2VD5A

Structure of human myotonic dystrophy protein kinase in complex with the bisindoylmaleide inhibitor bim viii
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
406
structure length
390
Chain Sequence
QQLVLDPGFLGLEPLLDLLLGVHQELGASELAQDKYVADFLQWAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDDTCNFDEDGLTAMVSGGGETLSDILGVHLPFVGYSYSCMALRDSEVP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structure of Dystrophia Myotonica Protein Kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DMPK PROTEIN
total genus 109
structure length 390
sequence length 406
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2007-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2vd5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2vd5A01
4J8NA 4YBKA 3UQCA 3Q53A 1MP8A 3N9XA 2H6DA 3PP1A 2C0TA 2REIA 4RIWB 4I3ZA 1K9AA 4A9YA 3GU7A 3KXZA 5BUJA 3FMEA 5A6NA 3KRLA 1OPJA 3ZBFA 3QALE 4MF1A 4L67A 5K0XA 4UY9A 4GU9A 4FOBA 5DYJA 3L8SA 2WTVA 4ALVA 3EQFA 3WOWA 3LPBA 4F70A 3NUSA 3U6HA 4FSTA 1Z9XA 3ET7A 1WBPA 2YFXA 3ETAA 3DBEA 5FLFA 4BVUA 3OCTA 4H3BA 3T9TA 5KHXA 2A0CX 3CEKA 5IQCA 2W5HA 3ENHA 2JGZA 3LCOA 4EWQA 3UOJA 2OF2A 4CCUA 3E8EA 3DJ6A 2HAKA 5LOHA 3MTFA 3M11A 1J7UA 3KL8A 4FTUA 3FPQA 5EKNA 2J0MB 3VUKA 4IAIA 1Q8YA 3LE6A 2XMYA 2E9OA 3CJFA 3Q4ZA 4HJOA 3REPA 3EWHA 2B52A 2E9NA 4J95A 2PMOX 3GI3A 4Y73A 3ACKA 3FKLA 4YURA 2NRUA 4Y8DA 3DB8A 1MQBA 1OMWA 2OLCA 3NVKI 2B53A 4AQCA 2C5NA 4EOKA 4WD5A 4P4CA 2QHMA 1ZWSA 4A9TA 4AOJA 3OCSA 3L9LA 3LXLA 4JBQA 1QPDA 2JKQA 2X6DA 1OGUA 3D5VA 3H9OA 3FYJX 3V04A 3G5DA 1ZOHA 4WKQA 2UW7A 2UW4A 3HGKA 3GC8A 2CMWA 4FKVA 4DFYA 4D9TA 2PVMA 3LJ1A 3CY2A 2GMXA 3NPCA 3RK5A 4D2WA 5K9IA 4WSQA 3WF6A 1FGKA 2F7EE 2PE2A 4O0WA 4F7LA 4ACDA 3ULIA 3ATTA 3F2AA 4LGGA 2F57A 4AN3A 3D14A 3P78A 4E4MA 3TNHA 4MCVA 4RBLA 5I9UA 3M1SA 2XNEA 3KXMA 3P79A 2XIZA 4WT6A 4YC8A 4XS2A 4N70A 5HG9A 5J7BA 3SOAA 3G9NA 2E2BA 3MVHA 4EORA 4KD1A 2I0EA 4FZAB 1E9HA 4TL0A 2DYLA 5H2UA 4NJ3A 5EHOA 5CNNA 5IEVA 3A7HA 2GFSA 4GU6A 4CQGA 2UZEA 5D12A 1H1SA 1W83A 4S32A 4YJTA 3LHJA 3PE2A 5HVYA 2XF0A 2YDIA 5DOSA 4CD0A 1WVYA 2WEIA 2I0HA 3MFSA 3OWJA 4A06A 5HNBA 3HMNA 3QTRA 5F1ZA 2PL0A 5EKOA 3RK9A 4RJ7A 1Q41A 3DTCA 3QWKA 2JIIA 3CP9A 3ODZX 5DIAA 4ZZNA 2X6EA 4EQMA 4O2ZA 5FGKA 3LXPA 3UZTA 3LMHA 3FLNC 3IQ7A 4O22A 4OBOA 5I9WA 1M2PA 3VN9A 1OKYA 3PZHA 2ZV9A 4ASZA 4BDDA 2FO0A 3PXZA 2PK9A 4M12A 4WG5A 1K2PA 5CSXA 3I0OA 4RZVA 2PVYA 4IACA 3GBZA 4F9CA 1FQ1B 5LVMA 3R8PA 2R3JA 3HV7A 2RSVA 4I6BA 2BRHA 3V5WA 4G6NA 3DKOA 3NCGA 5EHLA 3W32A 4BRXA 5CEKA 5HD4A 4FSNA 5BNJA 3OWLA 3W33A 4W9XA 3QLFA 3TJCA 1GZ8A 1ZAOA 4S30A 4QQCA 3TEIA 4EOPA 2O63A 3TV6A 5HE0A 3JVRA 4EOSA 4ITJA 3LZBA 2JITA 2X8DA 2X9FA 4CZTA 4DHFA 2VX1A 3D5UA 4ANLA 2WEVA 3ZHPC 2CNQA 2VWVA 3OMVA 3PPKA 5CWZA 3FWQA 2ZMDA 4KBKA 4Y72A 4ZSLA 4C33A 4BGHA 2W99B 1R3CA 1V0OA 4BCHA 5DA3A 4JDIA 2WAJA 4YJPA 1W8CA 5BVDA 3QQKA 4YJNA 2R3GA 2Z7RA 3DNDA 2X81A 4YTIA 4C7TA 5E8TA 4JG6A 1PKGA 4HYSA 5HCXA 5KMOA 4QNYA 4F65A 3FAAA 4XX9A 4ERWA 1IA8A 4IBMA 3HL7A 4IAKA 4TWCA 3ZMMA 3BV3A 4RT7A 3VUIA 2PVHA 2VNYA 3O7LD 3PJ8A 3RPVA 3ALNA 1TVOA 1V0BA 3JPVA 3N51A 4C4EA 4BDFA 1YDSE 3DU8A 1Q62A 1SVHA 4IM0A 2ZYBA 2IJMA 3C7QA 3NYNA 4PL4A 3TNPC 5AR3A 4M0ZA 3PA3A 5DFPA 3RPSA 4DH1A 3QXOA 5HO8A 5EDPA 2XIKA 2W5BA 2O64A 1IRKA 3F3TA 4K9YA 2IW8A 4M3QA 3VBQA 2Z8CA 4WA9A 4YNOA 4AW2A 2V0DA 2ONLA 4F08A 2FGIA 4FC0A 4JT3A 2CKQA 3NIZA 4MXCA 2FH9A 3MH2A 3MPMA 2BUJA 2WTWA 4GFOA 2W1ZA 5DT3A 2YERA 4FTLA 4WUAA 5JFSA 1JSUA 4U5JA 4AZWA 4FZ7A 1YRPA 1OL7A 3ID6C 4S34A 2JKKA 4HCTA 4HPUE 3R1YA 4E5AX 4BHNA 2C6TA 3QRUA 3TUDA 3FE3A 5FUTA 2WTCA 4CKRA 3E8DA 4G6LA 4WNMA 4HVDA 2OKRA 2YEXA 3KC3A 3VUDA 2XRWA 4XP2A 3MESA 4QMWA 3C0HA 2FVDA 1S9IA 4HVHA 4Q5HA 3UPXA 1YOLA 2BFXA 2VO0A 3QKLA 3V5TA 1YDRE 5KO1A 3UQFA 3QRTA 3UNKA 1TKIA 3UG2A 3EL8A 3DTWA 3G90X 2WZJA 4KSPA 3PSCA 4EH4A 3DFAA 4MVFA 5IDNA 4CXAA 4ACGA 3MS9A 3D0EA 5IG1A 4EK8A 3DK3A 3IECA 1M14A 3MSSA 3GFEA 4BDJA 4ZTSA 4K6ZA 5KKRB 4QQ5A 3VQHA 2V55A 3FLWA 2KTYA 3HMOA 5D1JA 5I3OA 3UMXA 4C3PA 1UU9A 3RJCA 3EIDA 4JVGA 4FV4A 5HIDA 5BMMA 2W1DA 3C0GA 3HDNA 3IDBA 4KSQA 3FDNA 1SNXA 1YXVA 1WBSA 1Z5MA 2R7BA 4I22A 4XEYA 4XP0A 4XUFA 4CLIA 4BZNA 3HZTA 5EDQA 5TE0A 3NAXA 1J7IA 3DK6A 4O7SA 3PVWA 5DN3A 4NT4A 5E8SA 3RK7A 1JVPP 4BCGA 5JFWA 4QMNA 2B9IA 2YM6A 4QYFA 1DAYA 3Q2JA 4GV1A 3CE3A 3HMPA 3SQQA 4KNBA 2WD1A 5AUYA 3UTOA 1A48A 4DF3A 4EHVA 4E93A 2C3LA 5C8MA 3QAME 5DMZA 4F0IA 5BMSA 4A9UA 3MIAA 1IEPA 1Q3DA 3BCEA 4P5ZA 4D2PA 3DXPA 2J51A 5EW3A 4FK6A 4NH1A 5AUVA 4RIXA 4DGNA 4MYGA 5CU4A 3EN5A 1F5QA 2P3GX 4U7ZA 4Y5HA 4UMPA 5E8XA 5AA9A 2BILB 5B2MA 3CS9A 4GK2A 3D4QA 2JC6A 5HESA 5E4HA 3A61A 4GJ3A 4F6WA 5EM7A 1GIIA 3FXXA 3FXWA 1JKLA 2C30A 3KGAA 4HGSA 4IH8A 4ALWA 5EQEA 4BIBA 3NAYA 4QMVA 3GC0A 4AZSA 3PY1A 3ORPA 1ZY5A 3O8TA 4M67A 3VAPA 4FTOA 2VTQA 4KIKB 5AIRA 2DQ7X 3AMBA 1XH4A 1L3RE 3LFBA 3VRYA 2R3IA 4DAWA 4F6UA 5IQHA 2UZBA 5IH6A 4AS0A 3HMMA 1O6LA 2P2HA 5LVNA 2PUIA 4BKZA 4ONAA 2EXCX 3EOCA 4RJ8A 5J87A 1E1XA 2VO7A 2XJ0A 4GMYA 5IKWA 3V8TA 1YHVA 3QQFA 4L8MA 4L42A 2GS6A 4X2NA 1UKHA 1WBNA 4FTJA 4LGDA 3PJ3A 3WARA 3U51A 3W10A 4USEA 2R7IA 3R8MA 3TJDA 2OF4A 4GVAA 4LUDA 1OVEA 4NFNA 4Q2AA 4EC9A 3TN8A 5JT2A 3C50A 3PP0A 3TDVA 1PXKA 3EKKA 3O51A 3SDJA 3LM0A 4I0RA 3P7AA 4TWNA 1OKZA 2VTLA 3AT4A 3T3VA 5CYIA 3FC2A 4DINA 4FA2A 4RWJA 4FZDB 2IZRA 3BKBA 1BL7A 2CGUA 2UZNA 1GNGA 3BYUA 4JQ8A 3LIJA 4BZOA 1OB3A 3F69A 3MY5A 4NW6A 1GY3A 3Q4CA 4QD6A 5KUPA 5ACKA 2PTKA 1EH4A 3VJNA 2VWWA 1F3MC 4HNFA 3SW7A 4PMTA 4O0UA 4XBRA 2UVYA 3HLLA 4TRLA 4AU8A 2HZ4A 1LUFA 3NNVA 3NW5A 2EB2A 2OIQA 3QD2B 4BN1A 4ZLZA 5CSPA 4HW7A 4BZDA 4ZJVA 3L9MA 2R3RA 3MH0A 2QO9A 5CT0A 3EN7A 5AV3A 4ZLOA 3DJ5A 4KKEA 2C6EA 2VWIA 4KIOA 3DB6A 5DPVA 5HOAA 4YHFA 2J5EA 4GS6A 5HBEA 1FVVA 5FBOA 4CCBA 3NYOA 4QTAA 5LCJA 3POZA 3QBNA 2LGCA 3DBFA 1OUKA 3OZ6A 5TKDA 3NW6A 3K54A 3GGFA 3VBYA 4G3FA 3OY3A 3IPHA 4LL5A 1BKXA 3DJ7A 4EHGA 3H9FA 3C4FA 2HXQA 3FI8A 1OL5A 2Z7LA 2W4OA 4CRSA 5CAUA 2UW9A 4GSBA 4WBBB 4LMUA 2X4ZA 4BYJA 2PVLA 4NCTC 3EFKA 4TTHB 5EOBA 2J4ZA 5AUZA 4FGRA 3A7FA 2YM4A 5LQFA 1R1WA 2UW8A 4V05A 4U81A 3JYAA 5JFXA 4L6QA 1FINA 4I41A 4Y83A 5DT4A 3ROYA 2CN8A 4QO9A 3R7OA 2PE0A 5HCZA 4PMPA 3GCSA 2WGJA 5FEDA 1WMKA 5DBXA 2QO2A 2A19B 4RC4A 2YCFA 4HGLA 3DXQA 3QZGA 4UX9A 2R3KA 3DCVA 2VX3A 3G0FA 4RFMA 4YZCA 5K3YA 4EKKA 4MWHA 4QP1A 5BX0A 5CQWA 4FSWA 4BWKA 4RQVA 3G15A 2VD5A 3UOLA 3RI1A 4O96A 1UWJA 4MTAA 4DEAA 3KREA 4ZMFA 5DEYA 3QCYA 3R8UA 5AX9A 2WKMA 1REKA 4NM7A 3AC8A 3EQCA 4J1RA 4ID7A 5KHWA 1DS5A 5LVPA 1TQPA 4FNYA 5KMLA 5HORA 4UBAA 3RM6A 4C8BA 4WNPA 1NY3A 4AFJA 4ZY5A 2BRNA 4IX5A 4AZTA 5CI6A 5CF8A 5DH3A 1TQIA 1ZYLA 3DGKA 3H0ZA 5GNKA 2WMVA 3CR0A 1OI9A 3UIUA 3HX4A 5CNOA 3WE4A 3VQUA 4FF8A 3W8QA 3ZC6A 5LJJA 2F2UA 3ZSGA 2Z7QA 2B1PA 2VNWA 2W05A 2Y6OA 2Y8OA 1F0QA 1PYXA 4FODA 3OEFX 3PLSA 3IGOA 1FMKA 4EZ7A 4IWDA 2C68A 4ANNA 5GJGA 3F3ZA 3QUEA 4P7EA 4YC3A 4RWIA 4BGQA 4YLJA 5JN2A 3O96A 3PPJA 2XBAA 4IB3A 4A4XA 4EL9A 1PXNA 4AN9A 1PJKA 4KIKA 5AFVA 2R3PA 4FKJA 4PPAA 2UZTA 3ZZWA 4CFNA 3ZC5A 3HUCA 3RALA 4LUEA 3R83A 5LWNA 3VS0A 3PVGA 4YHTA 1KE9A 3LFFA 2QOKA 5HI2A 4DEEA 3OF0A 4FK3A 4WRSA 5IUHA 3NEWA 4MD9E 1PMEA 3LFDA 4FKOA 4FKUA 3SOCA 1DI9A 3TKIA 1O9UA 3PA4A 5DLSA 4IZ5A 4AT3A 5A4CA 5IQEA 1PY5A 4FL3A 2V22A 5EYDA 3ZSIA 1ZOGA 1JSTA 2UW3A 5DT0A 5FEQA 1WBOA 1ZZ2A 4JQEA 3UMWA 2J90A 3EFWA 3TZ7A 4F9YA 4OTDA 3AGLA 3NUNA 2EVAA 2JDSA 3OBGA 3VVHA 3ZONA 3NLBA 5HBHA 4FKTA 4PMSA 2QKRA 4TY1A 4DLJA 3LVPA 1OITA 3TIZA 5TOZA 1W98A 4LI5A 3CQEA 3UYSA 4ALUA 5M53A 2JD5A 4O21A 5CVFA 3DT1A 3IONA 3LW0A 3R7EA 3E93A 3TNWA 1J3HA 4PDSA 2R2PA 4GYGA 4D2SA 5AP4A 4ZZOA 5HE1A 3ZLWA 5HIEA 1ZZLA 2GTNA 4OT5A 3W16A 1R0EA 3FMLA 1S9JA 4ZSGA 2OZAB 4QYHA 2XS0A 3NUYA 4ZTRA 4FTCA 4WUNA 3V51A 3UZPA 3KCFA 3FZPA 3ODYX 4ZY6A 2XK4A 3HV4A 4FV7A 1HCLA 3R7VA 5EQPA 4E26A 2YLFA 3THBA 3H0YA 3D94A 3S4QA 4XV9A 5CEPA 2HIWA 2WTKC 4L44A 4MXXA 3A8WA 3DPKA 3DAKA 4W8DA 4FEXA 5EG3A 4WBOA 4AW5A 1W84A 2J0KA 1Z57A 3ZFMA 4EK6A 3KK8A 4TZRA 3M2WA 2UW0A 1NVRA 4RLLA 4U43A 4FTNA 4PMMA 5E8UA 3UOKA 3IDPA 2IG7A 4BF2A 3SD0A 3KKVA 1NVQA 4EOOA 2XNBA 3ORKA 4HVSA 5KMNA 2B4SB 1Q97A 3LFNA 4I24A 2PYWA 4G17A 2XJ1A 3ACJA 3FLSA 2WIPA 4RX5A 2RIOA 3HNGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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