2W4KA

X-ray structure of a dap-kinase 2-302
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
301
structure length
301
Chain Sequence
TVFRQENVDDYYDTGEELGSGQFAVVKKCREKSTGLQYAAKFIKKRRTKSSRRGVSREDIEREVSILKEIQHPNVITLHEVYENKTDVILILELVAGGELFDFLAEKESLTEEEATEFLKQILNGVYYLHSLQIAHFDLKPENIMLLDRNVPKPRIKIIDFGLAHKIDFGNEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYILLSGASPFLGDTKQETLANVSAVNYEFEDEYFSNTSALAKDFIRRLLVKDPKKRMTIQDSLQHPWIKPKDTQQALSRKASAVNMEKFKKFAAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A Pef/Y Substrate Recognition and Signature Motif Plays a Critical Role in Dapk-Related Kinase Activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DEATH-ASSOCIATED PROTEIN KINASE 1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 97
structure length 301
sequence length 301
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-11-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2w4kA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2w4kA01
1OPLA 3WZKA 3QWJA 2OSCA 4EJNA 5DN3A 2ITPA 4I6BA 4FNWA 5FXQA 3I1AA 3OWJA 4QMWA 2BRGA 5IUHA 5KHWA 1J7LA 2XH5A 2A2AA 3HYHA 4K2RA 2PMNX 2LAVA 4OTDA 4Y85A 4YBJA 2C47A 4TW9A 3BYOA 4HVHA 3UIUA 3MH3A 2XEYA 1YI4A 2W1FA 1OZ1A 3KRXA 4TT7A 3QALE 5DRDA 5AP5A 3WIGA 5AFVA 2BZIB 3FQSA 2BTRA 2CGVA 4AA0A 4O7VA 3R8LA 4X2GA 2C0IA 2YIRA 4WNKA 3AQVA 3R71A 2X39A 2IJMA 3PY3A 2OZOA 4FKWA 5HD4A 4R1YA 4HVSA 5GZ8A 3LCSA 4EJ7A 3TTIA 3OC1A 4C8BA 3MY1A 3VF8A 2YITA 3R7GA 5KMMA 3PG3A 1Q8YA 2YJSA 4IFGA 3GU6A 4KIKA 3E93A 2ITOA 4I5PA 1JKTA 1WBTA 3NYNA 4IX5A 2ZYBA 3W8QA 4D2TA 5LVOA 3D7TB 3QD0A 4L42A 5EI8A 2QG7A 3NR9A 3ZCLA 5CU0A 4AG8A 2R4BA 4PTCA 1JNKA 1SM2A 2V5QA 4Z55A 4FT0A 1Q3DA 1W8CA 4JX7A 4M0YA 3ZO4A 2XNMA 2P4IA 3I5ZA 4ZSEA 3NIZA 4FA2A 5HD7A 3VULA 4LFIA 4KA3A 2OXDA 3NW5A 3O8UA 5A6OA 5AR2A 4PP7A 5JGAA 3WF5A 3WE8A 2YLEA 3D5UA 3A62A 1Q41A 4Y5HA 5IQCA 2YAKA 5LMKC 3PXKA 4F64A 1OIRA 3DPKA 3EFJA 4WG5A 1SVGA 3DLSA 4EWQA 5JRSA 1ATPE 4MXOA 5M4FA 5DT4A 2BKZA 4K8AA 3ZLYA 3R8UA 4AGUA 2B4SB 3QHWA 1HCKA 3VBXA 4WSQA 5IA4A 4BDGA 3CTJA 1G3NA 2CKOA 4QTBA 2NRYA 3ANQA 4KNBA 3C4WA 4K11A 3V8WA 3VUKA 3GT8A 2XEZA 1UWHA 3PWYA 5FP6A 3Q9ZA 3NUXA 5I0BA 5IMXA 1GIHA 3RWQA 3UNKA 1Q8TA 3PJCA 4FTQA 4BDIA 2CCIA 3HZTA 4BZOA 3GU4A 4DLJA 4M7IA 3ERKA 4D2VA 2JITA 3DNEA 4FG7A 2A4LA 3P7BA 4EH2A 3G90X 3OZ6A 4NEUA 2C3LA 2VUWA 3EN4A 2I0YA 3ODZX 3OW3A 1JSUA 3CBLA 4W4XA 5DEWA 4ZAUA 4ZMFA 3PJ3A 4XV1A 2WMRA 3JY0A 3H4JA 4XJ0A 2R3LA 3HP5A 2RF9A 3QC9A 3PVWA 3L8XA 4BCHA 2GS7A 2BROA 3EQGA 4M67A 3RAKA 4FKJA 3EN5A 3QCXA 4BC6A 2B9HA 1BL6A 2AUHA 4IWPA 2B1PA 4J97A 4EL9A 5A4QA 5IUGA 4ZSLA 3QUPA 1DI9A 3A4PA 4I92A 5HBJA 4ZZOA 3LAUA 4BBEA 3T9TA 3P7AA 1FQ1B 1OL5A 4WNPA 3VW8A 3TV4A 5C4KA 4L7FA 5D7AA 4JVGA 1YWVA 5DPVA 2UW5A 4AFEA 2HELA 5CEIA 3VQHA 3DLZA 2E9OA 2ERZE 2X7FA 3FYJX 2VTQA 3IW8A 4E6CA 3HEGA 4R8QA 3NLBA 1UNGA 3FMDA 4O6EA 5JKGA 2YZLA 3AC8A 3LMHA 4F9AA 2QOKA 4U0IA 4E4MA 1WAKA 3U51A 1YRPA 4UZDA 4JL9A 3AMYA 4DH8A 2YM8A 2WNTA 2C0OA 4AA4A 3COMA 3DB6A 3PJ8A 4IHPA 5HIEA 5AUXA 1E1VA 2ETMA 2C69A 3KXZA 5L6OA 2W1DA 2QKWB 3V51A 4AQCA 4QP2A 4UX9A 1RDQE 3KRLA 4L68A 4RIXA 2W1CA 3EFWA 3PE2A 4GT4A 1YWRA 2YLFA 4MH7A 3I79A 5CSXA 4HJOA 4PTGA 4E6QA 3RNIA 2WIHA 3O2MA 5DBXA 4ARKA 5J79A 3SXRA 3K5VA 3UVRA 3PG1A 1Z57A 1KE6A 2G1TA 4DTKA 4DEDA 3UJGA 3VS4A 3A61A 5JGDA 3UG2A 3Q53A 3U9CA 4BI0A 3MJ1A 3KULB 4Q2AA 3M1SA 4ZY5A 4R78A 3CTQA 1ZYJA 4H58A 3FSFA 3ALNA 3AT2A 4ZTRA 5IQDA 4TTHB 5JEBA 1ZOEA 2VTLA 4R7IA 4UMPA 5EI6A 4PTEA 3D4QA 5CVGA 4DGGA 5K4IA 5L6PA 5ACBC 1V1KA 2REIA 2WMAA 3PVGA 2UZLA 5AM6A 2IZRA 4ASXA 4DG3E 4USFA 1P4FA 3B8QA 3LFSA 4NTTA 4HYHA 5DNRA 1SNXA 4LUDA 2IW6A 4R7BA 1KE5A 4H3PA 3QQHA 1YOLA 4WUNA 5M4UA 3NW6A 4EH3A 4V05A 4D9TA 4FBXA 4WD5A 2QONA 4W4VA 5FTQA 5A9UA 2PL0A 1Q99A 4CKRA 3PZEA 4FT7A 4LGHA 3TXOA 1JKSA 4EHGA 2VAGA 4EWHA 4Y5QA 5KMNA 1DI8A 5CEMA 3W32A 3SG9A 2CLXA 4G9CA 4KIKB 4OTQA 4UWCA 3T9IA 4EOQA 3BYMA 2C5OA 2ITZA 5HX6A 4TKSA 3UNJA 4FC0A 4ACGA 4O0WA 4JG7A 3ZXTA 2PUIA 1J7IA 4UMRA 4D1ZA 4NW5A 2XNOA 4F6UA 3VRZA 3HV4A 4ACHA 4HNIA 4LRJA 2GU8A 5E8SA 3V5PA 5FM2A 4BDDA 2ZM1A 4DFXE 2HENA 3E8EA 4FTOA 4APCA 4IX4A 1YXSA 2XNGA 2ZV8A 1PJKA 2XJ0A 4A06A 1GAGA 2ACXA 4IEBA 3WI6A 4CFFA 3SC1A 3SQQA 5C1QB 5HQ0A 3P78A 4FSUA 4DFLA 4RX8A 3DFCB 3KXGA 4DLIA 3C7QA 4YNOA 5DE2A 3G9LX 3FHIA 4NU1A 1R0PA 3KVXA 3QTXA 4NL0A 3ITZA 2RL5A 3QZIA 3IW7A 3CEKA 4I0RA 4BN1A 3D2KA 5IUIA 2F2UA 5ACKA 3R9RA 4H1JA 2B0QA 2R3OA 3V8SA 5HGIA 2VTMA 3ODYX 1QMZA 2OWBA 5HTBA 5BYZA 1JWHA 4D55A 1UU9A 4MXAA 2R3IA 3UVQA 5EQPA 4YSJA 4ZS0A 2P55A 2R64A 1U5RA 5HESA 4E20A 3FMHA 4MBLA 4FV8A 3PXQA 4QP1A 2QOIA 3VJNA 4E1ZA 4IQ6A 4EZ7A 2A27A 3A7IA 5ANKA 4RFZA 4XUFA 4R6VA 5FGKA 3VUHA 3E3PA 3I7CA 4KAOA 4BIEA 3OROA 2I7QA 3UPZA 4PDYA 4M66A 1RJBA 1YHWA 4ACCA 4YPDA 3CKXA 2CSNA 3Q6WA 5I9ZA 3R9DA 2QO2A 3R1YA 3EYGA 5J9LA 2J7TA 3UC4A 4NYEA 4UBAA 3EQFA 2H6DA 4EC8A 4DE4A 1M2RA 4NH1A 3VUDA 2A1AB 1M7NA 2OJGA 4OTRA 3ZO2A 1BI7A 2PVYA 4IC8A 5FM3A 3TNIA 3LQ5A 5IU2A 3Q9XA 4XG7A 2C6IA 4EK5A 1TKIA 5K0XA 2Y6OA 4ZZNA 4DT9A 2QLUA 4FIIA 3PSBA 2WMWA 4JR3A 4XP2A 5L3AA 4IAIA 3EN9A 2Q83A 3OT8A 4FI1A 1YDSE 2PPQA 5B0XA 3MGYA 2CCHA 3PWDA 4GFGA 4JBVA 4F7NA 4YU2A 4XBUA 3TACA 5HVKA 4YZNA 4YZCA 3FZPA 4QMSA 3C13A 2Y4IC 2YFXA 4Z7HA 5C8NA 1ZZLA 2BR1A 3HA6A 3A7FA 4IAFA 5HBHA 2G15A 4NKAA 4F08A 3E88A 3PIXA 3RCJA 4E6AA 4JOAA 2YM6A 5L2TA 5IQGA 3QU0A 3KC3A 4QO9A 3DK6A 3KL8A 4MD7E 3E5AA 3K54A 2JFLA 2EB3A 3P7CA 4IACA 3FYKX 2Y6MA 4NCTA 2XJ1A 4RIXB 4ANLA 3AGMA 4EOMA 4YUQA 4QMLA 1UU3A 5BX0A 1OL6A 4NK9A 4MYGA 3NS9A 2HXQA 5ETCA 4F0GA 4DGNA 3BV2A 4QMYA 3KFAA 5CU4A 4U97A 2GMXA 3EQPA 3LFAA 2YIXA 3BE2A 3DKFA 4IB3A 3L8VA 5CZIA 2VN9A 4AOTA 4TL0A 4A4LA 1UVRA 4IWOA 4I23A 5HHWA 5I9UA 1G8AA 3N4TA 5HU3A 5K9IA 2BALA 2W0JA 4MWHA 4DEBA 3ZTXA 4O27B 2EXCX 1IA9A 4L46A 3SXFA 4CKIA 4RJ5A 5K4JA 5M07A 4FKVA 3EKKA 2IPXA 3BLRA 2JKOA 4PL4A 1VR2A 1WVYA 4BIDA 3KA0A 3QZGA 5IMEA 3PP1A 4U79A 1FPUA 3HUCA 2Z7SA 3Q4UA 1OM1A 3ELJA 2VGOA 5H8BA 2J50A 4ZK5A 2WU6A 1YDTE 2R7IA 3DGKA 2IO6A 5CVHA 4FZ7A 5BQ0A 4GKHA 3LVPA 3AT3A 1IEPA 4TYGA 5FXRA 2OF4A 4JAIA 2H34A 3FMJA 4ZTLA 2XKDA 3QTZA 2WQBA 2ONLC 5CS6A 3MPMA 1PRYA 4FKQA 4QYGA 3MIAA 3DQXA 2RFNA 2RFEA 4WT6A 3ET7A 4P7EA 2OIQA 3R7EA 4WKQA 4FTIA 4LV5A 3RAIA 3RPYA 2QR7A 4HW7A 3LMGA 2QOCA 3HRBA 1BI8A 4GSBA 4Q9SA 4ACDA 4B4LA 4F09A 3PDTA 4B6LA 2O65A 2XKCA 4BCOA 3V5WA 4YZDA 3S95A 3CD8A 5A3XA 5IA0A 3OWLA 5ANIA 1WFCA 3KF4A 3QCYA 2FGIA 3QGWA 3CIKA 5D7VA 5IEVA 2F7EE 2QI8A 2ZJWA 3KB7A 4CMTA 4FV4A 4HNFA 3V5TA 2O0UA 3DAEA 2IVTA 4ANMA 2QKRA 1XBCA 3HKOA 5EHYA 4QMQA 1Q8WA 3BU6A 3RALA 5A4EA 4CCUA 1L8TA 2X6DA 2C6OA 5CNOA 2QOQA 2QC6A 5EH0A 3MPAA 2YM4A 4KD1A 2R3MA 1STCE 3EL8A 4CTCA 5M56A 5IQEA 4PUZA 2GCDA 5C8KA 4FVPA 4FK6A 1DM2A 4JS8A 1DS5A 3OT3A 2EXMA 3Q60A 4YZBA 4ANOA 3BHTA 4AUAA 3QX2A 5EYMA 5LWNA 3MY0A 2J90A 3U54A 1LUFA 1P4OA 5AR8A 2XM9A 3DKOA 4LYNA 2EU9A 4M84A 4AN2A 2Z7QA 2XNPA 1H00A 1MQBA 5CSVA 1TQPA 3POOA 5DFPA 5BVOA 4ZTQA 3QQKA 3RK5A 5KX8A 1Q5KA 1XH9A 2ETRA 3DKGA 3EB0A 3OWPA 4U7ZA 5EDPA 4KKGA 3SW7A 2CHLA 3MH2A 3F3VA 5I3RA 2PYWA 2WPAA 4XNEA 4CRLA 5HTIA 5F9EA 2FSLX 2NP8A 4AF3A 4BYJA 2R3RA 4UMQA 4EOPA 4XLVA 4RGJA 4RBLA 3ZM4A 4TWPA 3PA4A 4TYEA 1T46A 3C0IA 3NNWA 4FZDB 1QL6A 2Y0AA 1OL2A 3ZUTA 3W1FA 1WVWA 2JDVA 4M97A 4CGAA 4C61A 5CAVA 3LQ3A 5M06A 3MYGA 5HKMA 1XBAA 5AV2A 2JDOA 3G15A 2OXYA 2IN6A 3NUPA 2GPHA 4O0XA 2FUMA 3EOCA 3PPKA 4ZJIA 3EQDA 2E9NA 2IZSA 5D11A 3E64A 4TNDA 1M7QA 3MW1A 4O96A 4Y46A 3ORNA 1PMUA 3IECA 4GT5A 2BMCA 2ZM3A 3PE1A 3HGKA 1WVXA 4X6QC 2G2HA 3DOGA 5DT0A 4XLIA 2PZYA 4EQMA 2Z2WA 1NW1A 4CMOA 4XV9A 3VS2A 5M4IA 3LFDA 3EN7A 2VWIA 2QG5A 2W1HA 2XK6A 1XH4A 3Q4CA 2ESMA 4BI2A 4NKSA 2OH0E 1Y8GA 4U3ZA 5KMLA 5JK3A 4FSMA 4FX3A 5M08A 3QQUA 4D0WA 4X7QA 4FTKA 1CDKA 1PXJA 1VEBA 4LRKA 3ROCA 3W55A 3HA8A 3GU5A 4MF0A 3DZQA 4KS7A 2RGPA 5LVLA 4XCUA 4GU6A 3IDBA 1YDRE 5CAPA 2EXEA 3O96A 2FB8A 1JSVA 4DC2A 5FUTA 3A4OX 3MESA 4XG6A 4AX8A 4DGOA 5IA3A 2RSVA 4LOPA 3LZBA 4JNWA 5ANDA 4X3FA 4XX9A 3OCTA 3UIXA 5IQFA 3AXWA 3KXMA 2WTKC 1UKHA 4OBOA 4QD6A 1U46A 1HCLA 1YKRA 4JBQA 5HVJA 2W1EA 4NW6A 3VS3A 4FE2A 4YJPA 4PQNA 4BCQA 3GBZA 2BIKB 3BELA 3HMMA 4QP7A 4XG2A 4NUSA 3CR0A 4OR5A 3ACKA 5AP2A 4BZDA 5A46A 3QUDA 2CKEA 5A4LA 4FL1A 1KV1A 2GDOA 2IW8A 3S00A 3OUKA 2B52A 2OFVA 4FEQA 5KMKA 3WZEA 3OFMA 4YJNA 4RG0A 5HE0A 5E91A 4GVJA 3G0FA 3THBA 3REPA 3O17A 1MUOA 1H1QA 4QP4A 4O91A 5CWZA 4N6YA 3LXLA 3UBDA 2FA2A 2VNYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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