2W17A

Cdk2 in complex with the imidazole pyrimidine amide, compound (s)-8b
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
298
structure length
278
Chain Sequence
MENFQKVEKIGETYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTEKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLAVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Discovery of Azd5597, a Potent Imidazole Pyrimidine Amide Cdk Inhibitor Suitable for Intravenous Dosing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 278
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2008-10-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2w17A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2w17A01
4C3RA 4JRNA 4TZRA 4TYHA 1IEPA 3H10A 4BWKA 4KIPA 4MF0A 2VGOA 3M1SA 4ASXA 3TDWA 4X3FA 5T3QA 4MX9A 4RFZA 3Q9YA 2EB2A 2XEYA 4YZBA 4BCJA 4BIEA 3OY1A 4TYEA 3E8DA 3I6UA 1YXSA 4RSSA 3KK9A 3H9FA 1VJYA 5A6OA 5KMLA 4A06A 1J91A 4QYHA 4E1ZA 4BRXA 3O8PA 4YR8A 2CCIA 4EK6A 4IX4A 4IMYA 3KXZA 2YCFA 3NAXA 4JBOA 4R3CA 3SV0A 4BCIA 5HU3A 5HZNA 3FY0A 4NSTA 4CRLA 5JKGA 3RPYA 5HLNA 3UQGA 4D9TA 4EJ7A 4J71A 2C6OA 4AACA 1IA9A 2PTKA 3NGAA 1PXJA 4RJ6A 4ANQA 2C6IA 3AT3A 3DNDA 2QKWB 3DTWA 4ZSAA 5IA1A 2C5XA 4IB0A 2VUWA 2OZAB 3GC8A 2VWWA 2UZUE 3F3UA 3PJ8A 1WZYA 5FQDC 4N70A 5HGIA 3VHEA 4E6CA 3OW3A 2CHLA 2H96A 3MWUA 4YZCA 4BDCA 4XUFA 2B9JA 4M0ZA 3UQFA 2E9UA 3R7YA 4RIWB 4ERWA 1Y6AA 4U40A 4MTAA 4M3QA 3R00A 5K3YA 4O0SA 2C6LA 1NA7A 1UKIA 4K1BA 3PVGA 1ZMWA 4FICA 2X7FA 4ANBA 3GCVA 3DXNA 2OJJA 1OL6A 3ORLA 2GHMA 4H3BA 3EHAA 5M51A 3TG1A 1Z57A 1JPAA 3DXQA 4ANLA 5LMAA 4BCGA 4IHPA 3EH9A 5LVPA 4YNOA 5DRBA 4V0GA 4YURA 4MEDA 2BALA 3L9NA 4I93A 4P5QA 4R1VA 4YC6A 4D1XA 2VX0A 2OI4X 4HNIA 4DFYA 4FTIA 4CVAA 2W1IA 1NY3A 5CAUA 4U42A 2W1CA 1ZOEA 3OT3A 4GRBA 4M84A 4PY1A 1DAYA 3OEFX 4NT4A 3IOKA 3TTIA 2WMBA 3NX8A 4UBAA 4C3PA 3Q9ZA 2XNGA 5IMEA 3A7IA 5FLFA 4BI2A 3DDPA 3EJ1A 2PVJA 2QOLA 3IW7A 4UALA 2GS2A 2WQNA 4AZSA 4HGTA 5AUUA 4R3PA 3MFUA 3KVXA 3MA3A 3UVQA 4IX6A 2DQ7X 4FK6A 2QODA 4J52A 1XHAA 4XLVA 3WZUA 4B7TA 4UMTA 3U6JA 3EOCA 3R9NA 3UYTA 3HRFA 1REJA 1QPDA 3F88A 4DBNA 5GJGA 2IWIA 5HO8A 4Q5EA 3QRJA 2A19B 3U4WA 1WVWA 4EOQA 5IA0A 2BILB 3ENMA 4BGQA 4E7WA 3BHUA 3UMWA 1SZMA 2XVDA 3ORZA 2G1TA 4FKWA 2JBOA 2Z2WA 2QVSE 3VVHA 5ICPA 1GZOA 3FUPA 3POZA 3MVHA 2I6LA 3EKKA 3R71A 5CLPA 3V5QA 1YXVA 4C3FA 2X39A 4WNMA 4OBQA 4AGUA 5A4EA 1OUYA 3ODZX 2WTDA 2P2IA 4FIJA 4FKPA 1XBBA 5ANJA 2XEZA 5HE2A 4FNWA 4FT9A 4IJPA 5CT7A 3Q04A 2BDWA 4MKCA 5FEQA 2GS6A 4DCEA 2XNOA 3QQKA 3ZC6A 2QO7A 2XRWA 5JN2A 2OLCA 4EK3A 2F7EE 1YDRE 3DK6A 3K3JA 3AD4A 4EYMA 5FP5A 4BBFA 5B7VA 1PXNA 2DS1A 3E88A 4I0SA 4Y8DA 2UVYA 5LJJA 2F57A 2QOFA 4GCJA 3PSBA 3MPAA 3C13A 3LLAA 4C02A 4NK9A 5E1SA 3VUHA 4NL0A 3NWWA 5AIKA 2X2KA 1OB3A 2YM7A 3A7HA 3FLZA 5L6OA 3PXKA 1M2PA 4FTCA 3HV5A 3PPJA 2WIPA 3TV6A 3ZO4A 1PMEA 1ZXEA 1V0BA 2XBJA 4CV9A 1Z5MA 1UA2A 5D7AA 2C6KA 3E8EA 3GENA 4WKQA 4WUNA 5CT0A 2WAJA 1WBSA 2P4IA 3R7EA 2W5HA 2A27A 3PXRA 5CX9A 3MW1A 2BIYA 1ZRZA 4I0RA 5HCYA 3UPXA 4J53A 4FUXA 2C1AA 2XH5A 3LQ5A 1CKJA 4L7FA 3K54A 4AX8A 3BU5A 3CY2A 3QRUA 3DAKA 5I3RA 3DB8A 3NW5A 4X2GA 4FZAB 4XG8A 4BI1A 2BZJA 3OW4A 3P7AA 2UZTA 2YN8A 2GTMA 4QP3A 5KMIA 2AC3A 4L44A 4XNEA 4EH4A 3R7UA 3WILA 4R1YA 4ZY5A 4L52A 4BKZA 4D1SA 5KCVA 4G5PA 2BZIB 4GG7A 3TWJA 2ZYBA 2HW7A 4HPTE 4IDTA 3TZMA 3U8WA 4OTFA 4CKIA 2R3JA 2R9SA 4WT6A 2UV2A 4A9SA 4EH9A 5FBOA 4KS7A 2JKKA 4EH6A 5GZ8A 4OTPA 2WD1A 3A99A 4NIFB 2GQRA 3DV3A 4RC4A 3DAEA 3L8PA 4QQCA 4IAAA 4L67A 4QQTA 3Q3BA 4RIYA 5BVEA 3LMIA 3MA6A 5EI2A 3IGGA 4QMPA 1YI4A 1OL1A 4I6QA 4DEAA 2RFDA 4XP2A 3DQWA 4ZZNA 5M07A 4NW5A 2P33A 4XHKB 4EKLA 2YCSA 4UWYA 5EDRA 1ZY5A 2VWIA 5BUJA 4YPSA 4AZVA 2FO0A 4BDIA 4Z7HA 5JT2A 1ZAOA 5H2UA 4QQJA 4EH8A 2JLDA 2B54A 3FDNA 2X2MA 1TVOA 5DR6A 4UY9A 3DK7A 5JRQA 4IM3A 4O0RA 2I0HA 4JG8A 4ZIMA 2WU7A 2R7IA 4QP7A 2X0GA 4NM7A 2BPMA 3EMGA 5CU3A 2PZRA 4RWJA 4QTDA 5AV4A 4F6SA 2Y4IC 3NUSA 2R3HA 4DEGA 4D1ZA 2X8IA 3MESA 2XKFA 4CFWA 4PL4A 4GT4A 4Z55A 3Q4ZA 4YHJA 4DFZE 3JY9A 3KXHA 3MPMA 2R3FA 3VIDA 3RI1A 1GJOA 5AV0A 4FV5A 4DAWA 1VYWA 3TXOA 2YACA 4JAIA 4IM2A 5IQAA 4QMOA 4IC8A 4ERKA 4IWOA 4EWQA 4QYGA 4EHEA 3LFBA 5DOSA 1H1QA 4DG3E 4P7EA 3H4JA 5BVFA 3C0IA 3MH3A 3OWKA 3PLSA 3PE2A 5EK7A 3KB7A 3HDMA 3IW8A 3A4OX 3D5VA 3LM0A 4O22A 1FVTA 4QP6A 4CNHA 4I3ZA 3KREA 2OZAA 5BYLA 4F7SA 4I6FA 3LE6A 3PSCA 3FMKA 2LAVA 3UOHA 4RVMA 2XIYA 3R01A 4MNFA 4W9WA 4QMUA 1CKPA 3FMEA 5KZ0A 4PTCA 3OF0A 3C9WA 3FKNA 3V04A 3ZSGA 5CVFA 2QHNA 2J50A 4DLIA 1BMKA 2AYPA 1MRYA 3DDQA 2B9FA 1OL5A 4WG3A 1J7UA 3K2LA 4XS2A 3WARA 4Y5HA 4YJSA 5LVLA 4XMOA 3ZDIA 4NKAA 4GW8A 3UOKA 1Q41A 4R3RA 5HVJA 1X8BA 2XK9A 3QD4A 3CJFA 1W8CA 4GJ3A 1R78A 5BVKA 4I5HA 3S95A 4K2RA 5LWNA 4WHZA 3F7WA 5M4FA 3HMOA 4GFOA 2HW6A 3O96A 3VO3A 2I0EA 2I0YA 4QP9A 4CD0A 2BRHA 3U51A 4HCUA 5CEOA 4UB7A 3UJGA 3QZHA 1BI7A 4MK0A 3VBTA 4CFMA 4EHVA 5CXZA 3FV8A 2BHHA 2W4JA 2WZJA 4IE9A 2UW5A 3V3VA 5I9VA 1IA8A 1LR4A 3OXZA 5D1JA 3ULZA 2WQMA 4Y95A 3P08A 1ZMUA 4JL9A 2YAKA 4O7VA 5C8MA 5AR7A 4I92A 5D9HA 1XWSA 5HD7A 3VJNA 3OCTA 3QF9A 4PV0A 3DKFA 3K5UA 4JG7A 1TKIA 3FMLA 4GT5A 5F4NA 1O9UA 4XG3A 4BCQA 2VO3A 3E3BX 5HKMA 3QALE 4V01A 3DFAA 3QGWA 1KWPA 4RQVA 4RX8A 4CTBA 3UO4A 3QUPA 4TYGA 3U4UA 3KMMA 2IO6A 4HVDA 2QKRA 3EN4A 1FOTA 4EHZA 3ORIA 4FOCA 2ITWA 3FSFA 3QLFA 4A07A 4BB4A 4IJ9A 3H0YA 4BTMA 4AWIA 4R5SA 5I5ZA 1F5QA 1UV5A 2QOOA 3F82A 5E8WA 1WAKA 4ZY6A 5J9YA 1SNXA 4XRJA 4DH3A 3I7BA 3R2YA 4JNWA 3HEGA 4HGLA 4R5YA 4TWNA 1H28A 3LQ8A 3KULB 4PPBA 4MNEA 3E3PA 4EOLA 2Y6MA 5C8KA 5JSMA 3RNYA 5AMNA 3TNIA 2R64A 3R83A 5CF6A 4GKIA 3TJCA 1YI6A 5B2KA 5DT4A 3ZBFA 2CNUA 5EW3A 2C0IA 2DYLA 3ATSA 2ETKA 3L9LA 5BNJA 3FLYA 4ZS0A 2UW4A 2O63A 2J7TA 4XLIA 4WG5A 3MSSA 5EDQA 4YTIA 3MY0A 4O83A 4ZMFA 2VNYA 3ELJA 3I81A 3CTQA 2BRBA 3GFWA 5AP6A 3VQUA 1Q97A 4BICA 3PFQA 3LXPA 1OIQA 3C5UA 2FA2A 3FZ1A 1XBAA 3R1QA 4FMQA 4G3GA 4E3CA 5CQUA 4EK4A 3G5DA 2QU5A 3CTHA 3F2AA 3CKWA 3KK8A 3VRZA 2ZV2A 2VRXA 2YM4A 4K6ZA 4NWMA 3GQLA 1H00A 3C51A 4KWPA 4CFNA 4ZZOA 3NNXA 5IG1A 3P23A 4FG7A 4BL1A 5CTPA 3DKCA 3V01A 3QUEA 2C5VA 3GUBA 1WBPA 4TPTA 5FDXA 3V5PA 4PPAA 3O8TA 5E1EA 1REKA 4R7HA 2YABA 3SD0A 4AW1A 3F3TA 4QTCA 2C3JA 4YNEA 2OICA 4DGGA 2X81A 4C36A 5E8XA 3LFQA 4DT8A 4JJRA 1IG1A 4PDOA 5L2TA 2ITPA 1BL6A 3EN7A 4XOZA 5IA3A 1YW2A 4FNYA 3LCOA 1PYXA 1SNUA 3OD6X 3PJ1A 4G3CA 4M66A 2H34A 5JGAA 4W8DA 3FMHA 4GIIA 3EZRA 4NCTC 3RVGA 4I4EA 5IDPA 4O81A 4FG9A 1OECA 2R3OA 3U55A 1BLXA 3ZO1A 3MGYA 2BFXA 3WZEA 1QPCA 3A60A 3N51A 3C4EA 5AUXA 1NVRA 1WBNA 3SHEA 3TCPA 3N4UA 2G2HA 4QT1A 4CG9A 2WOUA 3HYHA 3QTIA 4O0VA 5FRIA 3OCSA 5E7RA 1K2PA 5HIBA 4CCBA 4DH5A 4ZTSA 3VBYA 3P86A 4BY9E 3QRIA 3B2TA 4F0IA 4FKIA 3WF9A 4Z16A 3EIDA 2W9ZB 4NIFA 2WMUA 2IZRA 4FV6A 3F3VA 2XF0A 3VRYA 1ZZLA 3W1FA 4UYAA 4F9YA 3ZLWA 3ANRA 3O7LD 2ZB1A 3BLRA 3VUKA 4NH1A 4WNKA 3G6GA 3VHKA 4EZ7A 2JIVA 3KMWA 3R1YA 2W1FA 4L00A 2PMIA 2C3KA 2G01A 3QX4A 3MIAA 4V04A 5DH3A 5HVYA 4F1OA 2F7XE 3U54A 5IQFA 1GIIA 5KO1A 4IB5A 3W18A 5D11A 3WIGA 3ACKA 4GV1A 2QLUA 4PRJA 5AP2A 3E8NA 2B53A 2VTNA 2ZDTA 4F65A 5CALA 1J7IA 2ITYA 4KSPA 4ZP5A 5CYIA 3V8WA 2C5YA 3D5XA 1NXKA 3IW5A 4GH2A 5JQ5A 4HCVA 2CNVA 4X7QA 2OZOA 4NM3A 5EHYA 3Q9XA 3QTUA 3WE4A 2YDJA 4LGGA 1B39A 2QO9A 2XKDA 2BDJA 4CZTA 4JAJA 5C27A 5CNNA 3V6SA 3ZFXA 3E63A 3HMIA 3ROCA 3V5JA 3VULA 2BIKB 3WF6A 5M57A 2Q83A 5EYCA 3SX9A 1PMUA 4FTNA 4LUEA 4L3PA 5DT3A 4EKKA 5H8GA 2V0DA 4UZHA 5DIAA 4GSBA 4EONA 3MY5A 4Q9ZA 3CD3A 2EU9A 3QL8A 3BBTB 2JKMA 4USEA 4ENXA 3GU7A 3EN6A 2V5QA 2WEVA 3AOXA 4HOKA 5DWRA 4II5A 4O7LA 4IADA 5HE3A 5JGDA 3WF7A 2JGZA 2V7OA 3IKAA 2FUMA 1FGIA 1Q62A 4IVDA 5CSPA 4IW0A 2A2AA 2HELA 2IW6A 3NNUA 3NUUA 3Q96A 4KA3A 2A1AB 3IECA 4OUCA 4RJ7A 4YSMA 5I9WA 5IQDA 4Y85A 2HZIA 4TYJA 4ITIA 4NJ3A 4X6RA 3BHYA 1PYEA 1ZYJA 3O17A 1U54A 3BGQA 1RW8A 4U0IA 4TWOA 4D2PA 5EDPA 1KSWA 3QRTA 5BYZA 1TQMA 4E8AA 4WNPA 4EK8A 4K18A 3QCYA 3AGLA 5DPVA 2PVHA 2ITNA 2OBJA 4N4SA 3N4TA 4UWBA 2JD5A 4CYJA 2VAGA 3UNKA 3FXZA 4XOYA 2B55A 4C57A 1P14A 4B99A 5GZ9A 3SRVB 3OVVA 5C1QB 3FYJX 3BHHA 4LL5A 2PU8A 5K9IA 3F2RA 4IAIA 3UP2A 3DTCA 3FZOA 4DINA 2RL5A 5JK3A 2PMOX 4W9XA 3BPRA 3RPVA 4C33A 3QUDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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