2R2PA

Kinase domain of human ephrin type-a receptor 5 (epha5)
Total Genus 84

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
285
structure length
283
Chain Sequence
AVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPAAYTTRGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPAHHHHHH

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Kinase Domain of Human Ephrin Type-A Receptor 5 (EphA5).
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Ephrin type-A receptor 5
total genus 84
structure length 283
sequence length 285
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2007-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2r2pA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2r2pA01
3KXHA 4CMOA 3D4QA 3HMPA 3CD8A 3O96A 4RG0A 1ND4A 2DS1A 4QTAA 4ITHA 3ZZEA 4FEVA 5BUIA 4DTAA 3CLYA 3VBXA 1V0BA 2O3PA 4U7ZA 5E8YA 1E1VA 1UU3A 4NKAA 4CNHA 2BRNA 3E7OA 3F5PA 5A54A 3MPAA 2QVSE 2DYLA 4MCVA 1BI8A 3VS6A 4NYEA 3M2WA 3PA4A 1SYKA 3V5LA 4O96A 1XHAA 2C5XA 2XZSA 3MVJA 5CU0A 5EQPA 4CV9A 2XMYA 4AA4A 3TNWA 2X8DA 2YLEA 3L8SA 2ZV9A 3MFRA 2VTLA 3ALOA 5BVFA 4FYOA 4FVPA 4G9CA 4GVAA 1REJA 4I1ZA 4MD9E 3VNTA 5AUZA 2RIOA 4ZK5A 3LFSA 2W9FB 4RA5A 2GQSA 2R3FA 4E3CA 3ZCLA 4GG7A 4IAIA 3P7BA 4IAAA 3PE2A 2XNGA 4XMOA 3SRVB 2C3KA 5E90A 2R3HA 4FUYA 5DRDA 4RC3A 5GIPE 1UWHA 5M55A 2I40A 1Z9XA 2CN5A 2C1BA 2V0DA 3BGPA 5TO8A 4MWIA 5LQFA 5FG8A 1PMNA 5IH4A 2HZ0A 2QHNA 5FD2A 3RNYA 5E1EA 2WMQA 3W8LA 3ZLWA 4G3GA 3NLBA 4FX3A 3AT4A 2VWZA 4WRGA 4BTFA 3GB2A 2GFCA 3AC8A 4JOAA 3KC3A 3UNJA 4QNAA 3CQUA 3UDBA 4DGLC 4KINA 4RRVA 3Q4UA 3BGQA 4LMNA 2XEYA 3U87A 4B4LA 3O7LD 3PIXA 3TKIA 3ORXA 3OWPA 3TCPA 3NYVA 2CKPA 2O0UA 3D5WA 1RDQE 1OIUA 3IGGA 3F5GA 3NYNA 4HGEA 2XYNA 3ZDIA 2ITOA 2Y4IC 3IW6A 3ROCA 1XBAA 4TL0A 3MS9A 3OY3A 1FINA 3ORZA 3TNQB 3OD6X 1OMWA 3CD3A 2WTIA 4YGAA 1OL2A 4PQNA 3W55A 4M66A 5A14A 2XH5A 4N70A 3L1SA 4OTRA 3SHEA 5H9BA 3FQSA 4BY9E 4DFYA 3EB0A 4YTFA 3R7UA 3GCSA 3QTWA 3MFSA 4HVIA 1WZYA 4W4VA 3MVLA 5HI2A 5CS6A 3GC0A 4X3FC 3WYYA 5FBOA 1O9UA 3LCDA 3PFQA 3BELA 3FUPA 1Q97A 4BDDA 3VO3A 3ODZX 4UV0A 4EKLA 2J0IA 1FMOE 3UNKA 3G9LX 1YOJA 3ZONA 4NFMA 2YCFA 4LV5A 4FL3A 1MQ4A 2OIDA 4FIEA 4BHZA 3PJ3A 3QX2A 5CT7A 2HY81 4JAIA 4D2VA 2NNWB 3LQ8A 3JVRA 4XRLA 4M67A 2G2FA 4F6WA 3LCOA 3MY5A 3QU0A 5TT7A 3W18A 2V62A 5JK3A 3MGYA 3RMFA 2Y9QA 3SXFA 4RMZA 2PUUA 3BYSA 4ZSLA 3NIEA 2HY0A 5IQFA 2R0IA 3DNEA 4FKOA 1ZLTA 2VTRA 3LFAA 3ZU7A 1NVSA 3OZ6A 4RJ6A 3OP5A 4U0IA 1JSVA 3ZRKA 2UZBA 4CKIA 4YPDA 5TR6A 4AZTA 4CQGA 2E9UA 3F3TA 5I0BA 2XJ2A 1KOBA 4FICA 3PA5A 3SOAA 4O7WA 2WU6A 4O7YA 4MK0A 3QTIA 2YWVA 3ZUTA 2PUPA 4OR5A 3ELJA 4ZXTA 3VS3A 1I44A 4JDKA 2QR7A 3IQ7A 4UB7A 4XNEA 1A9UA 4BDEA 3ORIA 4PPCA 5HBEA 2WTCA 4AZFA 4C58A 2UW9A 2VGOA 4NTTA 3AC5A 4GK2A 3ETAA 4CRLA 5IF1A 2QOFA 2BFXA 3CP9A 4TKSA 3UMWA 3WIGA 3OUKA 4CZTA 4JX7A 4L01A 3V51A 1IG1A 4C4EA 3NYXA 4L53A 1Y6BA 1UKIA 3HDMA 4O0SA 5L8JA 5BNJA 3QD4A 3TNHA 4Z55A 5HESA 5FDXA 3ZFMA 1Q61A 1ZY4A 2BTRA 4U43A 4CCUA 3C4EA 2YLFA 3L9PA 3PPZA 4CMUA 5AFVA 4FODA 4C37A 3SG9A 5JGDA 1SM2A 2OICA 4BZDA 2PE2A 3QCYA 2W9ZB 3MIAA 4KAOA 4K0YA 4GFOA 5FDPA 4G16A 1PMEA 2P4IA 1VR2A 4C02A 2W4KA 3OROA 3W16A 2FA2A 2VN9A 3C4FA 2RFNA 3UE4A 2C4GA 5CEIA 2FUMA 2JBPA 4CQEA 3LAUA 2WEVA 1QPEA 4JRNA 4EHGA 3MJ2A 4NU1A 4TWPA 3W2CA 5ITAA 2KULA 3PY3A 4QOXA 2IW8A 4DT9A 3GFWA 5EDPA 4NT4A 4O6LA 3GOKA 5HG9A 4IM0A 2UZUE 2WMSA 2PPQA 4C61A 5BVWA 3WIKA 4PV0A 4U81A 4QTEA 2C6OA 4A4LA 4NCTC 4XBUA 5I9UA 4FTJA 3QYZA 3FC1X 2NRYA 2W1GA 4II5A 2GS6A 4PPAA 3WZKA 2UZTA 4W9WA 3EIDA 1DM2A 4AW0A 1WBPA 3PXYA 2XK6A 4EYJA 5BYYA 2PMLX 5I9WA 4U44A 2YIXA 5IA4A 3R2YA 3KVWA 3R0TA 1SVHA 3COKA 5CU6A 3QWKA 5IZFA 4OW8A 1KE5A 2ZB0A 3EKNA 3TI1A 4FSNA 3UOHA 4E6CA 2I0EA 2VRXA 4FIFA 2RG6A 3GQLA 4GH2A 4XH6A 4OTQA 3VULA 3UVQA 1YRPA 3W10A 4DG3E 4IANA 3DQWA 5HIBA 4Z16A 5HX8A 3Q5ZA 4DT8A 2VWBA 2IN6A 4ZTNA 4EL9A 5J7BA 4B99A 3TACA 4TN6A 1W98A 3RCDA 4D2SA 4I6QA 4EEVA 2F7XE 4IDTA 3WE8A 1GNGA 1PXLA 3ZXZA 4F7JA 2IJMA 5HU3A 4QD6A 4EHVA 4FEUA 3OCGA 4O38A 4OT6A 4Q5EA 4AF3A 4FKJA 1IEPA 4AUAA 4AW5A 5CSXA 2C69A 4R8QA 4BCJA 5LMKC 1PYXA 1U5RA 3GFEA 2WEIA 3LFNA 4QPSA 4XOZA 4O84A 3V5QA 1PMVA 2YITA 4YO4A 4H36A 3B8RA 1LEZA 4Y46A 5KMIA 3OHTA 5BVNA 4KSPA 4IZ7A 2X9EA 3R28A 3R9HA 2QO2A 4EZ3A 3HP5A 4XV3A 3V8SA 5KMMA 2C0TA 2R3RA 3O17A 4MH7A 4ZAUA 2CMWA 3FYKX 4ITIA 4QP7A 2HXQA 4HVHA 1Q8ZA 4FTNA 3FMLA 4FKLA 2DQ7X 1W0XC 4GS6A 4J96A 4K1BA 4F9WA 4RFZA 5CAQA 3RK9A 2PU8A 4C38A 2WQNA 3GU7A 3KXZA 5H8EA 4J97A 1JLUE 5M4UA 4HPUE 3MY1A 3RPYA 3DBDA 4P4CA 5FM3A 4U79A 3IECA 4JDIA 1M7NA 4JG8A 4IX5A 4ALWA 4CT2A 5JT2A 4O7NA 5CX9A 4EK5A 4FNWA 4RVLA 4ZJVA 1R0PA 2PMOX 3CE3A 2FSTX 5JEBA 3DZOA 5BUJA 3SXSA 3U6JA 1OM1A 3MFUA 4QPAA 3EQCA 1U4DA 3RAHA 4X0MA 2WMBA 4BDJA 3COMA 3DFAA 2BZIB 5I9XA 3QYWA 2BVAA 2VTNA 4MBIA 2VX1A 2GSFA 3FQHA 2R2PA 3A7HA 2IZTA 4MQ1A 4U3YA 2C6DA 4YZDA 4M0ZA 1GIIA 4WRSA 4YC3A 4DFXE 3PXRA 3QRJA 4FTTA 2HELA 5DLSA 4ASZA 4R5YA 2JAMA 4EOJA 5HIEA 1PY5A 3D2KA 3P86A 5HOAA 3R21A 3TZMA 4DH8A 5BVOA 4BGGA 3O2MA 3UGCA 2GFSA 4C7TA 3BX5A 3E62A 5A46A 2EXEA 3Q52A 3QTRA 4QP4A 4A7CA 3DFCB 4DBNA 4Y85A 5K0XA 2QLQA 5D9HA 2BPMA 2J9MA 3UOLA 3OMVA 2X8EA 2CHLA 4GJ2A 4RIYB 4FKSA 5ACBC 3I60A 4W4YA 2YCQA 3CJFA 3W32A 1H24A 5EM6A 3ZDUA 1OPKA 2UV2A 4UMRA 4TT7A 2DUVA 5DRBA 5LVPA 1NW1A 3Q6WA 3PIYA 2WTWA 4QMQA 4YMJA 3R04A 5EDRA 1OPLA 4O21A 2UW6A 3I0QA 4OBPA 3BHTA 4GIHA 4O0TA 3NNVA 4YP8A 3RHKA 3U6HA 1YI3A 3AXWA 2Q0BA 4I94A 3AGLA 3PE1A 5FTGA 3EL8A 5CSHA 1OUYA 3QQLA 4XG6A 3UG2A 5EG3A 4DLJA 3UYTA 3UYSA 5CWZA 5IMEA 1B38A 4JDHA 3E7VA 4I4EA 3FI3A 3NEWA 1QPJA 4CZUA 4JS8A 4DN5A 2VNYA 3KU2A 4FIGA 3GU4A 3R7GA 4NEUA 2VWIA 4OTFA 3WF6A 3RM7A 4CFMA 5FTQA 1OBGA 2C6KA 4OTPA 4FT5A 3PG3A 2ITNA 5EI2A 3Q9YA 3EYHA 5AM6A 4QO9A 4WA9A 3KRLA 3FXZA 4ZMFA 2UW3A 4RPVA 4BVUA 4O86A 1YDSE 3JUHA 1AD5A 1YDTE 3A8WA 4G6LA 4EJNA 5CVFA 3EKKA 3I7BA 4K9YA 4L52A 3H9OA 2GNFA 3QTZA 2ITYA 3HV4A 1OKWA 3RK7A 2PE1A 1YXVA 3V8WA 4EH6A 4F1TA 3F2RA 3N4VA 3LFQA 2Z60A 4LMUA 3KF7A 2ETMA 3PP1A 3RPOA 3V8TA 1GZKA 2CJMA 3TV4A 5CI6A 4FT9A 4BGHA 4I4FA 3S2PA 2SRCA 5EK7A 4HZRA 3ZSHA 4JNWA 1A06A 5HG8A 4FGRA 5J5TA 3LM5A 4LM5A 1IRKA 4IAZA 2XKEA 4NTSA 4WG4A 3ROYA 5LVLA 2XKCA 4E8AA 5CEKA 4J8MA 3FHRA 2R64A 4HGLA 3EZRA 3FY2A 4V01A 3R71A 5EW9A 3P5KA 5GZ8A 5M09A 3QRTA 5GHVA 2R3IA 4FTIA 5LVOA 3E8NA 3W8QA 4GFGA 4FV0A 5M08A 4WKQA 4QMNA 3HMMA 4BWKA 1CDKA 4MVFA 3KCKA 5DWRA 4F0FA 3SVVA 4GKIA 4H58A 4FNZA 4DEIA 1BMKA 2WTJA 3CKXA 4JL9A 1GJOA 1YWNA 3PJ1A 3MH3A 3QCQA 1FVTA 2R4BA 2WTKB 4JT3A 2WQMA 3Q9XA 2YJRA 3RTPA 2PVYA 3BQRA 3OFMA 3OOGA 3FHIA 4X2NA 3WARA 2E9OA 2R3PA 5HORA 5E8VA 5HE1A 3LKMA 4BDCA 5JZJA 4TNBA 2OIQA 2P0CA 4YJVA 5FLFA 3NWWA 3DPKA 4WO5A 1MQBA 1W82A 3HV5A 3UVRA 3RWQA 5JFWA 3DAEA 3LFEA 5C8NA 5JFVA 2YN8A 4MQ2A 4I5MA 2P2HA 3TXOA 4ACDA 2W7XA 5EH0A 4BCOA 5CALA 3C9WA 2B4SB 2QURA 4I6FA 3C4ZA 4FZFB 5AADA 4HVGA 4L3JA 2BAKA 5E8SA 1W84A 3HAMA 1O6KA 2ITTA 5JRSA 4CLIA 2WMRA 5JKGA 2W0JA 4EWHA 4FT3A 4RIWB 5AIRA 4L9IA 5K3YA 3A7IA 3CIKA 4B7TA 2B53A 3DLSA 3IDCA 1GZNA 4ANLA 3KMMA 3H9FA 3QGWA 2QOIA 3I7CA 4KS7A 2A19B 4FV2A 3SW4A 4CKJA 2ZDTA 5AR3A 3F6XA 3GOPA 4HYSA 2R3QA 2UZOA 2JDOA 2YACA 1UV5A 3QTSA 3QZHA 5CVGA 4BKZA 4DEEA 3ZC6A 4NM3A 5AV4A 2RFSA 4C36A 4C4JA 3BU5A 3D0EA 2X1NA 2WTKC 3BU3A 4I3ZA 4S2ZA 3T9IA 4BCQA 5CSWA 4AN3A 3OY1A 4ZSAA 2CGWA 4XG7A 3KMWA 3TL8A 4R3PA 2BAJA 2QKWB 2V5QA 3HV6A 4O0VA 4DLIA 4RJ4A 3OXIA 3EN4A 3DDQA 3DOGA 3T3UA 1PXMA 5EI6A 4ZLYA 3C0IA 3GEQA 4YJUA 2ZMCA 5DOSA 5EM5A 3U8WA 1QL6A 4BWXA 2ETKA 1AQ1A 2RFDA 4DGOA 3PSCA 4DEHA 3A61A 2QOCA 5L2QA 4DEDA 3IK3A 5L6OA 4FV4A 3NMUF 4C4GA 3G9NA 1H28A 1MRYA 3VBQA 3VAPA 2PMNX 4OLIA 5GIOE 2B0QA 3QZIA 4NWMA 4CTBA 4YBKA 3HMIA 2PYWA 4E6QA 4LOPA 5BVEA 2HZ4A 2A1AB 5ANGA 4EONA 5KZ0A 4O7TA 3MTLA 2W1ZA 2YWPA 3Q4ZA 4ERWA 3GBZA 5DVRA 2WMTA 2XIZA 1BKXA 3R8ZA 3LFCA 4F65A 5HE2A 4APCA 2NO3A 2XYUA 3OEFX 3JXWA 3QD2B 2F7EE 4A06A 2JLDA 1VJYA 1PXOA 4MXXA 3SOCA 3DKFA 4JQ7A 3I5ZA 3HNGA 5CQWA 3KULA 4DEBA 1TQIA 3ANQA 4FOBA 1U5QA 2G15A 3ZMMA 4FMQA 4BZOA 2X39A 4ZS0A 3W2OA 2ITXA 3FC2A 3R01A 4HNIA 5FEDA 4USDA 1L8TA 1JNKA 4IM3A 4S31A 4YJNA 4Z7HA 2LGCA 4FSWA 2IZUA 2YDIA 3RINA 4HVSA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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