2VZ6A

Structure of human calcium calmodulin dependent protein kinase type ii alpha (camk2a) in complex with indirubin e804
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
293
structure length
291
Chain Sequence
LYFQSMYQLFEELGKFSVVRRCVKVLAGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQILEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGAAVKLADFGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEALKHPWISHRSTVASCMHRQETVDCLKKFNARRKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of the Camkiidelta/Calmodulin Complex Reveals the Molecular Mechanism of Camkii Kinase Activation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CALCIUM CALMODULIN DEPENDENT PROTEIN KINASE TYPE II ALPHA CH
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 101
structure length 291
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2008-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2vz6A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2vz6A01
1OVEA 2PZIA 3MW1A 5E8UA 2RF9A 3DDPA 5M09A 3LVPA 3MYGA 4GL9A 3A2CA 2ZM3A 5KMLA 2X7GA 1JKSA 3KRRA 4QPMA 4CKIA 5HVYA 4GJ2A 2QURA 3HEGA 2OK1A 4FV8A 2WPAA 3TXOA 3UODA 3SAYA 5CEIA 3V5PA 3GCUA 5JGBA 4FTMA 2J51A 2RSVA 5L8LA 1Q24A 2C1AA 3QCXA 4U81A 2O8YA 3UVPA 4PDYA 4CGAA 1PMVA 4IVBA 5DPVA 3U55A 5HX8A 4FL2A 4NW5A 3R8LA 4IH8A 2C5NA 1CM8A 3Q9WA 2WTKC 4M7IA 3TNWA 1H00A 3ZXZA 2VNYA 4KBKA 2Z7SA 3IW5A 1F5QA 3KMUA 4PL4A 5I9ZA 2GS2A 4RFYA 3UO6A 4O84A 5C4KA 4IB0A 3PG3A 4LGHA 2OJ9A 4KIPA 4XG8A 5LVPA 1RQQA 2QOIA 2VTRA 4BR3A 3DCVA 2UZLA 2ZV2A 1H27A 3HRBA 4I21A 4OT5A 5LVMA 5IMXA 3ZM9A 3CD8A 2BHEA 4PRJA 3FHRA 3KC3A 4L6QA 3FZTA 4G3CA 3RHXA 1WFCA 2X2LA 3QTWA 4FKWA 3LQ3A 4JDHA 3GGFA 5GIPE 4AS0A 5DT4A 2ZB1A 3VQUA 4EORA 4XG7A 1UNHA 4JG8A 4FK6A 5L2WA 5E9EA 3E93A 3FZPA 3UVQA 4FC0A 1YRPA 2RFSA 3KVWA 3PVBA 2VO0A 2VTNA 3FWQA 2WQMA 2Y4IC 3OCBA 4CEGA 2QOKA 4CVAA 4J99A 2BAJA 2R3QA 3D7ZA 1WBTA 3AD6A 3BYVA 2ETMA 3ORKA 3R7VA 3ZTXA 3P4KA 4BWPA 1Q61A 4HVIA 2QO9A 3R1SA 4RG0A 1TQMA 5EOBA 5M56A 4ENXA 2QHMA 4YSMA 4BCJA 4L67A 4FSNA 4FZDB 3PVWA 2UZWE 2BR1A 4EH9A 4DEHA 2JGZA 3BHUA 3G0FA 4O0YA 3ZEPA 4B8LA 5CI6A 3MB6A 3UG2A 4W8DA 3VJNA 3FE3A 3BBWA 3L9LA 2X4ZA 3FI8A 5IQHA 1NXKA 4TWNA 3ZXTA 3C5IA 4ZTSA 3TKUA 3F66A 2UW5A 2E9VA 3EN9A 4ZSJA 3V51A 5HVKA 4GFGA 1FVRA 3VHEA 4LUDA 2WMSA 3AC2A 4WIHA 3F3TA 4OTFA 2IW8A 1PMNA 3ETAA 5KE0A 4JIAA 3DAEA 4JVGA 5CU4A 4RA5A 4C4EA 3NYVA 3H9RA 4IVDA 4GCJA 2BDWA 1KE8A 4JIKA 3VS2A 5HTBA 1HCKA 3REPA 4GVAA 5C03A 4OGRA 2C3LA 3W18A 4CKJA 4D0XA 2ZDTA 3A8XA 2XBJA 5EI8A 3RAWA 3E62A 3A61A 3AC8A 3PA4A 3RAIA 4C3RA 4KUJA 2I0VA 1MUOA 5I3OA 2X2MA 3O0GA 3UE4A 4YURA 4IC8A 4LYNA 3R63A 3HAVA 3UMWA 3QXPA 2VX0A 3L9NA 4IWPA 1L8TA 1GJOA 4G3FA 2WMRA 5EDRA 4F7SA 3ZZWA 4DFXE 2I1MA 5IKWA 3ULIA 4ZSLA 3MJ2A 4GW8A 2YM6A 3UIBA 1BUHA 1R0EA 2H9VA 3R7GA 1OM1A 2E9UA 3COHA 4BGGA 4A4XA 4F7JA 2PE0A 2G2IA 4ACHA 3TNIA 2J9MA 1HOWA 1ZMWA 2QOHA 4U41A 5KHXA 2YDKA 4HYSA 4FSWA 4I6FA 4YGAA 3SW4A 3AGMA 4ANBA 2XK9A 3QUDA 5IEYA 4OTIA 3BGPA 4GFOA 4AW5A 4BZOA 1PXJA 2OF4A 3FZSA 3Q04A 4N0SA 4UYNA 4B4LA 3H9FA 4U40A 4HGEA 5E92A 2W1CA 5TOZA 3UTOA 1CDKA 1VYWA 4Y85A 3OG7A 3BQRA 4NH1A 4BF2A 2NRUA 4IEBA 2C5YA 3UBDA 2PMOX 4EK3A 4ZXTA 3OCGA 1UKIA 4FVQA 1XH9A 1UA2A 2W1FA 2AC3A 2ESMA 3NIEA 3RK7A 4B99A 5KBQA 2OW3A 5HE2A 4PMTA 5C26A 5KUPA 3DZQA 3AMAA 2P3GX 5HEZA 3KRJA 3NW7A 2KULA 4FKIA 4R78A 2GNIA 3SDJA 4DAWA 1H1RA 3EQHA 4G16A 4NL0A 5AUXA 2A0CX 5DIAA 4QMOA 4EKKA 4CV8A 3FL5A 4CG9A 3IECA 4RJ7A 4S34A 2PMIA 3MN3A 3TUDA 5D7VA 2XRWA 3RPSA 2PVMA 4FV0A 1G8AA 2XB7A 4FK3A 3VF9A 4QQTA 3QD0A 3CKXA 4TY1A 3U6IA 3U6JA 4AN9A 1DI9A 3A7IA 3FLZA 3ATSA 4J95A 4PTGA 2A27A 3GQLA 4IB3A 2QODA 5CSWA 4U97A 4W4WA 5E8VA 3RP9A 3HYHA 2FVDA 3EKKA 4A9YA 3F3VA 3K5UA 1Q8ZA 2WMVA 2C0TA 3QQJA 3QRIA 2P2IA 2XK4A 4ZTRA 3ODZX 4CZUA 4ZZNA 5KMJA 4XG4A 3PUPA 3UZPA 4O7WA 4DG3E 4QYEA 2V7AA 3R0TA 4V05A 5JN2A 4NW6A 5LMBA 3VF8A 3PXKA 5CEPA 2EXEA 4AZVA 2XKFA 4J8NA 3ANQA 3EMGA 5LMAA 3ZEWA 1ZMVA 4RJ4A 1PMUA 2GDOA 4HW7A 4RZVA 2QOQA 2OKRA 4CMTA 4Q5EA 2VWUA 4M97A 2F4JA 3LFDA 2ITYA 4BTKA 4EOQA 3SOCA 2WAJA 1IAJA 1XH8A 3E7OA 5J87A 5CLPA 4FV7A 5M06A 2BILB 3PJ8A 4BCFA 1JLUE 3OWKA 4JQ8A 4BKYA 1Y8GA 2EB2A 1KOAA 4U0IA 2W17A 3B2WA 3VUDA 3AOXA 5D12A 4UZDA 4YP8A 4TNDA 3WF8A 5J79A 3BE9A 3TNHA 2OZAA 4RVTA 5BX0A 5IA3A 1SMHA 2W4JA 3UGCA 1PF8A 4XEYA 1DI8A 4BDAA 5DWRA 3VS5A 3MA6A 1W7HA 4E3CA 4FUYA 4MH7A 3AMYA 3FMNA 3JXWA 4UALA 1H0VA 2CDZA 4ACDA 5FWKK 4HVGA 4FZFB 4CYIA 4X2KA 2I0YA 3EN7A 3UG1A 4Y83A 5GZ8A 3DBDA 1YHVA 1M52A 4HNFA 2WOUA 1PY5A 4I0SA 2GHLA 2WGJA 4FKRA 4PTEA 5AP3A 4O91A 4XBUA 3BHHA 4M69A 5AIKA 1OIRA 4NZWB 1ERKA 4XLIA 3HLLA 3BWFA 4IE9A 3NW6A 2QR7A 4LV5A 3GC0A 3E88A 4UXQA 4ASDA 4G3EA 3PY0A 4O7NA 2OIDA 2R64A 5M4IA 4AZFA 3DA6A 2HENA 4D9TA 3KXNA 3WOWA 3LM0A 3UIUA 3BLQA 1OB3A 3I5ZA 3LJ0A 5EHYA 2OZAB 3D7TA 4EH2A 3TKIA 3FUPA 1OKVA 2ITWA 3D15A 2W1GA 3HDMA 4UMTA 3OP5A 5FRIA 4O22A 5HBEA 5FBOA 5FXRA 3DJ7A 3PXZA 3ZMMA 3ODYX 5AP2A 5AP7A 1WBNA 3OMVA 1YXXA 3HRFA 4LM5A 5C27A 4CCBA 2J7TA 4WSYA 2F2UA 4QQCA 3AGLA 4PF4A 3WI6A 5IQFA 1OPLA 2V22A 3MBLA 4YHTA 2JDRA 3EQBA 2WKMA 2UZOA 4HNIA 4D58A 3OC1A 2UVYA 4B8MA 4M69B 3AG9A 3O7LD 4Y46A 2BHHA 3FMMA 2PMLX 3IDCA 3KB7A 4DH8A 4X2NA 4DINA 3AQVA 3OBGA 2BMCA 2PUUA 2OSCA 2QKRA 2NPQA 1UU3A 5HD4A 4MK0A 5HNBA 3UO4A 1ZMUA 1LR4A 2HZ0A 4IC7A 4BWKA 1S9IA 3F61A 2XCHA 3BX5A 3D7TB 4D2PA 3BHVA 4IVAA 3NNWA 2HCKA 2VO7A 5EM8A 4DH3A 3Q2JA 2CLXA 2WMXA 4XOYA 1IA9A 3Q2MA 4E6QA 1P4OA 1ZYCA 4YPSA 3KREA 4PV0A 2XM8A 2UW3A 3C4FA 3R73A 3BI6A 4IW0A 2CSNA 4H05A 2VZ6A 4J7BA 3RAKA 4RWLA 4RIXA 4BY9E 4RJ3A 3MTLA 2B52A 1FMOE 3MVHA 4LOOA 1BL6A 5ITAA 3VUGA 3FYKX 2WTCA 4QMTA 2E9OA 3F3UA 5B0XA 2VRXA 3TG1A 5DT0A 3MFUA 2JEDA 3F2AA 2A1AB 1JAMA 4ZTQA 4Q5HA 4D55A 5GNKA 1YXTA 4Y95A 4F1MA 5IUHA 2A19B 3UP7A 3SV0A 3TWJA 3I6WA 4EYMA 3RWQA 3DY7A 3GENA 3MPTA 3TZ9A 3U51A 4U45A 2J6MA 1NT2A 3UOKA 4L43A 3MWUA 4IX6A 4AGDA 2I7QA 4FTTA 4MXCA 4R3CA 4EOSA 4LGGA 2RFDA 4Q9ZA 4Z7GA 5JQ8A 5EM6A 4QMNA 3T3VA 5E8TA 3QX2A 2E2BA 5T6KA 3EFJA 5I3RA 2IW6A 4E8AA 3F3ZA 4FVPA 3CXWA 1HCLA 5HX6A 3AC3A 3AD4A 3I7BA 2UW4A 3P7CA 4RIXB 4CRLA 1W0XC 4LRJA 5IQBA 4YLKA 4FSQA 5KKRC 3F5PA 4G6NA 1V1KA 4TWPA 3DZOA 4I20A 1OI9A 4FV6A 3ZH8A 5HTIA 2VWYA 3ET7A 5FDXA 1PHKA 1MQBA 1OUYA 1KUTA 3PY3A 1KOBA 1Q4LA 3UQCA 3VRZA 5C1QB 2YIXA 4HGLA 1YWNA 3E8EA 5EYMA 1O6YA 1KE6A 1UVRA 1XHAA 4NFMA 4A4LA 4EBVA 2ITNA 3GC9A 3R8MA 3NWWA 1H1SA 4IACA 2ZV8A 4IWOA 4K6ZA 3WZJA 2QCSA 1H26A 3L9PA 5FM3A 3O8UA 4XV1A 3RI1A 4IJ9A 4BYIA 3QRUA 4C57A 2GNJA 3SHEA 3QCQA 4N57A 3EQCA 1B6CB 4OR5A 4U42A 5EM5A 3BKBA 3DK7A 3L1SA 3T8OA 1Q41A 2Y7JA 4FEXA 2QOLA 4GIHA 1FMKA 2CGXA 4TYEA 2QLUA 5BYLA 4FIIA 3QAME 5TKDA 4H1MA 4UY9A 3S4QA 3TEIA 4AZEA 2X6EA 4BCIA 2VTPA 4FTKA 3BLHA 4IAFA 3DFCB 3BZ3A 4MAOA 5G6VA 3LCKA 2FO0A 3E8NA 4QP9A 1BKXA 1GZ8A 2QLQA 4F1OA 3ZDIA 5F20A 3D5WA 5CF6A 5LMKC 5I5ZA 3HA8A 2FB8A 4DN5A 4F0IA 4TYHB 4BTFA 4UWYA 1JSVA 4XV9A 5A4LA 1FPUA 1ZY5A 4ANMA 3CC6A 4BL1A 4I6QA 4X0MA 5I9VA 5JFWA 2FSLX 3Q60A 3MB7A 4MNFA 5I9YA 3ATTA 3NNUA 3SG9A 3R30A 1J7IA 3DXNA 1YVJA 3KK9A 2HZ4A 4Z55A 1WVWA 1V0PA 1YHWA 4RSSA 1OGUA 2XNPA 1PXKA 4TRLA 3GEQA 5E8XA 3VS1A 2YJSA 1MRYA 4LFIA 2HK5A 4QYYA 5CEOA 4RZWA 2ITOA 3LFCA 4X2FA 3R7OA 5JQ5A 4NJ3A 2OICA 4YR8A 3CP9A 4OUCA 4FKSA 3V6RA 1CSNA 1KV2A 4TXCA 2O5KA 5HHWA 4EONA 1Q5KA 5F95A 3QTZA 4JL9A 1YOLA 3L9MA 4MX9A 2UZNA 4DH7A 3C7QA 4DT9A 5M57A 3QLGA 1OIYA 1U46A 4DFYA 4DFUA 3DBCA 2ITVA 4I0RA 1GIJA 5HE3A 3ZBFA 4Y72A 5CTPA 1R39A 5HG8A 2YCSA 4V0GA 3R9HA 3ZLWA 2WQOA 3FI3A 5KHWA 5E7RA 4I6HA 4QPSA 2EUFB 1O9UA 3RVGA 3VS6A 5HLWA 3MFSA 3TDWA 1M2RA 1DM2A 3CR0A 3QA0A 2JKKA 4IXPA 3S0OA 1SNUA 1YDSE 3E63A 3H10A 4FEQA 4IX4A 3R8PA 3CSVA 3HAMA 5LWNA 3NUPA 5DEYA 4L00A 3IS5A 2VN9A 4DFZE 2QG7A 3FL4A 1MP8A 3QHWA 2PY3A 3GOPA 4AOIA 2YIYA 3QZHA 3ACJA 4ANOA 3OOMA 4JRVA 3GFWA 5L3AA 3NPCA 5F1ZA 4QYFA 3ITZA 4TWCA 2OO8X 5KX8A 3WBLA 2XNOA 3JPVA 3CY2A 4QT1A 4GKHA 2UUEA 4O7YA 3R9OA 3KXXA 1KE5A 2PE2A 3UPXA 5HKMA 3UOHA 3U9NA 2WMUA 5CX9A 3TUBA 2QI8A 3O2MA 3D0EA 5ANDA 4PUZA 5M53A 4EH4A 1QPDA 3EIDA 5HU3A 4XHKB 2JBPA 1WCCA 1FGKA 3LOKA 3QZFA 2GPHA 4V0GB 4DGLC 3GU4A 4CTBA 5IPJA 5AA8A 3ORXA 4IJPA 2W05A 3TDVA 2OJGA 1UWHA 4BDIA 4O0RA 5KZ0A 1ZRZA 1QMZA 3A7FA 4YHFA 3QQUA 5GZAA 3TM0A 3LFNA 2R3JA 2BRMA 4A9UA 4AT4A 4NFNA 4C4FA 4EH7A 4CFMA 4EOOA 4ZZOA 4BDDA 3UQFA 3NVKI 1VZOA 4ASXA 4IHPA 4R7IA 4HZRA 3DBEA 4EWHA 2JD5A 2YJRA 3QUEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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