2VGOA

Crystal structure of aurora b kinase in complex with reversine inhibitor
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
269
structure length
268
Chain Sequence
KFTIDDFDIGRPLGKGKFGNVYLAREKQNKFIMALKVLFKSQLEKEGVEHQLRREIEIQSHLRHPNILRMYNYFHDRKRIYLMLEFAPRGELYKELQKHGRFDEQRSATFMEELADALHYCHERKVIHRDIKPENLLMGYKGELKIADFGWSVHAPSLRRRMCGTLDYLPPEMIEGKTHDEKVDLWCAGVLCYEFLVGMPPFDSPSHTETHRRIVNVDLKFPPFLSDGSKDLISKLLRYHPPQRLPLKGVMEHPWVKANSRRVLPPVY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Reversine, a Novel Aurora Kinases Inhibitor, Inhibits Colony Formation of Human Acute Myeloid Leukemia Cells.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 12-A
molecule tags Transferase
source organism Xenopus laevis
total genus 89
structure length 268
sequence length 269
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2007-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2vgoA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2vgoA01
4NWMA 4O7VA 5CSXA 5JQ5A 3ZSGA 2REIA 2BZIB 4FTOA 5KZIA 4EH4A 4FV2A 2IW9A 3VQUA 5I9XA 2PMOX 5AP4A 1OKWA 2OBJA 4MQ1A 5AR7A 3PPZA 1LPUA 3H9FA 1YDSE 2HZIA 3HMIA 3ZLXA 4NCTC 3F2RA 4TWPA 3OBJA 5JGDA 2B7AA 4S2ZA 1J1BA 5DNRA 1PXOA 5EW8A 3ZFYA 5HVKA 4KBCA 5JH6A 2OZAA 2VD5A 3GVUA 3Q4UA 2PY3A 3OBGA 4FZFB 3GENA 4GVAA 2FSLX 4RX7A 4QP8A 4K9YA 1WBPA 4N6YA 4ACHA 3TN8A 4ZS0A 3UOLA 3QXPA 1M7QA 3ZDUA 4MD7E 5C27A 3V01A 1WBVA 4MXXA 2OG8A 3I5ZA 3IPHA 3BU6A 3E8DA 5CEMA 4RIXA 2WEVA 3CXWA 4JRNA 4HCTA 2R3HA 4L52A 3F88A 4O7WA 4BCQA 3UJGA 2XK4A 2J2IB 4Q2AA 4G3EA 4CCUA 3K5UA 1ZOHA 4BIDA 4IFCA 2JBOA 3CE3A 4M8TA 2A19B 1H24A 3LVPA 4H3BA 2UZUE 2WQOA 4EOLA 5IG1A 5DGZA 5JMSA 5FP6A 2OSCA 2W1IA 2BDJA 2Y6OA 1JQHA 4MBLA 4AF3A 2GSFA 4G2FA 1G5SA 4ZLOA 1SM2A 4PPBA 5DI1A 4BZOA 4D0XA 4AOIA 3PA3A 5CAVA 3SD0A 3DV3A 3N4TA 3V3VA 1GAGA 2ITQA 4AW2A 5EM8A 5K5NA 4IC7A 1H1PA 3Q53A 3O8UA 2YIQA 5HG7A 5E4HA 5C8KA 2PVLA 3P7AA 5J9LA 3G9LX 3GEQA 4TW9A 5AUYA 4ZJVA 3SRVA 3EYGA 3BCEA 1V1KA 4W4YA 4JIAA 4O2ZA 3R73A 4RWJA 4AE6A 5IQGA 3W55A 3UQGA 5AX3A 3BHUA 5TE0A 2XK3A 3OEFX 3QZHA 4RQKA 4PTGA 5FEQA 4ZEGA 3HRCA 3UMXA 3ZO4A 3MJ2A 3REPA 3FPQA 5J1WA 4BCMA 1XH7A 3NUYA 1OKYA 5GJDA 3IW4A 4XRJA 4DCAA 2W1ZA 2J0JA 2W99B 3Q96A 2X2MA 4NFMA 3LXNA 4I0TA 4R1YA 4NTTA 4AA5A 4AG8A 3GCVA 4FTCA 4YPSA 5HTIA 1F3MC 3AD6A 3MVJA 1WFCA 4XG3A 2C6TA 4G16A 4O22A 3TKUA 4WIHA 3WF5A 3UOHA 5CWZA 4TYEA 4E6CA 2XKEA 3NGAA 3ZMMA 4XHKB 2BROA 3NYXA 4IQ6A 5I9VA 2XNNA 1U5QA 5IEXA 3QKKA 3K3IA 2XZSA 4M0ZA 1OL5A 1YHVA 4XYFA 4M15A 3CR0A 1ZYCA 4IZ5A 4L45A 5DR9A 3WF9A 5HNBA 4DGNA 4D55A 4J1RA 2UZLA 2WOTA 2XNEA 5EG3A 3R30A 1P5EA 5HX8A 1XBBA 3OG7A 2CHLA 3RK7A 5CXZA 4I6FA 5BMSA 3EIDA 4D9TA 2XCKA 1V0BA 4DAWA 2C4GA 5A4QA 5C26A 2ZM4A 3Q9WA 4A4LA 4QMOA 2X0GA 4U3YA 4FSMA 4W9WA 5M4UA 4K0YA 2DUVA 3AC4A 4MNEB 5D12A 1PF8A 4RX8A 4U8ZA 3U6IA 4LL0A 4C58A 2ZB1A 3DK6A 4I93A 2C6DA 4LV5A 4OT6A 1OECA 3U9NA 4G34A 4FKSA 4F1TA 5AA8A 3OTUA 1U46A 4FIIA 4QD6A 5EDQA 2OFVA 2C6OA 1OITA 4BDBA 3A62A 3JXWA 5JKGA 4YJQA 4PX6A 4DCEA 2BRMA 4UALA 4F9CA 5D41A 2PU8A 4FVQA 3R7OA 3D7ZA 4USEA 3B8QA 4QRCA 3DU8A 2NRYA 3MV5A 4GH2A 3WBLA 3D2KA 3P7BA 5FBNC 4I92A 3TZ9A 3UYSA 3NVMB 2PE1A 2WGJA 4L42A 1MRYA 4XJ0A 1ZZLA 3NYVA 4R7HA 4BY9E 3R1SA 1BI7A 5KZ0A 3PXQA 2XEZA 2Z2WA 2YZLA 1P2AA 5J95A 4QMNA 3FAAA 5E1EA 1ZOEA 2WMQA 1X8BA 4FC0A 3MFRA 4O0RA 4ARKA 2YM3A 2Z7QA 1OL6A 4RQVA 5CQUA 3D83A 4XP3A 4DE4A 4QTCA 2VWWA 5AV3A 3VAPA 2YERA 4YJNA 3BHVA 4FK3A 4AT4A 4R78A 4NYEA 3AMBA 3QRTA 4R5YA 2C69A 2GTNA 5LMBA 4I20A 2YM4A 2I6LA 4DG3E 5ICPA 4EORA 5HQ0A 4H58A 3SXSA 3SG8A 2VX3A 5AUWA 1MRUA 4ZOGA 4YTHA 1VYWA 4MBIA 4BTJA 1QCFA 3OCSA 4QMVA 5A4LA 5M51A 2GHGA 2W96B 4RG0A 4BCNA 5LJJA 4YZ9A 4MXOA 5BMMA 3OROA 4GUEA 1P14A 1OB3A 4RX9A 4FNZA 4K11A 4R6VA 3MPMA 3SW4A 1UKIA 4CVAA 4G9RA 3ZTXA 3DA6A 5IISA 2PUIA 3QTUA 1MUOA 1UU8A 3I81A 2ZDUA 3IGGA 2H9VA 2JITA 2J50A 3MJ1A 3UTOA 4Z3VA 1M52A 4AOTA 4U97A 2B54A 4ID7A 3AG9A 4I6QA 4G6LA 3L1SA 4NL0A 3EQIA 3TNHA 3D2IA 3FLNC 4TWNA 2XJ2A 3QRKA 4O84A 2JDSA 1M7NA 3ODYX 4FSRA 3B2TA 3HMMA 5CEOA 4FNXA 5F20A 2HCKA 2WTDA 4R7IA 2QR8A 2QO2A 3M1SA 4RRVA 2CJMA 3MYGA 4FTKA 3FHRA 4FKWA 4EOSA 1U59A 2IN6A 1J91A 2ITWA 3NDMA 4JBQA 3BBWA 3NCZA 4D28A 3UIMA 5F9EA 3UIUA 3IOKA 2CNUA 2Z60A 3FE3A 2J5FA 2GS2A 3SAYA 4HGSA 2IZUA 4WNMA 2X1NA 4C35A 5EQYA 5AR8A 4LOOA 3BYMA 2GMXA 3OXZA 4PMMA 4ZY5A 4BDFA 3MH1A 2VO0A 2WTIA 3MDYA 3V51A 1MQ4A 4I3ZA 4EH5A 4Y8DA 1TKIA 2BHHA 3CGOA 3G5DA 3ZUTA 4TZRA 1OPJA 4G6OA 3QTWA 4DG2E 1PJKA 3N4VA 5IQFA 2C1AA 5DPVA 3TKIA 2A4LA 4C3FA 3BZ3A 2BAQA 4F7NA 2WAJA 2CGUA 1BLXA 2XH5A 1WBNA 3NW6A 4RBLA 4U7ZA 4L6QA 1XHAA 3OHTA 3SG9A 1U54A 2R64A 2WU6A 4OLIA 5EHOA 5IQHA 5AM6A 4CRSA 2ERKA 2Y7JA 2JDRA 4E5BA 4QQCA 1JSVA 4EOPA 4OAUC 2X2KA 2OJJA 5AV0A 5H2UA 2ACXA 3VS4A 4CFXA 3Q4TA 5HE2A 5H9BA 5FXQA 3MVLA 2VTPA 4M12A 5E8SA 4ENXA 3CKWA 2XIYA 1G3NA 1Y8GA 2J6MA 4XX9A 2HY0A 3HGKA 4YNOA 5K3YA 3VBTA 2PUPA 1ZRZA 4HVGA 3R9NA 3F9NA 4IMYA 1WBSA 4DTKA 5AP1A 4CFNA 4EH2A 1PW2A 2XIKA 3ZFXA 1BI8A 4NW5A 4YJUA 5E90A 5KMIA 4GKIA 3OOGA 3SW7A 4UXLA 4QMYA 3F5XA 1BKXA 1DAYA 3LFFA 3TG1A 3UNJA 2DS1A 3E92A 4CRLA 1PXPA 4F1MA 1YXTA 3FQSA 4C4EA 4CGAA 1NVSA 3DLSA 3Q04A 1PXLA 4DEBA 2ETRA 1PXKA 2BKZA 5E8TA 4F08A 3W2CA 2AC3A 5KMOA 4W9XA 4YURA 4FTMA 3GU6A 3P5KA 3G0FA 3I1AA 4PPCA 5CSVA 4X2GA 2OZAB 3ZLSA 4DT8A 3LXKA 4H05A 2J7TA 2Z7LA 2ITVA 2HXQA 4V04A 3DTWA 4BCPA 3PTGA 1TQPA 2WMSA 3PP1A 2OW3A 3LOKA 5A14A 1T46A 4KB8A 3AQVA 5DHJA 2QO7A 5LVLA 5DMZA 5LARA 4OBPA 1HCLA 3QHWA 1YXXA 1KE5A 3FLWA 5C03A 4Y46A 4I5CA 4ERWA 3C1XA 3OVVA 4JQ8A 4C2VA 4EHZA 4EH8A 2GQSA 5M4IA 3UO6A 1XBCA 5AUUA 3FMHA 4C4HA 4WUAA 3QTZA 4CV9A 1ZAOA 3C5UA 1YWRA 4FV7A 3KXNA 2RIOA 2VNWA 3IKAA 4CMTA 3FEGA 3PE1A 2VO7A 1OIRA 3OWJA 4EWQA 1OI9A 2HYYA 3E3BX 4BTMA 5M09A 5KMJA 5J5TA 3GC7A 3QF9A 5CF5A 4YO4A 2C5NA 4NKAA 4IAYA 2VTTA 2JEDA 5I3RA 1S9IA 2PSQA 4CMOA 1RW8A 4IM0A 2XCHA 3IO7A 4XG2A 4U43A 4X0MA 2JKQA 5IA4A 2IZRA 3U55A 2IO6A 4QMSA 3IDPA 5TR6A 4PNIA 2C6MA 2QOHA 3R21A 1Y6AA 2F7XE 3NWWA 4YNEA 5DH3A 4OTRA 3IGOA 3PA5A 2R3NA 1IEPA 3POOA 3S2PA 3FZ1A 4L3JA 3C0GA 1OIUA 3A60A 4O91A 4W8EA 5EI2A 4QMTA 3NX8A 4EH9A 4QQ5A 1Q3DA 1Y57A 4GMYA 4A06A 4GFGA 2X8DA 1YOMA 3PY3A 5CEIA 3ZEPA 4ZZNA 3LFSA 4CSVA 3VUHA 3I60A 4RVMA 3FI3A 3VW6A 1Q8WA 3V04A 2VTJA 1V0OA 3MFTA 4FKVA 1H07A 5BVKA 4BDCA 2BHEA 4HGEA 3QD3A 1NY3A 2RFSA 3CD3A 3IW7A 3L9MA 3Q52A 4V0GA 5D11A 2XM9A 3ULIA 1CTPE 4FI1A 4FX3A 4M84A 3AT2A 2WTKB 3LCSA 4F6WA 3TCPA 3NZ0A 4I5PA 4MQ2A 5CSHA 5L6OA 4CFWA 1FGIA 4RSSA 4TKSA 3W2SA 4AAAA 4IX6A 2OF4A 5L3AA 4BCJA 3KXXA 3L9NA 1DS5A 3AGLA 4AGCA 4FNYA 1PXIA 4GG5A 4JQ7A 4OUCA 1WVYA 4MBJA 5E7RA 4UMRA 1JKTA 2IVTA 4AQCA 4Y95A 3FXWA 3NNUA 2RFEA 4YLKA 3SOAA 3KF7A 4GV1A 4AZEA 4D2TA 2PE0A 3KN6A 3MB7A 2PVMA 3FXXA 4E6DA 5C4KA 5M44A 4FIEA 5AFVA 4NFNA 4EK8A 3FL4A 5HE3A 2QQ7A 3K3JA 3NW7A 4XCUA 3KFAA 3A7HA 3GGFA 5DFPA 4EBWA 3Q4CA 4Y5QA 4I21A 5EH0A 5CU4A 5C8MA 3P23A 2BMCA 4YZCA 5HU3A 4MX9A 1UU7A 4C33A 2PZIA 4HCUA 5GZ8A 4DTAA 5EKNA 2J5EA 3COKA 2YCSA 5KKRB 2CMWA 3MH2A 5CT0A 3VS1A 3NMUF 3R1YA 1E1VA 1SYKA 3LCKA 5DT3A 2Z02A 2OXDA 4MYGA 4E93A 4IAZA 4O7TA 5AP5A 5L4QA 4YHTA 3DBEA 3V5PA 2ZYBA 4IHPA 4NCTA 4O0YA 4BZDA 3V6RA 3Q2MA 3E63A 1R0PA 1FQ1B 2E2BA 4YTFA 1PRYA 3FLYA 5DRDA 4C0TA 4C8BA 4WG5A 5HVYA 4CQGA 4NK9A 3I0QA 1OBGA 2WTCA 2HENA 2J51A 2VWXA 4AZTA 1H1QA 4PL4A 5BVNA 1GJOA 2GNHA 1ZMWA 3BE9A 2XUUA 3R8ZA 4AZSA 2UW6A 2G15A 4OT5A 4ITHA 5IZFA 2QKWB 3L9LA 2HZNA 2XJ0A 3E62A 4JIKA 4L44A 4W4XA 3KRLA 3RVGA 2NNWB 4ZMEA 3EOCA 4OGRA 5JZNA 3D4QA 4XV2A 4KIKA 5DE2A 5LVOA 1WBTA 4RIWB 4E4XA 4GK4A 2YM7A 4RIYA 3IW8A 3SV0A 2W5BA 4DH8A 3GUBA 3HP5A 1PKGA 3ZO2A 1IAJA 3WI6A 5CNNA 2FGIA 3GNIB 4UZHA 4G3DA 3DB8A 2IVUA 1YW2A 1ERKA 2EVAA 2UW0A 2OF2A 3HMPA 2JFLA 3FKLA 4U9AA 3FXZA 4QMMA 5E8VA 2YM8A 3HL7A 4FG7A 3QLGA 3FC1X 3N51A 4OTIA 4GG7A 5DT4A 5IQAA 4D2RA 4QMXA 4FKPA 4O0TA 3HECA 3CY3A 3QKLA 1SVGA 3CS9A 4YZBA 2YACA 4XP0A 5AA9A 5IQBA 1XR1A 3ZO1A 2W1DA 5C1QB 4G9CA 3QUDA 5FDPA 3QCYA 5AMNA 5H8BA 4ZJJA 5TKDA 2R3FA 2EU9A 4FZ6A 4JDIA 4O0VA 3RGFA 4DFLA 4U81A 1B38A 2QG5A 2YDIA 4UBAA 2A27A 5EKOA 4QT1A 3E8NA 5IUIA 2W9ZB 4UWYA 5F1ZA 3VRZA 4EZ3A 4D1ZA 2X9EA 3A4PA 2QVSE 4HVSA 2W4KA 3NNWA 4YJTA 4G17A 4BGHA 3ATSA 5HNGA 4U42A 2BDFA 3L8PA 4FSYA 2BIKB 5B2KA 5FQDC 2AUHA 3P4KA 3RK9A 2H34A 1M2PA 1OL7A 3BGZA 4U80A 3QZGA 3UIXA 2UZBA 4YJRA 4USFA 2VV9A 3QXOA 3GBZA 2BTRA 3OD6X 4WUNA 5IDNA 4ZSLA 3PXFA 3R8UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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