2UZLA

Crystal structure of human cdk2 complexed with a thiazolidinone inhibitor
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
296
structure length
295
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of a Potent Cdk2 Inhibitor with a Novel Binding Mode, Using Virtual Screening and Initial, Structure-Guided Lead Scoping.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
total genus 84
structure length 295
sequence length 296
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2007-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2uzlA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2uzlA01
5DRDA 2ZMCA 3L8SA 2OIBA 5ANDA 1ZYJA 2J6MA 4M15A 5AP6A 3MTLA 1XH7A 2XA4A 3OW3A 4HYHA 4BWPA 5CEMA 3ANQA 3CY3A 3IDPA 4FZAB 2I0YA 4IBMA 4OTRA 3QTSA 4C8BA 1GAGA 1Y6AA 3BV2A 4U80A 1J91A 1FPUA 4F9YA 3P7CA 3PDTA 2ITYA 5DA3A 4MX9A 4CLIA 4U42A 3N9XA 4QPAA 1OGUA 3R21A 3F66A 4IVDA 4AACA 3PY1A 5K0KA 3ZSGA 1PXNA 2WOUA 4I6HA 4FKWA 2R0UA 5KHWA 3ULIA 4X3FC 3DBDA 4D4SA 5BUJA 4DH5A 5J9YA 3FI3A 3MVHA 4W4VA 4LV8A 1H0WA 4RJ8A 4YUQA 3CIKA 4IMYA 5FGKA 2R9SA 4M8TA 2BPMA 4CFWA 3UIXA 5E92A 3UMXA 1FOTA 1YKRA 3QUPA 3QWJA 4S34A 4P2KA 4IM2A 4ANMA 4N4SA 2QG7A 4I4FA 2VZ6A 5TO8A 4MAOA 2I6LA 3NUXA 4QMNA 2EXCX 3PXQA 4YJQA 3GBZA 2X8DA 4UYNA 4AN9A 5HD4A 1KV2A 3AC1A 1UNGA 5ETIA 4ZIMA 3UC4A 4B99A 3PE2A 4DFUA 4FT0A 4IC7A 1QCFA 5CT7A 2R7IA 5CEOA 4AWIA 4JXFA 3AMYA 3FKNA 5L8KA 2BDJA 5EW9A 4GT3A 4Y85A 2YWPA 4O27B 4DGMA 4DH1A 5CSXA 3REPA 4Y5HA 3E8NA 4DG0E 4OTGA 3AT2A 3CSVA 3FKLA 3NWWA 2HW7A 5CVGA 1M2PA 3PPJA 4D0XA 2X7FA 4FV0A 4DCAA 1H4LA 2XUUA 2BRHA 4I6BA 3VBYA 1CKIA 5HO6A 5LMKA 3SG8A 5E8WA 4FYNA 3FWQA 2OH0E 3HNGA 2ACXA 4CYIA 1IRKA 4P90A 3T3UA 2A27A 4FIFA 5HNIX 2JDRA 3FMDA 3QTUA 2QLQA 4TYEA 4FG8A 3O8UA 4V0GA 4IVAA 3OEZA 4OT6A 3HA6A 3BYVA 4FBXA 4G17A 4J1RA 5FTGA 3IG7A 4J53A 2BRBA 3ORNA 5KNJA 2JDVA 2QO9A 3E63A 3GU8A 3HMNA 4UZHA 4EI4A 5HO8A 2B0QA 3L9NA 4CMUA 4PPAA 2RG6A 3VBTA 1H24A 2LGCA 2WQBA 3FLWA 4RIYB 5HU9A 3D14A 3ZO2A 3ZYAA 2C1BA 4JT3A 4CRSA 2BTSA 4YJVA 3NNVA 3PLSA 3ZONA 4BDJA 2J0JA 3DJ7A 4FGRA 4BR3A 2REIA 3TKHA 3UPZA 3HX4A 1GIHA 4IADA 4LRMA 5HNBA 2LAVA 3E64A 3TV6A 3EN7A 4UXLA 1YW2A 2YCRA 4J7BA 3V51A 4O0WA 5J87A 3FBVA 1OL7A 3Q4CA 3DKFA 5DT4A 4L42A 3D5UA 5EDPA 3HP2A 2QLUA 3GCPA 4YTIA 1Q97A 3MI9A 1P2AA 2X81A 5HEZA 2O0UA 3BE2A 3F9NA 2IPXA 2YISA 1E9HA 4IJ9A 3TZMA 3W55A 2IZSA 4NTSA 1Y57A 3UZRA 2HK5A 2W1GA 2WKMA 3NLBA 4IAZA 3BLHA 5AAEA 4CT2A 5K5NA 1V0PA 1BLXA 5A6OA 2ZM3A 4IM0A 4XG8A 3RWQA 5JN2A 3DLSA 3C9WA 3I6WA 4FV6A 2YDKA 2W9FB 3IOKA 4PL4A 2VV9A 4FEQA 3U9CA 3DK6A 2BHEA 3QALE 3ORZA 4ASXA 2X1NA 4AW2A 3R8MA 1H27A 4O7TA 2X6DA 4FNWA 4JVGA 5HCYA 4NKAA 4CQGA 3LCDA 1RDQE 4XV9A 4DC2A 4G34A 3KK8A 4USFA 5EKOA 3M2WA 2H34A 2RKUA 3HMOA 2I0HA 4A4LA 2YM3A 1W8CA 3NS9A 1K3AA 5CS6A 3PXRA 2B4SB 2QD9A 4FKOA 4FZFB 2BTRA 4D2WA 3LFAA 2CKEA 3VO3A 1VEBA 4TWCA 4BKYA 1UKIA 1GIIA 4MWIA 4OTPA 2IVUA 3TUBA 3OP5A 3W32A 2GHMA 5M4UA 5E90A 2ZDUA 3H0YA 4DT9A 5CU2A 3IOPA 1WBWA 2OW3A 3HV4A 4XV1A 3TIZA 5CSPA 3KKVA 3OBJA 4I21A 4IZAA 4KIQA 4HZRA 5EQEA 2RSVA 3DKOA 4JQ7A 5D12A 3IDBA 3R1QA 4A06A 1M2RA 3CQWA 5AAFA 1KE8A 3O2MA 1V1KA 5IH5A 5T68A 4R7IA 1RJBA 3WZKA 1U4DA 3GC7A 4KD1A 3RPOA 1FVTA 2JAVA 3VJNA 3KXGA 3SD0A 4B0GA 2HXQA 3RGFA 2CGVA 4FOBA 2HZIA 4S32A 3W16A 5EKNA 3Q96A 5HLPA 1F0QA 1M7QA 2Z7SA 4RVMA 3N4VA 2GQGA 4I20A 3C0IA 4DH7A 3C5UA 2OFVA 3LJ1A 4CKJA 1Q8UA 3DK3A 3G0EA 2C5NA 3KRXA 4IZ5A 1XWSA 4LGDA 5H8EA 2XYNA 5KMLA 3S1HA 2HENA 3PRIA 4L6QA 3NW7A 3R71A 4FMQA 3PG3A 3EQGA 5CX9A 3GGFA 5AV2A 2WTIA 4G9RA 1ZMVA 4LOQA 2ZVAA 3AOXA 1K9AA 2P4IA 4AUAA 3GQIA 4Z7GA 5GJGA 2GSFA 1H01A 1SM2A 2HZ0A 4RGJA 1WVWA 2OBJA 2P3GX 2R7BA 1W83A 2AC3A 2R3GA 4FTMA 4I1ZA 1QPJA 4QTDA 5D1JA 5I3OA 3W8QA 4FZ6A 5TR6A 3W1FA 5K0XA 2ESMA 2NO3A 2W1DA 1LP4A 4K33A 2XEYA 3TZ8A 4EC9A 2Y6OA 4QQJA 4NFMA 3C4CA 3P1AA 4XP3A 1P14A 3Q53A 5HO7A 4FIIA 2YAKA 3RPVA 3N4UA 3AMAA 4RJ7A 2YLFA 2YIQA 4I6QA 3WF7A 4A9SA 3M1SA 3LJ0A 4M68A 2O64A 5AUZA 4IE9A 1YDTE 4LUDA 4CFUA 3OXTA 3BRBA 3K5UA 4U6RA 4BDGA 2XM8A 3KCFA 2F2UA 1VJYA 3EN9A 3UE4A 5AUTA 1Y8YA 3FSKA 3R63A 3UNJA 4IFCA 4GU9A 3QUEA 2JIUA 5BVOA 2VWIA 1ZYSA 5HGIA 4BGQA 3KN6A 4L9IA 1OZ1A 1ZY4A 2O3PA 2IVTA 3UPXA 3RNYA 4BZDA 4EHEA 4EUTA 3TDVA 4NSTA 2YJSA 4RX8A 5DR2A 4DTAA 3BELA 4Z55A 4OW8A 3COMA 4RWJA 4U7ZA 1M2QA 2ZV9A 5EI2A 2ITWA 3VRZA 3ZC5A 4O7YA 2X4ZA 3JUHA 4JDHA 4RLKA 1U46A 4FKLA 2YHVA 5LVMA 2JDSA 3JYAA 4E26A 5DR9A 5FP5A 1YDRE 4DN5A 4UY9A 3F3TA 3EHAA 3OWJA 3SC1A 3R01A 2E9NA 4RX5A 3CJGA 2YERA 4LG4A 3T9TA 4BBEA 3TACA 3ZUVA 2Y9QA 2UW0A 4U81A 1H1QA 2FH9A 3CP9A 4NWMA 2ZJWA 3QRKA 4EQUA 3R7VA 3TCPA 3QWKA 3ET7A 2JGZA 3FXWA 3NUPA 3TXOA 4J95A 4FI1A 5A46A 5IA3A 2J0KA 2X4FA 4FGBA 4GK3A 4IVCA 2G2HA 4PPCA 5KZ0A 4ENXA 1IA8A 4C34A 1JSTA 2C6DA 2DWBA 4L43A 4DGNA 4RZVA 3ULZA 5KHXA 4EQMA 3NUNA 2AC5A 3G9LX 4MKCA 4N0SA 1VYZA 2WGJA 3E7OA 3W33A 2XNEA 1KE7A 4JLCA 2WIPA 4TZRA 3U6JA 3W2QA 3ORKA 3MFTA 2OG8A 4E3CA 5K9IA 4JBOA 3CTQA 4IWQA 5E1SA 5JGBA 4XLVA 4DBXA 3LXLA 4IJPA 5IUHA 5JT2A 4WOVA 3TJDA 4BIBA 1GIJA 3NUYA 3MJ1A 4WUAA 2UVZA 4FSTA 2WOTA 3FAAA 5HX8A 3UQFA 2OFUA 3CQUA 2Y4PA 3R83A 2GNGA 3F3WA 3MB7A 2YIWA 3K54A 3AT4A 2CMWA 4FL1A 5AJQA 5ANJA 4EK6A 3P78A 2XMYA 3ORIA 3ODZX 2PZ5A 5E91A 4XEYA 5I9VA 2ZDTA 5CU4A 3O50A 3FL4A 4YNOA 3SGCA 3OCBA 4CZUA 3LE6A 1IAHA 1H1WA 2OZAA 2WMUA 3DY7A 4F6SA 4QMQA 1S9IA 5AP3A 3O17A 3EL8A 5FWKK 3QUDA 4XG3A 2XNOA 5CSVA 4IWOA 4I41A 4KKGA 4LL5A 4TPTA 4XCUA 3U51A 3EFKA 4JS8A 5JRQA 4HYSA 3FZSA 3Q9XA 2R3LA 4BDIA 3EIDA 3OHTA 2HELA 5K3YA 3TG1A 2QOCA 4DYMA 5E8XA 5IQEA 2BKKA 3GC8A 4LGGA 5BVWA 3POZA 4CLJA 1YWVA 3UO4A 2JD5A 5ANIA 2CJMA 3R0TA 3E8CA 3LIJA 4ENYA 3CS9A 2R3RA 5IEXA 3GQLA 1IG1A 1U54A 4C3PA 2A4LA 3GXLA 4IC8A 3DFCB 4O0RA 3Q5IA 2VO3A 4ZTQA 4AZSA 1KOAA 2QOOA 4I94A 2Y4IB 2WTKC 3FMMA 4Q5HA 4RIOA 5ACKA 4YU2A 1YWRA 2DS1A 5CQWA 3G33A 3UVQA 4QYFA 3ALNA 2XJ2A 3LMGA 1QMZA 2JKMA 4GYGA 2PVLA 4F7SA 2X9FA 1GZKA 4FL3A 3CR0A 1PKGA 1Q8ZA 2BZJA 4FODA 2GPHA 4HGSA 2PUIA 4XMOA 4LL0A 3Q04A 3OCTA 4O38A 1PXKA 1Y91A 1Q62A 4FUYA 4OTWA 2C6TA 3GOKA 4IVBA 4JX7A 5DWRA 1YI6A 5BYLA 5ETFA 1JWHA 4YTCA 4ZAUA 3E87A 3HVCA 3FXZA 2WMRA 3DTWA 5CNOA 4ZTLA 4RX7A 4I5MA 2YZAA 5CTPA 5KE0A 1FVRA 1LPUA 3EKNA 1OL5A 3EQCA 3QCQA 3HLLA 2QOLA 4GUEA 2FA2A 3DOGA 3ORMA 4XYFA 2CCIA 5HHWA 4R78A 5HD7A 3POOA 3Q6UA 4ALVA 1M14A 4O1PA 4NU1A 1OL6A 2PVNA 4FV4A 4QMYA 3BHUA 4O0VA 3VUKA 4DEAA 5AIRA 3U6HA 2YZLA 3AXWA 4F4PA 4EK3A 3SV0A 2EVAA 3VS5A 4FT7A 3WE8A 4F70A 4G5JA 4ZK5A 4PDYA 3UC3A 2UZUE 4DEGA 2PVRA 3D2KA 1PKDA 4W9WA 4HCVA 4KS8A 3JVSA 4KIKB 5AR2A 5M55A 3R7IA 4N6YA 4JQEA 5AUVA 5IQAA 4AX8A 3KULB 1KUTA 4E5BA 3QGYA 2VTAA 3ZLYA 4BTFA 3NR9A 5KKRB 5LCJA 1OITA 5EHLA 5CY3A 3F3ZA 4MHAA 1BI8A 1ATPE 4LGHA 3C7QA 3P7BA 3F5UA 4A07A 4ITIA 5IA0A 1XKKA 1WBVA 3S95A 2C3JA 4J52A 5GZAA 1R1WA 1R39A 2CLXA 4ZSJA 2VWYA 1OPJA 2OJIA 3A7JA 4F7NA 4IDTA 5JGDA 5LOHA 3OXZA 1SMHA 4D58A 3FMKA 4U0IA 2UW6A 2WZJA 5D7AA 4FZ7A 3FLZA 4UEUA 5HBEA 2UW7A 4MVFA 4R5SA 4AOIA 4RA4A 1OKVA 4TYHA 4C4JA 4F64A 5DMZA 4DEHA 4R1YA 2Q83A 2WHBA 4RZWA 5HOAA 2R0IA 3F6XA 4FVRA 2XIKA 4HNFA 3Q6WA 4YBKA 4YO6A 4M69B 4JI9A 4M14A 3BEAA 4AGCA 3V3VA 2B55A 4LMNA 2XNBA 4OTIA 3FZRA 4WKQA 4YZNA 4A9YA 5L4QA 2B9FA 4DFXE 5FXQA 3FC1X 5C26A 4BWXA 2I1MA 4FKRA 4RQKA 1TQMA 4DLJA 1U5RA 1WBNA 3QXPA 2I7QA 3DBCA 1UWJA 3TTIA 3LMHA 3HECA 2AUHA 2QC6A 3BU5A 4TY1A 4H39A 4PMMA 5AUWA 4FL2A 4EK4A 2PVKA 4ZZOA 3EQHA 4D2RA 5ICPA 5KZIA 2OKRA 2ITOA 3CTJA 3V5PA 3QRJA 4KA3A 4XOYA 4B8LA 1UU3A 2CGWA 5ANGA 2JBOA 3GCUA 1OIQA 4YHTA 3FPMA 3L9MA 1R0PA 3PRFA 4O0UA 2NNWB 3E62A 5F4NA 4ZS4A 4BCJA 2IW6A 5IQHA 1TVOA 2NRYA 3DTCA 3VIDA 3Q52A 4EUUA 3K3IA 3A62A 4FV8A 3FKOA 4BHNA 5A4LA 2UW4A 3ZFYA 2BALA 4FK6A 5BVFA 2EWAA 5CVHA 4BC6A 1H28A 4D9TA 3NSZA 2CNUA 5BYZA 4FZDB 4XV2A 3PIZA 4LQMA 3K5VA 2WPAA 3LFEA 5EHOA 1TKIA 4IHPA 4FTTA 4O6EA 4BVUA 3KB7A 3NMUF 5CEIA 3F5GA 5IUGA 4RIXA 2E9UA 2BRMA 4PTEA 3A8WA 2GNIA 3RI1A 1FBNA 4XHKB 4K11A 4QO9A 3P0MA 5HCXA 1Q3WA 3SXRA 5DGZA 3QD2B 3MVMA 3P9JA 1L3RE 3ZFMA 3TM0A 2XEZA 1XBCA 3ZSIA 3BU3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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