2VTTA

Identification of n-(4-piperidinyl)-4-(2,6-dichlorobenzoylamino)-1h- pyrazole-3-carboxamide (at7519), a novel cyclin dependent kinase inhibitor using fragment-based x-ray crystallography and structure based drug design.
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
298
structure length
272
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKITAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Identification of N-(4-Piperidinyl)-4-(2,6-Dichlorobenzoylamino)-1H-Pyrazole-3-Carboxamide (at7519), a Novel Cyclin Dependent Kinase Inhibitor Using Fragment-Based X-Ray Crystallography and Structure Based Drug Design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 272
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2008-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2vttA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2vttA01
5BX0A 1J1CA 3L9NA 2HENA 4EH4A 5K0KA 3MA6A 4IM3A 3TJDA 4EORA 2QLQA 1FMKA 4GJ3A 5A54A 3AC2A 5AJQA 3FQHA 5CU3A 4HZRA 4WUAA 1PKDA 3EH9A 1NVQA 2V7OA 3IKAA 4HW7A 5BQ0A 2QNJA 3Q60A 5JN2A 3LIJA 4YHJA 1QPDA 5BVWA 2NNWB 2WTKC 3CC6A 3LJ0A 3R9NA 4AGUA 2FH9A 4IFCA 2XUUA 3ZU7A 2DUVA 4K0YA 2PL0A 3RP9A 5GIPE 4X3FC 4RZVA 2DS1A 2HELA 4F6WA 3OWLA 4XLVA 4U79A 4DBNA 4G3DA 2RKUA 2YJSA 3FC2A 4O1OA 4O7NA 3Q32A 2W06A 4F9BA 4G9RA 4BHZA 3WE8A 4KKHA 4GSBA 2C1BA 5AUTA 3OVVA 2OXYA 3DJ6A 4O0VA 4PP7A 1W84A 4AU8A 4BGQA 2YDIA 5ANKA 3FLYA 1AQ1A 2J0IA 2QOOA 5AP2A 5FBNC 4BDJA 2GTMA 4D2WA 1OKVA 2V55A 4FT9A 5FGKA 5C8KA 3EFKA 2XBAA 4KABA 3TIZA 4NWMA 3LM5A 4BKZA 1O6KA 3GC0A 4IFGA 3UQFA 4GVJA 4HGLA 1BKXA 4XYFA 4AFEA 2OJFE 2YIWA 4QT1A 2BDWA 5G6VA 1UV5A 4O2ZA 2OW3A 4IAZA 1R39A 2BRHA 3R21A 3UC3A 1JSUA 2FSMX 5HLNA 2ITNA 4WHZA 4RQKA 3FY2A 3ZHPC 2R3NA 4AP7A 1YXXA 4TWOA 3PXYA 4ZZOA 4FGRA 3HGKA 5IMXA 5K5XA 1XBBA 4XHKB 4BDDA 2HZNA 2ZB0A 3DNEA 2QO9A 4OTHA 4Y5QA 1OKYA 3I60A 4FV8A 4UBAA 2GFSA 4GK4A 3GQIA 5ACBC 3TKIA 4BZDA 2OJGA 3KN5A 4JT3A 5CAUA 3A7GA 4LUDA 4HCVA 4CYIA 3TNPC 4GG7A 3II5A 4PNKA 1R78A 4CGAA 4CTCA 2R3RA 4AG8A 3A2CA 1YXUA 3MS9A 4ZXTA 4RC2A 5L6OA 1JSTA 4RJ5A 4DLIA 3VVHA 4FT3A 2J0JA 3UGCA 2CHLA 3ALOA 2OG8A 3CJGA 3LFQA 5E92A 3ORPA 4AF3A 3G2FA 2WTJA 3D2KA 3OT3A 3CQWA 5IA4A 3D94A 3FMKA 3PIZA 4DFUA 5KMNA 5KO1A 1SNXA 3LXPA 1UU3A 4X2KA 4USFA 3RKBA 4RFYA 5FM2A 2B1PA 3U6HA 4X2GA 4I4FA 3BZ3A 4H3QA 2XRWA 4FV0A 3ZRLA 3ZUVA 3O23A 2UW5A 4ANQA 3LMGA 4BKYA 1TKIA 3HV4A 3TUCA 3V6SA 2EXEA 3LAUA 2O2UA 2WMBA 4TPTA 5KKRC 4P5QA 4L9IA 3EKNA 1YQJA 4TYGA 4FTQA 4FV6A 1JPAA 3OUNB 3O17A 4LOQA 4C38A 3WZDA 2OF4A 4FV5A 4OTWA 3QQFA 4GUEA 4YSMA 2XIZA 4ANLA 3H0ZA 2P2IA 2VWXA 5E8UA 3ZLYA 1UWJA 3S95A 3OBJA 3EQGA 5D1JA 3POZA 3E3BX 4X2NA 4WT6A 1NVRA 5ETCA 3UG1A 3WF9A 3ORNA 5K9IA 4LUEA 4EHVA 2RFEA 2R3FA 3KRJA 2XKFA 3WI6A 3Q96A 5L3AA 3DAEA 2O65A 1NW1A 3BPRA 3MDYA 3U9CA 3F69A 2XKEA 3OTUA 2WPAA 4ZTHA 3R00A 4DA5A 3QQHA 4EZ5A 3LCTA 4DITA 1GNGA 4D4VA 3UYSA 5H8BA 3WZUA 3WZEA 3MA3A 4FV4A 4C7TA 4ZEGA 3MPAA 2C6LA 2BIKB 4IC7A 5EHYA 5ETIA 3OS3A 2Z2WA 3B8QA 4LOOA 2Y4IB 4R5YA 3NW5A 5JRSA 3ETAA 3NWWA 4IM0A 4F0FA 1Z5MA 3QZGA 4OUCA 3NUNA 3UO4A 5DH3A 3D4QA 5IUHA 2IVTA 5L2TA 2JIIA 4FICA 5AMNA 5CT7A 1OUYA 4Q2AA 4BCFA 1IASA 3CY3A 3HMOA 1W83A 5GZ9A 4E26A 4W4WA 4CLIA 3UQGA 3OOMA 4L3LA 3QWKA 5HIBA 5HI2A 5I5ZA 3AT3A 1RDQE 5EM8A 3TNQB 4QMXA 3L8VA 4CT2A 2XS0A 3QKMA 5KMMA 4IX4A 4EHGA 2BPMA 4FKLA 3BYUA 4BZOA 4D58A 3AC8A 2YM4A 3NAYA 2YZAA 3R0TA 4AA0A 4ZLZA 2EWAA 5FWKK 3VBQA 2OH0E 3UVRA 4O7ZA 4CKIA 3O50A 4Y72A 4CQEA 2WTDA 2UW7A 2ZM3A 3LM0A 3QHWA 5JFWA 5M53A 3S00A 3AT4A 1Q8ZA 1ZOHA 3LCSA 4ZLYA 3AD6A 3C4FA 3D83A 3LJ2A 2BVAA 2J0KA 4Z7HA 4M69B 2PWLA 4CFXA 3DU8A 4DFLA 1YI4A 2C6KA 4C61A 4YZCA 4LRKA 5GJFA 3H0YA 4XRJA 1UU8A 2JAVA 2WTKB 4ZY4A 4H58A 4ALVA 5I9WA 4X3FB 4GCJA 5AX9A 3OZ6A 3HUBA 4AGDA 4E6CA 2P2HA 2YIRA 2JDSA 4JRVA 3ET7A 2PYWA 4IWPA 3QCQA 1U59A 2YIYA 3KK9A 5HIDA 1M2RA 2WMVA 3OF0A 4K2RA 4JX7A 4FEQA 4RJ3A 4AZWA 3G15A 3U6JA 3F88A 3P4KA 5JGDA 3NEWA 2VNWA 3UOKA 3V8SA 3A7IA 4I94A 5AUYA 3GC9A 2BKZA 3NCZA 3F3VA 4YPDA 3SHEA 5DOSA 3R22A 2ITTA 3R9OA 4XOYA 3ZC5A 3ATTA 2OI4X 3FLQA 2BZJA 4FK6A 4BCJA 3CTJA 4RQVA 3DJ5A 4E6QA 4IB3A 3R8MA 4IAYA 3QTRA 2R3HA 2C6DA 3QLGA 5IZFA 4I0SA 4DT8A 4X6QC 5AADA 2ERZE 4UB7A 3ZLXA 2X6EA 3QTZA 3REPA 4AW2A 2FA2A 4MEDA 1HCLA 5I9UA 3TTJA 3D7TA 2X9EA 3EN4A 3PZHA 4IH8A 4QTEA 5KZ0A 4FL3A 5KNJA 2WMRA 4U3ZA 2H9VA 3GCSA 4I3ZA 4EK6A 5H9BA 3UQCA 1Q41A 1JKSA 4F99A 5AA9A 4G3FA 4IAFA 3IOPA 4D1SA 2XIXA 5HD7A 3PSBA 5IA0A 2O3PA 5K4IA 2BZKB 5M07A 4BY9E 2HY0A 3NSZA 3KVWA 3BIZA 4TRLA 4MVFA 2W1EA 5EOBA 4I5HA 5AUWA 4O84A 5FTOA 2Q0NA 3D14A 4BWPA 2R3JA 4BKJA 4BYIA 2ITPA 2XMYA 4XG8A 2UZUE 5EQEA 3CKXA 3UPXA 4D2PA 1ZMWA 4A07A 4EZ7A 5EW3A 4A9YA 4ZTNA 3P79A 2I40A 4QMQA 1QL6A 2X2MA 1PMUA 4GFGA 3PLSA 5BMSA 3ZBFA 3FMLA 3F2NA 3SOCA 4O7TA 3C5UA 4FYNA 4IX3A 4PWNA 5A4EA 3P1AA 1BL7A 4GEOA 2Z7QA 3MFTA 4YC3A 4DG0E 5KKRB 5DGZA 5C8MA 3VS1A 3RAIA 3HVCA 5HTIA 4YJSA 4JLCA 3ZEPA 4HVSA 1S9JA 3H30A 3QYZA 3ALNA 3FMHA 2B4SB 3R7YA 4ZJIA 5LMBA 3NMUF 3MVHA 4I21A 3H9RA 1STCE 4M0ZA 4DAWA 1OBDA 4GKHA 4MCVA 1CKPA 2XNPA 1KSWA 3OW4A 2VWYA 1ZWSA 4HYHA 3EMGA 2YM5A 3A61A 4KIKB 4ZY6A 4F08A 3BRBA 4WNKA 2XP2A 1YWVA 3BU5A 4UWBA 4BIBA 3JS2A 1HOWA 3FHRA 3HRFA 4YZBA 5L8KA 2X7OA 2UVZA 2BR1A 2P33A 3PG1A 4FYOA 1BI8A 4EUUA 3NUAA 3EIDA 4M13A 4ZLOA 4RFZA 4E8AA 4F0GA 4R7HA 4JBOA 3R71A 1SVGA 1WVWA 4ITIA 4FI1A 3UVQA 4D4RA 2FSTX 2ITOA 4NM5A 3WOWA 4H05A 4R5SA 1YDRE 5BVEA 5HZNA 4EC9A 3MGYA 5HICA 4MQ1A 2W17A 4GJ2A 4O0YA 4RVLA 4OW8A 2G01A 4ZP5A 3I1AA 5M09A 3UO5A 5H8GA 4ACDA 4FE2A 4FVPA 2W96B 4AW0A 4CV8A 4XG4A 2WMSA 4W9XA 1GOLA 2R3QA 3TKUA 1OKWA 1M52A 2FYSA 3FYJX 4FSTA 2WELA 2WXVA 5IQCA 4BI0A 3RWPA 5DHJA 3EQCA 1QCFA 5AEPA 4RIYB 3RK5A 4PDYA 3MTFA 3JUHA 3MVJA 4V01A 5I9XA 3HUCA 5D11A 4JG7A 4LV5A 3SD0A 2Y6MA 3PJ8A 3UZPA 4RIYA 3QQUA 3R8PA 4FSMA 4RVTA 5EFQA 5A14A 4MKCA 3HZTA 1XJDA 3RI1A 4DH5A 3KXNA 3L8XA 4OBPA 2P3GX 4XP3A 3V5TA 3AT2A 2YA9A 3Q5IA 3F3ZA 4FIGA 2UVXA 4PPAA 2OXXA 4WIHA 3DK7A 5H2UA 2PVFA 3DY7A 4HYIA 4NKSA 5C8NA 1KUTA 5IQIA 3BBWA 2W05A 2GNGA 4OR5A 3QYWA 3E8DA 3NS9A 2X39A 4FF8A 2A0CX 3G6GA 4FV1A 4X2FA 4I22A 3AC3A 3W2RA 3EQFA 5F94A 4A9RA 3SG8A 2FB8A 2JC6A 2W4OA 3O71A 4B8MA 5AP4A 3R8VA 1XKKA 4U81A 1GZKA 3BHUA 5DEWA 4KUJA 4FNZA 2BFYA 2F2CB 4FTKA 4KRCA 4IE9A 3R6XA 2UW0A 1PXJA 3G0EA 2UZNA 4D2TA 1YDSE 5HO8A 4FKQA 1YOMA 2ONLA 2QU6A 5ANEA 4E5BA 4EYMA 1FOTA 4FTOA 4FKTA 3TDWA 4XX9A 4YJVA 3LFAA 2VTHA 3I0OA 1BUHA 2WD1A 3EFLA 3UMXA 4BCKA 3EQPA 5HX6A 5LQFA 3BKBA 3QLFA 2WIHA 3D5VA 3PIYA 3P78A 3RNYA 3LW0A 5IQDA 2AUHA 3QZIA 3CEKA 1IA8A 4ZSGA 3QRTA 4EJNA 5KCVA 3HMIA 5HO7A 2RG5A 3Q9XA 4YZ9A 5DEYA 4QQTA 4RIXA 5DFPA 2ZOQA 2W9ZB 4FZ7A 5GZ8A 3IGOA 1GIJA 4K1BA 4E1ZA 3R2YA 4FT7A 3KL8A 2I0EA 5CX9A 4DGNA 1OL6A 2XNEA 4HNFA 4Q9SA 4C57A 2F9GA 4IXPA 2QVSE 5L6PA 3N51A 1QPCA 4FSRA 5CANA 4JJRA 2XH5A 3HX4A 3W55A 4W8DA 2IZSA 2XCKA 3UO6A 4F64A 3CPCA 3FLNC 3DB6A 1EH4A 3EZRA 3PXQA 3KEXA 5DG5A 3RAWA 3PRIA 3WF6A 4AOIA 5AUUA 3I4BA 4QYFA 3LQ3A 4PUZA 2OFVA 3PXKA 4A9UA 4BWKA 3NIEA 3S3IA 1XH9A 5I9VA 2OSCA 4FIJA 4ASEA 1MP8A 4FV3A 4H36A 5IQEA 5E9EA 3PXFA 4E4XA 4O7YA 2HYYA 3O2MA 4YU2A 4M97A 4EI4A 2F49A 3K3IA 3QCXA 4IJPA 3A4PA 3IG7A 2UW9A 4M3QA 4IVBA 3RHXA 4NM3A 5LMKA 2PUNA 4IAAA 3SV0A 4D1XA 2W1CA 4A9TA 5HE3A 4DGOA 5C9CA 4WD5A 4UXQA 3SXRA 2UZOA 2BALA 4FVQA 3PP1A 1WVXA 4RWIA 1OM1A 3KULA 3QQJA 4JXFA 5JSMA 3QQKA 4L45A 3MB7A 4ENXA 1OMWA 1PXNA 3OFMA 2ITUA 1R3CA 1Z9XA 4RIWB 3VUIA 2GNIA 3FXWA 2UW6A 2VNYA 4BDAA 4O27B 4S34A 5IDNA 3LOKA 4FTJA 3UDBA 4O0RA 2CGWA 3FYKX 3K3JA 5EK7A 2BUJA 4D9UA 5KMLA 5LVPA 5E4HA 1ZOGA 4OGRA 4K8AA 4Q9ZA 4C4HA 5HESA 3UTOA 5HTCA 2C6OA 1OL1A 3BEGA 4PRJA 2GU8A 2UZLA 1JKLA 4G16A 4NU1A 4EOJA 4ZS0A 3KA0A 3NVKI 2XNGA 4XJ0A 4BWXA 3I7BA 2R3MA 2YFXA 2OGVA 4GMYA 1BL6A 3NYOA 4TYHB 3DK3A 4S30A 3CS9A 1E9HA 4S31A 4MWIA 5BVDA 3FY0A 3OT8A 3QKLA 1YI6A 2ZV8A 3PPKA 3DFCB 2O8YA 2OIBA 4RLKA 4YLLA 3A62A 2P4IA 3BE2A 3F7WA 1OL2A 3QHRA 4AWIA 4XV1A 3O8PA 4RPVA 5GJGA 3ZDIA 1CKJA 3JY9A 4BR3A 4FT0A 4IX5A 3OG7A 2BRMA 2CGXA 4H1MA 4CSVA 4QP4A 3EQDA 4P5ZA 4FKRA 3NW6A 1QPEA 4JI9A 3QGYA 1ZY4A 3R7EA 4Z16A 5J87A 1UNGA 4JAIA 3NW7A 4RX9A 4MXYA 1MRUA 3TACA 4B99A 2C4GA 2ZAZA 4CZTA 5KMIA 3E88A 2JITA 3E7OA 4DEHA 3SC1A 3AMYA 4BF2A 1WBWA 2H96A 4MH7A 3V01A 2H34A 4YJOA 3NNWA 4ZY5A 3DLZA 2IVUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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