2REIA

Kinase domain of human ephrin type-a receptor 7 (epha7)
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
296
structure length
277
Chain Sequence
TYIDPETYEDPNRAVHQFAKELDASCIKIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRDVAVAIKTLKVGYTEKQRRDFLCEASIMGQFDHPNVVHLEGVVTRGKPVMIVIEFMENGALDAFLRKHDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMRYLADMGYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLPVRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVIKAIEEGYRLPAPMDCPAGLHQLMLDCWQKERAERPKFEQIVGILDKMIRNPNSAHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Kinase Domain of Human Ephrin Type-A Receptor 7 (Epha7).
rcsb
molecule keywords Ephrin type-A receptor 7
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 277
sequence length 296
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2007-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2reiA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2reiA01
1OPLA 2WHBA 3LFEA 1JKSA 3LAUA 3QQKA 2XK6A 3EQGA 3UIXA 3QTRA 3EQRA 5GNKA 4R5SA 3E8DA 5ITAA 4EOKA 1YDTE 2WU7A 3UP2A 3U9CA 1OL7A 3D94A 4YNOA 4ALWA 2XNNA 4IX5A 3OBGA 3OMVA 2O65A 2VO3A 3OD6X 5IQCA 2IZUA 4NH1A 5AP7A 2QR8A 4E4MA 2QHNA 5HNBA 2FSMX 3LCTA 4ANLA 2B52A 1GIIA 3OY1A 2BPMA 5KO1A 4G5JA 2EB2A 5E8VA 4RSSA 3NMUF 1JNKA 3D83A 3Q4CA 2XJ1A 4BCKA 3NVKI 3AQVA 5A54A 4Y5QA 4RIOA 4KBKA 4WRGA 2PMNX 2BFXA 3FLYA 4ZLYA 1VZOA 3L8VA 4ZP5A 5AP0A 2EUFB 4JI9A 5CS6A 5HX6A 3H9FA 3ODZX 4L46A 4QYEA 4YBKA 4PPAA 4FIGA 3EJ1A 1ZYLA 4XUFA 1R78A 2FSOX 3TNQB 3TNWA 4YO4A 4XG9A 4F70A 2KTYA 3D15A 4R1VA 3LFSA 5BVKA 5ETAA 5KKRC 4ACCA 2UW6A 5FXRA 2WMQA 4HVHA 4GUBA 4JDKA 4OTFA 3UQGA 2YM3A 5BX0A 2Z7LA 4O7ZA 4ZS0A 2OF2A 3PZHA 3ZFMA 5J87A 3RPOA 3SQQA 2X9EA 4MBIA 1MQ4A 1XO2B 4YNEA 4MCVA 4BCGA 4P5QA 2XB7A 3LXKA 1PMEA 4BCJA 1RW8A 2R7BA 4RRVA 3OCSA 4RJ4A 2RF9A 4GFGA 4CV9A 3BU3A 3K3JA 1FMKA 4HGEA 4FKQA 5F94A 5L8JA 3GUBA 3RNYA 4QMZA 4BICA 4IVCA 2XJ2A 3TIZA 3PJ2A 4BI1A 5HCYA 2FYSA 3RPYA 2PUNA 2QVSE 2OJIA 3C0GA 5DBXA 2X7FA 4NFNA 3TJCA 3LMIA 5JH6A 4U79A 3JY9A 3PJ1A 2JDVA 5FRIA 4DBNA 3TM0A 3FUPA 4RZWA 2A19B 1OVEA 3PIYA 1F3MC 5ACBC 4F08A 4RVLA 3Q2JA 1XJDA 3L8XA 3HRFA 3RM7A 5HE3A 4NJ3A 2J5EA 2ITZA 3P7AA 3R9DA 2GSFA 1ZY5A 3U6HA 4IZ7A 3ALNA 3IKAA 4EKLA 1M7QA 4CV8A 3QF9A 5KMMA 3R7IA 4AZWA 3BPRA 1P2AA 3COHA 3FMDA 4IFCA 4BDDA 4A9TA 3EFJA 4U0IA 5LVNA 4HVGA 4FTAA 4O0TA 5D11A 3DGKA 1JAMA 2X6DA 5AAGA 4YJPA 4EH3A 3OHTA 3KB7A 2YCQA 3ZM9A 5M4FA 3VS5A 1OPJA 4R8QA 4G3CA 4YZNA 3VW8A 2JITA 4AZSA 3KULA 3G51A 1H1WA 4FKIA 3MYGA 4FKUA 1LPUA 4H1MA 4IB1A 5ANKA 2DYLA 3I0QA 3TWJA 4FEXA 3R30A 1OBGA 3ZZWA 5KZ0A 3CY2A 4C8BA 4ZJIA 5EM8A 5IQHA 4YZDA 1STCE 2IVTA 3IG7A 4LRJA 2B7AA 3I1AA 1E1VA 4OTHA 4WBBB 4FT9A 1H8FA 4RX9A 3TL8A 5M44A 3V04A 2DWBA 4I94A 4IM3A 4K77A 3GBZA 4G5PA 4ITHA 4D58A 4QTEA 1NA7A 2OO8X 3CP9A 4CD0A 2GNHA 4FZ6A 5BUIA 4X0MA 4BYIA 4MD8E 2QD9A 5CU4A 4Q5EA 4BCFA 5HNIX 4YBJA 3ACJA 3BHHA 5CANA 4ANQA 2UZEA 3MTLA 3FLQA 5E4HA 4FIFA 2V5QA 2WXVA 3IS5A 4FV8A 4H1JA 1H1PA 2ETMA 2C1AA 2OGVA 3CJFA 2IN6A 4JG6A 1DI8A 2XH5A 2IW6A 3HA6A 3JUHA 2XIYA 1M2QA 3QRJA 4EK4A 1H0WA 3QZFA 3HP2A 3K5UA 2XS0A 3BQCA 3EKNA 4JIAA 3OWPA 4AN3A 1YOJA 3VUDA 3NZ0A 4U9AA 5DT0A 2PUUA 5J5SA 4EK8A 3WIGA 5JFSA 2WD1A 4C3FA 3VBVA 4EOSA 2XNMA 2CMWA 1OKWA 2E9OA 4RPVA 3F69A 2GNLA 2XIZA 3KXGA 5GJGA 4YTCA 2B53A 1OL5A 3POZA 4AG8A 3VUKA 2QOLA 4O0UA 4UX9A 1OI9A 2GS2A 4C7TA 1YI3A 4O21A 2XNGA 1K3AA 3F9NA 3V8TA 1OL6A 2BFYA 4APCA 2BRMA 5FTQA 1IA9A 3OOGA 4J99A 2FSLX 4ZSEA 4ZZNA 3DAJA 4QPSA 3V5JA 3C4XA 4DITA 1ZYCA 2QCSA 3R73A 4EQCA 2O8YA 4FEQA 3VS2A 5JT2A 5DR9A 3QRTA 2HW6A 2ERKA 5CVFA 3VNTA 2ZV9A 3CD8A 4ZZOA 5HO7A 3I5NA 1PXOA 5EQPA 3D5XA 1KE8A 2REIA 5IDNA 3H0YA 1UWHA 3LLTA 3PRFA 3R7GA 1PYEA 3ENHA 3VW6A 5HIBA 5IZFA 2BRGA 3PP0A 3IW7A 2WTCA 4QMYA 5F95A 4F63A 2W17A 2C6TA 5AR8A 5A6OA 1CSNA 3H9RA 4O7VA 1J3HA 5CEKA 4BN1A 3HLLA 3ZLSA 2ZJWA 5CZHA 2J0IA 3FY2A 1NVSA 5CTPA 3OW4A 1UKHA 4H3BA 2OXXA 1AGWA 5CSVA 1A48A 5HKMA 5TOZA 1Z5MA 1PMUA 3OTVA 5LVPA 1PMNA 3MW1A 4FUYA 3EN6A 4YO6A 4QO9A 4QPMA 2UW0A 2PUIA 2UW9A 5CU3A 3F3WA 4I6HA 5TE0A 2I1MA 4GEOA 4BWPA 4F64A 3ID6C 2P2IA 4O86A 4DTKA 4L43A 5HEZA 4E1ZA 3F61A 2B9HA 3FZOA 5JZJA 3IECA 2WQOA 4MAOA 4EWQA 3II5A 3L9LA 4FV2A 5BMSA 2OJGA 5HE1A 2I6LA 5I5ZA 4OBQA 2Q0NA 5D7AA 4BVUA 3KVWA 4ZSAA 4BCIA 4I5HA 3TTJA 4UWBA 1V0OA 1WBSA 5LCJA 3NW6A 3ORNA 4I5CA 3PUPA 3NUUA 5HVYA 1T45A 4X2FA 5FDPA 4FKVA 4O0WA 2ITPA 3IK3A 4DCAA 3GCQA 3OWJA 2A1AB 2JGZA 3PVGA 2HIWA 3OROA 5EOBA 3TKUA 4BHNA 3ZRKA 4YC6A 4KD1A 3QC9A 4FI1A 4TY1A 4UZDA 5FP5A 3MTFA 4ASDA 2J0JA 1SYKA 2PE1A 2B9FA 4W9XA 1KE5A 4BGGA 5HVKA 5K0XA 2YJRA 3PZEA 5AR5A 3DB6A 3IGGA 2F57A 3QAME 2Z7SA 4NJDA 2X1NA 4FNYA 4FTCA 4GMYA 2F4JA 3CPBA 5H3QA 4IMYA 4BDIA 2O63A 4D55A 5CF8A 4M7IA 4XP0A 2PY3A 4MBLA 3LLAA 5M57A 2J51A 4RJ7A 4BIDA 2Q83A 4G9RA 2BRBA 4ANSA 4O0XA 4TYIA 5CU0A 3TJDA 4F9WA 4PMPA 4LUDA 2WEVA 4K6ZA 4TL0A 4EH2A 2X0GA 2CGVA 4FNXA 4WUNA 4IDVA 3NCGA 5K0KA 2JKOA 2W1ZA 4NTSA 2NNWB 3A2CA 3MBLA 4YR8A 5FM2A 4Z16A 3LM5A 4S31A 5CAQA 2C3JA 4OTIA 4FKOA 5FEEA 3PJ8A 2BKKA 3ALOA 2PSQA 2VGOA 5J7HA 4M8TA 5EG3A 2XNBA 3I0OA 4R6VA 2GNJA 3IOKA 5AUYA 4GVAA 5ACKA 5M09A 5LXMA 1PXNA 4YJSA 3GC0A 4C37A 1ZYDA 4RC2A 3RAHA 1BI7A 2WIHA 4LMNA 2IG7A 3FL4A 4FKLA 2OZAA 4PDSA 1YHVA 2GS6A 2HY81 2OICA 2UVZA 3FYKX 3NAXA 4RWIA 5C03A 4QRCA 4ZAUA 5L2WA 1W98A 4AOIA 5IEYA 4I1ZA 4DG2E 3CTJA 1B38A 2W1FA 3NIEA 2Z02A 4IACA 5IH5A 3C9WA 5JGBA 3U87A 3QHRA 4C36A 5I9VA 4FV9A 5AUWA 3R02A 5IA5A 2W0JA 4HGLA 4Y8DA 2R3IA 5CAVA 4DA5A 4TNDA 2C3KA 2ZYBA 3QTQA 4K8AA 4MHAA 3R1SA 2ZV2A 3FMKA 4IHPA 4HCVA 2PUPA 2ZM3A 2QG7A 3EYGA 4RWJA 3FXZA 2BRNA 2JIVA 3NNXA 3QALE 2Z2WA 2RGPA 2C6MA 3CSVA 5HD7A 5HG8A 2PZIA 3OF0A 2BDFA 3AXWA 5F4NA 2ZM1A 2CNUA 3Q6UA 4L44A 4YJRA 3SOCA 4NL0A 3E7VA 4S33A 4DH5A 4EKKA 4AN2A 4NIFB 4JQEA 4GK4A 4FK6A 1ZARA 4B0GA 3DJ6A 1OL2A 2XKCA 4FEWA 2PZPA 1YOMA 3FAAA 2C6OA 4M69A 4QTDA 2LGCA 2R0UA 1UV5A 4H58A 1LEWA 4GUEA 2YZAA 3ZS5A 5JQ5A 4AACA 4H05A 3F7ZA 2GHMA 2IJMA 4IM2A 4KIKA 5E1EA 4I93A 1H1RA 3QTUA 4ASZA 2JIUA 2PZYA 3CBLA 4GRBA 4NCTA 4UALA 4BDCA 4C2VA 4RFZA 4EZ3A 4OTRA 3GCPA 4F9AA 5KKRB 2A4LA 2WEIA 4OW8A 4TYEA 3E87A 5AP2A 1ZZ2A 1BX6A 2ETRA 2BUJA 2XUUA 3MVLA 2W1DA 4XH6A 3PPJA 4BY9E 3UE4A 1CMKE 3WF6A 3P23A 2LAVA 1TQPA 4RFMA 4A9YA 4E7WA 4CLJA 4BDBA 3PY0A 2ACXA 2CLQA 4FR4A 2XNPA 5JRSA 5LOHA 2QOIA 4S2ZA 3JR1A 4I5MA 4NT4A 3AD4A 4HJOA 5L6WL 2WFYA 3P79A 3ENMA 1LUFA 3E93A 4XG8A 4Y95A 3OG7A 5I0BA 4DEAA 1FOTA 3KRJA 3FEGA 4ZTRA 2C3LA 4HGSA 4XMOA 3TNHA 4ANNA 1IAJA 2GU8A 4JR7A 4D2WA 2WTJA 4ZTSA 4MXOA 2JKQA 2BZKB 4QOXA 5M07A 3U51A 4HZRA 3P7BA 4GG7A 4QP2A 3V8WA 4LG4A 3KK8A 4RMZA 4BCNA 4WD5A 4ANOA 4F9YA 4CFUA 5LVLA 2PVJA 3R8UA 1J7IA 3EN4A 4NM7A 1XR1A 4YC3A 5EW3A 5TR6A 2WAJA 3KRLA 4WKQA 3CGOA 4GU9A 5CVGA 4CTCA 3R21A 2W99B 4HZSA 3DNEA 4OAVB 4E5AX 3LVPA 1IR3A 4FT3A 4MNEA 3SG9A 2G9XA 2J50A 2XK9A 1PKDA 3EZRA 3MH3A 3EYHA 4FSWA 4W4WA 2H34A 3R8ZA 5ETFA 2XYNA 3OY3A 1RDQE 2Y7JA 3PJ3A 2QLQA 4LL5A 4QPAA 4BTKA 5L2IA 4EH9A 4CT2A 3KXHA 4U7ZA 1R0EA 4BI0A 5E91A 2GFCA 4IB5A 3CQWA 3UOHA 2BCJA 4QQ5A 4NYEA 4EL9A 4FICA 4EUUA 1U4DA 3EIDA 4UZHA 4YZ9A 4FKPA 2XKFA 2YM8A 1P4OA 4G34A 5KMOA 5B2LA 3LE6A 4MWHA 4DFZE 5AA9A 4E6AA 2WQNA 1V0BA 2VAGA 3V01A 3PIZA 4RVTA 4QP9A 4IVDA 3QGYA 5G1XA 3D7TA 4I0TA 3BWJA 4FKSA 3MB6A 1YQJA 3FWQA 4IX3A 2OH4A 3KK9A 4UMUA 4IAIA 4ZS4A 3NAYA 2XM9A 3E62A 4F7LA 2XNOA 2PVLA 2XZSA 3KU2A 1WVYA 4GL9A 4IFGA 1M7NA 1IG1A 3CXWA 2AUHA 3FZ1A 3QZIA 2E9VA 4I20A 2CJMA 3DZOA 3UO4A 1GOLA 3L1SA 3EOCA 1KE9A 3OCBA 3T9TA 2UZDA 3SXRA 4OTGA 3DJ5A 4GIHA 5TT7A 4M97A 4FE2A 4O0YA 3OOMA 4NCTC 4EYMA 3S1HA 4S30A 5M55A 2VWIA 4LV5A 4QMSA 2ONLA 3P86A 4LOPA 3V8SA 2HYYA 2UV2A 3EFLA 2PYWA 1JOWB 4GSBA 1IRKA 4GK2A 2BHHA 2W4JA 2W1IA 4EH8A 5AUXA 2X39A 5AX9A 3RCJA 3MVHA 4YP8A 2OZOA 3C50A 3QC4A 4QYYA 4QQTA 3LXNA 5TO8A 3V6RA 4D9TA 3IOPA 4PMTA 3HMPA 5EDQA 2J5FA 2QG5A 4ERKA 1GZNA 4S34A 4D9UA 3NS9A 4GYGA 4WA9A 3WARA 4GVJA 2OLCA 3TI1A 4U41A 4NW5A 4NM3A 5IKWA 4RIWB 3GCUA 2GNFA 3QTIA 1ZLTA 5BVWA 2J9MA 3LFAA 4M12A 3FXWA 4V0GA 5EHLA 3ETAA 3UP7A 3ZLWA 4ACMA 3RKBA 4BC6A 5KHWA 4EQMA 1ZAOA 5KX8A 3DTWA 4G6LA 1OM1A 3D4QA 4CGAA 3R04A 4UYNA 2OSCA 4E5BA 3A7IA 3UBDA 3G2FA 1W83A 1CKPA 2XP2A 3BEGA 4L67A 3UIBA 1OUKA 3LFNA 4TWNA 4LGHA 5ANGA 1VYWA 4I23A 4F0IA 4F65A 4MWIA 4TWPA 2BIKB 3NW7A 4BCPA 4DH1A 3MPMA 3QYWA 4XP3A 2R3GA 4QT1A 5IA2A 4JLCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1OPL A;  2WHB A;  3LFE A;  1JKS A;  3LAU A;  3QQK A;  2XK6 A;  3EQG A;  3UIX A;  3QTR A;  3EQR A;  5GNK A;  4R5S A;  3E8D A;  5ITA A;  4EOK A;  1YDT E;  2WU7 A;  3UP2 A;  3U9C A;  1OL7 A;  3D94 A;  4YNO A;  4ALW A;  2XNN A;  4IX5 A;  3OBG A;  3OMV A;  2O65 A;  2VO3 A;  3OD6 X;  5IQC A;  2IZU A;  4NH1 A;  5AP7 A;  2QR8 A;  4E4M A;  2QHN A;  5HNB A;  2FSM X;  3LCT A;  4ANL A;  2B52 A;  1GII A;  3OY1 A;  2BPM A;  5KO1 A;  4G5J A;  2EB2 A;  5E8V A;  4RSS A;  3NMU F;  1JNK A;  3D83 A;  3Q4C A;  2XJ1 A;  4BCK A;  3NVK I;  3AQV A;  5A54 A;  4Y5Q A;  4RIO A;  4KBK A;  4WRG A;  2PMN X;  2BFX A;  3FLY A;  4ZLY A;  1VZO A;  3L8V A;  4ZP5 A;  5AP0 A;  2EUF B;  4JI9 A;  5CS6 A;  5HX6 A;  3H9F A;  3ODZ X;  3VON A;  4L46 A;  4QYE A;  4YBK A;  4PPA A;  1XMM A;  4FIG A;  3EJ1 A;  1ZYL A;  4XUF A;  3UDT A;  1R78 A;  2FSO X;  3TNQ B;  3TNW A;  4YO4 A;  4XG9 A;  4F70 A;  2KTY A;  3D15 A;  4R1V A;  3LFS A;  5BVK A;  5ETA A;  5KKR C;  4ACC A;  2UW6 A;  5FXR A;  2WMQ A;  4HVH A;  4GUB A;  2A98 A;  4JDK A;  4OTF A; 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