2R5TA

Crystal structure of inactive serum and glucocorticoid- regulated kinase 1 in complex with amp-pnp
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
297
structure length
284
Chain Sequence
QINLGPSSNPHAKPSDFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEVFYAVKVLQKKAILVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNSTTSTFCGTPEYLAPEVLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHLLEGLLQKDRTKRLGAKDDFMEIKSHVFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the kinase domain of serum and glucocorticoid-regulated kinase 1 in complex with AMP PNP.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Sgk1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 284
sequence length 297
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2007-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF00433 Pkinase_C Protein kinase C terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2r5tA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2r5tA01
5H2UA 5L4QA 2R0UA 4XX9A 1G8SA 4AP7A 4F65A 3KF4A 5HLWA 4TXCA 5GIPE 4HGLA 4Q9ZA 4JRNA 3W2RA 4E6CA 3OOGA 1U5QA 3I5NA 1MQ4A 1Y6AA 2OH0E 2OF4A 4FNYA 4UX9A 3T9IA 1WVWA 1R39A 2FSTX 3OBGA 4EORA 5HQ0A 3PA4A 4I22A 4MF0A 2BDJA 3ZFMA 5CWZA 3C4XA 4PL3A 4BDIA 3FDNA 3UP2A 1OI9A 3CTHA 4NT4A 4UMPA 3MVLA 1Q8UA 4J97A 5BYZA 4CMOA 3UO5A 3K2LA 2PUIA 1BI8A 4CKJA 3QUDA 2UZNA 3TNIA 4ERKA 1ZZ2A 2QNJA 3R63A 3VNTA 4U40A 5GJGA 1WMKA 3S2PA 4QP6A 4XJ0A 4QP1A 5E8XA 2PVRA 2PVMA 3CP9A 2FUMA 4A9YA 3VQHA 2HY0A 1NVRA 2YJSA 3W2PA 4AQCA 1U4DA 4MBJA 3ZUTA 5KMJA 4M0ZA 2YERA 4UB7A 4AT4A 2ITTA 3H9FA 2NRUA 2PHKA 4QNYA 4FG8A 3CY2A 3D2KA 4L00A 2C0OA 5DT3A 2CN5A 4KIOA 3SKCA 4FTNA 4J7BA 2YZAA 3HLLA 2BIYA 3NGAA 4QP9A 5JFWA 1IASA 4DBNA 1ZARA 3MA6A 4JNWA 3GXLA 4R6VA 4YC6A 1J1CA 1ZYJA 4YZ9A 2YEXA 3POZA 5AP2A 1AD5A 1JSTA 1UU7A 1PHKA 3EHAA 4TWOA 4ANSA 4QQ5A 4X3FA 2G2HA 3CD3A 3RPVA 5H3QA 2CGWA 2GNIA 2Y4PA 4XBUA 4H3BA 3WF7A 3NS9A 2R9SA 3FY2A 1PKGA 5LWMA 5IQEA 3TUCA 1F5QA 4WG4A 3QX4A 5FXQA 5D9HA 1MRUA 2C5XA 2YJRA 2PU8A 3WF5A 4NM7A 5M09A 3K3JA 5M44A 2PZYA 2Y6MA 3DY7A 5AJQA 2JKQA 3UO6A 4DEEA 3R04A 1PMNA 3ZLYA 4IFGA 4M15A 4ERWA 4XV9A 3BYOA 4YO4A 3R8UA 3HUCA 5BX0A 4BZNA 3RMFA 4GJ3A 3QXPA 5AA9A 2W99B 4GV1A 4FKTA 3NLBA 4LGHA 2Z7LA 3LM5A 5L2IA 3AMYA 4FKPA 4KSQA 2JAMA 3C4WA 4X3JA 4RX5A 1QL6A 4YJRA 5DYJA 3PY3A 4HW7A 4WBOA 1BYGA 4GK2A 4DEDA 4OBQA 5HTIA 1UWHA 4N0SA 2CNQA 3UIMA 5H8GA 5CSPA 2GHGA 4P5QA 3QTUA 2QLUA 5J1VA 4EC8A 1FMKA 4APCA 2B9FA 3MY0A 4NTTA 4IAIA 3OTUA 4PRJA 5HVJA 3RZFA 2HZNA 3TNHA 1BUHA 1ZWSA 3MSSA 3Q4UA 4KS7A 3Q5IA 5CU0A 4CYJA 1A06A 5HBJA 3EFLA 4TYIA 1KV1A 3MPTA 3QQFA 2VD5A 4RG0A 2WHBA 2PMOX 3NUPA 4FV6A 4L67A 2HXQA 4UMUA 5JEBA 4EOQA 5BUJA 2OIBA 4I5CA 5E8SA 4AAAA 4I94A 3DB6A 3TZMA 4ANOA 3Q5ZA 1H07A 4YTHA 5IUGA 3A4OX 4MXYA 4BHNA 5EM7A 4EL9A 4FKLA 5HNIX 4FUYA 4HGSA 4WUNA 3R8LA 2JKOA 4W4VA 1UNHA 1W82A 1YXVA 3KU2A 4EKKA 5IA0A 4DF3A 4M69B 4H3PA 3OWKA 2UZUE 2J0KA 5E8ZA 1Y91A 3AC4A 3F3ZA 4O0SA 5JGAA 2W0JA 2B7AA 1W98A 4HPTE 3ALNA 5AP0A 3WILA 4D2VA 3PLAE 4QMUA 4EHVA 4ZSGA 4ZLZA 3EN9A 4YNOA 3DB8A 3QCQA 2ONLC 4HNIA 3P9JA 3DS6A 5AUVA 4EHEA 4XS2A 3KA0A 2VTOA 5LWNA 2F4JA 4JG8A 5CU3A 3JR1A 5EM5A 2W1EA 4EOKA 3IONA 1V0PA 4DH1A 5DMZA 2BUJA 3DBQA 4HYUA 2CLQA 1WZYA 2X0GA 4H39A 4RPVA 1A9UA 2YM8A 2BAJA 5CTPA 3MFTA 1T45A 3QYWA 4O2ZA 5CNOA 4EUUA 4F0IA 2YLEA 3ZO3A 3NPCA 3UZRA 5EW9A 5C1QB 1CM8A 2J90A 3PA5A 4OUCA 4W9XA 3VQUA 3W2QA 4F9BA 5L2SA 2VNYA 5C9CA 3R7UA 1PYXA 5IQAA 3W2CA 2XYNA 4XLVA 2VWVA 1OL2A 1RJBA 2BZIB 2XH5A 2W1GA 4J52A 3WZJA 4DGMA 3UOJA 4BR3A 3QBNA 4RIYA 5LMKC 2WQMA 3FWQA 3H3CA 3O8PA 4ZEGA 3SX9A 4B6LA 4CT2A 2BZHB 3SVVA 3DLZA 5M4IA 4Z9LA 4RIXB 4DTAA 4NFNA 2RKUA 4BGQA 3IKAA 3P0MA 4C59A 1WBTA 5KX8A 2W5HA 3B2WA 3T3VA 2HZ4A 2EU9A 4G3FA 4MEDA 4K33A 3DTWA 2GSFA 2W4KA 3VW6A 5HE0A 3RZBA 3QD4A 4MH7A 3NMUF 2QG5A 3EQPA 2E9VA 4Y95A 1H1PA 4Z16A 5TR6A 4R77A 4I6FA 4OTRA 2HXLA 3MA3A 3TZ8A 3H10A 4RZWA 1P2AA 4D5HA 4TL0A 4DGOA 2X7FA 3AC1A 1IA8A 3VUDA 2C1BA 4E73A 1DAWA 5J9ZA 1PMVA 2RSVA 4F6WA 5EI8A 1DS5A 3U51A 3QD3A 4G9RA 5HBEA 2YDKA 2UZDA 4EH4A 4WNOA 4GKIA 5C03A 4FKUA 3NUNA 4IH8A 2AYPA 4KAOA 2V62A 2UZLA 4FTRA 4HPUE 3T8OA 3VUMA 3RK7A 3OEFX 2CSNA 1OB3A 2VWWA 3KXNA 3PLSA 2QHNA 2YIWA 3I6UA 4BL1A 4M3QA 5LJJA 2ZAZA 4ALWA 4IVAA 2WMVA 3LQ8A 4KABA 3F69A 5HE3A 2XRWA 3Q6UA 1S9JA 5CSXA 5HU9A 2B9IA 4EH3A 3GGFA 2UW9A 2RIOA 4O91A 4BF2A 4O7WA 4IDVA 4XV1A 4AOJA 4FIFA 5L2WA 3QZGA 4XRJA 3F66A 4XUFA 3D7TA 1YOJA 4EQCA 4DH5A 4IE9A 1H25A 4KIPA 1YWRA 3M11A 4AS0A 3FZPA 3UE4A 4FTIA 3FYJX 3LQ5A 3UNZA 1PRYA 2O2UA 2CKEA 5KMKA 2XIYA 4AT3A 4QP7A 1OVEA 1U46A 1H28A 4IM3A 5DEWA 3FLNC 4IWDA 1Q5KA 4CNHA 3P7AA 2W05A 3F7ZA 4ANBA 5JRQA 4MAOA 4QP3A 4LMNA 4HVGA 1F3MC 3A99A 2YABA 4AW2A 2IW6A 3R01A 4XH6A 2A0CX 3S3IA 4C35A 5M56A 5FM3A 3TV7A 3DXQA 1OPLA 4XCUA 4HYSA 4FF8A 3ANQA 4Y73A 1TKIA 4ZY6A 4YC3A 3TEIA 5CEPA 2CKOA 3F3UA 4YZDA 2WMXA 1O6LA 2G2FA 2Z2WA 4CMUA 3OS3A 3OVVA 4O0UA 4FMQA 4AA0A 3EKNA 2ITZA 3EWHA 4ITHA 5AADA 4J1RA 4DA5A 2JBOA 3G90X 3R00A 5HBHA 2OK1A 5ACKA 3UPXA 3UPZA 4GL9A 3DCVA 4MQ1A 3WARA 2ZDTA 3EJ1A 4F99A 4IAFA 2R3OA 4C62A 2LGCA 2UZOA 2YDIA 5EHYA 4JDJA 3QC4A 3ATSA 3HV4A 3O8TA 4EH6A 4FSYA 4JL9A 4LGGA 4O0XA 3HV6A 2IVVA 4C4HA 4W4XA 1J3HA 5LXMA 2NPQA 2GFCA 4GRBA 4K77A 3UDBA 5IEVA 1PXLA 3OFMA 3OT8A 5E7RA 4W9WA 1F0QA 3QLFA 4EH7A 3BHYA 2HWPA 5ETFA 3HV7A 5LVLA 3VS0A 4DAWA 2Z60A 4CD0A 2VTIA 2WTJA 3EQBA 3CKXA 4M84A 4V05A 3TL8A 3WZDA 4C02A 1Q3DA 5K0XA 5L8JA 4FGBA 5IA5A 4USDA 3MIAA 4IAYA 4FSQA 3UOKA 1U54A 5IMXA 4AW0A 3NNXA 3BV3A 1G3NA 3BLQA 4U5JA 4KNBA 2QONA 4QPAA 3A8XA 4NFMA 5ANIA 3A7JA 2C6MA 2Z7SA 4X6RA 4IW0A 5LVPA 1ATPE 1JSUA 3QQLA 4PX6A 3Q3BA 2BCJA 4Q2AA 4UYNA 5DN3A 2QC6A 4QPMA 5D11A 3RALA 3JVRA 3BLRA 2GNFA 5AV2A 4EWQA 5J79A 4OTQA 4CEGA 1X8BA 4UZHA 5BMMA 4OTIA 4QMYA 4YPSA 3KCFA 5CEIA 2VTNA 5HO8A 4U45A 3ZC5A 1PYEA 3DAJA 4IAAA 2YIRA 2WNTA 1KE7A 4QP2A 3DPKA 3GC8A 2H8HA 4YUQA 5CLPA 3R83A 3RPRA 4O96A 3Q2MA 3BIZA 5KO1A 1YXUA 3D5UA 2RFNA 3PY1A 4JI9A 4JQ8A 4RSSA 3W16A 4FEUA 3HEGA 4CRLA 3OROA 3C51A 4TNDA 4CZTA 4U79A 3EH9A 3V51A 1XH9A 3FI4A 4RC4A 4A9UA 3REPA 4ZJVA 4ENYA 4AT5A 2C6IA 1V0BA 4ZSEA 4FKJA 3QD2B 4J53A 4FI1A 2G1TA 3VJOA 5KUPA 3WOWA 3ZHPC 5FG8A 2E9NA 4EOPA 4CG9A 3KKVA 3F2NA 3NUXA 1K2PA 3W2OA 4UWCA 4E5AX 4HJOA 4QTBA 1Q8WA 2R5TA 4FT3A 2WQBA 1QMZA 1OZ1A 3LZBA 2I0EA 4MXOA 5E1SA 2XIXA 4FOBA 3LFNA 3PZEA 2ZV9A 3B8QA 4WD5A 4V0GB 4ZTMA 1JKTA 4QMQA 3GU7A 4XNEA 2WMQA 4K8AA 4D28A 4XEYA 4FSUA 4D2TA 3V5TA 4BCIA 5GNKA 4L7SA 3IK3A 1H0VA 1GNGA 3ELJA 4LGDA 4RRVA 3WF6A 4UMRA 1SM2A 2I7QA 3R30A 4YR8A 3BV2A 3PTGA 4A9RA 3MIYA 2W06A 1UNLA 1VZOA 2ERKA 2PL0A 3GEQA 4YTCA 2UW6A 3GU5A 4OBPA 4Y85A 4TYJA 4X2JA 4NTSA 2CCHA 5M4CA 1QPJA 4BIEA 4QTDA 4DT9A 3MFRA 3R1SA 3V8TA 5CXHA 3MTFA 3DKCA 3GCPA 2VO7A 2PVNA 4K6ZA 3MH0A 4JXFA 2VWYA 4OBOA 4EJNA 4PUZA 4GFGA 4LI5A 5EOLA 1IEPA 1J7IA 3RPSA 1I44A 3CQWA 4FTUA 4TYGA 1Y8YA 3FMMA 5A3XA 4NCTC 2VAGA 4DINA 3R2BA 4HGEA 2WMRA 4FTMA 4IJ9A 5HE2A 5KHWA 1E1XA 3R7VA 4XG4A 5AIRA 2CJMA 2PVHA 3DQXA 4PMPA 5FRIA 4PMMA 5BVKA 2R4BA 4TT7A 3CIKA 3HMMA 4AA5A 2B9HA 4YJNA 3KN5A 4MNEB 3TNPC 3UIUA 2WTWA 1BL7A 3W33A 5M06A 3VIDA 4ZLOA 3SD0A 3ORXA 4M13A 3PG1A 4IWOA 5EYKA 2BROA 2XK9A 3OUNB 4FKOA 2OFUA 2DS1A 2YACA 1YWVA 5C8MA 2UW0A 3DDQA 3JPVA 1WBOA 4BI0A 3Q9XA 4DEBA 5A14A 4TWPA 2J0MB 3VRZA 3VWAA 1OECA 2X9FA 5F94A 3ZS5A 1YHWA 2YISA 3ORNA 4I6QA 3UC3A 4C3PA 4AFJA 4C3FA 1XJDA 1ZYSA 3L8VA 4GG7A 1QPCA 2QCSA 2I40A 3TKUA 3CXWA 3QRIA 3LFFA 4IAZA 5A54A 4LM5A 2VWXA 3HYHA 5GINE 2PWLA 3VW8A 3W1FA 3VS4A 3HUBA 4KS8A 3AQVA 4GT3A 2XIKA 1YW2A 2G9XA 2Y4IB 3KXHA 3QZFA 4FTKA 3TV6A 3KQ7A 4E6QA 4GSBA 4FX3A 3LFSA 4MK0A 4C4FA 3NW6A 4B4LA 3SXFA 4GT4A 4FV3A 3FMEA 3HRFA 3UOLA 2XNGA 2OJJA 3SQQA 3DXNA 4A9SA 4O7LA 3MY5A 4I4EA 3GENA 3PDTA 2WTIA 4QMMA 3NUAA 3TNWA 1O6YA 3EL8A 4FTAA 4NIFA 4KRCA 3TJCA 2BRMA 1ZRZA 2J51A 3MV5A 3O8UA 3GP0A 4PDSA 1WBVA 3FY0A 1EH4A 1U54B 2WQNA 3OP5A 2C47A 4UY9A 3I1AA 3GCUA 3RWPA 3FC1X 1QPDA 1YI6A 5HORA 5J1WA 3Q96A 2QOOA 2ITNA 4X0MA 4RT7A 4FZ7A 3QQHA 3PVGA 4FV0A 3W8LA 5IQIA 3W55A 1PJKA 4FZFB 5D12A 2Q0NA 2JITA 3K5VA 4OTWA 4CZYB 1TQPA 5HLPA 2OXYA 4FL3A 1T46A 1O9UA 3H9RA 3IECA 2Z8CA 3NW7A 5KMNA 2IVSA 4YSMA 3WZKA 5IZFA 3D83A 4OR5A 4JLCA 4DG0E 4YTIA 3BE2A 3KULA 3DV3A 1XR1A 5FUTA 3NDMA 5EYCA 4Y5HA 3QA0A 5TOZA 1DI9A 3AD4A 3PXKA 4JAJA 5IEXA 2B0QA 5CF5A 2WTKC 4AGUA 1H24A 1OPJA 3BPRA 2VTQA 3DFCB 4YJOA 5DIAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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