 1SVEA 2HXLA 2XNEA 2XB7A 5FDXA 4FSTA 4UYNA 5HG7A 2QHMA 3V51A 5KMIA 4BTFA 3ZRLA 1JLUE 1ZMUA 5EK7A 1JKLA 3NUXA 3OXIA 4ASXA 3ROCA 2NO3A 2LAVA 4G34A 4BWXA 5BNJA 4J53A 4FTUA 3ZUVA 2XUUA 3WF7A 4APPA 3DBQA 4M12A 4FIJA 3QA0A 3PJ3A 2NRUA 4ACMA 4C3RA 2UZTA 3NAYA 3COMA 3R30A 4Y83A 1IG1A 2HWOA 3WZUA 5CU2A 4BDIA 4E6QA 3WZKA 3VBXA 4CKIA 4Z3VA 1J7UA 3TEIA 4DH1A 3NUSA 3OT8A 3F6XA 3IG7A 3KFAA 3Q5ZA 4S34A 4WBOA 2X9EA 5T68A 3CCNA 3TJDA 3FMEA 3FZTA 3G6HA 2C6MA 4QMUA 4TPTA 3RAHA 3B8QA 3RCDA 4CFXA 1FVVA 1APME 4FV0A 3ZH8A 4FTMA 3CD3A 4JS8A 2VWZA 1DI9A 2V7OA 5AV1A 4WSYA 3O8PA 4D9UA 4E6CA 5DMZA 3U54A 4C37A 1YWRA 1HCLA 2BHHA 1JVPP 2ZJWA 2G9XA 3KY2A 2CLQA 4XG3A 4BDGA 5AAEA 2H96A 1BI8A 3Q4CA 4FV6A 4UMTA 2XKCA 4GIIA 1OVEA 3FKOA 3TL8A 1XBBA 3ZRMA 3Q9ZA 5M4IA 3G51A 5JT2A 1P4FA 4BYJA 2CKEA 5HG5A 2X7OA 4ZTLA 5IQBA 3QKMA 3AT4A 4PNIA 3QA8A 4ZY6A 4FTLA 2PZIA 5I9UA 4EEVA 4WT6A 1YHSA 2VWIA 3Q9WA 4U9AA 3V5JA 4ZLYA 4WNPA 1XWSA 3EKKA 3EQHA 5EM7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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