2W9FB

Crystal structure of cdk4 in complex with a d-type cyclin
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
288
structure length
261
Chain Sequence
RYEPVAEIGVGAYGTVYKARDPHSGHFVALKSVRVPNGEEGLPISTVREVALLRRLEAFEHPNVVRLMDVCATSRTDREIKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPGLPAETIKDLMRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQMATLWYRAPEVLLQSTYATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGWPRDVSSVVPEMEESGAQLLLEMLTFNPHKRISAFRALQHSYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Cell cycle
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of Human Cdk4 in Complex with a D-Type Cyclin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords G1/S-SPECIFIC CYCLIN-D1
total genus 52
structure length 261
sequence length 288
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2009-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2w9fB02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2w9fB01
3CJFA 5DRDA 1JBPE 3P1AA 3MA6A 4ZSEA 3HDMA 4JDIA 4QMLA 4WKQA 3TJDA 2YA9A 2GHMA 4U41A 5F95A 2PUPA 1MUOA 2BRNA 3LQ8A 3H3CA 4FODA 4LMUA 2C3KA 5GJGA 3OWKA 4QP1A 4FKWA 3NLBA 4YNEA 5CWZA 3MFRA 3LXLA 4FV5A 4KD1A 5IZFA 1O6KA 3WF6A 5CF6A 3MH0A 4D2WA 4AOIA 3Q9WA 5DMZA 2JFMA 3POOA 4WOVA 4YJVA 2CN8A 3IW7A 4G6LA 3RK5A 4XP0A 4RZWA 4F7SA 3R7VA 1GY3A 5DR9A 3N4TA 3Q4CA 3BEGA 4G2FA 4NW6A 4AZWA 3P9JA 2ZM4A 3PA4A 4Z7HA 4CLJA 3A99A 4EH7A 3MWUA 2VTIA 4CV9A 3ORNA 2V5QA 3AGMA 5LVNA 3AQVA 4EYMA 2QO9A 3WF7A 3ZYAA 4OBQA 4PPBA 2QU6A 3AC1A 1JKTA 3OROA 1UNGA 2VTPA 3DAJA 4E6QA 3BQCA 4GVAA 4L44A 2GNLA 5ETCA 2A27A 4OT5A 5EK7A 3U9CA 4DH7A 3OWJA 4EZ7A 1FVVA 3EHAA 4CMOA 2XCKA 1UU9A 3VS0A 4ORKA 5DH3A 2HZIA 4RBLA 4RJ7A 3BYMA 3HV4A 3LMIA 2WD1A 2REIA 3OD6X 5DE2A 3DK3A 4QMNA 3TL8A 3BI6A 4H3QA 2J4ZA 5JFWA 3FMMA 3PXFA 4M67A 4XHKB 4BDHA 3Q4TA 3A8WA 3KL8A 4FKOA 4LRJA 3PIYA 5ANJA 4B4LA 1Y6AA 1H25A 4RQVA 2O8YA 2X6DA 3VBVA 1YXSA 3P23A 5I9YA 4KB8A 1GZNA 4QP3A 4QMOA 1FGIA 1R78A 3VHEA 2EB3A 3LQ5A 4O7SA 3QTZA 5IQDA 2E2BA 2PMNX 2BCJA 4HGLA 3UIUA 3QWKA 4ZY4A 2C0IA 2EWAA 3EYHA 3CGFA 3VF9A 2J0JA 4Q2AA 4BCGA 3PTGA 5AP2A 4D2TA 1QPCA 2JIVA 5HICA 5EM7A 4O7YA 3N9XA 4QTDA 5F20A 3VBYA 3FZRA 3GCQA 4B8LA 2WELA 3GBZA 5CF5A 4X2GA 1YHSA 2KULA 4C35A 5DHJA 5AUVA 2PU8A 3FMHA 3BELA 3VS1A 4E4MA 2ZJWA 4H3PA 3HV3A 3NNVA 4J96A 4RX5A 5AR3A 2WTWA 1T46A 3DKOA 4ZMFA 4G9CA 3ANQA 2W4JA 3FI8A 5HU9A 3FMLA 1QMZA 4FYNA 4C57A 4FV3A 5CEPA 3UODA 4ZLZA 5BUIA 4GT4A 4A9YA 1OL6A 3TZMA 3LM0A 5JZNA 3FMJA 5GZ9A 4YHTA 2YCSA 4IX4A 2XYNA 3KN6A 3Q52A 3QL8A 4KRDA 4WHZA 3D5WA 1H1WA 4N70A 5HKMA 5LMAA 1JOWB 2IVTA 4W4WA 3RPSA 3I79A 3SXRA 4BC6A 1LPUA 1H1RA 2GNFA 3EOCA 3F5UA 3F61A 3K54A 4II5A 4F7LA 4O21A 5F9EA 2HK5A 4LUDA 5EM8A 1WBTA 1E1VA 3SDJA 2XM9A 4J98A 2JD5A 4OBOA 4I0RA 3GENA 1REKA 3RTPA 3WZEA 4F7JA 2VTRA 5JMSA 4EH4A 2C6IA 3C4WA 3EN4A 3F7ZA 5FTOA 5EQPA 4FK3A 4U44A 3FUPA 2J9MA 4GFOA 5HO6A 4DINA 2W96B 3EFLA 4AE6A 2PVHA 4R7BA 4RJ3A 4IAKA 4O27B 4QQJA 5JGBA 4BB4A 2W1FA 4NL0A 2WMVA 4BCPA 2JIIA 5AIKA 4O38A 3EFJA 4WG4A 4JG7A 2ITNA 4C38A 3F88A 3MY1A 3U6IA 3QTWA 2JBOA 2O64A 4QP2A 4TN6A 3EH9A 3VS3A 4X2NA 1JLUE 4FNXA 5EW3A 5HE0A 5KMJA 4PP7A 4IWDA 2ITQA 4O0XA 4ALWA 4DEIA 2ERZE 4OAUC 5EM5A 4O6LA 4A06A 4IAIA 3WE8A 4AGCA 3G33A 2WMUA 3PRFA 3COHA 3NUSA 4FTKA 1OKYA 1W84A 3C13A 3DJ6A 4I23A 5LQFA 4EH8A 5T6KA 4W4YA 4IB3A 3CY3A 4APCA 5KZ0A 4M69A 2GDOA 1S9JA 2BIKB 4YLKA 4NIFA 5HTCA 3ORTA 1V0BA 5EG3A 3EFWA 4WA9A 4F6UA 4XS2A 2EVAA 2GFCA 3V01A 3TUCA 2ESMA 2IZTA 4EKKA 3QTUA 3LJ0A 3LQ3A 3L9MA 3W2PA 1W83A 3TEIA 3GC9A 2W7XA 4JI9A 5HG8A 2O65A 5HBJA 5JFSA 5L6WL 4IVDA 3THBA 3TV6A 4GKIA 3PG3A 3TIZA 5ICPA 1FBNA 4YPDA 3BHTA 1XBCA 1Z9XA 3BCEA 1Q8TA 3D94A 4EWHA 1WAKA 3RALA 4FIFA 5HORA 4JJRA 4AACA 5B2KA 4I6QA 4DH8A 3PXRA 4BCIA 1BL6A 4ENYA 3ZRMA 4BKZA 4MTAA 4QQTA 3OY3A 4DFLA 2AYPA 2X7GA 4IWQA 2PTKA 3IO7A 2V62A 3QHWA 5AR7A 3NNWA 3FMKA 5TKDA 5HQ0A 2UUEA 3AD6A 3U87A 4ZSAA 4BDFA 2X8EA 2GMXA 2ZMDA 1P5EA 3K3IA 4ACGA 2P3GX 4Z7GA 3PZHA 2YDKA 1YHVA 4PPAA 1XQZA 5KHXA 4Y5QA 4DTAA 3GC8A 3GC7A 5HIEA 2OKRA 4MXAA 4U3YA 1UWHA 2YWPA 5KE0A 5IKWA 3DBDA 4MAOA 3VBXA 4WO5A 4ZTHA 4XNEA 5HLNA 3M42A 2XNBA 5E7RA 1H08A 3ORIA 1OKVA 3DV3A 3QALE 4P5QA 5H8EA 3DNEA 3ZM9A 3DKGA 3JY0A 5FDXA 3V5WA 4C4EA 1OBDA 4GKHA 4V0GB 4JR7A 3Q53A 3NPCA 4K9YA 3C4EA 3KGAA 3RAIA 3PJ8A 3ZUTA 2JITA 2H9VA 3O71A 4EH9A 3H9FA 3RINA 1X8BA 5AM6A 2BFYA 3NUNA 4J52A 5KNJA 4U80A 3KXHA 4UMQA 3F3UA 4PTCA 4FNWA 5E8YA 1XH5A 2ITWA 5CY3A 4F09A 4RPVA 3OW3A 2NRYA 4ACMA 3D7TB 5KKRC 3CEKA 3VUMA 4X3FB 5D9HA 1XH6A 3FAAA 3PVGA 4DN5A 3R1NA 2IW8A 3QYWA 1P14A 1R39A 3PVUA 1UU7A 4GFGA 1Q61A 2YDIA 4I5PA 3FJQE 3VBQA 5IU2A 3DLSA 5AV3A 4EI4A 2XNEA 3Q6UA 4ZOGA 4CCBA 4KUJA 3EZVA 4RJ6A 3DB8A 1KE8A 3U55A 2YLEA 3N51A 1PYEA 2W0JA 4O83A 2VX3A 1YHWA 3ZDUA 2PVFA 1K3AA 3F7WA 4FGBA 3NX8A 3IS5A 3EN9A 5B2LA 3H9RA 5E8TA 2F7ZE 4F0GA 3LMGA 3O7LD 3HUCA 4BHZA 5AR2A 5HNGA 5J9LA 4FZAB 3DOGA 4FVQA 5HESA 3TKUA 3KRRA 1SM2A 2O3PA 4YJRA 4HGSA 2QLUA 5EOLA 3TZ7A 5CAVA 3E5AA 2DUVA 3UQGA 2XM8A 2J6MA 1B38A 3VJOA 4EOOA 4UN0C 4C62A 5IEVA 3U54A 4FSWA 3VJNA 4DH5A 2RFNA 3MPMA 3OCSA 4IVBA 2PK9A 3ZUVA 4D5KA 5J7HA 4PRJA 2PZ5A 4UV0A 3LHJA 3RM6A 3M11A 4QRCA 4TYGA 4X6RA 4D58A 5EFQA 5KCVA 5AWMA 5BVDA 2BROA 2JGZA 3RHXA 1GNGA 3IDBA 2VO0A 2XEYA 5H3QA 3EIDA 4FG7A 3D5VA 4TW9A 4G9RA 4D4YA 2CNUA 3BU5A 2VTNA 3LCSA 3WZDA 3W2SA 4BTMA 4KNBA 4RWJA 2WMXA 4H36A 4NU1A 4UWCA 1YOJA 5H9BA 5JH6A 4BY9E 4ANBA 3A60A 3MJ1A 3KULB 1IASA 4P2KA 3V5PA 3VQUA 4BF2A 2HAKA 5AV1A 1PMVA 4RIWA 4BTKA 4GT5A 4AX8A 3B8QA 5LMKC 4FOCA 1NVQA 2XP2A 3A2CA 3BE2A 4GU6A 3UDBA 3ZBXA 4C37A 1QCFA 2JAVA 3UIXA 4FIIA 4YJTA 4FKVA 3FSKA 5GJDA 1UKIA 2OG8A 5CNNA 2AUHA 3OT8A 3DDPA 3OP5A 2Y6OA 1A48A 1ZLTA 2YFXA 3V5LA 4EOLA 5IQGA 5FLFA 3ULZA 2FSOX 5CU0A 4ASEA 1ZOHA 2G2IA 3IONA 3AOXA 2F4JA 4FKTA 3G9NA 2BAQA 3GCVA 4CTBA 2GQGA 3TT0A 5I9WA 3QXPA 4MF1A 4CFXA 4PQNA 5J87A 3TDVA 4JBVA 2EXEA 2PUUA 3QQKA 4AN3A 4XG2A 3VULA 4FTOA 3UTOA 4I6BA 2YN8A 4W9WA 3LLTA 5J9YA 1NXKA 1UWJA 4BCHA 2BDWA 4OTRA 3TNWA 5G6VA 1J7IA 2J0KA 4MCVA 5FDPA 1YI6A 4L7SA 4Y46A 2JEDA 2C1BA 4Y95A 3ZMMA 2VTJA 3S0OA 2BZKB 4XLIA 3G9LX 3QC4A 1W82A 4IAFA 3KY2A 4IFCA 3ZZEA 3R2YA 3KRJA 2Q83A 5GIOE 2A4LA 1ZAOA 3PXKA 5CSVA 3KEXA 3EN7A 2QURA 3E62A 2JC6A 4EHVA 1ZYCA 4Q5EA 2QOIA 3R28A 4F1TA 5I9XA 1YWRA 3ZO2A 5FEEA 3T9IA 4EUTA 4O0RA 3AT3A 5L2WA 5CEIA 2QLQA 4EK5A 2PY3A 3RPRA 3GCUA 4EOMA 3DKCA 4FKPA 4TNDA 4DA5A 2NP8A 2PZYA 4NFNA 4G5JA 4FK6A 4LM5A 3CTJA 1GZOA 3FI3A 1Y8GA 3VAPA 4RIYA 4QMYA 4ZTNA 4UWBA 4PL5A 2W1ZA 4C3RA 2XIZA 3RAKA 2BRGA 1MQBA 3A61A 4V05A 1NW1A 2ZV2A 3Q4ZA 3DJ5A 4CFUA 2YM4A 4UALA 5FEQA 3VO3A 2I1MA 4B8MA 4BI0A 3KCKA 3EN6A 1OUYA 1GJOA 3OBJA 4FSUA 4J71A 1PXLA 1K2PA 4K2RA 4OR5A 4WBOA 4FIEA 4FV6A 5KMKA 4OTIA 4ACCA 2WO6A 4HVSA 3HX4A 3R02A 4ANNA 4RQKA 4JT3A 4AWIA 4ANMA 3GFEA 3UVQA 4QMXA 5J5TA 1ND4A 5L2TA 2RGPA 2ITVA 4IZYA 2PSQA 4WUNA 5HX6A 3AC2A 2BRMA 3QLFA 2RG5A 3E8CA 2GQRA 5A6NA 3ZM4A 4CTCA 4YSJA 1GZ8A 1H00A 2OJ9A 2YEXA 4E6CA 2WU6A 4DAWA 3QRIA 4RWKA 2JKQA 3F2NA 5B0XA 3GVUA 3MESA 5EM6A 4KS8A 1L8TA 4EONA 3VWAA 2WB8A 3HUBA 2UW0A 3CP9A 3QKKA 4GS6A 2B1PA 3FHIA 3GCSA 2XK9A 3F3WA 1GOLA 4QYEA 4D0XA 5IUHA 3W8LA 3A7GA 4XOZA 5I9VA 2SRCA 4N57A 4GSBA 1U4DA 3DB6A 3K5UA 3UVRA 4CZUA 2J0IA 5TO8A 4QQCA 2ZAZA 3VN9A 3PXQA 4FV1A 2JFLA 2XIKA 2G1TA 4IE9A 4XP3A 2WTCA 2BFXA 3ZUUA 5AMNA 3TV4A 2B55A 1Y8YA 4IC7A 2YCQA 4G3FA 4WUAA 4DC2A 5A9UA 2YWVA 5CAQA 2BDFA 4Q9ZA 3RZBA 5IEYA 4ZS4A 3DBCA 4I6HA 5BX0A 4ZZMA 5KBQA 1U54A 3KCFA 5CF4A 2VTMA 3IKAA 1KV1A 3MJ2A 2WNTA 3DXNA 1E1XA 1R0EA 1XH4A 2WMSA 3UOJA 4QYGA 4J7BA 1UA2A 4P5ZA 4BDBA 4EUUA 4KIPA 5CAUA 1UV5A 4R7HA 3SHEA 5EKNA 2CN5A 2XJ2A 4AT5A 2PMLX 4CFFA 4RX9A 4EOPA 1Q4LA 3WYXA 4EC9A 3TXOA 2OJFE 4MX9A 4NUSA 1U5RA 3SOCA 4G34A 2IG7A 1DAYA 2FSTX 3IW8A 4J99A 4WSYA 4NWMA 1M17A 4R3PA 4IH8A 2X8DA 3BYSA 5CQWA 5GHVA 4U6RA 4QNAA 3RP9A 3RWQA 1Z57A 4IWOA 1UNHA 3O50A 3FWQA 4GK2A 1OUKA 5JRQA 4I41A 3C4CA 3HNGA 3QGWA 2VUWA 2BZIB 3WZJA 3W1FA 3PJ1A 3H4JA 3ZZWA 3ZCLA 5LWMA 3FPQA 2ETKA 1PKDA 4LOOA 5IH5A 4F99A 4WNPA 1YKRA 3GOKA 4XX9A 4DGNA 5K4IA 4IBMA 4M84A 4OLIA 3ZO1A 4QMWA 4C02A 4PMPA 1KE7A 3LCDA 4ZJJA 1OPJA 4M0ZA 3FLWA 5FD2A 3WF5A 1JKKA 4E20A 5ETFA 5EDPA 3DTCA 4M68A 4EKLA 1FVTA 3ORPA 1ATPE 4GRBA 2NRUA 5DOSA 3DDQA 1YRPA 3TG1A 5A4LA 4JDKA 5JN2A 4J53A 4JG6A 4OGRA 2VN9A 2UZDA 3V8TA 4R78A 1JWHA 5FRIA 2CDZA 3QCXA 4AP7A 3UP7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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