2UW7A

Structure of pka-pkb chimera complexed with 4-(4-chloro-phenyl)-4-(4- (1h-pyrazol-4-yl)-phenyl)-piperidine
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
337
structure length
335
Chain Sequence
SVKEFLAKAKEDFLKKWENPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVKHMETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLTKLEFSFKDNSNLYMVMEYAPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLMIDQQGYIKVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Identification of Inhibitors of Protein Kinase B Using Fragment-Based Lead Discovery
pubmed doi rcsb
molecule keywords CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE, ALPHA-CATALYTIC SUBUNIT
molecule tags Transferase/inhibitor
source organism Bos taurus
total genus 109
structure length 335
sequence length 337
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2007-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2uw7A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2uw7A02
4MF0A 4GFGA 3LCTA 4YJVA 4PDOA 1Q3WA 4NTTA 2IWIA 5CVFA 4BCHA 5KE0A 4YZCA 4G6OA 4L8MA 3C4WA 3LQ8A 4UZDA 3VS6A 1TQMA 3QD4A 4QYEA 4N4SA 2B9HA 2W05A 3HKOA 1M14A 4EH7A 4UB7A 5AIRA 4LGHA 5TF9A 3VBWA 2VWXA 4U81A 4MX9A 3WYYA 3UNKA 1NXKA 4IC7A 5DR2A 4PX6A 4GG7A 5HNBA 4IVDA 5L6WL 4AN2A 4LV5A 1H26A 2FVDA 4W8EA 3QCYA 1HOWA 1XBCA 4UALA 3Q9YA 2WZJA 4N0SA 4GCJA 3VS0A 2O5KA 4BGHA 4BHZA 5KMNA 3O17A 2VV9A 4HCUA 2BRNA 5FEEA 2YCRA 3UP7A 3F2NA 3KGAA 3TIZA 4AUAA 4JQEA 3PYYA 2CMWA 2R64A 2UZDA 3PG3A 4A7CA 4BDEA 1Y6AA 4FG8A 3AGMA 3EQPA 2QG7A 3MESA 3C0HA 2X6DA 4FKRA 4RJ5A 5C1QB 4BHNA 5JRSA 3FXZA 4RJ8A 4ZTNA 2JFMA 3I4BA 4NWMA 4HVSA 4O7LA 3A7HA 2KULA 3TV4A 4RC4A 4LRKA 4QMLA 4DEIA 3R7EA 2Y4PA 5M53A 2PHKA 2GFCA 3ACKA 4GRBA 1IRKA 5AJQA 2YM6A 4AOTA 4BY9E 4IAFA 4QP3A 3MTFA 4OBQA 2OKRA 2VTQA 4X2GA 4AGUA 5GZ8A 4E5AX 3IOPA 1LP4A 4M13A 3AOXA 2WO6A 3BKBA 4CCBA 4KA3A 3LCKA 4JBVA 2NP8A 3V5WA 3UYTA 4V04A 3G9LX 1GIJA 1ZOGA 1PYEA 2VUWA 5H8BA 5M44A 3EHAA 2YCFA 2W5AA 5CENA 1RW8A 4XV2A 2PZIA 1Q5KA 2NPQA 3OF0A 5HIEA 3RHKA 2OH0E 4EOSA 2RKUA 4F1TA 5DEYA 3R9NA 4FV9A 2W1GA 4ERWA 4QYYA 4ACMA 3ZBFA 5LVLA 2C6KA 1U54B 3EL8A 3MS9A 2YCQA 4F65A 3U4WA 5IH4A 4O91A 5CI6A 4FTTA 3IQ7A 2QURA 5HBJA 5CSXA 2C3IB 4UN0C 4ALVA 3HRCA 1YI3A 5AAEA 1H1WA 1J7IA 3DK3A 2ETMA 2WMVA 5BYLA 4NW5A 4P2KA 1M7NA 2W4KA 3W33A 2PULA 3DQWA 3QC9A 2BTRA 1SVEA 4ZS4A 4O83A 5ICPA 2BR1A 4OBPA 3NAYA 4GT3A 2FH9A 2OFVA 4DG2E 4JOAA 2A1AB 4E5BA 3HNGA 3IDCA 3ZM9A 4HCVA 2WTCA 2ONLA 4LM5A 2UZVA 2VWBA 3TUDA 5CALA 3QTWA 3MY0A 2XNPA 3TV7A 2BTSA 2HELA 3K5VA 3D7ZA 4FV6A 2IO6A 4KKEA 5I4NA 2IG7A 5GJDA 3LXPA 2PMNX 1Q8ZA 4YR8A 4CMUA 2FB8A 4TYHA 4EJNA 2G2FA 1WBSA 2GS2A 3ATTA 3QYZA 3IW5A 3QGWA 5AUUA 3DA6A 4UMTA 5CEKA 3D7TB 3OTVA 2JD5A 4MTAA 2B4SB 2Z60A 3W55A 3D5VA 3W8LA 3PE2A 3WI6A 5M07A 4Y85A 3LXKA 3MA3A 1ZYSA 3KRXA 1U5QA 4BGGA 4I0SA 3PP1A 4NT4A 3NVMB 4ZMEA 3LAUA 4EOLA 5B2MA 2YM3A 4O6EA 3SKCA 2AYPA 4DGLC 5HQ0A 4V0GA 4YTCA 3HAMA 5D1JA 1SNXA 5AP2A 4E20A 5M51A 2HXLA 4FSMA 3UIMA 4DEDA 3I0QA 4QT1A 3ZXTA 1S9IA 3NS9A 3G0FA 2YIWA 4NM3A 5GHVA 5KMKA 1JKLA 2X2MA 5I3RA 2VAGA 4NM7A 4U8ZA 3UOHA 3VS2A 3D94A 3R8MA 3P86A 1WVXA 4RJ3A 3EJ1A 2NO3A 3FMEA 3FUPA 2OF2A 2FUMA 1U46A 3SV0A 3QTSA 3FMMA 4XJ0A 2WAJA 2VWZA 4D2SA 4HVHA 4PNIA 3E8EA 2UZBA 3R1NA 3HGKA 3UZRA 1OIUA 4QP6A 1M7QA 4EKLA 3IGGA 4RSSA 3K5UA 3F7ZA 4IZAA 3FC2A 4FL2A 4PMSA 5E8SA 5HG8A 3IDPA 4BCFA 1PYXA 5EM8A 5CEMA 2OGVA 5CT0A 5DIAA 3REPA 3CLYA 5CXZA 1TVOA 4TYIA 1GIIA 1OPLA 4RZWA 4ZZNA 3EQDA 3V3VA 1K3AA 3CD8A 4JBQA 3TNWA 3FLYA 4M7IA 3R9DA 5JGAA 4X7QA 4CNHA 2JLDA 2XYUA 4R6VA 3HUBA 5A14A 4C8BA 3FKOA 3OUNB 5AEPA 3QCXA 3DLZA 5DH3A 4BDGA 3P23A 4O0UA 3WE8A 2G1TA 3VRZA 1CKIA 3ZHPC 2RIOA 3P78A 4CT2A 5A4QA 5CAQA 4RIWB 3KREA 1AGWA 2PZYA 2QG5A 3QTIA 5EW3A 4HVDA 1Q41A 3H3CA 1URWA 4G6LA 3CGOA 2ZV9A 2PZPA 4YJRA 2PL0A 4M0ZA 1JSTA 4YJPA 4AFJA 4M68A 2P2IA 2X7OA 3NZ0A 4IW0A 5C4LA 3EQIA 4L44A 4IM2A 3FMDA 3NLBA 3P4KA 4FV7A 4GT5A 5HO8A 3G0EA 2JEDA 3LFSA 5AP7A 3S4QA 1V1KA 4OTWA 4U40A 3CQEA 4OTIA 4DGGA 5J9YA 4OBOA 4DFUA 5ANKA 2QD9A 2G01A 4GK2A 4O7WA 3RK9A 4OT6A 4M0YA 4EH9A 4BBFA 3ORMA 4BDCA 5KBRA 4LV8A 2F9GA 3FKLA 2PY3A 3Q4UA 2X2KA 2CGUA 3C4ZA 3A62A 4IAYA 3UIXA 3S0OA 3NW5A 5DA3A 2Y4IB 4TT7A 3Q5ZA 2PWLA 5CI7A 3UVRA 1XH6A 3HYHA 4AGDA 4EOPA 5I9UA 3V8SA 3OW3A 4B9DA 2B9FA 3BGZA 1VEBA 3RINA 3TKUA 3A61A 3OY3A 4AT4A 3SX9A 4DGMA 3HLLA 2XIZA 4NM5A 3FI2A 2HY0A 3DBCA 3DV3A 4Y8DA 3V51A 1GJOA 3DK7A 1K9AA 2WELA 4IB5A 2CGXA 5KKRB 4JT3A 2AUHA 2QOLA 4CXAA 4R3PA 4F08A 1R1WA 3EYGA 4JDHA 3DNDA 3CBLA 4FNXA 2WTDA 4D5KA 1U54A 1ZOEA 3FYKX 4O21A 4IX3A 4ASZA 2WTWA 3VBXA 4CFFA 4U41A 3ANQA 4KRDA 1FINA 3FLWA 2ITYA 4WO5A 4CMOA 4FKVA 4MNEB 5IPJA 3WOWA 3OWLA 3FXWA 5JFVA 3V5QA 3Q6UA 3FLZA 4FIEA 4GIIA 4MHAA 3JPVA 4NKAA 4DEHA 3LMHA 1BYGA 1JQHA 2YEXA 4QTEA 5GINE 2E9UA 3U51A 3MVMA 1BLXA 4YLLA 2Z7QA 4NH1A 4FZAB 5AM6A 2JIVA 1PXJA 1YOLA 4RIXB 4D1ZA 4PNKA 2VGOA 1E9HA 2HW7A 4KIKB 2WTKB 3AT2A 3I1AA 4PDSA 2DS1A 3VBVA 2C4GA 3FL5A 2P2HA 2YN8A 4DYMA 1JOWB 5C01A 2V62A 3ZZWA 3EB0A 4AZTA 1PHKA 4WNPA 1P14A 2XIRA 3CEKA 4RWJA 4ZY5A 3ZXZA 2ONLC 4DAWA 3D7TA 2PK9A 4GK4A 4A4OA 1UVRA 1Z5MA 2O3PA 3MFTA 2CKQA 3RALA 3GXLA 3MVJA 4FKQA 5IMXA 4M67A 4C59A 2UW6A 4JL9A 3BLQA 5L8JA 3O8PA 4AWIA 1UKIA 3OCBA 3SXFA 3HMMA 2WMRA 3PJ8A 2B52A 4F6UA 3U9NA 3WZKA 4LI5A 4ANOA 3CJGA 5E8XA 4EK6A 3EN5A 5IA2A 5IISA 3BYMA 2XP2A 3N51A 4O0RA 4QPSA 3BBWA 3H9RA 3PXYA 2W5HA 2W1ZA 4EQCA 3QXOA 4U45A 2V55A 3IW8A 4IB0A 2X9EA 4M14A 2CN5A 3HDMA 3SLSA 2YHVA 5AA9A 3QLFA 2CLQA 4IJPA 4OT5A 2GHMA 1H1PA 2OZOA 5GNKA 1ZZLA 1YXVA 4DG0E 3A7FA 1XQZA 2PMIA 3DB6A 3DZQA 2PVFA 4ZK5A 4D0WA 4XLVA 1YDSE 1PMNA 1QCFA 4O27B 3UGCA 5HE2A 3BCEA 4L7FA 3ROCA 5TE0A 4MH7A 4GH2A 5A9UA 4XCUA 3GEQA 3FLSA 4L00A 4TPTA 3PA5A 2ETRA 5C27A 2BFYA 4PPBA 3KF4A 5FTGA 3UOLA 4BCGA 3TZ8A 5AX3A 2BAKA 1H0WA 5JFXA 3IOKA 2HZ0A 3RK7A 3FI4A 1GZKA 1T45A 4LL5A 4EOMA 3WZJA 3COMA 2OSCA 3F3WA 1Q4LA 3ORNA 3BU3A 3P7BA 5EM7A 4H36A 4QMXA 1FBNA 2OK1A 2WMSA 2EUFB 4I20A 3HP2A 5F9EA 4UX9A 4FSQA 4S2ZA 4I6HA 3EKKA 3OT3A 2I0YA 2XCHA 4F4PA 4I5MA 5EG3A 2BZIB 3ZFYA 3UTOA 4E7WA 1BI7A 2V7OA 3T9TA 3ZO1A 2RG6A 4V05A 3PJ3A 1B6CB 2Y9QA 3FQSA 4RIWA 4UXQA 5CANA 5A4EA 4IC8A 3BGPA 3QTQA 3UIUA 2R3QA 2XBJA 1Z9XA 3HA8A 4DINA 4DFNA 3RGFA 3VF8A 2W96B 5GZAA 5J9ZA 4S31A 5HE0A 4BTFA 3UMXA 5EI2A 3BHVA 4ASEA 4BDBA 1KE7A 2UUEA 3BU5A 5CNOA 4EH8A 3AMYA 4FK3A 5JK3A 1PW2A 3UIBA 1YRPA 3PLAE 4EHGA 2BILB 2ZM3A 5ANJA 4DH3A 4OGRA 4F63A 1PRYA 5HU3A 4QP2A 4ZZOA 3LMGA 3ORKA 4QMPA 3VWAA 4K0YA 5D9HA 4BDDA 5HTBA 1OKZA 3ELJA 4AGWA 5AP1A 4AG8A 5M4UA 4G6NA 4YZMA 3DK6A 4FKUA 3WF5A 4ZJVA 3C13A 4B7TA 2PVJA 1VYZA 1VJYA 2QHMA 4IX4A 5KCVA 4XRJA 5E8YA 2FSLX 3PRFA 2XKFA 4O6LA 4AW0A 2GFSA 2RSVA 3SRVB 1EH4A 1UU8A 2JDOA 3EN7A 4FKJA 3BQCA 3OT8A 1YXUA 3MV5A 2HZNA 4TXCA 3LM5A 5E92A 4FTRA 3MH1A 2ZV8A 3HECA 3FWQA 4FSWA 1I44A 4EK8A 3H0YA 4C4IA 4ZJJA 4IE9A 2H6DA 2ZYBA 5CU2A 3DBDA 4AS0A 4JQ8A 4RPVA 1KV2A 1KE6A 1W82A 2E9OA 3QTRA 4J99A 2WHBA 4EWQA 4YTFA 3GVUA 4MBJA 4H58A 4YPSA 2QO9A 3COHA 2GS7A 4FSYA 5T68A 3R83A 4HNFA 3LPBA 5AV3A 4RLKA 3HA6A 2YJSA 3OHTA 3UQCA 3FC1X 2P55A 4FBXA 3FAAA 3BGQA 2QOBA 2W1EA 4WHZA 3A4OX 2WIHA 4C4GA 5IA1A 2J50A 3OZ6A 4FNYA 4MNEA 2PSQA 2XIKA 4MXAA 3LJ0A 4X3FC 5CQWA 3AT3A 3R7IA 4DCEA 4JQ7A 4QMTA 4F6WA 5I5ZA 1ZWSA 4OTGA 4YJQA 3Q6WA 4B8LA 3UZPA 4FEUA 5BVWA 3F88A 3QHWA 4ITHA 3TNHA 1WBNA 4BN1A 1DM2A 5BQ0A 2R0UA 3IW7A 2UVYA 3V01A 4F7LA 4NJDA 3IW4A 5AR8A 3SGCA 3MYGA 4E26A 3ALNA 3C0GA 2UZUE 4KS8A 1P4FA 4JR7A 4RIXA 5HIDA 3ZONA 4HVGA 5HU9A 3KRLA 2DWBA 4BCQA 4WNOA 3PVGA 3CY2A 3OCGA 3QCQA 3SW4A 1H1SA 1OL2A 3ORTA 4R7HA 4YHFA 3L8SA 3TN8A 2J90A 3Q4TA 2Y0AA 4EYJA 3BYUA 3SOCA 3ZUVA 4EUUA 3F5PA 1PKDA 5EI6A 3TKHA 3NX8A 4I92A 4IZYA 3PJCA 2PMLX 3I5ZA 3JS2A 5ANGA 4BCPA 4FEQA 3ZDUA 4ANNA 4DFYA 4DH8A 3NCGA 3A8XA 2Q0NA 3MGYA 3UDBA 3VBYA 3F66A 4HCTA 3K2LA 5IDPA 2J0IA 3OD6X 4QP7A 2J51A 3UE4A 4EQMA 2YABA 3F6XA 2EB2A 5IH5A 3H9OA 4I6QA 4Y46A 1OUYA 4MD9E 3VVHA 4IAKA 3U55A 2XKDA 3JY0A 3DT1A 5HTCA 5LVMA 3ZSHA 1BI8A 5HHWA 3L9PA 3MH3A 1Q8UA 2PUUA 4BCJA 1DS5A 4Q9SA 3OCSA 5LWNA 5E8UA 4D4VA 2WTVA 3R8PA 2FGIA 5AUYA 3O51A 4FV0A 4TNBA 5C26A 5DNRA 2ZMCA 3G51A 2PE1A 3PZEA 3LLTA 4S32A 2WQOA 3ZS5A 2PU8A 2CJMA 4C35A 1KOAA 2VRXA 1DAWA 3UC3A 4BBEA 3CQUA 2W17A 4K6ZA 3JY9A 3NEWA 4G3DA 5KMJA 3IW6A 3VC4A 4RVKA 4MXOA 4TY1A 1CM8A 2I40A 3SD0A 1H28A 3NNUA 2J4ZA 1Y91A 2BDJA 1ZRZA 3NW6A 4G5JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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