2R3RA

Crystal structure of cyclin-dependent kinase 2 with inhibitor
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
298
structure length
290
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure-guided discovery of cyclin-dependent kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cell division protein kinase 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 290
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2007-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2r3rA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2r3rA01
2XJ0A 3NRMA 3EN4A 1OITA 3OWKA 3QYZA 3EFLA 1T46A 1YDRE 2RG6A 1ZYCA 3QAME 2YM5A 3VJNA 3PFQA 4C2WA 3F5GA 3FMHA 3HRFA 3M42A 4U97A 4G5JA 3UQFA 4F1MA 2P3GX 3FDNA 1GOLA 4NKAA 4TWNA 2R3QA 2AC5A 1JSTA 3CQWA 2J0JA 3KEXA 4PDOA 3R9OA 3PJ1A 3KXXA 4W4WA 3LXPA 4F9WA 1XH5A 3PVGA 4E26A 1NA7A 3LCSA 4C2VA 4CRLA 3S0OA 3F5UA 5M57A 3CBLA 3RVGA 3FE3A 5EOLA 3DK7A 3SGCA 1H08A 3REPA 1KUTA 5BVWA 4I4FA 5GJGA 2X8DA 4RFYA 2YIWA 5I9UA 4FSYA 2FO0A 1UU7A 4CLIA 4F65A 2BIYA 3F3ZA 4QTBA 4O0RA 2PZYA 3CQUA 3BV2A 2I0HA 4BIEA 2HZIA 4C35A 3E63A 4EK4A 5B2LA 5IH6A 5KMIA 2X39A 5BVFA 4EH4A 3ZH8A 3OD6X 4FIJA 2PVFA 3P9JA 4FKJA 4NEUA 4EI4A 3KXZA 2JIIA 3H0ZA 4DLIA 1Q8ZA 2WIHA 4QPSA 4I24A 5CVFA 4AGDA 2OBJA 4BRXA 2FYSA 4WRGA 2WMRA 2WU6A 3LCKA 5AM7A 3QX4A 4X2FA 1WVWA 4NL0A 3LMGA 5KMJA 2XIKA 2VWVA 3HECA 2W1FA 3TUCA 4IX5A 4AT4A 3HDMA 3FL5A 4WD5A 3F82A 2VTNA 4TNBA 5HKMA 4NM7A 1UU8A 2XRUA 2QOQA 3FI3A 3NYOA 4OBOA 4NH1A 3TNQB 4DH5A 1LEWA 2JEDA 4FICA 4YJQA 4AOTA 4DFXE 5IA0A 3R7EA 4YBJA 3CCNA 4QP8A 3DBFA 4BGQA 4ZSGA 3P1AA 5FEQA 2BRHA 4PWNA 2GS2A 5EHOA 5CSWA 5HBHA 4FODA 3TL8A 4TWCA 2P33A 3WIKA 4IAIA 5AP3A 3LFEA 4FKTA 3EKNA 3W2OA 3LFDA 4DINA 4G17A 3QKMA 4AT5A 5CF5A 3VC4A 2GPHA 3EL8A 4JOAA 1OECA 2W1ZA 4LM5A 4BVUA 2PMNX 3AD4A 3C4CA 2HXQA 3O0GA 4E5AX 5J5SA 2JIUA 5EQEA 3R9HA 2YA9A 4G6LA 2QCSA 4ORKA 3QF9A 5HNGA 3ATSA 2PVJA 5CT7A 2W99B 3D83A 4IFCA 4BDDA 2PPQA 2WQNA 2W96B 3GU5A 3HYHA 4H1MA 4LYNA 4YZCA 2ERZE 5LQFA 4K8AA 2QG7A 5BYLA 2WPAA 4I92A 4ZJIA 1MQ4A 4W8EA 5EDQA 3B8QA 1PHKA 5L8JA 5CAPA 3G2FA 3QZIA 1FGKA 4MH7A 1Y8GA 3A7GA 3DAKA 2X4FA 5ANDA 4YJSA 3LFNA 4IW0A 2HELA 2QR7A 2J7TA 4JXFA 3TIZA 5HE1A 2GFCA 3ZXTA 3EQIA 3GB2A 3RTPA 2Y4IC 2R3LA 3CPCA 4G3GA 3GXLA 3U87A 3ZOSA 4F7NA 4HVIA 5IQIA 2JKOA 4JDIA 3JY0A 4BGHA 4P5ZA 3BHHA 4QYGA 4FIEA 4ZS4A 2ITTA 5KMKA 2YJRA 3POZA 4PNIA 5J9YA 3I0OA 3P7AA 2HWOA 3BPRA 4M14A 5E8ZA 4DG2E 3R2BA 3ZEWA 4X6QC 5I9WA 4ENYA 3ETAA 3UOJA 1OIRA 2PY3A 5AJQA 4NZWB 4LMNA 4BBMA 4BC6A 5A54A 3NUUA 3GFWA 5H8BA 4S30A 4FV4A 4OTHA 3OEFX 1U5RA 2QI8A 3MFRA 3LZBA 3C9WA 4F1OA 2I1MA 4MKCA 2PVRA 4BTMA 3FL4A 3MS9A 4PY1A 4BYIA 4IWPA 4YHTA 2RFSA 1XBBA 3BBWA 3DAEA 5EH0A 5KMOA 3HRCA 5E8SA 3R9NA 3K5UA 4R7BA 4L3LA 5AR2A 2H9VA 4V01A 5A4CA 3QQUA 3UNZA 1B39A 3E8DA 1J7LA 4NCTA 1Q3DA 4P90A 5AUYA 1WBWA 4IB5A 3CJGA 3FZRA 5IA2A 3D5WA 3OTVA 3AC8A 1LPUA 4KKEA 3DQWA 3D5VA 3F66A 4TRLA 3FC2A 4LRMA 3PVUA 2V0DA 1YDSE 3W16A 2YIXA 4S34A 2G9XA 4DEDA 4NIFB 3VS0A 3HMOA 2QU5A 2XK7A 2B55A 2ZB0A 1XH6A 3R28A 2P4IA 3R0TA 3QX2A 4YJOA 3CQEA 3U54A 2RL5A 1XQZA 2VTHA 2C6OA 4EKLA 4AG8A 5CVHA 4RWIA 2HWPA 4EJ7A 4LUDA 3RCJA 5J87A 2WZJA 2GMXA 4XLVA 4N4SA 2PZRA 3D9VA 4FNXA 4O0YA 3F3TA 2HYYA 2XNGA 5HIEA 3R21A 3ZLYA 3QRKA 1H0WA 5IF1A 3HAMA 1ZWSA 1WBVA 4RIWA 5ITAA 5CENA 3DDPA 3G6GA 4MHAA 3SA0A 1QPDA 5CNNA 3U9NA 3LCTA 3FSFA 3VS7A 4AU8A 4CV9A 2VGPA 4LRKA 3CSVA 4PTGA 3PVBA 5KZIA 3PJ8A 4N57A 2W1IA 4BIDA 4LL5A 5LARA 2VTRA 4EHVA 3BLQA 4JVGA 5KMLA 1OPJA 4H1JA 3O7LB 4G9RA 3IDPA 2X6DA 4XOYA 1TQIA 1I44A 3ZONA 1FBNA 4K11A 2W4JA 3BU3A 3DNDA 3UNKA 2XNMA 1W82A 1KE9A 2H96A 3PPZA 5AP5A 4O0XA 4JX7A 4D9UA 5HE3A 1PJKA 4PL5A 3IW7A 2X2KA 4L6QA 4PTEA 4IANA 1CMKE 3SAYA 3ZEPA 4XYFA 5JFXA 3HEGA 2XKCA 5L6PA 4O0TA 4GKHA 1ZRZA 3KK8A 1NY3A 3V8SA 2O65A 5KKRC 4AAAA 4AACA 4TN6A 3VRYA 3ZO2A 4YLKA 2C5YA 1CSNA 3TIYA 3PP1A 1OL7A 4G3CA 5HNBA 3VQHA 3RAKA 3T9IA 4ANSA 2H6DA 4PUZA 3UO5A 1PRYA 1KE7A 3OWPA 2G2HA 3EOCA 3NUAA 2V55A 5D7VA 4QMYA 1R0EA 1H00A 3RK9A 1H27A 4TTHB 1PXNA 3MJ2A 2HCKA 4IVCA 3TZ9A 2OW3A 3PJ2A 5J7BA 3CP9A 4S32A 4U3YA 2XNOA 4EUUA 4EYJA 2VO0A 4EORA 5CU0A 4CVAA 3PA4A 4N70A 3QXOA 3QA8A 2XCHA 4O91A 4XUFA 2PSQA 2WB8A 2R3GA 2XK3A 4XBUA 2C69A 3AT4A 4LOOA 3VRZA 5CAUA 2WQMA 3POOA 4X3FB 4FEWA 3TDVA 1QPEA 4Y8DA 3LM5A 3DCVA 4FNZA 2JFLA 3ENMA 4AN3A 5J9ZA 4MF0A 3ACKA 1OMWA 3SG9A 1DAWA 3V5PA 4MNFA 2A0CX 3UC4A 4KRCA 4OTPA 5F9EA 1ZOHA 2OXYA 2CJMA 4JQEA 4Y73A 3NVMB 5DT4A 3ANQA 3JVRA 3KCKA 4HGSA 5CNOA 3TACA 3BEGA 1QMZA 4J53A 3PRFA 2YITA 5L2WA 4QTDA 4UX9A 3CS9A 5CYIA 1SVEA 4GUEA 2QU6A 4R5YA 3SXSA 1SZMA 1PW2A 2QO9A 3SRVA 5A4LA 4NCTC 4MXCA 1H01A 3EN7A 3PUPA 5HE0A 3TXOA 3BX5A 3QTXA 1NW1A 1ND4A 4BCJA 4GIIA 2CCHA 3FLZA 3D5UA 3FUPA 3NR9A 3ODYX 4LV8A 2WTWA 3DK3A 4RVTA 3P7CA 2W1DA 4PMSA 1ZY4A 5ETCA 3A4PA 2BKZA 4NJ3A 3PXZA 2YM4A 4FKPA 3DQXA 5M56A 3QC9A 4H3PA 4EH8A 4B8MA 1M2PA 4BCFA 2OO8X 2JAMA 4V0GA 1MQBA 2BTSA 5JGAA 4N6ZA 1U5QA 1OPKA 1P2AA 4YU2A 2WELA 4EK3A 4Z7HA 3U6HA 3LFFA 3DNEA 5AP4A 3F3WA 5IA5A 2E9UA 4OT6A 3KMWA 5FXQA 3ANRA 4YTHA 4DFBA 2CHLA 2HXLA 1ZYDA 4BZOA 4DH1A 4UEUA 3DZQA 4HVSA 5AUUA 3FZTA 2QURA 3DZOA 2Y4PA 2C1AA 4M84A 2QOKA 4QT1A 5GZ9A 3SW4A 2PVYA 3WE8A 1I09A 4BCGA 3KRXA 4FNYA 1FMOE 2GQSA 3KXNA 4AW2A 4IC8A 2I40A 2WOTA 2C0TA 3O8PA 4CQGA 2BFXA 5AV0A 3ULZA 4K0YA 3IECA 3I81A 4LUEA 5DA3A 4U40A 4E3CA 4FV8A 3NZ0A 3Q9XA 4L52A 2YAAA 4O2ZA 4O6LA 1YKRA 3R01A 5LVLA 1R0PA 1FINA 4IMYA 3EYHA 2J0IA 4RSSA 3UG1A 2I6LA 2C30A 3LQ8A 4G3EA 1JNKA 4EKKA 3VBWA 1F0QA 4FZ6A 5E90A 3ZC6A 3ZM4A 2WEIA 3MVHA 5A6OA 3ZO3A 4A06A 4CTBA 2XM8A 3E3BX 4O7RA 4EK5A 1P4FA 5I9VA 3MN3A 2JIVA 4CLJA 4JIKA 2ONLA 4JR3A 2O8YA 4AQCA 5D7AA 2Z7RA 4GT3A 5CTPA 1WBSA 3ZSHA 4CFWA 4MBIA 5DOSA 2VWIA 5A6NA 5JN2A 4AT3A 5IQAA 4YURA 2CKPA 4ACDA 3ZM9A 3H30A 4CCUA 4PDPA 2YDKA 3OXTA 3E8NA 5IKWA 4RFMA 4F4PA 4TWOA 4XG3A 1JVPP 2C3KA 1SVGA 3ZYAA 5HNIX 4B7TA 1ZYLA 1SVHA 4WBBB 1TKIA 1PMVA 2QQ7A 4L43A 3CTJA 3FQHA 3COHA 2J50A 3OXZA 3HV7A 3Q60A 4WNOA 3W10A 4X21A 5F4NA 3GU4A 3SHEA 1ERKA 1NVQA 2ERKA 2RF9A 1PMEA 4Q5EA 4FV2A 2YWPA 3R30A 4O1OA 4GT5A 4PPAA 4D2PA 3I6UA 2OIBA 5CXZA 5FEEA 4ENXA 3E7VA 3NUPA 2UW4A 5DRDA 3V5JA 4NFNA 2QO7A 5E1SA 4RX5A 3ET7A 4NW6A 1IASA 4I5MA 4R1YA 4XP2A 4YTCA 2IW6A 4DG0E 1W98A 2VTJA 4JI9A 5L6OA 1Q41A 2EXEA 4QP9A 4J97A 4CYJA 4E6DA 5AWMA 4HYIA 2BCJA 1XH8A 2WMBA 4R7HA 4RVMA 5M4CA 1XBCA 2ZAZA 2VX1A 3MVLA 2IVSA 4GRBA 1HCKA 2X2MA 4UYNA 3E88A 4ITHA 4H58A 4PL4A 5CASA 2VNWA 2B9IA 3LFSA 4O6EA 4W4VA 5EW8A 4EZ7A 3NVKI 2UW7A 1NVRA 3GFEA 5HG7A 3WZUA 4CFMA 1UWJA 3QHWA 2V7OA 5HVKA 1FQ1B 1ZMVA 2YEXA 4OTQA 5AAGA 3LOKA 2NPQA 3N4UA 3ZBFA 2VWZA 2WMTA 2XEZA 5AV2A 4XRJA 2W5AA 4O7NA 1BI7A 3LM0A 5IDPA 2QD9A 4Y83A 3MI9A 2QONA 4GT4A 3BEAA 4I1ZA 4YSJA 4C38A 4BFMA 3QZHA 4XCUA 4MF1A 4EH6A 3V8WA 4FNWA 2B1PA 4D2WA 1PXMA 4F7SA 5K5NA 4FT0A 2ZOQA 3EQPA 3CEKA 4JG6A 3RAHA 2HOGA 3RZBA 5IISA 5AIKA 4WG4A 4FKRA 5BPYA 4UWCA 2BAQA 2B0QA 3PWDA 2CMWA 4FL3A 1KOBA 3CC6A 3FLNC 3NSZA 2F7EE 4JNWA 4Q2AA 4RC3A 4BKJA 4W4YA 4BCPA 3FZ1A 4EHGA 4EOIA 5IUGA 4FR4A 4FSQA 2XJ2A 4TWPA 1JBPE 3PDTA 4R7IA 4IB3A 1OKWA 2DS1A 4TT7A 3MGYA 2J0LA 4OUCA 4Y85A 2XM9A 3VHKA 4HGEA 4FV0A 4HCUA 3ZSGA 3C4WA 4FK3A 1JLUE 4QMXA 4BL1A 4FEUA 5IQFA 2C5OA 2F49A 4CZTA 3IQ7A 4F99A 1Q8TA 3FXZA 3OWJA 3OY1A 3R6XA 3TZ7A 4FUXA 4U43A 2NP8A 1IAJA 3FEGA 3MFTA 4WBOA 5EM6A 4GJ2A 3H9RA 4XV1A 1YOLA 3S00A 2ZV2A 1PXOA 3L8XA 2QR8A 4QQCA 3VVHA 5H2UA 3BLHA 5IU2A 3VBTA 4RX9A 2BALA 2O63A 4DCEA 2W06A 2Y8OA 4EQMA 3CGFA 1WVXA 2J0MB 2ONLC 4JLCA 3HV6A 3KK9A 3KXHA 5FTGA 4UZDA 4PMTA 5AR3A 5CZHA 1FPUA 5DN3A 4BDFA 3CY2A 4DGLC 2OH0E 3E8EA 3VUTA 3OROA 4ONAA 1S9IA 4O7ZA 4RIXA 1XBAA 3LE6A 4TYHA 2E9PA 3H0YA 3P78A 1ZZLA 3ORPA 4ZSJA 5TKDA 3BKBA 3OTUA 3TT0A 4FKVA 3BIZA 3LPBA 3PVWA 3FMEA 5T6KA 4D5HA 2CSNA 3DPKA 4MVFA 1YQJA 5AX3A 2BHHA 2WMWA 5DHJA 4YZNA 5J1VA 4ZTHA 4C59A 3LMHA 5JFSA 3FAAA 3SQQA 4FKQA 4ALWA 1VZOA 2GNGA 3DKFA 5HU3A 2UZEA 4MNEA 4BBEA 2F2CB 2FSLX 1M17A 5E7RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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