2VTQA

Identification of n-(4-piperidinyl)-4-(2,6-dichlorobenzoylamino)-1h- pyrazole-3-carboxamide (at7519), a novel cyclin dependent kinase inhibitor using fragment-based x-ray crystallography and structure based drug design.
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
298
structure length
274
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Identification of N-(4-Piperidinyl)-4-(2,6-Dichlorobenzoylamino)-1H-Pyrazole-3-Carboxamide (at7519), a Novel Cyclin Dependent Kinase Inhibitor Using Fragment-Based X-Ray Crystallography and Structure Based Drug Design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 274
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2008-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2vtqA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2vtqA01
1Q97A 2WOTA 5KX8A 2R3PA 1UNHA 2UVYA 3DQXA 3K5UA 3MH1A 4IEBA 4N0SA 3DBQA 4X21A 5H9BA 2XKFA 4KABA 4M8TA 5LMAA 5LOHA 2PE2A 3B8QA 5AAGA 2LAVA 4EH5A 3H9FA 5EDPA 5IMXA 3LMIA 4FTKA 3FXWA 4GK2A 5EKOA 1Q3DA 1T45A 4PMSA 4F70A 4FKJA 2VO3A 3POZA 1REKA 1SMHA 3QTUA 3CD3A 1WCCA 3VUKA 4RJ6A 4R7IA 5J9LA 5IQGA 4CCBA 2OXDA 1AGWA 3EB0A 5AP5A 2GQGA 5LCKA 2X39A 2IVVA 4FKUA 4BCKA 5DMZA 4XH6A 3LJ1A 3EKNA 4EOJA 2CN5A 4Q9ZA 3EQFA 4TTHB 1JSVA 4KS8A 2F4JA 5HHWA 1G3NA 3ZSHA 4GRBA 5JFVA 1YXTA 2ZB0A 3VS4A 2P4IA 4XJ0A 3A7HA 3MVMA 2Z02A 3P7BA 3A7GA 4UB7A 5HBEA 4DH1A 3H9OA 4FIGA 4DE4A 3EKKA 5LMKA 2GTMA 4WBOA 5AP1A 3PXFA 2XKEA 4XOYA 3UNKA 2VWUA 3EZRA 2G9XA 4EOQA 3BGQA 1PXMA 4YU2A 4FOCA 3E63A 3F6XA 4PTGA 5HCXA 3HRBA 2JFLA 3PY1A 4BF2A 3LFNA 3R30A 3GC8A 2XM8A 3UPXA 4RFMA 5FD2A 4CZTA 2CPKE 5FEDA 4FL2A 5HVKA 2VTPA 3NUUA 4MQ1A 4IX3A 5HCZA 5EH0A 3MH0A 2BDJA 3LMHA 2GHMA 1PMNA 4BGQA 2VO6A 4D28A 3D7ZA 1WBSA 5CF5A 5IEYA 2OFUA 4FZAB 3LM5A 4XEYA 4G3FA 4BN1A 5AA9A 4MF0A 4BBEA 2JKKA 3Q9ZA 3QALE 3WF7A 4FV3A 4D1ZA 4Z55A 4YTIA 4BCMA 3PJ8A 5AWMA 4JX3A 4XLIA 3HKOA 4AP7A 2BCJA 5IQDA 3H0ZA 1ZRZA 2XNGA 4MWIA 4YO6A 3NAXA 3TXOA 4F4PA 3I5ZA 2F57A 3FMMA 3NW6A 3W2RA 3DTCA 3EFLA 1B39A 4AZWA 5G6VA 1Q5KA 2VTNA 3JXWA 3I60A 4BDCA 4CG8A 2B9JA 1QPJA 2BFXA 2JDRA 3GC9A 3QZIA 3D94A 2IVSA 3H9RA 3LOKA 4JQEA 3FMKA 3MFSA 1Z57A 4HZRA 4C34A 5AUXA 4EOOA 2KULA 2RSVA 1FMKA 3ALNA 4GH2A 4GJ2A 3RWPA 1UV5A 4YO4A 5DFPA 1E9HA 2XK9A 5EKNA 4CMUA 3HGKA 4FX3A 3KFAA 5GJDA 4WRSA 1H07A 5HTCA 4E5AX 4IVAA 5EHOA 1JVPP 5CSXA 4ZY4A 2DUVA 5AP3A 5FM3A 2QU5A 4YR8A 4H58A 4PPAA 3HV5A 3HLLA 5M51A 1QPCA 4BTKA 2YIXA 2BILB 4PNKA 4WO5A 2B9IA 4CZUA 3JY0A 3W33A 5C8NA 3DLZA 3FQHA 4FSWA 2QOCA 5LARA 5AAEA 3DKOA 2UW9A 3PA5A 5I9XA 4C33A 2WELA 3KY2A 4CFNA 3ZM4A 3F5UA 3BWJA 4C61A 2X7GA 5BVWA 4BBFA 3P7CA 4UWBA 3OW3A 4G31A 4AE6A 5AADA 1V0PA 4FOBA 3BE9A 4DH8A 4EOIA 1OIQA 5L8KA 2P55A 5HNBA 2C3LA 2ITYA 2V22A 4EC8A 4F0GA 1ZMVA 5DT0A 2BHHA 4NUSA 3VVHA 5CEOA 1RE8A 1IASA 2X81A 3QRKA 4DLJA 1YDRE 4FT3A 3TZMA 4KB8A 3KXZA 3PJ2A 3CBLA 1R0PA 3HNGA 1L3RE 1DS5A 2HY0A 4A07A 4BKYA 4X7QA 1OIYA 3LQ5A 3KXXA 4X2KA 5AX9A 5DG5A 3O7LD 1VYWA 3ACJA 3C9WA 3PG3A 3BI6A 4QD6A 4LGGA 5CALA 3GGFA 3CP9A 3MIYA 1HCKA 4AU8A 4RX8A 2PVJA 5AMNA 4FC0A 2Y9QA 3F9NA 4O7TA 4QMVA 2HYYA 2OG8A 2YM7A 4CFMA 5ETCA 2ZMDA 3PJ1A 2RKUA 3SAYA 5ANGA 5H8GA 3PP1A 1YW2A 5DPVA 2ITVA 2Z60A 5M55A 2AYPA 2HWPA 5E1EA 3V8TA 1ZYSA 3CLYA 4O7VA 4GT5A 1V1KA 4G16A 4L68A 5AUVA 5AP7A 4DLIA 4U6RA 4W4VA 1BYGA 5FDPA 2PSQA 1ZARA 4A06A 2BIYA 4C4FA 2F7XE 1ZYLA 3CCNA 5D9HA 3CR0A 3COKA 3ORTA 5J8IA 3ZUVA 1R1WA 5ACKA 1PXOA 2UV2A 2XBJA 3F3UA 4GEOA 2R5TA 4S34A 4FTUA 2I1MA 4HGLA 1KE5A 4MQ2A 2WZJA 3HMIA 4XV2A 3BU3A 4XUFA 4IM0A 4I0RA 2CKQA 4C37A 4HVSA 4BDJA 2CDZA 3OEFX 4W4WA 4WD5A 1NA7A 5E90A 3VS5A 4E6QA 4D2VA 3NIEA 5KKRC 2ITPA 2NO3A 3NPCA 4R78A 2C3IB 2E9NA 4KSQA 3DAEA 2QO7A 3BHUA 4D58A 2WMXA 4F99A 5TT7A 4UYAA 3I4BA 4ACMA 3ORNA 2W1ZA 4G5JA 5JFSA 2YCFA 4RVKA 1AD5A 5DR2A 3TJCA 4Q2AA 3UOHA 4OT6A 1E1VA 3GI3A 2C6OA 5AAFA 4CEGA 4BTFA 3BYVA 4XV9A 4OUCA 3WBLA 1JKKA 5I9UA 4O91A 4MEDA 2VTTA 3DFAA 3HMPA 3SV0A 2OXXA 1XHAA 2OGVA 2QOOA 5FGKA 4EOLA 2YWVA 2RGPA 3PPJA 1OUKA 3QUDA 5F4NA 2P2IA 5KO1A 3I7CA 1VZOA 5AR3A 2VWYA 4QP7A 2YWPA 3NVMB 2JKMA 4C35A 3ZO4A 5FP5A 5HVYA 2NP8A 4P5ZA 4KS7A 4PWNA 2XZSA 1XH7A 4JRVA 1UNLA 3CXWA 2NNWB 5TKDA 1P4FA 1OIUA 4K2RA 4MVFA 1YOMA 3R28A 4BI0A 2HK5A 2R9SA 4FV6A 4CFFA 2HENA 4J97A 2XK8A 3K54A 4I22A 5A4EA 4ZJJA 2UZOA 2VX3A 3KU2A 3ZONA 4HNFA 3BU6A 5CXHA 1OKWA 4BYJA 2FB8A 3L1SA 2H96A 4DFUA 3UOKA 4TYIA 3TUCA 3IOKA 3NUAA 4JT3A 4OR5A 2V7OA 2C5VA 3ZO1A 2C3JA 2C5NA 3CS9A 5A6NA 5CAUA 5KUPA 4IC7A 2VTJA 4FNXA 4TYGA 4IZAA 4FEQA 3WIGA 3W8LA 5FDXA 3IONA 3IECA 5FEEA 4FTJA 4D5HA 4DAWA 4RZWA 3PVWA 4DG3E 1GZOA 5J87A 4EKLA 4FZ6A 3R1SA 4FIJA 4FKQA 4GU9A 5DEYA 4BKZA 1X8BA 4G9RA 4XG4A 3KMWA 2J5EA 4I5PA 3A61A 2E9PA 2QR8A 3PIZA 4FGBA 5L2IA 2CCHA 1JSUA 4RWLA 3GC7A 2QOQA 4K6ZA 4BVUA 4R7HA 4FZ7A 4YBJA 4UMPA 5JFWA 3CSVA 4PDYA 3ODZX 5KMJA 5DOSA 4F08A 3A7FA 3C0IA 2ZYBA 4QYFA 2R3RA 1DAYA 2X7OA 5HQ0A 3FPQA 4XMOA 3EN9A 2GMXA 3DDPA 2XNMA 4W9XA 2CGWA 1YOLA 5DR6A 3WZJA 3ZHPC 2IJMA 3MTLA 3VS0A 3WF9A 5HU9A 3GUBA 2WEVA 3D5WA 3I5NA 3LJ0A 4AXAA 3GB2A 5GZAA 3C0HA 5FBNC 4C7TA 3GU7A 1R0EA 4CGAA 4DFYA 4YJSA 4PMPA 1GJOA 2WB8A 3Q32A 3EN4A 2CKOA 3LFCA 5FQDC 4QQJA 2Y6OA 3NAYA 3AC4A 3KVXA 4Z9LA 4ITHA 4U3YA 4ID7A 4IX6A 4L01A 3KC3A 4QYEA 3U4UA 5E91A 3LW0A 3P9JA 3O50A 3MFTA 2FVDA 2XK3A 4IIRA 4GJ3A 3V3VA 5EYDA 4KIOA 4QTEA 2ZVAA 2BRGA 5D1JA 5DVRA 2OIDA 4OTPA 4B7TA 4WA9A 4YLKA 4ZS4A 3I1AA 4TXCA 4AAAA 4IVDA 2R0UA 2UW7A 3UC3A 5GZ8A 4DTAA 5EYKA 3OW4A 1STCE 5JFXA 2VD5A 2CKPA 2B1PA 1U5RA 4M12A 5HG7A 4CQEA 3UQFA 3LLAA 3LJ2A 4PL4A 3NUYA 3GU8A 3P4KA 2QKWB 4LI5A 1KUTA 4AOJA 4DGMA 3IK3A 4FNZA 3ORMA 4ZTQA 3UVQA 4QP3A 4XRLA 4J52A 3EYHA 2XNPA 3JVRA 4LOQA 4ALWA 2HIWA 2WTKC 4RJ7A 3WARA 5KMKA 3FC1X 5CU6A 3BBWA 5AV3A 4LFIA 3UIXA 2QD9A 3QWKA 3RKBA 2CNQA 3V5PA 4QQ5A 3KF7A 5K5NA 4IHPA 5AP0A 3WZKA 1PXIA 3QRJA 3C4CA 4EKKA 1XKKA 4I6QA 4OW8A 4CV9A 4RC2A 1G8AA 1M14A 5BX0A 2VNYA 1PHKA 2ESMA 4GVAA 1JBPE 2FGIA 4ZTNA 1BL6A 4IWQA 4FSZA 4UWYA 3R7YA 5HBJA 4H05A 2WMWA 1URCA 1ZOGA 3ZFYA 2UVZA 5L8JA 4QMPA 1ZXEA 4G3DA 4MD8E 4YTHA 3L9NA 4HGSA 4PF4A 4W4XA 4F09A 3BGPA 2ERZE 3EQBA 2GS7A 2XJ1A 3KB7A 4K9YA 3MB7A 3OY1A 3PA4A 4ZP5A 4B0GA 1ZOEA 4GIHA 5CSWA 1P5EA 3IW6A 3E7VA 5CZHA 3AT2A 2ZV2A 4QMTA 4JQ8A 4XS2A 3SW7A 3VQHA 4R77A 4FVPA 3PY3A 5D11A 3H4JA 3UP7A 4HOKA 3TG1A 3R71A 2XK6A 3RBWA 4EH6A 4JLCA 4FKRA 3E62A 4ZLOA 5BYYA 3FYJX 4WNKA 3LAUA 4ZTSA 2X2MA 5AUUA 4LGHA 5CNOA 4CFUA 4NT4A 4AT5A 3QTWA 4IB3A 5CSVA 1ZYCA 5I3OA 2BHEA 3PSDA 3LCKA 4MD7E 2XIXA 2UW6A 3A2CA 3DKFA 4RIOA 3KRLA 3G9NA 4FSNA 4EZ3A 5ANDA 3OXZA 2XCHA 3TNQB 4O7RA 2XNOA 3W1FA 3RI1A 5JKGA 3V5JA 3P78A 4OTWA 2ACXA 4XG8A 5AV1A 2QG5A 4O7ZA 3OWKA 4I20A 4E6CA 2F49A 2WHBA 3SX9A 3M11A 5M4FA 3CJFA 1H1RA 5EYCA 1W84A 4GCJA 5HLWA 4JX7A 2PVFA 3EN5A 5IF1A 3TI1A 1XJDA 2W17A 3IW7A 5DA3A 4PP7A 3FZRA 5AP4A 3QA0A 1GOLA 3QQJA 4J98A 3ULZA 5CU2A 3W2SA 5ETAA 3LCOA 1M2PA 3K5VA 2JD5A 2GNFA 1OL1A 3TNWA 4WNMA 3BLRA 1UWHA 3KCFA 5CEMA 3BV2A 3Q6WA 4XG3A 5IZFA 3IGOA 3L9MA 1UKHA 1XBBA 3U6IA 2Q0BA 3FXZA 5C1QB 4CYJA 3ZM9A 4ZSJA 3AOXA 3NEWA 3FLQA 5A4CA 3VS2A 4PL3A 4NZWB 3FZOA 3NUNA 5C4LA 4TW9A 2C4GA 3ZRMA 4EUTA 4RC3A 2A2AA 1H26A 3HMOA 3DS6A 5HG8A 4BCQA 4DEDA 3EH9A 3VUDA 4RJ3A 5A6OA 3SG9A 3WF5A 5HO8A 3GCPA 5CEKA 2R3GA 3CEKA 2R3HA 4G17A 4LGDA 2ZJWA 4A9RA 2P33A 1JKLA 3HECA 4B6LA 3ATTA 2YCQA 2PUNA 4NM3A 4FKTA 3F3WA 4I6BA 3O7LB 3BV3A 1WMKA 3UBDA 3ZO3A 4O82A 2R64A 4MD9E 4X2FA 5CU4A 3UQGA 3Q5ZA 1QMZA 4O1OA 4CLJA 3FKLA 2QVSE 4CQGA 3MH2A 4RPVA 5ANJA 1YOJA 4Y8DA 3SLSA 4AACA 1SM2A 4YC8A 2ITZA 5JZJA 3ULIA 5K3YA 1JKSA 2GFSA 5E4HA 3EN6A 1ERKA 5CU3A 3PSBA 4C58A 3DAKA 4Q5EA 1TKIA 2PK9A 4M66A 2X8DA 4QMWA 3I6UA 3PIYA 5BVDA 5CSPA 2XB7A 5I9VA 3V5TA 2W99B 3F5PA 2Z7SA 4ZZOA 4HVIA 3E3PA 2X9EA 1Y8YA 4LOPA 4LL5A 3D9VA 1Q8WA 4WG3A 3TIZA 4CVAA 4DA5A 1FVRA 3OFMA 3TDVA 2XK7A 4KBAA 2ZV8A 2O64A 1K9AA 2OKRA 3D0EA 2CJMA 3UYTA 2UZUE 3AC8A 3TTJA 4EBVA 3NYVA 1GY3A 3AMYA 5HO6A 5HE1A 4AZEA 4L7SA 3KMUA 4QMLA 4IWDA 1OPLA 3COMA 4LL0A 4G2FA 4IWPA 2C6EA 4G6NA 5G1XA 4BCOA 2CHLA 1OBDA 5KNJA 2PE0A 4XRJA 3ZSIA 5AV4A 4UX9A 5EW8A 2YITA 3QBNA 4HVDA 3P86A 3PY0A 5AFVA 2X6EA 2YZAA 4M84A 4QMQA 4ALUA 4R5YA 2YAAA 4LV5A 5JGAA 4BI1A 5IQCA 3KRWA 2ITNA 1O6LA 3C7QA 3JYAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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