2VZ6A

Structure of human calcium calmodulin dependent protein kinase type ii alpha (camk2a) in complex with indirubin e804
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
293
structure length
291
Chain Sequence
LYFQSMYQLFEELGKFSVVRRCVKVLAGQEYAAKIINTKKLSARDHQKLEREARICRLLKHPNIVRLHDSISEEGHHYLIFDLVTGGELFEDIVAREYYSEADASHCIQQILEAVLHCHQMGVVHRDLKPENLLLASKLKGAAVKLADFGLAIEVEGEQQAWFGFAGTPGYLSPEVLRKDPYGKPVDLWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYQQIKAGAYDFPSPEWDTVTPEAKDLINKMLTINPSKRITAAEALKHPWISHRSTVASCMHRQETVDCLKKFNARRKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the Camkiidelta/Calmodulin Complex Reveals the Molecular Mechanism of Camkii Kinase Activation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CALCIUM CALMODULIN DEPENDENT PROTEIN KINASE TYPE II ALPHA CH
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 101
structure length 291
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2008-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2vz6A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2vz6A01
3GENA 3OZ6A 4AFJA 4E7WA 3RAHA 3K5VA 4GUEA 2VTHA 2OJJA 2BAJA 5J1VA 1PMVA 1PMUA 5E8VA 3K2LA 3G6GA 3W16A 4AT5A 4EOQA 5IA0A 3S4QA 4EC9A 1Y6AA 1UU7A 5E8SA 4PQNA 2R2PA 3OEZA 4JJRA 3TACA 4BL1A 5H8GA 3KXMA 2JEDA 3KFAA 2VTTA 2YZAA 3FQSA 4IAFA 1OI9A 4BDEA 4BN1A 4L68A 2F7EE 2R0UA 3QX4A 3VHKA 3U55A 3EN9A 3GBZA 4YLLA 4DEIA 3U8WA 4R77A 3CJGA 4RC3A 4DEAA 5AAGA 2BZHB 2X2LA 5LVOA 4A9TA 2JKOA 5GINE 3VUDA 3PY3A 3C4XA 2CKPA 4O0WA 5B0XA 2P0CA 1UNGA 3C50A 3KMUA 3UO5A 3LOKA 3OHTA 3FC1X 2RG6A 2VWBA 4KKGA 4JBVA 5FXRA 3TNIA 4XEYA 2W06A 5HX8A 5BUJA 1HOWA 3R1QA 4HGSA 4BHZA 2R9SA 3CXWA 4V0GB 3Q3BA 4AXAA 4F1MA 3ZLYA 4PDOA 4RT7A 3R9DA 5LQFA 4X3JA 3FEGA 3R0TA 4M8TA 1M2RA 4JR7A 4NM0A 4XLIA 3ZLXA 2OICA 2VAGA 3GU5A 5LVPA 3NAYA 1H27A 1W8CA 4DGMA 2G15A 4YZMA 3UNKA 4DC2A 4F0GA 2WGJA 4TPTA 3CC6A 1DS5A 2O8YA 3QYZA 4YZNA 3ZSHA 5HORA 3HA6A 2GHMA 4FV9A 4KKEA 3EYGA 4GIHA 4MNEB 4JBOA 3QGWA 4N57A 4YGAA 5A3XA 4JQ8A 4MK0A 5L4QA 4BTFA 4CFMA 2GDOA 5L8LA 4RIYA 3PIXA 5DNRA 2UUEA 3D5VA 3S2PA 2W1IA 5J9YA 5JEBA 4UX9A 2CMWA 3OBGA 2JDTA 3QRKA 2J5FA 5IDNA 1OUYA 2ZV2A 4AOJA 5D41A 5TO8A 4FF8A 4IBMA 5HG8A 3CTJA 4F0FA 4HGEA 3QU0A 2JLDA 3WF6A 3UIBA 4WSQA 3UC4A 5AR7A 3SX9A 3P1AA 3DS6A 3GCUA 2VUWA 5M53A 5I9UA 2EXEA 3RAWA 3UVQA 4JOAA 5AX3A 4G3EA 1Q5KA 4G3FA 1MQ4A 3C51A 5HQ0A 4FV0A 4AGUA 2GS7A 4FTCA 1KE8A 3OY1A 5HZNA 4AOTA 4CLJA 5A6OA 3A8XA 2ZB1A 5AP5A 3W2RA 2WQBA 3D4QA 3ORXA 3ZEWA 3KXXA 5HNGA 4DN5A 4BCNA 2YCFA 3R1NA 1Y91A 3H9FA 4P5QA 2YWVA 4AW1A 3EN7A 4KIKA 3UZRA 4W4XA 3NLBA 5ITAA 3N4VA 5FG8A 4I5CA 2VZ6A 2UV2A 4O1OA 2CPKE 3QL8A 5EDPA 4C35A 2P3GX 4IZ7A 4AP7A 5HBJA 5IU2A 2PU8A 4AGCA 4FX3A 2W1GA 2VWYA 4BYJA 3JY0A 4FSYA 4D2TA 5K0XA 3UNJA 1TQPA 3Q6WA 3BHVA 3P4KA 4MQ2A 5HD7A 4ALVA 1PXMA 4K0YA 2UW9A 4JIAA 3LM5A 4MD9E 4UN0C 2DYLA 4AG8A 4ID7A 3U4UA 4FSQA 2QOLA 5JFVA 2R3NA 3EZRA 3LJ0A 4QMSA 4DLIA 3C4EA 4BTKA 1LEZA 3L8VA 5CI6A 2GPHA 4QMLA 4Z9LA 3SA0A 2WFYA 4BI0A 2SRCA 3HV3A 1NVRA 2BKKA 3FHIA 4TT7A 1STCE 4LOOA 4ANSA 4E4XA 4EBVA 4IAKA 3IOKA 4K2RA 4NFMA 1XQZA 5ANEA 5EHLA 5LARA 3ZYAA 4I4FA 4BHNA 1MRYA 2VTIA 5EOLA 4CCUA 2OFVA 1PYXA 5CU2A 4KA3A 3FKNA 3EIDA 4AGWA 2YDIA 4EL9A 1OIQA 4J8MA 3BEAA 3UYSA 2ZV7A 4YTHA 3MS9A 4D5KA 4BDAA 4PDSA 4FKJA 3GNIB 4YJUA 2YWPA 1KV2A 3UOKA 1BKXA 2PZIA 2ZAZA 3A4OX 5T6KA 4XV9A 1MP8A 3ZMMA 1XBBA 3SXRA 4CRLA 3VBXA 5CAQA 5EH0A 3IW8A 5CXHA 4CZYB 3MSSA 3RAKA 4ZOGA 3FLSA 3P0MA 5CASA 4IQ6A 2XKCA 1YRPA 4RIXA 4H58A 4DBNA 5H2UA 3LFCA 1FVRA 2GNIA 2C5OA 4PDPA 3VUTA 5FM2A 3HAMA 4O1PA 5BVDA 2W0JA 5ANOA 3E3PA 4I21A 4FSWA 3MFSA 5DIAA 4H36A 3MVJA 4WKQA 2QHNA 3H3CA 3QUPA 3RKBA 1ZYCA 3RCJA 3IPHA 3R8LA 4C4FA 4EH2A 1GOLA 4JVGA 3PZEA 2IPXA 4GW8A 3V8WA 3MY5A 1GY3A 3D9VA 1KE6A 2G1TA 1OUKA 2W99B 2XIKA 4FKUA 4I92A 1REJA 3GI3A 5AP6A 2XP2A 2Z02A 1OVEA 2DS1A 3MY1A 4XH6A 4PMPA 3P7CA 4Q9ZA 2V62A 4HOKA 4CKRA 3GCSA 5I3RA 3BGQA 3NVKI 3DAJA 3ZDUA 2R0IA 3GC8A 1U46A 2WIHA 1HCLA 2X7FA 3BE9A 4I0RA 4M15A 3CGFA 3ZUTA 4FKVA 4IM3A 3OXIA 3UP2A 4KIPA 4K6ZA 3TXOA 3JVSA 3GFEA 1PW2A 3KGAA 2PVMA 2VNWA 4UV0A 4W8DA 4WOVA 4ZMFA 2OF4A 3GOPA 2QO7A 1SYKA 2HWPA 3JYAA 4FODA 2QU5A 4RSSA 4UMQA 3RM7A 4PMSA 3SV0A 5K4JA 3PLAE 4DH8A 4FTMA 4JS8A 3OP5A 4BCGA 1I09A 2XA4A 4NFNA 5EM7A 2WAJA 3BPRA 2Q0BA 2R3OA 2OJ9A 3WF8A 4FTUA 5AUXA 4FVPA 1Q3WA 4F7NA 3MPMA 2ETMA 1Q8YA 3H4JA 4CFUA 4V0GA 4EOLA 1OKWA 2GQSA 3TG1A 2B4SB 3Q6UA 3R7GA 3EOCA 1P14A 1YHVA 2C6MA 3QQUA 5FTOA 5H9BA 4ANNA 1ZOHA 3C0HA 1YHWA 3E62A 2VTMA 1R0EA 5LMAA 5LXMA 2YITA 3U6IA 2EVAA 4XHKB 3SKCA 2ZJWA 4BZOA 2GNJA 2XM9A 3A8WA 4ZY6A 2YJRA 3NUUA 3FJQE 3LFEA 2X9EA 3BYVA 4G2FA 3ZUVA 4IEBA 4BKZA 3PY1A 1Q41A 3S3IA 4G9CA 2R64A 4IHPA 4MNEA 4I22A 3QHRA 3DOGA 3JPVA 4JT3A 4K33A 1SMHA 2W9FB 3VBYA 2VX3A 5DLSA 4BC6A 4CVAA 5BVWA 3SW4A 2C47A 3ACJA 3NUXA 5HO7A 3OC1A 2PZRA 4FSUA 5JZJA 2HAKA 3ZFYA 4RJ4A 2R3MA 4F7JA 1OL5A 4EZ5A 2VO7A 4IJ9A 3KRRA 3DXPA 3DBQA 3EKNA 4QT1A 4Y5HA 5BMMA 3D5WA 3DLZA 2JDVA 2C3JA 5HU9A 5LWNA 2Z60A 1GNGA 2XKDA 4JL9A 2PMLX 2VO0A 3CKXA 4QPSA 4H1JA 3K54A 3GFWA 5CF6A 1FOTA 1P4OA 3F5XA 2J90A 5CZIA 4C33A 2JD5A 1M14A 4CFNA 4ZZNA 3N4TA 4TWOA 1YXVA 4J53A 4XBRA 2H96A 3GP0A 4L8MA 4FK3A 3TNHA 3UIXA 4D9UA 2GTNA 4ACGA 3QGYA 3FI3A 3L8PA 4V04A 2BRNA 4HCVA 4IWDA 3NMUF 5IEVA 2ZDUA 4BCFA 3CPBA 5M57A 3E8CA 3SC1A 5CAPA 2YIRA 5HBEA 2EUFB 4M66A 2IO6A 3M2WA 4G1WA 4YUQA 4BKYA 4AAAA 4EC8A 4FL1A 4GH2A 4PV0A 2XK6A 2ZM3A 3BYSA 2JFMA 2X6DA 2YLEA 3E7OA 3KB7A 4G6LA 4R8QA 4AGDA 4FNZA 4ZTMA 5M4CA 3VC4A 5GJDA 5L2SA 2F49A 2KULA 2YIWA 4TYHB 4KBCA 3VBTA 5LCJA 4GJ2A 2PL0A 1TVOA 2XNMA 3ACKA 4LQMA 2CN5A 5AJQA 5DFPA 5DRDA 3ZLSA 4C62A 3I0QA 3LXLA 1B38A 3KY2A 3F3TA 3VO3A 4DEDA 5BVFA 4AE9A 1P4FA 4M84A 4II5A 4ASDA 5KKRB 2CNQA 3VQUA 4BBEA 1U5RA 5IUIA 2CKOA 2WHBA 2YA9A 3E88A 3KK9A 4A9RA 2QOBA 3VJOA 3SOCA 1R3CA 2UZTA 4I6QA 4RQVA 4C36A 4TRLA 2RFNA 4NW5A 5EI6A 4I24A 4NJ3A 3H9RA 3NWWA 2XH5A 2WMBA 5CENA 3QTRA 1I44A 3UPZA 3VBWA 4A07A 4R7HA 2F9GA 3LXPA 4KABA 3GU7A 5HD4A 4A4XA 4NK9A 4EOJA 3U6JA 1H0WA 4FK6A 2X7OA 3GC7A 3LCKA 1FVVA 2WMRA 4LMNA 4QMZA 4RZVA 4YZDA 4EWHA 1GZNA 3COHA 5E8UA 5JQ5A 2YEXA 2B9IA 4L3LA 2X9FA 4LM5A 2QOHA 4R6VA 2H8HA 4BDDA 4FTTA 2NRYA 3AT2A 2R3KA 3E63A 3ZC6A 5FDXA 2QR7A 2OG8A 2YJSA 2VTSA 1FGKA 4MNFA 3PLSA 3ZUUA 4BDCA 5AR8A 4FKPA 3QCXA 4JG7A 4L44A 1YI6A 1OIRA 3KRWA 4DG2E 3QQJA 2C5YA 4CRSA 1J7LA 4B6LA 3COIA 3TZ8A 4MXZA 1ZMWA 3KULA 3P7AA 1OZ1A 2CSNA 3KC3A 1H8FA 4M68A 4QP3A 4Y8DA 2I7QA 3P79A 3MJ2A 1XR1A 1Q99A 2F57A 4MKCA 3O8TA 5J95A 5LWMA 3MA6A 3R7OA 1ATPE 3ZOSA 2E9PA 2NRUA 3R7UA 4LYNA 2PUIA 3F2AA 4Y83A 5D12A 5KMKA 4USEA 1H1QA 3EL8A 3QD2B 2X8IA 4K11A 3IDCA 1Y8GA 3AD6A 3LE6A 3ORMA 4KSPA 2PVFA 5IPJA 4L67A 4KS8A 1H1RA 3FSKA 2OFUA 1JVPP 2EU9A 4DGOA 2OH0E 5I9WA 4ZSLA 2E9UA 1IA9A 1JBPE 1ZARA 3OY3A 1K3AA 3E5AA 4F6SA 3A7JA 3DXNA 3MVLA 5KHXA 4HCUA 3CBLA 4IAIA 4C3FA 3CY3A 3MV5A 3ZO1A 4AFEA 1Q8WA 3ODZX 1PXJA 3ULZA 1YHSA 3EN6A 3VS4A 2I1MA 5F94A 1IASA 2X81A 3ZM4A 4E20A 4O0XA 2UZDA 4IWQA 1ZYSA 3VUHA 3C7QA 4D58A 2WMUA 5AR4A 4RJ5A 3QKKA 5IQIA 4FV2A 3R9RA 1PMNA 3PFQA 3KRLA 1V1KA 4WRSA 5IQHA 4QTAA 3OCTA 4TKSA 2IZRA 3V5TA 2GQRA 3FPMA 4PPAA 4CCBA 5IQFA 1FGIA 4S33A 2YABA 2YCSA 2ONLA 3R7IA 3QUEA 1E1VA 3A4PA 4R5SA 4ZTLA 3RAIA 4KRDA 3TKUA 4EOKA 3FI8A 2W1EA 2GNHA 3ORTA 4TY1A 5HESA 4R1YA 3KF7A 3ZO3A 4APPA 3C4ZA 1DI9A 1OKZA 4FEWA 4YC8A 5CU6A 5IH6A 2G9XA 4OW8A 3DKCA 4D0XA 3AGMA 3T9TA 1IA8A 3AG9A 3OEFX 5EDRA 3WARA 3QRTA 2XIYA 3R28A 5IA1A 1Z9XA 4OGRA 3E8EA 5KMJA 3HA8A 3LLAA 3U9CA 4FG8A 5AIRA 2O3PA 5D11A 2PYWA 3C4WA 4RWKA 3OCGA 5EOBA 3R7VA 4E93A 5M06A 2XB7A 4RX8A 3TZ9A 2BRBA 4X21A 2W1HA 3KVWA 2XK7A 3Q4CA 2JKQA 4MF0A 3V5PA 1YOMA 2QC6A 5JH6A 4PUZA 4N4SA 3LCSA 3ITZA 5CQUA 3NIEA 5K5NA 5ACKA 4E6CA 3FL5A 3O7LD 4E4MA 5HCZA 3DKOA 2AC3A 3KMWA 4X3FB 2JKKA 3JXWA 1OPLA 3P23A 3VBVA 2J50A 4CNHA 3C4FA 3GC0A 2IVSA 4FUXA 4EOMA 3CPCA 1J91A 5E8TA 2XVDA 4JQEA 4DCAA 4DH7A 5IISA 5DR6A 1FVTA 5CY3A 2RFEA 1WZYA 2V5QA 4HVSA 3W33A 4EQCA 3FXWA 1L8TA 3RINA 2WD1A 4YLKA 2Z8CA 3GT8A 4DFLA 3GB2A 1YXXA 3LMGA 4E5WA 4Z16A 4TYHA 4HCTA 4RJ6A 3RPVA 4NU1A 5CU4A 4FR4A 4U9AA 3F5PA 4DHFA 3FI2A 5TOZA 5HIEA 1R1WA 3ZM9A 3FLQA 4IVBA 2IZSA 4H1MA 4IFCA 4IDTA 4GT3A 5IF1A 4HW7A 3CE3A 4JG8A 5AA9A 1BX6A 4S2ZA 4UWBA 4O7LA 4O7RA 3CLYA 3ZEPA 3OUKA 2UW8A 3WZKA 4RBLA 5BMSA 5CF8A 3LXKA 5ANGA 3ODYX 1TQIA 3QRUA 5A4TA 4DTAA 4RWIA 3R8PA 3VW8A 2QOFA 3FMNA 4WSYA 3TEIA 4GFOA 4UYAA 2WMWA 4MXCA 3ENMA 1PXKA 3QTUA 3RPYA 1PYEA 4ASXA 4IVAA 5CNNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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