2R0UA

Crystal structure of chek1 in complex with inhibitor 54
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
279
structure length
269
Chain Sequence
AVPFVEDWDLVQTLGEGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMKNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAKRPRVTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Synthesis and evaluation of substituted benzoisoquinolinones as potent inhibitors of Chk1 kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
total genus 79
structure length 269
sequence length 279
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2007-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2r0uA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2r0uA01
3IGOA 5AAGA 2QD9A 1TQMA 3RWQA 1OZ1A 5K4IA 3E93A 4ZLYA 4X2GA 4JT3A 3WIGA 3H3CA 3QUEA 4DGMA 4E7WA 1PYEA 4DBNA 1Z57A 3K54A 4C57A 5CALA 3V5QA 2HW7A 2GPHA 4C4EA 5JZNA 3TWJA 3QQJA 3ULZA 4AUAA 4QMWA 3DS6A 4IB1A 5BUJA 4C37A 1SMHA 5JEBA 1WVWA 3HP2A 3QHRA 3K3IA 1W8CA 4FKOA 4GU9A 4O96A 4WA9A 3W55A 3VS5A 3P5KA 4BCFA 4YTCA 4X3FC 3UMXA 1KE5A 4A9RA 4F9YA 3ALNA 3MY1A 1JNKA 2QOIA 4YHJA 5L6WL 4IVDA 3F69A 1BLXA 4ZXTA 2IJMA 1MQBA 4TWNA 1SVHA 2I0VA 1LPUA 2YFXA 4M84A 4ACMA 4ANBA 1FMKA 2WTVA 3EYGA 3A61A 5DH3A 3R8PA 4I24A 3CP9A 2BKKA 4JOAA 3U54A 3VVHA 4D5KA 1O6LA 1J1CA 4DEHA 4FT0A 1KV2A 4J95A 3U87A 4KKEA 3V5JA 4M69B 5L6PA 3PWYA 4RX8A 4WD5A 5EG3A 2PMOX 3TI1A 1WBNA 4YP8A 3TV6A 4BDBA 1TKIA 1QMZA 1RW8A 4IVCA 4RJ7A 4AA5A 3PRIA 3S2PA 2QOHA 1JSUA 3QWKA 2W9FB 2XZSA 2X8IA 4RLKA 1HCKA 1OUYA 3GT8A 4X0MA 5AUZA 2WTDA 4OT6A 4MTAA 4WT6A 4PNKA 2UZEA 1QPCA 4I6QA 4L52A 3QZHA 3VNTA 3U9CA 3F61A 5CANA 2CGUA 3FKNA 3CPCA 2J0JA 3CQEA 2BDWA 3VBTA 1TQPA 4P4CA 3ATSA 2QO9A 2J5FA 2V22A 4M0ZA 3SA0A 4TNBA 3COHA 2Z2WA 3HAMA 5T3QA 3D7TB 3ZDUA 5AP2A 3LHJA 2GFCA 2J9MA 4ACHA 4EOMA 3H9OA 3EFJA 3PPJA 3SW4A 2B55A 2XK9A 5L3AA 2OFVA 4FT9A 4NT4A 5FGKA 2BHHA 4EYMA 5IH4A 2VWVA 4X2JA 4FV7A 5HO7A 5HZNA 4DH1A 5KHXA 4IC7A 4DFNA 2VD5A 4PPBA 4BDFA 4NW5A 4QMSA 2ITZA 3C4EA 2G15A 2W1HA 4BWXA 4EHEA 5KHWA 2BDJA 2I6LA 4IDVA 4O91A 3AD5A 4F09A 3QUPA 3ZLSA 2V7AA 1ZY4A 5DGZA 4DE4A 4L46A 2X6DA 4ZOGA 4V04A 4L53A 3UOHA 5IF1A 3HP5A 4MH7A 5CTPA 3R73A 4USDA 2PVLA 3SAYA 4ZS4A 3GCQA 4DG2E 4BTKA 3BYOA 3CTHA 4UN0C 5G6VA 3QTZA 4BICA 4X7QA 1XBBA 2X4FA 2R3QA 2VZ6A 4DEEA 2JDSA 2ITXA 4EOPA 2WQNA 4WIHA 2WOTA 3KCFA 3KMUA 5DVRA 3LZBA 4G5JA 4ZTHA 2WPAA 4GUEA 3RVGA 3FPQA 4FGBA 4RIXB 4CT1A 4QP4A 3KXMA 5C03A 1YI4A 3RPRA 2ERZE 4NU1A 3FKOA 4G34A 1F5QA 4BKJA 3VUDA 5BX0A 1OM1A 3SQQA 2VO6A 2P3GX 3VS7A 3UQFA 2O64A 4G5PA 3B2WA 5HBEA 3P78A 5EKOA 5HQ0A 3DXQA 5GIOE 5JT2A 4NH1A 5IKWA 3HMMA 2BRBA 4K18A 2VTIA 3LXKA 4C8BA 3QGYA 3DKCA 4E3CA 2A27A 4PDSA 2HY81 4RJ4A 4FSWA 2R3NA 3QD2B 4L01A 3OG7A 1PXNA 3UO4A 3ZSGA 2IPXA 4RFYA 3ZO2A 1BI8A 3NUUA 3V6RA 4FT5A 5FBNC 3L8XA 1PRYA 3JY9A 4Z9LA 5GNKA 1T45A 2QR7A 4JNWA 3QQLA 4O0YA 3DDPA 1PXMA 2CJMA 3KEXA 3Q4CA 3AT4A 5HX6A 1ZOHA 3KU2A 4QNYA 3G9NA 4I41A 2P55A 2ZM4A 5HD7A 3VS2A 4WUAA 4ZJVA 4A4LA 4F7SA 2PUUA 3EN5A 3G0FA 4W4XA 4EZ5A 4Z7HA 5GZAA 5B0XA 3Q4TA 4E20A 4AG8A 2UZWE 3KGAA 4JBVA 3T9IA 3VO3A 3FLYA 2VTJA 4YO4A 4FICA 1BYGA 1T46A 4OBPA 4G3GA 2UW7A 3O7LB 4GEOA 2G2IA 4EOLA 4E8AA 3DV3A 4O82A 4I6HA 4LRMA 3SRVA 3RNIA 1GZOA 2GMXA 2R4BA 1OKWA 2VRXA 3COKA 3KF4A 3Q9YA 3QC9A 4IE9A 5HE1A 3THBA 4AZSA 4PDYA 4AW0A 4HCUA 4NM3A 5CWZA 2ITWA 2C1BA 1KE9A 3R1QA 4V01A 4JDKA 3H9RA 4MXYA 4RWJA 5BVWA 1U54A 1WBPA 4I4FA 2ITTA 5AUVA 5BYZA 4PY1A 5EDQA 3OD6X 2WHBA 1PKGA 4J1RA 2XNBA 4I93A 3IW8A 4EH6A 3Q52A 3FI4A 5LARA 4UMRA 2FYSA 2PZPA 1ERKA 3FYKX 2B54A 2B53A 3R7VA 4DC2A 5F95A 4DGLC 5LMBA 1WAKA 3NNXA 4U41A 2Y4PA 4Y73A 4FTUA 2BRMA 4EUUA 4EK6A 5IMXA 3LMHA 1S9JA 4U6RA 4AGWA 5D12A 1UA2A 3GVUA 4ZK5A 4EWQA 4F64A 5AFVA 4OW8A 1J7LA 5IH5A 5DR2A 2Q83A 3FSFA 3WIKA 4C3PA 3F3WA 4UV0A 3KULA 4C33A 4NJDA 4XBRA 5FXRA 2YA9A 4TXCA 4RT7A 3A8WA 1KV1A 2IW9A 5B7VA 5E8ZA 3TTJA 5JMSA 4KKHA 2PUPA 2X9EA 4DTKA 3Q5ZA 3WF8A 2OK1A 4EK5A 4C36A 5K9IA 4GVJA 4K1BA 4BF2A 2O65A 3MFSA 4AOTA 1QPDA 4M69A 4EKLA 5GJGA 4CFNA 2XEZA 1BX6A 4OR5A 1UVRA 3DOGA 1G8SA 5M4CA 3M2WA 4EH8A 3TT0A 3U8WA 4BWPA 4C35A 4U79A 3LCOA 4R1VA 3LW0A 3PA5A 4LUDA 4O7NA 4RQVA 2BIKB 3L9LA 4F7NA 3NW7A 3ZRLA 3A4PA 1G3NA 3W2SA 1A9UA 3II5A 1Q61A 5FUTA 4IWOA 2ZV8A 4R6VA 4MKCA 2O2UA 2YWPA 2Z8CA 3KRRA 1OECA 2HWPA 3MGYA 2VTAA 3NUNA 3V8SA 3OEZA 4FF8A 3KRLA 3QAME 4FNYA 4XEYA 2X2LA 3UOJA 3V51A 2UUEA 2WTKB 4PL5A 3V3VA 4BCHA 2DS1A 3KRJA 4D9TA 5J1WA 4WOVA 5FEEA 4FKRA 2ZV2A 4GKHA 3WARA 5F20A 4EK3A 3IOKA 5E1EA 4WNOA 2C6EA 3NYOA 4IWQA 2ZB1A 2IG7A 1ND4A 3DKFA 4MNEB 4KIPA 3JVSA 4QP1A 4XHKB 1FBNA 4FV8A 5FRIA 4F0IA 5EOLA 4ASEA 4D1XA 2ITOA 1UNHA 3EMGA 3ORKA 5H8GA 2OG8A 3RWPA 3TJCA 5IQEA 4WG4A 3ZEPA 3ATTA 1XH8A 5D7VA 1OIQA 3I1AA 5FP6A 5IQCA 2NRUA 2E9UA 2W1ZA 1NXKA 1XKKA 3Q3BA 4ZZMA 3UPXA 3D2IA 3FLWA 4BCQA 2XBAA 4LGDA 4HVDA 4V05A 4X3FB 3O0GA 5KMMA 3FYJX 5K5XA 5ANDA 1H1WA 4IDTA 3E62A 5LVOA 1IA8A 2B1PA 3DKOA 4FTNA 2C1AA 2PMNX 3R8VA 3PLAE 4UZDA 1FQ1B 1FPUA 4IC8A 5E8XA 5A9UA 4BY9E 2R3RA 5E8VA 5LMAA 3D5XA 3OWKA 2FA2A 3R00A 4RVKA 4O84A 4PRJA 3KB7A 4F9AA 4PMMA 3MIYA 3BE2A 1PXJA 5LWNA 2HCKA 3PIYA 5H8EA 2Y9QA 3HGKA 4L67A 3M42A 4RWKA 1V0PA 2FGIA 2XB7A 3E8DA 2CGXA 3FMNA 3SXFA 1P2AA 4LOPA 3TCPA 3MI9A 2C0IA 2BZJA 4K2RA 3GI3A 5DHJA 3Q04A 2V62A 2WFYA 1AGWA 4JAIA 3VN9A 3FZOA 3O96A 4GYIA 3RP9A 5LVPA 3FI8A 2JKKA 3PP1A 4H05A 5BQ0A 3MFRA 1Q8YA 4U44A 1TQIA 5HESA 3WF5A 3ZOSA 2YM3A 3HA8A 3Q96A 4FKJA 4C58A 4O1PA 2VX3A 1MRVA 3WYYA 4G31A 5A14A 3ZC6A 4AZEA 3LFSA 1XWSA 3VHKA 3JUHA 4KSPA 3HLLA 4YJUA 4BGHA 5BVNA 5HBJA 3R9DA 5AIRA 3SOAA 4FSMA 5CF6A 4WBOA 2VGOA 1YWRA 5FDPA 4I5MA 1UWJA 3ZFXA 5DLSA 4E73A 4E4MA 2XKFA 4Q2AA 4QTBA 2XKDA 3NUYA 4PQNA 4BTFA 5I3RA 3FY0A 3FL4A 2JFMA 3E5AA 5HG5A 4W8EA 4D4YA 4EORA 5CSXA 4R3CA 3H9FA 2DYLA 4CLJA 1UU3A 2XJ1A 5IU2A 4LFIA 5AR5A 3MFUA 3I79A 2WMUA 1JWHA 2PZYA 3EFLA 4O0XA 5CU3A 2WMAA 4YZDA 5EYDA 5C4KA 2W1IA 5HTCA 3QRUA 4ZSLA 5HCYA 4P5ZA 2GHLA 3H30A 4J52A 2XIYA 3CR0A 3RPYA 3OY3A 4AX8A 3R2BA 1REKA 4PP7A 2RFDA 4IBMA 4D0XA 4QYYA 1J1BA 2OKRA 4LRJA 3ZTXA 4NEUA 4C7TA 3IS5A 4EOIA 3H4JA 1H4LA 4HYSA 1H26A 3PRFA 2BRNA 2XK3A 4FZFB 5IISA 3VF9A 3ORLA 4NZWB 4USFA 2IZRA 4CQGA 4TT7A 3PPKA 4U80A 2Q0NA 2W4OA 5AUYA 2H9VA 1P14A 2J50A 5KZIA 3U4WA 4BHZA 4DAWA 3F9NA 4KAOA 5JKGA 5M4IA 1UU7A 2OIBA 3IOPA 2R3LA 4BC6A 2OSCA 5B2KA 2HW6A 3MW1A 3MJ2A 3PXZA 4KB8A 4ALWA 4BYJA 4K11A 4QP7A 2GNIA 3BV3A 4LOOA 4CZTA 4AGCA 3R7OA 4JDJA 3HYHA 2W5BA 4FZAB 2I0YA 4HGTA 5I9XA 3LJ2A 3GEQA 4XOZA 4ZTSA 2BRHA 3O7LD 1XH4A 5E8SA 3BEAA 4Z7GA 4DGOA 5A4QA 4O0TA 4EH3A 3ORNA 5HHWA 3UOKA 5JQ5A 3LKMA 3ALOA 1V0OA 5IA2A 5CENA 4PL4A 3TV7A 3UTOA 2XVDA 2FVDA 1WMKA 2ZVAA 3FDNA 3MH0A 4ORKA 2YCRA 3QU0A 3SD0A 3HRFA 4MK0A 2FSOX 3UNZA 3AXWA 4Y5QA 2XK4A 4EBVA 3WE8A 3WZKA 4QMTA 4ERKA 4FYNA 3TM0A 3TEIA 4ZTMA 5IMEA 4FTTA 5EW3A 5CAVA 3LFCA 1GY3A 3D9VA 2GQRA 4DFBA 4ANSA 3W2RA 2JAMA 4K0YA 2XIZA 3FZPA 3MB7A 5AP5A 4FL2A 2WTJA 3VAPA 4EBWA 5HO8A 4IADA 3REPA 4F7JA 3NAXA 3R7EA 2E2BA 3MVMA 4XG4A 2WMWA 2R3KA 3P23A 4M14A 2W1EA 3ZO3A 1M17A 3MDYA 3F2AA 3RJCA 5M4UA 1K2PA 1FOTA 2XK6A 4NTTA 4RLLA 3AC1A 4F0FA 4OT5A 3AMBA 1IRKA 4MBIA 1FGKA 2YIRA 2V55A 3HECA 4XG6A 5H8BA 1VJYA 3FXWA 5CEOA 2VAGA 3QC4A 1ZOEA 5KMLA 4L6QA 4C4IA 4TW9A 5KZ0A 5CT0A 4EYJA 5HD4A 4FNWA 3ZBXA 2JKQA 2W7XA 3OXTA 4AF3A 2C68A 2RFNA 1H07A 3L8PA 4ACDA 5LOHA 4FKQA 3SOCA 2VWXA 2BAKA 4Q9SA 1XQZA 2VNWA 4PP9A 3L9NA 2CDZA 2QOCA 2ITNA 2QOQA 4NK9A 4OTWA 1Y91A 1H0VA 4PV0A 4UWBA 3LCKA 4CV8A 3EL7A 2QKRA 4BDHA 2ITPA 4ASXA 5CEKA 2P2IA 3IDPA 3LPBA 3NVKI 4G6NA 2QODA 5B2LA 3I6UA 3LVPA 1Q8WA 2H8HA 5GJDA 5HG7A 2QCSA 3JPVA 2OICA 4L3JA 4AFJA 4LGGA 4RZVA 3OT8A 5HIBA 4EI4A 3C4FA 2VWYA 1P4OA 2OH4A 2YLFA 2YIWA 5KX8A 5AP1A 3DFAA 5JRQA 4I20A 2VTNA 2Y7JA 4YLJA 4DFLA 5IA0A 3VW8A 2ERKA 3QQKA 1VEBA 3NUPA 2WMQA 4JRVA 5K0KA 2OFUA 3GC7A 3P08A 3WE4A 5M09A 2F57A 3DK6A 5EM5A 4GU6A 2ITVA 4QPMA 1RDQE 2UW3A 4C4FA 1OL5A 4C4HA 3OZ6A 4CFFA 3QQHA 3E3BX 5HNBA 1VR2A 4H1JA 5HTBA 4IZAA 3PXKA 4ZAUA 3HMOA 5AWMA 4FTOA 4BZNA 4H3PA 3C0IA 3ZO4A 1ZARA 3ZLYA 4W4YA 2XRUA 1G8AA 4EEVA 4K9YA 4CNHA 4DG0E 4F1TA 4TYHA 4DEIA 5L8KA 4FI1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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