2W9FB

Crystal structure of cdk4 in complex with a d-type cyclin
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
288
structure length
261
Chain Sequence
RYEPVAEIGVGAYGTVYKARDPHSGHFVALKSVRVPNGEEGLPISTVREVALLRRLEAFEHPNVVRLMDVCATSRTDREIKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPGLPAETIKDLMRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQMATLWYRAPEVLLQSTYATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGWPRDVSSVVPEMEESGAQLLLEMLTFNPHKRISAFRALQHSYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Human Cdk4 in Complex with a D-Type Cyclin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords G1/S-SPECIFIC CYCLIN-D1
molecule tags Cell cycle
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 261
sequence length 288
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2009-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2w9fB02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2w9fB01
4Z7GA 1H1QA 2X9FA 2XP2A 3LLTA 4I24A 4QMWA 5AR4A 4N70A 4GS6A 4L9IA 5GJDA 4RJ3A 3H30A 3COKA 3R2YA 4NJDA 5IQBA 4HGTA 2JFLA 5DHJA 3SA0A 3U55A 4QP6A 3PA3A 4FV6A 3GB2A 1CM8A 4J71A 3Q9WA 4NKSA 4FKTA 3ZO1A 4U44A 2OK1A 1H01A 4HYSA 4K0YA 4ZSAA 3SX9A 3IQ7A 3PWDA 4WNPA 2PZRA 4OR5A 4YO6A 2BKZA 4ENXA 2PPQA 2FSTX 4RJ4A 3CTHA 3D0EA 3THBA 3VS4A 4BVUA 4GG5A 2PU8A 3R8VA 1GZ8A 1AQ1A 3TV4A 2CKEA 4R5YA 5K4JA 3HRFA 3ZLWA 4C59A 2ZV7A 4CZYB 1FPUA 4NJ3A 3KY2A 4ACDA 5A3XA 5KMKA 2LGCA 4KRDA 1LPUA 3TDVA 5GZ8A 3M1SA 5K0KA 4RJ8A 1REJA 5A4TA 3SRVB 1ZY5A 1FOTA 2W99B 3KCKA 4CZTA 4BDGA 2BZKB 2OICA 4BN1A 1MQBA 3HUBA 4TN6A 3QQLA 4CNHA 2WXVA 2XNNA 4PP9A 3HZTA 1JPAA 3IGOA 3TZ7A 1TQMA 4D1XA 4RVKA 1OM1A 1WVWA 4L00A 2XM9A 5DFPA 1Q97A 3HMNA 3DLSA 3G6HA 3GC9A 5JZNA 3D5WA 3FPQA 2XNMA 3LCTA 3QRJA 4HCVA 4DG0E 5M55A 3R01A 5CEQA 3EMGA 4YZBA 5D12A 2QOLA 4MWIA 3G5DA 2YLFA 4Y5QA 4FSZA 2WTVA 3VS7A 2C6MA 3JVRA 3U8WA 2XNOA 4YJQA 4EH4A 4FTAA 3ZLSA 3FSFA 3LJ1A 5M57A 4WNMA 5AP4A 2DYLA 4I22A 3HL7A 3KK9A 3QTQA 2VTNA 3AT2A 1ZZLA 2VGOA 4WG3A 3SXRA 4CFWA 3VULA 3TM0A 3C51A 2EXEA 5HVKA 1B6CB 2B0QA 1PRYA 4QMVA 4FZDB 1Q3DA 3PA4A 3ZUVA 3R71A 5ANKA 2WQEA 3QQUA 5HIDA 4BTFA 1B38A 2ONLA 3E8DA 3FL5A 4FK3A 4QP1A 4H39A 5AADA 1H27A 2IW8A 2G01A 5CF5A 4YSMA 4K77A 4QP8A 5K3YA 4EOIA 1VYWA 1BI7A 4FTQA 3DZOA 5CS6A 3UQFA 1LEZA 2A0CX 2OSCA 3IECA 3QF9A 3UZPA 4O86A 2BRHA 3QWKA 4WRGA 4AW2A 1HOWA 4AZSA 3EL8A 5FXRA 2HZ0A 5E4HA 4D5KA 4C38A 3FMJA 4S31A 3W2RA 5DE2A 2BZHB 2QOCA 4IJPA 3RTPA 1YI4A 5GZAA 5HNBA 1Y91A 3NCZA 5FBNC 5FM3A 4C37A 3LFNA 4EK5A 3FZSA 4QYHA 3PP0A 3R7UA 3TTIA 4FKWA 4O83A 2AYPA 5J8IA 5M08A 3EL7A 1WBTA 2CGXA 5AP3A 3LJ0A 4EQCA 3LFDA 4Y73A 4BCQA 4O0TA 3DGKA 5LMKC 4JDKA 4N6YA 5HZNA 5JMSA 2VWYA 1XH5A 3D7TA 3R7IA 2C69A 5E1SA 4EORA 1TQIA 4I4FA 3R7OA 5JZJA 4FSYA 3M11A 4BI2A 3BIZA 3MIYA 2IW9A 2VTRA 3GFWA 4RIYB 4UX9A 3UGCA 3G9LX 1P5EA 5AM6A 4PMSA 1GIIA 2W1GA 4BDCA 5KHWA 5A46A 2ZDTA 4AWIA 4YLLA 3OY1A 4HNFA 4ZZMA 4DEAA 1ZXEA 4F7JA 4DFUA 5FTOA 4E5AX 1OBDA 1G5SA 4NH1A 4F7SA 4BL1A 2X6EA 2NP8A 3CTJA 4F63A 5FEQA 2J50A 3CGFA 3L1SA 4EYJA 1Y6BA 2O65A 3DQWA 2CKOA 5EM8A 5D1JA 4B8MA 3SOAA 3WF8A 1FMOE 5CAQA 4P4CA 1MRYA 2V22A 4FEVA 4R78A 4WUAA 4CFUA 4E3CA 3K2LA 3C5UA 4OTIA 2E9OA 5FP5A 2Q83A 5IQEA 3GU6A 3QD2B 4AGDA 4EJ7A 4WO5A 1JSUA 1LR4A 4HGSA 2R64A 3BGQA 3FLZA 2WMUA 3SVVA 2HK5A 3OW3A 4IM0A 2GS2A 4GW8A 3SXSA 5CQWA 3HV5A 2XM8A 2GFSA 2JKMA 2XNGA 4AA0A 4E20A 4OTRA 3COIA 3CLYA 5EM6A 4EOSA 2HY81 3Q32A 4LGDA 1OZ1A 3L8VA 4H1JA 2Y4IC 3CCNA 2O8YA 3OS3A 4C02A 5EQYA 2QCSA 5DWRA 1OL6A 4BWKA 3P79A 1J7UA 2W1FA 4FVQA 3SXFA 4YZDA 1OPJA 4LUDA 4FSMA 2JKOA 3NYXA 2SRCA 2WQMA 4QTEA 2I0VA 3QD0A 3O8UA 4NIFB 4C61A 5HNIX 3CR0A 3QL8A 3TV7A 3UG1A 2G2IA 4B9DA 1J7IA 5CEKA 2VO7A 4D4VA 4EBVA 3DJ5A 3LFAA 5I5ZA 3DNDA 3HAMA 3DFCB 5LVMA 5KE0A 3RK5A 1IRKA 4LMUA 3BU3A 5G6VA 4QTBA 4RIOA 2OU7A 4ANLA 3DK3A 1OVEA 4W4XA 3MI9A 5J87A 3ZFXA 4DCAA 2ZM4A 1SVHA 5ANJA 2JIVA 4QQJA 2BDFA 4DFXE 3E88A 2YDIA 2XBJA 2QLQA 3QRUA 5CU4A 3MN3A 2C0TA 3OFMA 5CASA 3R8MA 5M06A 1P14A 1ZY4A 2VTQA 4FIFA 3TEIA 2NRYA 3H9OA 3PE1A 2C6IA 3AC5A 3QZFA 4KSQA 3ZU7A 4YURA 2I0YA 4O7LA 3SD0A 3NEWA 1ZYCA 4RX7A 5FDPA 4KABA 5K5NA 1G3NA 1YHWA 4IVDA 3SQQA 5CU6A 1M52A 4C0TA 4BICA 2YHVA 4JQ8A 4FV8A 4IC8A 3MA6A 1LEWA 4F9YA 2JDOA 4XV9A 1UKHA 3DZQA 1M2PA 5KZ0A 4ZIMA 3DXQA 3ZC6A 3HMIA 3K5UA 3PJ8A 4ANOA 1DM2A 3N4TA 3F3VA 3FY2A 3VS1A 4O84A 3OY3A 4NEUA 4BWXA 3IW7A 3W2CA 3VW6A 4XUFA 5TR6A 2VX0A 4F0GA 4WSYA 1XH7A 5M4FA 3TZ8A 3BRBA 3CJFA 3HNGA 5HO6A 4EOPA 3NS9A 2R7IA 5LMBA 2UW7A 2XJ0A 3PZHA 4ZK5A 4BDJA 4CFMA 5FTGA 4JRNA 3ENMA 3FL4A 3NW7A 4FTRA 4YBJA 3VS5A 4AU8A 2UW5A 4RRVA 2QOHA 3KA0A 3RPVA 2QR7A 3VHKA 3Q52A 4YJPA 3BX5A 2XBAA 3WBLA 4E6DA 4CCUA 3VBVA 2QD9A 4MNEA 4U0IA 5JGDA 3KXZA 5D7VA 2J5FA 3T9TA 1OL5A 3COMA 4ACGA 4FV7A 2XKFA 3A62A 2R3QA 4NT4A 4JAJA 1I09A 1O6LA 1CDKA 3BQCA 4W8EA 3W33A 4E73A 4JBQA 1UU7A 2CHLA 5FTQA 2VWXA 1FGKA 4PQNA 4PPAA 4BGGA 3W18A 3F82A 4X6QC 5CALA 3OXZA 3QCSA 2PVFA 4DBXA 4DE4A 1XO2B 2V7AA 4F0IA 3S0OA 2VUWA 4BTJA 3F5PA 4G9RA 2CN8A 3PXRA 2PUNA 4R7IA 2C3KA 2GNFA 4U7ZA 4I0TA 3QYWA 2OFVA 4U42A 3EQRA 4Y8DA 3P4KA 5AV1A 3RJCA 4F99A 1OB3A 5CF4A 3LVPA 3HV6A 5IH6A 4QMLA 3D4QA 3BELA 2WTDA 4ANSA 2GMXA 3CP9A 4QMYA 2RFDA 2CKPA 4L67A 2A2AA 4RX8A 3NR9A 2PZIA 1W8CA 4EH9A 3EFKA 4I5MA 3DBDA 3EQCA 1H08A 1JLUE 5IA5A 4Y85A 3MS9A 4F6WA 4CFXA 1J3HA 5LVNA 5B2KA 4GKIA 2GNJA 4U45A 3KULB 3I79A 1H28A 3E3PA 2Y6MA 4J8MA 4UMPA 1PXKA 1MQ4A 3PG3A 4HYHA 4JT3A 5EI2A 2WQNA 4HGEA 4BCOA 4U43A 3W10A 4MNFA 4C62A 2PZ5A 4I3ZA 4U97A 3DB6A 3AC1A 3NAYA 4CYIA 2GHMA 3PDTA 4O7SA 5IA2A 1E1XA 4BZNA 1KSWA 4N6ZA 4PDPA 3G51A 3EIDA 3ALOA 3R02A 5IZFA 3QTIA 3SW7A 5CU0A 4JDIA 5CI7A 5IDPA 2YIYA 4Q5HA 4KNBA 4E4MA 4JG8A 1UWJA 2ACXA 4JOAA 3RAHA 3OCGA 1PHKA 3QQKA 1K9AA 2GSFA 4P2KA 4A9RA 3ID6C 3Q4UA 5HE0A 2YN8A 4FV3A 2RFSA 3LFFA 2HZ4A 4DGOA 3TG1A 3D5UA 5KCVA 2BDJA 1P4FA 1NXKA 2IVTA 3R9HA 4CKIA 4RWJA 5DPVA 3VBTA 4BFMA 3ZOSA 1L8TA 4C7TA 1YI6A 2YLEA 3OT3A 3QU0A 5LMAA 3I0QA 4ZTMA 2R3JA 5I3RA 4GVAA 2J4ZA 3CSVA 3N4VA 3LFSA 4EHEA 5ANIA 3QUEA 2BALA 3VBQA 2GPHA 4M0ZA 4MXYA 2QHMA 3DNEA 5ANGA 3BE2A 3P08A 3TIYA 2WMAA 3QKMA 4MBLA 5T3QA 2B9JA 2OJ9A 1B39A 1O6YA 5BVEA 3ZONA 4BIBA 3EFWA 2EVAA 2ZV2A 4XX9A 4X2GA 4E6QA 5BVFA 2WTKC 4X3FB 4MEDA 1OUYA 1FQ1B 3FMHA 3ORPA 3P78A 5I9WA 4K1BA 3FZOA 2CKQA 3DXPA 2QURA 1XBBA 4QP4A 3U6HA 3CD8A 4ONAA 3MVLA 2J90A 4L42A 4AP7A 2ITNA 2WMXA 4EK8A 2Z60A 3EKKA 4L46A 5D10A 5KMMA 3NNWA 4YR8A 2UZTA 5AX9A 4AOTA 3IG7A 3PG1A 4IANA 3T8OA 4GL9A 3PY1A 3II5A 2NO3A 4PPBA 1BUHA 4FKLA 5CLPA 2Y9QA 4UV0A 4E1ZA 5AUTA 5HX6A 2YA9A 4JXFA 2OJGA 3UZRA 4BKZA 1DS5A 3PLSA 4I5HA 4BCJA 2ITQA 5EK7A 1F3MC 3LCDA 2F7XE 5BVNA 4PDSA 4ID7A 4ACHA 2VU3A 1JAMA 2YJSA 3ORLA 4XP0A 3R7VA 5JFVA 4EZ7A 5DLSA 2PVHA 3GP0A 1ZOEA 4AG8A 2WGJA 3R1QA 4AS0A 4QMUA 5TF9A 3UOHA 4LMNA 2OH0E 2BTSA 3EZVA 3EHAA 4FSRA 5L2QA 1PKGA 4FV4A 4DITA 3MY5A 5H8GA 3UO5A 4IC7A 1U5QA 4EC9A 4HNIA 3KC3A 4WRSA 4F6UA 3ULIA 5LOHA 4FZAB 4F64A 4G3FA 1UNGA 5L6OA 1YWVA 3CC6A 1CMKE 2VZ6A 5K4IA 5ETAA 5IISA 4II5A 2ITPA 3BZ3A 4O6EA 5C01A 4FT9A 1STCE 4EH5A 2JGZA 1WBNA 4OAVB 4IDTA 5AV2A 5EOLA 2W1CA 3OTVA 3UC3A 3DXNA 4UMUA 3DU8A 4EBWA 1RQQA 1ZMVA 3B8RA 4KB8A 4DFYA 4C2WA 3FMLA 2XUUA 4IWDA 2ITZA 5JFWA 3ODYX 3VBXA 5EW9A 3Q9YA 3KXGA 5DT4A 4HYUA 2V0DA 4ITIA 1AD5A 4IB3A 5FQDC 2LAVA 4PDYA 4O2PA 3FQHA 1YDSE 2R3IA 4N57A 1WVYA 2PVMA 3F66A 4F0FA 3MJ1A 4FF8A 4CFFA 5ICPA 2X7FA 2YIXA 1H26A 4J97A 4AT5A 3TDWA 3L9NA 4RQVA 3A4OX 3AXWA 3QZHA 5AM7A 4NM7A 5DIAA 3U9CA 4USDA 4JQ7A 2ZVAA 5DMZA 2C5VA 3F3UA 4O91A 5FP6A 3UVPA 4AT4A 4S33A 2WOUA 4R77A 3SGCA 3BU5A 3KRXA 3MYGA 5DT3A 3VIDA 5L3AA 4AZTA 4QMQA 4M0YA 2I40A 3RM7A 4EC8A 4GUBA 4TYGA 2ZAZA 4IFGA 5HQ0A 2EUFB 5KX8A 2R4BA 3UNZA 3V6RA 2ITYA 3PXFA 4BHZA 3RVGA 4DAWA 5JN2A 3I81A 1FBNA 4AFEA 5B7VA 5HIBA 3S00A 4UZHA 4XV1A 4YLKA 3FI2A 3OT8A 2XK3A 4L3LA 3MH0A 4I92A 3RPYA 3SW4A 1OGUA 2B9IA 4BCIA 2C6EA 4IVCA 2WOTA 1P2AA 1PY5A 3ZYAA 5A4CA 2BZJA 2X1NA 2ZV9A 3S95A 5J9ZA 4HVIA 1FVRA 1Q8ZA 2DQ7X 3IDPA 3LPBA 4JJRA 4J96A 4L6QA 5EM7A 3VRZA 3UOKA 3LQ3A 4X6RA 4KIOA 3ZO4A 3CPBA 3OW4A 3IW5A 4BKJA 3O2MA 4TYIA 4A9UA 3HKOA 3EN4A 1IASA 2JC6A 3C5IA 1BLXA 1R0EA 1RW8A 2J6MA 2VTJA 3DV3A 2RG5A 3TJDA 3V5JA 4ANQA 4A07A 2C1AA 1BYGA 3MFTA 3DKFA 4XRJA 4X7QA 4BZDA 4AAAA 4IM2A 5LMKA 2Y4PA 3NIEA 4BTKA 4JR7A 2Z7LA 4BDAA 4GKHA 4ITJA 4XG7A 2BRBA 5BQ0A 3RKBA 3GOKA 5IA0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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