2QVSE

Crystal structure of type iia holoenzyme of camp-dependent protein kinase
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
338
structure length
323
Chain Sequence
ESVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title PKA type IIalpha holoenzyme reveals a combinatorial strategy for isoform diversity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase, alpha-catalytic subunit
molecule tags Transferase/transferase regulator
source organism Mus musculus
total genus 87
structure length 323
sequence length 338
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2007-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2qvsE01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2qvsE02
4HW7A 2J0LA 2EU9A 3I0QA 4YJVA 5FBNC 2ZAZA 2Z2WA 2XA4A 3LFSA 4ZY4A 3AGMA 4WBOA 3NWWA 3FKNA 4U80A 3VRZA 2J51A 5EKNA 1KUTA 3RVGA 4BHNA 4IWQA 2PUPA 2YLEA 3JS2A 4FMQA 4XYFA 5CF8A 3JXWA 4Y73A 3UIBA 4IZ5A 1WFCA 2CJMA 4YC3A 2XNMA 4HYUA 5H2UA 3I5NA 4I23A 4JAJA 2QOFA 4U45A 1E9HA 4AF3A 2VTHA 3G33A 4OT6A 4YJQA 3CPCA 4XG9A 4O91A 4GK2A 4YP8A 4CZUA 2F2UA 5HG8A 4CMTA 2Q0NA 3MI9A 2YIXA 2LGCA 2G9XA 4QQ5A 1M2PA 3NR9A 1NVSA 4BYJA 2YM8A 3RZBA 2W1DA 1DM2A 3C4XA 2CGVA 2QO9A 4QMTA 4MTAA 2XIZA 3OW3A 3PTGA 2C68A 1Z9XA 3F69A 2UZOA 3G2FA 2QOBA 4QMPA 5CXHA 4AZEA 3D5UA 2XNEA 4J8MA 5CZHA 4JAIA 4X2KA 5IA1A 3A7HA 3TL8A 2GQRA 1OL6A 4O2PA 5EI6A 4XEYA 1OMWA 2VO7A 4DFUA 3FMHA 1ZMWA 2HWPA 3E7OA 2UZNA 3I5ZA 3MS9A 4ANSA 4KBKA 2UW5A 3W2SA 2OIQA 4FIEA 4WHZA 4K8AA 4S2ZA 5E1EA 5C8MA 1H0VA 3Q5IA 2Y7JA 4ZP5A 5AWMA 3Q3BA 1XQZA 3AGLA 2PVJA 3TZ9A 3NUYA 4XUFA 1JQHA 3QLGA 3U9NA 2PPQA 4MD9E 4DHFA 2VWVA 5HVJA 4Y46A 5LMBA 5F1ZA 3QX2A 3Q96A 3DXNA 4S34A 4G2FA 5BPYA 3R73A 3FXXA 3SGCA 4JR7A 4AAAA 5JK3A 5KBQA 5M4UA 1JKKA 2GPHA 2ZOQA 3RPYA 5C01A 1IASA 1HCKA 5E7RA 2Z7RA 1V0BA 3GBZA 4CFNA 3R2YA 4FODA 4CFUA 3CKXA 5DVRA 5FEDA 2WIPA 4C4FA 4FT3A 4UYAA 4J8NA 2I0VA 4RFMA 1BUHA 3FMNA 5KE0A 2IW9A 3CQEA 3Q2JA 3P7BA 4F7JA 2J50A 5ANDA 2GQGA 3BLRA 4FOBA 4EOKA 3FMLA 4BI2A 4YURA 2P2HA 4DG3E 4DT9A 2VWWA 5ETAA 4JQ8A 2YJSA 4YSJA 2HZ4A 2J5FA 3QCQA 4XHKB 4XOYA 4FGRA 4I6BA 3O7LB 3RK9A 5AFVA 1OBDA 4EWQA 1Y91A 3L8PA 5L6PA 4V0GA 5JEBA 3P1AA 4I6HA 1SMHA 5A4EA 4QTBA 1BL6A 2ITOA 5HEZA 4EC8A 3KN6A 4E6QA 2AYPA 3D94A 4O1PA 3VHEA 1TKIA 4AT3A 3TACA 4DEEA 4ACHA 4HVGA 5E8YA 1ZAOA 5M09A 3GOPA 4ZTMA 5HNGA 1Q8ZA 3F88A 4WUNA 5DA3A 3QRIA 4TZRA 4YLLA 3FMDA 2XJ2A 3QF9A 4BDCA 4J97A 4C4GA 4E6AA 3KRJA 1DS5A 4TW9A 1FVTA 3BBTB 5JFXA 5KUPA 3N51A 4DC2A 1Y6AA 4EL9A 4NM0A 3Q4CA 4RX8A 3ZS5A 4AZWA 4ZLYA 3EMGA 2CNVA 4NM3A 4F7LA 1MP8A 3NW7A 2ITPA 5JSMA 4LYNA 4QP2A 4IX4A 5DG5A 3R9OA 3FEGA 4O27B 3LCOA 2ETKA 4ASEA 4WKQA 3HX4A 4GU9A 4BWKA 4OTHA 1OIQA 3FZOA 3HV7A 4PL5A 4XMOA 4OAUC 2YZLA 4CKJA 2YIWA 3EL7A 4AN2A 4NH1A 4GL9A 3ATTA 4LMUA 4ZIMA 4FV1A 3PXYA 3EJ1A 4OTFA 4EWHA 2WMUA 3LOKA 3OUKA 3R2BA 3RTPA 2W9ZB 3RHKA 3RKBA 2IN6A 3LMGA 5HG7A 2WKMA 2X1NA 2ZM3A 5AP2A 4X2NA 1K2PA 4L6QA 4XLIA 3DFCB 4XP3A 2G2FA 4XG8A 2OJ9A 3A2CA 3LPBA 4FKRA 4FTTA 2ZMCA 1ZXEA 2WMRA 2Z7LA 3ORKA 3FUPA 3Q60A 2PZPA 2XKDA 2XNBA 3AQVA 3DTWA 4CLIA 5LWNA 3QXPA 4H3PA 4NKAA 5E8VA 5HLPA 4II5A 4ASDA 4Z7HA 4CQEA 4V01A 5M08A 5LVLA 4FTAA 4PPBA 5DFPA 3QKKA 3PUPA 5D7VA 4USEA 2J90A 2Y8OA 2YACA 4CFMA 3B8RA 3LCKA 4G31A 5B7VA 3ZC5A 4EHVA 4XG4A 2ZM4A 3C4FA 4YBKA 5EOLA 3QQKA 2X4ZA 4CYJA 2QOQA 2R7IA 2YM7A 4PPAA 4ARKA 3Q4UA 3WI6A 2R3NA 1U4DA 3WIKA 3PJCA 2I0EA 2FA2A 4FKQA 3V5QA 2XYUA 4PL3A 2RFDA 3KA0A 3MTFA 4O81A 4YGAA 5KMJA 3GC7A 1Q4LA 2OWBA 4F63A 3EN6A 4LRMA 5J9LA 1WCCA 5EW3A 4QOXA 5LVOA 4QTEA 3FBVA 4TWNA 3PPJA 3CD8A 4FSYA 2ONLA 4UMQA 2OJJA 3HDMA 4K2RA 4WOVA 2X9FA 3OROA 5HG9A 2C0IA 3IW6A 3SKCA 5CEOA 3PA4A 2RF9A 3NZ0A 4AE6A 1CTPE 2W4JA 4MD7E 4Q9SA 5LWMA 1NW1A 3A8WA 3OS3A 4RIYB 3QBNA 2A2AA 5E92A 3FI4A 4V0GB 3ODZX 4RC3A 1PXJA 4BDIA 1F3MC 4PMMA 4FG8A 2XBJA 4FVQA 4PP9A 3NSZA 4ITJA 4J95A 5I0BA 4IIRA 3Q6UA 2BRGA 1URWA 3PJ2A 4IAYA 1R0EA 3U54A 2X2KA 1QPJA 2BDJA 2R3QA 5HG5A 4O7NA 5TO8A 2VO3A 1ZOGA 2W0JA 3D0EA 4I93A 4G3CA 5CLPA 5CVFA 5DR2A 4M69A 3FC1X 3ITZA 4GT4A 3MGYA 5AP6A 3F2NA 3R01A 4YZDA 3CQWA 4EHZA 2QR7A 4ITHA 4GJ2A 3VRYA 4ZTQA 2BROA 2W05A 1OKZA 2YN8A 4D4SA 1JKSA 2PSQA 4AA0A 4C4JA 5D10A 3LXKA 5HCZA 2VGOA 4YZNA 3L9NA 1T46A 3FZRA 2ITTA 3FYJX 3PVGA 4PTCA 3MH2A 3ID6C 4DG2E 3LCSA 4BKJA 4O83A 2RL5A 3HEGA 4YZ9A 3NUNA 2IPXA 3A60A 1CM8A 3DCVA 3FAAA 3GU7A 3HZTA 4OTGA 2UZVA 4PTGA 2YITA 3UC3A 3PP1A 3FZ1A 5DE2A 3ORZA 4OTDA 1SVHA 2OK1A 4R7HA 2P33A 2PE0A 4YC8A 5L2WA 4OTQA 4WBBB 2BRNA 4TT7A 2YM4A 3OBGA 4HVDA 3IOPA 4AUAA 2BAJA 1YWNA 4XRJA 2V62A 3BHUA 3IW4A 4WRGA 2X7GA 3H4JA 4D5HA 3UMXA 3ALOA 4RX9A 4EZ5A 3V51A 2ITYA 1YVJA 2PMOX 3C0HA 5GJDA 4QMQA 2XB7A 3QQFA 4ZSEA 3P0MA 2QONA 5GJGA 2PWLA 4FSZA 3KC3A 5B2LA 4AT5A 4BHZA 4XP0A 5FXQA 3R7VA 3ZYAA 4I20A 2HAKA 4W4YA 2PVNA 5AP3A 3LMHA 2PUIA 3VW8A 3AC5A 5CSVA 3BKBA 1H26A 3MFUA 4G17A 3FZSA 2ZV8A 3HRBA 2JFMA 3MPTA 3P86A 3QUEA 4FK6A 4WSQA 2Z60A 3G0FA 3QRJA 5ANKA 2VTPA 5AM7A 3EYGA 3EKKA 4APCA 4QMWA 3IDCA 2UVYA 4ZY5A 3TCPA 3G6HA 3LW0A 2GNHA 2A27A 4TN6A 1JSVA 5EKOA 3TWJA 2G01A 3ZLWA 4IXPA 4RJ8A 2CLXA 4A06A 3MSSA 4EOMA 1PXIA 4ORKA 2DWBA 3VULA 2O2UA 4BIBA 2IW8A 3FLYA 4NW5A 3CGFA 4BZOA 2XIKA 3R0TA 2H96A 3R63A 4WNMA 4QRCA 3UJGA 2VTAA 2B9IA 3KREA 3PDTA 3DBFA 4PPCA 5IQEA 3UZTA 3RPRA 4MXAA 2GFSA 4C34A 5FEQA 2CMWA 2CCIA 3OXZA 4XS2A 5CU2A 5IUHA 4IM3A 4DGNA 1H1SA 3IPHA 2WMSA 2VV9A 3EFWA 3DV3A 3DBCA 1PJKA 1ZZLA 4TNDA 4E3CA 3CY3A 5FG8A 5AP7A 4G3DA 2WIHA 4EH6A 2R7BA 4NKSA 4ALVA 4GS6A 5CYIA 4ZXTA 2F7XE 3FYKX 4JVGA 4A9UA 4AZFA 5CSHA 4C2VA 3RM6A 2PZ5A 2X6EA 1Y8YA 5HIBA 2BZJA 3R7IA 4GJ3A 4L42A 4EHEA 2C5VA 3ZXZA 2REIA 4FSQA 4IM2A 3BEAA 4E4MA 3CKWA 4I1ZA 4EZ3A 4WNKA 3ZEWA 4HCUA 3NYNA 2XEYA 4CNHA 4QD6A 3C0IA 4I3ZA 4NEUA 2ZDTA 3H0YA 2QG7A 4IVBA 3JR1A 5HX8A 3F3VA 4FTCA 3D14A 4QMMA 2VRXA 2UW3A 3O8PA 1LEZA 3PG3A 5B0XA 3OTVA 5JFSA 2R5TA 3MV5A 4BCNA 3KEXA 4UY9A 4DFZE 2OZAA 3FJQE 2FGIA 4I22A 3EQBA 4EK6A 3LXPA 4M69B 4F0GA 3VBQA 1JWHA 3KCFA 5HZNA 2C3IB 3FMKA 4IVDA 4KIOA 5IF1A 3QCSA 4P4CA 2XEZA 1Q3WA 3F6XA 1AQ1A 2VTTA 3FQHA 4XG3A 5EQEA 3GCVA 4I0TA 4ALWA 3K3IA 3QTUA 3A8XA 5DRBA 2OICA 2VWZA 4FZ7A 1ZRZA 1OM1A 2IVVA 3MA6A 4FV9A 3TT0A 2EB3A 2C47A 2I1MA 3LQ5A 5FP6A 1NT2A 3CD3A 3OHTA 2G15A 4FTNA 4HNFA 3LCDA 5AX9A 4GFMA 4FL1A 2R3OA 1PXMA 3QCXA 2CKQA 3OEFX 3SG9A 5JRQA 4KS8A 2CLQA 4AT4A 4P2KA 2UZTA 3ZEPA 4F9YA 1ZWSA 3EZRA 3R8ZA 4CZTA 4ENXA 2YDIA 3U51A 3QCYA 4C62A 5BYYA 3I7CA 5CEIA 5IH5A 4FKSA 2RFNA 2B1PA 2R3PA 4JXFA 5FWKK 1NVQA 3GC0A 4DTKA 4BN1A 3VJNA 4H3QA 4BCOA 4S32A 2PVFA 3T9IA 3QZGA 3WE4A 2O63A 3FXWA 4UZDA 3R1YA 2GCDA 3NS9A 4EUTA 1X8BA 4OBQA 3SG8A 2W1FA 4N57A 1Q8TA 3PSDA 3UE4A 3CJGA 4H1JA 4IC7A 2W99B 4I24A 4J99A 3DKOA 1P4FA 5B2MA 5HQ0A 2QQ7A 4A7CA 4RC2A 3OUNB 2FO0A 4IBMA 4O1OA 3UVRA 4I5MA 4D9TA 3OC1A 1TVOA 3MVJA 3G9LX 2V22A 4I0RA 3D15A 3LM0A 4BCHA 5K0XA 4FTJA 2YM5A 5J5SA 2QURA 3BU3A 5TE0A 1Z5MA 5AP1A 4EQMA 3MH1A 3DK3A 5FXRA 3NUSA 3P9JA 4O7WA 1YOLA 5A4CA 4DH7A 2XNPA 5KHWA 3Q6WA 2XM9A 2OH4A 3AC4A 5CTPA 4FV4A 5G1XA 3TNWA 3UNJA 4AQCA 3VBTA 4O7TA 4FTRA 3SX9A 2UZDA 5CEMA 4LI5A 4FBXA 3R9DA 4NCTC 1PMVA 3D2IA 5CU4A 1REJA 2O64A 2WTCA 3JY0A 3L9LA 4MF0A 4NM7A 2XM8A 1WBTA 4QMZA 1T45A 1JNKA 5EQYA 1PMNA 3CEKA 3D5WA 3QZFA 5LCKA 4AG8A 4P5QA 1A06A 4WD5A 2F9GA 3BBWA 5HESA 4P5ZA 3UC4A 4DGLC 2YFXA 2ETMA 4Z55A 3CTHA 3Q4TA 4CMUA 3W8QA 5EG3A 4EH7A 5L4QA 3OZ6A 4TKSA 2WQOA 3MPAA 2V7AA 4GG5A 4WO5A 4ACMA 2ZDUA 3O51A 4GH2A 3WZKA 4KKEA 3QTXA 1XH6A 4U43A 4L67A 5FBOA 2KULA 2PE2A 3FPMA 4LFIA 3SHEA 2OZAB 4EC9A 1FBNA 2X2MA 3HA8A 1FPUA 2JITA 5EHYA 3QHWA 2PULA 3WF6A 4RSSA 3PVUA 2XZSA 2ESMA 2XS0A 2XNNA 1ZY4A 3NUPA 2J7TA 4I92A 5E91A 4ZTRA 5AAEA 4PQNA 3UOHA 4YTFA 2GHGA 3I79A 1HCLA 5EYMA 5I9UA 3BV3A 4RJ5A 1KSWA 4BDEA 3M2WA 3VWAA 4U3YA 4FUYA 4X21A 3VBWA 1Q99A 4EOIA 4F6UA 3DGKA 4IAAA 4GV1A 3QA8A 3R8PA 1YOMA 4D4RA 2R3LA 3V5JA 5CEPA 4FV5A 4WG3A 4DITA 1XH9A 3AT4A 3AMBA 3U8WA 3DQWA 3QTQA 4FNXA 5BX0A 1IR3A 1A48A 4U9AA 3UG1A 3KXGA 4YC6A 4EJ7A 2ITQA 3VS0A 5J7BA 2WTJA 2WNTA 4JDHA 1VEBA 3QKMA 3CY2A 2R3RA 3FZTA 4M68A 1K3AA 2IVTA 2IO6A 2ETRA 2UW7A 1WBOA 5HE0A 4EONA 5IQBA 4DEDA 4G3EA 1O6YA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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