2W96B

Crystal structure of cdk4 in complex with a d-type cyclin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
289
structure length
267
Chain Sequence
SRYEPVAEIGVGAYGTVYKARDPHSGHFVALKSVRVPNGEEGLPISTVREVALLRRLEAFEHPNVVRLMDVCATSRTDREIKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPGLPAETIKDLMRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQMALDPVVVTLWYRAPEVLLQSTYATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGLPPEDDWVPEMEESGAQLLLEMLTFNPHKRISAFRALQHSYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Cell cycle
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of Human Cdk4 in Complex with a D-Type Cyclin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords G1/S-SPECIFIC CYCLIN-D1
total genus 57
structure length 267
sequence length 289
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2w96B02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2w96B01
5B0XA 4CZYB 1KV2A 2X9EA 4ZTNA 2ITZA 5CASA 4FZFB 1Q8ZA 4XV2A 2G2HA 2GPHA 3VUGA 4I0SA 4X6QC 5CSVA 4X3FB 5KMJA 3UC4A 3UIMA 2FSLX 4R5SA 2C1AA 2JDSA 2YJRA 5EYMA 1BL6A 2XJ0A 2VWXA 5HD7A 3FLZA 3NLBA 3R8PA 4NU1A 4APCA 4XG8A 2I0HA 2XCKA 4XG9A 3G9NA 2OFUA 5H8BA 3HVCA 3OVVA 4TYHA 3QCXA 3EIDA 2GNLA 3BQCA 4BDHA 4C0TA 4CG9A 3F3UA 2W7XA 4IZ7A 3WE8A 5IQEA 4ACMA 2UZWE 2XP2A 3ZUUA 3MN3A 1FPUA 3R8UA 5L2QA 2YLFA 4S31A 4QYEA 4K8AA 4DLJA 4UMPA 2ZV9A 3CGFA 2E9OA 3LFFA 4PUZA 5HESA 3I0OA 2Z7SA 4P5QA 4RG0A 3GEQA 4U41A 5E91A 3RMFA 3DKFA 3ZC6A 3Q2JA 3E92A 5L6OA 4FKVA 1Y8YA 4Q5EA 4O7SA 2HAKA 5HO6A 3TKUA 3MWUA 2GHMA 4EHEA 4OGRA 4V0GB 4BDEA 2C1BA 4ZMFA 3GC8A 4YJSA 2YM4A 4FKLA 2ZM1A 4JOAA 4RVKA 3II5A 2QU6A 4QQJA 5CVFA 4YTIA 3UYSA 4ZY5A 3MESA 4PWNA 1TQMA 1ATPE 2G1TA 2QVSE 3E64A 3I6WA 4DCEA 1IEPA 5D12A 4R5YA 3ET7A 3KB7A 3VUDA 4FA2A 5IU2A 1ZY5A 5AX3A 3UVPA 5HNBA 3CPCA 1WBTA 4UWBA 3R01A 3DV3A 3KGAA 3ZUTA 1NVSA 4EKKA 1URCA 1QPDA 2X81A 2RFDA 3NUUA 2X2KA 4GT4A 3C7QA 3UBDA 4AE9A 3BGZA 3KULA 3EN9A 2X8EA 2VTHA 5IA5A 2B54A 4JBVA 3PG1A 3S95A 4UBAA 2OU7A 4UX9A 4D1XA 4U45A 1MP8A 3P5KA 4HGLA 3VC4A 5GJGA 4I6BA 3R02A 1CKJA 3RI1A 3TV4A 1ZOEA 3FQEA 3I60A 2F7XE 2X8DA 4U81A 4F99A 2OJGA 4FV5A 2EB2A 3MV5A 3UO6A 4F63A 2J5EA 4MD9E 2VTSA 2F2CB 4X3FC 4YJUA 5I9UA 5C03A 4XMOA 3W8LA 4BKZA 3DJ5A 3MFTA 3KN5A 4OBQA 5JRQA 3MA6A 4H39A 5JK3A 2J7TA 2XNNA 3PUPA 4I41A 2I7QA 3C0GA 4FSMA 4PRJA 4JQEA 4WG4A 4W4WA 1O9UA 2WIPA 3MI9A 3SV0A 3VAPA 5AV4A 4FT3A 2SRCA 5M08A 2PVKA 4R6VA 2BROA 3R73A 4O1PA 3QRTA 4BZOA 3SRVB 3QCYA 2IZRA 3SOCA 4L67A 4YTCA 1G8SA 5L8JA 1R78A 1DAYA 5LWNA 3R00A 4E5AX 2B9FA 2X7GA 5EI2A 1PXOA 3LJ0A 1PXIA 4JI9A 3ZHPC 1Q8YA 5A46A 2G01A 2PE1A 4OT5A 1A06A 3GOPA 4ORKA 3QTWA 4DEAA 3TACA 2B0QA 4BICA 2C5NA 3A99A 3WYYA 4MAOA 3OXTA 4NIFB 1JKKA 4I6QA 2XK4A 1JKTA 4DTBA 4EHVA 2XRUA 3QTZA 4WUNA 4EH5A 4H3BA 3U6HA 3OWKA 4FV9A 3VF9A 3TDVA 3HMNA 2C3KA 4YZNA 5EYDA 3RNYA 4BCGA 2QO7A 4DH8A 3DBCA 3OOMA 4GW8A 3RPYA 3QXOA 4BCMA 2XIYA 4ANSA 4DEGA 4I6HA 4UB7A 5EK7A 1STCE 1TVOA 3IDBA 4UWYA 4FODA 1W84A 1Q5KA 5BVOA 5KMLA 2BIKB 3COMA 3BWFA 3WIGA 1V0OA 4GU6A 3GUBA 3CKXA 4GJ3A 3KEXA 3MPTA 4O0RA 2GTNA 4YJNA 2QOCA 4FT5A 5AUVA 4QMOA 3E8CA 2C0TA 5M06A 3WYXA 4D0XA 1T45A 1F5QA 2XH5A 3QKMA 2WQNA 5IUHA 3BI6A 4YJRA 2BFXA 4WIHA 3AD6A 5L8KA 4TT7A 2UW4A 2BTSA 4Z9LA 1UNGA 4XG3A 2OJ9A 3QCSA 1SNXA 3KXGA 2X4FA 4B7TA 3KMMA 4GUBA 4IW0A 4QMVA 2JGZA 3ZBFA 4WHZA 5HIEA 4D58A 4ENXA 3VNTA 1U54A 4XP0A 2B9IA 4S2ZA 5AWMA 4OTWA 3RP9A 3EL8A 2C3LA 2QO9A 3DKGA 3G0EA 1PXPA 4JQ8A 4L3LA 5I3OA 2VTNA 4EYMA 1URWA 3HEGA 4IZ5A 4IAYA 2BAKA 3WZUA 4FNWA 4EOJA 5L2TA 2IW8A 5LXMA 2C68A 4FUXA 5E8WA 4BBMA 2XNOA 3BLRA 3LFBA 3MJ2A 3QTUA 1MQBA 4FKQA 5C27A 3UQGA 4JRVA 5I9ZA 4F7JA 2CN5A 4ACDA 1TKIA 4JDHA 4HPUE 2ZB1A 4UYAA 2YIYA 4HVGA 3DXPA 3AT2A 5AR5A 2R3LA 4EH8A 1Q24A 1YXSA 4X2FA 4PTGA 2YZLA 1SZMA 3I79A 5ETAA 3ZOSA 5EKNA 2OXYA 2IW6A 4EQUA 3C50A 4GMYA 4WO5A 4YNOA 5DRDA 4ZTQA 3M11A 2R3IA 4C62A 2IN6A 3FHIA 4BIEA 4O84A 2UW0A 3EN4A 3FI3A 4IAAA 1WCCA 3GC7A 4GRBA 5E92A 3LCTA 4DEBA 2VZ6A 2GCDA 1UU8A 1OPJA 4M3QA 4HGTA 2PVYA 2ZOQA 1SMHA 3EYGA 3PFQA 4UMQA 3QUDA 2CLQA 4TW9A 5HCXA 1YVJA 2KTYA 5JFSA 5EDRA 4Z55A 3DNEA 3LIJA 5D10A 5HG7A 4O83A 3PVUA 3KRLA 3FAAA 5H8EA 4E73A 5HE1A 2OXXA 2QOKA 3I4BA 3CPBA 4MHAA 4P7EA 3T9TA 3UYTA 1H26A 1H1PA 1H01A 3R28A 2XF0A 2XKCA 3T9IA 4DEEA 2UW9A 3ZRLA 3QQLA 3AQVA 4BZDA 2YN8A 2G9XA 3BYUA 2JBOA 3HV6A 2J5FA 3LFQA 3E93A 4GJ2A 3JY0A 2JIVA 2NO3A 2R3NA 3PRIA 3RM7A 4AGUA 4IWPA 4XEYA 5CSHA 3ZXTA 4KIQA 2XKEA 3FQHA 3HA6A 2XNBA 3BYOA 2AYPA 4UN0C 2BALA 3SQQA 1PXKA 3H9FA 5A3XA 3Q3BA 4EQMA 4C4JA 3ZEPA 3MVJA 2B55A 3G2FA 3GP0A 2GQRA 4CSVA 3DQWA 1FOTA 3DBDA 2WMVA 2XBJA 3C4CA 2PE2A 3BE9A 3WF8A 4ITJA 2QCSA 4BB4A 1MQ4A 5AUYA 3GCSA 5TR6A 3RHXA 2PVLA 3B8QA 3W18A 1H4LA 5J5TA 2VO7A 3QA0A 4G3FA 3LFNA 4G6OA 4U80A 3DK7A 3FZRA 3O50A 2XM8A 4PDOA 4Y83A 1PMUA 2R3KA 1FVRA 1FQ1B 3HKOA 4AZTA 4ZY4A 4EQCA 5DOSA 3A7GA 4PX6A 4U8ZA 4C7TA 3TI1A 5FUTA 2RGPA 4I20A 3ZO1A 1H07A 3GBZA 3IW8A 4WT6A 4C37A 5CF4A 3F5GA 2BAQA 4FK3A 3ZS5A 3H10A 4F9BA 1XBAA 3BQRA 4BHNA 4R3CA 4F0FA 1PJKA 3C5UA 3UP2A 5AUWA 5HO7A 3FEGA 3OZ6A 1Y91A 2PVMA 2VTTA 5E8TA 4ZY6A 3TJDA 4DGLC 3ZONA 4P5ZA 1VR2A 4FIFA 2YHVA 4BDKA 4GEOA 2W1GA 3E7OA 3KU2A 4E20A 3L1SA 4JG6A 1JSUA 3CC6A 3CXWA 5CU6A 5IF1A 3LMHA 3O96A 3F2NA 3L8VA 4J95A 2WMBA 4QMSA 4WNPA 3OP5A 3TZ7A 3IQ7A 3LQ8A 4WKQA 1O6KA 3TIZA 3DB6A 3RWPA 3IW6A 4QPAA 4X3FA 3UOKA 1ZOGA 3QYWA 3VBXA 5TOZA 2OICA 4TN6A 1XHAA 1UU7A 5A14A 2VO0A 4YBKA 3V8WA 1PY5A 2FGIA 2VX0A 4U7ZA 4CKJA 4GSBA 4EL9A 5T3QA 2WMXA 3WI6A 4YSJA 3EZRA 3OY1A 3V5LA 3C51A 2W4JA 3UO4A 3KQ7A 4RJ5A 1RQQA 3TZMA 2YERA 4C59A 5EW9A 5HE2A 3ZRKA 3F7WA 3PG3A 1JAMA 4FV1A 4DAWA 5DT4A 4KBKA 5M4UA 3GCPA 1AD5A 2BILB 2VAGA 2XNMA 5K3YA 3LQ3A 5FXRA 5AV1A 4BIDA 1H1QA 3FLSA 1CTPE 1ZWSA 5GINE 2B1PA 4FEQA 3HV7A 4BWKA 4C4FA 4DT8A 3RAHA 3V5WA 3FC2A 4EH9A 4IC7A 3S2PA 4LQMA 2ACXA 5KE0A 4YLLA 3QRUA 4V0GA 4AFEA 2PY3A 5E8YA 5HG5A 4I5CA 3ZLXA 4F08A 3K5UA 3HMPA 3NUAA 5I3RA 4TYJA 4QMWA 2WZJA 4UALA 3QC9A 3GQLA 3ZFMA 2JDTA 1ZYCA 3CJFA 3MH2A 2J51A 5C8NA 2OFVA 5HICA 2CPKE 2XA4A 3R6XA 4FT0A 4XS2A 3Q9XA 4C36A 3O0GA 5LCJA 3ORPA 3W2SA 4J98A 2JD5A 3OC1A 1PMEA 3A8XA 2DWBA 5DA3A 5KMIA 2VWZA 4AE6A 5HVKA 3GCUA 1YI3A 5ETFA 3LCOA 4MD8E 4ZLZA 4RC3A 3T3UA 4MBJA 3UIUA 5CTPA 5CXZA 5CLPA 2G2FA 3M1SA 2R4BA 3Q52A 4G31A 2JKQA 5ACBC 1X8BA 2A0CX 3NEWA 5A4TA 1BUHA 2A4LA 4QMYA 5IPJA 3HZTA 5CENA 3AOXA 1GZNA 3AD5A 3D7ZA 3NIZA 3JR1A 2J90A 1ZYDA 4AUAA 4DYMA 5L6WL 4A9YA 2YM7A 2VD5A 5CQUA 4E5WA 4QTEA 4CLIA 3C13A 3BU5A 4WBBB 4ONAA 4DEIA 5F9EA 5DIAA 4XOZA 3DQXA 5TT7A 1YXUA 2YIWA 3QTIA 4R8QA 4XHKB 1YOMA 2C5YA 2IWIA 4HVHA 4F9WA 3GU6A 1ZAOA 3MJ1A 5KKRB 1KE9A 2OJFE 4K18A 1YWVA 2W5AA 3D5UA 3GU7A 1O6LA 3O51A 3SC1A 4EC8A 4RIYB 5AR2A 2WOTA 3SRVA 4E4NA 2R2PA 4QP2A 3FI2A 4EKLA 4YJTA 4C4HA 4AS0A 3KRXA 1OKZA 1VYZA 5IH6A 2VTRA 3ZDIA 2PTKA 4YMJA 4ZTSA 4RBLA 4BCHA 4OTDA 5GZ9A 4UMUA 2J9MA 3OXIA 4OTIA 3CLYA 3VUTA 4ANOA 2UZNA 2I0VA 5IQBA 5EW3A 4F0IA 3G6HA 2P2IA 3NAXA 4GG7A 4C2WA 5JFVA 3MY1A 1Q61A 4IACA 1J1BA 4BDGA 2J2IB 2OW3A 4APPA 4D55A 5CAQA 4AZFA 4NIFA 4FTRA 1NXKA 3MH0A 4FVRA 1YXTA 1WZYA 2H9VA 5HGIA 2C30A 2GNGA 4L00A 2KULA 1RJBA 4YHFA 5CT0A 3TKIA 5EG3A 2Q0NA 4JJRA 2YIQA 3AC1A 1PXNA 4C3RA 3QUEA 1E1XA 3QXPA 5AP4A 4CTBA 2PU8A 3VS0A 2ETMA 1E1VA 3FC1X 2WELA 4IVAA 5FM3A 4KIPA 3OEZA 2J0JA 4QTCA 4OAUC 2Z7LA 5AJQA 5IDPA 3U55A 5CQWA 3HGKA 4ASDA 1OITA 3S1HA 1YW2A 5DI1A 1KWPA 2ITPA 2Q0BA 4N6YA 2CKOA 3F3VA 4IX6A 3QYZA 1GIHA 2G15A 5KUPA 2JFLA 4GV1A 4FV7A 4JQ7A 4AW0A 3PY0A 2WMWA 5CSWA 5H2UA 2EXMA 4ASEA 5J9LA 3QD3A 1UNLA 4TYEA 4YGAA 4LUEA 4BBFA 5HU3A 4R1YA 4CFWA 1T46A 3WF5A 1XH8A 5D41A 1UWJA 2JKMA 3EWHA 1XQZA 4DFXE 1DAWA 1ZMVA 3MB7A 3H4JA 3QRKA 4RFMA 5AP6A 4DGOA 4KRDA 2HY0A 3DCVA 2H34A 4QTDA 4RX8A 2ZDTA 5KKRC 3IO7A 5ANOA 4S32A 3E8DA 4YHTA 3P7BA 4PTEA 3NWWA 4AP7A 2HIWA 4FEWA 3MVHA 1ND4A 5CU3A 3UJGA 2G2IA 4M69B 4BBEA 3UG1A 2E9UA 5B2LA 2BZIB 2ITTA 2XNPA 4CEGA 3VHEA 2CGXA 2UUEA 1U59A 3O2MA 5BMSA 3BBTB 4RQKA 1B6CB 1V0BA 4FIEA 5CX9A 3WARA 4FR4A 1P4FA 1UVRA 4LYNA 3DT1A 3IG7A 1AGWA 4C4IA 4FSRA 4CT1A 5CS6A 2FYSA 4AZEA 1ZYSA 4KS7A 4W4VA 3ZMMA 4YP8A 3COKA 3AC3A 2YDJA 3E3BX 3I0QA 4PPAA 2VWBA 4L01A 1BX6A 1Q8UA 3PJ2A 5JRSA 5FEEA 3W2QA 3TNWA 5LOHA 1B39A 4F7NA 3NGAA 1UU3A 4I5PA 5ANIA 4HYSA 2OJIA 2B4SB 1HCKA 3I7CA 3ZZWA 4AW2A 3MW1A 4YUQA 4M12A 4O82A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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