2R3KA

Crystal structure of cyclin-dependent kinase 2 with inhibitor
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
298
structure length
277
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARVVTLWYRAPEILLGKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-guided discovery of cyclin-dependent kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Cell division protein kinase 2
total genus 79
structure length 277
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2007-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2r3kA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2r3kA01
2NRUA 3JR1A 4X3FB 2J51A 2RFDA 3W16A 3TZ8A 3NUSA 3QX4A 3GP0A 3G33A 4FG7A 1P14A 1AGWA 3UNZA 2JEDA 4HW7A 5IUIA 2EUFB 3LJ2A 2HY81 4V01A 1H8FA 3F3TA 4IWDA 5KMNA 3QQFA 3EQPA 2E9UA 2QI8A 2WMXA 4ANQA 1W8CA 1PRYA 3TUCA 3W32A 3MW1A 3UO5A 4AUAA 3C7QA 2V62A 3DAEA 1IEPA 2IVVA 1A9UA 5AX3A 5LXMA 2PVYA 3I79A 4LL5A 4OLIA 2F7EE 2XNGA 3MDYA 1SZMA 3ZH8A 2B4SB 5I9ZA 3DBCA 2R7BA 3IO7A 2YLFA 1FVRA 3SOCA 4CRSA 5I3RA 3POOA 4M67A 5IF1A 3MVMA 4YJOA 5BQ0A 3ZC5A 4OBQA 3R7YA 4U42A 4USDA 4R3PA 4C2WA 4DH5A 3KC3A 3HKOA 3UYSA 4FMQA 4KIOA 4FNXA 2OKRA 5IQIA 3FC2A 4U45A 4XG8A 4AWIA 1UNHA 5K9IA 2CNVA 4IWPA 3CLYA 4WUAA 4X21A 1OIRA 4QP3A 2IWIA 3UDBA 3NYXA 5HIBA 4OGRA 4FIEA 4HYSA 2DWBA 4MF1A 4R1VA 4UMQA 1Q3DA 2KULA 2UVYA 3SRVB 3FBVA 3ENMA 4MHAA 4F6SA 4IAFA 3PRIA 3ZLXA 2YWPA 5AV1A 1YXUA 3BGQA 4DFLA 4UEUA 4PMPA 4ZY4A 4E8AA 1JNKA 2YHVA 1H00A 4PUZA 4F9WA 5KMLA 3H10A 2WZJA 3DCVA 4RC3A 4ZK5A 3LIJA 2OXDA 3OY1A 2PUIA 1ZZLA 3VBVA 3KA0A 4N6ZA 5HU3A 4D9TA 4TKSA 3QWKA 4QPSA 1KE9A 3LW0A 1P4OA 3RJCA 3JS2A 3RZBA 4G5PA 1YQJA 3GGFA 3U9CA 5E92A 4DFYA 5DMZA 2OH4A 3TI1A 4G6OA 3BE2A 4HGSA 5E4HA 1E1VA 4EC8A 5I9WA 4CRLA 4XRLA 1WBTA 1PXKA 3GB2A 2JD5A 3DOGA 3Q9XA 4RX7A 4YJNA 4FEWA 4I0TA 1YOMA 4AGWA 4EI4A 4QYHA 5HBJA 3MGYA 4MEDA 4IB1A 4TYEA 4RZWA 4L6QA 3QTSA 4D5KA 5J9ZA 1V0BA 3QD4A 2J4ZA 2V5QA 2X6EA 3DGKA 2ITOA 1Q3WA 4FT7A 2YABA 4Z7GA 2XNEA 4NW5A 2V7AA 3Q04A 4A9TA 4E6DA 5HBHA 2C3LA 2UV2A 3QU0A 1FVTA 4GFOA 4YTHA 5B7VA 4NSTA 4UXLA 2BUJA 3FXXA 4HZSA 4RJ4A 5DEWA 4ZIMA 3WZUA 3WF7A 4C3PA 3H9OA 2OJGA 2HYYA 3CTQA 2G9XA 4HZRA 2YM8A 2VTOA 3LCOA 3PWYA 1IAJA 2JAMA 3WBLA 2OF2A 2C6KA 1SVGA 2BCJA 4FOBA 5EM7A 5BUIA 5KMOA 5FTGA 5CU3A 5ANOA 4LRJA 5C01A 1U59A 5BVKA 3ZLYA 1OBGA 1REKA 3AC3A 4MBIA 3I7BA 2NP8A 5KO1A 5HBEA 2ITUA 3OW4A 4IAIA 4I41A 4J52A 4YBKA 2ITXA 4YZMA 3LLAA 3WZKA 4BCPA 4BDJA 4WRSA 4O6LA 1VZOA 5L2WA 1P5EA 4IM0A 5BVNA 2Z7RA 2IZTA 1H1RA 2WTIA 4JG8A 3FSKA 4IX3A 5JFXA 4RVLA 3CS9A 1CM8A 4BVUA 3BKBA 4GYGA 4LMUA 5TF9A 3IQ7A 2IO6A 2OXXA 2R3RA 5L6OA 4I4EA 2QOFA 2R3HA 3K5VA 3WOWA 5K0XA 1F3MC 1Q8WA 5AUXA 2R3IA 3F2NA 3OXIA 4KD1A 4MYGA 3VRZA 1ZYLA 4FKJA 3UNJA 4O7SA 3IKAA 2P2IA 4FNWA 4D4YA 2VWUA 3BCEA 4JIKA 3HAMA 4BCOA 5HTCA 5BVWA 3V8TA 2BDWA 1JKTA 3MH3A 3T9TA 5IA4A 3ZEPA 1WVWA 1PYEA 2BAJA 3P5KA 4HYUA 3BYUA 1OPLA 5H2UA 4E7WA 3C51A 1QCFA 4DEGA 2B52A 3NNUA 4NTTA 4BZNA 4ZJVA 1SNXA 4XRJA 4MXAA 3FLWA 1OGUA 4JNWA 5AV2A 1MQBA 5HO6A 3ZRLA 4BKZA 4G1WA 1JSTA 3AD4A 1YHSA 3BYMA 2ZM1A 3EQGA 3ULIA 5JKGA 4CZUA 3FMJA 5FUTA 4CFFA 4X3FA 3FKOA 5HLPA 2Z7QA 3PVGA 5EYKA 4EK8A 1SVEA 2ETKA 2I40A 4WKQA 5CU2A 3UQFA 4IW0A 3FPMA 1XWSA 2OZOA 3VJNA 4PV0A 3BHVA 4MXOA 3NYNA 1OPKA 2YIYA 5HIEA 4M0YA 2P4IA 3QUDA 5JGDA 3UC4A 2O5KA 4XNEA 3ZU7A 1QL6A 4BCKA 4JS8A 5FD2A 5LVOA 5HCZA 5I4NA 4DH1A 1OUKA 1M17A 2XCKA 4HVSA 2J0MB 4O1OA 2IZSA 2J0KA 4RIWA 2ETRA 4CFXA 4EBVA 2QR8A 4DEAA 3FLQA 4LOPA 2XBJA 4DFBA 4E26A 5F94A 4GV1A 3KRWA 2WTWA 2BZIB 4DAWA 3Q6WA 3GU4A 1CKPA 5CLPA 3TZ9A 5AR4A 4O2ZA 4EK6A 5ITAA 2J2IB 3R8VA 5CSWA 3W2CA 4F6UA 4YP8A 4MK0A 4K18A 4LFIA 3F3ZA 2WTVA 5AV3A 4ZOGA 4LV8A 3B2TA 4H3PA 4I1ZA 2XZSA 2GNHA 2GSFA 4D0WA 2R3GA 4ARKA 3KU2A 3MH1A 3CY2A 4WUNA 3TL8A 4MXCA 1U54B 3VW6A 3E5AA 1AQ1A 1W84A 4I5PA 4Y46A 3EYGA 1XH8A 2XBAA 3BWJA 5JH6A 5FEDA 4ZSJA 4ZXTA 2UZWE 5CX9A 4O7TA 2XYUA 3QTZA 3RP9A 3ZLWA 5B2MA 4ZZMA 4RLLA 3ZZWA 3V8WA 2QU5A 3EKNA 2UZNA 4O2PA 3DY7A 5HNBA 4FZ7A 1DAWA 3DBQA 4L44A 2YZLA 3SV0A 3M42A 4Q5EA 5AJQA 4UBAA 3UVPA 4AGCA 1Q4LA 5J7HA 1L8TA 1Q8ZA 4NJ3A 5HG8A 3NW5A 4K11A 5BX0A 3VUKA 5CEQA 3NX8A 2B9FA 3CY3A 5C9CA 4FV1A 4M12A 4YJPA 2BILB 1PMUA 3TTIA 4EUUA 4FV0A 5E8TA 3C4EA 5BVDA 2YDKA 5E7RA 4CCUA 4KS8A 3BHUA 5CI7A 3W18A 1J7IA 4BCFA 3NWWA 4EH9A 1SM2A 3FQEA 4TYIA 3FPQA 3ZZEA 5AFVA 1PYXA 3PJ3A 4FA2A 1MUOA 2XRUA 4L67A 4YTIA 2C0OA 4D1XA 1BL6A 2E2BA 5JQ5A 3W2QA 4M0ZA 5DG5A 3JYAA 1HCKA 4L3PA 3OROA 1TVOA 3FLSA 4YJQA 3EH9A 3K2LA 2ITWA 3F61A 4MF0A 4BBEA 3VUMA 3P1AA 3D0EA 2C3KA 3H3CA 4TXCA 2ZM4A 4AZVA 5HLWA 2BDFA 3KFAA 5KNJA 2CGUA 4ORKA 4C36A 2W4OA 3Q4UA 3G9LX 3WYYA 2KTYA 2YITA 2YIWA 2YM3A 4Q2AA 1OL7A 4RVMA 1VYZA 4NL0A 4P5ZA 4CKJA 4E6QA 1UWJA 3HRCA 2RL5A 4BBFA 3DXQA 5J5SA 2HCKA 5ACKA 2C68A 5EK7A 3HMIA 2PVRA 2XNOA 3OD6X 1YXTA 2VO0A 5LWNA 4FE2A 1SVHA 3PJCA 1Z9XA 3L9NA 1IRKA 3E8CA 4FKOA 3H30A 1YRPA 2C3IB 4YJRA 4EH8A 3WE8A 3IW6A 3U87A 3C0GA 3PVWA 4BGHA 3H9FA 3SLSA 3EL8A 1K2PA 4EH5A 5EHOA 5LWMA 1J3HA 3TZMA 3E3PA 5IH4A 2CMWA 3CP9A 3QRTA 5LVMA 2VGPA 2WQBA 4FEVA 4CG8A 4FKLA 2OG8A 4WT6A 3BU3A 4C62A 4YC8A 1YXXA 4H3BA 1H28A 4QP2A 4E20A 1PKGA 3MBLA 2I0VA 4L7FA 1XBBA 2EXMA 2JITA 3CD3A 3EQCA 2R0IA 3MH2A 3PA5A 5CXHA 3N4TA 4QMPA 4OTIA 3SGCA 5KX8A 3N4UA 4CMOA 4PWNA 1Q24A 4M84A 2X8EA 3K3IA 3I5NA 4RIXB 5KKRB 4U44A 4OAVB 4QTEA 3OOMA 3FI8A 3F5UA 4TRLA 4ZSAA 3O23A 2ITNA 1BUHA 2AC5A 2WKMA 3COHA 4ZTNA 4H05A 4I0SA 2JKQA 4X6RA 5CZIA 4A4OA 5TO8A 4AA0A 2OBJA 3TACA 3BV3A 3OWJA 1GY3A 3RGFA 3NMUF 4TWCA 3RNIA 4BDIA 5GZ8A 4FVQA 2ERZE 2J5FA 3FSFA 3QGWA 4UXQA 3FZ1A 1BKXA 1H1PA 3EFKA 3HV7A 1MRYA 3LKMA 4O1PA 4GT5A 4NCTA 3WARA 4BGGA 3AT4A 3E62A 4Z55A 2O0UA 3P4KA 3U54A 3BYVA 3C5UA 4ZY5A 4ALUA 3MIYA 5IMEA 3Q6UA 5GJFA 2UW9A 3BU6A 5BMSA 4ZS4A 5HVJA 4FIJA 2CLXA 2G2IA 5G6VA 3I5ZA 2XIRA 4X7QA 4WRGA 1YOJA 3IONA 4GK2A 2OGVA 4QMXA 4BDEA 2VV9A 3MFSA 3PZHA 4BGQA 3OCBA 4WHZA 3FXZA 2OJIA 1DI8A 4N4SA 5D7VA 3IW8A 4HNIA 5IA3A 5ICPA 2OW3A 2PZ5A 2JLDA 4I4FA 1EH4A 4FNZA 4OTRA 4E5WA 2PZRA 4EBWA 5KBQA 4BY9E 5IEYA 2PMIA 4MVFA 2Q83A 5AAGA 4Y72A 4FTUA 4DCEA 3CC6A 3BQCA 2F7ZE 1U54A 5FTOA 2WMUA 1UA2A 4AGUA 4E4MA 2UW8A 4AG8A 3U6HA 1KV1A 4YO6A 2WXVA 3NNXA 2RFEA 4RJ3A 4KIKB 4HGEA 4PMTA 5FGKA 3PLAE 1JPAA 2GHMA 3TNWA 4HGTA 2YJRA 3A7IA 4QTCA 4A9SA 4EH2A 3R2BA 3D5XA 2CJMA 2YWVA 1W0XC 2X8IA 4FUYA 4KKGA 3I6WA 5EYCA 2LAVA 4UWCA 2PVMA 4G31A 2C3JA 3QC9A 4JDIA 2C5YA 5HNGA 4DFUA 4QMMA 5IZFA 5C4KA 4PMMA 3GEQA 5LOHA 1PMVA 3D7ZA 4TWNA 4X6QC 5GJDA 3UVQA 3H0ZA 4O7VA 1V1KA 4ACMA 4KBCA 2HXQA 3PXQA 4FL2A 5L6WL 5EYDA 5EQEA 2YN8A 3UODA 2QNJA 5HCYA 4DEBA 4MXYA 4EOOA 5A54A 2G15A 2DYLA 2QO2A 2IVUA 3VIDA 4BI2A 4GUEA 4DH7A 4Z9LA 4GL9A 2PZPA 3JY0A 3TG1A 4FSMA 2B9JA 4MX9A 5HG9A 4EKLA 4F9AA 3IK3A 4BWKA 2SRCA 4GMYA 2ERKA 4CLJA 4FTMA 5LQFA 3OEZA 5JZNA 3C4WA 1I09A 1GAGA 5J8IA 4S34A 4EUTA 2YIQA 5IA1A 4ENYA 1R3CA 5GINE 4EOQA 3M1SA 3R21A 5CVFA 2BRGA 3IG7A 2A27A 4CMUA 2EU9A 3D4QA 3A62A 2Z7SA 4CG9A 4IMYA 3O71A 3WIGA 5HU9A 5J9YA 3O8UA 2YDIA 5D1JA 4DN5A 4U3ZA 1OPJA 2HZ4A 3L8PA 4QMNA 3BX5A 4B7TA 4EWHA 3ZBXA 2VAGA 1YDTE 3FMNA 1YWRA 4QQ5A 4IB0A 3FV8A 3R1NA 3R6XA 4FIIA 3C0HA 4O84A 5CSPA 3FQHA 4FV2A 3ZM9A 4FTRA 4RJ5A 5LARA 4DTBA 1APME 1YOLA 2YCQA 1XBCA 3LCSA 4JAIA 3KRXA 3GU8A 3PY1A 3PA3A 5FDPA 4QMLA 4FNYA 4OTFA 4BZDA 4N6YA 5CAOA 2CNQA 2VTAA 5L6PA 2QHMA 1YKRA 2XNBA 3QHRA 4GUBA 4G3FA 2HELA 4MD7E 3KN5A 4BDCA 4E6CA 5ANDA 4D2WA 3L8SA 4I23A 3FZRA 5B0XA 1H0VA 3UPXA 5A6OA 4HPTE 4JR7A 5CWZA 3FZOA 1I44A 5JEBA 3AC1A 2YM6A 3HL7A 3A60A 4TTHB 4BCNA 3NRMA 3UBDA 4FV6A 2OWBA 4G17A 4RIXA 3KF4A 4ZSGA 1Q41A 3PP0A 4DT9A 4C59A 1PXLA 3HMMA 1ZOEA 4IM3A 3MFTA 3ZSIA 4NM3A 4QP9A 3CGFA 3QD2B 3LM0A 3R2YA 4QOXA 1LUFA 2WQNA 2YA9A 4Y5QA 4F64A 2WMVA 1GOLA 2CSNA 2QOKA 3G6HA 2WMAA 4FF8A 4IDTA 5D11A 2ZVAA 3LAUA 1GZKA 3BBWA 5AP3A 4UMPA 3UTOA 4JI9A 4XG3A 3LJ0A 3Q32A 3QCSA 5HO7A 4RJ7A 3PXFA 4FTIA 4V04A 4OTDA 5F20A 4LOQA 4AAAA 5CTPA 3HYHA 3IS5A 4RIYA 4RA5A 3O8TA 3GI3A 5M53A 1OL1A 3G0EA 4QTDA 3SD0A 3LFNA 4XG9A 1XH9A 4I5HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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